1I2OA

Crystal structure of escherichia coli transaldolase b mutant e96a
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
TDKLTSLRQYTTVVADTGDIAAMKLYQPQDATTNPSLILNAAQIPEYRKLIDDAVAWAKQQSNDRAQQIVDATDKLAVNIGLEILKLVPGRISTAVDARLSYDTEASIAKAKRLIKLYNDAGISNDRILIKLASTWQGIRAAEQLEKEGINCNLTLLFSFAQARACAEAGVFLISPFVGRILDWYKANTDKKEYAPAEDPGVVSVSEIYQYYKEHGYETVVMGASFRNIGEILELAGCDRLTIAPALLKELAESEGAIERKLSYTGEVKARPARITESEFLWQHNQDPMAVDKLAEGIRKFAIDQEKLEKMIGDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Identification of catalytically important residues in the active site of Escherichia coli transaldolase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRANSALDOLASE B
molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli
total genus 138
structure length 316
sequence length 316
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2001-02-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1i2oA00
1UJPA 1ME9A 5KSWA 4X22A 5AC6A 2VEPA 3S9YA 2NWSA 1ZCOA 3DH7A 1NAL1 3C2RA 5E1QA 4ZZ9A 1EUAA 4K39A 2V5LA 1ZAHA 1HO4A 3BGGA 3PM6A 4YLWA 4O28A 3IVTA 3TFXA 2QR6A 3B05A 2A2IA 3KRSA 1EIXA 2JGYA 1S5WA 3EWUA 2ZA2A 1OX6A 3GLCA 1EEPA 2TSYA 3ZWTA 3JRKA 4MY1A 4UTWC 5HMSA 3MBFA 5DN1A 1OFEA 2YYUA 3PVFA 4A29A 5T26A 4N4PA 3H53A 4RX0A 1DBTA 1F6PA 1WAUA 4PFMA 5AHLA 1FCBA 4O53A 3NQ2A 1R47A 3DFQA 3EX4A 1TQXA 3R2GA 2AQWA 4GWEA 1KM6A 3TSMA 1W56A 3Q94A 3LV5A 4FO4A 5CG7A 5KTLA 4L4LA 4C1LA 2Y6ZA 3MO7A 2NX9A 3NPXA 4IQLA 3L67A 1XDLA 4ZQCA 1I2PA 1TPWA 3B0PA 1KTNA 3DFOA 5H2ZA 5F1UA 3HPZA 4N9DA 5DXYA 3ZFHA 3M7WA 1AW5A 5HULA 5GVJA 1EA0A 1OFDA 3LHVA 1KA9F 1Q3NA 1F5ZA 3OIXA 2C6QA 1ZAJA 4TMBA 1WYIA 1LOSA 3LHZA 5K9XA 1W5QA 1BTMA 1LRQA 4M7TA 4IGHA 5IM51 2C1HA 2A4AA 5K7JA 2QDHA 5CZJA 2B7QA 4XBKA 3T44A 3T40A 1ZNNA 3OVQA 4UFHA 3W2KA 2B0MA 3S0CA 2FDSA 4EOUA 3W76A 1M7PA 4IJBA 2Y61A 3PY2A 1W5OA 1F74A 1M7OA 4GUJA 2TPSA 4CNNA 3NQGA 1VCFA 3UWQA 2QAPA 3L66A 4OV9A 1KM4A 4IOTA 1KM0A 1QMLA 4LUIA 4LVFA 3MHUA 3G0XA 4DF2A 1FY6A 4S2BA 1OX5A 3LHTA 5G2WA 1PE1A 5AYYA 1WA3A 3NEVA 4E0CA 2Q8ZA 2RDWA 1G69A 4A22A 4JIQA 2ABBA 4UMAA 4O4WA 2H3DA 3W88A 4BWLC 1DL3A 3FEMA 4ONVA 4UC5A 3W70A 2P10A 5G2IA 1DJNA 4LS0A 3BLIA 1Z44A 3CTLA 3QSTA 3W1PA 3LTYA 1FDYA 2X1SA 3CHVA 2Y89A 1Z41A 1FXPA 5C5YA 5I3GA 2JBMA 3WK0A 1ZFJA 4MYAA 1S3HA 3PUEA 4JDBA 4FIQA 1K02A 1YXCA 2YZRA 5DBUA 3O05A 1SW3A 5D05A 3W2NA 2OT0A 5D03A 3C0JA 2ZQ0A 2D73A 2FB2A 4FNRA 5EMUA 1TTPA 2H3BA 4RCXA 3CWNA 1L9WA 1UUOA 4RZ6A 1HFBA 4DPPA 1KFKA 3UQNA 1KW1A 1WV2A 4JYDA 2HMCA 5HWMA 3LV6A 3EXRA 4JTTA 4R7JA 3UXAA 3B4UA 4ADTA 4R53A 4BF9A 4Z08A 4EF8A 1O60A 2G5WA 3P74A 1G4EA 2F7FA 4MOZA 3UZ5A 1YXYA 3G8RA 1TJRA 3CU2A 1OX4B 5LNWA 3E12A 2GQ9A 4QQ3A 3MI6A 4JDYA 5EKYA 1TRDA 2QCEA 1OJXA 1O5KA 3S5OA 1VGAA 3RLVA 2V2HA 2VFHA 2Z0IA 3BO9A 1SFLA 1RD5A 3IIOA 3ABRA 4UTTC 2OJPA 3LCGA 2OMAA 1QPRA 5FI8A 3C52A 4JNMA 1LBFA 3UWUA 1K7EA 3RFAA 3DU0A 4YMZA 2GOUA 3T4CA 4JY9A 2DU2A 3LCFA 1I2QA 3O63A 3L0KA 2WV8A 4HNTA 2ISVA 1H7OA 5KZDA 1VLIA 1TJPA 4RXFA 4K7VA 1MSSA 4HHPA 2CZ5A 4K38A 4WX2A 5A5WA 1N7KA 5FEZA 3TAKA 3R8RA 1XFBA 1KFBA 2ZA3A 2WNQA 1SUXA 1B4KA 1ICPA 4NU7A 1TYGA 4HSNA 2RKXA 2VFFA 5G4WA 3GIYA 3EX6A 1LRNA 4NZJA 3P61A 3TIMA 5C6MA 4GRSA 4O1BA 3R12A 2YXGA 3B04A 2ZRWA 5LNUA 1O4UA 1C9DA 2GVGA 3ELFA 4WOZA 5L6UA 3G24A 5FEWA 4DF1A 3R89A 1TRIA 5AYXA 2R91A 2ZZ6A 2NUYA 1EP2A 3HGOA 2HS6A 3NZRA 1N55A 3TH6A 3FKRA 2Z2UA 1AK5A 4O11A 4MJMA 4O18A 7TIMA 4KFPA 3ANYA 3M44A 4N2YA 4PCFA 1AL8A 3QRHA 2GUUA 1PCKA 3THAA 2C19A 1WX0A 4N02A 4IX2A 4FNQA 2ZFAA 3BW2A 1TV8A 3LCHA 3NPVA 2QCLA 3N2XA 2E5CA 3KVLA 1SO3A 4JX5A 4ORMA 2E6FA 1QR7A 3EXTA 4CCEA 1WQ5A 3PUDA 2NUWA 4X9SA 5L9FA 1YDVA 4IXXA 1AMKA 3NQ6A 3LBCA 3VE9A 3W2JA 1OX4A 3A5VA 1SPQA 4MFDA 3KRZA 3M5YA 4MLJA 4IMEA 3TQKA 1XM3A 4JR5A 1VH7A 1OFPA 2RH9A 2WJZA 1SSGA 1U83A 1SO5A 3SY5A 3MYOA 1P1XA 4BR1A 2H6RA 5HWJA 2Q8LA 1B57A 1FDZA 4MZYA 3EXSA 2DZSA 3W7IA 2GVLA 2R14A 3G1SA 3HO8A 1CI1A 3OG3A 1PVNA 4RZ4A 1TPDA 4WOQA 4FNTA 2XN2A 2VEIA 3R13A 1D3HA 3TW6A 1K8XA 2LLEA 1A5CA 2NV2A 3LDVA 5AHMA 4AHQA 2PURA 2DJXA 3SSJA 1WBHA 3WJZA 4PH6A 3UY7A 3TA6A 4E2BA 4ZVJA 1V7YA 5EBUA 1T96A 1JCJA 5AYZA 3CIWA 4M19A 1TTJA 5D2TA 3C2OA 3LCWA 2W0UA 2QCCA 2WO5A 1ZALA 1TCDA 1UCWA 2DP3A 3FIGA 3NVTA 3UWZA 2H8XA 1GYLA 4Y90A 3LCXA 4O1CA 3P82A 2DORA 5FF3A 4K37A 1KBIA 3A23A 3S5ZA 1ML1A 4IUOA 1ADOA 2V9DA 4JYFA 1K8YA 3GNDA 3CWOX 3LXBA 3TJXA 1VJIA 2E6DA 1YPFA 2E6AA 3CEUA 1FUYA 5LZLA 5DCDA 2R94A 3N9RA 4MLRA 2PRMA 3NPWA 2JK2A 1J4EA 4MZ8A 3ZS4A 4N6EA 1OFAA 4Y9AA 4DO5A 3TR2A 3V1PA 3G0SA 5A8GA 5F2MA 2GJNA 4ADSA 4GUHA 3W83A 1HTIA 2RDUA 2NUXA 4GUIA 1SZEA 5DXXA 3C3NA 1ME7A 1RR2A 1O95A 4EIVA 3C2EA 1GOXA 4RR4A 1CX9A 2QF7A 1RQEA 4Z1BA 1YADA 1ZHAA 2DZTA 3W74A 1EPXA 1KM2A 2YFNA 5HQEA 4E2DA 1QDSA 3AJXA 3L68A 2QCGA 4MZ1A 5CSSA 2W6RA 2Y62A 5E93A 4AEOA 3PBWA 1P0KA 5EPDA 1OABA 2QJIA 3S1XA 1QWGA 4H3DA 3ATZA 4JTGA 1A53A 3TQ0A 5U7SA 5J5DA 4JN6A 1LBLA 2A85A 3M41A 2VEKA 4JX6A 3RU6A 1OHLA 4I7UA 2CLLA 3C2VA 5BMWA 2RHGA 3S1VA 4RJEA 3IV3A 4U4MA 2J88A 3W2UA 4Z0JA 3KVMA 1AL7A 1G4SA 3LLFA 2V0TA 5D09A 1DOSA 1FWTA 3A21A 3O6DA 4WY0B 2V8ZA 3PB0A 3TE9A 3HG4A 3G0UA 3NQ8A 2FFCA 3PB2A 5FF4A 2QKFA 2ZRUA 3UY8A 4H4IA 3L5MA 4NJIA 3W1RA 3W86A 3N14A 2YR1A 2ZZ5A 1SW7A 2A7NA 1LLZA 3IVUA 3Q58A 4AAJA 4HNVA 1OYCA 1VYSX 3BG5A 3NL3A 3P5ZA 4DEFA 1W5NA 1XUUA 1VPXA 3GXPA 3GB6A 4FNUA 1XI3A 1V5XA 1IXOA 1LLWA 3IRDA 4A2RA 3SJ3A 1LDCA 3CEPA 3C56A 3SW6A 3HMJG 4GC4A 1LCOA 3CIXA 4FX7A 2Z1BA 4QIUA 2F84A 3I68A 5LSMA 5LNRA 4ZQOA 2QUTA 1YPIA 4TMCA 3LGEA 4FNPA 4UTWA 4X2RA 5BW6A 3HG2A 1X1ZA 4MYXA 2YW3A 1NEYA 3DFPA 5F4WA 4JX4A 5TQLA 5LGZA 4JTIA 5LNSA 1Q6LA 3B03A 2A0NA 4LS1A 4LVAA 3W75A 4QISA 1FXQA 1I4NA 3YPIA 1P4CA 5DY3A 3TXVA 2Y63A 1X8FA 4CLMA 4NNAA 1T8XA 5AHFA 1KM5A 4O54A 4JTFA 4ZL1A 2VFIA 2V2CA 2QCHA 1TPFA 3LCIA 2RDTA 2JKAA 3PBUA 2AAMA 2H90A 2NV1A 1OK4A 4UFKA 2BLEA 4O16A 3IEBA 2NXHA 1NFBA 3TW7A 4HSOA 1TV5A 1M5WA 3NQFA 3U2OA 2TYSA 4OU1A 5CPMA 1I8JA 1Y0EA 3IVSA 4NXKA 3THQA 3NM3A 3DHDA 3EX3A 4O50A 1LBMA 2Y70A 4PL1A 1SZGA 1QPNA 4B5NA 4ZQRA 5AC8A 3EX1A 4TIMA 3GX9A 2WNZA 1G67A 3WJXA 1TO3A 1H7XA 3T78A 1SU5A 3W72A 4GBUA 3NQAA 1MEHA 4WY0A 3QPZA 2G97A 1LP6A 4WQ6A 4XTDA 1I2OA 3E02A 4UTHA 3QF0A 5EA9A 2QEZA 1GEQA 2NXGA 5K4ZA 1QPQA 2Z6IA 1XUZA 1VLWA 1XBXA 3HGRA 4DPQA 1JCNA 2E5BA 5E0KA 3I6RA 5G1YA 1W5MA 4FB7A 1HL2A 2Y7DA 3TMLA 3MWAA 4XTIA 1GPWA 4O0KA 3OHIA 3WJWA 3W7MA 3N2MA 1L2UA 2ZRZA 2J27A 3B06A 3M9YA 1I2RA 2Z6JA 2EPHA 2I1OA 4BWLA 3FA5A 2CLKA 2O7SA 4S2CA 3FOKA 3M43A 1XBYA 4NX0A 2JKPA 1FX6A 3UWWA 4HT3A 3DENA 3TQVA 5LHFA 4IXHA 1JCMP 5K9DA 1B4EA 3P80A 4OHQA 1UB3A 2GQ8A 5KZEA 3DGRA 3LERA 4QSHA 3PG8A 3DZ1A 4O14A 3EWBX 5K4XA 3TSBA 5TIMA 4GUGA 1QCWA 1HO1A 1NVMA 2C18A 1A5AA 3M47A 4JD4A 4K7YA 3GYEA 2EAWA 3V75A 3M5ZA 2A21A 3FFSA 2FJKA 1RZMA 2C3ZA 1J5TA 3BK0A 4W9TA 3C4UA 2DJLA 3G1VA 1LTDA 4UUIA 4GNJA 5D2VA 3GVGA 2E09A 2NXIA 5AFDA 4UNKA 1VC4A 3EWZA 4POCA 2RFGA 3I7QA 2PCQA 4NJKA 2A7RA 5FESA 4M6PA 3N9SA 1YTEA 1MEIA 3O16A 4PODA 3T7VA 4E38A 3S6DA 5HR6A 3L5AA 3MHGA 3VE7A 1H60A 1R2TA 3N19B 1NF7A 1OYBA 3BV4A 4UXDA 3BW3A 4UCGA 3DFSA 1LORA 1TPUA 2FQIA 3P60A 2WSYA 3OVRA 2I9EA 1JVNA 1TSIA 3NXFA 3MP3A 1QNVA 1VS1A 4MJZA 3TDFA 3TMQA 4R34A 1AG1O 4LRTA 2Y85A 5FEXA 1R2RA 1Q6QA 1F7BA 1JUBA 3CM4A 1TMHA 2NX3A 3C6CA 4IPJA 5U4NA 2FPVA 3PAJA 2PE4A 4BI6A 4UTTA 2TRSA 1W3TA 5BRBA 1LM1A 5I3HA 4NVTA 3DI0A 1LOLA 3GDKA 4LOCA 2X16A 5G2HA 1GVSA 4HN4A 2XFWA 4A3UA 5LHEA 4MFEA 3O15A 3C2FA 1W3NA 2VENA 1KTBA 5KZMA 1R46A 3UXDA 1PIIA 2AGKA 4NZFA 4PTNA 4RV8A 1I45A 1VQTA 4Z1DA 3G22A 3W22A 1RQBA 4PA8A 2V2DA 2ZTKA 1H62A 3P5YA 2EHHA 4AHOA 2FPYA 3L65A 4DQWA 2GPTA 5CZSA 2GQAA 1DQXA 2OT1A 5DCEA 4CQ9A 5DLCA 3PSWA 1TPVA 2J9YA 3W7QA 4LW7A 5J5RA 3S1WA 1H61A 2DZWA 3HQ1A 3M1ZA 3R5EA 3QFEA 1OFBA 4KKXA 3NL6A 3A24A 1L6YA 3LCLA 3N3MA 3NL2A 5C55A 2I14A 2Y7EA 4LV9A 1T0OA 2ZBTA 4OT7A 3SGZA 3LX9A 1THFD 4FX8A 2OCZA 4N9CA 2B4GA 3IGUA 1BWLA 2VKZG 3G3DA 4RK8A 5C54A 1OG0A 3F1QA 1KFJA 3ABSA 1OFOA 3LXAA 3L21A 3GZ3A 2ZRXA 3W7PA 1PS9A 2P0OA 2BZNA 2DZUA 3S8HA 3EB2A 3W1AA 2CLMA 2QAFA 3W71A 3IIPA 3INPA 1W3IA 2NX1A 1GVOA 5CZTA 1RVGA 1QO2A 3WFAA 3JR2A 3KFTA 2FLIA 1DVJA 1DJQA 4JS3A 3CQ0A 1GG1A 4N4QA 2ZA1A 1G7VA 3CPRA 3TK7A 4OE7A 4O15A 3LHWA 4O4VA 4Q4KA 4QITA 1MZHA 1FDJA 5G5IA 1Q45A 3DHFA 3IIXA 4P2VA 3NR0A 1K03A 1AW2A 3QC3A 4DBDA 2CLIA 2Y88A 4CQ8A 5ABTA 2ATMA 4ML9A 2ZZ7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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