1I2OA

Crystal structure of escherichia coli transaldolase b mutant e96a
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
TDKLTSLRQYTTVVADTGDIAAMKLYQPQDATTNPSLILNAAQIPEYRKLIDDAVAWAKQQSNDRAQQIVDATDKLAVNIGLEILKLVPGRISTAVDARLSYDTEASIAKAKRLIKLYNDAGISNDRILIKLASTWQGIRAAEQLEKEGINCNLTLLFSFAQARACAEAGVFLISPFVGRILDWYKANTDKKEYAPAEDPGVVSVSEIYQYYKEHGYETVVMGASFRNIGEILELAGCDRLTIAPALLKELAESEGAIERKLSYTGEVKARPARITESEFLWQHNQDPMAVDKLAEGIRKFAIDQEKLEKMIGDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli
publication title Identification of catalytically important residues in the active site of Escherichia coli transaldolase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRANSALDOLASE B
total genus 138
structure length 316
sequence length 316
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2001-02-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1i2oA00
1H60A 3C4UA 3LXCA 1VYRA 2GJNA 3TW7A 1TREA 5BW6A 4LUJA 1EUAA 2WJZA 3LBCA 4IXXA 1TPUA 2CLLA 2QAPA 3QSRA 1LYXA 3LHUA 3NQDA 3SY5A 4ADSA 5A5WA 4O17A 5HUPA 3ATZA 3G3DA 1X6UA 3LV6A 3W1PA 3O6CA 3TXVA 3W7OA 4HSNA 3NL6A 1G69A 1XUZA 3LB0A 3W23A 1HG3A 4AWUA 2ZRYA 2ZA2A 4JY9A 4GFSA 1GTHA 5BRBA 1OF6A 3BW4A 2E09A 3W1QA 3W7CA 1EA0A 2NUYA 2X1SA 3GR8A 2E5CA 3TROA 3PR2A 1OYAA 3DU0A 5CPMA 2BSLA 3DFQA 3NQ8A 4LWWA 2YW3A 2GVGA 1H7XA 3HQ1A 3IEBA 3M44A 3LHZA 1TYGA 8TIMA 1LCOA 3OVRA 1YTEA 4Y96A 4ZL1A 4LOCA 2Z6IA 3M7WA 3FA5A 1TTJA 1AMKA 3ABOA 4MUZA 2R14A 3O16A 4AVFA 3UWQA 2LLEA 3NG3A 4UNKA 4JTHA 4QNWA 2CZDA 5AC8A 2AAMA 5G4WA 1KA9F 2CLMA 3LTPA 1F7BA 1JCYA 1LBLA 1H1ZA 5ABTA 5AN7A 1I45A 3UWUA 2BLEA 3P7YA 1WQ5A 3BO9A 4TR9A 1QWGA 4I7UA 1NSJA 1YDVA 3QPZA 1W8SA 2H8XA 1T8XA 3Q37A 5K4ZA 3MHFA 3DAQA 1TPVA 4UMCA 3N14A 3HGJA 1VHNA 1LOSA 3PULA 1K7XA 4NJHA 4DBDA 1YXDA 5K4XA 2JKAA 4AMAA 4ZQMA 1H7RA 1WAUA 3SI9A 3GDMA 3GKAA 4AWSA 4X2RA 1S5WA 2CZ5A 1MEIA 4N4PA 1LLWA 2E77A 3TC7A 4DPQA 4NJJA 1BTMA 3VNDA 4Z08A 1XI3A 5F4XA 5D2YA 3UY8A 1VH7A 3FKRA 4AWTA 5DCBA 3NPVA 1Q6RA 1RV8A 1W31A 4UUIA 1I2OA 4FF7A 4O52A 3TK7A 1V5XA 2QDGA 3VCRA 4BI5A 1KTNA 3NQCA 4GXMA 4AF0A 3RU6A 2GVLA 3M5ZA 1WOBA 2PC4A 4JTTA 1FWNA 4UTTA 3TQVA 1OABA 3I68A 2Y7FA 1QPOA 1FCVA 1SFLA 2OCZA 3SIZA 3G8EA 3W7GA 5G1TA 4CCDA 3EXRA 4O4VA 4IX2A 5G2HA 3DFSA 5AOUA 4CNPA 1DL3A 4WUIA 3MI2A 4UNLA 5F2GA 4M6QA 1QOPA 3S5OA 3RLUA 3BARA 1LRNA 1KFCA 1FWTA 1KM2A 4PODA 1GYNA 4IX0A 4XWUA 1JCNA 4JDYA 6ALDA 2B7PA 2A0NA 4JTUA 3W2NA 2B0MA 4ZVJA 1FCQA 4FXRA 2R91A 3NZ1A 3P67A 4LY8A 2FLIA 2X30A 5E0KA 2J6XA 3E49A 5D37A 4HNVA 2FPYA 3HGSA 1H7NA 4RKAA 1I2QA 1A5BA 3STGA 1IXQA 2ZZ7A 3DHFA 1KTBA 2RKXA 5LNVA 1G6CA 2V81A 3NDOA 1NFBA 2CFFA 3G0UA 1W5QA 2C3ZA 4O13A 1FXPA 1AG1O 3F03K 3B04A 3VE9A 1K7FA 3BVJA 3LTSA 2QCFA 1T96A 3GYEA 4BWLA 1H51A 3W9ZA 4PC8A 3BLIA 4AH7A 1IIHA 1VCGA 2FPVA 1AL8A 5D2VA 4JTFA 1JQXA 1K8XA 2E6DA 4MZ8A 1SPQA 3IIVA 3THAA 3R5EA 4IUOA 3MJYA 1DJNA 1YTKA 3W7RA 2VFEA 3QYQA 1O60A 2Q3OA 4FNSA 4GBUA 4UCGA 2JGYA 1F05A 3NPXA 4LUIA 3BLEA 5I3IA 1O4UA 3P5ZA 4IJBA 4MZYA 1G4SA 5LGZA 1LTDA 4LT9A 4A29A 1KM5A 2YYTA 2FJKA 5DLCA 2JK2A 1I2NA 2WSRA 3P80A 1MEHA 4DO4A 1SZEA 1TJPA 2NX9A 3KVMA 3BV4A 3DI0A 3EX3A 1P4CA 2BXVA 3EXSA 1JRBA 4NJGA 4GUGA 5E93A 4UTTC 3LRKA 4MYAA 3W1RA 1VS1A 4JX5A 1O5XA 1ZNNA 5DY3A 3W88A 3VKJA 3SW6A 1GTEA 4NNBA 4YCOA 3INPA 1ZJIA 3TAKA 2H8ZA 3BW3A 3STCA 1TTIA 1QNVA 4IXHA 3JS3A 4JTGA 1TTPA 4LRSA 4WXZA 4UTKA 4I7VA 5AHMA 4M6PA 4HPXA 4HNNA 3OEXA 2CLFA 2V8ZA 1OFAA 5LSMA 3KVLA 1LBFA 4FXSA 2YFNA 2ZRUA 1H63A 4L4LA 2WSQA 3HOJA 3N3MA 1Z48A 4ORMA 1W37A 4WD0A 1TPC1 5L6UA 3I7QA 3NPUA 1I2PA 3CIWA 5EPDA 1KFJA 1EX5A 3GIYA 4PFMA 2R94A 4UFHA 3GNDA 2AQWA 4WJEA 3HMJG 2V2DA 3MW7A 3CLMA 2ATSA 3B06A 2YXGA 4XKYB 2WNQA 3HF3A 2QCDB 5D03A 4I7WA 3L67A 3RFAA 2C0AA 3R13A 2ZDRA 2W0UA 2Y70A 1G4PA 4JDBA 4PL1A 3CWOX 3SGZA 3H53A 4H4IA 5AHIA 3FIGA 2CLOA 4BWLC 4XBSA 3FLUA 4CCCA 2C18A 2CZEA 2YZRA 1B9BA 1LM1A 3PVFA 2NV1A 4MKNA 1O94A 3G1AA 3M43A 3ZFHA 5MHBA 5G5IA 4IGHA 3PWAA 2NV2A 2C15A 1ME7A 5CPOA 3M41A 2UV8G 1FCBA 3P62A 3G1FA 4MY8A 3CWNA 4RV8A 1WOAA 2RH9A 2Y88A 3IRDA 4RR4A 5CPNA 5F1UA 4JX4A 1KTCA 4RXFA 1SZFA 1XBZA 4O4WA 2GUUA 1Q45A 4O57A 3N73A 3OIXA 1TPB1 1A5CA 1TB3A 2ZRXA 1JVNA 2NXGA 3WJYA 5IBXC 2VFFA 2NZLA 3QC3A 4AXKA 3TSDA 1OG0A 4B5NA 4IOTA 4Y90A 4EVZA 1FUYA 3W75A 4RCXA 3BGGA 1ZFJA 3V1PA 2TSYA 5G2IA 2ZRZA 2BZNA 3NQGA 1PE1A 2WV8A 4NQ1A 1HUVA 3C2EA 2YYUA 3UNDA 4O0KA 3CHVA 2A7NA 1IGSA 2Y7GA 4JTSA 4MY1A 3L5LA 1WBJA 1LBMA 2A85A 1P0NA 3CQ0A 1AL7A 4JTEA 5I3FA 1OFRA 1N8FA 2QJIA 2E6AA 2QCMA 2Z1BA 3O8AA 4YLWA 1YLVA 1ZENA 1XL9A 3PSVA 1LDCA 1KM1A 1D9EA 4JR5A 4UFIA 2WSYA 4LRTA 3W71A 1TPWA 1C8VA 2B4GA 1R2TA 4WOZA 3STEA 1FDYA 4FB7A 3MHUA 3W7JA 2XN2A 3CEUA 1ME9A 2GVJA 1VLIA 1VRDA 1U5JA 2FPTA 3QZEA 4X3ZA 3OA3A 4PL2A 3LHTA 1TJRA 1D3HA 2ZA3A 3QW4B 4ADTA 4FNRA 2Z6JA 3GZ3A 1ONRA 2VXNA 3DFTA 4H6KA 3SGUA 4O15A 4UTJA 3LCHA 5AB3A 1QPRA 1XCFA 3GX9A 4RLIA 3WK0A 1AK5A 2FB2A 3UXDA 4WQ6A 3EWUA 1FX6A 5I3GA 5TIMA 4UTWC 4QM1A 3G22A 2G96A 4LV9A 3OHIA 4N9DA 2I14A 5K9CA 3R2GA 1QO2A 3E0IA 4CQ8A 1MEWA 3FOKA 3W76A 1K02A 1VYSX 4MJZA 1R47A 4O8RA 1FDJA 4JTIA 3HGOA 4TU1A 3PB0A 5K7JA 1RVGA 3M5YA 1FBAA 3O6YX 4HSOA 3W1XA 3I65A 3W3OA 4DO5A 1LORA 1LLZA 2QJGA 4JICA 1PHWA 1TO3A 2DZVA 2Q8ZA 5J5DA 4DEFA 3N9SA 3KX6A 3GXPA 1HO1A 3BG5A 1XBYA 7TIMA 1H5YA 1OFPA 4LVFA 1JUBA 3GB6A 3UY7A 3FJLA 3Q94A 3GR7A 3UPBA 3STFA 5D33A 1IXOA 1TV5A 4ZQPA 3L2IA 2HS6A 1H61A 1XXXA 3S1UA 1K7EA 2BWGA 3PG9A 3C2FA 4EWND 1TTQA 1GEQA 2A7RA 5AC7A 3NQMA 2E6FA 3IV3A 2A6NA 3LI0A 3G1VA 1ZAHA 2NUXA 5F2IA 2ZZ3A 4I9AA 1GVSA 3BG9A 4WOQA 3ABQA 2JBMA 4WXYA 3T78A 5CZSA 3PC0A 3KRUA 3BK0A 1YPIA 4J9JA 1RD5A 3F4NA 2QCLA 2ZA1A 5HWMA 4YCPA 4M6VA 5EKYA 2WQPA 4JGDA 5HWNA 2NXHA 3W22A 4ML9A 3NPWA 5D30A 3TV8A 3KHJA 2Y85A 5F2MA 3HGRA 4FO4A 3KRSA 3T4CA 4GUJA 1B4EA 5HWJA 1ALDA 4UTIA 4UR7A 3QMTA 4HNTA 3MI6A 1XDLA 3PUDA 2ZZ2A 4ICNA 1TCDA 3TA6A 1F5ZA 1Z42A 3EX6A 1R2SA 1XM3A 3G1SA 3WJZA 3UD6A 3CU2A 4E2DA 1VCVA 1VHCA 5DELA 3VFLA 1LROA 3B05A 1E51A 1IXNA 1F6KA 3M9YA 1X8FA 3C61A 4JIPA 5LNUA 4UC5A 4JYFA 1A53A 1OX5A 2X1UA 3GNNA 1CX9A 2ZZ5A 3PG8A 4K37A 3C6CA 3W87A 2QUTA 2RHGA 1THFD 1J5TA 1TV7A 3O63A 4O18A 1G7UA 3QM3A 4LW7A 5LNRA 2DZWA 2X2GA 1OFQA 1FQ0A 3IIPA 5HJLA 4UMAA 2C13A 3NYZA 4QQ3A 5HR6A 4E2BA 3FYOA 1JQVA 3W2JA 1QOQA 1L9WA 4CNOA 4OHQA 2EHHA 2BX7A 3EEGA 3NQFA 2OMAA 3G1DA 3R89A 1N7KA 3CT7A 2DORA 4X22A 1H1YA 2C6QA 3NA8A 1XKYA 2PRHA 2GQ8A 4GRSA 1EP1A 1D3GA 3EWZA 3LCGA 3TX9A 2J27A 2WNZA 2PE4A 4N4QA 4ALDA 3IGSA 4UFJA 3PBWA 3TQ0A 1C29A 2DJLA 4Y6GA 1NAL1 3AO0A 1UUMA 2TPSA 3PF3A 1DQXA 4Q33A 2A2IA 4UTMA 4HNUA 4GJ1A 4GUIA 3ZWSA 1GG1A 4UTUA 3MMTA 5HQEA 3DI1A 1QPNA 1RZMA 3UWWA 4DF2A 4NZFA 1ZAIA 1W5NA 5C5YA 5KTLA 4O14A 3TH6A 4RZ4A 2VEPA 3TJLA 3GXTA 1RPXA 4NVTA 3NOEA 3UXAA 3JR2A 2PURA 4HT3A 3T44A 5D05A 1B4KA 1HTIA 3GDTA 1PL9A 3UYCA 3IGUA 3OVQA 4MY9A 5FEWA 4HHPA 1MZHA 3GAYA 3W1AA 4LS2A 3G8RA 1A5AA 2H3BA 2F7FA 3HPXA 1QAPA 3TSBA 4O16A 4JXCA 3LCLA 4A22A 2NX3A 5FESA 5D02A 3TSMA 3W7PA 4IMCA 4OU1A 3NL2A 3W7HA 3WJXA 5AYYA 3ZS4A 3UWVA 5CZ0A 4L4MA 2OX1A 2DZUA 1A50A 3NR0A 3B03A 3L68A 3CIXA 1B3OA 1PS9A 3CM4A 5I3HA 3TR2A 2V30A 4WY0F 1W3NA 2A4AA 2YX0A 4FX6M 2E1DA 4NX0A 5HR7A 3KXQA 3MYOA 2XFWA 3T55A 3U6WA 2Y7EA 3P61A 1PCKA 1TSIA 2J9YA 2JKEA 4O1AA 3HBLA 3S5ZA 1EP2A 3DGRA 5HUOA 1V7YA 4EF8A 1ZCOA 1R30A 2E68A 4NXKA 3GDLA 4QNEA 3LRMA 3NQVA 4O0ZA 4Q32A 1P0KA 3WK1A 3M0ZA 1I8JA 1LRTA 2YGYA 1OX4A 4AHQA 1BKSA 4HPJA 4KFOA 3ATYA 1W3TA 2BTMA 1ICSA 5LZLA 3DFOA 4DQWA 5FF0A 3G0SA 4Z1AA 4PH6A 1NVMA 1CW2A 2VKZG 5G2WA 4FX8A 1NEYA 2I1OA 3SSJA 5CKSA 4K8HA 4N6EA 1S5TA 1IXPA 4K36A 1SO4A 2H90A 5U7SA 4FIQA 1ADOA 3L0GA 3MBDA 1WXJA 3G1XA 3C2VA 1JJKA 3S5NA 2TRSA 3SJ3A 3SR7A 3W1LA 5D38A 2VFIA 3E96A 4KFPA 3EX4A 3PBUA 5EYWA 3L0KA 4GUHA 2FFCA 3NQ7A 1KM6A 5SWUA 1GYLA 3L66A 4BR1A 1VPXA 1WYIA 1Y0EA 2XN0A 4Z1DA 4LVBA 3KVKA 4RXGA 3L9CA 3TFCA 4QISA 1GJPA 1N55A 2X1TA 1SO6A 2PRLA 4XQ6A 1QR7A 3DFPA 3P5YA 3IVUA 3QJAA 5KITA 3QEZA 4O10A 3EWYA 1EEPA 3S1VA 1SQ7A 1WV2A 2Y89A 3T40A 4DO6A 5G4EA 3Q58A 2DZTA 2QCCA 2D73A 3WK3A 1H62A 2V5BA 4ORIA 3U2OA 1GT8A 3TKFA 3ZWTA 2WO5A 3W70A 2CLIA 4R33A 1TMHA 3MP4A 3M47A 1QMLA 4A21A 2B7NA 5U4NA 5DN1A 4LC6A 4M7TA 1VCFA 3W7KA 2VELA 3OBKA 1SFJA 1KW1A 1UUOA 1SO3A 1Z44A 5LHEA 3PSWA 4W9TA 1ZAJA 4Y8FA 3NAVA 1L6SA 1TV8A 5EA9A 5AC6A 2YCEA 1JULA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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