1I2QA

Crystal structure of escherichia coli transaldolase b mutant t156a
Total Genus 137
50100150200250300020406080100120140
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
TDKLTSLRQYTTVVADTGDIAAMKLYQPQDATTNPSLILNAAQIPEYRKLIDDAVAWAKQQSNDRAQQIVDATDKLAVNIGLEILKLVPGRISTEVDARLSYDTEASIAKAKRLIKLYNDAGISNDRILIKLASTWQGIRAAEQLEKEGINCNLALLFSFAQARACAEAGVFLISPFVGRILDWYKANTDKKEYAPAEDPGVVSVSEIYQYYKEHGYETVVMGASFRNIGEILELAGCDRLTIAPALLKELAESEGAIERKLSYTGEVKARPARITESEFLWQHNQDPMAVDKLAEGIRKFAIDQEKLEKMIGDLL
5010015020025030030025020015010050
020406080100120Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH1 (4-11)AH12 (246-254)EMPTYS8 (241-244)S1 (13-17)TIV1 (29-32)TIV2 (239-242)S2 (31-33)S4 (129-134)AH14 (289-315)AH3 (36-43)3H3 (126-128)AH5 (66-87)S3 (93-96)S5 (153-158)AH6 (105-122)3H2 (99-101)TI1 (101-104)O1 (134-136)AH7 (137-149)AH10 (201-216)AH8 (161-170)S7 (221-224)AH9 (179-189)TII1 (236-239)AH13 (278-286)TVIII1 (286-289)AH2 (21-27)AH4 (49-62)S6 (174-177)AH11 (230-235)3H1 (46-48)3H4 (197-199)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli
publication title Identification of catalytically important residues in the active site of Escherichia coli transaldolase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRANSALDOLASE B
total genus 137
structure length 316
sequence length 316
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2001-02-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1i2qA00
1GVFA 1I8JA 4R7JA 1ZAJA 2QCHA 3A5FA 2QCFA 3IIOA 2EKCA 4Q33A 2Y88A 3HO8A 3B0UX 1QWGA 1THFD 3PSWA 4GC4A 4XBSA 1G7VA 3I6RA 3LXAA 3CQ0A 1VJIA 4JTSA 1VLIA 2R14A 1YDNA 1PCKA 3I68A 1FDYA 1H63A 1D3HA 3P61A 1WX0A 5K2ZA 1VYPX 3W1MA 2X30A 3Q2DA 1JQXA 1W54A 1Q45A 3R2GA 3W6YA 3BG5A 3RNDA 1QAPA 3LRLA 2QJHA 2ZA2A 1I2NA 4M5PA 1F73A 4O17A 3P81A 1VS1A 3BVJA 4GWEA 3B8DA 2A1YA 2DZWA 2OMAA 2NXIA 3T4CA 4IJBA 3GYEA 3G1XA 5C54A 2CLMA 3O8AA 5I3FA 3GKFA 3S0CA 1W3IA 1RD5A 3GDTA 4ML9A 4DBEA 1OYBA 1ZCOA 3L21A 4GUJA 4LC8A 2RKXA 4JTGA 1WOBA 5K4ZA 2CZFA 3R8RA 3BPWA 4WOQA 1LOQA 2G97A 1GTHA 2DZUA 4UNLA 1FWSA 2J9YA 1LRTA 3QSRA 3KRZA 4Z08A 3IIVA 2JK2A 3YPIA 2X1SA 4C1LA 3NQ7A 1SUXA 2QJIA 5AHFA 3UWZA 3BGGA 4BFAA 3A24A 1GYLA 3NPUA 1GZGA 4K36A 1XUZA 4YLWA 3FOKA 4IQLA 4AAJA 3W7KA 2NV1A 1F76A 1W3NA 4R53A 4A3UA 3CEUA 2B7OA 4ZQPA 1I2QA 5FF4A 3G1FA 3SGZA 1UUOA 2GQ8A 3GXNA 1XKYA 3C8FA 1TTJA 4MJZA 3TC7A 1YTEA 4Z1AA 5HJLA 4N2YA 2YZRA 1ME8A 5F2IA 5H91A 3W1PA 3QMSA 3N14A 4DO4A 5LHFA 3NM3A 5HWNA 1SZEA 3GDLA 3HB9A 5J5DA 1XC4A 3N34A 1JRBA 2NX3A 4LC6A 1VCVA 3WK3A 2W6RA 3B06A 1JR1A 1U83A 3IRDA 3KFTA 1KM3A 2HMCA 4B5NA 4FX6M 4ADSA 4OE7A 1V7YA 1ICPA 3NG3A 3P8JA 1EA0A 4HSNA 4O10A 1L6WA 4LVBA 3FLUA 4NZFA 2NUWA 1AL7A 1QOQA 3LCWA 3G1HA 4HKPA 4N6EA 1TV5A 3P62A 3W2KA 4DPQA 3W87A 2C1HA 3TV8A 1G4TA 1EX5A 2G95A 1VRDA 1FWTA 2GVJA 2P0OA 2O7QA 5CPOA 3TR2A 4IWWA 1QPRA 4RZ4A 1TPUA 2PCQA 3TW6A 1QPQA 2EF9A 4JD4A 1OFRA 3W1QA 3FYPA 3CHVA 3T7VA 1NAL1 1VH7A 4XUGA 3QM3A 3LHWA 3HBLA 1SO6A 4U4MA 4NNBA 3UWWA 3SGUA 3SW6A 1P0KA 3NNTA 4JX4A 5F2LA 2CZDA 2Y61A 1TRDA 2NX1A 5HULA 1F6PA 4JR5A 3L68A 1W5PA 1TJRA 3QFEA 3FIGA 1YXDA 1R46A 4K39A 2QCLA 3P7YA 3S5ZA 2QEZA 3PG8A 3HF3A 3W88A 1Q6QA 5F2GA 3WK2A 1TPFA 1SO5A 2YFOA 3B0VC 4IXXA 5HWJA 1FCUA 5HNRA 1W1ZA 1T8XA 4POCA 4AH7A 1XBVA 1SFJA 4Q4KA 5IM51 3W7OA 3M5ZA 2Q8ZA 4XQ6A 1TPVA 4CNOA 1OYCA 5DLCA 4X3ZA 5H2ZA 1ZALA 2WJZA 5D2YA 2VELA 2ABBA 3UWVA 1T0OA 2A2IA 2NUXA 4RCXA 3PSVA 1EP3A 4PODA 2YCEA 4DPPA 1G69A 2QAFA 4LRTA 5KZMA 5F4XA 4R34A 1K8ZA 4NUWA 2ATSA 3F4NA 5D02A 1GT8A 1WBJA 5J5RA 3F1QA 1M6JA 3LBCA 3M6YA 1O4UA 1BEUA 1SU5A 1OFOA 3BARA 3W7QA 3TMLA 1KBIA 4LT9A 3NR0A 4L4MA 5GVJA 3OA3A 3IGSA 2E68A 2FDSA 4JY9A 3M0ZA 3W1NA 2YW4A 1JRCA 3ZWSA 1IXOA 3NA8A 5LZLA 1A5AA 3OVQA 1YDVA 2KZHA 1NF7A 4EF9A 4UTWC 3PBVA 4JTEA 1GOXA 2OX1A 4O53A 2A6LA 4UMBA 2HS6A 5TQLA 5D30A 1DL3A 2H3DA 3VI2A 4JX5A 1ADOA 1XM3A 4KFNA 4LOCA 3W1LA 3TU9A 3DHDA 4AWSA 3CIXA 4Z1DA 3OBKA 4A2SA 1H62A 3WJXA 4XBKA 1LLWA 1FWRA 1G6CA 3QH2A 1V5XA 3G1DA 3KVKA 1YPFA 2WSRA 5BMXA 5U4NA 5LGXA 1EIXA 5D2VA 1KFKA 3S42A 4ADTA 4QQ3A 3ABQA 3LM7A 3L66A 4IMDA 4PCFA 2YYUA 5FF7A 4O8RA 3MP3A 1MZHA 1LBLA 3NQ6A 4G1KA 1S5TA 4Y9AA 1CX9A 4S2BA 3EX6A 4OU1A 3G24A 2C15A 1OFBA 5EYWA 4EF8A 2A4AA 1OX4B 5I3GA 4MZYA 3NQ2A 2CLHA 3ABSA 3P8IA 3FS2A 4M6QA 4A2RA 2J9ZA 2EGZA 2F84A 5LNRA 3LHVA 5K7JA 2ZA3A 3NL2A 2ZRXA 5CGQA 3PUDA 1TPDA 4JS3A 4M7SA 2P1FA 3L5LA 5HINA 3TE9A 4ZQNA 5DELA 4N9BA 2ZZ1A 2GVGA 4UCGA 3SI9A 1SQ7A 3PC0A 4GFSA 2WSQA 3HG4A 4RZ6A 4EIVA 3GVGA 1LOLA 3CTLA 3FYOA 2FJKA 1DQXA 3W72A 5TBOA 3H55A 4LVFA 3DHFA 3PAJA 2A5HA 3NQAA 3P80A 3AO0A 4JTJA 4K37A 3QMTA 1W5MA 4ZQRA 4GRSA 2QAPA 3S5OA 4NU7A 4ZQMA 4HHPA 3LCHA 2NXHA 3IGXA 2B7QA 4O14A 4MVAA 4O4WA 3E12A 1IXPA 1I4NA 4AVFA 3MI2A 4LV4A 3B03A 5CSSA 3NYZA 1JCMP 4WOZA 5DY2A 5HUPA 1H7RA 4UMCA 5C2XA 3PB0A 4O13A 1FCBA 5AC6A 5IBXA 2J6XA 1BWLA 1O60A 2A7RA 3B05A 5I3KA 2TRSA 2R94A 2Y6ZA 2CU0A 5CZ0A 3UPWA 5CZJA 4OBTA 1Z48A 2ABAA 2PRMA 5AYZA 4I9AA 3LV6A 3NL3A 3A9IA 5L6UA 5BMWA 3GXPA 2D73A 4K38A 3T40A 3W23A 1FCVA 1BKSA 2QCNA 2E5CA 1DQWA 3DKLA 3G3MA 3TX9A 2I1OA 3R5EA 5E93A 3H53A 3IVTA 3WJWA 2Z6IA 2X2GA 4UTTA 4A29A 2QCMA 3SIZA 3TW7A 4IPJA 2EHHA 4RZ5A 4QIUA 1SSGA 2VXNA 1BWKA 5G2WA 2ZRYA 2ATMA 1FDZA 3ABOA 4GE8A 3LERA 1QDSA 2YX0A 2Y62A 2VFDA 4FNUA 3PF3A 3KHJA 3TQKA 2P10A 3M16A 4O50A 2FPVA 1J2WA 4IMEA 2OT1A 1N55A 4DEFA 3CLMA 2RDTA 3S8HA 3M41A 5D33A 3C6CA 3SJ3A 3W7PA 4QM1A 1KLYA 2QCDB 2Y7FA 2A6NA 4UNKA 1KA9F 4O1BA 4RV8A 1RR2A 3MW7A 4TR9A 3SZ8A 3KRUA 3L0GA 4O0ZA 3ZR4A 2BXVA 4UR7A 1OHLA 1Q6OA 1EP2A 1W0MA 3OVPA 3LTYA 4UTUA 3TAOA 4NXSA 3PBWA 3EX4A 3TMQA 2ZTKA 3DZ1A 1W5OA 2A0NA 3FA5A 1FUYA 1M7PA 1H1ZA 4FB7A 1DOSA 3MHGA 1WYIA 2Y7DA 3SR7A 1XI3A 3EXSA 1OFEA 5AHIA 5D09A 4JICA 5FI8A 1LZOA 3OEXA 4GUFA 1IF2A 1K8XA 4JX6A 1JCXA 2A85A 3UD6A 1OX4A 2B7PA 3LTSA 3N2MA 4CQAA 1H1YA 2WQPA 5EA9A 3L67A 2CLIA 1L2UA 1TV7A 4MZ8A 4DF0A 4A22A 1KBJA 3LTPA 5EBUA 1TTIA 3I7SA 4JTFA 1LLZA 2EAWA 4Y6GA 1KTNA 3KOFA 1F5ZA 1R47A 2PC4A 4NX0A 5T26A 1H7WA 2PE4A 2VKZG 3TFCA 2NWSA 1G4EA 3PULA 4RX0A 3CWOX 1GJPA 4FX8A 5DCBA 3HGOA 4ALDA 4P2VA 4EVZA 3NDOA 5CG7A 2VEMA 4E0CA 5LNSA 1XL9A 3THQA 4BWLC 2NUYA 3G1YA 1ML1A 6ALDA 1JULA 1C9DA 4BR1A 1GVSA 1KFJA 3KVJA 3HQ1A 1A50A 4N9EA 5D2TA 1B57A 3W71A 1LDCA 1N7KA 4Z0JA 3N9SA 1HG3A 5D05A 4FO4A 4XWUA 5G2IA 3CPRA 4H4IA 3CC1A 2V82A 3L5AA 4BK9A 5F4SA 2VFFA 3QZEA 1AW2A 4WXZA 4TMBA 1HFBA 5FF2A 3N73A 3STGA 1H61A 2AQWA 3W7MA 3ZFHA 2ZZ3A 4WQ6A 1Z41A 3W7EA 3C3NA 4LTSA 2H8XA 4FXSA 3CWNA 4X22A 3G8RA 2DZSA 5K4XA 1XBZA 4HPJA 3QC3A 3L9CA 4RXFA 3OIXA 5HQEA 1UCWA 1LCOA 4TX9A 3S5NA 3PY2A 1L6SA 1MXSA 4JTIA 4QITA 2J24A 5EL1A 1AK5A 4I7WA 2ZZ6A 3BG3A 3PB2A 1CI1A 4K8HA 1LTDA 4JYEA 1EP1A 2ZZ5A 2RDWA 8TIMA 1VCGA 4GUHA 1B3OA 4RKAA 4MOZA 2RFGA 1XXXA 3HPSA 3FKRA 4O52A 3TAKA 4ADUA 4WX2A 2CW6A 5HR7A 2X1RA 1TO3A 1TRIA 1AW1A 1JUEA 5LGZA 2Z1BA 4YXGA 1N8FA 4TO8A 4PH6A 2GJNA 2QUUA 1TSIA 1W3TA 2DU2A 5EPDA 2BZNA 1PHWA 4H6KA 1SW0A 1GWJA 2V9DA 3Q58A 3C2FA 3W1AA 4JTLA 4WY0F 3GR8A 2WOQA 4IOTA 1RPXA 3FKKA 2ZCGA 1MSSA 5D2WA 2VEKA 3TKFA 2XN0A 3UXDA 4HNUA 3MWAA 2FIQA 1D3GA 3BW4A 4UIOA 4UR8A 1M5WA 3GDKA 3IVSA 5EKYA 1LROA 2C14A 3PR2A 3G3DA 1RV8A 1NFBA 1OFDA 3W7RA 4FNSA 4HSOA 4GUGA 3LXBA 1P5BA 1TJPA 3EEGA 1OX5A 4LRSA 5BRBA 3NQEA 3GIYA 1KM1A 3DFSA 4XTDA 1KFEA 4ZQOA 5AYXA 4O4VA 4LS2A 2NWRA 5CZTA 1IXQA 4N02A 1B4EA 4M19A 4UFMA 4OV9A 1W37A 1X7FA 1KM2A 3LLDA 4WY0A 4OGZA 1T96A 1TREA 2BSLA 1MEWA 4OV4A 2NXGA 4PC8A 2ZRZA 3NAVA 4Y8FA 1XFBA 3P82A 2YDAA 1UASA 2C16A 4RR4A 2HSAA 5HWMA 1DJQA 3CT7A 4MYXA 1NVMA 1I45A 3TROA 2DP3A 1X1OA 3A21A 3GNNA 2Y7GA 1KM4A 2CLEA 4XKYB 4BF9A 4FNQA 3MI3A 1C29A 3W7DA 4N4PA 4MPQA 2CLFA 3TXZA 1O94A 2RDUA 4JYDA 5C55A 3IIXA 4M6PA 3NQCA 5LHEA 3DFOA 2VFGA 3F4WA 3VNDA 3B4UA 3W22A 2WPBA 1QFEA 1ME7A 1R2RA 4CQ8A 1OYAA 3P60A 4JIQA 5D32A 5FEWA 2YPIA 4CCEA 3TJLA 3GKAA 1VYRA 4O18A 4RXGA 2I14A 3EWYA 4NXKA 1GG0A 1XCFA 3O6DA 1YADA 3LDVA 2X1UA 3LCIA 4O12A 4NJIA 5AFDA 4DO5A 4JTHA 2C19A 1ZAHA 1SO4A 4FIRA 1JUBA 4R33A 3TJXA 1J4EA 3TSBA 1F74A 2R8WA 2WNNA 2AAMA 3LOTA 3KVLA 2F7FA 3W7LA 5LNWA 3MP5A 5AHLA 4IX0A 3B0PA 1KTBA 3NZRA 5DBTA 1IXNA 1GVRA 2VFHA 5D38A 2V81A 3Q94A 1P4CA 2EPHA 3NM1A 1DV7A 2C13A 2QCGA 3S9YA 2CZEA 2RH9A 2BLEA 1DBTA 3MI6A 3MP4A 3NPXA 2OT0A 4NT0A 1EPXA 4LY8A 1TYGA 2V30A 3ZS4A 2FPYA 1MEHA 3NPWA 2DZPA 2QKFA 1A5CA 3DKJA 2JGQA 1LRQA 2FPTA 5AB3A 4MFEA 5FF0A 4AHQA 4OQVA 1SZFA 3G1VA 3QYQA 3A23A 3L2IA 4TMCA 4IMFA 3T55A 1A5BA 3M9YA 2Z6JA 4KFOA 4RJEA 3DENA 4O1CA 4ZQCA 4JDYA 3PUOA 3IV3A 2FB3A 4FXRA 2A21A 4O1AA 1ZFJA 4UFJA 2BX7A 1LYXA 4DELA 5BOOA 1E51A 1WBHA 2VENA 4XTIA 5C5YA 2A7PA 5AN7A 4YWIA 4DXVA 6TIMA 3BO9A 1K7XA 2TSYA 3NOEA 3NQGA 3ZWTA 3KAOA 3PM6A 3W7NA 2JBMA 3VE7A 1KV8A 3W84A 1ALDA 1RQHA 4UXDA 4Y90A 3FFSA 3IGUA 2VFIA 2NX9A 1S3HA 3OHIA 4OWGA 3W85A 1ZJIA 1G4SA 1H7PA 5I3JA 1OFQA 1U5JA 1B4KA 3U2OA 3TK7A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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