1I2QA

Crystal structure of escherichia coli transaldolase b mutant t156a
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
TDKLTSLRQYTTVVADTGDIAAMKLYQPQDATTNPSLILNAAQIPEYRKLIDDAVAWAKQQSNDRAQQIVDATDKLAVNIGLEILKLVPGRISTEVDARLSYDTEASIAKAKRLIKLYNDAGISNDRILIKLASTWQGIRAAEQLEKEGINCNLALLFSFAQARACAEAGVFLISPFVGRILDWYKANTDKKEYAPAEDPGVVSVSEIYQYYKEHGYETVVMGASFRNIGEILELAGCDRLTIAPALLKELAESEGAIERKLSYTGEVKARPARITESEFLWQHNQDPMAVDKLAEGIRKFAIDQEKLEKMIGDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Identification of catalytically important residues in the active site of Escherichia coli transaldolase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRANSALDOLASE B
molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli
total genus 137
structure length 316
sequence length 316
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2001-02-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1i2qA00
3W84A 5FEPA 5I3KA 4HHPA 2V81A 3EB2A 3USBA 1G6CA 3EEGA 4UTTC 4RZ4A 2YYTA 1L6YA 3GIYA 1SFJA 4JTLA 2ZYFA 5H2ZA 2A5HA 4AF0B 2BX7A 4QJ1A 1YXCA 2VFEA 1C29A 4IOTA 4NZJA 2UV8G 1EP3A 1JR1A 3JRKA 3NAVA 4XUGA 1UB3A 4O0KA 5AHMA 5D2TA 3YPIA 1FCQA 1DJQA 3LTYA 3FA5A 2J9YA 5DXYA 5TQLA 3G22A 4AHOA 3NL5A 4GNJA 4HT3A 2ZZ2A 5BW6A 4LTSA 4P61A 3GR8A 1GVSA 3BG5A 1GTHA 3QZEA 4JTSA 1OYCA 1HUVA 4N4PA 2KZHA 1AW2A 2Q3RA 5K3VA 3HGJA 2I1OA 1LTDA 4UFIA 4NZFA 3IIXA 4JDBA 1XUZA 3W7RA 3GXPA 1Z44A 2TYSA 3W7QA 4O1CA 5AFDA 2IQTA 1Z41A 2LLEA 3NQCA 5AYYA 4MLRA 4BI7A 2CZ5A 3W1NA 1OFOA 1VS1A 4JGDA 3PVFA 3FFSA 1PHQA 1FDJA 1RV8A 2YGYA 3P84A 1G4TA 1JULA 3UWWA 3TK7A 3ZWSA 2ZZ4A 4Z1DA 4WZHA 1VHNA 1EPXA 5EL1A 1VGAA 4LUIA 3HGSA 2ZA1A 3TSDA 3L5LA 5D2VA 3MHUA 4QISA 3EKZA 4RR4A 3TXVA 3CWNA 3C6CA 3EKLA 4UR8A 2FDSA 1GPWA 4M6VA 3HMJG 2WPBA 4CQ9A 4UFMA 4RXFA 4QIUA 1PIIA 3KRSA 3NYZA 1TB3A 1J5TA 1X1OA 1KFCA 2H8XA 3UWZA 5LHFA 3CM4A 1LRNA 4OBTA 6TIMA 5ABTA 3GDTA 4GBUA 2JKPA 1H1ZA 2O7QA 1QPNA 3MI6A 5E0KA 3IIOA 4FNSA 1TPUA 1GTEA 3O15A 1GG1A 3UPWA 5FESA 1S5TA 1XDMA 1VC4A 3H53A 3PG8A 3W1MA 4R53A 4KWVA 3M47A 4O1BA 1VZWA 4X22A 5HINA 4HPXA 3TSMA 2V5LA 3HB9A 4JR5A 1TTQA 2ZTKA 3GDKA 2V2HA 1KFEA 4FNQA 4IUOA 3UXAA 4RXGA 3INPA 3W1QA 5AHLA 1C8VA 4OV4A 2DZUA 5HUPA 5I3JA 3W1TA 3H55A 1WBJA 1TPVA 3LCIA 3C4UA 4BF9A 3UWUA 3P61A 5FEZA 1H61A 4FXSA 4YXGA 2QCGA 4XBKA 3NG3A 3W71A 1NAL1 1UUMA 4I9AA 4OGZA 4PC8A 2G5WA 2QUUA 4Y90A 4E0CA 1HG3A 5DY2A 3W74A 3P82A 2A7NA 2X1UA 2NXGA 1OG0A 5D38A 4EF8A 1RVGA 1P0NA 2DZXA 4IPJA 2YXGA 4ZVJA 1CW2A 1GWJA 3KVKA 3DKLA 2WJZA 2BWGA 1ICPA 3C2RA 3NZRA 3HQ1A 1H50A 1H7OA 3ABRA 4O50A 4UMAA 2HS6A 1R2SA 1F73A 4ZQOA 1N55A 4MY9A 1EWDA 4NJJA 8TIMA 3P7YA 5D32A 2AGKA 4JTFA 1K7FA 1OFPA 3KFTA 1OX6A 3HG4A 5KMYA 2GQ9A 1OK4A 1U5JA 4LVDA 4PH6A 2ZRUA 2J9ZA 3THAA 4JTUA 1HTIA 3WK2A 3TMQA 1YLVA 4XKYA 3W83A 1YTDA 3NPXA 2EF9A 2Y6ZA 4LW7A 4YL2A 2QCNA 3M16A 3T78A 3ELFA 5CPMA 1GYNA 3CU2A 2VFHA 3W87A 3M0ZA 3DKJA 1M7OA 1E51A 4FXRA 2YYUA 3LRMA 1IIGA 4GJ1A 1P5BA 2ZTJA 1EUAA 1ME7A 5HUOA 1H51A 2FLIA 1X8FA 1QR7A 3MW7A 4RJEA 3S5ZA 3TJLA 1IXPA 3BGJA 1FCBA 3HG2A 1B3OA 4HNTA 1VCVA 1SO3A 3UY7A 2GUUA 1DL3A 3UPBA 3DFSA 4MJMA 4GC4A 1LROA 5G1TA 2NV1A 5K2ZA 2P10A 4ADTA 4K36A 2C14A 3WJYA 3MYOA 3EWUA 1F6KA 4IX0A 2YPIA 3C56A 4X9SA 3H54A 1O5KA 2FPYA 5LGXA 4ALDA 2VEKA 2NXIA 4FNPA 4UCGA 5L9FA 2Z1BA 2OT0A 1XFBA 3E49A 3E96A 1JVNA 1PE1A 1TPWA 1WDWA 4CCCA 3NQDA 3FOKA 1SPQA 3TFCA 3I6RA 3NQAA 2RH9A 4KFPA 1W3IA 2ZBTA 3L0NA 3W7MA 4XBSA 4UTWA 1ZFJA 2Z6IA 5HULA 3M5YA 2CLOA 1VJIA 3TKFA 1RQBA 3M43A 4TR9A 2I14A 3O6CA 1LORA 3E9AA 2OMAA 5D05A 1Q6OA 1S5WA 3FEMA 3BGGA 2BLEA 1BTMA 3FYOA 3AO0A 2JKEA 2A21A 1W31A 1J2WA 4TIMA 1G4PA 1W3TA 5F2IA 1Q6QA 1TPH1 1Y0EA 3PS7A 4O12A 4EWND 4NVTA 3TSBA 1H7XA 1NF7A 2CLHA 2YZRA 3M9YA 4UFHA 1B9BA 2H90A 4JX5A 4K6AA 4OHQA 4O10A 2A7PA 2GVJA 1GEQA 3O16A 4LWWA 1R47A 3A9IA 5K9CA 3W07A 1I8JA 1OFAA 4RCXA 5C54A 4BK9A 3TAOA 3QMRA 3I7QA 4HPJA 2B0MA 4NNBA 3SGZA 1IF2A 2DZWA 3MP3A 3PBVA 2V9DA 3EWWA 1KFJA 3G1XA 2QCDA 5HMSA 2WSRA 1O5XA 3W85A 4MIMA 4UTWC 4Q4KA 1GG0A 3LX9A 1U83A 3I65A 4WY0F 5DCBA 2Q8LA 1VCFA 1QO5A 3PF3A 1NFBA 3DXIA 4JD4A 4ZZ9A 1GVOA 4EF9A 4HKPA 4UTKA 1ZJIA 3TROA 3QC3A 4UMBA 4CNNA 5GVJA 1FX6A 5HNRA 1W5OA 4LV9A 4AVFA 4UIOA 4KWWA 3EWZA 3WK1A 4N02A 1H62A 5CPNA 1TO3A 3O8AA 1RZMA 2C1HA 4O11A 4O18A 3G1DA 3TX9A 1QPOA 2A7RA 3NEVA 4HNUA 3IIPA 2V2CA 3A22A 1TRDA 1PCKA 4WY0A 5DN1A 4HN4A 4S2BA 3TQVA 4Z1AA 3MI3A 1KLZA 5AC6A 3G8EA 3IIVA 2QCHA 1LP6A 2QR6A 1DKWA 4IXXA 3TR2A 3STGA 2RDUA 2ALDA 4DO4A 3GKAA 3L5MA 4CQ8A 1WV2A 1EB3A 1XCFA 4IPIA 3MHGA 3HIJA 1IXQA 5EKYA 2EAWA 4PODA 1CI1A 5J5RA 5KTLA 4LS2A 4KFOA 1K8YA 1OX5A 3MWAA 2Y85A 5EYWA 2CFFA 5EBUA 3TH6A 1AK5A 3G18A 3MYPA 1LBFA 4MLJA 1KM1A 3W9ZA 5BMXA 3G0XA 4MZYA 4O17A 3U2OA 4X3ZA 3MP4A 2ABBA 5E93A 5HR7A 3LCGA 2WSYA 2DZPA 2VC6A 2A1YA 4DXVA 3QPYA 2QAFA 4WXYA 1S3HA 3I7SA 4UFKA 1YDOA 4LU0A 2G97A 4R33A 3QFEA 5FF2A 4NUWA 3UYCA 2E6AA 3DI0A 2CW6A 3MP5A 2C3ZA 5HWJA 1RR2A 1DHPA 3P5YA 4JIQA 4NJGA 2ATMA 1TREA 3W2JA 4TU1A 4JEQA 2BTMA 4YCPA 2E5BA 1ZNNA 4OU1A 1I2QA 3RLVA 5F4WA 1ZENA 3N2XA 1FCVA 4RKAA 5T26A 4NQ1A 4PL2A 4WXZA 1KV5A 3GLCA 1C9DA 4PEKA 1WYIA 2B7OA 3ZS4A 1SO5A 4DBDA 3F4WA 4CCEA 2YFOA 4JN6A 1WAUA 3HGRA 4OE7A 3GXNA 2CZDA 4AB4A 1J4EA 1DJNA 1LOSA 4XKYB 5LNSA 1Q3NA 1OFBA 3LRKA 5AHFA 3O63A 2E6FA 3TMLA 3TU9A 2WO5A 5K4ZA 1XKYA 1LRTA 3NA8A 1H7NA 4O54A 1KM4A 2WNQA 3GKFA 3IRDA 1YADA 5J5DA 5FF4A 1PHWA 1Q6LA 1HO1A 2E6DA 4K39A 3SGUA 1PCWA 4UTUA 2GOUA 3TFXA 4LC8A 1Q45A 5D2XA 1M6JA 3BK0A 1ML1A 4AEOA 2ZZ6A 3LCXA 4Z08A 1NEYA 3KHJA 3PSWA 5KZEA 1EEPA 1QOQA 1KTBA 4QM1A 5AC8A 1FCUA 5FEWA 1GT8A 2ZCGA 3KRZA 1GVRA 3W7PA 1TQJA 1A5CA 1I2NA 2YDAA 2YR1A 3NOEA 4JYEA 1SW7A 3UWQA 5AB3A 3M5VA 2EHHA 4IX2A 2B4GA 4FF7A 5CPOA 1QPQA 2C19A 1Z48A 2QCMA 2QCCA 1MEHA 3EXTA 3W6YA 2NWSA 3W7KA 3S1XA 1OFEA 4ZQNA 3N73A 3Q37A 2E6YA 3OVRA 4CNOA 1FY6A 1W54A 5CG7A 3L21A 4NT0A 1SO4A 4DEFA 1XBVA 3VFLA 1QOPA 1TYGA 3QW3A 3GDMA 4BI6A 2TMDA 4JY9A 2H8ZA 4JYDA 3CEPA 4AAJA 2B7QA 4TMBA 2OJPA 1F05A 4JTIA 1VLIA 1TTIA 4NXSA 4I7WA 1EA0A 3S42A 1ZHAA 3CIXA 1SZNA 3RFAA 5F4XA 1THFD 2X30A 5AOUA 3HF3A 4BWLC 1W5MA 3TDFA 5D04C 1A53A 4MY1A 4E38A 2ISVA 2FPVA 3EX4A 2ZA2A 1K8XA 3TQ0A 3T4CA 3L0KA 2A85A 4LUJA 3PM6A 3LLFA 1UCWA 1KLYA 2ZZ5A 4PA8A 1OFRA 5CGQA 3MMTA 2QUVA 2NLIA 3VCRA 3IVUA 4IMCA 3LGEA 4FEZA 5FF0A 1P4CA 3SSJA 3QSRA 4ICNA 3TA6A 1OABA 1SR9A 3NGJA 3B03A 2NX3A 1H7WA 4CLMA 5LNVA 4BI5A 4CNPA 4YLWA 2G96A 4JTTA 3S9YA 4DQWA 3SY5A 2QCDB 3GYEA 3GDLA 3O05A 3QMTA 2BXVA 4GE8A 2QJIA 2YCEA 3IEBA 4FHAA 4GRSA 4ADSA 3LBCA 2P0OA 1DQXA 1IXNA 3PY2A 2AAMA 3FKRA 3P5ZA 3BO9A 2GQAA 3P62A 3M5XA 1OFQA 4XWUA 1O4UA 4GUIA 3S1VA 2X1TA 4WQ6A 3LV6A 4JTKA 3STEA 3O06A 3CHVA 5AHIA 3E12A 3M7WA 2NUXA 5DCEA 3C8FA 3W7LA 4HSNA 4ML9A 5E1QA 1I2OA 1QMLA 2J88A 5KZDA 3W2KA 3P81A 1XC4A 1BEUA 3T55A 3FLUA 4WY0B 3HG3A 4Z1CA 3C2EA 2G95A 2J6XA 3QYQA 2Z2UA 1DBTA 3GB6A 4OT7A 4UTJA 2QKFA 1YDNA 2CLFA 1X1ZA 2E77A 1A5BA 1SZGA 3KX6A 4JXCA 3KRUA 3L65A 3SJ3A 1KBIA 3PWAA 1B4EA 3W7HA 5SWUA 4JIPA 3NQ8A 3CQ0A 3WJWA 4AWSA 5C5YA 3P8JA 5EPDA 4O0ZA 1BWLA 1KV8A 2B7PA 4MFEA 3L66A 3OBKA 4Y6GA 4M7SA 2VKZG 3LXCA 3F4NA 5BRBA 1LOLA 4DF0A 5D2WA 4UNKA 1AG1O 1VR6A 4TMCA 3FIGA 3O1NA 1ZAHA 2BZNA 2D73A 4O15A 1OF8A 1GYLA 1WBHA 4TO8A 3CC1A 4KFNA 1K7XA 3OIXA 1K3UA 1GJPA 2Y7DA 1O94A 3GX9A 2CWNA 4IJBA 3E0IA 3M44A 4ZQCA 3TQKA 3THQA 4N9EA 1ICSA 4MYAA 4IWWA 1SW0A 2DZTA 1XBXA 1HO4A 3SIZA 2WV8A 4AHQA 3EWBX 3PBYA 2H3DA 2VXNA 2DU2A 1JRBA 5D2YA 3P80A 4FO4A 3W7OA 3SZ8A 2OZ0A 4U28A 1OVDA 4N4QA 3UY8A 4K7YA 2FTPA 3LXBA 4PTNA 2ZRVA 1FDZA 2PC4A 1F6PA 1GOXA 3VE7A 2VEIA 4M7TA 3LI1A 1A5AA 1UUOA 1TQXA 1F2JA 3G1SA 2VFDA 1MXSA 1H5YA 5MHBA 3FYPA 4Z1BA 3EX6A 1Z42A 3AJXA 1F74A 5EA9A 4K38A 1OYBA 5D03A 1JQVA 2F84A 3KVLA 2GJLA 3W7DA 1TJPA 3ZFHA 3M5ZA 2QEZA 5BOOA 4UMCA 4UTIA 4I7VA 5LZLA 1K8ZA 1O95A 3GNNA 4ZQRA 5AN7A 1R30A 3DGRA 4JTEA 3PULA 3SW6A 1ALDA 1XUUA 1G7UA 5TBOA 3W2UA 2Y63A 3B0PA 3STCA 2QJHA 3N19B 2W0UA 1VQTA 3CLMA 3R2GA 1W1ZA 1KM0A 3W7EA 4FX7A 2NXHA 2Y62A 2PCQA 3TIMA 5DELA 1V5XA 3Q2DA 3M6YA 4IMFA 5HWNA 2RDTA 4D2JA 3PC0A 1JCNA 3G1AA 5HJLA 3HPZA 3B04A 3S1WA 1KTNA 1OHLA 4BFAA 1AL7A 4NX5A 4O19A 3TE9A 1VCGA 3PUEA 4MZ1A 5IM51 4NU7A 1OJXA 2X16A 5FF7A 3PAJA 2VFIA 3B0VC 1UBSA 2B7NA 4DF1A 1PL9A 1IGSA 3PR2A 2E1DA 2TRSA 5CZSA 2ISSA 4FIQA 3S6DA 3ABQA 4M6PA 4MZ8A 5KITA 2YFNA 4UFLA 3DENA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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