1I2QA

Crystal structure of escherichia coli transaldolase b mutant t156a
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
TDKLTSLRQYTTVVADTGDIAAMKLYQPQDATTNPSLILNAAQIPEYRKLIDDAVAWAKQQSNDRAQQIVDATDKLAVNIGLEILKLVPGRISTEVDARLSYDTEASIAKAKRLIKLYNDAGISNDRILIKLASTWQGIRAAEQLEKEGINCNLALLFSFAQARACAEAGVFLISPFVGRILDWYKANTDKKEYAPAEDPGVVSVSEIYQYYKEHGYETVVMGASFRNIGEILELAGCDRLTIAPALLKELAESEGAIERKLSYTGEVKARPARITESEFLWQHNQDPMAVDKLAEGIRKFAIDQEKLEKMIGDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli
publication title Identification of catalytically important residues in the active site of Escherichia coli transaldolase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRANSALDOLASE B
total genus 137
structure length 316
sequence length 316
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2001-02-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1i2qA00
1D9EA 2FDSA 1QPOA 1VYSX 1AG1O 2E6FA 3B05A 4E38A 2RHGA 4MLRA 3W7LA 4DQWA 2C19A 5CPOA 3M43A 4O16A 3P62A 3EWYA 3NZ1A 4NJHA 1ADOA 1TTIA 5I3HA 4CQ8A 1G6CA 2J27A 4QNEA 4UC5A 4AH7A 1DVJA 4YLWA 1H7RA 3NAVA 1PIIA 4QSHA 4N9EA 2F84A 3RLVA 5D2WA 1KFLA 4HPJA 4E2DA 3UWQA 4WY0A 5DCBA 3TDFA 4CQ9A 1VCFA 1VZWA 2R94A 1Z42A 2Z6IA 3S1XA 1KM3A 3LGEA 3G24A 4LS0A 1TIMA 4WJEA 4JYDA 3PWAA 3G1DA 5FEPA 4HPXA 3I6RA 3TX9A 5AC6A 3VE7A 1NAL1 4JR5A 3JS3A 3DFQA 4XWUA 1U5JA 3S9YA 1OK4A 3L0GA 3STGA 4JYEA 5T26A 1TQXA 1OABA 4S2BA 3SGZA 1VC4A 5EMUA 5KITA 3E12A 3IIVA 4O14A 1EP3A 1TRIA 3LHUA 3OVPA 4O19A 4DPPA 1ZNNA 3UWWA 4TMCA 1P5BA 2BX7A 2QUUA 1AW1A 4YCOA 4N9BA 2WNNA 3GKFA 4LTSA 1O94A 1H60A 2G96A 4ALDA 4Y96A 1JUKA 4O1BA 5E0KA 1VCVA 4E2BA 3UXAA 3LCWA 1UUOA 1HO1A 4MOZA 5DXYA 3CHVA 3IIOA 4JDYA 4ZQOA 1L6YA 3EXTA 3PUOA 4KFPA 4O53A 3M5XA 4UIOA 4UNKA 5HR7A 2JBMA 3ABQA 3T4CA 4MYXA 3HG3A 4O15A 1HUVA 1X7FA 3LBCA 1JULA 5AHIA 4GWEA 3G1YA 2CW6A 1A53A 3Q94A 3LRLA 1WDWA 5CPMA 4JYFA 1F74A 1QCWA 5C6MA 3FS2A 4JD4A 5AYXA 1DOSA 2QCDB 4O57A 3E49A 4KWVA 2LLEA 4UFMA 4OGZA 3L2IA 4LVAA 3FA5A 4UTKA 1SSGA 1PE1A 3W83A 1F76A 4CCCA 3BK0A 4Z0SA 4GUGA 4G1KA 3MJYA 2JKPA 3L5LA 1SO4A 5BOOA 2WKJA 1AK5A 5CZTA 1OFBA 4GUFA 4A2RA 4AAJA 1I2QA 3P60A 3W2JA 3NG3A 4MZ8A 1JQVA 3THAA 4QISA 1ME9A 4FO4A 3ELFA 5G2IA 1KTBA 2FTPA 2QCDA 4IX0A 3C3NA 4FIQA 4UTUA 1AL8A 3P84A 3LHYA 1K02A 2WSQA 1TTPA 4K8EA 4ML9A 5FEWA 4IMFA 3TKFA 3W1PA 2V0TA 1J4EA 5C2XA 1SZGA 2C18A 2OX1A 1Z44A 1DQWA 3WJXA 1KFBA 1K7XA 1XL9A 4K39A 4A29A 2I9EA 1LTDA 1EUAA 2Q3RA 2Q8ZA 5DXXA 2YZRA 3LDVA 4PL2A 2QAFA 4QQ3A 3FJLA 3GDKA 2O7SA 3TAKA 4JTHA 3LCIA 3S0CA 3F4WA 1R2TA 3UQNA 4AEOA 4OE7A 1K8YA 3QPYA 1FWTA 4N6FA 1ML1A 3L65A 3N9RA 4FXSA 4JTFA 2H8ZA 3Q58A 1I45A 5TQLA 4JIPA 4JS3A 4MKNA 3W6YA 4BI7A 3BG5A 2VFGA 4O28A 3BW3A 1TV5A 1YLVA 1V5XA 2Y7FA 3VI2A 3N3MA 4FX8A 1RPXA 1KM1A 3TUUA 2WOQA 2C16A 3G1XA 2HTMA 3P82A 1H7OA 2Y63A 5K7JA 3HGSA 3TE9A 1RR2A 1GTEA 6ALDA 3GAYA 4UTHA 4BI6A 3EX1A 1LDCA 1MEHA 2CLOA 3LM7A 1TPH1 4IOTA 1FCBA 3W22A 2YX0A 3W2UA 3PAJA 1A5CA 3O1NA 4O18A 3BV4A 2TRSA 1ZALA 3S1VA 2CLLA 3LTSA 5C55A 3EB2A 3PR2A 3S5NA 1X8FA 4YWIA 1LYXA 3BLFA 3LRMA 4JICA 1VLWA 3LX9A 2TYSA 4UTLA 1OFAA 1I2PA 1O5KA 1TB3A 3LCHA 3SSJA 4A22A 4DF1A 1HL2A 2YFNA 1DKWA 1JCJA 2ZRUA 5SWUA 4XKYB 4IXXA 4JTJA 5L9FA 2WPBA 2ZBTA 3CIXA 2E5CA 1Q6RA 1IXQA 1TV7A 1JRCA 3JR2A 3PUEA 2XN0A 2Y89A 4JEQA 4M19A 4UR7A 3LHWA 1WOBA 3MI6A 4M7SA 3B06A 3ZR4A 1RVGA 5HNRA 3NQ8A 3C56A 3MI3A 3CT7A 4PFMA 5C5YA 2X1TA 4NZFA 4NXSA 3C6CA 1C8VA 3IVSA 5FEZA 3RF9A 1SFLA 4OT7A 4PA8A 2D73A 4WD0A 4H3DA 1W3TA 2V5BA 5HJLA 1XXXA 1TCDA 3ANYA 4XKYA 1TPWA 5K9DA 3TC6A 2ZA2A 2JKEA 3G8EA 5LNWA 3STCA 3EXSA 2HSAA 2TMDA 1WQ5A 1PHWA 2ISVA 2B4GA 1R46A 1UCWA 4RXFA 4GBUA 1PS9A 4GXMA 3M5ZA 4PODA 1LBFA 3NYZA 5EA9A 5KZEA 1W31A 1GG0A 3W7NA 4K8HA 1GT8A 1N8FA 4HHPA 1XBYA 3L5AA 3UWZA 5F2GA 3TW6A 4CNPA 1SQ7A 4BK9A 3FKKA 3R13A 3LTPA 3QMRA 3SGUA 4N02A 5CZSA 2JGYA 1JUBA 2AQWA 3PB2A 3L21A 3RNDA 1IXOA 1IIGA 3R89A 1AW5A 1R2RA 3TXZA 1H50A 1GQNA 3LV6A 4JX5A 3CM4A 1BWKA 3M0ZA 2GPTA 3C2OA 3W7JA 2O7QA 1SU5A 4ZQRA 1KA9F 3GVGA 4JTLA 4MYAA 1YADA 1BEUA 1GVSA 2Q3OA 1TJRA 3TROA 4M7TA 3OVRA 3HO8A 4HSNA 2ZA3A 4WXYA 4DO5A 3HOJA 2V30A 2ZZ7A 4UTTC 2FJKA 1H7XA 3QF0A 1TPDA 1ME7A 2QCCA 2QUTA 5HWMA 3MBFA 1W3IA 4EIVA 5BRBA 1FUYA 4X2RA 5CSRA 2Z1BA 1I8JA 3O05A 3GDMA 3B03A 1OJXA 1WAUA 2XFWA 3EX3A 2Y61A 3MO7A 4O11A 3L0NA 1TPFA 4N4PA 4W9TA 3N9SA 2DZTA 4JTEA 1X6UA 1S5TA 3L68A 4QNWA 1YXDA 4JDBA 5AYYA 1VLIA 2H90A 3FYOA 3W1QA 4UFHA 1S5VA 1G7VA 1KW1A 1WOAA 3HPZA 3DFTA 4AWUA 5DLCA 4MJZA 4UTWC 3EX2A 3P8IA 4UTIA 2OZ0A 1UBSA 2GUUA 4AVFA 5FI8A 3F4NA 3TJXA 3WJSA 5H91A 4QM1A 2QJHA 2E5DA 3QW4B 2CZDA 3G22A 1JVNA 4OU1A 2QCMA 3NL5A 3E02A 3INPA 3BW4A 5AC8A 3TV8A 3GB6A 2CLMA 4EVZA 4RKAA 4HNUA 3LXCA 2ISSA 2I14A 4RK8A 1SPQA 4UTTA 3SJ3A 4AHOA 4NT0A 4IMCA 3QW3A 1RQHA 3B0VC 3W7DA 1KM2A 3WK0A 2P1FA 1N55A 4C1LA 4KFOA 3QM3A 3TSBA 1OX4B 2W6RA 3A5VA 4Q4KA 1FWWA 2VFIA 3DFSA 5HINA 1GOXA 1TPUA 3W71A 1J5TA 4BR1A 3UY8A 3MP4A 3NQ7A 2OT1A 2PURA 3B4UA 3G1FA 2W79A 2VEPA 3CLMA 4JNMA 1LORA 1SR9A 1ZHAA 1K7FA 4XTIA 3TFCA 3JRKA 4JTKA 4UXDA 2E6YA 4GRSA 2C13A 3O16A 4UFJA 2R91A 5FF4A 4UTWA 1VRDA 4BWLC 2ZZ3A 1MSSA 1KM5A 3KRUA 3NPVA 1W5MA 1W37A 2P0OA 5F1VA 1LROA 1OX4A 5KMYA 5AHEA 3L67A 3TMLA 1EB3A 4ZL1A 1VR6A 1I2RA 1RD5A 3O06A 1OHLA 5F1UA 3W70A 1HTIA 2NUYA 3P61A 1DBTA 5CSSA 4FB7A 4RJEA 5G5IA 2CU0A 2CFFA 3LLFA 1VYPX 1B4KA 3IGUA 1M5WA 2VFHA 4MZ1A 4LV4A 4M5PA 2VXNA 2EHHA 4DF2A 3TNOA 1GVRA 2CZ5A 2NV2A 5EYWA 3SIZA 1JR1A 1TMHA 3UWYA 5DCEA 2FB3A 5C54A 3NDOA 4UUIA 4JIQA 2ZZ1A 4ICNA 4Q32A 1KFCA 3W1UA 1LOQA 5E1QA 1QPQA 1TPB1 2ZTJA 5D2VA 3LLDA 2BSLA 3ABRA 2J24A 1W0MA 1L2UA 1KFEA 4JX4A 1LP6A 1OX6A 3DGRA 5D04C 1A50A 4BI5A 1EA0A 4LY8A 3PVFA 1WV2A 5LKYA 1DQXA 1UJPA 3S5YA 3PBVA 1BKSA 3V75A 4N4QA 1VQTA 4CNOA 2EAWA 1HFBA 3TAOA 4LVFA 3G1AA 1SO5A 3BPWA 2E09A 4FNQA 5K2ZA 1LZOA 1KM4A 3TQ0A 4BWLA 3LERA 3UPWA 1YTKA 2X1SA 1H7PA 3LTYA 4LRSA 3L0KA 1EP1A 4Q33A 3RFAA 3ABOA 5KZDA 4POCA 3THQA 2NWRA 3M7WA 5HULA 4LS1A 2H8XA 3PY2A 3M16A 4E0CA 3N14A 1KV8A 3TCEA 3W88A 4I7WA 4MY1A 3W76A 3ATZA 3EX4A 2WNZA 4N6EA 3LHZA 5EKYA 1YDOA 5I3JA 5IBXC 1W3NA 3C4UA 3O8AA 1FWRA 3GNDA 2QKFA 3G1SA 2A6NA 1Y0EA 3B04A 3IVTA 4AF0B 3KRZA 3O6YX 4ADTA 2CLHA 4NJGA 4JTSA 4XQ6A 5TBOA 4U4MA 4KKXA 1VGAA 5L6UA 2QUVA 3TW7A 2A4AA 3G1VA 1TPC1 5FF2A 4ZQNA 4J9JA 3WK2A 1G4EA 1LLWA 4O1AA 3OA3A 4GNJA 2DZSA 5HR6A 3GDTA 2VELA 4ZMGA 4MVAA 2OJPA 1JCXA 2E6AA 2FIQA 1VCGA 3BG9A 5EBUA 3DH7A 3I65A 2X2GA 3IIXA 2NV1A 4FEZA 4LUJA 3A5FA 1W56A 5CGQA 1SZEA 2NZLA 2QJGA 6TIMA 4AF0A 3WJYA 4IX2A 4K38A 3CQ0A 3NPXA 5BMXA 2RDUA 3STFA 1OK6A 3NPUA 2X1RA 1QR7A 3FJ6A 3B0PA 4FNUA 2BTMA 4ORMA 1JQXA 3W73A 5HWJA 1SFJA 4Z1CA 4O12A 1TV8A 4YL2A 1GVQA 2ZZ4A 4K6AA 5EY5A 3HG5A 1A5BA 4PH6A 4ZQMA 3DFNA 1LRNA 4H4IA 3GK0A 3T7VA 3UZ5A 5IBXA 3M6YA 1FBAA 4L4LA 3G0XA 3NQAA 3E9AA 5BMWA 3CU2A 1G4SA 3K30A 2YW4A 3KFTA 2ZCGA 1D3GA 1BWLA 2J88A 4IMGA 3HGOA 3NL6A 3CIWA 5I3KA 5BW6A 3NQFA 4ZQPA 1FWSA 1QPRA 2RKXA 3A24A 1HO4A 3PSWA 5AOUA 4DXVA 4DPQA 3M5VA 1O4UA 3N2XA 3DI1A 1DORA 1TO3A 3ABSA 1WXJA 4MY8A 2WV8A 1ALDA 1Q6OA 3UXDA 3KVLA 4IJBA 4O17A 2GOUA 5F4SA 3TQVA 1H51A 1TJPA 1IXPA 1SW7A 5D05A 1LCOA 5AHLA 3W7HA 1NF0A 3FLUA 3PF3A 1JJKA 3RK8A 3LBMA 2ZTKA 2QEZA 3IGXA 4XZ9A 3UYCA 1TSIA 5HMSA 4XUGA 5G2WA 3MWAA 2NUWA 1GTHA 1MZHA 3CB8A 3P7YA 2ZFAA 3E96A 2A21A 1O5XA 1W8SA 1FCVA 3KRSA 4O13A 1R30A 4FX7A 3ZWSA 2JK2A 3NPWA 4CNNA 4Z1AA 1W5QA 3SW6A 1DJNA 4WUIA 5AFDA 4ADSA 1K8ZA 3RMJA 5U7SA 4IWWA 3W1MA 2CLIA 4IUOA 3W7RA 5FF7A 1B3OA 3OEXA 1F6PA 2GVGA 1B9BA 1NFBA 3A9IA 3PBYA 3W07A 2Z6JA 2YXGA 2H3DA 2WSRA 4K7YA 1F05A 3S5ZA 1ZJIA 2Y70A 2ZQ0A 3WFAA 1B57A 1P0NA 2B7QA 2NXHA 1E51A 2VFFA 4LS2A 5F2IA 3QYQA 2IQTA 1S5WA 2V8ZA 3TR2A 1JCNA 4NVTA 2NWSA 1SZNA 3FIGA 1MO0A 2NX1A 2A7PA 1TREA 1VPXA 3HG2A 1M7PA 1P0KA 3HG4A 4JXCA 4NX5A 4AMAA 4WQ6A 4IXHA 3W9ZA 1OYBA 2J9YA 1ZCOA 5DN1A 2EPHA 5DY3A 3G18A 5AHFA 1K7EA 2FLIA 1H7NA 1DJQA 2A6LA 3B8DA 2A85A 4WZHA 2I1OA 2CWNA 2DJLA 1QO5A 4RZ5A 3GXPA 4RX0A 3NQ2A 4LVDA 5FF3A 1UASA 3T40A 2ZRXA 4MLJA 4IQLA 5BNKA 5LSMA 3FYPA 3NA8A 4NNCA 1IXNA 1YPIA 4AWSA 4UMAA 3M9YA 1W5OA 4MFEA 1ICSA 4P2VA 2QCNA 3WK1A 1SZFA 1W1ZA 2R14A 2C3ZA 2VOMA 3GNNA 3IEBA 3QEZA 3YPIA 1HG3A 2QCGA 4Z0JA 4HSOA 4MPQA 1ZY9A 3MHGA 3VKJA 1IIHA 5LHFA 2Y62A 2KZHA 4DF0A 5LNVA 3R8RA 1CW2A 2VEIA 3LXBA 1XBXA 4TX9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1D9E A;  2E6F A;  4E38 A;  3BSM A;  4MLR A;  2VDG A;  8XIA A;  5I2U A;  1HL8 A;  1X1N A;  2OPJ A;  4NJH A;  4S3D A;  7A3H A;  3LBO A;  1G6C A;  3CUF A;  3NAV A;  4QSH A;  1QW9 A;  5D2W A;  1J6O A;  3H2M A;  4HPJ A;  2YIH A;  1CGX A;  3OHM B;  5HXM A;  5DCB A;  2HVO A;  2C8N A;  4CQ9 A;  2CES A;  2VCA A;  1V3H A;  1NQK A;  4HCD A;  2VGF A;  3LGE A;  2QVH A;  3G24 A;  1CGY A;  1T40 A;  3M0V A;  4FOJ A;  2ESC A;  3G1D A;  3MSY A;  1U1H A;  1C92 A;  4Q22 A;  3I6R A;  5AC6 A;  3W4R A;  6ENL A;  1NAL 1;  3EOS A;  4JR5 A;  4Q6X A;  4XWU A;  3S9Y A;  4C6Q A;  3STG A;  2E40 A;  5T26 A;  1F4H A;  4S2B A;  3SGZ A;  5KIT A;  3E12 A;  4DLM A;  3IIV A;  1EP3 A;  1TRI A;  4CNS A;  1ZNN A;  3HA1 A;  4Z2K A;  3TZN A;  1P7T A;  2XSX A;  5D4Y A;  1O94 A;  1H60 A;  4DI8 A;  5BRO A;  1VCV A;  1E9Y B;  2G4F A;  1HO1 A;  1QI2 A;  4JDY A;  2EO7 A;  1L6Y A;  4V28 A;  1UD8 A;  2CYG A;  4O53 A;  4PCT A;  1IHI A;  2WM1 A;  3T4C A;  4O15 A;  3HG3 A;  4FR1 A;  2WHL A;  1HUV A;  1X7F A;  2ZUV A;  1JUL A;  4F0H A;  4J3U A; 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