1I4NA

Crystal structure of indoleglycerol phosphate synthase from thermotoga maritima
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RRLWEIVEAKKKDILEIDGENLIVQRRNHRFLEVLSGKERVKIIAEFKKASPSAGDINADASLEDFIRMYDELADAISILTEKHYFKGDPAFVRAARNLTCRPILAKDFYIDTVQVKLASSVGADAILIIARILTAEQIKEIYEAAEELGMDSLVEVHSREDLEKVFSVIRPKIIGINTRDLDTFEIKKNVLWELLPLVPDDTVVVAESGIKDPRELKDLRGKVNAVLVGTSIMKAENPRRFLEEMRAWSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of indoleglycerol-phosphate synthase from Thermotoga maritima. Kinetic stabilization by salt bridges.
pubmed doi rcsb
molecule keywords INDOLE-3-GLYCEROL PHOSPHATE SYNTHASE
molecule tags Lyase
source organism Thermotoga maritima
total genus 87
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2001-02-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00218 IGPS Indole-3-glycerol phosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1i4nA00
3L0GA 4KFNA 1KV5A 2NUYA 4MLRA 1AL7A 3EKZA 2QJGA 5D02A 3W9ZA 3DHDA 3L65A 5DY2A 5AYYA 2XFWA 2HTMA 2VEKA 4IMGA 3S1WA 5EBUA 4UNKA 5CG7A 4N9DA 3LRMA 5K9XA 1LOSA 4AAJA 2OCZA 2V9DA 4Q33A 3TSMA 1KM2A 3L9CA 2DZXA 1JCYA 2X30A 4MY8A 4UFHA 4GUIA 1O60A 3NQVA 1HTIA 1X1ZA 5D2YA 2OJPA 5AYZA 2R14A 3W1QA 4UTIA 1ONRA 1PL9A 4S2BA 4ZVJA 3CB8A 1W5QA 5D2XA 2RDWA 1KBIA 1VYRA 3LOTA 5D33A 3TMQA 1DV7A 2FPTA 3MWAA 3QW3A 4JGDA 4D2JA 4WD0A 3W83A 4UTJA 2Y88A 1SO6A 4TMBA 2YYUA 3ATYA 4UTUA 1O95A 5E93A 4PTNA 1KM1A 4ZQOA 2YW3A 1X8FA 3HPZA 1I2NA 1G4EA 4O8RA 1C8VA 3L68A 1OK4A 4BK9A 1I2PA 2HMCA 3P80A 5F1VA 1WOBA 4LT9A 2E6FA 3O6DA 4UFMA 3G1YA 1GYNA 3E0IA 4AWUA 1KTNA 2WNZA 3M47A 4AEOA 5DCEA 4M7TA 1TRDA 3PBWA 3W85A 2ZRWA 2VEIA 1H63A 3O1NA 1FQ0A 3HB9A 1OABA 2ZTJA 4LUIA 4RR4A 1JCXA 4MZ8A 4FHAA 2ZZ1A 4JIPA 1JRBA 4UTWC 4JTGA 1H7RA 1QCWA 3BG5A 5CPOA 3I7RA 3GAYA 4RJEA 1SW7A 3GVGA 1LBMA 3GDRA 2A2IA 3TU9A 3S5YA 2FLIA 2VFFA 4AHPA 4I7VA 1W5OA 1JRCA 2W79A 5U7SA 1XXXA 3NQ8A 3P74A 3SI9A 2QCCA 3M5ZA 3C2FA 1ZFJA 4UR7A 1UB3A 4IQLA 4O4VA 3S1VA 3PUEA 3BLEA 1F6KA 2YX0A 4BI7A 5L6UA 2NZLA 1QR7A 1UUMA 1YPFA 4FO4A 5G1TA 3TQ0A 5KITA 2CLFA 5G2HA 3HJZA 1EX5A 3HQ1A 1XBYA 1TTJA 4JEQA 2NWRA 2A4AA 1ZJIA 3DAQA 4LC8A 3B05A 1M7OA 5K3VA 1A5BA 1L9WA 3INPA 1F74A 3NO5A 3P60A 3GAKA 1K7XA 1N8FA 1SQ7A 3R2GA 4BR1A 3GNDA 3O6CA 3W73A 5DN1A 1RZMA 1TYGA 1QWGA 2QCMA 3O15A 4K7VA 3O06A 4FNPA 3PF3A 2GVLA 1QPNA 4A29A 2QAPA 2P1FA 2A7RA 1A53A 1WQ5A 1TPB1 1EP2A 2NXGA 1G67A 2DP3A 5DBTA 3UZ5A 4KFOA 1H7WA 2H3DA 1ZHAA 2WNQA 1OX6A 2UV8G 2R91A 4O1AA 2GPTA 1OK6A 1IIHA 2EPHA 3UXAA 4UTKA 3LRLA 3WFAA 3N3MA 5F2GA 4CQAA 3I6RA 1LBLA 4O1DA 3W7DA 4NNBA 1DL3A 3GDTA 2QDGA 4E38A 4HNTA 1Z44A 2QAFA 4HNVA 3W84A 1S5VA 1OFPA 1FDZA 4NJKA 4A22A 4CCDA 3UQNA 5BMWA 2CLEA 4MY1A 1T0OA 1H61A 1UCWA 3THAA 4JX5A 4UC5A 3VI2A 3STCA 4EF8A 1JR1A 2I1OA 3QPYA 2ABBA 4JICA 1TPWA 2KZHA 1WV2A 1PV8A 1G69A 2OT1A 3TR2A 3OHIA 5F4WA 3DFPA 5TQLA 4KFPA 2WOQA 3UYCA 5MHBA 3W7GA 1RVGA 2QJIA 2VFDA 4LVFA 4AF0A 4XTDA 1A5CA 2Y63A 3GLCA 5F2IA 1G6CA 5C55A 3ANYA 3O63A 2A5HA 3EX2A 3MI6A 1AK5A 2C14A 3R12A 3TQKA 4UTTC 1FXQA 1Q3NA 5CPNA 4LNYA 3S42A 3IV3A 2DZPA 4O11A 1FCVA 1AMKA 1ZAJA 5D03A 3CEPA 5AOUA 4NXKA 1VCGA 3RF9A 3R5EA 3W1TA 3PSVA 4EWND 1OFQA 5L9FA 1NSJA 5EL1A 1H5YA 4E0CA 4L4LA 4JS3A 4RV8A 4K37A 4HHPA 4Z1CA 2V5LA 2RH9A 4I9AA 2Z2UA 4XZ9A 4UMBA 1OX4A 3TKFA 4NJGA 2A6LA 2ZZ7A 3RMJA 3EX6A 3PS7A 1WBHA 2OZ0A 3NOEA 4WX2A 4P61A 1R46A 3CM4A 4WXZA 1M7PA 3MMTA 4DO5A 3DU0A 1KFLA 4Q32A 3LHUA 4RKAA 3WK3A 1PS9A 5C54A 2V2DA 4FXSA 3RFAA 1LLZA 5AB3A 2C16A 3NL5A 4X22A 3MO7A 2VOMA 4UXDA 3D0CA 3I65A 3G1HA 4M7SA 4YCPA 4JD4A 4OT7A 3HG3A 3M7WA 3IIOA 2C3ZA 4PC8A 1RV8A 2RKXA 2GQ9A 3LHVA 4XKYA 4JY9A 3DGRA 1WAUA 4LU0A 4IOTA 2E68A 2B4GA 3PR2A 2VELA 1QAPA 5CZSA 3W6YA 1ICSA 3G1VA 3L0KA 3TROA 5J5RA 4MIMA 4RZ4A 2E5BA 3F03K 1ZAIA 3LTPA 1AG1O 3CWOX 1KFEA 4FEZA 1VCVA 4JNMA 1G4TA 2G96A 1R2RA 2GQ8A 1P5BA 2H90A 5C5YA 5I3JA 2VFEA 3T55A 5AHMA 4FNUA 5HUOA 1YTDA 2WO5A 4FB7A 2Y7EA 5LNSA 1JCJA 2GOUA 3S1XA 2ZA1A 1PE1A 3QZEA 4JYFA 1NVMA 4NX5A 1IXQA 3HGOA 3LX9A 4LVBA 4GNJA 5H2ZA 3T40A 4ZMGA 1SSGA 2EF9A 4UMAA 3BLFA 3BO9A 1N55A 2ZTKA 5F2MA 3QC3A 1LOQA 2Z6JA 3TXZA 3G8EA 1F2JA 5C6MA 4XBSA 5HR7A 3ABOA 2OX1A 1PHWA 4JTIA 5K9DA 4HSOA 3M9YA 5AHLA 5LKYA 3P84A 1TPUA 4TO8A 1RQBA 4HKPA 2J9YA 3IEBA 1DOSA 2H3BA 2BSLA 5D2WA 3PUDA 1OFDA 4PFMA 3G8RA 3NA8A 2WQPA 2FQIA 3NQ2A 3C0JA 3NR0A 4O10A 2VFIA 4IJBA 5AHFA 3OVPA 4UFJA 3DFNA 4O0ZA 5K2ZA 4A2SA 1SO5A 3L21A 3TW6A 3M0ZA 3NQ6A 4IPJA 3TX9A 5BW6A 3LDVA 2Z0IA 3MP3A 4WY0F 4MZYA 2JKPA 1JCNA 1O5XA 5DY3A 1OFEA 1WBJA 5TBOA 3B4UA 3KHJA 3KOFA 1W0MA 1UASA 2ZA3A 1IXPA 2Y7DA 3S6DA 3NPWA 1VPXA 1F05A 3FKRA 5J5DA 4BF9A 4OV9A 1CX9A 2JKAA 3C8FA 1TQXA 3M44A 4N6EA 4ICNA 1G7VA 3NQMA 3VE9A 3W1MA 1EIXA 4JXCA 5I3HA 2LLEA 3MYOA 4GC4A 3EWUA 3NAVA 3NL2A 3B06A 5FEZA 4RZ5A 4JN6A 3P5ZA 5A5WA 2AGKA 1XCFA 3IVTA 1VS1A 2W0UA 3NXFA 4QSHA 3N9RA 3W7IA 4KKXA 4MYAA 2A1YA 2ZCGA 3MHGA 4DF0A 1YDOA 2ZZ5A 1DQXA 3PWAA 1Z42A 1B4EA 1IGSA 1RQEA 4CQ8A 3TA6A 3G1SA 3DFTA 5D32A 4QNWA 4W9TA 3M1ZA 3SFKA 3WK0A 1VYPX 4DELA 3NNTA 3PUOA 1K8XA 3PG8A 2HS6A 5I3KA 4O14A 4OE7A 2V0TA 4GBUA 5BOOA 4XTIA 1EA0A 4Y6GA 4O52A 2ALDA 3ZWTA 1QPRA 1XC4A 3UWQA 1TSIA 4WUIA 3TXVA 2TMDA 4QIUA 1U83A 4UUIA 3RNDA 3DI1A 3EKLA 4HPJA 4IMFA 2O7QA 1L2UA 1VHNA 2J88A 3G0UA 1F76A 1PCKA 5D05A 5HINA 3TK7A 2PRHA 4CQ9A 1DVJA 5G4WA 3P61A 2QR6A 2DZWA 3IGUA 1MEIA 2ABAA 3PC0A 4A3UA 1KM3A 2E6YA 4DO6A 3S9YA 5D04C 2WSRA 4DF2A 4JYEA 4LV9A 5FF4A 4XQ6A 1TPC1 1SZNA 2B0MA 3DKLA 4RXFA 2V2HA 4JTFA 3EXRA 3LCFA 4ADUA 5SWUA 1XBVA 2ATSA 3P5YA 3C56A 2QKFA 2W6RA 4FXRA 3EXSA 5HWMA 4PL2A 4RXGA 5KSWA 2QCHA 3UWYA 1J4EA 4JTUA 3NVTA 2CZEA 4X2RA 3WK2A 3W87A 3BK0A 1TCDA 1LRNA 5DXXA 2ZRXA 4R7JA 3KVJA 4O18A 4UCGA 3TCEA 4JDBA 4ADSA 4LWWA 4DEFA 1LBFA 4GWEA 3Q94A 3T78A 1O4UA 1A5AA 5AHIA 4PA8A 3TQVA 4MZ1A 4IX0A 4UTMA 1K7EA 3GX9A 3QJAA 2XN1A 3SGUA 1TIMA 3TJXA 2A6NA 4E2BA 4QJ1A 1KV8A 2ZDRA 5HR6A 3R8RA 3CEUA 4DBDA 3QEZA 1HFBA 3A9IA 3N9SA 3UD6A 3NQDA 3DFQA 1LTDA 1R2SA 3YPIA 2GJLA 1HUVA 3STEA 5I3GA 4RLIA 3W2MA 3EWYA 3W7PA 1Z48A 5HWNA 3NQGA 3VKJA 4FIQA 1T8XA 1GT8A 2PURA 2FJKA 2CLLA 2Q3OA 4NT0A 4Y9AA 1QPOA 2ZBTA 1SUXA 3A24A 5D2TA 1HO1A 3C2OA 3STFA 1TRIA 5CSSA 4P2VA 4JR5A 5DCDA 3CIXA 3DENA 4LUJA 4YLWA 4YXGA 4ZQNA 4FX7A 4PL1A 3W7HA 1G7UA 4A21A 3DI0A 3A21A 5FF2A 5CPMA 1GTHA 5D37A 2C19A 3MUXA 2V81A 6TIMA 4N9BA 2NX1A 5K7JA 3LM7A 5KZDA 1MEWA 5FF7A 1YADA 4ORMA 3I7QA 3BW3A 3C2RA 4FF7A 5AC8A 2ISWA 1Q6OA 3W2LA 2EHHA 4X3ZA 4UIOA 3EEGA 3R89A 1HG3A 4KWVA 4QITA 6ALDA 1W8SA 4B5NA 1NAL1 4OV4A 1K3UA 2G97A 2CU0A 1LDCA 4WZHA 1T96A 1KM0A 2NV2A 3DXIA 1Q6RA 1KM5A 3L0NA 1WA3A 2Y89A 4AMAA 2FDSA 4O13A 5DLCA 1YDVA 1W31A 4JTHA 3GXTA 3LV5A 3GIYA 4JTTA 4GUHA 3WJSA 2D73A 4Z0SA 4WY0B 4R53A 2YW4A 5HMSA 1WYIA 2VFGA 1H7OA 1SFJA 2I14A 1LRTA 3GR7A 4H6KA 4N02A 2FIQA 2X16A 3FYPA 1YYAA 1TTIA 3MBDA 4O0KA 3PBUA 3DBPA 5E1QA 3NPVA 5G1YA 3GNNA 3HG5A 3JRKA 1GQNA 1GVFA 2DZTA 4O16A 3TC6A 4N9CA 3R13A 3KVLA 3TIMA 4LVAA 3FJ6A 1OYBA 1LOLA 1C9DA 3OVRA 3W7NA 3CPRA 4MYXA 2FTPA 1VGAA 1A5SA 3FYOA 3W07A 2HSAA 3A5VA 4NXSA 1K8ZA 3W7KA 3A22A 4U28A 4DF1A 3FFSA 1W56A 2CLOA 5CSRA 1DJNA 1TV5A 2GQAA 2J9XA 2CZFA 5E0KA 3TUUA 5EMUA 3W7MA 1OX5A 3GDLA 4NNAA 1XBZA 3W3OA 3LB0A 4GRSA 1H50A 1ZALA 3CQ0A 4S1FA 1XDLA 4IMEA 3C61A 4AWSA 1GVRA 4EOUA 5K4XA 3UXDA 1NF0A 1DORA 1W5NA 2V30A 4RX0A 1SW0A 1LLWA 1P1XA 3MJYA 4JIQA 5LGXA 3TDFA 1CI1A 3ZFHA 3TMLA 3NZ1A 3GXPA 1SZGA 3KRZA 2ZYFA 2ZRUA 3AJXA 3N34A 2Y7FA 1C29A 2A7PA 5G4EA 1XKYA 5DELA 1IF2A 1H60A 3EX3A 1YTEA 3NDOA 3O8AA 1L6SA 3IVSA 3ABSA 1OYCA 2BZNA 1W1ZA 1VH7A 1WXJA 7TIMA 1J2WA 1GVQA 4IWWA 3GR8A 1UJPA 2E09A 2ZQ0A 5CGQA 1BWKA 2YYTA 1JQVA 3W72A 2NX9A 3QMTA 3W2JA 2NXHA 4EIVA 5LNWA 3BGGA 1OHLA 2BWGA 1KM4A 1WOAA 3UY8A 4XBKA 2NV1A 1TTPA 3P7YA 3IRDA 1I4NA 3DH7A 3SR7A 3HGJA 3OBKA 3W22A 3QW4B 5U4NA 5CZJA 1VC4A 3F1QA 4MFDA 2C0AA 4K36A 2XN2A 1JQXA 2JK2A 3JS3A 1THFD 1FWTA 1P0NA 3ELFA 3O05A 4OQVA 1G4PA 2NX3A 4LRTA 3IIXA 2QCDB 4FNSA 2B7OA 3TSBA 1PIIA 3KX6A 3SW6A 3S0CA 3PBVA 5BNKA 1CW2A 4EF9A 3TW7A 3N19B 4RK8A 4O1BA 3NQFA 3H53A 3LXAA 4ALDA 2NWSA 5D30A 3DHFA 3FOKA 3P62A 5AHEA 4M6PA 2CFFA 1M5WA 3CHVA 2GJNA 3ZR4A 4WXYA 3W7OA 3W2NA 1Q45A 3W7QA 5F4SA 5EPDA 3W70A 1QPQA 1H62A 3LBCA 2ATMA 1OYAA 1HO4A 4BI6A 3UWZA 4DPQA 3U8GA 4ZL1A 3W2KA 4TIMA 3EX1A 2E5CA 1P4CA 1V5XA 1FY6A 5CZTA 1IXNA 3U2OA 4GUGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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