1JQVA

The k213e mutant of lactococcus lactis dihydroorotate dehydrogenase a
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
311
structure length
311
Chain Sequence
MLNTTFANAKFANPFMNASGVHCMTIEDLEELKASQAGAYITKSSTLEKREGNPLPRYVDLELGSINSMGLPNLGFDYYLDYVLKNQKENAQEGPIFFSIAGMSAAENIAMLKKIQESDFSGITELNLSCPNVPGKPQLAYDFEATEKLLKEVFTFFTKPLGVKLPPYFDLVHFDIMAEILNQFPLTYVNSVNSIGNGLFIDPEAESVVIKPEDGFGGIGGAYIKPTALANVRAFYTRLKPEIQIIGTGGIETGQDAFEHLLCGATMLQIGTALHKEGPAIFDRIIKELEEIMNQKGYQSIADFHGKLKSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Lactococcus lactis dihydroorotate dehydrogenase A mutants reveal important facets of the enzymatic function
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase A
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lactococcus lactis
total genus 114
structure length 311
sequence length 311
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2001-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 1jqvA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1jqvA01
3I7SA 4Z1BA 4YLWA 3W7NA 2RDTA 1ZALA 3FYPA 3INPA 3OVQA 3MJYA 3QMRA 1YDOA 3W2LA 3VE9A 1RQBA 5KMYA 1XBZA 4O18A 4HNVA 5H2ZA 1YXDA 4N2YA 3GAKA 2FPVA 5EYWA 2A4AA 3DI1A 3SFKA 3IIZA 4FIRA 2QCDB 1SW0A 1YXCA 3NQEA 3W3OA 1Q45A 1FXPA 1EB3A 4Z1DA 3W84A 2QCMA 4WQ6A 4AWUA 1X1ZA 4FB7A 4Y8FA 3YPIA 3PULA 4O17A 1PE1A 3QM3A 4UIOA 1SW3A 2ZZ6A 2C0AA 1OFBA 1QPOA 1K7FA 2A6NA 3VCRA 1VLWA 3CU2A 3M5VA 2JGQA 3DZ1A 2E77A 1GEQA 3O1NA 2QUTA 5H91A 3M44A 3LGEA 5DBTA 3W7QA 2D73A 3P74A 3CWOX 1DVJA 3IVTA 2E5BA 3NZRA 1LYXA 3LCIA 3P5ZA 2FLIA 3W7HA 1R2TA 5F2MA 1ICPA 1JRCA 3TDFA 3P8IA 1IXNA 5D30A 2FIQA 3G0UA 3PSWA 5F2LA 1LORA 1M5WA 2XN0A 3LERA 3P67A 4BK9A 4JTEA 5AHNA 1MEHA 1FWRA 2GVLA 3NDOA 3PWAA 2RDWA 1ZY9A 4AHPA 5BMXA 2A7RA 4FXSA 1GZGA 4ICNA 2GJNA 1NF0A 4IOTA 1EUNA 1WBHA 2ISWA 1FWTA 5D2TA 1GYNA 2E09A 4QQ3A 4RR4A 2VXNA 3FOKA 3LB0A 2NWSA 3WJSA 1KM0A 1KV5A 4BI7A 3HGJA 1DHPA 4IMEA 2HS6A 3NA8A 1UASA 3LI0A 5BNKA 3L68A 2ATMA 1SO5A 3NOEA 5KZDA 4JTIA 4MY9A 4QITA 3P7YA 2CLLA 1BWLA 4Y6GA 2DZXA 3O06A 3T7VA 4UFLA 3M47A 1T99A 3DFNA 2VEKA 3SJ3A 4LTSA 1KTBA 4I9AA 3ABQA 3UQNA 3JRKA 1N55A 1Q6OA 3TAOA 3LXCA 4HPJA 3QH2A 2TSYA 3KRZA 5SWUA 3EX1A 1OFEA 5HUPA 4J9JA 2YGYA 3W7LA 3STEA 4ADSA 2Y89A 3O16A 4WOZA 1KFCA 1GVOA 2E6YA 4O1BA 5D02A 2BWGA 4O28A 1Q6LA 1P0NA 2Z2UA 4UMCA 2CZFA 4UCGA 1B4KA 4WXYA 5AHEA 2ZZ2A 2BSLA 2YR1A 3W76A 3EXTA 3NVTA 3P5YA 1QOPA 1X6UA 2A6LA 2H90A 2E5DA 4PA8A 3TU9A 4M6QA 3W7PA 1QMLA 3CB8A 3S5OA 1AL8A 1S3HA 5BRBA 2A0NA 3W7OA 4ZL1A 4PL2A 1QO2A 3O8AA 5D03A 4N4PA 5K4XA 3WK1A 4RKAA 3SW6A 4JDBA 3GR8A 4ADUA 1OX6A 4FX8A 4ZQOA 4LV9A 4FF7A 3W88A 4A22A 1R30A 3WFAA 3TFXA 4XQ6A 1UB3A 3CC1A 3L5AA 1P1XA 4L4LA 2J9ZA 1W5OA 4R53A 1TPFA 3HMJG 1WOBA 5DY3A 5DY2A 1K02A 3DKJA 1L6YA 1TJPA 3NYZA 5FEZA 4QSHA 4N9DA 4EWND 1EX5A 1OFOA 3LCXA 4M7TA 2Y7GA 4JIQA 4LRSA 1OHLA 4C1KA 2W0UA 3BK0A 5ABTA 1I2NA 1JCMP 1ZCOA 4RJEA 4UNLA 3FJ6A 3TNOA 1GTHA 4JXCA 3W7DA 4JS3A 3L21A 4OV4A 3TUUA 1T96A 4GUHA 3JR2A 5FF2A 3GDRA 4Z08A 4MYAA 3GNDA 5I3KA 2B7OA 4QNWA 4ALDA 4M7SA 3MHUA 4O52A 2WJZA 4JGDA 1XBVA 3F1QA 3OHIA 3C2FA 2RKXA 4JYEA 4O11A 1BWKA 4HT3A 4UTTC 2NX1A 3GZ3A 2J24A 3KVLA 1JUBA 5C54A 3E49A 2CZDA 2ZBTA 3QQ1A 3W2MA 4ZQCA 3FFSA 2QCHA 1OF8A 4AB4A 3C0JA 1DOSA 1TTJA 1DKWA 3IGUA 2C14A 3KRSA 1PHWA 4UFKA 1FY6A 4MZ8A 3DU0A 3USBA 4RX0A 3ATYA 3CLMA 3TQ0A 4FNPA 4QJ1A 5G1TA 3M43A 2NXIA 4ZMGA 4GUGA 3LHVA 2DZUA 3I7QA 4LC8A 5A5WA 1KLZA 1PVNA 2C13A 2WQPA 4NJJA 3ELFA 2VFDA 4CNOA 1LLWA 2A7NA 3TXVA 3QYQA 3NR0A 1LP6A 1L6SA 2Z6JA 1K8ZA 1Q6QA 4UFJA 3W2UA 1LBLA 5CZTA 3DBPA 5G2WA 2Q8ZA 2PURA 1VHNA 2FPTA 4O10A 2VEPA 3ABOA 3NQFA 3TW6A 3LV6A 2OT0A 1JUKA 3DENA 3QJAA 3RMJA 1KLYA 3HG2A 4X22A 5C2XA 4MFEA 5KSWA 4MY8A 1OF6A 5CZSA 1UUOA 2X1TA 3O15A 3DFQA 3C6CA 4AVFA 2YFNA 1TPDA 1TQJA 4ZZ9A 1MSSA 4K6AA 4PCFA 1H63A 4RZ6A 3GIYA 4YCPA 2GQAA 3RK8A 3MP5A 4KFOA 2Y85A 1C9DA 4ZQNA 5D2WA 1FWNA 1KM5A 3HJZA 5G5IA 1PL9A 4LV4A 1JQVA 1W54A 4O16A 2YXGA 3W22A 3GX9A 1F7BA 3E9AA 1GTEA 2DZSA 1SZFA 1A5SA 5LNWA 4UTHA 4IX0A 3EWUA 2JKPA 1JUEA 4B5NA 1FCQA 4MIMA 3CIXA 3TW7A 2RFGA 4PC8A 4HHPA 2DZVA 3MBFA 5G4EA 1ALDA 4R34A 3STGA 4Z0SA 1OYAA 2ISVA 2TMDA 2CWNA 4UR7A 1OFQA 1A5BA 3TK7A 4N9CA 5HWNA 4OU1A 3KHJA 4IMGA 4LVGA 2B4GA 2ZZ3A 3U6WA 3MWAA 1QDSA 1JCJA 3N9SA 1TPC1 3WJZA 2GQ9A 2X1SA 1BKSA 4O4WA 3UNDA 1FWSA 4ADTA 3W72A 1D9EA 5DLCA 4M6PA 5LNSA 3W7EA 4XBKA 1KA9F 3S1XA 1O60A 1T0OA 4FEZA 3OG3A 1YDVA 4UFHA 4GUJA 1GPWA 5GVJA 4IQLA 3FLUA 3VKJA 3T4CA 2ZCGA 4R33A 3MW7A 5AYXA 4YWIA 2V30A 2ISSA 2NWRA 3CWNA 4GC4A 4RV8A 2QCGA 3BARA 3EWBX 3UD6A 2J6XA 3MI3A 3L2IA 1W5PA 4JTHA 3WK0A 3KAOA 1NF7A 4WOQA 4NU7A 5CPLA 2ZTJA 3BLEA 4QNEA 4UTIA 1W5MA 4R7JA 2QUUA 3A9IA 1TJRA 1J4EA 1NFBA 3IV3A 8TIMA 2WSQA 4MZ1A 1OYBA 5DXYA 4UTUA 1ICSA 3QF0A 3GYEA 3NG3A 5AHIA 1X1OA 5CZ0A 4A29A 3W7GA 2VEIA 5CKSA 2ZRVA 2PRHA 3C2VA 2P1FA 1F2JA 1SZGA 2WSYA 2WOQA 4KWWA 1XCFA 2OMAA 3P61A 3PF3A 3C3NA 3KVJA 2FFCA 3MBDA 2F7FA 4BFAA 1OVDA 4OBTA 4CCDA 2LLEA 1O5KA 2XN1A 1TCDA 1YXYA 4NNBA 3QSRA 4LVFA 2QKFA 4A2RA 4JTUA 4JTLA 1OFAA 1XI3A 3S5NA 1Z48A 3LXAA 4UMAA 1OABA 2QR6A 1X8FA 2QEZA 5FF3A 1FWWA 4XZ9A 4OE7A 4UTLA 3IIPA 4BWLA 3G1FA 1FDJA 3R8RA 2C15A 1N8FA 5EBUA 1VHCA 3W2JA 1VGAA 1MEWA 3EWXA 4K7YA 2V9DA 4Y9AA 3IIVA 5U4NA 5TBOA 2V2HA 4O4VA 2Y62A 3NQ8A 3DFOA 1YDNA 3GB6A 1KBJA 4JYFA 1ICQA 4YXGA 3QC3A 3L67A 2TPSA 2WNQA 1RPXA 4LT9A 4IXHA 3N14A 4K8EA 3GKFA 1I8JA 1ZENA 1R47A 5DXXA 4ZVJA 5F2IA 3S42A 1SSGA 1M6JA 4O14A 3W85A 3HIJA 3G1XA 1RR2A 3LCGA 4MLRA 5KINA 3B0VC 5D2VA 3OBKA 1SO3A 6ALDA 1JCYA 3LCHA 2ZRZA 3NQMA 5IBXA 1NAL1 1RV8A 1G4TA 2HSAA 3BV4A 1T8XA 2X1RA 2V5BA 3T78A 3B04A 4FNQA 3PBVA 5HR6A 1FBAA 3W87A 1QWGA 2DJLA 3W07A 1FCUA 4PEKA 4UC5A 2ZRUA 4S2BA 3W73A 3BG3A 4WY0B 4GFSA 5D38A 3L65A 3KX6A 3PUOA 5FF0A 3GXNA 2HMCA 3BLIA 5HJLA 2ZA2A 4IJBA 5TQLA 4NNCA 1YADA 2GQ8A 1SSDA 4RXGA 4WX2A 3EWYA 2EGZA 1S5VA 2I9EA 4RCXA 1SU5A 2PRMA 2CLIA 5AHMA 3MI6A 4UUIA 2C1HA 1FX6A 1SZEA 2BXVA 1XKYA 2P0OA 1B3OA 4O12A 2RDUA 4MJZA 1B57A 4N4QA 4FO4A 4JYDA 4MVAA 3MP4A 3G0SA 3G24A 3IRDA 1DV7A 1P4CA 3U2OA 1O5XA 1C29A 1PIIA 4CQAA 4ZQMA 5DCDA 4TMCA 2DJXA 2QAFA 1QO5A 3M6YA 4H4IA 1AG1O 5FEWA 4LU0A 4TO8A 3LXBA 4JX6A 4MOZA 3GDKA 4GUFA 2XN2A 3E12A 2EAWA 2J9XA 3DKLA 1DORA 2V2CA 2CLKA 2G96A 3IVSA 3QMSA 4AHQA 3EX4A 1BTMA 5HNRA 2WV8A 4IGHA 3UXDA 1MZHA 3TSBA 1F73A 5EY5A 4OV9A 5G2IA 4N6EA 5DCEA 4IMDA 3HGRA 3I6RA 3C2RA 3W1TA 3LBCA 4POCA 1SFLA 4G1KA 3FJLA 3AO0A 1OFPA 3C2EA 5LNVA 1PV8A 2RH9A 2ZA3A 1PCKA 2QCDA 1MXSA 2VFGA 1FCVA 4AEOA 3FKRA 4JICA 3G3MA 3O07A 3H54A 2PC4A 3CPRA 3EKLA 5HUOA 1F6KA 1ONRA 1KW1A 1JVNA 1XDLA 1QR7A 1G4PA 3G1AA 3HG5A 4QM1A 3A21A 1R2RA 3IIOA 5AC7A 4Q33A 3PVFA 4O19A 4UFIA 3R89A 1W37A 3R2GA 4IX2A 1H7NA 3E02A 3F4WA 2ZRYA 3LHUA 4EIVA 1EP3A 4O13A 5BMWA 2ZA1A 3TQVA 1W1ZA 3BO9A 1XUUA 3MMTA 3A23A 4AWTA 4MYXA 2CU0A 4LS1A 2Y7FA 1WAUA 3BW4A 1XUZA 3Q58A 3W1LA 1W5NA 3G8EA 1SO6A 4WJEA 1EP2A 2FPYA 4GE8A 2QUVA 1XFBA 3DFSA 5HWJA 3EX3A 2A21A 1G7UA 3TA6A 1UJPA 5K9XA 3P60A 3BGGA 3OA3A 3PSVA 3OIXA 2YX0A 4N02A 3TFCA 3T40A 3HB9A 2NX9A 2OJPA 1EP1A 4CCCA 2NUXA 1WA3A 1WQ5A 5BW6A 3U8GA 2C19A 3NQ2A 1TTIA 3M1ZA 1A5AA 3K30A 1VR6A 4S1FA 4JD4A 5CPOA 2OCZA 5G2HA 3QFEA 4TX9A 5C6MA 1VCVA 1VCGA 1DL3A 4CNPA 1KM6A 1WXJA 4EF8A 3EKZA 1OX4B 1F76A 1FCBA 1W56A 1KFBA 2ZTKA 5A8GA 3BW3A 2ABBA 4P2VA 3P82A 1W3TA 4PTNA 3TKFA 4YCOA 4AMAA 2X30A 3O6DA 1SPQA 3W2NA 6TIMA 2JGYA 5F4SA 1XDMA 2OT1A 3CEPA 3IGXA 1TRDA 5D09A 1WBJA 1O4UA 4DF1A 4DBEA 4RZ4A 4GRSA 3NQ6A 3W7RA 3G1HA 3ZFHA 5AYYA 4QAIA 1WV2A 2VFIA 3KXQA 3NPVA 1EPXA 1LRTA 2J9YA 3LCFA 3UY7A 2VEMA 4AHOA 1LLZA 4RXFA 4NX0A 3TR2A 4JDYA 1NEYA 4N6FA 1TTQA 2CLFA 4Z1AA 3UWQA 3Q2DA 1QCWA 5HMSA 3NQAA 4OWGA 3LHWA 1ZAIA 1XM3A 2H8ZA 3LV5A 3RU6A 3RNDA 1SW7A 3W7KA 3S5ZA 4IPIA 1WDWA 4UXDA 3S1UA 1S5TA 1H61A 5HWMA 2ZQ0A 1ZHAA 1W31A 3DAQA 3E0IA 2NZLA 4RK8A 2HTMA 1Z44A 5AFDA 1HO4A 4NJHA 2CLOA 3SIZA 2YYTA 3BG9A 4O0KA 4DF2A 1SUXA 4AXKA 3IEBA 4IMFA 1JJKA 2BLEA 2PE4A 4MFDA 1I2RA 2PRLA 1H7PA 1YTDA 3TH6A 2FB2A 3H53A 4ORMA 3DH7A 1VC4A 2O7QA 4K8HA 3WK3A 3C61A 5J5RA 3BG5A 1U83A 3NQ7A 5T26A 3SY5A 3NXFA 1NVMA 3L0GA 3M9YA 3NM1A 4RZ5A 3TXZA 1AL7A 5CPMA 3S0CA 1YTEA 2YFOA 3FKKA 1H60A 1TV5A 1WOAA 1QOQA 3PG8A 4K37A 5L9FA 2V2DA 1H1YA 1RZMA 1TPUA 2FB3A 3HGOA 4XKYB 1ADOA 4IPJA 1DJNA 2C6QA 2Q8LA 5D32A 1TQXA 4GBUA 1ZJIA 2H8XA 2A1YA 2QCNA 2ZRWA 3A24A 2YSWA 1E51A 4E38A 2QF7A 3W1AA 5FF4A 3L9CA 1YLVA 4JX5A 4LRTA 1I2PA 3HO8A 3SI9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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