1JQX | Genus

Total Genus 113

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	113
sequence length	311
structure length	311
Chain Sequence	MLNTTFANAKFANPFMNASGVHCMTIEDLEELKASQAGAYITKSSTLEKREGNPLPAYVDLELGSINSMGLPNLGFDYYLDYVLKNQKENAQEGPIFFSIAGMSAAENIAMLKKIQESDFSGITELNLSCPNVPGKPQLAYDFEATEKLLKEVFTFFTKPLGVKLPPYFDLVHFDIMAEILNQFPLTYVNSVNSIGNGLFIDPEAESVVIKPKDGFGGIGGAYIKPTALANVRAFYTRLKPEIQIIGTGGIETGQDAFEHLLCGATMLQIGTALHKEGPAIFDRIIKELEEIMNQKGYQSIADFHGKLKSL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Lactococcus lactis dihydroorotate dehydrogenase A mutants reveal important facets of the enzymatic function pubmed doi rcsb
molecule keywords	dihydroorotate dehydrogenase A
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Lactococcus lactis
total genus	113
structure length	311
sequence length	311
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2001-08-09

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	1jqxA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1jqxA01

3UYCA 1IIGA 1QMLA 1LDCA 4K7YA 4QM1A 2GVJA 5LZLA 2ZZ3A 4RZ6A 1MZHA 4XBKA 3NAVA 1VYSX 2QCHA 3OA3A 5BMXA 4BF9A 1HO4A 2FFCA 4IXHA 1KTCA 1DL3A 4DPPA 2TMDA 2RFGA 3I7QA 1M7PA 2NUYA 4NNAA 1K7EA 1H62A 3QSTA 3ATZA 1YTEA 4N9DA 4O12A 4CNOA 3S5YA 1KV8A 1JQVA 3ELFA 4IUOA 2NUWA 4HHPA 5LNSA 1FDYA 5FI8A 1XBYA 4NJGA 1OK4A 5FF7A 1DKWA 2J88A 5AHNA 5AC7A 4L4MA 5G2WA 3KX6A 1OFRA 4Q32A 4LVFA 4FNRA 1B57A 3SECA 3SW6A 3S9YA 1UASA 2JK2A 1R46A 2QAFA 3W2NA 3LDVA 1QDSA 3STGA 4MZ8A 2VFFA 3CM4A 4EIVA 1GYNA 4TX9A 1KM5A 2H3BA 3RFAA 3THQA 2VEKA 1TREA 3G0XA 1YPFA 3L66A 1CW2A 3LGEA 5AYYA 2W79A 3KAOA 2VEMA 4N9BA 2DZTA 2NXGA 5CPNA 4Z0SA 4LS0A 3UPWA 4AEOA 1S5TA 4Q33A 5BNKA 1QWGA 1ZY9A 3L5LA 1BWKA 3MI2A 1PVNA 2V5BA 5CPMA 2DJXA 1TV8A 5DBUA 5TBOA 2CLFA 2Q8LA 1LBMA 5CKSA 1GTHA 2J24A 2DZWA 2YCEA 3HG2A 3W22A 4O19A 3W75A 3T40A 2NWRA 3NVTA 3M41A 1DJQA 2WSRA 2QCEA 3G3MA 4O28A 3BV4A 3HG3A 5HUPA 4ZVJA 4UTMA 2JKAA 2PRLA 1VCVA 2QDGA 3CC1A 2YX0A 3HQ1A 4MY1A 5LNRA 4JDBA 3W2JA 4U4MA 1LP6A 2ATMA 2ISSA 4ZQNA 1NVMA 2VFEA 4RJEA 1FWTA 4DQWA 5G2IA 3B0PA 4XQ6A 2ATSA 1OX5A 4WY0B 2H8XA 1A50A 4KFPA 3BO9A 4MJZA 2ALDA 4TMCA 4N6FA 3D0CA 3MI6A 4GBUA 3W1RA 2A21A 1LLWA 3VNDA 2H6RA 5CPLA 1ME8A 3M5VA 2PURA 4UFJA 4CQ8A 4NT0A 2HS8A 3RLUA 4MVAA 3YPIA 4UTWC 3STFA 5G4EA 1X8FA 4Y9AA 1KBJA 1E51A 4C1LA 3LLDA 4CCDA 1JCLA 1NEYA 3EB2A 2G96A 2VEIA 3P84A 3LCGA 1T8XA 2VKZG 4WY0F 4OV9A 3SJ3A 5BOOA 4UR8A 1O95A 2V8ZA 1Q3NA 2G5WA 2E77A 3GDRA 3GXPA 3P74A 3GDTA 1FXQA 1XI3A 3JS3A 1I2PA 1H60A 3L21A 2R94A 3O6YX 3R2GA 3MP3A 5D2TA 2YW3A 1TPFA 2WJZA 2KZHA 5KMYA 5CZJA 3NQ6A 5T26A 3ZWSA 3PBWA 4K39A 2I1OA 3PG8A 1XUUA 2I14A 5C2XA 3RU6A 2C13A 1W5PA 4LWWA 3QMSA 1RQHA 1VPXA 4JIQA 4R34A 2FPYA 3PVFA 4E2DA 4GUIA 3NQFA 1QPRA 2FB3A 3EWWA 3FKKA 3NA8A 1K8YA 1F73A 2WNNA 1I45A 3PS7A 1NF7A 1LROA 5KSWA 1QOQA 1YADA 3KOFA 1ZFJA 5EKYA 1SW7A 4UTTA 4X3ZA 1VH7A 1XKYA 1C29A 2G97A 4OE7A 5I3KA 1I2OA 1GG0A 1N55A 3W88A 3G3DA 4IWWA 3UWWA 4AMAA 2RDTA 2X1TA 4O11A 1KM2A 1TPVA 4CLMA 1ZAJA 2QEZA 3P61A 3IVSA 1KM3A 2V30A 4TR9A 4Z1AA 1AW5A 3F03K 1LBLA 3TKFA 3LB0A 1RZMA 4JTJA 2G95A 4HSNA 3U2OA 3G0UA 1WXJA 1D3HA 4JTLA 3O6CA 3FJ6A 3W73A 2E5BA 3M5YA 4Y6GA 4DEFA 4QAIA 4UXDA 2QJIA 3O07A 2C18A 1TTQA 5BW6A 2WNZA 1WA3A 2FPTA 5DBTA 3LHTA 2OT1A 2FDSA 5HR7A 3QPYA 1G7VA 1IXQA 1TPWA 4JDYA 5HMSA 2HS6A 3NM1A 1XUZA 4AAJA 2QAPA 1KFJA 3OVRA 5DY2A 4WQ6A 5LGZA 4GJ1A 4JGDA 2V9DA 3VFLA 2CZEA 3STEA 3NXFA 4O8RA 1W3IA 4OBTA 5D2YA 2A2IA 2R14A 3CWNA 5I3HA 4ZL1A 4FX7A 2QJGA 5K7JA 4UFKA 1O5KA 4GNJA 4CNNA 4RZ5A 3P7YA 3L2IA 3M47A 2ZA3A 1G4SA 1NFBA 2J9ZA 3TAOA 1CI1A 4FHAA 2PRMA 5K9CA 3GKFA 1GPWA 1A5CA 1YPIA 3FIGA 2NX9A 3G1VA 3CWOX 5G1TA 1KLYA 3CEPA 4MYAA 3W2UA 2BLEA 1QAPA 1TQJA 4O1CA 4K36A 4QITA 4IQLA 1JCMP 2XN0A 1ZNNA 4NJKA 2O7QA 4OT7A 4ZQMA 3RK8A 3SFKA 4AB4A 4X2RA 1KM0A 3LCXA 3NQ7A 5IM51 1W56A 4UNKA 3TQVA 1H50A 4J9JA 3SGZA 2NXIA 2RKXA 4P2VA 1A53A 1XDLA 1P5BA 5SWUA 3W2LA 1ZAIA 3QQ1A 3W3OA 1W37A 4WJEA 2TSYA 3SGUA 1LYXA 5LGXA 5DCDA 5DELA 1QCWA 3C2VA 1IF2A 2X1UA 3NGJA 3TQ0A 4FF7A 3TFCA 1J4EA 5AOUA 3QW4B 1IXNA 1BTMA 4D2JA 4LY8A 2HSAA 1LRNA 1FWSA 3NDOA 3TSMA 4FIRA 1IGSA 1OF8A 2BTMA 4DPQA 1VCFA 3LHVA 2GJLA 5K3VA 3IGSA 4GUJA 1GWJA 1T96A 3PG9A 4CQ9A 3C2FA 2A6NA 2ZZ4A 3TA6A 1VZWA 5D03A 3GB6A 3DFOA 2J9XA 1ZALA 3Q94A 4HSOA 4A2SA 3NQEA 3HF3A 5DXXA 4CCCA 2WOQA 3MI3A 3C8FA 1ME7A 1RV8A 2WKJA 5DY3A 3P67A 5DXYA 4HT3A 4UUIA 4LS2A 2PE4A 1EB3A 1WOAA 3HPZA 1I2NA 2FB2A 5F4WA 1ZAHA 3DFNA 4CNPA 3L0KA 5D32A 2CFFA 3L65A 4O18A 2VELA 3N9RA 1FUYA 4NU7A 4TIMA 4LC6A 1L6YA 4JX4A 1AW1A 1PCWA 3OEXA 4JTGA 3MUXA 4LUIA 2E68A 1TRIA 1A5AA 3VI2A 5C5YA 3SZ8A 3LCHA 5HWJA 1YXDA 3DKLA 3O63A 1I4NA 1FWNA 1NF0A 3QSRA 1P0NA 5AHLA 1EX5A 3UNDA 5AHIA 2Y85A 1LM1A 3HIJA 4MLJA 3TXZA 2A6LA 2VEPA 5FF2A 4O50A 4JYEA 1UBSA 1SW3A 4WXZA 1X7FA 4JR5A 1H1ZA 1K7FA 4IMEA 3PB0A 1FWWA 3M5ZA 5AC6A 3QM3A 3EXTA 3LCFA 4O1BA 2Y7FA 4QJ1A 1GQNA 3IV3A 3S1WA 3EX4A 2Y61A 1JVNA 1Z48A 3NQMA 2DZUA 4IPIA 3R5EA 1PV8A 4C1KA 2QUUA 1G6CA 3W76A 4AF0B 3NQCA 3BVJA 3LERA 3O16A 5I3JA 1Q6LA 3EXSA 1QO2A 4FNQA 1DOSA 5A8GA 4LV4A 3C4UA 3WJWA 4S2BA 4BFAA 2RDUA 3QFEA 5F1UA 2GOUA 5LHFA 3N3MA 1F6KA 1P0KA 3HGOA 4GUGA 4LT9A 4RXFA 4LC8A 1EP2A 2WSYA 3DHFA 3TNOA 1ICPA 4AWUA 3LI1A 2C16A 1O60A 3LOTA 4GRSA 1TSIA 1HO1A 1XFBA 2X30A 1JCJA 3AO0A 3TFXA 4YWIA 4KFNA 3W07A 3M44A 3A24A 3G18A 3P82A 3RLVA 1N8FA 4ZMGA 1Z41A 5FEZA 3GKAA 3W74A 2H3DA 5CSRA 1KFEA 4MFEA 1S5WA 4HPXA 2J6XA 1FCQA 5FF0A 1YDVA 3EKLA 1SZGA 2CLKA 4PC8A 2FQIA 2V0TA 1RQEA 3HGJA 3G1XA 3UQNA 3QQ0A 3MP5A 1U5JA 4M7TA 1P4CA 1VYPX 4QIUA 3PUEA 5LNWA 3PC0A 4AWTA 1DVJA 4O1DA 3GXTA 5D04C 4MKNA 1FDZA 3LHUA 3ABOA 1RPXA 1SR9A 3BW3A 2ZZ1A 4WXYA 2GVGA 3HPSA 1B4KA 4YLWA 1MO0A 1SFJA 3HG4A 4MY9A 2EPHA 4Z0JA 3W9ZA 3FYPA 5DCEA 3W1QA 2NWSA 3GIYA 3IRDA 3P8JA 1EP1A 5K2ZA 4Z08A 3LRKA 3G1YA 3B4UA 1VHCA 1H63A 1I2RA 3HG5A 3NQ8A 4JTKA 3IEBA 3MHUA 2ABBA 2W6RA 3E12A 3SSJA 4POCA 3MO7A 4FNPA 4Z1DA 3C6CA 1H1YA 1JR1A 4GUFA 4AXKA 3MP4A 1XCFA 3W7GA 3QW3A 5CGQA 3C0JA 3TSBA 3C52A 1ME9A 1DBTA 3W7NA 2E6FA 3EEGA 4ZQOA 2HMCA 3W7DA 3NM3A 2QCDB 5G4WA 2DORA 2XN1A 4MYXA 4UTKA 4TO8A 3RF9A 4O15A 3KRZA 4GC4A 3N14A 3S1VA 1SSGA 3KVJA 1L2UA 4TMBA 4FXRA 4M6QA 3BLEA 3DENA 4BWLA 3NEVA 3DZ1A 1DQWA 2D73A 3PBVA 2ZYFA 1OFOA 4O52A 5LSMA 2AQWA 4YL2A 4LOCA 3UXAA 4DF1A 4PODA 4XTIA 2QCNA 3GLCA 4EOUA 1QFEA 1VQTA 3LTYA 3TAKA 4LV9A 4OGZA 4E38A 4PEKA 1JULA 1SO6A 5D2WA 2JKPA 3NZRA 3BW4A 1LOLA 3OVQA 5K9DA 1SO4A 3TCEA 4UTTC 3MHFA 1AK5A 5A5WA 4AWSA 3A21A 1C9DA 5LHEA 5L9FA 5HQEA 3QYQA 3S1XA 4LS1A 3S5NA 4A21A 3PY2A 1FXPA 1B4EA 1I8JA 5HNRA 1LOQA 3W7KA 2VFGA 2EGZA 4MZ1A 4WUIA 1QO5A 2B7QA 3RNDA 3LXAA 2WSQA 5I3FA 2VFIA 3KRSA 3W7HA 1EUAA 3E49A 3I6RA 3N73A 3QMTA 3W70A 4JTSA 3Q2DA 4UTJA 2ZTJA 1SQ7A 4NX5A 3TXVA 3QZEA 5DCBA 4O0ZA 2ISVA 2PC4A 3EWYA 2EKCA 2F84A 4QNWA 4ZQPA 4MUZA 3TW7A 3TQKA 1DHPA 3UWVA 3DGRA 4HKPA 4OU1A 4I7UA 1YYAA 3C56A 3C3NA 4XUGA 3ZS4A 4Z1CA 1XBVA 1FCUA 2ZCGA 3NL3A 5EBUA 1EEPA 4Y96A 5U7SA 1TIMA 4O0KA 4UMAA 5F2LA 4ADSA 4S2CA 3TU9A 4O57A 5F2IA 3LM7A 1VR6A 4NJHA 4NXSA 1WBJA 4FIQA 4JIPA 2A7PA 3NZ1A 1TTPA 2AAMA 3TC6A 3TJLA 5CZTA 3EX1A 4LRTA 4AF0A 3ZFHA 4MLRA 4JTUA 5TIMA 4B5NA 3SIZA 2FTPA 3DI0A 3EXRA 3NOEA 5LNVA 4HNTA 2JKEA 1X6UA 3W1TA 5E1QA 4O16A 2BXVA 3TH6A 5KZMA 5EPDA 1ALDA 4MOZA 2RH9A 1MXSA 3P8IA 2VFDA 1UJPA 4M7SA 4UTUA 3DFTA 3N19B 2TRSA 2Z0IA 4LW7A 4DO4A 1K3UA 3W1PA 2DP3A 1RR2A 4UMBA 1KFKA 5I3GA 5E0KA 4RV8A 1JJKA 1KM4A 4L4LA 3W1NA 2ZRVA 4I7VA 4UFMA 4FNTA 3A5FA 3PUOA 3WK1A 4LNYA 1PCKA 3CHVA 1YDOA 3I65A 1XM3A 2Q3RA 2A4AA 1H7WA 3GVGA 3L9CA 3LRMA 4M6PA 1K8ZA 3S1UA 1R2RA 2QKFA 1EPXA 5AN7A 3OIXA 3TE9A 1DV7A 3EWXA 1OFAA 3JRKA 3A22A 3IIXA 4O13A 1QOPA 7TIMA 2FIQA 1FY6A 1SUXA 2CLEA 2QCMA 4X9SA 1F76A 2FPVA 1CX9A 1SO3A 2O7SA 3L5AA 2FJKA 4Y90A 2Y7EA 3GXNA 3IGXA 3O05A 1BWLA 3TROA 4K7VA 5KZDA 1JCXA 4BK9A 4LRSA 3O1NA 4M5PA 1VYRA 4FO4A 5TQLA 1VGAA 2OT0A 3FOKA 4HIBA 3VKJA 3BARA 4ZQRA 5GVJA 2C3ZA 2IQTA 3NPWA 4IOTA 3HJZA 1GVRA 1TPDA 2NX3A 3G1HA 3NL5A 1QR7A 3ABQA 1JCYA 2R8WA 3S8HA 4WD0A 1B3OA 4NJJA 3ZR4A 3HB9A 4R33A 2NZLA 2H90A 3M43A 3U8GA 1FX6A 1OFQA 4AHPA 4UCGA 3G22A 3WK0A 3DH7A 4BR1A 3K30A 3R8RA 5H2ZA 3MMTA 2X16A 3CQ0A 3L0NA 2P1FA 5HWMA 4UIOA 5EY5A 5CPOA 4JTTA 3A23A 5LNUA 2QCDA 3UXDA 5F2MA 5IBXC 3GDLA 1Q6QA 4LU0A 3B0VC 3IIPA 3B8DA 3KVLA 3EX3A 1V5XA 1WV2A 3G1AA 4WZHA 3W85A 2QCGA 1HG3A 3O06A 3USBA 4XZ9A 1MEWA 4X22A 2YDAA 2ZFAA 4UFHA 2OX1A 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2P0OA 4EVZA 1F6PA 2EHHA 2V82A 4Y8FA 1RD5A 2VOMA 1XL9A 2VFHA 3DBPA 1F2JA 1XBXA 1L9WA 1LCOA 3PBYA 4JNMA 4PH6A 4YMZA 3GYEA 4ONVA 5KZEA 3S5OA 1H7NA 4O17A 2A0NA 3B06A 1F05A 1UB3A 5EYWA 1YDNA 5FEWA 4DELA 3NG3A 4CQAA 1YLVA 1EWEA 1ADOA 4N2YA 2ZRZA 1GVOA 4AHQA 3GK0A 1TPC1 4HNNA 4XBSA 3MHGA 4N9CA 3U6WA 4BWLC 4DBEA 3ATYA 3GX9A 1GG1A 4DXVA 4YXGA 4O4VA 3NQAA 1UUOA 4JICA 3BLIA 1A5BA 3L0GA 2Y6ZA 4KWWA 5D09A 4MIMA 3TC7A 2C14A 2WNQA 1T99A 1JUKA 4NVTA 1GYLA 3O8AA 3HO8A 3GAKA 3LXBA 1SFLA 1XC4A 4MFDA 2QUVA 1QPQA 3B05A 4RK8A 2NX1A 1VJIA 1NSJA 2CU0A 2JGYA 3MWAA 3ZWTA 3FYOA 1O4UA 4EWND 3TMQA 1OX4B 2W0UA 4A22A 1OFBA 1KM1A 3M9YA 3TW6A 4N6EA 5K9XA 2XFWA 2J9YA 2WO5A 3W1XA 4ZQCA 3NYZA 2Z6JA 1F7BA 5KINA 4UFIA 3W7QA 1C8VA 3UY7A 2Z2UA 2LLEA 2YSWA 3LCWA 2DZPA 4FNUA 3OVPA 3LCIA 3W7RA 3BG3A 2YPIA 4RXGA 1OG0A 3PF3A 1S3HA 5HUOA 2YXGA 5I3IA 4DF0A 3KVMA 1DJNA 3W7PA 1OFEA 2E6AA 1ICQA 3FEMA 2C6QA 3MW7A 4JEQA 5HWNA 2RDWA 3T4CA 4DF2A 3G24A 1VRDA 2VXNA 3W83A 2FLIA 2CW6A 5AB3A 4IX2A 1HUVA 1H7PA 3NO5A 1Z42A 1PIIA 4IX0A 1X1ZA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1JQXA

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