1JRC | Genus

Total Genus 115

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	115
sequence length	311
structure length	311
Chain Sequence	MLNTTFANAKFANPFMNASGVHCMTIEDLEELKASQAGAYITKSSTLEKREGNPLPRYVDLELGSIASMGLPNLGFDYYLDYVLKNQKENAQEGPIFFSIAGMSAAENIAMLKKIQESDFSGITELNLSCPNVPGKPQLAYDFEATEKLLKEVFTFFTKPLGVKLPPYFDLVHFDIMAEILNQFPLTYVNSVNSIGNGLFIDPEAESVVIKPKDGFGGIGGAYIKPTALANVRAFYTRLKPEIQIIGTGGIETGQDAFEHLLCGATMLQIGTALHKEGPAIFDRIIKELEEIMNQKGYQSIADFHGKLKSL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Lactococcus lactis dihydroorotate dehydrogenase A mutants reveal important facets of the enzymatic function pubmed doi rcsb
molecule keywords	dihydroorotate dehydrogenase A
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Lactococcus lactis
total genus	115
structure length	311
sequence length	311
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2001-08-13

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	1jrcA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1jrcA01

4WD0A 1OK6A 5BOOA 2YDAA 4OQVA 2ZFAA 3B4UA 4MLRA 3JR2A 3QH2A 4LWWA 5FEWA 2H8XA 1VYSX 4X22A 4AF0A 4H4IA 1A5AA 4YL2A 1OG0A 4O0KA 3H54A 2HSAA 4GWEA 3BW3A 1OYAA 2CZFA 3LHYA 1EP3A 5CPMA 2FPTA 3W2MA 2J27A 3DXIA 5IM51 3CM4A 2EPHA 3FIGA 4UXDA 4GUFA 2O7SA 1U83A 4O50A 3TQKA 2NLIA 2V8ZA 4LY8A 3IIZA 4AB4A 4JICA 4AHPA 2ALDA 4M19A 1SO6A 3GDRA 5I3IA 3I7QA 3P74A 1E51A 5LHFA 5DXYA 2ISVA 4N9EA 1OVDA 4A21A 1P5BA 2HMCA 3W1PA 3TFCA 1IXPA 3LTSA 3MUXA 4O11A 2V82A 5AHEA 1AG1O 4MY1A 3PR2A 4C1LA 2R14A 3L21A 3S1WA 2FLIA 5DXXA 1D9EA 1TJRA 5E93A 3WK1A 2H3BA 1A5CA 4ZZ9A 3FEMA 4JTFA 3G1VA 5FF0A 3HQ1A 1QPQA 1XUZA 4GC4A 4IMFA 4NJHA 1TPDA 2C3ZA 2QF7A 1OFAA 4LVGA 5CSSA 3UZJA 4O15A 2QEZA 3P5YA 1DL3A 1PCKA 2PURA 3VE9A 3Q37A 4YCOA 4CNNA 2QR6A 3DHFA 5F2LA 3KRSA 3RLVA 1DV7A 2QCHA 3W7LA 3M41A 2QCLA 3W1NA 4PL2A 2QUVA 2ZQ0A 3LHUA 2Z6IA 3NQVA 3DFPA 4NX0A 1OYBA 3W2UA 1Z42A 3A21A 3BPWA 1PS9A 1LLZA 1KLZA 5AC8A 2DZUA 1DOSA 3PULA 3N14A 3RK8A 2Y7FA 2VENA 1HO1A 4BR1A 1BWKA 1FXPA 2DZXA 3PS7A 4LVFA 3PY2A 2AQWA 3KHJA 1K7EA 3W1QA 1QDSA 3M5ZA 4JTHA 1VQTA 3C2FA 5CZ0A 3W23A 1BWLA 3O16A 1GVOA 5DN1A 3TROA 3G1XA 1G7VA 3TC6A 4O1BA 4CQ9A 5AC7A 4FF7A 3CT7A 1KM4A 4TMBA 1J4EA 3UWQA 3C56A 1W3IA 3KOFA 2ISSA 3N3MA 2G5WA 1XBZA 2BXVA 4I7UA 1YDOA 3QMSA 5KSWA 3RMJA 1EX5A 2C6QA 3PG9A 2V30A 3S5ZA 1UCWA 1K03A 1KFJA 1KFKA 4W9TA 1KFEA 4QITA 1FCVA 1HTIA 1A53A 1S5VA 4M6QA 4IPJA 3W74A 3DI0A 3T7VA 3BK0A 3DFNA 1XC4A 4S1FA 1OABA 4LUJA 3QPYA 4NUWA 5HUPA 2VEMA 1JUEA 4R34A 5BW6A 5IBXA 1CX9A 4GE8A 1IIGA 3MP4A 2E6YA 5AOUA 1SZFA 5TIMA 3FJLA 1N8FA 3G1DA 3WJYA 2NX9A 5G2IA 3C2OA 3HPXA 3OIXA 1OK4A 3W7CA 1KM5A 4O18A 5D04C 3A5VA 3JS3A 2A7PA 2H90A 4K6AA 2C16A 4FEZA 3PB0A 2XN1A 1FWNA 2OCZA 5FEPA 2EF9A 3BW2A 2YGYA 1GJPA 1I8JA 3R5EA 4IX0A 3M47A 1FXQA 4IXXA 1PVNA 5K9CA 1B4KA 4LC6A 1GG0A 1YTDA 2E5CA 2J6XA 1RZMA 4BFAA 3LCLA 1TPVA 4O4VA 1SO4A 1VH7A 1YPIA 3G0UA 3GDKA 1YXYA 4EOUA 1LRNA 2E68A 3EWBX 4CCDA 4RZ4A 3HOJA 2B7PA 5EMUA 2DU2A 3L5LA 4WXZA 3LX9A 4UFMA 3O6YX 4NNAA 2GVJA 2XN0A 4KFOA 1H7PA 1FWTA 2W6RA 4HIBA 4N6FA 1KA9F 3W2JA 2QAFA 2QDGA 3NQDA 3QC3A 1KV8A 5KINA 5J5RA 1OF8A 3GIYA 5G5IA 1B57A 3B06A 3QMTA 1VLWA 2J88A 1OFQA 3DKLA 4NZFA 3LXCA 1H7NA 4A3UA 3LHWA 1QAPA 2JKAA 3L0KA 2VEPA 1S3HA 5E1QA 3WK3A 4ADTA 1LRTA 2WKJA 5KITA 3G24A 4JN6A 2DORA 2HS6A 5CGQA 1FWWA 3PSWA 1OFBA 3G18A 4OGZA 5HQEA 3GR8A 1LYXA 3W2LA 3MYOA 3QFEA 4FNPA 3S1XA 5DLCA 3NAVA 4Q32A 5EA9A 2V5LA 3W7KA 3O15A 4QISA 3W85A 1ML1A 2F84A 4MZ8A 3FYOA 4IMCA 4AVFA 1DQXA 3EWUA 3E49A 3FA5A 1VRDA 2BWGA 1XBYA 2QUTA 4PEKA 3UY7A 3W7HA 1GTEA 1KM3A 4JXCA 3HJZA 4RV8A 2GVGA 2WNZA 1ME9A 3H53A 3SFKA 5LZLA 4JX4A 5K4ZA 3LRLA 3STFA 1G6CA 1G4EA 3LERA 3SGUA 4JDYA 3NZRA 1IXOA 3M16A 3TSBA 3QPZA 1X7FA 4NXKA 1K8XA 4KKXA 4NU7A 3EXSA 1FQ0A 3NQMA 4WJEA 4JY8A 5C6MA 3TA6A 4IUOA 1JCXA 1MO0A 2VEIA 3KAOA 3S1UA 4WXYA 4U4MA 4UFHA 4UMBA 3N73A 3HB9A 3HGRA 5FF7A 4JTEA 1Q3NA 1VYPX 1WBJA 4WY0B 4DBDA 1KFBA 3HO8A 4LTSA 3NVTA 2B7OA 3OVRA 4ADUA 3QW4B 3TAOA 4H3DA 3VKJA 5D2YA 3L65A 3C4UA 1FWRA 4Z1BA 3UPBA 1VCFA 3QSTA 1QPRA 2ZA2A 1LCOA 3C2EA 1G4SA 3LBCA 4CQAA 2OJPA 3HPSA 1HFBA 1OJXA 3BG5A 3M5XA 4QNWA 3LGEA 3TQ0A 2G97A 4XTDA 4FNTA 1RPXA 5CZSA 3P5ZA 2VFGA 5A5WA 3O8AA 5DELA 5U4NA 3MJYA 4AHOA 1YPFA 4O0ZA 3SW6A 3EWWA 1RQEA 2BSLA 3WJZA 4JY9A 4Z1AA 1XKYA 3PBUA 1PHWA 5CZJA 3W7RA 3W7OA 4GUJA 4XZ9A 1FCUA 1RR2A 4X9SA 1VS1A 1NAL1 3W1RA 3A24A 4XUGA 2DZWA 2PE4A 1MZHA 4HT3A 3UWZA 1FUYA 5F2MA 4JDBA 1F74A 3NM3A 4TX9A 5EYWA 3M5VA 2B4GA 1MXSA 3CHVA 4GRSA 4H6KA 3W7EA 5DCEA 3FOKA 3A5FA 4UTJA 4MPQA 3G1AA 3EB2A 1VLIA 1W54A 4Z08A 3BG9A 3TU9A 3CLMA 2ZBTA 3NQ6A 5I3KA 2GQ8A 3NYZA 2FTPA 3S6DA 3CU2A 4LC8A 2OZ0A 2VOMA 3OG3A 1JQVA 2YCEA 1QMLA 3P61A 5CPOA 1OX4A 3UZ5A 4ORIA 1M7PA 4DO6A 3TIMA 3G22A 3W9ZA 4ALDA 3TK7A 3THAA 5AHFA 1L6WA 3BW4A 1WBHA 2NXIA 1LOQA 4FX8A 5FESA 3KVMA 2WSQA 1EEPA 2JK2A 3RNDA 2Y62A 5C5YA 3LLFA 2CLMA 3O05A 5A8GA 2YYTA 5I3GA 3BGJA 1GVQA 4ONVA 1H51A 1LROA 3KRZA 1R47A 3NDOA 1T99A 2ZZ5A 3TNOA 2YX0A 4KWVA 3CPRA 5HWNA 1TYGA 5K3VA 2A6NA 3N9SA 4QQ3A 3GKFA 5IBXC 3R8RA 3W7NA 4LRSA 3TFXA 5ABTA 1C8VA 4LNYA 2WPBA 2LLEA 2RDWA 4CCCA 2A5HA 1TPUA 5C2XA 1H7OA 4OU1A 4AMAA 1KM0A 5F1VA 2WNQA 2GPTA 1Z41A 4K39A 3RLUA 1H7WA 1HG3A 1W5NA 4M7SA 5D2TA 3LRKA 3LB0A 3OA3A 3TDFA 3MMTA 4JYFA 1GVFA 3GAYA 2I9EA 2EHHA 3QQ0A 3N2MA 3LI0A 1XI3A 1FDJA 2E77A 3NXFA 1DORA 2VKZG 2I14A 3C6CA 4CNOA 3QF0A 4UR8A 1TTQA 1LM1A 3W83A 2Y6ZA 4HSOA 1H1YA 3GLCA 3W1UA 3CEUA 3B05A 4GUIA 1ZHAA 4FNUA 4DO4A 2NX3A 3F4NA 2E6AA 3M7WA 1SZNA 3W76A 3GNDA 1R2TA 4OT7A 3ATYA 1W1ZA 1JCLA 3IIPA 1VJIA 2I1OA 4L4MA 3ZR4A 4AXKA 2Q3OA 2XFWA 3MP5A 3R13A 4NVTA 1TQJA 5D05A 4E0CA 3WJXA 4U28A 4CLMA 1JR1A 1BKSA 2CZ5A 2VXNA 4BWLC 4FNSA 1YXCA 3MBDA 1O95A 1MEWA 1L9WA 3Q2DA 5K4XA 1TPEA 1VHCA 1LLWA 3I7SA 4RX0A 4DF1A 3EWZA 5DY2A 1KTBA 4IQLA 2A85A 1PCWA 1QNVA 2VFEA 5DBTA 4D2JA 2Q8ZA 5K7JA 1KBJA 2PRHA 4WQ6A 2JBMA 4GBUA 1M6JA 2JGQA 4M6VA 2RHGA 1CW2A 2YFOA 4UR7A 1KM6A 4GUGA 4LU0A 3P82A 3QEZA 3BLIA 2EKCA 3NL2A 2WJZA 1WQ5A 4UFKA 5L9FA 1NF0A 2P0OA 4DO5A 1TPC1 3PF3A 1YDNA 3E9AA 2J9YA 4MLJA 2VFIA 8TIMA 2YFNA 3IIOA 4Z1CA 3TSDA 4JIPA 3NNTA 5G4EA 5HWMA 5I3FA 2C0AA 4DELA 1K3UA 5F1UA 3W72A 7TIMA 3B03A 4P61A 4O1AA 3P80A 3DHDA 1W37A 5AYXA 5HWJA 4MZ1A 3H55A 1S5TA 1VCGA 3EX2A 2V81A 4N02A 4IMGA 3BG3A 1MEIA 4FX6M 5LNSA 1PHQA 2Y70A 1VPXA 2QCDB 3ABSA 4JTKA 4PODA 3UXDA 2CLIA 1SZGA 3FS2A 5TQLA 1RV8A 1A50A 4XBSA 1G67A 1G4PA 3E0IA 1OFRA 2J9XA 3EKZA 4NJIA 3TV8A 3O1NA 4K7YA 2H8ZA 2FDSA 3L9CA 3I68A 2DZSA 4YWIA 2ZZ1A 4WZHA 2J9ZA 4DQWA 1Q45A 1V7YA 3DBPA 1HL2A 4FNQA 3C2RA 4E38A 3QYQA 4J9JA 4FIQA 3NOEA 4ADSA 2NV2A 4I9AA 2DJLA 3TXZA 1LP6A 4GJ1A 2ABBA 2V5BA 4FIRA 1JVNA 2OX1A 3N9RA 1ICQA 1LOLA 3AO0A 1EIXA 1B3OA 2FQIA 3C61A 2F7FA 4MFEA 1X6UA 5KZEA 3KFTA 2Y7DA 2QAPA 2QCMA 1TJPA 4HKPA 4JYDA 1XDMA 3D0CA 4R33A 5BRBA 1B9BA 2P1FA 2HTMA 4ZVJA 4HNNA 3L66A 4YMZA 3HF3A 2PCQA 2ZA1A 3LCFA 3FFSA 3O6CA 2VFFA 4ZQMA 1FCBA 3STCA 1Q6OA 2FB2A 2GVLA 2VELA 3UPWA 3GVGA 4O19A 4POCA 2CWNA 4N4PA 4O54A 3OVQA 4JD4A 3G0SA 1GEQA 1QWGA 1H7RA 3LHZA 1O4UA 3N19B 1DBTA 3DGRA 3E96A 3MI6A 3NQFA 5SWUA 2RH9A 3TCEA 1GG1A 1IIHA 3W7IA 1QCWA 3GR7A 4O1CA 4UC5A 1L6SA 3VE7A 4QM1A 2W0UA 1TSIA 3UWUA 5AYZA 5G1YA 1TREA 2Y88A 4AWTA 1NEYA 2ZZ3A 2NXGA 3QRHA 1MSSA 3TH6A 4MYXA 4JIQA 3C3NA 3V1PA 4ZQPA 3S42A 3LCHA 2V2CA 3KVKA 1JUKA 2Z0IA 3EX1A 1DVJA 3RF9A 2GJNA 2PRLA 3S0CA 1ICSA 4TU1A 3PVFA 4NX5A 1F05A 1XDLA 4QAIA 5C54A 3LV6A 2R94A 3O07A 4BI7A 5LNVA 2Z1BA 1LBMA 1EWDA 4BWLA 3TW6A 2WSYA 4EF8A 5MHBA 1F6KA 2E6DA 5HR6A 2C19A 4HHPA 3NM1A 3BLEA 3QQ1A 4AWUA 3YPIA 1LBLA 5D38A 1EUAA 4UIOA 1FX6A 1ZAIA 4K8EA 1XBVA 1UUOA 2DP3A 3PM6A 3TR2A 3NEVA 1UUMA 3NL3A 6TIMA 3KX6A 4JTIA 3QZEA 3TSMA 3IRDA 4BI6A 2GQ9A 3ELFA 3OBKA 1P0NA 4UFJA 3R89A 1EWEA 3NL6A 4O16A 3M6YA 4JX6A 1I45A 1F73A 4MVAA 4EF9A 5D2WA 3TQVA 1GVSA 2FB3A 4WY0A 2E5BA 2YR1A 4O53A 4UMCA 2ZCGA 3VNDA 3W1LA 4UCGA 1H1ZA 1OYCA 1ME8A 3M0ZA 2RKXA 2QKFA 4NJKA 1QR7A 2QUUA 3NGJA 4OV9A 2Q8LA 1UBSA 4R7JA 1AL8A 1THFD 3DFOA 3U8GA 3TMQA 4UUIA 4LT9A 4WY0F 1OFDA 1LBFA 2ATMA 1W5QA 1WXJA 4QIUA 1G7UA 3DU0A 5KZMA 4E2DA 3MHUA 1OFOA 1Z48A 3NQ7A 1Q6LA 2Y63A 1NF7A 5GVJA 2EGZA 2WQPA 1PV8A 1TRDA 2Y7EA 4ICNA 3GZ3A 3M9YA 3FLUA 3BO9A 1G4TA 2DJXA 3P81A 3SZ8A 4DF2A 3L68A 3KVLA 4PC8A 1TPFA 4MY8A 3PWAA 4UTWC 3U6WA 1QFEA 1JQXA 2NV1A 2R8WA 3I6RA 3LHVA 3P67A 2Q3RA 1RD5A 1LZOA 1GTHA 4JTUA 5K2ZA 4IGHA 1XFBA 3W88A 2RDTA 3EX3A 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2OMAA 3PUOA 5D09A 5G2WA 4EWND 3VCRA 3Q58A 1KW1A 2ABAA 5DCBA 3A9IA 1JCNA 4UTHA 1DHPA 3UWVA 2G96A 1GQNA 2QJIA 1IXNA 1TPB1 3MO7A 5F4WA 4GUHA 2FIQA 3G0XA 4WX2A 4Y9AA 4UTLA 4TR9A 2ZA3A 3NG3A 5FEZA 2Y85A 1WDWA 4GXMA 1W31A 4RXFA 5BMXA 1FDYA 3LCGA 1XM3A 1SSGA 1H7XA 4IMDA 3PBWA 3NZ1A 4NT0A 5LNUA 1NSJA 5DCDA 2CU0A 3PG8A 1YYAA 3KVJA 1I2OA 1SFJA 4LVAA 3F4WA 3B0VC 5FF2A 3F1QA 1P4CA 5L6UA 1NFBA 1ZAHA 3GAKA 1OX4B 3V75A 4HNTA 2ZRZA 4O13A 2ZRWA 1K8YA 2V9DA 2P10A 1YDVA 1OFEA 1LORA 4JNMA 2BX7A 2BTMA 3QSRA 5CPLA 3HGJA 3AJXA 2ZTJA 3UD6A 3W87A 2Y89A 2A2IA 4UTWA 1W5MA 3R12A 4Y8FA 3W84A 5C55A 3VFLA 3ANYA 1TTPA 1EP2A 1ZNNA 3OEXA 2ISWA 3CQ0A 2YXGA 4E2BA 1XL9A 3EWXA 1JRBA 3L2IA 3E02A 1WOBA 4KFNA 1QOPA 1JUBA 2JGYA 2X1SA 2QCDA 3EWYA 3BV4A 3W1MA 5AHMA 4PL1A 5G2HA 1FCQA 4JEQA 4M5PA 3RFAA 2A1YA 3INPA 4FO4A 1KV5A 2WSRA 4DPQA 4X2RA 4M6PA 3NPWA 4MYAA 4MJZA 1DJQA 4PTNA 1WV2A 5I3JA 3B8DA 5HR7A 3DENA 1ZJIA 2PRMA 3GXPA 3LI1A 4OBTA 1RQHA 3S9YA 2B7NA 5DY3A 4O14A 4EVZA 5U7SA 3G8EA 4FB7A 4AH7A 3W70A 3NPUA 1H50A 4TO8A 4Z0SA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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