1JUE | Genus

Total Genus 116

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	116
sequence length	311
structure length	311
Chain Sequence	MLNTTFANAKFANPFMNASGVHCMTIEDLEELKASQAGAYITKSSTLEKREGNPLPRYVDLELGSINSMGLPNLGFDYYLDYVLKNQKENAQEGPIFFSIAGMSAAENIAMLKKIQESDFSGITELNLSCPNVPGKPQLAYDFEATEKLLKEVFTFFTKPLGVKLPPYFDLVHFDIMAEILNQFPLTYVNSVNSIGNGLFIDPEAESVVIKPKDGFGGIGGAYIKPTALANVRAFYTRLKPEIQIIGTGGIETGQDAFEHLLCGATMLQIGTALHKEGPAIFDRIIKELEEIMNQKGYQSIADFHGKLKSL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Lactococcus lactis
publication title	Lactococcus lactis dihydroorotate dehydrogenase A mutants reveal important facets of the enzymatic function pubmed doi rcsb
molecule keywords	dihydroorotate dehydrogenase A
total genus	116
structure length	311
sequence length	311
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2001-08-24

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	1jueA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1jueA01

3P8JA 1TPVA 1SO3A 4LW7A 3G1SA 3BGGA 1KM2A 4A3UA 5KZEA 1XUZA 3DBPA 2NV1A 3DGRA 4JTEA 4UR7A 4YLWA 3WJXA 3IEBA 1BWLA 1LLWA 3MP5A 3GXPA 1HUVA 1UB3A 1TTQA 2ZFAA 2GOUA 3CWOX 3P61A 2V5BA 5IBXC 2CWNA 3GXNA 2VFHA 3T7VA 3PF3A 3STGA 2Z1BA 4S1FA 1FXPA 2CU0A 2H6RA 2QJIA 2E5BA 4QSHA 4C1KA 3TH6A 5DN1A 5IM51 4K36A 4C1LA 4CLMA 3S1WA 2WNQA 4A22A 4FXSA 3L5MA 4POCA 2YZRA 3D0CA 2EKCA 4UXDA 3KX6A 3C0JA 1BEUA 4Y6GA 2R8WA 3L5AA 4N2YA 4AMAA 1N8FA 5HUPA 2QUUA 3GIYA 4LVAA 4K7YA 2NX1A 1FWSA 3UZ5A 4YL2A 1W3IA 1J5TA 4X2RA 3W7KA 3ABOA 5HWJA 4IMDA 2Q8ZA 3HGRA 3IGUA 2ZCGA 1DHPA 1JUBA 2BX7A 5DBTA 3PVFA 1EA0A 4XZ9A 3NQMA 2RDUA 1MZHA 4ICNA 2ZZ5A 3N34A 4XQ6A 4GJ1A 1CX9A 4UTHA 3GDRA 1JUKA 1LBFA 3P74A 4HN4A 2JKAA 3LCFA 1GG1A 3PBUA 5H91A 5DCDA 4X9SA 5G2IA 3UY7A 1QPQA 3M16A 3P67A 1FDZA 3UWVA 1TQJA 3GNNA 1JCXA 1PS9A 3BV4A 4XUGA 3W9ZA 5DCBA 1B57A 1SR9A 3CPRA 1FQ0A 4JIQA 4AHOA 3TU9A 1EX5A 4IMFA 2PRLA 3NO5A 4LS0A 4BWLC 3QRHA 3NM3A 2BXVA 1JR1A 1VH7A 3NQCA 3LOTA 3LV5A 2Q3OA 3NVTA 1Z48A 3GR7A 1H7XA 4WXZA 4FNSA 4JTHA 3F1QA 1O5XA 1TV8A 3N2XA 1K3UA 2V0TA 4UTIA 1LRQA 4NZJA 4W9TA 1RQHA 1JQVA 2YYTA 2Y7DA 4O4WA 3DFOA 3L21A 4HSNA 5TBOA 3W1AA 1UASA 5EKYA 4K7VA 4OV9A 3KAOA 2V30A 3DH7A 4ZQPA 1MSSA 3U2OA 4FX8A 3BW2A 5G2WA 5DBUA 5HINA 3WJWA 5AHLA 4O53A 3S42A 1EP3A 5CPMA 1A5BA 1LRTA 3SW6A 3O16A 2Y7EA 3DFTA 4N9DA 5C6MA 4DPPA 1Q6RA 1TPDA 3LLDA 3I68A 3TDFA 2BTMA 2WPBA 3FOKA 2ISSA 3FKKA 4MZYA 3MI6A 5FEWA 3SI9A 1FWWA 1YTDA 2ISWA 3RU6A 3UWUA 3LBMA 5I3HA 2CZEA 3W2LA 3NQAA 1I4NA 1XC4A 1H62A 1HO1A 1J4EA 3HOJA 5LNRA 1WQ5A 2X2GA 2ZRZA 3O6YX 3P62A 3C2EA 3E0IA 4MFDA 1XI3A 1ZENA 4M6VA 4LVDA 4K8HA 2JGYA 1LRNA 1EPXA 1X1ZA 3DFQA 2E5CA 4DO5A 1H51A 3TAOA 3W1NA 1OABA 3TXZA 4YWIA 2PC4A 4RK8A 1OX4B 2TRSA 3R8RA 5FF2A 2CZDA 2KZHA 3TK7A 1GTEA 4WY0F 1K8YA 2FQIA 3CIXA 4FNRA 1G4TA 1ZCOA 4O0ZA 1IXNA 3O1NA 5KSWA 3FS2A 3C3NA 2ZZ2A 2WQPA 4DBDA 3NL2A 3LXAA 2GUUA 1PCWA 3ZS4A 4UC5A 4IPIA 3B05A 1SZFA 4AWTA 1MXSA 2NUWA 4NNCA 2VFFA 1KTBA 1YADA 3MO7A 2ZA3A 3VFLA 3PC0A 3W73A 4CCDA 1HFBA 3G8EA 4LV9A 1GOXA 1O5KA 4XBKA 3EWZA 2XFWA 1LOQA 1KFCA 2DZVA 1G7VA 5AHNA 3VKJA 2QAPA 3N9RA 2DP3A 3P81A 3L66A 3QSRA 3TQKA 1VRDA 1I2OA 3G1AA 3W76A 3KVMA 1KFLA 2YR1A 3ANYA 3SGUA 2ZRVA 3W2MA 3NL3A 1OFQA 3DI1A 3MP3A 3C6CA 4N4PA 3TW7A 1I2RA 3SGZA 2TSYA 1H5YA 4E0CA 2W6RA 4H6KA 3F4NA 4QISA 4IOTA 3T78A 2ZZ1A 3UXDA 4Y96A 1TPC1 4O1BA 1OYAA 2WSRA 3IIXA 1OK4A 2Y85A 1JCYA 2DU2A 3W1RA 1Q6OA 4OT7A 3S1UA 2BLEA 4I9AA 2VC6A 5J5RA 3CT7A 1VHNA 3BK0A 3M41A 5EY5A 3O07A 1Q6LA 4JX6A 3RNDA 4PH6A 5U4NA 3W75A 1SO4A 1ICPA 3EX1A 1ADOA 1GWJA 1K8ZA 1TYGA 3STCA 1RZMA 4CNNA 3V75A 3W88A 3HG3A 2A85A 1WX0A 3G1VA 2YYUA 5MHBA 5CPNA 5D03A 3W2KA 3MYOA 2CLLA 2GPTA 1DQWA 5C2XA 3UPWA 5C5YA 4O52A 3UPBA 2X1UA 5FEPA 2JKPA 3NL5A 4R7JA 2DZWA 5LKYA 4UFKA 3W2NA 3SZ8A 1A53A 4X22A 5LGZA 1HO4A 1QFEA 1G4PA 1XCFA 2G96A 1L9WA 2NX3A 3STEA 3C52A 3A9IA 5FF7A 2PRHA 1XXXA 3TE9A 1FWNA 1SO6A 3NQ8A 2VEIA 5LNWA 2DZTA 4WQ6A 1H7OA 4PA8A 3CIWA 4CQ8A 4FIRA 3W71A 2NLIA 2VFGA 2YW3A 3R2GA 2R94A 4YCOA 1XFBA 5G4EA 4RZ6A 5HMSA 5D2TA 3GYEA 3KRSA 4N6FA 2NWRA 1TPWA 3B0PA 3L0GA 5IBXA 1SPQA 3M5VA 5KZDA 4AEOA 3FA5A 1H1ZA 4NNAA 2ZBTA 1IIGA 2TYSA 2J24A 2DZSA 3NOEA 3E96A 5H2ZA 4WZHA 1VYSX 1XL9A 1G7UA 3CEPA 1VYRA 5F4XA 3UZJA 2J9YA 1GEQA 4IX0A 2E68A 3IGXA 1T96A 4JYFA 2P0OA 1UBSA 3NZRA 3Q2DA 3UQNA 3TFCA 1W37A 3M0ZA 3LCIA 3LXBA 1KV8A 1H63A 5T26A 3SSJA 3E12A 1NVMA 3GR8A 1KM1A 1S3HA 3NQDA 4O1CA 2QCEA 1AW1A 3ZR4A 4JYEA 3GLCA 3OVRA 5CSSA 5AN7A 3OG3A 1D3HA 1P0NA 1K7FA 1LBLA 5GVJA 4GUGA 1X7FA 5DCEA 1DVJA 3LTSA 1KA9F 4UNLA 1KM5A 4GRSA 2YX0A 5LNSA 2QUVA 2RDTA 3G1FA 4UMCA 1W8SA 3W2UA 3BW4A 1F7BA 4KKXA 3M1ZA 4JGDA 5FEZA 4TX9A 2CLEA 3IV3A 3STFA 3EKLA 1L6WA 3VCRA 1GJPA 3NDOA 1EEPA 2YXGA 3BG9A 1M7PA 1F73A 2QCNA 1H50A 3B0VC 5D2WA 3QJAA 2NXIA 3PY2A 3TQ0A 1JUEA 1UUMA 2VELA 3A24A 5K9XA 4RJEA 4WXYA 1TTJA 1U83A 2HSAA 4JXCA 4TMCA 3TNOA 2V9DA 3TAKA 4UTLA 3SECA 1ONRA 4LUIA 1GPWA 4K8EA 4O4VA 3PAJA 4HIBA 3USBA 2CZFA 2E6DA 4FO4A 1TJPA 4Z1DA 2B4GA 1FWTA 4IXHA 1RQBA 3LDVA 3MP4A 1W5MA 5DY3A 1WXJA 2VKZG 3L2IA 1ZFJA 3NZ1A 5G5IA 3QQ1A 3PWAA 1GVQA 1SW7A 4WY0A 5HR6A 3NEVA 4MVAA 1KV5A 2WJZA 3H54A 3OBKA 4HHPA 2VEPA 4MOZA 1OK6A 4ALDA 3JS3A 1ZHAA 4IX2A 4FEZA 1QO2A 3W7CA 1R30A 3RK8A 3T44A 2YPIA 1V7YA 3PUOA 3W23A 1MEWA 3CHVA 4A29A 4FNTA 4M6QA 4ZVJA 2YFNA 4MLRA 3QW4B 4QJ1A 5AYZA 1KFJA 4IJBA 5LZLA 4JTFA 3B06A 4I7UA 5L6UA 3E02A 2Y63A 1QOPA 4J9JA 1BWKA 1QAPA 1H61A 2WNZA 3HBLA 3LCHA 2RKXA 4MPQA 3GDTA 3G1DA 4O13A 5DELA 3P7YA 2PURA 3LRKA 1I2NA 1M7OA 3KVJA 3MBFA 1I8JA 3TV8A 1VC4A 4R33A 4E2BA 3W7QA 2A4AA 3G1YA 3HF3A 3W1UA 3MHGA 3C2RA 4HPJA 3QH2A 4OHQA 1EUAA 1O4UA 1B9BA 4GE8A 1G69A 3BG5A 4ZMGA 4P61A 4N9BA 4UTJA 1JRBA 2E6FA 1TQXA 4JX4A 1AW5A 2V5LA 1B3OA 3GAKA 1JCMP 1TRDA 3I7SA 1M5WA 4WD0A 2OX1A 2AQWA 3QMTA 4ZQRA 3EWBX 2HS8A 4AHQA 2QDGA 4NXSA 2EF9A 5K2ZA 3GNDA 4NZFA 1FDYA 5HNRA 1NF0A 3PM6A 3W1XA 1EP2A 4UNKA 1VLWA 2VFDA 3RF9A 1F6PA 1YXYA 4DF2A 3LCGA 3HPZA 4MY9A 2A6NA 1EP1A 2X30A 1IXOA 3R5EA 3W7JA 5I3GA 3EWXA 1KBIA 4DO6A 3KFTA 3TJXA 2ZZ4A 3PG8A 4AF0A 4HPXA 3Q94A 2X1RA 2FPTA 3UD6A 4RXFA 2V2HA 4QIUA 3HGJA 2H3DA 3QF0A 1W31A 3TC6A 4PL2A 2I1OA 4Z0SA 1YPIA 2HTMA 1QPRA 5D2XA 1FXQA 3CTLA 3L9CA 1EUNA 3W7NA 1W54A 3S5NA 5C54A 2I14A 5DXXA 2QCHA 3CLMA 3B0UX 3S6DA 1RD5A 2GQ8A 1NAL1 1VCVA 3U8GA 2OT0A 1AG1O 2OMAA 3PBYA 4Z1BA 3E49A 3NXFA 3MMTA 2J9ZA 2WNNA 2VXNA 4ZQMA 1YYAA 1WDWA 3HIJA 1F76A 3A21A 5E1QA 3GK0A 1W1ZA 2H3BA 1R2TA 1MO0A 1OYBA 1TCDA 3TW6A 3ABSA 4XTDA 3U6WA 1CI1A 2WSYA 3ATZA 4UFLA 5K4ZA 3NQFA 1UUOA 2FB2A 4IXXA 2F7FA 5I3FA 1JULA 3HG2A 2V2DA 3HG4A 3WK0A 3HPSA 5F2MA 3HO8A 2QCDA 4RR4A 2V82A 4LS2A 2J9XA 3OIXA 3HMJG 1UJPA 3W74A 1YDNA 1QNVA 3R12A 2OT1A 5AHFA 1AMKA 5LSMA 2ZZ6A 3E9AA 1XUUA 3THQA 4HNTA 1TRIA 2NXGA 1YLVA 5C55A 5FF3A 3CB8A 1QPOA 4N9EA 3DAQA 3PULA 3INPA 2G5WA 1DORA 3ZWTA 4PODA 1JCLA 4MY8A 5K7JA 1VYPX 1H7PA 4JICA 2B7PA 5BW6A 1ZY9A 3I6RA 3RLVA 3RFAA 3P82A 2GVJA 1VCFA 1YPFA 2ZRXA 1B4KA 3VI2A 4BI7A 4JIPA 5FEXA 1FCUA 2WOQA 3N3MA 2GJNA 4WUIA 4JR5A 3C2OA 4UFJA 5D30A 7TIMA 2YCEA 4S2BA 3QMSA 2A7RA 1Z44A 2Y61A 1ZALA 4PC8A 2YFOA 1QO5A 2ZZ7A 3QM3A 4LC6A 1VCGA 3W7HA 3IIPA 4JTSA 2QDHA 1C8VA 1TPH1 3L67A 3W07A 3FJ6A 3HQ1A 3EKZA 5G2HA 1S5TA 4Q33A 5BOOA 5I3IA 1H7NA 3KRZA 1W3TA 1LBMA 2WO5A 2VFEA 4JTGA 3W3OA 2H8ZA 2V81A 4LY8A 4Z1CA 4RKAA 1LCOA 4NJKA 2NUYA 1XBYA 3EWWA 3NPVA 1TV7A 3QPZA 2A7PA 3SJ3A 3TROA 1NSJA 3Q58A 1ML1A 4R53A 1LYXA 1AW2A 4LRSA 2ZTKA 1OFPA 5DLCA 5E93A 5LHEA 1DOSA 5A5WA 3NG3A 1X1OA 5FI8A 3LB0A 1KFKA 4X3ZA 2ZA2A 3O8AA 2H8XA 1F5ZA 1A50A 4QQ3A 1R46A 1TJRA 5D38A 3DI0A 5AC8A 1EB3A 3HG5A 2GVLA 2GQ9A 5EBUA 4LOCA 3IVSA 4JDYA 3FFSA 4L4MA 4KFNA 5HWMA 1DQXA 4B5NA 4LC8A 1PL9A 5DXYA 2BZNA 3G24A 1KFBA 2Y62A 5HR7A 4PL1A 3NAVA 1QR7A 4O1DA 1YTEA 4FB7A 5KZMA 2CLHA 3TMLA 3QYQA 4CNPA 4K39A 2ZDRA 4UTUA 2VEMA 5HULA 1T99A 3MI3A 4M7SA 3W86A 1XBXA 1A5SA 5CG7A 2JGQA 4BI5A 1UCWA 2C3ZA 3M5XA 1IF2A 2QKFA 4BF9A 2C6QA 2Z6JA 4WJEA 4HT3A 1IGSA 2WKJA 3GB6A 3W1TA 2CLOA 4IMCA 2O7SA 4O50A 3W1PA 1KM0A 1TSIA 3L0KA 2YGYA 3H53A 4MY1A 3VE9A 1IXQA 2QF7A 3OA3A 4LU0A 4LV4A 1N55A 4I7VA 5I3JA 4BR1A 4PTNA 3F4WA 1D3GA 1OX5A 2C0AA 2J27A 4EVZA 2Y7GA 3QZEA 1DV7A 3I7QA 2RDWA 5F2IA 3N14A 3QSTA 5AC7A 4P2VA 4IPJA 5F4SA 5J5DA 3FKRA 5CZJA 5D2VA 3QPYA 4CCEA 3W84A 5HUOA 2PRMA 2Q8LA 3B8DA 1TMHA 2HMCA 3P80A 1JVNA 4JYDA 1FWRA 4M7TA 4K37A 5TQLA 1GZGA 5EA9A 3S0CA 4O17A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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