1JULA

Indole-3-glycerolphosphate synthase from sulfolobus solfataricus in a second orthorhombic crystal form
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
PRYLKGWLKDVVQLSLRRPSFRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAEYKRKSPSGLDVERDPIEYSKFMERYAVGLSILTEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMKDFIVKESQIDDAYNLGADTVLLIVKILTERELESLLEYARSYGMEPLIEINDENDLDIALRIGARFIGINSRDLETLEINKENQRKLISMIPSNVVKVAESGISERNEIEELRKLGVNAFLIGSSLMRNPEKIKEFIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Sulfolobus solfataricus
publication title The crystal structure of indole-3-glycerol phosphate synthase from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus solfataricus in three different crystal forms: effects of ionic strength.
pubmed doi rcsb
molecule keywords INDOLE-3-GLYCEROL PHOSPHATE SYNTHASE
total genus 95
structure length 247
sequence length 247
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 1996-05-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00218 IGPS Indole-3-glycerol phosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1julA00
5L9FA 4YCPA 3LX9A 5CZ0A 3C61A 3M1ZA 3AO0A 3DZ1A 1NSJA 3O6DA 3W1XA 1W56A 2NZLA 4CCDA 1H7XA 4E0CA 3UWUA 4E2DA 4YCOA 4UMBA 2FFCA 1KW1A 2YGYA 1O5XA 1T99A 4JIPA 1K03A 3PBVA 1EWDA 3AJXA 4NNBA 2J27A 1SZNA 4QNEA 5K3VA 1BWKA 1N8FA 2A7NA 4JTIA 4UTTA 1LOSA 5CKSA 1AG1O 1H1ZA 3I65A 4HNTA 3BGJA 2VEPA 1TRIA 2NXHA 3Q58A 4MFDA 4UR8A 4I7UA 1ZAHA 1B57A 5BW6A 2WNNA 4AWTA 4Z0SA 3ZS4A 1OYAA 4NJGA 4TMCA 4EF9A 1BWLA 3O1NA 4C1LA 2NX9A 2ZZ5A 4OU1A 4HT3A 3TQVA 4JTUA 1J4EA 1UUMA 3VNDA 2Y61A 3Q94A 3LOTA 1KBJA 1ME8A 2FJKA 3PY2A 1SZFA 4MLJA 1MEWA 4WY0B 1PVNA 3CU2A 5I3HA 3BLFA 3BW3A 3HMJG 3IVUA 4LW7A 4NXSA 4S2CA 2ZZ1A 3P67A 4WXZA 4CQAA 5FEWA 1FCBA 3ZR4A 3PBYA 5LGZA 1H1YA 3UPBA 3LHTA 2YYTA 3QF0A 3O05A 1JVNA 3UWWA 2D73A 4FHAA 4IUOA 3RNDA 2CLHA 3NR0A 1CW2A 3Q2DA 2ZA3A 2CLEA 2F7FA 4DBDA 4GUHA 1P0NA 4UC5A 2GUUA 1G7VA 4LVBA 3CHVA 4WD0A 4O0KA 5D2WA 4JYEA 1W37A 5DXXA 1VYPX 1EB3A 4LV9A 4ALDA 4H4IA 1TTIA 3P7YA 1VJIA 3IIXA 3CTLA 1OX5A 2X16A 1IXQA 1F5ZA 2QUVA 4BFAA 5KMYA 5MHBA 1CI1A 1YPIA 3HQ1A 3NA8A 4JTTA 3TSBA 2E6AA 2WO5A 2VELA 3G0SA 1U5JA 2OZ0A 2EHHA 4RX0A 3RU6A 4JXCA 4HPJA 2WJZA 3BG3A 1TPVA 1YDOA 3FLUA 3W73A 2B4GA 3HG3A 3QMRA 1GTHA 5LHFA 4QITA 1TPWA 2ISSA 3N14A 3S1VA 3PS7A 4ORMA 4UTUA 4Z1CA 1LOLA 1WOAA 1YXDA 4UXDA 2DP3A 3OEXA 5EYWA 3M9YA 3LV5A 3O06A 1J5TA 4HNUA 5D02A 3UXAA 3A5VA 1LZOA 1XI3A 2E77A 2FLIA 2A6NA 3GKAA 4LVGA 1ZFJA 1GG1A 4IXXA 5A5WA 1R2RA 1QCWA 1A5BA 2YW3A 5HULA 3EX4A 2CLKA 4IGHA 3P8IA 4A29A 4AWSA 2QCHA 1B4EA 2DJXA 3NQ6A 4XTDA 3BW4A 3NDOA 4NX0A 4NX5A 5DLCA 2QCEA 4NJIA 1OK6A 3N34A 3GXPA 1L6SA 3GYEA 5KITA 4FNUA 2JKPA 1BKSA 2ATSA 1JQVA 2NLIA 3TQKA 4TMBA 1SSGA 1ZAIA 1W3NA 4IQLA 1AL8A 4UNLA 3GXTA 5EMUA 4N02A 3C56A 4OWGA 1P0KA 3P62A 1MO0A 3PG9A 4MUZA 3C2RA 1SQ7A 4RV8A 1GOXA 1GYLA 1R2TA 3IIZA 1XUZA 3HG2A 3NQFA 1W5NA 4GUGA 2DZXA 2JGYA 2Q3OA 1XCFA 1Z41A 4NNCA 5DXYA 3G1HA 2E5DA 2TSYA 1R47A 1SSDA 4ML9A 3UD6A 1FDZA 3PULA 4JDBA 3GX9A 3PF3A 1KM2A 1ADOA 2YXGA 3TJXA 1LLWA 4TR9A 1G4TA 5DBUA 3M43A 1I2PA 2DZVA 1Z44A 3O8AA 5AC6A 1VS1A 3PB2A 5AYYA 5KTLA 4NJJA 5IM51 2CZEA 1KFKA 2QCLA 3WK0A 2QCFA 2TRSA 1YTDA 2QJIA 3H55A 1OF8A 2ZRUA 1G6CA 5CSSA 4WQ6A 2R14A 2HS6A 4MZYA 4IPJA 1YXCA 5LSMA 4K8EA 1FWSA 4LUJA 1YLVA 1GTEA 4DF0A 4XZ9A 5LKYA 2ZA1A 1H7NA 3L5LA 2A1YA 4QISA 1TV7A 1UUOA 3ABOA 2RHGA 2RDTA 5EPDA 5KSWA 1ZAJA 4GC4A 1THFD 2V81A 2YR1A 1Q6RA 2DZWA 1KM5A 5G2IA 1WOBA 1TV8A 3SECA 1QDSA 5LNWA 2H3BA 3NQDA 3G8EA 3QH2A 4IWWA 3NQMA 3P5ZA 3BGGA 1KLYA 3W7RA 3GAYA 3DGRA 4MKNA 5DY2A 5G2WA 3TH6A 4Q32A 2ZZ7A 4R34A 3WJSA 1OG0A 5KINA 5CPMA 3FIGA 1VH7A 1DJQA 5D37A 4XKYA 1I2RA 4K37A 3C2FA 4KWVA 4FF7A 2HS8A 2H90A 4JY9A 4Y6GA 1FDYA 3CWOX 3PBWA 1OFRA 5U4NA 4K8HA 4A2RA 5HMSA 4AHPA 4ZMGA 4LV4A 3IIOA 3BLEA 3MYPA 4D2JA 3HGRA 3QSRA 1EWEA 3DHDA 4Z1DA 4A2SA 2GQ8A 3A9IA 5AHLA 4DBEA 1TO3A 4K38A 1KM4A 4LT9A 5GVJA 1RPXA 3IGXA 4BWLA 1IXOA 3TCEA 5CGQA 1EUAA 4FNRA 3TXVA 1FCVA 2TPSA 2EKCA 3A24A 2VENA 2C19A 1LOQA 3W7KA 3P80A 1K8XA 3MBFA 3W7OA 1IF2A 3MW7A 5ABTA 4LVAA 4O1AA 2R91A 3LCLA 2A6LA 4PH6A 1Z48A 1KM6A 3GDLA 4O14A 2Y89A 2WNZA 4HNVA 3S1UA 4ZQRA 1TPC1 5HUPA 1I2NA 4PA8A 3EKZA 3C52A 5H91A 4MPQA 1DL3A 4GUIA 2XN1A 1OFPA 3B04A 3NPUA 4O0ZA 1X1ZA 4Z1BA 3DKLA 1KFEA 3SW6A 3UYCA 3LCHA 3W7DA 1TTJA 4PEKA 4KFOA 1F2JA 4NVTA 2A5HA 1X6UA 4X22A 4N9BA 1W1ZA 3W2KA 1AMKA 1FWTA 2O7QA 1Y0EA 3TSDA 3STFA 4GJ1A 2XN2A 5HUOA 2ABAA 5LNRA 1H60A 2GPTA 3UWQA 5AC8A 5HWMA 4ORIA 4U28A 2G95A 4RZ4A 1C8VA 3OHIA 2X2GA 1W5MA 1QPOA 3NQ8A 5D32A 2H6RA 4JTHA 3W9ZA 4YWIA 1AW2A 4JX5A 6ALDA 3C0JA 4KFPA 3W1PA 4UTWC 1VZWA 2DU2A 3SZ8A 1JQXA 4UUIA 3RK8A 3UPWA 1OFOA 5D05A 1PCKA 1T96A 1XDMA 1X8FA 4MIMA 1VCVA 3DBPA 2VFEA 1PE1A 3IEBA 3R8RA 1CX9A 1G4PA 4GWEA 1NFBA 3TW6A 4WUIA 3MHUA 1EIXA 3NPWA 3SIZA 3USBA 4E2BA 2VOMA 2ZRYA 3KOFA 4S1FA 4C1KA 2NV1A 1OF6A 4XKYB 3THQA 3NL6A 3JR2A 4WY0A 2VFIA 2YSWA 2VFGA 4X2RA 3E96A 1LBFA 3LXBA 4UCGA 4ZZ9A 2RDWA 4RK8A 2P10A 3O15A 4LOCA 3P60A 1E51A 3UQNA 2WNQA 4BF9A 2CLLA 3TV8A 1GG0A 3PBUA 4R53A 2QEZA 4JGDA 5DELA 3B05A 1DQXA 3W7QA 3G18A 4LNYA 3V1PA 4FIRA 2Y63A 2Y62A 1IGSA 1K7EA 1ICQA 4ZQCA 3UWZA 4Z0JA 1KFBA 2NUYA 1OFDA 3NL2A 2GQ9A 1X7FA 4R33A 2QUUA 3UY7A 1VYRA 2A21A 3RMJA 1LLZA 1F74A 3EWBX 4JYFA 5F2GA 1SU5A 3R89A 1LM1A 3WK1A 2NUWA 3GIYA 4LU0A 3VI2A 2QKFA 3G1SA 1JJKA 3QZEA 1RVGA 4NJHA 3PR2A 1GJPA 2C15A 3M41A 4GBUA 4K39A 1UJPA 1PHWA 5EKYA 2Y70A 1M5WA 2C16A 2ZA2A 1XM3A 2PURA 3N2XA 3P5YA 5K4ZA 3S5NA 3DAQA 3DFPA 4J9JA 5IBXC 2FIQA 5D30A 3U2OA 2V2DA 4AAJA 4M6VA 1P1XA 1TQXA 3GR8A 4ADUA 3NQ2A 2J88A 1TPEA 3L5AA 4O19A 3UZ5A 3F4WA 2QAPA 3KVLA 3B0VC 4BK9A 1FQ0A 2P1FA 3LB0A 2ZTKA 4YL2A 3P81A 4I7VA 2QCCA 2VC6A 5BMWA 1XKYA 5D2TA 1WBJA 4N4PA 2RH9A 4JX4A 3VE9A 3TR2A 1WX0A 3LGEA 3NAVA 2BSLA 3W86A 2Q3RA 2TYSA 1JRBA 3T44A 5T26A 5HR6A 3NQGA 3OVRA 4EIVA 2PRMA 4RJEA 3IGUA 3HB9A 1WV2A 2NX1A 3TUUA 3JRKA 2YPIA 5FEPA 1KM3A 1HTIA 4LC6A 2WSYA 3BPWA 3TU9A 1GZGA 3C3NA 1GT8A 3CQ0A 2A2IA 1JR1A 2ZRVA 4K36A 3M0ZA 3GKFA 3W2NA 4H6KA 1GPWA 1I8JA 1QPQA 3ZWTA 4IX0A 2FPTA 1LROA 3MYOA 5AN7A 1JRCA 2ZRXA 2V82A 4G1KA 3QYQA 3TROA 3D0CA 3K30A 4RR4A 3PUOA 2TMDA 1SO4A 2QCNA 1F73A 4NNAA 3W84A 3LERA 3TMLA 2X1TA 1TPH1 4M7TA 1UBSA 2DZPA 5K2ZA 4CNPA 4CNNA 3KHJA 3TDFA 1JCXA 1DOSA 1PCWA 3TC7A 1V7YA 1LBMA 3FYOA 3MWAA 5AYXA 1XC4A 2BLEA 1K02A 3TXZA 3NQ7A 1RR2A 4NU7A 2H3DA 1KTBA 4ADSA 1FY6A 2WKJA 1TSIA 2ZDRA 1LORA 3NM3A 3HGOA 4O50A 1NAL1 4LY8A 4O18A 3TKFA 3TMQA 1TIMA 3EX3A 4JD4A 3VFLA 4XTIA 4WJEA 3I7RA 3TA6A 1W5OA 3N19B 4DQWA 3BG5A 4MFEA 3W85A 4DO4A 1QAPA 3W1MA 1F76A 2Z1BA 3CC1A 4FNQA 3FKRA 1GQNA 1QNVA 1T0OA 1W3TA 3G3MA 1HG3A 4FX8A 1TREA 3PSWA 1EP3A 2EAWA 1G67A 4KFNA 3BG9A 3TSMA 3W76A 1OFEA 5E0KA 1TTPA 3KVJA 5I3GA 2E09A 3FOKA 3LXAA 4DEFA 3NNTA 2HTMA 3M5VA 5AOUA 5G4EA 4O53A 2W79A 2PRLA 5BRBA 3DFNA 3LCWA 5F4SA 1Q6OA 5AHEA 1K7FA 4PODA 2BX7A 1VR6A 1ONRA 1OFQA 4DXVA 5LNVA 4X3ZA 3VE7A 4JX6A 2W0UA 3NL5A 1K8YA 2CW6A 2Z2UA 1GEQA 5F2IA 3MO7A 3GLCA 3DH7A 1VCFA 1TRDA 3NXFA 2GQAA 4QIUA 2QDHA 3LHYA 5TQLA 3RF9A 4ICNA 3EXSA 4IJBA 1H7WA 1ZALA 2BXVA 1PHQA 3DKJA 1WQ5A 1ZENA 1W8SA 1W54A 3KX6A 4FXSA 1JCNA 3HPSA 2VEIA 1OYBA 4IMCA 1SO3A 2ISVA 1W31A 2B7NA 3NQEA 1ICSA 3H54A 1FWWA 2VKZG 1S5VA 3P74A 4RLIA 3W83A 3W7JA 3UWYA 3NZRA 4O1DA 5KZMA 2RDUA 3LBMA 4K7YA 5K4XA 3NPVA 1OFBA 1VGAA 1J2WA 2ZBTA 1RZMA 1O60A 2YYUA 3EWZA 1EX5A 2OX1A 2VEMA 4FXRA 1PV8A 1A5AA 3PUDA 4BI6A 5G1YA 5FF4A 4RZ6A 4ZQMA 3PC0A 3GDMA 1XBVA 3O6YX 3PUEA 5FI8A 3W1QA 3IV3A 1W5QA 3FYPA 4Y90A 1M6JA 4UFMA 3IGSA 3LCXA 1GVRA 2Y85A 2ZTJA 2I14A 1SZEA 4M19A 5G5IA 3CLMA 2QCGA 3HO8A 5EA9A 2ZZ4A 4NT0A 5AB3A 4QJ1A 1D9EA 3BV4A 3TC6A 1RQHA 1FWRA 3DHFA 1DKWA 2EPHA 1FWNA 4O1BA 3TNOA 4JNMA 3OIXA 1OX6A 4MLRA 3NL3A 5I3KA 2KZHA 4K6AA 2QAFA 5LNUA 5TBOA 4AB4A 4UFHA 1SO6A 3NM1A 1T8XA 3NQCA 4DO5A 4MJMA 3LTSA 3S9YA 3GVGA 3CEUA 3M16A 4O11A 3LCFA 4X9SA 3S8HA 1I4NA 1H61A 3L0KA 2AGKA 4JTKA 3S0CA 1H7RA 1QPNA 1EEPA 1RQEA 5HWNA 4GNJA 4MY9A 3T40A 4QM1A 4O10A 4M5PA 1ML1A 1QWGA 5D04C 4FEZA 4CLMA 1HL2A 4FB7A 3LHUA 5C54A 3DU0A 3E12A 4YLWA 2CLFA 4ZL1A 3NQAA 4POCA 4QNWA 3GAKA 1SPQA 4TX9A 5G1TA 1OK4A 1N55A 4N9CA 2ZRWA 3M5YA 1JUKA 3G1AA 3L21A 4O1CA 1O5KA 3LI1A 3MHGA 3A23A 5F2LA 2QJHA 2Q8ZA 2EGZA 3U8GA 3MP5A 1JCJA 4N4QA 3STEA 2BTMA 3KVKA 5D2VA 2Z6IA 5CPOA 3ANYA 1A5CA 3HBLA 2JGQA 2FB2A 5FEZA 3STCA 4DELA 4XQ6A 2PE4A 3B03A 1FBAA 1PIIA 3BLIA 4LWWA 3IVSA 3WK2A 3QEZA 3N2MA 3LXCA 4CCCA 4Z1AA 3R5EA 3LBCA 1EUNA 5DCDA 3QC3A 3W87A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3CPU A;  2OVL A;  4KMQ A;  4CLM A;  4GQG A;  4C6K A;  3GTN A;  1HL2 A;  4FB7 A;  3WQ6 A;  5C54 A;  2CLF A;  1B54 A;  4XVD A;  4TX9 A;  1N55 A;  4N9C A;  2W67 A;  3M5Y A;  3FY1 A;  5E5C A;  1O5K A;  3A23 A;  5C0Q A;  5F2L A;  3BUV A;  3CLW A;  1FP8 A;  1W9U A;  4J3S A;  4WSH A;  3KVK A;  1F3T A;  3W25 A;  5XIA A;  2Z6I A;  3WH6 A;  3EZ4 A;  3HBL A;  3PZI A;  2JGQ A;  2DIE A;  4XQ6 A;  1PII A;  2X0S A;  3RIL A;  3CV6 A;  3THD A;  3DFH A;  2INE A;  2BOG X;  3UJS A;  3QR3 A;  2DW7 A;  4Z1A A;  3KZP A;  2P3Z A;  4CN1 A;  1UR2 A;  5A6M A;  1WDQ A;  3G1X A;  3W72 A;  4C1N A;  2X40 A;  1E1F A;  3CXO A;  3TX9 A;  4W9T A;  2H8Z A;  4DJF D;  2UY2 A;  3MT1 A;  1CT5 A;  2ZUW A;  2YCI X;  1CGU A;  3EXR A;  4ADT A;  3FST A;  1JPI A;  3RCN A;  4UTW A;  2I9E A;  4DPP A;  2CHO A;  4GC3 A;  2O55 A;  2DSU A;  2FZ8 A;  1P43 A;  2PZN A;  4FOK A;  1GON A;  1NP2 A;  2XIO A;  3IV8 A;  5ABF A;  3R11 A;  7A3H A;  1EEX A;  1VJS A;  4GIE A;  3H2A A;  3MUX A;  3WJX A;  1OGB A;  3DOP A;  4YTT A;  1DV7 A;  2G3F A;  3MPG A; 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