1K7EA

Crystal structure of wild-type tryptophan synthase complexed with n-[1h-indol-3-yl-acetyl]glycine acid
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
268
structure length
261
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of a new class of allosteric effectors complexed to tryptophan synthase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
total genus 100
structure length 261
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2001-10-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1k7eA00
3W1TA 1QWGA 4A29A 1JUEA 1DORA 4RZ4A 3SGUA 3LTPA 2QUUA 1Q6QA 4LVGA 3W70A 4X22A 2VELA 4M5PA 3W1RA 2ZA3A 3MBDA 1OK4A 3LRMA 4M7SA 1VLWA 1ME9A 2Q3RA 3LHVA 3W1PA 4NJJA 4XQ6A 3C2VA 1TB3A 2JGYA 5HQEA 3SW6A 3QSRA 2AAMA 3VE7A 4UC5A 1H7PA 4HNUA 1L6WA 3BVJA 4NVTA 4P2VA 4DQWA 1TV5A 1XBXA 2J9XA 2NX1A 3P67A 3PAJA 4S2CA 4ZQRA 1KBIA 1YLVA 2WJZA 1B57A 4EIVA 3T40A 2Y88A 5I3HA 1XC4A 1B4EA 4OV9A 3E0IA 3PR2A 1YTEA 4RR4A 3LV6A 2QCLA 2W0UA 1VCVA 5CPMA 1I4NA 4KWVA 1OX4B 1A5AA 4O12A 5FEWA 5D33A 4IX0A 4JR5A 1SO5A 5IBXA 3FEMA 1VQTA 3EXSA 1QPNA 5F2LA 3CWOX 2OZ0A 5K9XA 4QM1A 4XKYB 4UNKA 2E6DA 3L5LA 2ZQ0A 3KRUA 5H2ZA 4BK9A 1OX5A 3EKZA 3G0XA 2YR1A 3HJZA 4AEOA 1XDLA 4M6PA 3I7SA 2A5HA 2QEZA 4ICNA 4LOCA 5IBXC 3W76A 1JUBA 1KV5A 4XTDA 2GQAA 2ATSA 3EX2A 3M5XA 1ZFJA 4LV9A 1KM5A 1SFLA 1UB3A 3GR7A 1RPXA 1ADOA 3ABSA 3ATYA 4PA8A 4RK8A 4N4QA 2ZBTA 4YXGA 3TA6A 1EWDA 2H3DA 4ZQMA 3MO7A 2EF9A 2RDWA 2QJIA 1F6PA 1TV8A 3DFSA 4K37A 5DBUA 5HJLA 3NQVA 1SFJA 4TMBA 5K4ZA 3H53A 4IMEA 3NQDA 2H6RA 1FDYA 3R2GA 4JTTA 4TIMA 4O10A 3PC0A 3T7VA 4LVBA 3G0SA 5LNVA 3MP4A 1TTIA 1OK6A 1X6UA 1KM4A 2JKEA 3LXBA 3NEVA 3KVJA 4FB7A 3FA5A 4AXKA 1QCWA 3LTYA 1K8ZA 4FIQA 5EPDA 3TR2A 3LCGA 2A6LA 1TRIA 5EKYA 4RZ5A 2DORA 1D3HA 1B3OA 1TMHA 2NV2A 4GNJA 4JTIA 4UFKA 4RX0A 3QMRA 3F1QA 3TSDA 1GQNA 4PODA 4I7UA 4JXCA 3OVPA 3Q2DA 3MI2A 1CW2A 1XDMA 1TCDA 3RLUA 3PY2A 4IUOA 4K6AA 4MFDA 4O1DA 3IGXA 3H54A 3M5ZA 3W1NA 5E0KA 2ZA2A 4EWND 3QJAA 3DH7A 3PBUA 2A2IA 5I3IA 3I7QA 3S1WA 3G1FA 5E1QA 5IM51 1PIIA 1JQVA 3GKAA 2EAWA 3W88A 4BR1A 3S1UA 2FJKA 2FIQA 1M7OA 1H7XA 1R30A 1F76A 4MY9A 4HPJA 1PS9A 5D2TA 3IVUA 1Y0EA 2ATMA 1G6CA 1GVOA 3WK2A 1WOAA 3L68A 2QDGA 3WK3A 5HINA 4LUJA 1VLIA 2R94A 2CZ5A 4OQVA 3LI1A 3STEA 3W6YA 3W7QA 5C55A 4ALDA 1XI3A 2J24A 5LGZA 4CCDA 2Z6JA 2GUUA 1JCXA 1OFBA 5K3VA 3LM7A 3TX9A 1PVNA 2E6YA 3EWYA 3W2KA 1KTNA 3M5VA 4A2SA 1SSDA 2FQIA 2DZSA 3LX9A 2HS6A 5DN1A 1PHQA 2G5WA 4UTWA 4RJEA 1LDCA 5T26A 1H60A 3PSVA 3VFLA 3FJ6A 3BARA 2Y63A 3L65A 3OEXA 5G2IA 3KOFA 3LDVA 4PL1A 5F1UA 4DBEA 2C0AA 3LXCA 4NJHA 4TX9A 3LOTA 3M43A 1EP3A 1IGSA 4YL2A 5A8GA 1VS1A 5DCEA 1G7VA 4UTWC 3TK7A 2CLLA 2YSWA 3A5VA 4M6VA 4NNCA 4UFHA 5AYYA 1GVQA 3C56A 3W7EA 4ZQNA 3O07A 2Z6IA 4K7YA 2RH9A 4JTJA 4AVFA 3M0ZA 4MY8A 4WQ6A 4DELA 1W37A 1VZWA 3CTLA 4GJ1A 1MXSA 3A21A 4GWEA 2Y7EA 2ZRZA 2QCCA 3W1XA 2X2GA 4K8HA 3HG5A 5KZDA 2XN2A 1S5WA 5AHFA 4ONVA 5EA9A 4E2BA 3IEBA 4MYAA 1F7BA 2VEIA 2ZZ6A 5FESA 1LYXA 2RDUA 2YFOA 3SFKA 2V30A 1DQXA 2OMAA 2E5CA 4UMAA 1K3UA 4N9CA 1KFJA 3GDKA 3R12A 3G0UA 5TQLA 2I1OA 3MUXA 3FLUA 4O16A 1DOSA 2J88A 4LU0A 5AN7A 2GVGA 3M7WA 4ADSA 4FNPA 5FF7A 3G1YA 2DZVA 3LLDA 1B9BA 4UTTA 3CIWA 3TAOA 3QC3A 3TH6A 4DF2A 2CLOA 2QCHA 3H55A 1WBHA 3IIZA 4IXHA 4IXXA 3BGJA 5KITA 1FUYA 3W83A 1OFOA 4NJIA 4RXGA 4UTTC 4AWUA 4ZL1A 1YDOA 3TUUA 5MHBA 3UZJA 4WOQA 1WBJA 3C2OA 2EGZA 2WNQA 4O4VA 1T8XA 5D09A 3NR0A 2PC4A 3L2IA 1Z44A 3W2UA 1UASA 4O28A 5D30A 2B7OA 3G3MA 4WXZA 3IVSA 3W7JA 1K8XA 3I6RA 1SO4A 1QFEA 1W3NA 4QQ3A 3FIGA 3W7GA 4TO8A 3RK8A 4JTHA 3KVLA 4WUIA 4DPQA 3S1VA 2QKFA 1JCLA 5DY2A 2QUVA 5DCBA 4WJEA 3WJWA 3NQFA 2DJXA 2QR6A 1ZY9A 1YTDA 2VFFA 1XXXA 2G95A 1XUZA 1OJXA 3LTSA 3DBPA 1IXNA 4POCA 1NFBA 1H7NA 2B4GA 4MUZA 3GZ3A 5D02A 3G1SA 4KFNA 3T44A 5F2MA 3GIYA 4QAIA 3L0KA 3UWQA 3I7RA 2OX1A 5KMYA 2H3BA 1QAPA 3LCLA 1G4EA 1TQJA 2NX3A 5TIMA 2YFNA 1KM1A 2IQTA 3W75A 4PTNA 1MEHA 3LGEA 3B05A 4WXYA 5U7SA 3HG4A 4GUFA 1Q6RA 1KFBA 1TTPA 2V2DA 2PURA 3CM4A 3HPXA 3C52A 1I8JA 3O15A 2ISWA 1C29A 3HG3A 1OYCA 4AHPA 1TQXA 4MLRA 3UQNA 1EP2A 3N2MA 2DZPA 1OVDA 4JNMA 1OFRA 3HG2A 4BI5A 3M6YA 4JICA 3W7IA 3KRZA 1EUNA 3VE9A 4N4PA 1VYSX 3B8DA 1ICSA 3TDFA 2W6RA 5LZLA 2RKXA 1SZEA 4DO4A 5C2XA 5LNRA 1OX4A 4LW7A 3TCEA 3PUDA 2YX0A 3TSMA 3SY5A 2ZCGA 2ZZ4A 2QUTA 5CZ0A 4R7JA 5LNSA 2RFGA 4NNBA 1RZMA 3PULA 2A21A 1XBYA 3BV4A 2V5BA 1W5OA 2V0TA 4KFPA 4MKNA 5FEPA 1JR1A 4UTLA 1OYAA 5D2VA 1X7FA 4LUIA 1P1XA 3C3NA 1YADA 4EOUA 1WV2A 4TMCA 3QYQA 4N9BA 1VGAA 4EF8A 3G1VA 1F5ZA 2NUXA 3EKLA 4ZQOA 1LOQA 3TV8A 3O16A 1V7YA 3PBWA 3QPYA 3DU0A 3EX1A 1G67A 2E68A 5HUOA 1A53A 1DBTA 1PV8A 2NWRA 5F2GA 1N8FA 3A23A 3P84A 3NYZA 1SR9A 4LS1A 1NF7A 2LLEA 3W2NA 3L0NA 4P61A 3R8RA 2X1TA 4NJGA 4TR9A 3EB2A 1A50A 3BG5A 3EX3A 3NQAA 1HG3A 1X1OA 1WX0A 1KLYA 2QCEA 5CSSA 4J9JA 5CPNA 2CZFA 1F6KA 5KTLA 2C3ZA 4UXDA 4HT3A 5FI8A 3WJYA 2GVJA 5LNWA 1TRDA 1KM0A 2ZTKA 2E1DA 1GZGA 4QITA 2CLKA 4L4LA 5HWJA 1IF2A 2A4AA 3FKRA 3GB6A 4FX8A 3W2LA 2B0MA 2X1UA 5CPOA 3KAOA 1X1ZA 1RD5A 3NQCA 1EWEA 3W2JA 2WNNA 2C19A 1LRTA 1LLWA 2XN0A 4UR8A 3LCHA 1OF6A 4IMFA 3V1PA 4NQ1A 2GJLA 2XFWA 4UR7A 5SWUA 3RMJA 5D32A 1SZGA 2FPTA 5K9CA 4NNAA 3JR2A 6TIMA 4LNYA 3QRHA 4FX6M 1JJKA 4FX7A 4GC4A 3W1UA 4Q4KA 1GTEA 1MO0A 3GXTA 3QH2A 2F84A 2Y89A 1UBSA 1HO1A 3UY7A 2C14A 3W7DA 3MHGA 4Z0SA 1S5VA 3S5ZA 3OVRA 1AL8A 3PB2A 5BMWA 2NUYA 5FF2A 4XUGA 2WSYA 3NPUA 3ZR4A 2TMDA 4JD4A 4UFMA 2UV8G 4Q33A 4N6EA 3DFNA 1ZAJA 5TBOA 1W5PA 3F4NA 4UCGA 1MEIA 5U4NA 3UYCA 2Y7DA 1N55A 3G24A 3MP3A 3NXFA 2CZEA 3F03K 2C15A 1K02A 1FX6A 4AMAA 2FFCA 3C6CA 3DI0A 2NX9A 4MJMA 1WOBA 5G2HA 3L21A 3UD6A 3EWXA 1GYLA 3P7YA 4HIBA 2OT1A 4LRTA 4M6QA 2FB2A 4UNLA 4O13A 4FF7A 2WQPA 1H1YA 2V82A 4JY9A 3W1AA 3MP5A 2QCGA 4MY1A 1F05A 1LOLA 4IWWA 3QM3A 1I2PA 5EYWA 2JK2A 1RVGA 5ABTA 4BWLC 4GBUA 3LCWA 1JUKA 3LBMA 5C54A 4GRSA 4FIRA 4ZMGA 3O6DA 4K8EA 4X2RA 1TSIA 4X9SA 2DZTA 5BRBA 2E6FA 2Z1BA 1IIHA 4NX0A 3NDOA 2DZWA 3DENA 4FNSA 2HSAA 4MVAA 1GT8A 2PE4A 4O18A 3BG3A 1XL9A 4A22A 1JULA 3P82A 1W8SA 3A22A 2E5BA 5HWNA 3UWUA 4S2BA 3S42A 3LB0A 4ORIA 3HMJG 3TSBA 3LHTA 3GKFA 2NXGA 3DFQA 1GOXA 5LSMA 3LHZA 2NWSA 4JTUA 3W1QA 5D04C 3M47A 1M7PA 1SUXA 2NLIA 3TXZA 2J9ZA 3DAQA 3CU2A 2YGYA 3L9CA 3LCIA 3S6DA 3AJXA 3R13A 4OV4A 1LZOA 1FWWA 4NJKA 4ADTA 1LP6A 2A7RA 3INPA 4HKPA 3TC7A 4LT9A 1YXCA 3FYPA 3EX4A 2X30A 4OGZA 1W3IA 1LRQA 5F2IA 1G4TA 4QJ1A 2X1SA 1LBLA 3NQMA 3G18A 5AC7A 1R2RA 3QF0A 1KFLA 4Y9AA 3THAA 4YCPA 3MHFA 1LLZA 3W1MA 4C1LA 3UY8A 5HWMA 5K9DA 3FS2A 3GDRA 1ME7A 2CLEA 2QAFA 3BW4A 2CU0A 2DZXA 3MW7A 3TIMA 1QNVA 3P8JA 5G4WA 3KFTA 2VFIA 3FYOA 4E0CA 3YPIA 3N2XA 3B0VC 2ZDRA 3N9SA 4MPQA 2Q8LA 3MWAA 3CPRA 2ZRVA 2QDHA 1G7UA 2NXIA 3GDLA 4XTIA 3USBA 5DXXA 2HTMA 5FEXA 1Q45A 1GVSA 3EWUA 3ZWTA 1TYGA 1WXJA 1EUAA 2X16A 4Y90A 4PCFA 3NAVA 2PRLA 1QO5A 1QPRA 4Z1DA 2V9DA 3SJ3A 3DI1A 3W7PA 5C6MA 4OWGA 4ML9A 1WAUA 1L2UA 1J2WA 4UTUA 1SZNA 1TPUA 4O52A 3K30A 3C2RA 5AHMA 1YPIA 4I9AA 4A2RA 1U5JA 1OYBA 1IXPA 4KWWA 3B04A 2Y85A 3S5YA 1J4EA 4WY0F 1OF8A 3O6CA 2BTMA 1LBFA 4OE7A 5CZTA 3QSTA 3NQ6A 2VEKA 2JKAA 4FHAA 1FBAA 1K7XA 1KM3A 1Q6LA 3PUOA 4JS3A 1PHWA 4AF0B 1EPXA 2R8WA 2EHHA 4IMGA 3TU9A 3A24A 3W87A 4YCOA 2FPVA 2KZHA 1HFBA 1FXQA 2ALDA 4MOZA 3QFEA 4NT0A 4PFMA 4AWTA 2VFHA 4N9EA 3M9YA 3NQ7A 1P0NA 1PL9A 1QPQA 3M41A 3OIXA 4ORMA 3RU6A 4RCXA 1ICPA 3W72A 4DXVA 3OBKA 2VXNA 4A3UA 4XBSA 3B0PA 1SW7A 4H4IA 3TXVA 5F4XA 2DP3A 3IIOA 1VYPX 1VHCA 3PS7A 3TQKA 3C8FA 1LTDA 2OJPA 1AG1O 1SO6A 3UXDA 3S5NA 5HULA 3W7OA 2F7FA 4A21A 1TTJA 1SSGA 3M44A 2D73A 3EWWA 2RDTA 4JX5A 1OFPA 3HGJA 1YTKA 1P0KA 3QW3A 2I9EA 3IVTA 4MZ1A 3SI9A 1H61A 1XM3A 2NV1A 1ZJIA 1NSJA 3E9AA 5I3FA 2GPTA 1T99A 2ISSA 4JYEA 2E6AA 3PG8A 4N2YA 3EX6A 1EB3A 5CSRA 1H7RA 1VPXA 3FJLA 4O0KA 2VFEA 5AB3A 4CLMA 1GJPA 1CI1A 2BXVA 1GVRA 3NL5A 3HB9A 1QOPA 5D2XA 1EEPA 4UTHA 1ME8A 4FO4A 1EX5A 5J5DA 1RQBA 3C2EA 1L9WA 3W85A 4JGDA 4LV4A 1GWJA 2YW4A 1HO4A 4IX2A 2Y7GA 3S5OA 3SZ8A 3U8GA 3VCRA 3WFAA 1V5XA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3AYR A;  3W1T A;  1JUE A;  1O1Z A;  3CQI A;  2FZM A;  3LTP A;  4X22 A;  3D46 A;  1TWZ A;  3MBD A;  1OK4 A;  1R3V A;  1GNX A;  4S3A A;  3WQ8 A;  2QXW A;  3QGK C;  3QZA A;  4M80 A;  1L6W A;  3BVJ A;  3AS3 A;  2QLY A;  2JIE A;  2J9X A;  3P67 A;  4S2C A;  4RDV A;  2WJZ A;  1B57 A;  3BL3 A;  4WRH A;  2OLH A;  4HHH A;  2WC3 A;  3EOO A;  4RR4 A;  2Z24 A;  3KOY A;  1BWV A;  3VDG A;  6XIA A;  2Z7G A;  3P14 A;  3MJM A;  3UR7 A;  3GVV A;  3LK6 A;  1VQT A;  3P93 A;  5F2L A;  3CWO X;  4LUS A;  5AY7 A;  1F3T A;  1QAT A;  4XKY B;  5I23 A;  1BYB A;  3EKZ A;  3QLD A;  3GBE A;  4XZB A;  1YDY A;  4I9T A;  2YIH A;  3I7S A;  2V3G A;  4GHR A;  4LOC A;  5EMM A;  3GUW A;  3D3F A;  3WML A;  3AJ7 A;  3N6J A;  3EX2 A;  4LV9 A;  4MGG A;  1HZY A;  1UB3 A;  1RPX A;  1XG3 A;  4OOZ A;  3ABS A;  4RK8 A;  4GIS A;  4CVU A;  1I0B A;  3TA6 A;  3VUP A;  1EWD A;  1VAH A;  2H3D A;  3ICJ A;  4ZQM A;  2YL5 A;  3MO7 A;  2EF9 A;  1AD1 A;  1TV8 A;  4TMB A;  2ZC1 A;  3LMY A;  4EPE C;  3N4E A;  4TOQ A;  1VPY A;  2EJ1 A;  3ID7 A;  4J2M A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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