1K7X | Genus

Total Genus 95

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	95
sequence length	268
structure length	254
Chain Sequence	MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
source organism	Salmonella typhimurium
publication title	Crystal structure of the beta Ser178--> Pro mutant of tryptophan synthase. A "knock-out" allosteric enzyme. pubmed doi rcsb
molecule keywords	TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
total genus	95
structure length	254
sequence length	268
ec nomenclature	ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date	2001-10-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00290	Trp_syntA	Tryptophan synthase alpha chain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1k7xA00

3QMSA 3GDKA 1ZJIA 3S5OA 4CLMA 2Z6IA 4FXRA 5LHFA 3GYEA 4XWUA 5TBOA 3S8HA 3L5LA 3JRKA 1Y0EA 1K7EA 3FIGA 4UFHA 3TK7A 2PRHA 1QO2A 3RNDA 3NZRA 2QCNA 1OFPA 4D2JA 1GPWA 3DKLA 3BW2A 1UCWA 5D2VA 4YWIA 3L2IA 1H1ZA 3P60A 2QJIA 4N9EA 2ALDA 1X6UA 2V5LA 3W23A 4OV9A 1RR2A 3LXCA 4B5NA 4UR7A 2NZLA 1AW2A 5AYZA 2O7SA 2EGZA 3MP5A 3EX6A 3QMTA 3G1VA 1SO6A 5HR6A 2Y61A 4M5PA 1PE1A 1VC4A 1E51A 3HPZA 3RFAA 4NNAA 1KM0A 4KWWA 1TSIA 3STCA 4UC5A 3NM1A 1XM3A 1YXCA 4TIMA 4NJHA 3S5ZA 1ME7A 1VZWA 5MHBA 4JTKA 3FJLA 1MSSA 2W79A 4BF9A 4MOZA 3G1HA 2VEPA 2JKAA 1DL3A 1MEIA 1GOXA 4IWWA 1TTJA 3GDTA 3ZWSA 1KM1A 2NXHA 1L2UA 3W86A 1X8FA 2EHHA 4BWLC 1MXSA 2BWGA 1FY6A 5KZEA 5FESA 1GVOA 3CWOX 3A24A 2GVGA 3N9SA 5K3VA 3O6DA 1YTDA 4IMGA 3IGUA 4NVTA 1KM6A 1YXDA 2VXNA 5KITA 1VHNA 3IEBA 1CX9A 1OYCA 4OV4A 4FIRA 1FXQA 3V75A 3MUXA 2GJNA 1XFBA 4CNPA 4R7JA 1JCMP 3NQVA 1MZHA 2E5BA 1XBVA 3VE7A 3ATYA 2VEIA 3P81A 3T40A 4CNNA 1ADOA 3TQVA 3W1UA 1LOSA 1A5BA 1LTDA 1Z48A 3HOJA 1VYSX 1MO0A 3DU0A 4RV8A 4WUIA 4JTTA 1K8YA 1WBJA 4X9SA 3B4UA 3L66A 3KRZA 1QAPA 4HHPA 3GZ3A 1K03A 1NAL1 3HPXA 1G4PA 3HF3A 4LS2A 2YYTA 4FIQA 1F7BA 5DY2A 4WOZA 3QM3A 3KHJA 4JYDA 2Y7EA 4Q33A 3S1VA 4M19A 1IXOA 2A4AA 2A7PA 1W5OA 2OJPA 2WJZA 4YCOA 2QUVA 3DENA 2ZTJA 1N7KA 2OZ0A 4KFPA 5D33A 2CLIA 3LLDA 4Q32A 3ABSA 2GUUA 5CZ0A 4UIOA 2X16A 4LVGA 1VS1A 4UCGA 4RZ6A 3R5EA 3CEUA 4NXKA 3USBA 4BWLA 2QUTA 5G5IA 4CCDA 2LLEA 3BARA 5I3IA 1OF6A 3LB0A 3W22A 4RXGA 2ISVA 3S1XA 1UB3A 4JS3A 3OG3A 4QITA 2D73A 5C54A 5K7JA 1TPVA 3L0GA 3LXAA 3MWAA 4I7UA 1H7XA 4Z0JA 3I7RA 3LCIA 2R8WA 1KTCA 1WV2A 4O11A 5G2WA 3P8JA 3QF0A 2YYUA 1YDNA 5L6UA 5KZDA 4LS0A 1KBJA 3HGRA 4JNMA 4UR8A 2A6NA 4BI6A 4JTSA 2E09A 4KFNA 1KFCA 1EB3A 4AF0A 4MKNA 4O10A 4HSNA 2ZRZA 3FJ6A 4GJ1A 3TJLA 4O54A 1OFBA 3S1WA 4O14A 5FF0A 1BTMA 3H55A 3W75A 3KVJA 4EOUA 2V2DA 4ZMGA 3NNTA 3TC6A 3LV6A 1OK6A 2NWSA 2G96A 4JR5A 1V7YA 3W7KA 1PIIA 3G1YA 4O19A 5AN7A 4JD4A 3SSJA 4JGDA 4BI7A 3H53A 2GOUA 3W70A 3EKLA 1VCGA 5HINA 1DQXA 4O15A 2YXGA 2CFFA 2WKJA 4RLIA 1BKSA 3LCHA 4JDYA 3W7LA 3V1PA 2JKEA 4A29A 2R91A 3QRHA 1F05A 5CG7A 4ALDA 3TXZA 1D9EA 2VC6A 5KMYA 2NX9A 3C2FA 4MFEA 1LRNA 3L67A 5U4NA 1O95A 1G4TA 1S3HA 1J5TA 4NJIA 4LOCA 3CHVA 4YMZA 1KFJA 3Q2DA 2RH9A 4RZ4A 5CPOA 1LRQA 4CQAA 3IV3A 5D03A 1FQ0A 1LLWA 1O94A 2JGYA 1G4SA 3BO9A 5G1YA 2P1FA 1FBAA 3DBPA 2ZA3A 4MYXA 5HULA 3EWYA 1FDJA 3NQAA 3PBVA 4ZQRA 3WJZA 2W0UA 3LXBA 2ZZ2A 1NFBA 2XFWA 3KX6A 5FF4A 4PFMA 1A53A 4HNUA 2RFGA 1GJPA 3C61A 1H7PA 2QKFA 3EEGA 4O1CA 5EKYA 4E2DA 5FEXA 1JUBA 2V2CA 5EBUA 1VCVA 3BLEA 2FB3A 2ZZ7A 2IQTA 4ZQNA 3MBDA 2KZHA 5D32A 3WK2A 3ATZA 3MYOA 4XKYB 4IX2A 3TFXA 3W87A 2QCCA 2ISSA 4ICNA 1KBIA 1VYRA 1OFDA 5AC7A 1FCBA 4WXYA 4XTDA 3EX4A 2X30A 5CSSA 3SI9A 4K38A 1LRTA 3T4CA 2R14A 2ZRXA 3LV5A 5AOUA 3SY5A 2DU2A 3PBUA 1IF2A 5L9FA 3PF3A 3THQA 4O50A 3GNNA 4PA8A 3RF9A 3OVRA 3PUDA 3UWUA 3Q58A 2C6QA 1R30A 3UNDA 3F4NA 1GT8A 4IPIA 4DBDA 1EPXA 3HGSA 5C5YA 1XL9A 5AHFA 4OQVA 4AVFA 1GG1A 4UTJA 3BG5A 3U2OA 3M0ZA 3N14A 4HIBA 4H4IA 1DV7A 3G8EA 3W76A 2ZZ6A 4R53A 3AJXA 5FF2A 1XCFA 1N55A 2CZ5A 5LNRA 4JYEA 2DORA 4RXFA 3T78A 1ME8A 4O1DA 3B0VC 5LNUA 4HN4A 4O17A 5D37A 3TW6A 4GNJA 1QNVA 3NDOA 4JN6A 3N34A 3IIOA 4IXHA 3PG9A 3E9AA 1JULA 1QPQA 3ANYA 2V30A 4AHQA 2ATSA 5LKYA 3JR2A 5H91A 1F6KA 1ZAIA 2J6XA 1JQVA 1TO3A 3DXIA 3HG5A 4PL1A 1TQJA 1M6JA 2BZNA 1LOQA 2YFOA 4E0CA 1KM4A 2NUXA 3W2KA 2PE4A 4TU1A 1KM3A 4JY8A 1KFKA 4OBTA 1OVDA 4NU7A 3EWBX 2QCFA 3B04A 4NX0A 4NNBA 1SPQA 4JTIA 3W7RA 4XUGA 2FPVA 4UMBA 1PS9A 1K8XA 1ZALA 3HMJG 3W1LA 3W07A 2H3BA 3LM7A 4DO5A 2OMAA 4BI5A 4Y96A 2DZXA 1N8FA 2RDTA 3DI0A 3TDFA 4JIPA 4LC8A 3HGJA 1VH7A 1RQHA 3W1AA 3W2MA 3OEXA 2Y85A 2XN2A 4IMDA 3O6YX 3W2LA 3RMJA 1Q6QA 1RPXA 2CLMA 4AXKA 3VKJA 1W1ZA 4JTGA 1I45A 1PCKA 1DBTA 1GVFA 3W7EA 1WYIA 4AH7A 4ZQMA 3R2GA 3VNDA 3DFPA 4IJBA 2CLEA 5IBXC 1W8SA 5D2YA 3INPA 3MI6A 3O8AA 1T0OA 3C2VA 3BGGA 3EX1A 3E0IA 3NYZA 3NQFA 1OFEA 3W3OA 3TQ0A 5C6MA 2VEKA 3EXTA 2H8ZA 1H5YA 3OHIA 5E93A 4MYAA 3KVMA 3M41A 1OX5A 1GQNA 1LROA 1OX6A 2NV1A 3T55A 3L65A 3HPSA 4CNOA 3K30A 4Y8FA 3TV8A 2QR6A 2A0NA 4O0ZA 1Q6RA 2XN0A 1QPNA 3E02A 1SQ7A 3TKFA 3F4WA 3KRSA 2Y89A 1WOAA 4HPJA 3SECA 1KW1A 4MZ8A 5D2XA 1OFQA 3PC0A 1YYAA 2QCLA 3MJYA 1EWDA 3GAKA 1H50A 5D2WA 2E6FA 1YDOA 1I2NA 2ZTKA 4P61A 2BSLA 1IIGA 3DFNA 2E77A 3O1NA 1I2OA 3W7OA 4ZL1A 3MW7A 4UTHA 4O18A 1EUNA 4O1BA 5F4XA 1YTKA 3L68A 3W1XA 5LNVA 4JICA 5GVJA 4EVZA 2NUWA 4LV9A 3LCFA 4JIQA 3FKRA 3G8RA 3SFKA 1YDVA 3WK3A 4IMCA 2Y7GA 3SGZA 4LTSA 3ABOA 4RKAA 3R89A 3UZ5A 1OG0A 4FB7A 3S1UA 1TTPA 2PRLA 3L9CA 3W85A 5G1TA 3PSWA 3G18A 5D38A 5IBXA 3W1RA 3N73A 3GLCA 3KOFA 1S5VA 4S2BA 1YXYA 3LTPA 2NX3A 1H51A 3VI2A 1TPDA 3C52A 5LZLA 1QWGA 5A5WA 3RLUA 1DHPA 3NL5A 2V0TA 3D0CA 2DZPA 1K7XA 4A21A 4DXVA 6TIMA 2Y7FA 2B4GA 4K36A 3DFQA 3E12A 3O07A 3WJWA 4ADUA 1AG1O 3UY7A 4ZVJA 3HG4A 3BV4A 4IUOA 4MLRA 2AAMA 5K9DA 4UFMA 1H61A 2DZSA 3W74A 5SWUA 4YCPA 3STFA 1IXPA 4C1LA 2ZA1A 1FCUA 4CQ8A 5K9CA 2ZBTA 4RJEA 3NPXA 1NF0A 3LHTA 3NM3A 5HNRA 3TIMA 3IVSA 1D3HA 2V82A 3W2JA 5D02A 4MJMA 4AAJA 4JEQA 1TPB1 5AC8A 1OX4A 1TIMA 3FKKA 4I7WA 1P1XA 3GR7A 4UXDA 1LBLA 1M7PA 2B7QA 1HO1A 4A22A 1H7RA 1W3IA 1VHCA 3M7WA 2ISWA 4R34A 1KFBA 1JCLA 4CCCA 4DPQA 3LOTA 4TMBA 5D30A 5K9XA 3TMLA 1G67A 4A2SA 2FB2A 2CLKA 4NJGA 1LLZA 1HUVA 2WSYA 4WD0A 4OE7A 4R33A 1SO3A 4LVAA 1VGAA 3GXPA 3N19B 3GVGA 4GWEA 5HWMA 3IGSA 1EWEA 4O53A 4Z1DA 1I2PA 1FWWA 1JR1A 1FDZA 1F2JA 3M5XA 5K2ZA 3SR7A 2WO5A 1J4EA 4DPPA 3MMTA 2ZCGA 3GDMA 1ICPA 2NXIA 1FWSA 3W1NA 3G3DA 4Z1CA 2WV8A 4ZQCA 4NUWA 1W31A 4K39A 3EXSA 1A50A 3CM4A 3UWQA 1VYPX 2VFEA 1QOQA 1SW0A 1W3NA 4WY0F 1TMHA 2VFFA 4O12A 4NXSA 1XUZA 4HPXA 4K7YA 1XDMA 4DEFA 3CIXA 4K37A 2RKXA 5F4SA 2YCEA 2F7FA 4DBEA 1KTBA 4JTEA 3DI1A 2E1DA 1RQBA 4JY9A 2A7RA 4A3UA 2ATMA 3TFCA 4Z0SA 4CQ9A 1SU5A 1XC4A 1GYLA 4MZ1A 3LHVA 4LVFA 1JVNA 1D3GA 4GC4A 1G7VA 2FPTA 1TREA 3W6YA 3I7QA 1FUYA 1XDLA 3NQGA 3LRKA 3PUEA 2ABAA 3KFTA 2QF7A 4X22A 4WJEA 2JK2A 1R2TA 2J27A 4UTTC 1OHLA 4OU1A 3EWZA 1U5JA 1TQXA 3UXAA 4GUHA 4GUJA 1OYBA 2BLEA 2CLHA 2DZUA 5CGQA 4IMEA 1TPEA 4QAIA 3IVTA 1ML1A 3PB0A 3G0SA 3QQ0A 3BVJA 1WXJA 3ZWTA 4KKXA 1U83A 3F1QA 2I1OA 4LUJA 3WFAA 3FFSA 4POCA 3UWWA 1UUMA 1IGSA 1ZY9A 1AW5A 3F03K 3C2RA 4U4MA 1TYGA 1RVGA 3SJ3A 3ZS4A 3HGOA 4JX5A 3LI0A 3TNOA 3QW3A 4UFJA 3EXRA 2O7QA 1GZGA 3W7JA 3TH6A 1SZEA 3TROA 4JTLA 4K6AA 5AC6A 1PHQA 1JRBA 1SUXA 4LNYA 3ELFA 2CZEA 3IVUA 4N9CA 4NZJA 3C0JA 2Y62A 2CU0A 4LS1A 4EIVA 3GIYA 3P5YA 1DORA 3ABQA 3VFLA 2VFIA 3LBMA 4OWGA 1UASA 3HIJA 3BPWA 1RQEA 5F2LA 4UTKA 1NEYA 4K7VA 3P67A 1P0KA 4K8HA 4KWVA 2ZZ5A 1GWJA 4DQWA 4FXSA 1G4EA 3B05A 3LLFA 5AHEA 2YZRA 3C2EA 2A21A 1A5CA 4JTJA 4QNWA 4AWTA 1BEUA 1L6YA 3N2XA 1JCXA 4AWSA 5KINA 4UTTA 5EY5A 4NNCA 5HJLA 3BW4A 5LGXA 4Y90A 5AFDA 4DELA 1I2QA 3BGJA 5DN1A 3KXQA 5HUPA 5I3GA 1Z41A 1EIXA 1YTEA 4AMAA 3W7MA 4NZFA 1T96A 4NX5A 3MHFA 4ZQOA 6ALDA 3G1FA 5U7SA 3W84A 5BOOA 1CI1A 3E49A 4LU0A 1H1YA 3L0KA 4FNUA 3CQ0A 3G0XA 1C29A 3BLIA 3QYQA 3C2OA 5BNKA 1K3UA 3L0NA 4W9TA 8TIMA 4MUZA 5CPNA 2PC4A 5D04C 2ZZ4A 4JX6A 3NO5A 4ONVA 3P62A 2QCHA 4N4PA 1OK4A 5D05A 1KLYA 1QFEA 1YPIA 1F5ZA 4MY8A 1K8ZA 4UMAA 3HQ1A 3BG3A 2QDGA 1GG0A 3W7GA 1VLWA 1HO4A 1B3OA 1AMKA 2BXVA 3NPVA 3LHYA 2WNZA 3M16A 3LCWA 4JTUA 2Z1BA 5BMWA 1ZCOA 2DZVA 4LY8A 5D09A 3S42A 3C4UA 3LCGA 4WY0B 2H90A 3CEPA 3P80A 5EYWA 3AO0A 1ZENA 3NAVA 2ZZ1A 3FYOA 3NVTA 5DXYA 2OT0A 2PCQA 1FCVA 2HTMA 3DFSA 4UFKA 2C0AA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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