1K7XA

Crystal structure of the beta-ser178pro mutant of tryptophan synthase
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
268
structure length
254
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
publication title Crystal structure of the beta Ser178--> Pro mutant of tryptophan synthase. A "knock-out" allosteric enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
total genus 95
structure length 254
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2001-10-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1k7xA00
1O60A 1SZGA 3LERA 3PG8A 3W7PA 2H6RA 3W7EA 4NNBA 2V2CA 3EXTA 1IIGA 3R13A 2QEZA 2EHHA 1FWWA 3NPVA 3KVLA 5C55A 3TMLA 1MEHA 4N4PA 1X7FA 1PE1A 4EOUA 3R2GA 4N02A 4BR1A 1TPC1 4PL2A 3W1QA 1GVFA 1W3TA 5CSSA 1OFPA 3RNDA 4IX0A 1LRQA 3HG2A 1G4EA 4JYDA 4MIMA 3TK7A 1H60A 2Y63A 3EX3A 1MSSA 4WY0A 3W70A 4AB4A 2Y7FA 1KM0A 5D2TA 4LVDA 5F2GA 4L4LA 5HWNA 1SPQA 1X1ZA 1KFEA 3P84A 1ZALA 4FX6M 4CNOA 3N34A 1LLZA 1YDOA 3T55A 4GUJA 4Z0SA 2P1FA 1KW1A 5DLCA 1SW7A 3NAVA 4HNUA 2D73A 4NJGA 3AO0A 4A22A 5LNWA 5DCBA 2QJIA 2WNQA 3C2EA 4QNEA 4DBDA 1SU5A 2NX3A 4YLWA 4N6FA 1JULA 2FDSA 4AHOA 4LRTA 3UPBA 1BKSA 1HG3A 3NXFA 3SGZA 5DELA 3O06A 4MFDA 1AL7A 4KFNA 2ZA2A 3CIXA 3P5YA 3TW7A 2EF9A 2VC6A 4DF2A 4O15A 2DZWA 2RDUA 1TCDA 2IQTA 4ORMA 1H7NA 3KHJA 4UNLA 4D2JA 1W56A 3D0CA 5H91A 4H3DA 2A1YA 3FJLA 5HJLA 2V0TA 2Z6JA 1YDNA 1NAL1 3HPSA 2X1TA 1ZHAA 4ZZ9A 1Y0EA 1TSIA 3LHTA 3NQ7A 2E6AA 3NZ1A 1I2RA 3HIJA 3HG5A 1P0NA 3CEUA 1TPDA 4FO4A 1ZJIA 2J9XA 3TX9A 2ZBTA 4DF0A 2HTMA 3U6WA 4H4IA 1V5XA 2Q3RA 4Y6GA 1GTHA 2VEMA 2CLHA 1OABA 3NM3A 3P81A 1KBIA 1QOPA 2FIQA 4XTDA 3W75A 2FLIA 1QPOA 2A85A 1AW2A 3AJXA 3N73A 1FQ0A 3T40A 3MP3A 4ONVA 1OHLA 4JY8A 3RU6A 5EKYA 4FNUA 4NJIA 3K30A 3WJXA 4CQ8A 1KM1A 2ZRWA 1DBTA 4FHAA 3W2MA 2X2GA 3U2OA 1B3OA 2DZXA 3C3NA 3S5ZA 3N14A 2RDWA 1K7XA 1VHNA 4DO5A 4XTIA 5K3VA 3T4CA 2Z2UA 2ZRXA 4MYXA 3LI1A 2B0MA 1EWDA 1X8FA 2C14A 4N9CA 4S2CA 5EA9A 3F4WA 1LTDA 4NX5A 3NA8A 1ONRA 3G8EA 2E6FA 4IOTA 1KFJA 5AOUA 2Y70A 3G22A 3GXNA 3JRKA 5EPDA 4A21A 1G4PA 3DFTA 4BK9A 3B03A 2ZDRA 3A5VA 1OX5A 3NL6A 4LT9A 2OMAA 5F2MA 3W7MA 4O4WA 4RZ4A 3HB9A 4NXKA 4OE7A 4O10A 1TQJA 4AVFA 3LCFA 1A5CA 4UR8A 4KKXA 3BG3A 4TR9A 2YW4A 3LHUA 1I45A 4LVGA 1H5YA 2DJXA 1TTQA 2V82A 1OFDA 4M5PA 3KRZA 4UFMA 3LXBA 2QCNA 1FXQA 2P10A 3M6YA 4GXMA 2HS8A 1NFBA 1FX6A 3STFA 1A50A 1MEIA 1H62A 2OT1A 3IVSA 4JX6A 3P5ZA 2J88A 2C16A 1HUVA 1NSJA 1W0MA 5AHMA 3T44A 2YZRA 5LHEA 3HQ1A 3P82A 4C1KA 1T96A 3W1RA 3E02A 1YPFA 3QH2A 3DFPA 5HMSA 3QW3A 1WDWA 5G1YA 1TO3A 1K8ZA 2VEPA 2JKEA 4BF9A 4ZQNA 4FX8A 4YWIA 3O15A 3O05A 3F4NA 3TE9A 1DOSA 1FWSA 3LBMA 3NPXA 4LY8A 3TROA 4YCOA 5G5IA 4LVFA 1FXPA 2CZEA 3S5YA 3TFXA 3TW6A 4O11A 5D02A 1VHCA 3EWZA 4GUGA 3P7YA 1QOQA 3G24A 5FESA 1TPWA 2R14A 3GDRA 4P2VA 3I68A 1W1ZA 3O6DA 2FQIA 2QCHA 1GYLA 1QO5A 2C3ZA 4PL1A 3W07A 5AHLA 1W5OA 1EUNA 4QQ3A 4RR4A 3QSRA 3E0IA 5C6MA 1KM3A 4HNTA 1XCFA 4AH7A 2X16A 1LRNA 3NEVA 4RCXA 2NWSA 3I7RA 4QSHA 3G0UA 5AC8A 4RX0A 3W23A 5K2ZA 2HS6A 3MHFA 5C5YA 1TMHA 1UUMA 4XUGA 4NZJA 1F2JA 3BLFA 5C2XA 3W1TA 1FCQA 3W3OA 3TSBA 3UWYA 2CU0A 1AMKA 2Q8ZA 3LLFA 1R2SA 3P74A 5DBUA 3SIZA 1VH7A 4FXRA 3SFKA 4O57A 3MBDA 3W2UA 3DFQA 3QMTA 4JNMA 4CCEA 1FBAA 2Z1BA 1Q3NA 2QCFA 5KINA 4K36A 4AXKA 3PG9A 2R91A 3M47A 5LNRA 4I7UA 3GDMA 3PR2A 3C2FA 2Y61A 3FYOA 3LCHA 4Y96A 4UTMA 2ALDA 3L5AA 3G8RA 4DELA 3FS2A 2V8ZA 3TXZA 3W2NA 3GZ3A 4IMGA 5HQEA 4O8RA 1DKWA 3F1QA 1QPRA 4WUIA 3GXTA 4JTTA 2G96A 3LI0A 5DY3A 3DXIA 4GFSA 4BI5A 3KVKA 3LHZA 3MO7A 5AN7A 1ZNNA 3WJWA 1KM6A 2A21A 2Y7DA 2FPYA 4LS2A 3DH7A 4GNJA 3IIXA 4JEQA 1LLWA 1K8XA 3MYPA 1WBHA 5GVJA 2FTPA 3CTLA 3G3DA 2VFIA 3QYQA 2CLLA 3RMJA 1PIIA 3W83A 1G6CA 4UUIA 3G3MA 3VFLA 1JR1A 2FPTA 4AHQA 4ALDA 1TPVA 4O1CA 3UQNA 4Y9AA 3SY5A 1VLIA 4ADSA 1OFQA 1FWTA 4M6PA 3QJAA 4RXGA 3GLCA 3STGA 4MOZA 4UTTA 3DHDA 3OVQA 4OHQA 4EF9A 1RD5A 5HWMA 3DENA 3BW3A 3WFAA 3NO5A 1OK6A 4TX9A 2PC4A 3M41A 4YMZA 4DF1A 1GPWA 4UIOA 5LZLA 5IBXA 1G4SA 2X1UA 4GRSA 4JTUA 4HNNA 2TYSA 3CPRA 4NX0A 3TCEA 3UWUA 5CZTA 1B9BA 2GUUA 3M7WA 1KLYA 2E77A 3WJZA 1W5MA 3S8HA 1DQXA 4O4VA 4CQAA 3NL3A 4OGZA 1P0KA 5F2LA 1L9WA 3H53A 3LRLA 4JTSA 3PAJA 4A3UA 5LSMA 4HHPA 3QZEA 1GTEA 1DVJA 5H2ZA 2YGYA 4MFEA 4LRSA 4FB7A 2BLEA 1TRIA 4WXZA 5J5DA 3UWZA 5D30A 5CPMA 4S1FA 3JS3A 2ABBA 3L2IA 3NL5A 3WK1A 4UFKA 1UJPA 5D2XA 5KZMA 1I8JA 1CX9A 2VOMA 1LM1A 3TSMA 3GR7A 1XKYA 3PC0A 3TKFA 4QM1A 1ME8A 1AL8A 4AAJA 1HO1A 1UASA 4PC8A 4ADUA 2E09A 2B7NA 2YR1A 3TU9A 3E12A 1SUXA 3HGSA 3IIZA 1SFJA 2FFCA 3UY7A 3GAKA 1O5XA 2BZNA 4Q32A 3L66A 3G18A 1DQWA 2NUYA 3ZR4A 3DU0A 5HR7A 3C0JA 3BG5A 3P62A 6ALDA 3QPZA 2CLFA 4O12A 1CW2A 3N2XA 4G1KA 4UTWA 3DFOA 3W87A 2E5BA 1PCWA 4UTHA 4TMBA 4ZQCA 1W31A 1ZENA 1QPQA 1VYRA 3S6DA 3W22A 1VLWA 3IIVA 2E5CA 1ZAJA 3NQEA 4JYFA 2CLMA 3NPUA 1H7WA 3A22A 1YADA 2CLIA 3WK2A 2FB3A 1KM2A 3RK8A 4GBUA 4FNRA 3WJYA 5LNVA 3W76A 4CCDA 4N6EA 4O16A 3GX9A 3SZ8A 4O1BA 4N2YA 1L6SA 3HPXA 3UWWA 2H3DA 1XL9A 3BG9A 1YTDA 1WX0A 3P60A 1FWRA 5AFDA 5DXXA 3W1MA 4MZ1A 4NT0A 4JD4A 2C13A 1A5AA 2CW6A 3RFAA 1K02A 1JJKA 1H7RA 1U5JA 1IXPA 1LBLA 1OX4B 3O07A 2QUUA 2Y85A 2TMDA 4HSOA 2A7PA 3I6RA 2DZTA 5AC7A 8TIMA 3GK0A 5I3GA 5SWUA 1VYSX 2YCEA 2VEIA 3QPYA 4KWVA 1FUYA 3ZWTA 5HNRA 4O28A 2WNNA 4M7SA 5I3JA 3DI1A 4JN6A 2WQPA 3LXCA 4UTTC 3TH6A 1FCVA 3PULA 1JQXA 4K38A 5F2IA 2TRSA 3MP5A 5IBXC 3DAQA 4YCPA 2C6QA 3LHVA 3CIWA 3WK0A 2TPSA 3BGJA 4QITA 2G97A 5D37A 5FF2A 1GVSA 1Q45A 3GXPA 5AYXA 2CZ5A 2VEKA 1JCMP 1R2TA 3H55A 3LTPA 2E5DA 3BLIA 3I7QA 5FEZA 2CZFA 3HF3A 1XUUA 3CT7A 4GUHA 5D03A 2Q8LA 1M7PA 3L68A 2DZVA 1HL2A 1I2OA 4ICNA 1QWGA 4OU1A 1YPIA 3WK3A 2A7NA 2V5LA 3O8AA 4TU1A 2RH9A 3BW4A 5G1TA 3C56A 1OX4A 2Y88A 3KXQA 3KVJA 1S5WA 1OYBA 3IIOA 1VCVA 2EKCA 5D05A 1QO2A 1FDZA 3CWOX 1TPUA 3OHIA 1VYPX 1GYNA 1BWKA 1OG0A 2NV2A 1P1XA 4OV4A 2A2IA 2ISSA 3PS7A 3PM6A 1QMLA 3L5LA 1VJIA 4NJJA 2CLEA 5E0KA 3EXSA 2QF7A 4UFJA 3TAOA 1LBMA 2C18A 3V1PA 1VPXA 2J9YA 3R89A 1LP6A 3TMQA 4LC8A 1GVRA 4UTWC 4E2DA 1M5WA 5I3FA 1TTIA 4WJEA 1W3NA 1M7OA 3SECA 4CCCA 5EYWA 4GE8A 1S5VA 2GQ9A 2NWRA 5CKSA 1H7XA 3OBKA 4XQ6A 1D3HA 4M6QA 3TXVA 3ABRA 1EB3A 2WSYA 4Z1BA 3L5MA 2BSLA 1DORA 3G1VA 4DBEA 1F73A 4OWGA 4I7VA 5BRBA 2QAFA 2V2HA 4LV9A 2JKPA 3E96A 1O4UA 2GOUA 3HO8A 1ME7A 3JR2A 1UCWA 3EWBX 4MZYA 1RPXA 3E49A 3INPA 1W54A 2C19A 3LCXA 4O1AA 5K4XA 1DL3A 3USBA 1THFD 4AEOA 1RR2A 3FKRA 3MP4A 1SW0A 1OJXA 2ZFAA 4NQ1A 4IMDA 2EGZA 3MI3A 2DZSA 2YSWA 1H1YA 3NPWA 3FKKA 1E51A 3W2JA 3GYEA 1W37A 4DPQA 3TA6A 4HNVA 4X2RA 4Q4KA 5EY5A 2PE4A 2ZCGA 5FEXA 4LOCA 3G1XA 4OBTA 4Q33A 4DPPA 5DN1A 2JK2A 1EA0A 4IX2A 2YDAA 3HG3A 3G1YA 3A5FA 6TIMA 4IXXA 1GOXA 4IPJA 4FNSA 1GQNA 3IV3A 3PB0A 5AHIA 2NV1A 5FF0A 1L6WA 3BO9A 1IXQA 4UTJA 4BWLA 3OG3A 1VR6A 1F6KA 5G4EA 3RLVA 1JCYA 2C1HA 1WXJA 4MLRA 4PA8A 2V9DA 4ZL1A 2QR6A 4UTUA 2FB2A 2QCEA 1C8VA 1A5SA 1EP1A 4UMAA 1W5NA 2OCZA 2A0NA 3MHUA 2QJHA 4JTLA 1SSGA 1G7VA 2V2DA 2WV8A 1HO4A 4JTIA 4IUOA 5D32A 4CNPA 3THAA 2H90A 2E6YA 2ZA3A 1FDYA 4MJMA 4MUZA 5KZDA 4JICA 2OX1A 1UBSA 5KZEA 3C8FA 3GAYA 4FIQA 3I7SA 1O5KA 1KLZA 1XDLA 3LTYA 2QCLA 3A9IA 2I1OA 3NQMA 4LW7A 4UXDA 3UZJA 1LOQA 4RZ6A 3W1UA 3LGEA 3LV6A 3MI6A 1JRBA 4JDBA 2NX1A 2AQWA 4A2SA 2ZTKA 4EF8A 3QM3A 4HSNA 4LUJA 3TJLA 3PVFA 3FYPA 3NDOA 4UTKA 3MBFA 4JXCA 3LOTA 3NM1A 2NLIA 3G1AA 5HULA 3UYCA 4JIPA 4LWWA 4AHPA 3W73A 4WY0F 3TQVA 5BW6A 3NVTA 3GB6A 3SSJA 1LCOA 3N9SA 2C15A 5CZ0A 3TV8A 2VFEA 3PSWA 2CLKA 1G4TA 4NZFA 2B4GA 3B0PA 3STCA 1C29A 3BPWA 4O52A 2JBMA 2Q3OA 5BMXA 2FPVA 1DHPA 3GR8A 2BXVA 4UTLA 4O1DA 1TRDA 3KOFA 1LORA 2AAMA 3W1AA 4WXYA 3G0XA 3PUOA 1K7EA 5A5WA 2CWNA 2ABAA 5F4WA 1EUAA 4L4MA 1SQ7A 5A8GA 3S42A 5G2WA 1P4CA 1ICSA 1P5BA 1EP2A 1VS1A 4N9BA 2ATSA 1O95A 1TJPA 3G1FA 3LM7A 4ORIA 4B5NA 3W7QA 2E68A 1TPEA 1TIMA 1RQHA 3W9ZA 2VXNA 1TV7A 2OZ0A 5EBUA 4O19A 4YL2A 2GVJA 2B7QA 4N9EA 2ZZ1A 4HKPA 5ABTA 4J9JA 4U28A 3UPWA 3R8RA 1L2UA 4NNAA 3W71A 3B0VC 5CGQA 3MHGA 1I4NA 4Y8FA 1S3HA 3TNOA 1OFBA 1EEPA 2QDGA 2DP3A 1OX6A 4XBSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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