1K8YA

Crystal structure of the tryptophan synthase beta-ser178pro mutant complexed with d,l-alpha-glycerol-3-phosphate
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
268
structure length
255
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the beta Ser178--> Pro mutant of tryptophan synthase. A "knock-out" allosteric enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
total genus 95
structure length 255
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2001-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1k8yA00
4NX0A 5HULA 3NPVA 3P81A 2W0UA 1OABA 4YCPA 3UQNA 3LBCA 4DQWA 3SGUA 1T99A 1DVJA 3MO7A 4LS2A 3WK2A 2ISWA 2YW3A 3PS7A 3UXDA 4AWTA 1OFQA 2X1TA 4BWLA 1NF0A 4LS0A 1H50A 3ZWSA 4FNTA 2DZXA 1DQWA 2Q8LA 5BRBA 2E09A 1DHPA 1QAPA 1MEIA 1RD5A 1SSGA 1Z41A 2AAMA 3QC3A 3HGSA 3I6RA 1VZWA 5EPDA 4XQ6A 5G2IA 2RDWA 1IIGA 3G1YA 4U4MA 4UTTA 4MUZA 4DF0A 1YDOA 1DL3A 4FIQA 3CU2A 1NFBA 4K37A 5CZSA 1YPIA 4O16A 3W1XA 1P0NA 3EXRA 3L0KA 4K38A 1W1ZA 3G1FA 4QAIA 3LCGA 3NQAA 4C1KA 1TO3A 2Y7GA 1ICSA 1W3IA 3R5EA 5F2LA 2C15A 3LM7A 3FEMA 4QNWA 4QQ3A 4IJBA 4AWUA 4BR1A 3DI0A 2TYSA 4OQVA 5FEXA 2W6RA 1JQVA 3B0VC 2QEZA 1JRBA 3B03A 1VGAA 2CLMA 4NNBA 3DU0A 3UWQA 3P5YA 1OHLA 1ZHAA 5KZMA 5GVJA 3W7QA 2Y89A 2QUUA 4NVTA 5AYYA 3MI3A 3EX2A 3LDVA 5DY3A 5FI8A 3W7IA 1W8SA 4JTUA 1QDSA 2KZHA 3V75A 1UB3A 3P67A 1YDVA 1LLWA 1O95A 3W1RA 4BI6A 2JBMA 1QMLA 1R30A 4RJEA 4JYDA 3IGSA 3O15A 2ZZ7A 1GVOA 2VKZG 4JD4A 2PCQA 2C1HA 3LCHA 4GE8A 2E77A 3QPYA 1KTNA 5D03A 3SZ8A 4J9JA 3SR7A 2BSLA 4O10A 4M6QA 3CWNA 1QPRA 4LU0A 1KM2A 2YSWA 3EWBX 3THAA 1LROA 3CLMA 2ATSA 5LHEA 2ZA2A 1FWSA 2V30A 4U28A 3FKRA 1QCWA 1OFBA 3VE9A 2RDTA 3GKFA 1Z42A 4Q33A 5DCDA 2YYUA 2ZZ6A 1YTDA 3S5YA 5EA9A 1OF8A 3FJ6A 4DPQA 3NQVA 2GVLA 3MWAA 2QCDB 4KWWA 3PG8A 4MLJA 3EKZA 1FUYA 4AEOA 2VFGA 3HQ1A 2FTPA 3W7NA 2ISVA 3TC6A 3DAQA 4NQ1A 1THFD 4K7YA 3LHWA 1WA3A 2FB2A 3MI2A 4RR4A 4AH7A 5LGXA 3DFNA 4WUIA 2XFWA 4YLWA 1TRDA 1VYPX 4O18A 4O1AA 1S5TA 4BI7A 1LYXA 1FQ0A 1W5QA 1ME8A 2VEIA 3DGRA 2J24A 5HMSA 4UTWC 3HGOA 4L4MA 5HUOA 8TIMA 3EX3A 1EUAA 3ABRA 4N9CA 3OVPA 2WV8A 5DN1A 1H1ZA 3ZS4A 1QWGA 3TU9A 3PR2A 1W3TA 3TSDA 3PBWA 3EWWA 1OFPA 1MEWA 2PE4A 3NQDA 3VFLA 4N9BA 3PSVA 1D3GA 1PHQA 2ZA1A 4YXGA 3UYCA 3GZ3A 1TPVA 4JICA 3N73A 1UCWA 4M19A 4AMAA 3TMLA 1KTBA 1KM0A 4PFMA 1DJNA 2VFHA 3BLEA 4NU7A 1UBSA 3M6YA 4CCEA 1ZNNA 2C3ZA 1J5TA 3QPZA 3TJXA 2Y63A 1F6PA 5G2WA 4UTIA 5HWNA 3S0CA 3PULA 4IMGA 4QSHA 4A2RA 2VENA 3H54A 1TV8A 3NQ6A 4PL2A 5F1VA 3PUDA 5G4EA 3UWUA 3W87A 1WDWA 5J5DA 5G1YA 3L65A 4IUOA 4E38A 3KAOA 3Q37A 1FDJA 1OK4A 2V2DA 2Z2UA 3S1WA 2G5WA 3P8IA 2F7FA 3CWOX 3LRMA 4CQ9A 2V2HA 1W0MA 2YCEA 3FS2A 3W86A 1UASA 3TQKA 3UY8A 3NPXA 4AHQA 2WNNA 2IQTA 4JS3A 4Q32A 3R89A 1F2JA 3IVTA 1JRCA 4B5NA 3M47A 5CPNA 3TDFA 2VFDA 3W9ZA 5EKYA 1T0OA 2Y7FA 3N3MA 4JY8A 1WBHA 3TC7A 1EUNA 3DFPA 1WX0A 4WY0F 4JR5A 2CZFA 3ANYA 3L5MA 1GVQA 1TV5A 4O1DA 1T8XA 5CPOA 3P84A 2ZZ5A 2QCLA 2I9EA 5K3VA 3RU6A 1M5WA 3WJZA 3QSTA 4BWLC 1XC4A 1XCFA 1QNVA 3E49A 2ATMA 3N9SA 4N6EA 4WXZA 1F7BA 3W3OA 2NX3A 1VLIA 1I4NA 1WOBA 2GJNA 1AL8A 1I2OA 3G1AA 4PEKA 3H53A 5CGQA 1RVGA 4UTTC 3A5VA 2DORA 3M5ZA 4LV4A 3IRDA 3W83A 1Q6OA 3C2OA 1SU5A 3M1ZA 4KFOA 2B7QA 3LB0A 4YMZA 3NOEA 4FB7A 1HUVA 5HQEA 3A24A 1KM4A 3CHVA 2A0NA 3G18A 3TKFA 1G7UA 1OFEA 3Q2DA 5D32A 3W7OA 4GJ1A 2A21A 4OV4A 1EWEA 3NQMA 5KZEA 5F2IA 3SECA 3MP4A 2YGYA 3IIZA 4RKAA 3SI9A 4DBDA 1DKWA 5D02A 1O5KA 3BGJA 5DCEA 3FOKA 3CIWA 1WQ5A 2P0OA 2O7SA 1WOAA 3OIXA 4LC8A 3WJWA 1OVDA 2HSAA 4I7VA 4HKPA 4IMDA 1M6JA 3SW6A 4IWWA 2C19A 2NX9A 3PF3A 2VEKA 2QCFA 2EHHA 4PA8A 1K8XA 3BLFA 3R8RA 1KTCA 3JRKA 4K8HA 1LOSA 4HNVA 5LKYA 2Z6JA 2FPYA 2NWRA 3W1NA 4R33A 1TYGA 1SZNA 1JR1A 1LOLA 2ZZ4A 2WNQA 5DCBA 4C1LA 1FX6A 1LBMA 4EWND 2QDGA 3GVGA 5I3FA 3VI2A 4O13A 1LP6A 2JGQA 4JTSA 5LZLA 3RMJA 3DFSA 1KLYA 2DU2A 1FCVA 1K8ZA 2RFGA 2WOQA 4GWEA 4GUJA 3PC0A 1VLWA 1TPB1 2CZEA 3IIPA 1ADOA 4TO8A 1KM1A 3KVJA 1H5YA 3WJSA 3LX9A 4JTKA 3PB2A 3A21A 3GLCA 4Z1CA 3GDMA 1G4TA 3EX1A 1BWLA 4FXRA 3PM6A 1G67A 2LLEA 5HJLA 2YPIA 4XKYA 4DEFA 2AGKA 1K8YA 2RHGA 1K7XA 2E5DA 3GDLA 2V2CA 1LRTA 4ZVJA 1KFEA 5BMWA 5TBOA 5LGZA 1K02A 3VNDA 5C6MA 2QCGA 5CKSA 4JX4A 1VCGA 1XXXA 3B04A 4O57A 2FPTA 5AYXA 3TW6A 4UIOA 2C13A 4Y96A 4Z0SA 3DXIA 3NQCA 2JKAA 2X16A 4BFAA 3RNDA 4JX6A 3GXTA 1GEQA 4LVAA 3MHFA 1GTEA 1VC4A 4I7WA 3O6CA 1CX9A 4MY1A 3I68A 1JVNA 3M5XA 5AHNA 1SO3A 2A5HA 5D38A 3WJXA 5C2XA 3INPA 4WZHA 3CQ0A 3TQVA 1VHNA 1SW7A 3PB0A 4QNEA 4PL1A 5E93A 3GNDA 5U4NA 2CLFA 1W5MA 2FB3A 3NGJA 3W7JA 1SFLA 1MXSA 2I14A 1X8FA 1G7VA 4Z1AA 2CW6A 3W7CA 2E68A 1DORA 1W31A 3S5ZA 4CNPA 1K03A 5LNSA 5D2VA 2YZRA 2WSYA 1TRIA 3C2FA 1FCUA 3NZRA 3WK0A 3KXQA 4P2VA 1GJPA 2CFFA 5BNKA 2VFFA 2FDSA 1ME9A 3LOTA 3QQ0A 3BLIA 3HBLA 1HL2A 4GUGA 2B7PA 4FF7A 3A22A 4R34A 3LHYA 4NJIA 2X1RA 1VCFA 2OX1A 2P10A 3L5AA 1D3HA 3W7LA 2E6AA 3GYEA 4O52A 3W7EA 1HO1A 5IBXA 1W5NA 3LI0A 4ZL1A 3YPIA 3I7QA 3TXZA 1TPEA 1VQTA 1H7RA 5TQLA 3M43A 1FY6A 1S3HA 3U2OA 3W07A 3W72A 3E9AA 1FWRA 3FYOA 5K9CA 5U7SA 3P5ZA 3STGA 2ZRVA 4I9AA 5D09A 2QJHA 1Y0EA 3T4CA 1L9WA 1PE1A 1GQNA 3NQ2A 3LHVA 1C9DA 4HPJA 1W37A 3C8FA 2ZRZA 5DELA 1RPXA 1QO5A 3KRZA 1F5ZA 1HG3A 3GAYA 1ICPA 3S5OA 1IXNA 1TMHA 4RCXA 1TJPA 2YR1A 1TQJA 1VS1A 4HPXA 1KV5A 3BG5A 4MYXA 1H7WA 1AW1A 1TSIA 4UTJA 1KBJA 1EPXA 1LLZA 4E0CA 1SUXA 4XWUA 1G69A 3T78A 4R7JA 5J5RA 3HB9A 4WY0B 1SZGA 5KINA 2C16A 3PAJA 4FHAA 1EX5A 2JKPA 3UPBA 5G2HA 3G1VA 3NQ8A 3QQ1A 5F1UA 2TRSA 3LI1A 4UR8A 4ADTA 1IIHA 4JX5A 5D30A 6ALDA 3FKKA 1YADA 1A50A 4JDYA 3E02A 4R53A 5L6UA 4BI5A 1FCQA 1TTIA 1NAL1 5CPLA 5LHFA 3V1PA 2E5CA 4UTLA 2NUWA 2CLEA 1OF6A 4AWSA 2VC6A 4ZMGA 3UWVA 2ZBTA 4EF8A 5SWUA 3TSBA 2EF9A 5I3HA 2PRMA 3NL2A 4N2YA 1ZALA 2QCNA 4AAJA 5I3JA 2OMAA 2C0AA 5FF3A 4UTHA 1U83A 3BW3A 4DPPA 1ALDA 3DZ1A 1SFJA 3EWXA 1PVNA 1W56A 2NXGA 5CZJA 4JTHA 3L5LA 3TH6A 1V7YA 1Q6QA 4OBTA 1VJIA 3TX9A 3BW2A 3W85A 4LUJA 5D2XA 1A53A 3LERA 4ML9A 4TIMA 4OV9A 1P1XA 5HR7A 4IX2A 2RDUA 4ZQPA 5CZ0A 4MJZA 1PV8A 2HTMA 1OYCA 1TPH1 2ZRYA 4FIRA 2F84A 3QEZA 2ZTKA 3DKLA 3SJ3A 5KTLA 3M44A 1L2UA 4NX5A 3S1UA 1ZENA 5CSSA 1JCMP 4UMBA 4YWIA 4LV9A 2B7OA 3UD6A 2ZZ1A 1BKSA 3E96A 1X6UA 4S2BA 4Z08A 3QMRA 2ZRWA 4AF0B 2CLKA 1GZGA 1N7KA 2V9DA 3NQGA 4EIVA 1IXOA 2CZDA 5F4WA 3WFAA 3W7HA 1OX4A 2H8ZA 5AHMA 1QFEA 4JTTA 4EF9A 2QCHA 1Q3NA 2OJPA 3PBYA 3GK0A 1LORA 4LVGA 3QF0A 1AG1O 4JYFA 4JEQA 4Z0JA 3W70A 1G4SA 1JULA 4ADUA 2GQAA 4PCFA 4FEZA 3W88A 1E51A 4DELA 1ZAHA 4M5PA 4DXVA 4MLRA 2E1DA 3LRLA 1RZMA 3NQEA 2PRHA 3WJYA 1N8FA 3HO8A 3W7MA 1XBYA 3EXSA 3L0GA 4AXKA 1QOPA 4O0ZA 2FQIA 3PBUA 1DQXA 4UTMA 4HNNA 4RZ6A 4FX8A 3C2VA 3NVTA 3I65A 4IXHA 4NT0A 5K4ZA 3VKJA 1FXQA 3LTPA 1F74A 2A6LA 2OCZA 1VYSX 4JTGA 4O12A 2QF7A 1F6KA 3QYQA 1UUMA 4E2DA 4DO4A 3IIVA 3LTYA 1ICQA 3LLFA 3TA6A 2ABAA 5IM51 4O17A 1KFJA 3PY2A 5D2TA 1TQXA 4GBUA 4IGHA 1IXPA 2ZRUA 3TROA 4CLMA 3R13A 4LNYA 3HG2A 3P60A 5FF2A 4JTIA 3JS3A 2TPSA 3KFTA 3G24A 4WOQA 1NEYA 3UWYA 3GB6A 1M7OA 2Y7DA 3UPWA 4JDBA 3NDOA 1QO2A 1SW0A 1EB3A 1GVSA 1OJXA 5K4XA 3S1VA 3GDRA 1GVRA 1B4EA 4GNJA 4ICNA 2VEPA 2X1UA 4ZZ9A 4JIPA 1H1YA 1TCDA 2ZZ3A 4RXGA 4UFMA 1DJQA 2YX0A 5IBXC 3QRHA 3OA3A 1YTEA 4O14A 3F4NA 4H4IA 4POCA 1YLVA 5DBUA 5FF0A 1XBVA 4MZ8A 1XBXA 1J2WA 3W7KA 4GC4A 2VFIA 5K7JA 2E5BA 3Q58A 3GKAA 1ZY9A 3LBMA 3G22A 3PVFA 4FNSA 2Y6ZA 3NPUA 3BW4A 2Z0IA 4O4WA 4GUFA 4LVBA 3C2EA 4GFSA 1H7XA 4JTJA 4FNPA 2CLOA 3LGEA 3IVUA 2EGZA 3G1XA 3M16A 3W84A 3U6WA 4FX7A 2QCMA 5DXYA 5DLCA 2DZVA 3LLDA 3C0JA 1M7PA 1W5PA 4H3DA 1H7NA 4WD0A 3QM3A 3G1SA 4MVAA 3TIMA 4CQAA 3L66A 3S6DA 1LDCA 3MYPA 3P7YA 3O07A 4NJGA 5LNWA 1Z44A 1YXYA 3CB8A 4QISA 3HOJA 2J6XA 4WJEA 3O63A 3KOFA 1WBJA 2EAWA 3W2UA 3GXPA 2X1SA 5AYZA 3UXAA 3CIXA 3W76A 1XUUA 3BO9A 4UTUA 4WQ6A 1KLZA 3S8HA 1SO5A 5FEPA 2GJLA 3LXCA 4N4PA 1H51A 2QCDA 3QW3A 3BK0A 3GDKA 4NJJA 3W7GA 5C55A 2D73A 4QIUA 7TIMA 2OT0A 1FWTA 3W2MA 3QJAA 4JNMA 4KFPA 4MZYA 3G3MA 1QPQA 4JTEA 2R94A 3G8RA 5EL1A 4O1CA 4UC5A 2YXGA 4LTSA 4JXCA 1TREA 3DENA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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