1K8YA

Crystal structure of the tryptophan synthase beta-ser178pro mutant complexed with d,l-alpha-glycerol-3-phosphate
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
268
structure length
255
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
publication title Crystal structure of the beta Ser178--> Pro mutant of tryptophan synthase. A "knock-out" allosteric enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
total genus 95
structure length 255
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2001-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1k8yA00
3HB9A 3OVQA 1GTEA 1HTIA 3Q94A 2C1HA 1YPIA 1Z42A 5U7SA 5C2XA 4N4PA 3TC6A 3G1SA 3CPRA 5KTLA 4XWUA 4K39A 3G3DA 4UUIA 1TPVA 2W79A 1OFDA 3PBUA 3UWWA 2G97A 1L6WA 1VS1A 4NNAA 2RDTA 1HO4A 5HR7A 4LT9A 3EWBX 4OV4A 4H3DA 3HG5A 5F2MA 5CSSA 4AAJA 4B5NA 5CSRA 1LLZA 5AHFA 3BW3A 2B7NA 3GR7A 3I65A 3N14A 2Z1BA 4K8EA 3T7VA 1TV8A 1R2SA 5AHMA 3NA8A 4DXVA 1M6JA 2EF9A 2V82A 2F84A 1TTQA 3PR2A 1YPFA 3GDMA 1J2WA 1JUBA 3PBWA 3M9YA 4CQ8A 4UTMA 1QMLA 1TREA 1AK5A 3B8DA 1XI3A 2B7OA 3N2XA 1I2PA 4YL2A 1KM1A 2F7FA 1MZHA 4IXHA 3L21A 1MEWA 3DI0A 1EPXA 5AHNA 2Y70A 4LRSA 1QPOA 3KRZA 2AAMA 3TC7A 2VXNA 3MBFA 3TXVA 4JYEA 1VCFA 2YYUA 2A6LA 4IJBA 4FNSA 2VEKA 1FWNA 4RJEA 1S5WA 1VQTA 3DKJA 4O1CA 1Q3NA 4FNRA 2Y88A 2AQWA 4MFDA 1L6SA 4WY0A 3MI6A 2GVLA 1WOBA 1XFBA 5HMSA 5FF3A 4LC6A 2NXGA 3HMJG 3KRSA 1VHCA 4YXGA 1IF2A 4LVDA 3O6CA 1WBJA 4JX6A 1Q6RA 1BTMA 3W85A 2A2IA 3IIXA 3DKLA 1XL9A 5FI8A 3LHVA 4JTFA 2E6DA 3BO9A 1PE1A 5I3GA 5AHEA 3A9IA 4JTUA 4ICNA 3IV3A 3Q58A 1N55A 3Q2DA 5AC6A 4XBKA 3B0VC 1MO0A 1FWSA 3GKAA 4UTJA 3EKZA 5HUOA 3W87A 4UTTA 3A24A 4A21A 3NZ1A 3GXTA 4IOTA 3M41A 1YDNA 2OZ0A 5LZLA 3I7RA 1F05A 3GDKA 4PL2A 2ZZ2A 1C8VA 3IIVA 4FX7A 2ZZ4A 1TV7A 2EGZA 3NEVA 3MP5A 4TO8A 3HG3A 1V7YA 3G0UA 3NYZA 3W7JA 4N9DA 3LTSA 4XBSA 1H5YA 1LOSA 4EIVA 3NO5A 2D73A 1KFCA 4UTKA 2AGKA 1KM3A 2R8WA 3TSMA 3KFTA 3QMSA 1WQ5A 3TROA 1OG0A 3BV4A 3W1QA 4OBTA 1RQEA 3WJYA 3DXIA 4O53A 3EX2A 2QAFA 3TH6A 3U2OA 2CLOA 3SJ3A 4IMGA 4JTIA 4ZQNA 1FCQA 1GG0A 3O1NA 3JS3A 4K38A 1KM6A 3E9AA 3B0UX 1DQXA 4DO4A 4BWLA 4UTLA 1XC4A 3EEGA 4MKNA 2X1UA 7TIMA 1FDZA 1W37A 3P74A 1KA9F 1PL9A 2X1TA 1KM4A 4L4MA 1YTEA 2J9ZA 4KKXA 3OIXA 2G5WA 3HPSA 4Y6GA 3NAVA 3B05A 3NQ6A 2Y7DA 1AW5A 3P80A 2V9DA 5G2IA 1WDWA 1OF6A 1UJPA 1W3IA 1IGSA 1D9EA 3HOJA 1LROA 2O7QA 4PL1A 1P4CA 2ZDRA 1THFD 2PURA 4E2DA 3TSBA 5K9CA 1B57A 2Y7GA 2FPYA 3W3OA 3TCEA 2Y7FA 3W73A 1H7RA 4ZQOA 4WXYA 4OGZA 5BMXA 5D2XA 1LBFA 3RF9A 1R2TA 2ABAA 5DN1A 5KZMA 5K9XA 3M5VA 4TIMA 4W9TA 3C8FA 3IVSA 1G67A 3BW2A 4JGDA 4Q4KA 1PV8A 2VC6A 3L0GA 5EPDA 3NPVA 3P60A 5DXXA 3O16A 4PEKA 2QUUA 4LWWA 3NXFA 3HG4A 1A53A 1PCWA 4OT7A 1GTHA 3BG3A 2W0UA 4JIQA 4XZ9A 1FQ0A 3QSRA 3BGGA 1HL2A 1JCNA 1S5TA 3MI3A 4PFMA 3CHVA 1KBJA 1PHWA 1SUXA 1JCXA 3NL2A 3NGJA 5BW6A 4JY8A 3MW7A 4PTNA 2GJNA 1H1YA 3FJ6A 3W07A 3W1MA 3QF0A 3RK8A 1YDOA 4Y96A 3KAOA 3LXCA 1QOPA 4O11A 5L9FA 2JKPA 4IUOA 4UMCA 2E6AA 3F03K 4MUZA 4HHPA 1GPWA 2TMDA 4NJJA 3RMJA 4QNEA 3S6DA 1B3OA 1UUMA 3LRLA 3M0ZA 3UQNA 2EHHA 2C3ZA 5LNRA 2DORA 4LS1A 3LLDA 5I3JA 4CCDA 3M7WA 2VENA 4RV8A 1FY6A 2J24A 3WK1A 2EKCA 1SZEA 1QAPA 2H3BA 2NWSA 3P5ZA 3NQEA 4JTKA 3BLIA 3QQ0A 3C56A 5DY2A 4R34A 4QITA 4UFIA 1L9WA 2ZA3A 3A22A 4FHAA 1KBIA 1KM0A 3MJYA 1F73A 3EWXA 4HKPA 2ATMA 1IIGA 2ALDA 1G6CA 3E49A 3EXSA 1H7PA 3W1NA 3UWVA 4LVAA 3NQMA 4UMAA 3QPZA 5D2TA 5G4EA 1YTDA 1W54A 3AO0A 1KV5A 1TO3A 3NZRA 3W1LA 3P62A 3VCRA 3NQCA 1NEYA 4LNYA 2BX7A 4FNTA 4DPQA 3DFQA 3L66A 4NXSA 1VCVA 4FNUA 2NUWA 2C18A 2NX3A 2WQPA 3LB0A 1QDSA 1QWGA 1RVGA 3W1RA 1OFOA 1OFAA 1JVNA 3G8RA 4UFLA 3L67A 1J5TA 4G1KA 5SWUA 1TJPA 4ADUA 3EX6A 2WO5A 4MVAA 1TPB1 5AB3A 4IPJA 1TQXA 1H7OA 1EX5A 3YPIA 3A21A 4NZFA 1OABA 1K8ZA 1YXDA 1KFEA 4XTIA 2V5BA 4NNCA 1VCGA 3W1XA 4MZYA 3W7KA 3P7YA 1R47A 1XUUA 3BLFA 1NAL1 3VKJA 3L5AA 5KINA 1DORA 2GQ9A 2VEIA 1X1ZA 3W9ZA 3QYQA 5G1YA 2ZRWA 4JY9A 1H7XA 1JUKA 4RXFA 1TQJA 1ML1A 1RV8A 5D09A 3EWYA 3NVTA 2C14A 5D38A 1LCOA 3W84A 4BI7A 1I45A 2EAWA 2P1FA 2DZTA 3LHYA 1YXCA 3GIYA 3K30A 5C54A 2QUVA 5FF4A 3R12A 3TQKA 2CLEA 2P0OA 4IX0A 1P0KA 5I3HA 3SFKA 1QO5A 4QISA 4IX2A 4TU1A 5K2ZA 4TMBA 2QCDB 2CFFA 3CLMA 3CT7A 4M7SA 3P61A 1I2OA 3R2GA 5HQEA 3SR7A 2ISWA 3S0CA 3CC1A 3TXZA 1QPNA 3N19B 5A8GA 3R89A 2CZFA 5BRBA 1DVJA 3TJXA 1GVRA 3SSJA 3DI1A 1UB3A 3GXNA 4UTHA 3INPA 2YW4A 3VE7A 3S1UA 1SSDA 3LX9A 3HBLA 3FS2A 2WPBA 1TPDA 2ZZ6A 3C6CA 3QSTA 3NQVA 6TIMA 2WNNA 4FO4A 5A5WA 4E0CA 4LV4A 1G69A 3QFEA 3IRDA 4O1AA 4JIPA 1GEQA 3CU2A 1WXJA 3NM1A 5J5RA 3IGSA 3KOFA 1DOSA 4UIOA 2QJIA 3T44A 1UBSA 4GE8A 2V2CA 1W56A 3OHIA 3STCA 4RZ5A 3LLFA 1PIIA 1FCUA 3HPZA 5D37A 3SGUA 2O7SA 3L5LA 2HMCA 1ZENA 4ZQRA 4P2VA 5I3IA 1LM1A 1DL3A 1ZAIA 3AJXA 3SW6A 4JDYA 1AL8A 3CQ0A 3PF3A 5AC8A 3PG8A 3KXQA 3W7CA 2TRSA 3TUUA 1XM3A 2Z6JA 3G1XA 2H8XA 1FCBA 3NR0A 3LDVA 1G7UA 1A5SA 2JBMA 3W1PA 3MI2A 4OU1A 4JTEA 1YDVA 1B4KA 2Y85A 4YLWA 3S1XA 3HGJA 5K7JA 1OK6A 3TMQA 5CG7A 1ZJIA 4I7UA 5CKSA 3OBKA 3DFSA 4FXRA 2VFGA 4O17A 1XXXA 1TMHA 1SZGA 3DHFA 3ZS4A 5F4WA 3W7NA 3UNDA 4PH6A 1F74A 3TX9A 2ZZ5A 4JNMA 1HG3A 3EKLA 4MIMA 1Z41A 4IGHA 4O0KA 1F76A 4MY1A 1EIXA 4RR4A 1O5KA 1LLWA 2E77A 3W7MA 1FCVA 1EUAA 4JX5A 3ELFA 3W2NA 2YSWA 1TPC1 2QJGA 5DBTA 3HJZA 1NSJA 4AVFA 4CNPA 1W5MA 2NXIA 5LNWA 1ZCOA 1JCMP 1OFPA 1OX6A 1TCDA 2V30A 4O50A 1R46A 1XBZA 2BWGA 2IQTA 3L0KA 1ME7A 3WJSA 4UR7A 3W2UA 3U6WA 3L5MA 2R14A 1N8FA 4JYDA 5DCBA 2TPSA 3EB2A 3N9SA 2YR1A 3DENA 4JEQA 5CZTA 4M7TA 3DGRA 2I1OA 3UY8A 5EA9A 1ZFJA 2WNQA 5FF7A 3LTPA 4UTWC 5J5DA 4N02A 3GK0A 3NNTA 4WUIA 3MMTA 5I3KA 3MUXA 1QPQA 4AMAA 4E2BA 3KVKA 1VYRA 1LZOA 2NV1A 1KW1A 3CEUA 4NJKA 5F1UA 3PVFA 2CU0A 3O15A 4ZVJA 3FOKA 3CWOX 1W3NA 1LRNA 2C0AA 2OCZA 3O6YX 2NUXA 3SIZA 3C2FA 1ZNNA 1GJPA 1TYGA 3PULA 3H53A 3IIOA 4N6FA 1VJIA 1D3GA 3G24A 4AEOA 5KITA 3TW7A 2H6RA 1TPFA 1T0OA 3DBPA 3U8GA 4LC8A 1BKSA 1LOLA 3RU6A 4DPPA 2QR6A 1O60A 4UXDA 3LCGA 1JQVA 3WK2A 3ABOA 3EX1A 3SI9A 4MYXA 4ADTA 5TBOA 1K03A 3VNDA 4GXMA 3L65A 2G95A 3OVRA 2Y63A 1K8YA 2RHGA 1ZHAA 2GVGA 4FF7A 4GUGA 3P81A 3W7IA 4NVTA 4ORMA 1MEIA 2PE4A 3PBYA 1M7OA 4LW7A 1A5AA 5D04C 2OMAA 4AWUA 4DF1A 4H4IA 3MHFA 3HF3A 5KSWA 2NZLA 3BVJA 5E93A 5CPMA 3HO8A 4JX4A 4Q33A 1LRTA 3NPWA 1EP2A 3BLEA 3WK3A 1Q6LA 3TQVA 4JDBA 2ZA1A 1SFLA 4MJMA 2WSRA 4NQ1A 1F5ZA 2ZTKA 2CLKA 2H3DA 2FDSA 2NX1A 4ORIA 3EWWA 1DQWA 5EMUA 5KZDA 5LNVA 4D2JA 4CNNA 4MY9A 3Q37A 4NJIA 3GB6A 1VZWA 1ME8A 3D0CA 3HG2A 5D2VA 2PCQA 3B06A 4C1KA 1L2UA 5E1QA 2J88A 2OJPA 1FBAA 1W5OA 1KV8A 4O16A 3NPUA 4JTLA 3W7EA 2C6QA 1QNVA 3W7HA 3LV6A 5G2WA 4BR1A 4MLJA 1X7FA 2BLEA 1KLZA 3NL5A 5F2GA 3W72A 4J9JA 4WJEA 3ZWTA 3STEA 5ABTA 3E02A 3C52A 3DH7A 3PUEA 4QQ3A 5CPNA 4FNQA 4M6QA 3S9YA 4FNPA 3RNDA 1KTCA 2YDAA 3BG5A 3M5XA 1Q6QA 4Y8FA 3MYPA 4NU7A 3W83A 3WK0A 5TIMA 3NQAA 4DBDA 4M6PA 4HNUA 1VR6A 3EX3A 4KWWA 5FEWA 2QCEA 2CLHA 1TIMA 3G8EA 3CTLA 1OFQA 3I6RA 4K8HA 2VOMA 1OX4A 2Z0IA 3W1AA 4FX6M 3FKRA 1UASA 1DJQA 5DELA 4MY8A 4O12A 4HNTA 2CWNA 4UTUA 2HSAA 2Q3RA 3EX4A 1ONRA 3S8HA 3C2RA 1FXQA 1Z44A 3O63A 2OT1A 3S5NA 3KVMA 3O8AA 4ADSA 1T99A 1L6YA 4BI5A 3LXBA 3N2MA 1W31A 1NFBA 3C61A 3N34A 2ZBTA 1XDMA 3MP4A 4DO5A 2OX1A 3IEBA 4AH7A 3ABRA 1ICQA 1PCKA 5DLCA 4CCCA 2QCMA 3GVGA 3FYOA 3VFLA 1SQ7A 4GUJA 3PUDA 1A5BA 2A7RA 2BSLA 4Z1BA 3QH2A 5D32A 3A5VA 3O05A 5IBXA 4TR9A 5CZJA 1C9DA 1C29A 3F4NA 2Z6IA 3NQGA 5CZ0A 4EWND 2FB2A 3W22A 2QCCA 2WOQA 4OHQA 3LXAA 2JKEA 3QZEA 1VH7A 1SPQA 4EVZA 4NX5A 3CB8A 1I2QA 1W5NA 4PCFA 1OJXA 3W23A 3NG3A 1WBHA 5TQLA 4HPJA 4UTWA 1IXPA 1SW7A 2RH9A 3THQA 4A3UA 3W7QA 1TTIA 4XUGA 4GRSA 1NF7A 2DJXA 2QUTA 1T96A 3UYCA 4ZMGA 3M5ZA 2I14A 1DJNA 1EP3A 1U5JA 4UMBA 2JKAA 3OG3A 2P10A 1B4EA 5K9DA 4WY0F 5DCEA 5CGQA 2ZRVA 2V81A 4ZQCA 4AHOA 2Y61A 4GBUA 4POCA 4UC5A 3B03A 1LORA 1SFJA 1GYLA 4X9SA 4PA8A 6ALDA 1O95A 2QDGA 1DKWA 3FJLA 5KZEA 1IXNA 1EA0A 3L2IA 1HO1A 1GOXA 3NQ2A 5HR6A 4M5PA 4HPXA 1MEHA 1Y0EA 3PS7A 1QO2A 2YGYA 3H55A 2QCLA 2A85A 1I2NA 5FEXA 3T55A 2CZEA 3P8JA 1W8SA 3MBDA 1AW1A 3IVTA 3IIZA 5CPOA 3LOTA 1ALDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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