1K8ZA

Crystal structure of the tryptophan synthase beta-ser178pro mutant complexed with n-[1h-indol-3-yl-acetyl]glycine acid
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
268
structure length
257
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSALPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
publication title Crystal structure of the beta Ser178--> Pro mutant of tryptophan synthase. A "knock-out" allosteric enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
total genus 98
structure length 257
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2001-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1k8zA00
1P1XA 5C54A 4RR4A 4Z0JA 3M5ZA 3BGJA 5BW6A 4OWGA 4ZQNA 3L21A 3C2RA 1JRCA 5F2LA 1GVOA 1TPH1 3KVMA 4RK8A 2X1UA 2XN2A 2VEIA 1W5MA 2C1HA 3NYZA 1PVNA 5HUPA 4EWND 3R5EA 3PUOA 3UPBA 5LNUA 3M43A 2C3ZA 4FNUA 2TRSA 3ZS4A 3U2OA 5U7SA 4JICA 3HBLA 2QKFA 3EX1A 3KVJA 4NZFA 4IX0A 3W2UA 1Q6RA 2QDGA 3NQMA 4NZJA 3LCLA 3S1WA 3P7YA 3IVTA 1XKYA 1QR7A 2Q8LA 3B06A 1I2QA 5FF0A 2ABAA 3C2VA 3THQA 1NFBA 2QEZA 3G3MA 5H91A 5D02A 1H5YA 1ZJIA 2DORA 4XKYA 3SGZA 1M5WA 1M6JA 5KTLA 1X1OA 3ZWSA 1IXNA 4RJEA 1P4CA 1GTHA 1H7OA 2E1DA 3F03K 3GXNA 5BNKA 2ATSA 2ZA3A 3STCA 1K7EA 4H3DA 4MFEA 5EPDA 1RQEA 3CIWA 4AWUA 4NJHA 1EEPA 1AW2A 1I8JA 3P8IA 4HN4A 4FB7A 1Z42A 3UY7A 1IF2A 2ZRUA 2VFEA 3PBYA 5I3GA 3UZ5A 2VFHA 3MI3A 3BARA 3KHJA 3MO7A 3FFSA 1VYPX 4NQ1A 1OVDA 3LTYA 3QF0A 4OQVA 1FWSA 4WZHA 3GDKA 4KKXA 1S5TA 3CWNA 4MZYA 1VCFA 1YXYA 1RD5A 1RPXA 2DZSA 4WY0F 2B7OA 2A85A 1T0OA 2VENA 1LROA 1KTCA 3GIYA 5EKYA 1EP2A 3A23A 4WJEA 5F4WA 3W86A 2WQPA 3A21A 1DJQA 4QM1A 3SECA 5AOUA 5SWUA 3TMQA 1E51A 2HTMA 4IMFA 2DZTA 1UASA 2V5LA 2X1SA 1H1YA 3DXIA 3G1FA 4MPQA 5EY5A 1C29A 4O0KA 1BWKA 2QCDA 3O6YX 2BSLA 3TQVA 1H50A 3SIZA 1PCWA 2NX3A 4M19A 3EWZA 5F1UA 4OGZA 2YCEA 3KVLA 4FNSA 2YPIA 5D09A 2H6RA 1SSDA 1F73A 3P5YA 3P82A 1H1ZA 3P67A 5TQLA 1H7RA 1P0NA 4O28A 4WD0A 3QMTA 1H60A 1TJRA 1KLYA 2QUVA 2RH9A 1XI3A 3LX9A 1ICQA 3TIMA 3W6YA 3HJZA 2QDHA 3W7PA 5G4WA 5IBXA 2RDTA 1FQ0A 5K4ZA 1GVFA 2JGQA 1LZOA 2Y70A 4O1CA 2WSQA 2RDWA 1LP6A 1R46A 2O7SA 3L5MA 4GFSA 1PHWA 1AMKA 3BVJA 4UC5A 2Y85A 5LNRA 3S0CA 1GOXA 4O12A 1OFQA 1XDLA 5A8GA 3E0IA 3M16A 4I9AA 4TR9A 4XWUA 5DCBA 2B7NA 1QPRA 3QPZA 4S2CA 1MZHA 5LKYA 3HQ1A 1IXQA 5KZDA 2ZRVA 3EWUA 3SZ8A 2UV8G 5AHNA 5FI8A 4U4MA 4CCEA 3LDVA 3PVFA 3QQ1A 1NAL1 3N9SA 4UTWA 3S42A 3UWYA 4DQWA 3JRKA 2GVJA 4QJ1A 2CWNA 2J6XA 1MEIA 5E1QA 1VCVA 2JGYA 3O6CA 3QMRA 4MZ8A 5HULA 4UTMA 1I2RA 3B0PA 4O18A 2GOUA 2BWGA 3P80A 4MYXA 3UYCA 4DXVA 2PURA 3PBWA 2CLEA 4JS3A 1W3TA 5HINA 2VFIA 3RU6A 3C2EA 2CFFA 4FXSA 3L67A 3SSJA 4TO8A 2RDUA 3MWAA 2J9YA 3PUEA 3B4UA 3EKLA 4AWTA 3MJYA 1KFEA 5EL1A 1DVJA 3NQDA 4O14A 3Q37A 4UR8A 1C9DA 2OCZA 1TO3A 3W2LA 1VS1A 2V2DA 4R7JA 5FEZA 2Q3RA 4WY0B 1JUEA 3AJXA 4IMEA 4QSHA 3VI2A 4M7TA 3G3DA 3UWUA 3LCIA 4JX4A 4GJ1A 4WXZA 3LCGA 3BW3A 4YL2A 4HNUA 1GJPA 3UWZA 1JCXA 3TCEA 5J5DA 1SUXA 5HR7A 3F4WA 1FWWA 1YDVA 1H63A 3DENA 5C5YA 2NUWA 4UTTC 3BO9A 4JR5A 4FX7A 3WJYA 1I45A 2V9DA 4K7YA 4NX0A 1NF7A 3FKRA 1LOSA 3W7NA 4K38A 1ZNNA 5D38A 5ABTA 3W1TA 4LNYA 5HWNA 4WQ6A 3OVQA 2V81A 5E0KA 4KWVA 1PL9A 3N2XA 1SW0A 1QO5A 2EAWA 1B57A 2CZEA 4ORMA 4UFJA 4JTUA 2JKPA 4ZZ9A 4QITA 1SW7A 3NL2A 2Z6IA 4PL1A 4Z0SA 4ADUA 2R8WA 4HHPA 4K8HA 1QOPA 3KX6A 4HNNA 1LOLA 5FEXA 3W3OA 4A29A 1W8SA 2FPYA 4POCA 3W1QA 4Z08A 1KTBA 4X9SA 1GEQA 2I14A 5LNSA 3I7SA 2E77A 5D32A 3IGXA 1H7NA 3GVGA 4TIMA 3GLCA 1GG1A 2FJKA 4QQ3A 4AB4A 4UNLA 3QPYA 4XTDA 3M41A 2CW6A 3MHFA 2C6QA 3N19B 1TRDA 4DF1A 1DOSA 2GQAA 4BWLC 5K2ZA 1RV8A 3S1VA 3WJSA 2WNQA 1XBVA 4ZQRA 5AFDA 2V8ZA 3C4UA 4Y6GA 4A2RA 4MVAA 1O4UA 4PFMA 2C19A 5AYZA 5K9XA 4RXFA 3FA5A 3LRMA 3VCRA 4UFMA 1YXCA 2ZBTA 3S8HA 3W72A 3EXTA 5AHEA 4ML9A 1H51A 2RKXA 4GRSA 4XUGA 1LLZA 1FX6A 2W6RA 1L9WA 1OX6A 3S1XA 3GR7A 1Q45A 3MHGA 4GBUA 4IGHA 1GPWA 3H54A 2CZFA 3M47A 4OT7A 3FJ6A 3IIXA 1ZCOA 1XBZA 2ZZ5A 3GKFA 3O8AA 1K8XA 3CM4A 1X7FA 1Y0EA 1YADA 3CTLA 4UFLA 5DXXA 4LVBA 1J4EA 3G22A 2VELA 2BLEA 1G7VA 3I7RA 2XN0A 3BW2A 3NPWA 3C2OA 4OV4A 3CIXA 2O7QA 5HQEA 4RKAA 1FUYA 3K30A 2BXVA 5F2IA 5K9CA 1FCQA 3NPVA 4DBDA 1M7PA 1OFPA 5FF3A 3PBVA 3C61A 1EB3A 2ZZ7A 2WO5A 3PM6A 2WNZA 1QPOA 2A0NA 3MP3A 4JXCA 2FB2A 1GT8A 4PODA 2A7PA 5HNRA 4XBKA 3V1PA 2E6AA 2PRLA 3TSDA 4UTHA 2ZZ3A 3OHIA 3UWQA 1YDNA 3LI0A 3TAOA 5KITA 3TQ0A 1TYGA 4ICNA 1VHCA 5LGZA 4M5PA 3FOKA 3QYQA 5I3IA 1TV7A 1KFBA 1JCLA 1VCGA 1F7BA 1LM1A 4EVZA 1KM0A 3F4NA 3YPIA 3LERA 2A6NA 3IV3A 3W2MA 1U83A 3ABRA 2FQIA 3PG8A 4JYEA 4O17A 1DORA 3SJ3A 1B4KA 3FLUA 3TE9A 1DL3A 5F4XA 3LHTA 3DFQA 3M5YA 4MLRA 1FCUA 1KBIA 3TMLA 5CKSA 2C16A 3BLFA 1ME8A 1OYBA 4L4LA 2C13A 2ZCGA 4JTHA 3HGRA 4E38A 5CZ0A 1XM3A 4Y96A 4LS0A 1IXPA 3HG3A 3E9AA 1OX4B 2C18A 3TAKA 4N6FA 3W88A 2ZFAA 1LOQA 2V30A 1TPB1 3UQNA 1A5CA 4WOQA 4BI7A 2X30A 1WOBA 4DO5A 3LV5A 1F74A 1FDYA 1FCVA 3LCHA 5LHFA 2W79A 3W7EA 1QO2A 3W7CA 5HWJA 4WXYA 4RX0A 5G5IA 1P0KA 2CLOA 4JTKA 1XXXA 3WK3A 2V82A 4TMCA 1I2OA 1ZHAA 3BGGA 1GYNA 3W1XA 4X3ZA 1RZMA 4LRSA 4K6AA 3W7IA 4UTIA 3DKJA 1W5NA 3N3MA 4LT9A 4UMAA 1K8ZA 6ALDA 2CZDA 3U8GA 3W7HA 5F2GA 3NZ1A 5DLCA 5A5WA 4PTNA 5G2HA 3Q58A 1F76A 1T96A 5DXYA 1DQWA 4K7VA 2ZZ6A 5AB3A 3O06A 1JCMP 4GUJA 4HSOA 4G1KA 5G1YA 3NOEA 1D3HA 2VC6A 5CZJA 1WX0A 3W2KA 2B7QA 4O50A 2A2IA 2CLIA 2CZ5A 5DY3A 2EF9A 1WAUA 2OZ0A 5KZMA 1WA3A 3W1AA 3ZWTA 3DHDA 3FIGA 1G4PA 4ZMGA 1Q6QA 3TUUA 2X1RA 3T55A 1RVGA 4LVFA 3BG3A 4NNAA 2ZDRA 1SFLA 3R13A 3E96A 3SY5A 4FXRA 4DO4A 5D33A 2A1YA 2ZZ4A 5KMYA 4IOTA 1OFAA 4ZQCA 3PB0A 1LCOA 2Z2UA 4IPIA 3C52A 4HNVA 1QWGA 3QMSA 5I3FA 1SFJA 1Z44A 3G18A 4N2YA 5GVJA 4AAJA 3M44A 5TIMA 1YPFA 4W9TA 2QCNA 3DFPA 1A5SA 1OHLA 1CW2A 3BLIA 2Z6JA 3W1RA 3MI6A 1R47A 4PL2A 3UWVA 3WJXA 3TKFA 3S9YA 4UMCA 1A5AA 1O5KA 3ABSA 4J9JA 1JVNA 5CSSA 5U4NA 2J24A 2YFNA 4AF0B 3GAKA 2QJIA 1ONRA 3C0JA 2P1FA 1SZEA 1TTQA 3RK8A 3IIZA 3LOTA 4MZ1A 2H90A 5T26A 2V2HA 4JTTA 1TPUA 5FF7A 5L6UA 1KM1A 4O0ZA 1JR1A 5EYWA 3R12A 2WV8A 4AMAA 2C15A 1W3IA 2DZUA 3PY2A 1BEUA 5G1TA 3LB0A 4EIVA 3NO5A 1FY6A 1IXOA 5DY2A 1T99A 1VZWA 1OYAA 1TTIA 3W7GA 2PCQA 4QAIA 4HPXA 4PH6A 3DFSA 1H7WA 4KFPA 1M7OA 3UWWA 3W71A 2Y7GA 1O94A 2H3DA 4M7SA 3QW4B 3LBMA 3UNDA 2FIQA 2PRMA 2ZRYA 5L9FA 4BI5A 4M6VA 5F4SA 3I7QA 4YCOA 4CNOA 2LLEA 3C8FA 1KM5A 5F2MA 1TPEA 1I2NA 5CGQA 1I2PA 4LUIA 1LDCA 3ELFA 2WOQA 3E12A 3LBCA 4RZ6A 1JCNA 3S5OA 2GJLA 4AXKA 2NZLA 2QCEA 1GWJA 2C0AA 1FXQA 3EXRA 2OX1A 2QCHA 1TPVA 3KXQA 3DI1A 4JTSA 3ATYA 1LYXA 4CCDA 1B9BA 1TREA 2Q3OA 1PS9A 3C3NA 4O4VA 3EKZA 3JS3A 2Y88A 1EPXA 5DBTA 1YYAA 3GDMA 3PF3A 3E02A 2P0OA 2WSRA 4QISA 3NQCA 3LCXA 2OT1A 1MXSA 3I65A 4UMBA 3G1XA 4PA8A 4JNMA 3DFTA 5D03A 2YW3A 1FDZA 1IIHA 2PE4A 1MEHA 4GUIA 1TPFA 2BZNA 1XUZA 1R30A 1ZAIA 1GVQA 3PULA 1C8VA 2TMDA 1X1ZA 3T7VA 3EX3A 1OFEA 4LS2A 5CSRA 4JYFA 2Y7FA 2A6LA 4O52A 3NQVA 4M6PA 5CG7A 1FBAA 3P81A 4LY8A 5C2XA 4Z1CA 1FWTA 3NQ6A 1T8XA 2NV2A 3G1VA 3T40A 1YTKA 1HL2A 2DJXA 1LRTA 4NXSA 1V7YA 1N55A 3QZEA 3W1UA 3IVSA 3W76A 4N4PA 4Z1AA 4CLMA 4K37A 4OHQA 4LVDA 3OEXA 3O6DA 4HPJA 4QNEA 4UCGA 2Y89A 4BI6A 1FCBA 4Y90A 1WBHA 2DZXA 4DO6A 1BWLA 3PS7A 3NNTA 1G4EA 3TJLA 4HSNA 4R34A 2ZRXA 3ABOA 4RXGA 4GUGA 4O10A 3SGUA 1HG3A 2YFOA 1XC4A 3GXTA 4DF0A 3W7KA 4XBSA 1H62A 3W1PA 1GYLA 5KZEA 1XL9A 3H53A 1TSIA 2YR1A 4MKNA 5D2YA 2WNNA 4IJBA 4CCCA 3CU2A 5CZSA 4NJKA 3N2MA 2GQ9A 3W85A 1XUUA 3FJLA 2NLIA 4KFNA 5AYXA 4CQAA 3LXCA 5AHIA 2VFGA 3W2JA 3TFCA 4BWLA 2Q8ZA 3DZ1A 2Y62A 4NJIA 2OMAA 3PB2A 3LLFA 3W87A 2QCCA 1EX5A 3DGRA 2V2CA 4UFIA 3RLVA 4CNNA 4UTUA 3A9IA 3HG4A 3MUXA 1KFJA 1EP1A 1OF6A 3QEZA 3W7MA 3GDLA 5HUOA 2CLLA 2GPTA 2E5DA 1WV2A 4YLWA 5CPNA 4RLIA 3P5ZA 3WJWA 1JRBA 4JTFA 2I1OA 3GYEA 3NQEA 3A24A 3TQKA 1VH7A 3CPRA 3CC1A 1ZENA 1SO3A 2ISVA 1PV8A 1KM4A 3S1UA 2EKCA 1LBMA 4PCFA 4OU1A 5C6MA 1J5TA 3NA8A 3G8EA 4MY1A 2A21A 1F6KA 3HB9A 2TYSA 4O13A 3USBA 4LVAA 4KFOA 3TR2A 4GNJA 4GE8A 3NVTA 4JIPA 1FWRA 1AW5A 3HGOA 1TMHA 1W0MA 3QM3A 3BG5A 4OV9A 3R2GA 5G4EA 1LTDA 4I7WA 3WK1A 2BTMA 1G67A 4JTLA 3TC6A 1XBYA 1VYRA 1WOAA 1O5XA 2E5BA 2R91A 1KTNA 3NG3A 4WUIA 4O57A 5DBUA 1LRNA 4GC4A 2Y7DA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1DWF M;  3H2N A;  3VOH A;  4C1N B;  4TVU A;  3SRH A;  4OWG A;  4ZQN A;  2HVO A;  3C2R A;  4F3H A;  1JRC A;  4DRS A;  5F2L A;  4AIU A;  2QII A;  2X1U A;  2XN2 A;  1TFV A;  1LWH A;  2C1H A;  1UH4 A;  1PVN A;  2J7C A;  2IPJ A;  5LNU A;  2C3Z A;  4FNU A;  4DJE D;  1JZ4 A;  4D6I A;  1WDR A;  4JIC A;  2QHA A;  2XII A;  3KVJ A;  1M04 A;  4IX0 A;  3W2U A;  4M3P A;  4REQ B;  2XH2 A;  2GUB A;  3IVT A;  3C3U A;  1R3Q A;  1UQZ A;  3C0S A;  4CCZ A;  4WEV X;  1Q4N X;  3THQ A;  1NFB A;  2QEZ A;  4DYK A;  3KOX A;  3VOC A;  2NVD A;  3SGZ A;  4DM2 A;  1M5W A;  1M6J A;  4GI8 A;  3W53 A;  3EB4 A;  3CAV A;  1H7O A;  3DYP A;  3SCN A;  5BNK A;  3UGV A;  4HOX A;  3PTD A;  1HNY A;  4GLE A;  4P8U A;  3EPO A;  3BMX A;  5I3G A;  1PPI A;  1GPF A;  3TLQ A;  4CN6 A;  3KHJ A;  1WNO A;  1RJR A;  3BZG A;  4MKS A;  3POH A;  5G4H C;  1PUD A;  4L80 A;  3GDK A;  4ZEP A;  1E6X M;  1XIC A;  3BCF A;  4CN1 A;  9RUB A;  1EJT C;  1U2Y A;  1VCF A;  1YXY A;  1RPX A;  2PTD A;  4U2Z A;  4WY0 F;  2I9U A;  3E3H A;  1VIZ A;  2VEN A;  2XYL A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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