1K8ZA

Crystal structure of the tryptophan synthase beta-ser178pro mutant complexed with n-[1h-indol-3-yl-acetyl]glycine acid
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
268
structure length
257
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSALPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
publication title Crystal structure of the beta Ser178--> Pro mutant of tryptophan synthase. A "knock-out" allosteric enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
total genus 98
structure length 257
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2001-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1k8zA00
1R47A 5CZTA 2ZRVA 3E9AA 3S5OA 1TCDA 5TIMA 5BRBA 3F03K 3PM6A 4HHPA 3WJSA 4O13A 4ALDA 3M7WA 1H61A 5HJLA 2O7QA 3CLMA 4A21A 3UWUA 2ZZ2A 3LTSA 1HTIA 2Y85A 3PBVA 3TJLA 3F4WA 2PRLA 1TO3A 2FB2A 1THFD 3TXZA 3M47A 2WO5A 2BTMA 3LDVA 4HPXA 1KM2A 3G0UA 4O1DA 4QQ3A 3TMQA 5KZDA 4U4MA 3NQCA 4DQWA 4UTIA 1FWTA 4IX0A 1S5VA 2DJXA 5I3FA 4WXYA 3SGUA 1NVMA 2BZNA 3M5XA 4JTJA 4ZQNA 2ZZ5A 2UV8G 4JNMA 5HULA 3NQFA 2X1RA 4GUIA 4MLJA 1OFBA 2HMCA 5K9CA 5DLCA 4LWWA 5C2XA 4BK9A 5J5RA 3EX1A 2YCEA 1OFQA 2ZBTA 3TC7A 3M5VA 1W3IA 5H2ZA 3TAOA 5DBUA 3QEZA 3L0NA 3QQ1A 1UUOA 2I9EA 4FXSA 1A53A 4O0ZA 3NVTA 4A2SA 2GQ9A 3L0GA 3FJ6A 4HIBA 2QKFA 1HFBA 2V2DA 4EVZA 1ONRA 4M5PA 2DZPA 4CNOA 1BWLA 2NWRA 3HPZA 4CCDA 3GAYA 3BVJA 3EX3A 3ATZA 4NUWA 5FF4A 4IPJA 3O15A 5CZJA 2E1DA 3MI6A 3P82A 1JUEA 4K8EA 3DBPA 3TH6A 4XKYA 3BK0A 3R8RA 3OVPA 1Z44A 2QCNA 1CI1A 1DOSA 2P0OA 3GAKA 3OEXA 3TFCA 1RQEA 4YLWA 3B0VC 3GYEA 2Y62A 2B7OA 4MVAA 3EX2A 3TFXA 3UY7A 1VYPX 1G4PA 2ZCGA 1DORA 4N02A 3GKFA 1H5YA 3TW6A 1QR7A 3W2NA 1JRBA 1TMHA 4KWVA 1YDOA 2A6LA 4M6QA 4CNPA 1OK6A 4JTFA 3EEGA 3HF3A 5HWJA 1W54A 1R2TA 5D2XA 1PCWA 1A5BA 5H91A 3TSBA 3QH2A 5AC6A 1GQNA 1XCFA 4ZQPA 4MJMA 3ZR4A 3LOTA 4RKAA 4FF7A 2Z0IA 4QISA 1ZAHA 1EEPA 3MMTA 4X2RA 4XKYB 3ABRA 1X1OA 1ALDA 1SFLA 3FYOA 2NUYA 3KHJA 4OU1A 4LOCA 3TE9A 1JUBA 5LZLA 3EXRA 4NXKA 4MIMA 2FJKA 4MLRA 1G69A 3M1ZA 2A6NA 5AFDA 4UTWA 1FCQA 5AHIA 4UFJA 3VNDA 1IIGA 3CEUA 3P84A 3STGA 1TPB1 1HO1A 2GQAA 2NV1A 4Y9AA 3G0SA 1JCYA 1XXXA 2JGYA 4OV4A 5FF2A 1OHLA 4MFEA 4ZZ9A 1W3NA 4NJJA 3E49A 3S42A 2G5WA 4O12A 4O1BA 4UFLA 3W22A 3UWWA 1KM5A 3DFOA 5HUOA 3VE7A 3BPWA 2DZUA 3MP3A 1GVQA 3W7OA 1KFEA 1N8FA 4LTSA 3B06A 1M5WA 1PE1A 4JTLA 1YXCA 2H3DA 2VFIA 3BG9A 4WOQA 3CEPA 3EWWA 3B8DA 3UWZA 4M19A 3UZ5A 5D33A 5G4EA 4CQAA 3W7JA 3P60A 1XDMA 4K7VA 1G4EA 1EPXA 1MEWA 1L6YA 1XDLA 2NX3A 4JTGA 4JTKA 1B9BA 3NL5A 3QC3A 3LCHA 2FPYA 3C2RA 2NUWA 1Z42A 4LVGA 5K7JA 5DY3A 4QSHA 3GNDA 2J88A 2NZLA 1KTBA 3BG3A 2V9DA 1R2SA 3L68A 4IMDA 4O1CA 3IEBA 2TRSA 3LBCA 3CHVA 3O63A 3PC0A 2Z6IA 1NF7A 3O07A 5CKSA 1OFDA 3O6CA 3LV6A 3VKJA 4L4MA 4NJGA 4XUGA 2EKCA 2W0UA 3B4UA 2V2HA 5K9DA 1JCXA 3SI9A 1I2OA 2CLLA 3TK7A 1O94A 3W07A 4YWIA 3WJXA 1J4EA 4PL2A 1YDNA 1QNVA 5F4XA 5LNUA 1KFBA 5F2MA 1EB3A 2P10A 4MJZA 3M9YA 4O19A 1XUZA 4Q4KA 4NZJA 3W1NA 3G22A 3FJLA 5E1QA 2B7QA 2FPVA 3NDOA 3PR2A 3W76A 4Q33A 1YTDA 3LHUA 1DBTA 4LV9A 3QMSA 2QDHA 1M7OA 5D37A 2NXHA 4TMBA 4FX6M 3JR2A 1TB3A 4YCPA 3NQVA 1OX5A 2ZDRA 1R30A 4CQ9A 5C6MA 5MHBA 1B3OA 2DP3A 1Q6OA 2VFFA 4BF9A 1LROA 1GVSA 3W7LA 1D9EA 5FEXA 1IF2A 4FO4A 3NXFA 3WK2A 1I2NA 1BWKA 3LGEA 3PUDA 4CLMA 2ZA2A 3EX4A 4Q32A 1S3HA 4LVBA 5LNRA 2VEKA 2VXNA 3L5AA 2H3BA 1YLVA 3PUEA 1VCGA 1JQXA 1LRQA 4OWGA 1T99A 4UTHA 1X1ZA 2A0NA 4H6KA 4JX5A 2OT1A 3H53A 3WJZA 1TSIA 3HJZA 1VCVA 2J24A 4PL1A 1TV5A 4O17A 4Z1BA 2XN2A 4E2DA 4M7TA 3GXPA 3IIVA 2LLEA 4PEKA 2NUXA 5DXYA 5LGZA 4EF8A 5K4ZA 3O16A 1AK5A 2W6RA 2YYTA 3KVLA 3SJ3A 1SZNA 4WY0A 3UYCA 4O50A 1XL9A 3UWQA 4M6VA 3GIYA 3MW7A 4EF9A 4HT3A 2CU0A 4QAIA 2EPHA 1KLYA 3QQ0A 3P61A 1PS9A 3P62A 3P81A 4RK8A 5HWMA 1ME7A 1GVRA 3EWYA 1PV8A 4TX9A 1KBJA 3N9RA 3E12A 3OA3A 1OFPA 1MXSA 3TKFA 4JTEA 1OK4A 4PTNA 4K6AA 4ZQOA 3W87A 8TIMA 2GVGA 2QCCA 4ICNA 2WV8A 4UMBA 3EWZA 1F73A 4HNTA 1H7NA 3THQA 1YPIA 4HNNA 4ADSA 4O10A 1MSSA 1VYSX 1PVNA 1G4TA 1Q6LA 4O14A 3C8FA 3G1YA 3LTYA 2ISVA 4WY0B 4ZQCA 4PH6A 1YDVA 5CPMA 2DJLA 4LVFA 3W88A 4XBSA 4JR5A 2RDWA 3C2EA 4O0KA 1LZOA 1W3TA 3U6WA 1L2UA 4XZ9A 4J9JA 3LHVA 4JS3A 3FEMA 5LHEA 2YX0A 1XUUA 2A7PA 4AWSA 5C5YA 1KM1A 4UIOA 1TPUA 4XQ6A 1Q45A 2Y6ZA 4GC4A 4DEFA 3GNNA 1D3GA 5DY2A 3NQ2A 5D38A 3N73A 1LBLA 1FDZA 2VFGA 1PCKA 1G7UA 4X22A 4YXGA 3W7KA 2V30A 3CIXA 1TRDA 1J2WA 3W1TA 3STEA 4ORMA 4RXFA 5F2LA 5CGQA 3IVSA 3S8HA 5FF0A 3GDMA 2FLIA 4O57A 3G3DA 1WXJA 3NL2A 3E96A 4O4WA 4N9DA 2V2CA 1KFJA 1W37A 1AL7A 2Q3OA 5DBTA 5KSWA 2H8ZA 3UPBA 4H3DA 3WJWA 3E02A 3KVKA 5DELA 2E6FA 3CC1A 3GXTA 2E68A 3HIJA 3GXNA 1L6SA 1L9WA 3SGZA 1O5XA 4P2VA 4KKXA 5EL1A 2QJIA 4FNTA 2AAMA 2ZA3A 3U8GA 3BW2A 2E09A 3AJXA 3CU2A 2H90A 1HG3A 2E6DA 4FNUA 1K3UA 1QOQA 1NF0A 3HG4A 3N3MA 1VRDA 4BI7A 3O05A 3I7RA 2Q8ZA 4DO5A 1QO2A 2Y7DA 4Y96A 3M16A 5K4XA 1KM0A 2VOMA 2YFNA 3KVJA 2NXGA 5EA9A 4CCEA 3QSRA 3UD6A 2DZWA 2Z6JA 5LNSA 2BX7A 1K8XA 3F4NA 2QCEA 3IGXA 3P80A 4ADUA 3W6YA 3TQKA 4JYFA 1SW3A 5AYZA 1VR6A 3QZEA 4UTKA 1FQ0A 3QF0A 1N7KA 1TPFA 4BR1A 4NNCA 3ZWTA 4X3ZA 3L21A 4DPQA 4N4QA 1TTPA 3NQGA 4UFKA 2WPBA 3QM3A 2J6XA 3DFPA 3NYZA 2WQPA 3BGJA 1HUVA 1H1YA 2A5HA 1AG1O 3W1MA 1SFJA 1H50A 3NQMA 4GFSA 5TQLA 2QCDA 4GJ1A 2ZFAA 1KFLA 4RZ6A 2B7PA 5KINA 2WOQA 3BO9A 4JX4A 2DZVA 1ZNNA 2FB3A 2ATMA 4KFPA 2OJPA 4O53A 3IVUA 4JY8A 4UMCA 1B4EA 2QCGA 4LUIA 5CSSA 4UNLA 3S5YA 2C19A 2ZRUA 1X6UA 1OVDA 3JRKA 1SUXA 4JD4A 1CW2A 1G7VA 5IBXC 1J5TA 1DVJA 2A2IA 2Y7GA 5C55A 1IXOA 2ZZ6A 3CWNA 1HL2A 4FNRA 2X2GA 3QPZA 4UTLA 1O5KA 4MY9A 5ABTA 2Q8LA 1DL3A 1KM6A 3NQDA 4AXKA 1X8FA 3KXQA 4OT7A 2C1HA 3LBMA 3ATYA 1VLIA 1VPXA 2HSAA 1YADA 2CZ5A 2ZRXA 5U7SA 3W3OA 3W2LA 2WSYA 4AF0A 2GQ8A 1GZGA 2RDUA 2ISWA 3SZ8A 1H7XA 1K7EA 1WV2A 3ELFA 1QPQA 3DFQA 1TJRA 4LU0A 1H63A 2YFOA 1L6WA 5J5DA 5FEWA 1Y0EA 1N55A 3C56A 4DELA 4NNBA 4A3UA 4LV4A 5KTLA 1LBFA 3STFA 3M41A 3DGRA 5AHEA 2DZSA 3W7DA 1KBIA 3LHTA 1QDSA 3T78A 3W7PA 4I7WA 2EAWA 2ZTKA 5I3KA 3PF3A 4O4VA 4QNWA 4XBKA 4FX7A 3WK0A 3TSMA 5DN1A 1QCWA 4MZ1A 2HTMA 4OHQA 2WNQA 5FF3A 1M7PA 1TPEA 4DF1A 1OX4A 1EWEA 1WOBA 3DHFA 3HGOA 3L65A 4LT9A 3LCGA 4RV8A 4MOZA 4HKPA 2A7NA 3PB0A 3U2OA 1H51A 2IQTA 3LCIA 2QCHA 1V7YA 3L2IA 3NO5A 1ML1A 4L4LA 2PRHA 3TCEA 4Z1AA 1OYAA 4QM1A 1P0KA 2A21A 3DXIA 2E6YA 1JRCA 3S1VA 3CM4A 1ZCOA 1MEIA 1LM1A 4K39A 3M0ZA 2P1FA 3DHDA 2ISSA 2WNZA 4OE7A 1TPH1 1I2PA 3G1HA 4MKNA 4XWUA 2HS8A 3TXVA 1EP3A 4KWWA 3PBYA 4LC6A 4R53A 3FOKA 1IXNA 1VC4A 3VFLA 3CIWA 1T96A 3L5MA 5IM51 3MP5A 1EX5A 3CTLA 1F5ZA 1OG0A 5G5IA 5T26A 4FB7A 1F76A 3IGSA 1DKWA 2QUUA 3MWAA 4KFNA 4QIUA 3P5YA 4NNAA 3T55A 1TV7A 3FKKA 3UNDA 4I7VA 3W7RA 1H62A 4N6FA 3FKRA 3A24A 2CLHA 4LNYA 3S0CA 3TW7A 1UASA 4Z1DA 3G8EA 2CLEA 3GVGA 3W1PA 1QPNA 1FCUA 2O7SA 2C16A 1H1ZA 3YPIA 3W72A 1ZAJA 1FCBA 1DHPA 1U5JA 1IIHA 5HR7A 1FX6A 2OX1A 4POCA 3P67A 3TX9A 5C54A 2E5BA 4UNKA 4YMZA 3HGRA 4JXCA 2OZ0A 1TV8A 1QFEA 2VEIA 5AHLA 5BMWA 2A7RA 3TA6A 2TPSA 4N6EA 1TPVA 3MHGA 5HMSA 4I7UA 1I45A 4NX5A 4ZVJA 1F6KA 2VC6A 3C0JA 3GK0A 4AWUA 1BTMA 5D2WA 2VFHA 2ZA1A 1RV8A 4C1LA 1LDCA 4FXRA 1KTNA 3TMLA 5CPLA 3L9CA 2DU2A 1H7OA 1KM4A 5GVJA 3FA5A 4RX0A 3UQNA 5G1TA 4O15A 4G1KA 3W84A 1K02A 4K36A 1FCVA 4AHQA 4UFMA 3UXDA 4IQLA 4HN4A 5AOUA 2XN1A 5LNWA 3G8RA 4EOUA 3NQ7A 4A22A 5G4WA 1SW0A 4FX8A 4NZFA 2A4AA 4UR7A 1SO5A 3Q2DA 1FWNA 1KV8A 5HUPA 4M6PA 4AEOA 2X30A 2QAFA 3W83A 3W9ZA 3EWUA 5D32A 2DZXA 4D2JA 1M6JA 1YXYA 2I1OA 3KAOA 3BW4A 3O06A 1Q3NA 4W9TA 2X1UA 3G0XA 3LCFA 4LUJA 1K03A 3PG9A 3S9YA 4WZHA 5KITA 1SO3A 3N14A 4UTTC 4XTIA 4DO6A 1RQBA 1C29A 3NZRA 1SZFA 2HS6A 3VCRA 4EWND 3NQAA 1H7RA 3G1AA 3KRSA 3STCA 4RXGA 3UY8A 1O60A 4FNQA 5EBUA 3GDRA 1LOQA 3LM7A 4XTDA 4IMFA 4MY8A 2CFFA 5D30A 5AHNA 3I7SA 3P5ZA 3PS7A 5AN7A 2GJLA 2CLFA 2D73A 3O6YX 3CQ0A 1P4CA 1PL9A 3G1VA 3GR7A 3PVFA 3DAQA 3W75A 5I3IA 4UC5A 3HO8A 3W2UA 3NM3A 5D09A 3CWOX 1VLWA 4Y8FA 4DF2A 2Y89A 1PIIA 1GG1A 4CNNA 1XC4A 2PCQA 1F2JA 3I68A 1VH7A 5EPDA 4ZQRA 2JKEA 1W0MA 4O54A 5G2HA 3RNDA 1LBMA 4RZ4A 3TR2A 5IBXA 1FDJA 3S5ZA 4O52A 2VEMA 5DCBA 3W1XA 4UTUA 5EKYA 3LXAA 4I9AA 1WA3A 5DCEA 5L6UA 3NR0A 2FQIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1R47 A;  1EIB A;  3U7B A;  4LPC A;  1S1R A;  4O13 A;  1DPM A;  3R1Z A;  3DG3 A;  2PSN A;  1E1C A;  4ILS A;  1HTI A;  1JPK A;  1VEP A;  3TJL A;  2HPI A;  1UC5 A;  3DC0 A;  4D72 A;  2FB2 A;  1IZK A;  1THF D;  4QXI A;  2BTM A;  2EPM X;  5CC3 A;  1KM2 A;  3PFR A;  4O1D A;  1HJV A;  3NTY A;  3BXW A;  4U4M A;  3NQC A;  5LIK X;  4UTI A;  1UZ1 A;  1FWT A;  3IS4 A;  2WZE A;  5FA5 A;  3AS3 A;  3M5X A;  2VRQ A;  4WSH A;  1O68 A;  4JNM A;  5A94 A;  4Q8V A;  4R5E A;  3WX7 A;  3NQF A;  4PMQ A;  4GIR A;  2X1R A;  2V67 A;  5K9C A;  2AL1 A;  4YVP A;  5ABE A;  3ITT A;  5J5R A;  2DIE A;  3TWA A;  3CZL A;  3GC5 A;  3M5V A;  1QNQ A;  1E1C B;  2W5F A;  5DBU A;  1XR2 A;  1UUO A;  2BOG X;  2VJX A;  3KL5 A;  2V2D A;  1PX8 A;  3GW0 A;  3GAY A;  4V2X A;  5FAJ A;  3KRB A;  5FF4 A;  2E1D A;  3P82 A;  4KW2 A;  4K8E A;  3BE7 A;  4Z42 C;  3OLD A;  3TH6 A;  1CGT A;  1Z44 A;  4WSK A;  1CI1 A;  3OEX A;  3HQO A;  3TFC A;  1RQE A;  4YLW A;  2Y62 A;  4KER A;  1BYB A;  4MVA A;  1DED A;  5LA1 A;  1XLL A;  2ZCG A;  1DOR A;  4I3G A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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