1KFBA

Crystal structure of alphat183v mutant of tryptophan synthase from salmonella typhimurium with indole glycerol phosphate
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
268
structure length
255
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
publication title On the Role of alphaTHR183 in the Allosteric Regulation and Catalytic Mechanism of Tryptophan Synthase
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
total genus 98
structure length 255
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2001-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1kfbA00
1JCMP 3G24A 1NF0A 4A2SA 4NZFA 1GYLA 2DU2A 3LM7A 2V0TA 3C2RA 3OG3A 4UTKA 2VFEA 4NJJA 1K8XA 3A5VA 1SPQA 3NM3A 3SECA 4KFNA 3ZWSA 3WJWA 3WK1A 4Y8FA 3ATYA 3R12A 4QNWA 1X8FA 5HWJA 5EA9A 1PIIA 2ZTKA 3S9YA 1W5MA 5F4XA 3QSRA 1JRBA 2XFWA 4HNTA 4JYDA 1VZWA 3HJZA 3DGRA 1FY6A 2ZBTA 1EWEA 3PB0A 1TTQA 2PRHA 1AL8A 1HG3A 3EWXA 4GBUA 3W74A 1FXPA 3P60A 3FKKA 2JGQA 4FX7A 4JXCA 4O53A 3CM4A 5BRBA 1GT8A 3TXZA 4QISA 2R8WA 4DELA 4BWLC 3W1RA 3RMJA 3S0CA 5AHLA 3G8EA 3LCFA 3SI9A 5FEWA 4JDYA 4FNQA 2FDSA 3NPXA 1OK6A 1WDWA 4ADSA 5D37A 2JGYA 1XDMA 3ABSA 1M6JA 4NXSA 3LERA 1KLYA 4JTSA 1QFEA 3TUUA 1TPUA 4AB4A 1JVNA 4C1KA 1G6CA 1VC4A 4J9JA 3FKRA 1TREA 2QCFA 3W7PA 3H55A 1QWGA 4E2DA 3CU2A 4WJEA 1RPXA 2GJNA 1FUYA 2E6AA 3GAKA 1OFPA 5DCDA 1JCLA 2C1HA 4DPPA 1KA9F 5EPDA 3RNDA 2TMDA 5DLCA 3CT7A 1ME9A 5GVJA 2OMAA 3M1ZA 5BMXA 3RLVA 1ZJIA 1K8ZA 1Q6OA 3DFOA 3IGUA 3F4WA 2EHHA 1SR9A 2ZTJA 3A9IA 4RR4A 2BLEA 5I3JA 3K30A 3L65A 4NNBA 1DORA 3A22A 4LV4A 2XN2A 5D2VA 3WJSA 4MJZA 2QDHA 1LROA 2B4GA 3CIWA 1R2RA 1UJPA 4Q32A 3SGUA 4GUGA 1CI1A 4CLMA 4LS2A 5TBOA 1TV7A 3W7GA 4Z0SA 1J2WA 1WOAA 4QAIA 1TTJA 4ZQMA 3HG4A 1D3HA 2QJHA 4UTWA 1EA0A 4OWGA 1F6PA 4D2JA 2YYUA 2WQPA 4X3ZA 3CPRA 3RLUA 4JX4A 5LNVA 1MZHA 5EL1A 1VLIA 1SSGA 4OQVA 3MBFA 3LXCA 3H54A 4GNJA 1V7YA 3LCXA 4AVFA 1WV2A 3NZRA 4QSHA 3GDTA 5I3HA 2ZZ7A 3C2FA 3O15A 1GQNA 4JD4A 2V8ZA 5D02A 3U6WA 1OHLA 1XKYA 4HPXA 1TQJA 3TROA 5C5YA 3ABOA 1W37A 1KBIA 4JN6A 5AYXA 2Y85A 4A29A 3W7HA 3RU6A 3PS7A 3BGJA 4WD0A 4WOQA 1H5YA 4NNCA 2ISVA 5AN7A 4HT3A 3STCA 2X16A 1KFBA 5BOOA 5HULA 2YR1A 3KAOA 3MWAA 5TQLA 3E02A 3SW6A 5LZLA 3NQMA 1SW3A 2YW3A 4I7WA 3PR2A 1BTMA 4MPQA 1HL2A 4DBEA 3CQ0A 1TPEA 2DJLA 5FESA 5K9CA 4UIOA 5K4ZA 2G5WA 2NXIA 4ZQNA 4DF1A 3LDVA 3G0XA 4XTDA 3NDOA 1ML1A 3MHUA 2FLIA 4OBTA 4PH6A 1TPB1 3UY7A 1KBJA 2QCLA 2B0MA 4UXDA 3IEBA 2QCMA 1HUVA 2CLFA 5K9DA 5LKYA 1XFBA 1LDCA 3O8AA 4C1LA 3TV8A 1KFLA 3W71A 1Y0EA 3CTLA 1T96A 1KM1A 3PY2A 3DFNA 4FHAA 2TSYA 1DJNA 3LRLA 3M5VA 3NGJA 4JTHA 3W1XA 1TB3A 3MO7A 2R94A 3T4CA 3HG5A 1SFLA 4M6QA 1YADA 5F1VA 5AFDA 4TIMA 1DV7A 4WXZA 3HGJA 1H7PA 2Q3OA 5LHFA 1OX4A 2ZRVA 4JDBA 3UWZA 3BW2A 3KRSA 2QJIA 3B0PA 3UY8A 1WX0A 4XWUA 2V2DA 2NV2A 1CW2A 1H63A 2YGYA 4FNUA 4FB7A 4N4PA 3NQVA 1O60A 5AOUA 1H7RA 3FFSA 5E0KA 1O5XA 3LV6A 4HHPA 1Q45A 4IUOA 4FNPA 5D2YA 1IXNA 2OT1A 3G22A 2WSQA 3EXSA 1W1ZA 2ZCGA 3FOKA 2CZFA 3LCGA 1FCUA 2JBMA 3KVMA 1LP6A 4UR7A 2JKAA 4K6AA 2E6YA 4AF0A 4AWSA 5KZDA 3HO8A 4NQ1A 4KKXA 3L21A 2TPSA 3UXAA 3T7VA 1OABA 4XTIA 4N9BA 4RXGA 4WY0A 3EX6A 3NVTA 2A85A 4GUJA 1BEUA 1QO5A 3THQA 6ALDA 3ZWTA 2CLIA 2QUVA 2OT0A 2YPIA 2QF7A 2VC6A 2GQ9A 1DQXA 1HTIA 3S5ZA 1U83A 3TK7A 1W5OA 2FJKA 3CHVA 5SWUA 2OJPA 1K7EA 4AHQA 4AMAA 2Y63A 1P0KA 4YXGA 5HWMA 1NSJA 1YPFA 1WOBA 3W87A 1F7BA 1TTPA 2ATMA 5FF3A 3GYEA 1A5SA 3FA5A 1QPOA 5H91A 2ZRYA 1QMLA 4AWTA 4EF9A 5AHNA 1FX6A 2AAMA 4O28A 4IMCA 5CZ0A 5L9FA 1DVJA 3LCIA 4LY8A 4QJ1A 4ZQRA 2AQWA 3DAQA 4GWEA 1R30A 1H60A 4RV8A 3PSVA 5HUOA 4O14A 2BWGA 3W1UA 4PL1A 2Y88A 1GJPA 3TSBA 5U7SA 3KVKA 4OGZA 5DCBA 4MY9A 1GEQA 2WSRA 4FEZA 3DI1A 3LGEA 3TMQA 5LGZA 2F7FA 3GDMA 1GG1A 1TV8A 1JQXA 2BXVA 4NJHA 2WPBA 4KWVA 3W7NA 2X1TA 2BSLA 2ZZ5A 1IXPA 1I2OA 4S1FA 1KM2A 1KFEA 2WNQA 4LOCA 2WV8A 4QM1A 4DQWA 4G1KA 3NPUA 5HQEA 3IIOA 3M7WA 3NL2A 3LRKA 3NYZA 2DZWA 3TH6A 2Z0IA 4NUWA 3CEUA 1SW7A 3UZJA 2V30A 4ZQOA 3N3MA 3G1XA 2C14A 1JR1A 3P81A 1KFKA 4UTJA 3HPXA 1SSDA 1MEIA 1MEHA 3I6RA 4KFOA 4DO5A 1IXOA 4NZJA 1R2TA 1VYRA 1SUXA 2PURA 3C52A 3EX3A 1LYXA 1ZHAA 1AW5A 1P0NA 3LTYA 3QW3A 1FXQA 2ZZ3A 2ZQ0A 2NX1A 2V5BA 5K7JA 5KSWA 3ELFA 4HPJA 4FXSA 4PEKA 2WO5A 4QNEA 2FPTA 3W2KA 3LTPA 3MW7A 3MP3A 3ABRA 5FF0A 1ZALA 3E0IA 2ABAA 1P1XA 2DZVA 3USBA 5D2TA 4K7VA 4M7TA 3MP5A 1DHPA 2QCDA 4DO6A 4K36A 3DI0A 4LU0A 4UTTC 4NT0A 2RDUA 4PCFA 3MHGA 5F4WA 5KMYA 3LOTA 3PVFA 5D2XA 2E6DA 3LV5A 3W83A 2WSYA 3UPWA 4O13A 3FLUA 2VFHA 5G5IA 1KTCA 4ONVA 1BKSA 3GDKA 3SSJA 2V81A 3EWBX 4MVAA 4FIRA 1UUMA 4JX6A 5KZMA 1SZFA 3W7KA 3QMSA 3HBLA 1X1OA 2P0OA 1LLWA 4IGHA 8TIMA 1EPXA 2QCCA 2J9YA 1MO0A 1OYBA 1YXDA 4UFMA 1R47A 3E49A 3FYOA 4HKPA 4I7VA 4K7YA 2W79A 3NL6A 3EWYA 3M5YA 4MZ1A 4JTEA 1LOLA 3F4NA 3W1AA 3QMRA 3UWYA 3G8RA 1A5BA 1I2NA 3C0JA 2JKPA 3B06A 1G4SA 1JCJA 2CFFA 4BF9A 3NZ1A 1T99A 1LRNA 4N02A 5FF4A 4FF7A 2ZRZA 3L2IA 2FPVA 2V9DA 2A0NA 3PB2A 2VEMA 4N6EA 5A5WA 5HJLA 4JTUA 1SO4A 3BLFA 3EX4A 1QOPA 1Q6RA 4S2BA 4ZQCA 3T44A 3NOEA 5KTLA 1UBSA 1YTEA 2A21A 4FX8A 3NL3A 4N9CA 1EWDA 1VHCA 3SY5A 2QUTA 5EBUA 4N2YA 4UTTA 2TRSA 2Z2UA 1CX9A 4O50A 1A53A 3PG9A 1TO3A 4BI7A 2P10A 3MI2A 1H62A 5LNWA 1JRCA 4XUGA 3C56A 1A5CA 4WX2A 2RDTA 2J9XA 3IVTA 1S3HA 1GVOA 2C18A 1F05A 2ZA1A 3LX9A 2V2HA 3W22A 5DELA 1B4KA 2B7PA 4HSOA 4PC8A 3SGZA 3L9CA 4CQ8A 1VCGA 4JNMA 3EKZA 3C2OA 2I9EA 2C19A 4HN4A 5AYZA 2ZDRA 3CEPA 3PSWA 2A4AA 2R91A 4O1DA 5ABTA 3SIZA 1LOSA 3VE9A 1RV8A 3L67A 1OJXA 4QQ3A 3N9SA 4NX5A 4RKAA 3QC3A 1W5PA 3NQ2A 1S5VA 4UC5A 5FEXA 2Z6IA 3S42A 3PULA 4K8EA 4ADTA 1AW1A 1PE1A 1JQVA 1KV8A 3PWAA 2CLHA 1N55A 3P67A 3FIGA 4DXVA 4UTHA 3WK3A 1W31A 4JICA 3LHVA 4JTKA 1LOQA 1K8YA 2IQTA 2G95A 4Q4KA 1I4NA 1L2UA 1HFBA 4ICNA 3WK2A 4M19A 1EB3A 3C8FA 2C0AA 2H3BA 1RD5A 1XBZA 5AHEA 4JTGA 4PL2A 5CSRA 2LLEA 3VCRA 5LNSA 4S2CA 1YXYA 3LCHA 1KTBA 4LUIA 2NWSA 3M41A 5G4EA 4TMCA 4XBSA 1V5XA 1LTDA 4IPJA 4O16A 3NXFA 1W0MA 2C3ZA 1WBHA 1EP1A 1Z41A 3QM3A 1TRIA 3R89A 3NQDA 3TCEA 3UWUA 1UUOA 1WYIA 3LHTA 4DF0A 4UNLA 1OG0A 4AHOA 1GOXA 4MLRA 4DEFA 5G2IA 3A24A 3PUOA 1TV5A 4X22A 2FPYA 4JY9A 1DKWA 1QAPA 3BG9A 1GTEA 3S5OA 3FJ6A 3BG5A 1SU5A 3UWQA 4IX0A 5DY3A 3DH7A 1A50A 3LXAA 1QPQA 2C16A 4JYFA 2W0UA 3INPA 4N9EA 4LW7A 3MYOA 4U4MA 2GUUA 1KM3A 4BWLA 1W54A 4H3DA 4WUIA 2QAFA 1VRDA 1AW2A 5HINA 1LBMA 3GR7A 4K37A 1T8XA 4IMDA 5LGXA 1OFBA 3W7OA 3EWWA 4MY8A 3R13A 4O1BA 2CU0A 1H1ZA 4E2BA 1W3TA 3VI2A 1SO3A 1FCBA 3S5YA 5K3VA 5D32A 1QR7A 3B4UA 1C8VA 1TJPA 4WQ6A 5CPLA 3V75A 1M5WA 4IWWA 5C54A 4Z1AA 3SJ3A 3N73A 1M7PA 3P61A 1ICQA 3PBVA 3NQ8A 4ADUA 4LNYA 1L6YA 3DXIA 3NQAA 4HNNA 1RZMA 2XN1A 3W7IA 2RH9A 3W7QA 3WK0A 5D33A 1W56A 2JKEA 3T78A 3O16A 1RVGA 3HPZA 3NEVA 3PC0A 2YX0A 1KM0A 3QEZA 2NZLA 5DY2A 4HSNA 2RKXA 2FFCA 3TDFA 1TCDA 1JCXA 3UPBA 1PHQA 3HF3A 1YPIA 4QIUA 1QCWA 3GAYA 3WJYA 3TQ0A 4OE7A 2H8ZA 3N34A 1RQEA 2Z1BA 4UMAA 1QO2A 1LCOA 4MOZA 1JULA 2CZDA 1E51A 3DZ1A 3B05A 5EKYA 5FEZA 1I2QA 5MHBA 5AYYA 1OFDA 3PG8A 2CLEA 1SZEA 1XUUA 3OVRA 3P84A 2ZZ2A 1L9WA 3TR2A 4ZVJA 4ALDA 1B9BA 2QCEA 3F1QA 1OFOA 1EUNA 3GLCA 4O19A 5T26A 3M6YA 1EIXA 1XI3A 4QITA 3PBUA 4BI6A 4TX9A 5CPOA 3TMLA 5D09A 2CZEA 1XBVA 2I14A 1PVNA 2QAPA 3P62A 1O94A 1W3IA 4LC8A 4OV9A 1X6UA 2A5HA 3QQ1A 1GWJA 1SO5A 1SO6A 3MMTA 3HGRA 1KM6A 1W5QA 3BW3A 3BVJA 2NUWA 3W85A 4FNSA 1Z44A 1OFRA 3DBPA 4UFHA 5K9XA 4LVFA 4JIQA 3S1XA 4HNVA 1TRDA 3IIXA 4MZ8A 3DHFA 2HMCA 2JK2A 1DBTA 2FB3A 4O17A 3L0NA 1TPH1 2A1YA 4JTJA 4LWWA 3NM1A 5J5DA 1TPFA 4WZHA 1F74A 4M5PA 3W1NA 4ZZ9A 1KV5A 5K4XA 1H7XA 4O8RA 3KVLA 4O11A 1OX5A 1VR6A 4A3UA 3W75A 2X1RA 1FWRA 3LBCA 5H2ZA 4LC6A 3GVGA 3LBMA 3QJAA 3W3OA 2CLKA 1OK4A 3U8GA 3W2JA 4MKNA 4N6FA 4GE8A 3LLDA 2X2GA 2RFGA 1BWLA 3LXBA 3BO9A 3W7RA 3O63A 5HWNA 4WOZA 1TSIA 3HGOA 3EWZA 4EVZA 2FIQA 3UXDA 3W9ZA 2NXHA 2ZZ6A 1QOQA 3EXTA 3NPWA 4Y6GA 2VKZG 1GZGA 1MEWA 1ME8A 3W2NA 4LVDA 4AAJA 3M9YA 2ATSA 1W8SA 1Q3NA 5CPMA 1OYAA 3P80A 3TAOA 4IQLA 3C4UA 5DBTA 3B04A 1ONRA 3O1NA 3EXRA 2C15A 1FWWA 2BX7A 1AL7A 2VEIA 3NNTA 3G18A 2NV1A 4Z1BA 1P4CA 2VFIA 3EX1A 4PTNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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