1KFEA

Crystal structure of alphat183v mutant of tryptophan synthase from salmonella typhimurium with l-ser bound to the beta site
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
268
structure length
252
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLAIIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title On the Role of AlphaTHR183 in the Allosteric Regulation and Catalytic Mechanism of Tryptophan Synthase
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
total genus 96
structure length 252
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2001-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1kfeA00
4R7JA 3SGUA 3LLFA 1OK6A 2AAMA 1H7OA 2YGYA 3W2LA 4LS0A 1F05A 2WKJA 1THFD 1OFOA 1TQXA 3PB2A 4E38A 5HQEA 3CEPA 2CFFA 3P74A 4JN6A 1OJXA 4O54A 2FDSA 5BMWA 2Q8LA 1WDWA 2ZZ5A 1VS1A 1LCOA 1FWSA 3LOTA 4AHQA 3C0JA 2A0NA 1OX4B 1UBSA 4Z0SA 3CM4A 4WD0A 1JUBA 3P7YA 3GDKA 4TMBA 3C2VA 3L67A 1YYAA 3I7RA 3FKKA 3TU9A 2QUUA 2NXGA 3CC1A 3U6WA 4GJ1A 2O7SA 1JCYA 3DU0A 3GXNA 1OX6A 4WX2A 3TW6A 2FQIA 1XBYA 1GZGA 5F4SA 3UD6A 1FXPA 2PURA 4L4LA 1TYGA 1OX4A 1W56A 3HO8A 3VCRA 3S1WA 5C2XA 1AG1O 3T7VA 4GNJA 3SY5A 2Y7GA 3MWAA 3MHFA 5DY2A 1K8ZA 4XWUA 1QOPA 5D2WA 2HS6A 3FA5A 5BMXA 3BV4A 3SGZA 1H61A 1MSSA 3G22A 3NAVA 4FXRA 1UB3A 4FNQA 1SU5A 3W72A 1C9DA 3RMJA 3FJ6A 2VFDA 1OFRA 1I4NA 4CCEA 1TTJA 4JTIA 4OHQA 3D0CA 3BO9A 1NEYA 2QCFA 2ISVA 3PF3A 4M19A 1IXPA 4AH7A 4GUFA 3L9CA 4UIOA 1OABA 4CCDA 1G4TA 3C4UA 3V1PA 1W54A 4GC4A 4WOZA 3NGJA 4P61A 4FX6M 1ICPA 1RQEA 1GEQA 4IWWA 1MEWA 3L66A 4WXZA 1N55A 2QCNA 4WY0B 2WJZA 3U2OA 2CLOA 3A5FA 4ZQRA 4J9JA 3WJZA 3JR2A 1N7KA 1XDLA 3Q2DA 3O07A 4IX0A 4O14A 5FEWA 4O10A 3DAQA 1K03A 2GUUA 3CTLA 5AHFA 1RV8A 1KV5A 1GVFA 4LC6A 1W31A 3GB6A 4WY0A 3BARA 3LTPA 4Z1DA 4UFJA 4UTJA 1R2SA 2Z6JA 2Y85A 1FWRA 2Q3RA 3SSJA 1TPH1 4DBDA 1A5SA 1PS9A 4GBUA 4OGZA 3C52A 4MOZA 4Q4KA 3W70A 1QNVA 3CLMA 5J5RA 3KFTA 3L0KA 3GR7A 1VCVA 3P5YA 1R2RA 4R34A 1DJQA 3M5VA 3WJWA 2GVLA 3W22A 5CSSA 4O11A 1D3HA 3NQVA 5H2ZA 2UV8G 2A5HA 4ZL1A 4JX5A 2B7PA 1TJRA 3FLUA 3LM7A 4JYFA 4O50A 4EF8A 3NQAA 5AFDA 3O06A 5EYWA 3LDVA 1KFBA 5C55A 2GQAA 3A21A 5KTLA 3STGA 1SZFA 1FUYA 4R53A 2C14A 2YW4A 4N6EA 4OBTA 5DCBA 3MW7A 3HPSA 4HPJA 5FF3A 3BW2A 5DXXA 4UFIA 3N2MA 3BLEA 3I7QA 4NZJA 2QCGA 2ZA1A 5LNSA 2Q3OA 3DENA 4UTTA 1K8YA 4YCOA 3OVPA 3E02A 3MBDA 4Y6GA 1GG1A 1F6PA 1SFJA 1FDZA 4KFNA 3Q58A 1Z44A 1TPVA 2FB2A 3T4CA 1K02A 2J9ZA 2WNZA 3PBUA 3PBYA 4XUGA 2E68A 3FYOA 3W1LA 5DLCA 4JX6A 4AHPA 4NX0A 3TA6A 4PL1A 5BW6A 3S9YA 4HNTA 1KLZA 2E6FA 4BF9A 2YYUA 4N2YA 2Y88A 4O1CA 3W2JA 1H1YA 3UY7A 1F2JA 2Z0IA 2NZLA 3MP4A 3HMJG 1X7FA 1TPB1 1OX5A 4L4MA 4N9BA 1VLIA 1DJNA 1I45A 4JIQA 1KFEA 4ZQOA 3TAKA 3EEGA 4GUHA 1KM2A 4CNOA 3DZ1A 2YPIA 1CX9A 3QQ0A 4JTJA 4RXFA 3WK3A 2CZFA 2DJLA 1KTBA 4ADSA 4HKPA 3HG5A 1JCNA 4JDYA 4NXKA 1FDYA 2WSYA 3P60A 1JQVA 2XN2A 4BR1A 4I9AA 4O16A 3EWBX 2FPTA 4DQWA 1PHQA 1SO5A 4UFHA 1YPIA 3R12A 3DFOA 3PWAA 1RR2A 3TMQA 5DELA 2TSYA 3G0UA 1ZAHA 4YMZA 5D2VA 1QO2A 2NWRA 5D05A 5G2IA 3U8GA 1KA9F 3N3MA 2ATMA 3EXRA 1XC4A 3TIMA 2QJIA 4AWSA 1HO4A 3DFQA 3EX3A 4MLJA 1C8VA 4BK9A 4N9DA 2LLEA 5C54A 5LHFA 5LGZA 3WK1A 1J5TA 3LERA 2ZZ2A 1EIXA 3OIXA 3PSVA 2V2HA 5GVJA 3DFTA 5LNVA 4UTTC 2TMDA 2Y70A 5LNRA 3WFAA 3PG9A 1LOQA 1WOAA 3NG3A 3V75A 1W1ZA 3L2IA 2J6XA 1L2UA 3NYZA 2JKEA 4NUWA 4DPPA 5G1TA 4ZVJA 4PC8A 3LV5A 5CZJA 3W7OA 2CLFA 4O4VA 3RF9A 3N73A 2YXGA 2JGQA 3B0UX 5G2HA 3WJSA 1JUEA 5AN7A 4M7TA 5G4WA 2VEKA 4ZMGA 4WXYA 3W7PA 4HSOA 3O15A 5BOOA 5KZEA 2B7NA 5E0KA 1YTEA 4IMGA 3HPXA 2JKAA 3UWVA 4FB7A 4Z0JA 5D33A 2ZZ3A 4UTKA 4RZ5A 4E0CA 3GXPA 3NL3A 2QCEA 1KM3A 1Z42A 4Y8FA 5DCEA 3DHFA 1VCGA 4QIUA 3NL2A 4A21A 5D02A 4A2RA 4D2JA 1X8FA 3HGRA 2Y61A 1C29A 4RLIA 3TXZA 3PG8A 1YDNA 5FF0A 3LRLA 3GKAA 5TBOA 3IIVA 4M5PA 3DI1A 4UCGA 5LHEA 1I2NA 1XDMA 1XI3A 1HFBA 1OYAA 2EGZA 3SJ3A 4A3UA 1UUOA 2VELA 2X1SA 5FI8A 4ICNA 3W85A 4I7WA 2OZ0A 3G3DA 4DEFA 1WBHA 2NXHA 3C56A 5U7SA 3W7NA 2Y63A 4KWVA 3LCGA 5F2GA 2QCDB 1XBZA 4O0ZA 4BI5A 2V5LA 2P0OA 3MYOA 1AW2A 2V2DA 2Z1BA 2X16A 4LOCA 3S8HA 4IGHA 1EP3A 1NAL1 5CZ0A 2QUTA 1NVMA 1O4UA 1LZOA 3SZ8A 1H63A 2QCDA 4A22A 1UUMA 4UTLA 3MP5A 4DXVA 5H91A 4LS2A 3O1NA 3BVJA 3PULA 3QMSA 2DORA 3C3NA 5FEPA 3HB9A 4KKXA 5IBXC 5CG7A 3UWWA 3BLIA 2WNNA 3GXTA 2QAPA 1KTCA 4RX0A 2ZRZA 5I3IA 3W73A 3FYPA 3THAA 2E5BA 2WV8A 2NX1A 2RH9A 3RK8A 4MPQA 2C13A 3EB2A 1MEIA 4XTIA 4FX8A 2G96A 5K9DA 3PUOA 1G7UA 3LHUA 4O1AA 4JICA 4P2VA 5CKSA 4QJ1A 3S5ZA 2H6RA 3STFA 3IIXA 3E9AA 2PRMA 4O17A 5K2ZA 3GAKA 1GVOA 3WK0A 1H5YA 4O53A 4NT0A 1TTQA 1TV5A 1AK5A 3ATYA 4K37A 4TIMA 5FF7A 3QMRA 5EKYA 3W88A 4I7UA 1CW2A 2OT0A 3OBKA 3GDTA 4UMAA 1KM1A 3W7CA 1TIMA 4K7VA 1A5BA 2CW6A 2DZPA 5K9XA 4EVZA 4Z1BA 4Y96A 3NR0A 5AHIA 3W2KA 4O1BA 4QSHA 4ML9A 1FCQA 5FESA 3HG3A 1K7XA 4MY9A 3ZWSA 2ZRYA 5K4ZA 1XUZA 3LTYA 1ZNNA 3W71A 3SFKA 3G1YA 2DP3A 1OFEA 4WOQA 4XBKA 1XKYA 3HG4A 4AHOA 1JRCA 1V5XA 3DHDA 1IIHA 5KMYA 3F4WA 2Q8ZA 3I6RA 4JTSA 2V8ZA 3DXIA 2E1DA 1ZJIA 4DF0A 1RZMA 1FWWA 1LRNA 3PR2A 4MY8A 2WOQA 1KFCA 3LXCA 3S1XA 4YCPA 1EA0A 3LHZA 4HNUA 1YXDA 1EUNA 3EWWA 4CQAA 3M16A 5D2XA 3A9IA 3EXSA 1YPFA 1YTDA 4K8EA 3STEA 2JKPA 3UY8A 2GPTA 2A7PA 3QQ1A 4MLRA 2ZTKA 1SW7A 4IUOA 4BFAA 3TW7A 2GVGA 4FXSA 2ZRWA 4JTHA 2V82A 2QCCA 4OWGA 5I3GA 4IOTA 5EMUA 1LRTA 4BWLC 1KV8A 3DBPA 1AMKA 3O63A 1S3HA 2CU0A 3AJXA 3W1NA 1XCFA 1DV7A 1RQHA 1DOSA 3KAOA 5EY5A 3UZJA 3LCFA 5L9FA 3UPWA 3M1ZA 5A8GA 4UTUA 2CLKA 1VYSX 3EX4A 1KBJA 1ADOA 4YXGA 3RNDA 5DCDA 2NLIA 2R8WA 2V9DA 2PRLA 3ZS4A 1ONRA 1QPOA 2PC4A 3IIZA 3KHJA 1KM4A 4ZQMA 4LT9A 4OV9A 5HINA 3EXTA 2G95A 2E77A 4QNEA 1PCKA 3ANYA 4PODA 3P61A 4G1KA 4ALDA 4CLMA 5C5YA 3R13A 4JTFA 1S5TA 1J4EA 1ZFJA 5EA9A 3NZ1A 2CLHA 3R2GA 3QSRA 4LUIA 3IVSA 5HULA 4JIPA 5DY3A 4QM1A 4RZ6A 2E5DA 3GX9A 1JQXA 4JXCA 4RCXA 4XZ9A 3LBMA 3O8AA 4NXSA 3OEXA 5AC6A 1XFBA 3DGRA 3UWYA 4OV4A 3TSDA 1M5WA 2ZCGA 4K36A 1P5BA 3QFEA 4JTGA 3TAOA 3KVLA 3NQ8A 3TK7A 1KLYA 4U28A 3QF0A 1U5JA 3DFNA 4NX5A 4UR7A 5ABTA 2EAWA 5CPLA 2B7QA 3EWXA 3DFPA 1I8JA 4Q32A 1OYBA 1TB3A 4NJIA 5E1QA 4O28A 1SUXA 1DBTA 3QZEA 3BPWA 2GQ9A 4O8RA 3LLDA 3R8RA 3T78A 4UFLA 1JCJA 5FEXA 1OFBA 2YSWA 4LW7A 4OU1A 3EX2A 4DO5A 3PM6A 1H7PA 2ZRUA 1OVDA 1G69A 1EP1A 3GIYA 1TJPA 1UCWA 4PCFA 4DF2A 3G1DA 4LV9A 4HHPA 3ZWTA 2VKZG 1TPDA 5K9CA 1EUAA 1TRDA 3C61A 4O57A 2QCHA 4HSNA 2GJLA 1YDOA 4CQ9A 4N9EA 4DPQA 4GUJA 1QPRA 1KFKA 2VFHA 4MIMA 3H54A 4JR5A 3LCLA 2YW3A 3G8RA 3JS3A 4FEZA 3NQDA 4H4IA 4PH6A 2CZ5A 4S2CA 5LKYA 2QR6A 4Y9AA 4GRSA 4RZ4A 4NNBA 1H7RA 3ABRA 1BWLA 4FIQA 3W9ZA 1EB3A 3P62A 1EP2A 2QF7A 2A7NA 3S5OA 1VHCA 2RDWA 2FPYA 3IVTA 1SW3A 3S42A 3C2OA 4ADUA 3NQCA 5I3JA 2XFWA 5TIMA 4PA8A 5HWJA 1W5QA 2ZRVA 4TU1A 4UFKA 1SSDA 3EX1A 1GPWA 1EX5A 1Q6QA 1M7OA 4IPJA 2BWGA 1W5OA 1JR1A 4KWWA 2Y89A 5HJLA 1R47A 2BLEA 3QRHA 3HPZA 3LRKA 3G3MA 3I7SA 4ONVA 4RKAA 2V5BA 3IGXA 3MJYA 4GWEA 4C1KA 1O5XA 1QCWA 2ZYFA 4LRSA 3WK2A 1WXJA 1KM0A 1TPUA 4OQVA 4YL2A 5HWMA 2WSRA 4U4MA 2RFGA 3TSBA 4O18A 5LZLA 3OHIA 2VEIA 3THQA 4LVFA 3S0CA 1VLWA 4QISA 3O16A 1J2WA 1FWNA 3GNNA 2JBMA 3W86A 2YZRA 3KX6A 5HWNA 3W74A 2A21A 3NOEA 5A5WA 1SZEA 5K4XA 1AL8A 2WNQA 4YWIA 4NZFA 1Y0EA 3A23A 1I2PA 2Y7EA 4K39A 2ZBTA 4MJMA 4IQLA 1VZWA 1XM3A 2ZRXA 3LHYA 3GVGA 3OA3A 4FO4A 4NJKA 5IM51 4PFMA 4IMEA 2E6YA 5F2IA 3C2EA 3N2XA 3W1RA 2ALDA 3O6DA 2IQTA 4AF0B 5LNWA 4H3DA 2BXVA 1P0NA 3W7JA 2YR1A 3LCWA 4JDBA 4IMDA 2V2CA 3CU2A 4R33A 1FWTA 4UNLA 2BZNA 2QJHA 3TQ0A 1VGAA 1QAPA 4LNYA 2E6AA 3L0GA 3HIJA 1O60A 4O0KA 2VFGA 1QFEA 5BRBA 4IXHA 2H3DA 3TXVA 3I65A 1LOLA 1L6WA 4AF0A 4HT3A 4ORMA 4DELA 2GQ8A 1MZHA 1XXXA 3FEMA 4RJEA 1TRIA 3ZFHA 5K7JA 1JUKA 4GXMA 1G7VA 3M44A 4XTDA 3LI0A 2RDTA 5EBUA 3LX9A 3TFCA 1SW0A 4JX4A 1G4PA 1BKSA 4DBEA 4CCCA 4UTWC 5AB3A 2BX7A 2QUVA 3LI1A 1YDVA 2A4AA 3FKRA 4MFEA 1TO3A 5KSWA 1DVJA 1ZAIA 3IVUA 3M7WA 3P5ZA 3M41A 2QDGA 2VXNA 3B4UA 2X1RA 3FJLA 5IBXA 3TJLA 1QPQA 2H8ZA 3RU6A 4JTUA 1MEHA 5I3FA 3KRUA 3PSWA 3NDOA 4JTKA 1LYXA 2ZA3A 4JEQA 2ZDRA 5AYZA 2NUWA 1FQ0A 3CT7A 3LB0A 4EIVA 3DFSA 3NPXA 1JCMP 1LOSA 3F03K 5D38A 2X1TA 3VNDA 4N4PA 8TIMA 4NQ1A 1FXQA 4LV4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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