1KM2A

Crystal structure of orotidine monophosphate mutant q185a with 6-azaump
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
211
structure length
211
Chain Sequence
MNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAAGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Mapping the active site-ligand interactions of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase by crystallography.
pubmed doi rcsb
molecule keywords OROTIDINE 5'-PHOSPHATE DECARBOXYLASE
molecule tags Lyase
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 83
structure length 211
sequence length 211
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2001-12-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1km2A00
2ZCGA 1SW0A 3ABSA 1V7YA 4GE8A 4BI5A 2WKJA 1A53A 3PC0A 1ONRA 4X3ZA 3GKAA 3L67A 3TMQA 2TMDA 1AG1O 1O94A 4RXGA 3S8HA 4Z0JA 1N55A 1TRDA 3RF9A 1TPEA 1T96A 2NUWA 2QCLA 3STCA 3KXQA 2GJLA 4TO8A 2H3DA 4UFLA 3P81A 2P0OA 4A29A 3SZ8A 4RKAA 4A2SA 1F76A 3SECA 3TQKA 5K2ZA 5KINA 1SO5A 1KA9F 1SU5A 5LNSA 3BW3A 5HUPA 3MHFA 1GG1A 3EX4A 2OJPA 1KTBA 1XM3A 1LDCA 1W1ZA 2TPSA 2CZDA 4JTLA 1QAPA 5TQLA 5FF4A 3PBWA 4DO5A 4JIPA 4C1LA 3W1UA 3S5NA 1HFBA 3C0JA 5IM51 1JCNA 1OX6A 1JCMP 5D03A 4BK9A 2G5WA 3PBYA 2WSRA 3G1FA 3TFXA 2JK2A 3FJLA 2QCEA 3C2EA 4Y6GA 5DY2A 1IIHA 5DY3A 2QCGA 4QNWA 1H7OA 3TE9A 4CNNA 4LVGA 3BLFA 2PRMA 1OX4A 2YYTA 4QIUA 3NPUA 2O7QA 4J9JA 3PS7A 3USBA 2V8ZA 3U2OA 3LCIA 1GVQA 3MW7A 4RK8A 1OFDA 3UPBA 3DBPA 2Z6IA 3LCGA 2CLIA 4GRSA 3BG3A 1O60A 1GTHA 2ZRZA 3QC3A 2CU0A 1P5BA 2J6XA 2RDUA 1HTIA 4P61A 1J5TA 4K37A 3DKLA 4O57A 5I3GA 1B3OA 3W2JA 3CM4A 3NR0A 1KV8A 2YDAA 1K8XA 1EA0A 3MI3A 4CQAA 4UR7A 4QQ3A 3QM3A 3TW7A 5BW6A 1ME8A 3N9RA 1DJQA 3HGSA 3QYQA 1ZY9A 4X2RA 5BRBA 4R34A 1I8JA 1OFBA 2JGQA 1C29A 5G2HA 3DFOA 3E96A 3TSBA 1Z48A 2NXHA 3GVGA 3Q2DA 3W2KA 5F4XA 5C55A 3O6YX 1SPQA 5AYYA 1QDSA 3NL6A 1XI3A 5DXXA 4OQVA 3TQVA 1QOPA 1W5QA 1O4UA 4JTFA 1ZALA 2RFGA 3ANYA 4O17A 5KZDA 5CZTA 2QAFA 4ALDA 4M7TA 1HUVA 1ZJIA 3GK0A 2WJZA 2WSQA 3M7WA 3DFPA 5MHBA 1IF2A 5AYZA 1LRTA 3HPXA 2E5CA 4A21A 3TU9A 3ZR4A 3DAQA 5CGQA 1TPC1 3CHVA 2R94A 3IIOA 3LHWA 1PL9A 4IOTA 4DBDA 5LHEA 1SZEA 2ZA3A 4TMCA 4K7YA 5FF2A 3TC7A 2VEPA 3FEMA 2V5LA 3A5VA 3VFLA 3P80A 1L9WA 1W5MA 4FNQA 4DF1A 1WOBA 5G4EA 3R8RA 4DO4A 5D2XA 4HNUA 4XQ6A 5DCBA 1Y0EA 3QPYA 3GKFA 2IQTA 2QUTA 3M6YA 1WBJA 2VFIA 1YPFA 3KRUA 4XZ9A 1LROA 4E2BA 1VYPX 1XKYA 5FI8A 3NL3A 2FDSA 1EP1A 5AHLA 2FQIA 3W88A 3T55A 2I1OA 2C1HA 3W23A 3N9SA 1F2JA 3CIWA 4ORIA 1OABA 1UB3A 1YTEA 1SUXA 5KITA 1L6WA 4N02A 4O8RA 2YX0A 4FB7A 3W2MA 1QO2A 2ZYFA 2NX3A 3EB2A 4IQLA 1KFJA 1SZGA 3ZFHA 4JX4A 4XBSA 5FEXA 2GVJA 3QMTA 4MY9A 4AF0A 4ADUA 2VEIA 3NYZA 1K03A 4JIQA 2ZA2A 4AAJA 1AK5A 2Y62A 3R12A 2HSAA 1Z41A 3G1SA 4O12A 2PRHA 4IX2A 3CWNA 3LRLA 4MLJA 4NNCA 2ZZ1A 2ABBA 2B7NA 5J5DA 3N34A 1JUEA 4N9EA 5KZEA 4UTUA 1EIXA 3O07A 3N73A 1G69A 4WY0F 2C15A 3QW4B 4JGDA 3F4WA 1KLYA 3S0CA 3AJXA 4UFKA 3QRHA 3TUUA 4O18A 2PE4A 5F2LA 1I2OA 1F73A 1KFEA 2VFEA 2CFFA 3SI9A 1KFLA 2JGYA 4TR9A 1TTIA 2FLIA 4PFMA 4ZQMA 5EL1A 5F2MA 5BOOA 3W7QA 4N6EA 5AHIA 5HQEA 4NXKA 3LLFA 4AEOA 2PCQA 2XN1A 3UWZA 4FNTA 4AHPA 2YPIA 3GDMA 3HPSA 4XKYB 1G67A 1EP3A 1VQTA 5D33A 3TJLA 4UIOA 1P4CA 4QNEA 2H3BA 2OMAA 3UD6A 2FB3A 2B4GA 4NNBA 3FIGA 2Y7FA 3S1WA 3QQ0A 4ZQOA 3NQCA 1TPB1 4K36A 4O19A 3O16A 4GJ1A 3C4UA 1F6PA 2CW6A 1UUOA 3DHFA 3UWYA 2PC4A 1KLZA 3WK1A 1M6JA 2VFFA 3JR2A 4FHAA 1TPDA 1SSDA 3LXBA 1G4SA 4Y9AA 3EWYA 2VOMA 3RLUA 1H1ZA 3HMJG 4AVFA 1VHCA 3C2VA 2G95A 2CLLA 4MYXA 2Y7EA 3W86A 1BWLA 2QR6A 5KSWA 1F5ZA 3O06A 3G0SA 4FNSA 1S3HA 1H62A 1VH7A 2DZPA 3NZRA 3DI1A 3QPZA 3M5ZA 3S5YA 3TK7A 1TTJA 3LV6A 2JKAA 2VEKA 3A5FA 3PY2A 4X9SA 5G1YA 3MP4A 1V5XA 4H3DA 5AHNA 5AC6A 4LC6A 1S5TA 1K8ZA 2NZLA 4JDBA 3P8JA 3TIMA 4UTMA 2ZTKA 1OX5A 3M47A 4FIRA 1GTEA 2BWGA 1FUYA 3F4NA 1XBXA 5KZMA 2GQAA 4CCDA 1VRDA 4QAIA 2QEZA 4PEKA 3P62A 5LKYA 3M1ZA 1MO0A 4GWEA 2RDWA 2Z0IA 3L68A 1OX4B 3W1MA 2R14A 2GJNA 6TIMA 2J27A 2VXNA 3EXSA 3SFKA 5HNRA 1ML1A 3M5YA 4JTEA 5KMYA 4I9AA 3V75A 1ICPA 2VC6A 4IMGA 1I2RA 1FXQA 5D38A 4HT3A 1F7BA 3FOKA 1FCVA 2G97A 3E49A 2E77A 4I7VA 2QDHA 2FPYA 1ADOA 1I45A 1NEYA 7TIMA 1XBZA 4O0ZA 1K7XA 3NA8A 2P1FA 3MHGA 3B04A 1W0MA 1H7NA 2B7OA 3MI6A 2F7FA 5F1UA 1EB3A 3CT7A 1J2WA 5E93A 4ZQRA 3C61A 4RZ6A 4LW7A 2FFCA 4UTHA 3KVKA 4UFJA 2C18A 4H6KA 4RX0A 2F84A 3W75A 4JICA 5I3KA 4IX0A 5LNUA 2NV1A 3NQVA 3LHVA 4ZVJA 3BLIA 2C13A 2QCDB 3W2NA 4LS0A 3ABRA 3MYOA 4UR8A 3R13A 4Y8FA 1F6KA 2YW3A 1JQVA 5FF7A 4LC8A 3W1LA 2Y6ZA 4JY8A 3PR2A 1KM0A 1OF6A 2DORA 1LRQA 3VKJA 2H6RA 3GIYA 2W79A 3LGEA 4NJJA 2QUUA 2C3ZA 2NV2A 3W7RA 3HG5A 4UTJA 3B0UX 3G1XA 1M7OA 4A22A 3W2LA 3MBFA 1XC4A 3BG9A 2RHGA 3BARA 4LOCA 4N9BA 4Z1CA 1OYBA 1FDZA 4PTNA 2JKEA 4RCXA 3NM1A 4KWWA 1Q45A 4WOZA 1KM1A 3W1AA 3W7DA 4FX7A 3MP5A 1W3NA 3UYCA 3NQGA 3W7CA 3C8FA 3L2IA 1YTKA 4JTJA 4BWLA 2NWRA 3W7JA 1ME9A 5AFDA 2E6AA 1BKSA 4M6VA 5D2YA 3ATZA 4I7WA 3LHTA 3HBLA 4UTKA 1GZGA 1ZAIA 1D3HA 1KM6A 4L4LA 2E6YA 4R53A 1BEUA 1TO3A 4NZFA 3GAYA 2PURA 3IRDA 3EX2A 4N9DA 5CSRA 3TV8A 3HIJA 3KHJA 3T78A 4DQWA 3PWAA 5EKYA 4PC8A 3GDLA 3C2OA 1I4NA 1DOSA 4JD4A 4U28A 3PM6A 2DP3A 5F2IA 4EVZA 3BGGA 2C14A 2CZ5A 1QPOA 4Q32A 4ZMGA 1VLIA 1H7XA 2V2DA 3OEXA 5H91A 3L0GA 4ONVA 4JTTA 2AAMA 4BI6A 1EEPA 2QCNA 1MSSA 3YPIA 3W7NA 3UWWA 1KBJA 3B0PA 1TMHA 1TREA 1OFPA 5G5IA 4AF0B 2OCZA 1TPWA 3HQ1A 3EEGA 3TSDA 1GJPA 2FJKA 1RVGA 1TPFA 2Y7GA 3BG5A 2OT1A 4O50A 3RMJA 1FCBA 1VGAA 3W73A 2ZBTA 1LOLA 1TTPA 1MEWA 4JDYA 1YPIA 5TIMA 4LY8A 3KX6A 1PHQA 1H51A 2FPVA 2NUYA 4OT7A 3NPVA 2R91A 3G1YA 1NSJA 4BWLC 3GAKA 4RV8A 3GX9A 4POCA 3L5LA 4FIQA 1QNVA 1OK4A 2B7QA 2GQ8A 5I3JA 4AHOA 1GYNA 3TSMA 2Z2UA 3DFSA 1VCFA 3EKZA 3EKLA 4B5NA 4YLWA 3FFSA 3VE9A 4Y90A 3GR7A 3QF0A 3Q94A 3O6DA 1KFKA 2B7PA 1MEHA 4K8HA 4O4WA 2BXVA 2QDGA 3L5AA 1WXJA 5D30A 3PBUA 2G96A 4ZQCA 2YYUA 6ALDA 2ISSA 1QO5A 3GDTA 3M0ZA 1ALDA 3NZ1A 1WYIA 4IPIA 3P61A 5E1QA 3WJZA 1Q6LA 2DZWA 4NXSA 3RFAA 4MFEA 4LVFA 4PL1A 1VC4A 2V2HA 1AL7A 1Q3NA 4HSNA 4RR4A 3DKJA 3W76A 3N14A 1YDVA 1A5CA 2YGYA 4JX5A 1IXNA 4MJZA 5I3HA 1SR9A 4TMBA 5D2TA 3KRZA 3RNDA 2GPTA 1RPXA 1XBYA 4LUJA 3LOTA 3TQ0A 5K4ZA 1OYAA 3TXVA 4ML9A 4Z1AA 4JTGA 3S9YA 3FKKA 3W1TA 4RZ4A 2J9XA 3N2XA 4S2BA 1EPXA 2A7RA 4FX8A 5U7SA 3LCLA 5BNKA 1CI1A 5F2GA 1X1OA 3GR8A 5CPNA 4JN6A 3LI1A 4QSHA 4GC4A 1O5KA 4KFNA 2Y61A 4QITA 3H54A 1I2NA 1RQHA 5AOUA 4A2RA 4AHQA 4OBTA 4O1DA 3E02A 3MUXA 5DCEA 2WQPA 4ZQNA 4RXFA 1A50A 5DCDA 2RH9A 1JRCA 5D37A 2DZUA 1L6SA 3MBDA 1W5OA 2QCDA 3KVMA 3OVRA 4GUJA 2E09A 3HG4A 2D73A 3IVUA 1CW2A 2I9EA 3MP3A 5LNRA 1YLVA 3TFCA 5DBUA 3JS3A 4UNKA 1OVDA 2FTPA 3BV4A 1I2PA 5HUOA 3W1RA 3CU2A 3HPZA 2Q3RA 2ISVA 2JKPA 2H8XA 1OG0A 2AQWA 1W3IA 3L9CA 3WJXA 3S42A 2A1YA 5T26A 5K4XA 1WV2A 2V5BA 2X1RA 1XDLA 1U5JA 4O28A 4HSOA 4LS2A 3W74A 1VS1A 5CSSA 1X8FA 4LNYA 1PVNA 3IIXA 3C2FA 5D2WA 2E68A 1OF8A 2V81A 5SWUA 4MLRA 1K8YA 3KOFA 1AW1A 3I6RA 3LTSA 2CLFA 2ALDA 4MVAA 5FEPA 3PUDA 3NO5A 1OK6A 3PSWA 2Q3OA 2CLHA 2W6RA 3W7OA 3BGJA 1WA3A 1R46A 1SFJA 3G1HA 1TPH1 5EYWA 2YXGA 2CLEA 3STEA 4DO6A 1UJPA 4TX9A 3W1QA 2X30A 3FA5A 1EP2A 4KFPA 1UBSA 1W56A 2H8ZA 2Y70A 3Q58A 3ABQA 4UTIA 2VFGA 3U6WA 3PVFA 2KZHA 3QFEA 4IUOA 1FWNA 1KFCA 3V1PA 4CQ8A 1H50A 2QCCA 3A22A 3M5VA 4JYDA 3GXNA 3W83A 1LZOA 1VR6A 1JRBA 1UUMA 3SJ3A 4WQ6A 3DHDA 3SSJA 3EWZA 4OV4A 4AWTA 1QMLA 1DBTA 3H55A 3NQ2A 4DEFA 4NJIA 1YXYA 2YSWA 1GQNA 3AO0A 2EPHA 1YDOA 2GVGA 1RV8A 1FDYA 3OVPA 3IIZA 1W8SA 2BZNA 5K9XA 1TRIA 3W7GA 1TQXA 4WJEA 1N8FA 4DXVA 1GWJA 1LOQA 1DKWA 3NDOA 3MYPA 1X7FA 3GB6A 3HF3A 3IGUA 4GUGA 3C2RA 1QR7A 4ZQPA 4AMAA 2DU2A 3DFQA 5DLCA 3PSVA 3CEUA 4UMCA 1TPVA 3RU6A 3S1UA 3DZ1A 4ICNA 2YCEA 3WK0A 1WOAA 3LXCA 2QUVA 3U8GA 2ZTJA 2Y63A 2WOQA 1H1YA 3TMLA 3PUOA 1F05A 5KTLA 3GYEA 3HGOA 1TCDA 1NFBA 3NNTA 5LSMA 4JS3A 2QKFA 4NJHA 4LS1A 4PH6A 3E9AA 3C3NA 3ATYA 3HJZA 1KM5A 1E51A 1S5VA 1SO4A 5AB3A 4K39A 1ZHAA 4D2JA 4JTKA 4WY0A 3G0UA 3OVQA 4AXKA 3EWUA 3G0XA 1HO1A 2HTMA 2ZDRA 3W84A 3N2MA 1DQWA 2DJXA 4LRSA 3EWXA 5A5WA 1JJKA 3S5OA 1W37A 1GVOA 2NX9A 3BW4A 3T4CA 1R30A 1FQ0A 3IGXA 3L65A 3HO8A 4HNTA 5K9DA 3ZWTA 1F74A 5G1TA 2GOUA 4MFDA 5EY5A 1W5NA 3HB9A 2WV8A 3BK0A 1WBHA 5HINA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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