1LBFA

Crystal structure of indole-3-glycerol phosphate syntase (igps)with reduced 1-(o-caboxyphenylamino)-1-deoxyribulose 5-phosphate (rcdrp)
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
PRYLKGWLKDVVQLSLRRPSFRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAEYKRKSPSGLDVERDPIEYSKFMERYAVGLSILTEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMKDFIVKESQIDDAYNLGADTVLLIVKILTERELESLLEYARSYGMEPLIEINDENDLDIALRIGARFIGINSRDLETLEINKENQRKLISMIPSNVVKVAESGISERNEIEELRKLGVNAFLIGSSLMRNPEKIKEFIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The catalytic mechanism of indole-3-glycerol phosphate synthase: crystal structures of complexes of the enzyme from Sulfolobus solfataricus with substrate analogue, substrate, and product.
pubmed doi rcsb
molecule keywords INDOLE-3-GLYCEROL PHOSPHATE SYNTHASE
molecule tags Lyase
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 93
structure length 247
sequence length 247
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2002-04-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1lbfA00
3DXIA 3YPIA 2ZRXA 3FYOA 3W72A 3PSVA 1AW5A 3TC7A 3GNDA 2VFHA 2G96A 3IRDA 1EUNA 5CPMA 3P5YA 3ABQA 3N2MA 4OV9A 3QMSA 1A53A 3PG9A 3PBYA 1JRCA 3PBVA 2ZBTA 3N9RA 2ISSA 3HGOA 4N9DA 2P0OA 5D2TA 1D9EA 4X2RA 1G4PA 1RR2A 5D2VA 3EX4A 4NJKA 3Q58A 2RKXA 2J27A 5HULA 1WOBA 1FWWA 4WOZA 4JX5A 4A2RA 3EX3A 4N9CA 4Y90A 4YL2A 1NSJA 3W2KA 1VLIA 3NQGA 1KTBA 4MVAA 2TYSA 3EEGA 3INPA 3PAJA 5G4WA 2Y62A 3OIXA 4Z1BA 3C8FA 1H62A 2NX1A 4P2VA 2CLEA 2ZRYA 3KHJA 1QPOA 3PB0A 3B0UX 2E1DA 3LRKA 2GQ9A 1OYAA 2IQTA 3U6WA 3LRLA 1LOSA 3G22A 3NZRA 4XZ9A 2V0TA 3DKLA 3FFSA 3QMTA 3F03K 2QCEA 1NEYA 5AHMA 1IIHA 1G67A 1DJNA 1KW1A 3LHZA 4GUIA 1W5PA 4FB7A 1XBXA 4BF9A 3WJSA 5IBXC 3P7YA 3S5ZA 4X22A 5FEZA 5CSRA 3W70A 4JX4A 2WNQA 4O54A 5ABTA 1W3NA 2EF9A 2X30A 4XTDA 1D3HA 4JEQA 3NM3A 5HWJA 1G6CA 4HSOA 5A8GA 1EPXA 3QH2A 3DU0A 3TH6A 4GUGA 3W2NA 1YTKA 1FXPA 3A5VA 3S6DA 1TPC1 2ISVA 2QF7A 3TSDA 3VNDA 1R47A 3PM6A 3WJXA 4I7UA 1GVQA 4OT7A 2Y70A 3S8HA 1PV8A 2H90A 3QW4B 3TW6A 1XBZA 5F2MA 4UTMA 1AL8A 4FF7A 4JY9A 3LCFA 1OFAA 3GK0A 4O1AA 4UIOA 3BLIA 5G5IA 3PF3A 1W1ZA 3TV8A 4DELA 3LB0A 1V7YA 1K8XA 4R53A 1UBSA 3ZWSA 1YTEA 4UFIA 1AW2A 4G1KA 1FWTA 2X1UA 3M41A 5AHNA 3NPWA 3GNNA 1KM1A 1QPRA 3V1PA 5LZLA 1C8VA 3NL6A 3S5YA 1SO3A 4RR4A 5CZSA 1FY6A 3UZ5A 1SUXA 3TKFA 2YZRA 4TMCA 3P81A 4UCGA 4JXCA 5DXXA 3EX6A 1KV8A 1SZEA 1SZFA 2P10A 3W1AA 2ZRWA 3NQDA 5LNVA 2NX3A 1ZNNA 3EWZA 4HHPA 4A29A 1TTQA 3W3OA 5K9DA 4LVDA 2H8XA 1OK4A 3EX1A 2FQIA 2YW4A 1RZMA 1OFDA 2OCZA 4UTLA 2W79A 2YFNA 1VJIA 3NR0A 3NM1A 5MHBA 3DAQA 2VFEA 3BW2A 3UY8A 3W7EA 3B05A 5L9FA 3IVSA 5EBUA 4PH6A 3G1FA 2QCFA 3EB2A 1QAPA 3O63A 4UFJA 1ZAIA 3W88A 3NL5A 3WK3A 3EWWA 2NXIA 1Y0EA 1FDJA 5FF4A 3RF9A 2H3BA 2XN0A 1RQBA 5D2XA 3UYCA 1QMLA 4WUIA 4NJHA 2ZA1A 2C19A 4CNOA 2G97A 3A9IA 4U28A 3UWYA 4AWTA 3IGXA 3A24A 1RVGA 1GZGA 1A50A 3W7PA 3MWAA 5HR6A 2AQWA 1SW3A 4OHQA 4QQ3A 5C6MA 3H55A 4A2SA 4B5NA 4LRSA 3W2MA 3BVJA 3F4NA 1BWKA 4IQLA 1E51A 5F4WA 3E49A 4UFMA 5BW6A 2C18A 4GJ1A 4WXYA 4EIVA 4UTWA 1FCUA 1KLYA 1K7XA 5KSWA 4PL1A 4OGZA 2ISWA 3NPVA 4UNLA 3MMTA 1LOQA 1SSGA 5G2IA 2V5BA 3O06A 2J6XA 1KV5A 3TIMA 5E1QA 1GTEA 2ZZ5A 3LCIA 3PUDA 3I7SA 4FNTA 1K8ZA 1BEUA 3GIYA 2DZTA 2E6FA 4YWIA 3UXAA 3M47A 3IVTA 4RKAA 3BG9A 1YTDA 3UWQA 3LTYA 3QEZA 3BGJA 1VPXA 5KTLA 4JGDA 1PCKA 1QPNA 1TPVA 2DZXA 5J5DA 1XCFA 4IJBA 3KOFA 3T4CA 5I3HA 1OFPA 4C1LA 3OG3A 4DF0A 3I68A 1CW2A 2A5HA 3NQMA 2W6RA 4LUIA 4NT0A 2ABAA 1AG1O 4XBKA 3TROA 4IGHA 2DJLA 5LGZA 4LS1A 3I7RA 2HS6A 2RDWA 1M5WA 2PCQA 4JTGA 1TQJA 1TO3A 3QMRA 2GJNA 1Q6LA 1T0OA 3A21A 5HINA 1SZGA 3PUOA 3TSMA 2Z1BA 3TJXA 1F6PA 2QDHA 4WY0A 3W7IA 3SSJA 4ZL1A 2ZTKA 4RZ4A 3MBDA 2FPYA 2FLIA 3NL3A 1H7RA 4HIBA 4FNRA 3NQCA 4JTJA 3IIOA 3EKLA 3NNTA 3PUEA 2RFGA 4MOZA 4JTLA 2TRSA 5F1VA 3OVRA 1C9DA 2GQ8A 3SFKA 3E0IA 4UFLA 3LLFA 3S9YA 2I1OA 3QPZA 2Z6JA 4FX7A 5I3GA 3RK8A 1VGAA 3DFQA 4O12A 2NWRA 5EYWA 3Q94A 3O15A 5D37A 4LOCA 2ATSA 3PC0A 2V81A 4HSNA 1TPB1 3P80A 5DY3A 4H4IA 3Q37A 1ICQA 1DQXA 3ZR4A 4X9SA 5L6UA 1KBJA 4CLMA 2QUTA 4JNMA 1TSIA 3OVPA 2WJZA 3LCWA 1H63A 3WFAA 2V2HA 4E2BA 3ATZA 4E2DA 4UTTA 5DN1A 3F1QA 3PWAA 4UTWC 3TW7A 2OMAA 1TRDA 4IMCA 3THAA 1VC4A 4H3DA 3BPWA 4MLJA 5D2YA 3W2LA 1U5JA 3W1TA 3W7GA 3LRMA 1A5BA 4NU7A 5D03A 4A22A 1ZCOA 1KFCA 3QFEA 1W54A 3N34A 2Y61A 2EGZA 3IIZA 4JTSA 3T40A 4NNAA 3HF3A 5D02A 3STEA 2C0AA 3R5EA 4QITA 3N14A 3O16A 1TV8A 3BW3A 2QCHA 5E93A 2O7QA 1OFQA 3O6YX 1L2UA 5HWNA 1I8JA 1GG1A 4Z0SA 2HS8A 4JTIA 1W37A 4HT3A 3W7RA 4NQ1A 1S3HA 5FI8A 1CX9A 1L6YA 3R13A 4YCOA 3L68A 3C4UA 3LXBA 4CNPA 5LHEA 4K6AA 1LM1A 3P74A 1B4EA 3W83A 4BI5A 1LDCA 4K7YA 3LXAA 2B4GA 2ZCGA 4YLWA 3NXFA 3O05A 3KRZA 3W7QA 3BARA 4IPIA 2Y63A 5EKYA 2V9DA 5EA9A 4HNTA 3S1XA 1X7FA 4CQ9A 3M5VA 1IIGA 3UPWA 3W7JA 3TCEA 4ALDA 3L66A 1M7PA 3LV5A 3VKJA 3R8RA 3C2EA 2NUWA 1RQHA 4BR1A 3IGSA 3CPRA 3TQ0A 1Z41A 3B4UA 3HG4A 4LY8A 4UUIA 1H7NA 5CZ0A 4EOUA 3TQKA 4AHPA 3WK2A 1EUAA 3BLEA 1FWNA 2VFIA 5IM51 2CLLA 1FDYA 3ANYA 4ZQMA 3P61A 4O16A 1ZY9A 4AAJA 3G1SA 1ML1A 1HTIA 3STCA 3HG5A 1QDSA 3G0XA 1MXSA 2JK2A 3LTSA 4LS0A 3E9AA 4OBTA 2YCEA 1YLVA 1GTHA 1TJRA 3P5ZA 1H7OA 3GB6A 2OJPA 2JKEA 3MHFA 1IXNA 1GYNA 4UTTC 2ZRUA 1S5TA 1KFJA 3GXTA 2EHHA 4XQ6A 3C52A 4BI7A 5DY2A 4RZ5A 4GE8A 4UFHA 3TU9A 2QUUA 3H53A 4O0KA 3QSRA 3SR7A 3P60A 2Y88A 2FB2A 3MJYA 3K30A 4LC8A 1G7VA 5HUPA 4UNKA 5KZMA 2BWGA 3HIJA 1GT8A 3C3NA 5AHLA 4Z1AA 3L0GA 3TC6A 3ZWTA 3B0PA 1JQVA 1LROA 1KM4A 2E5BA 1DOSA 4O57A 2JKAA 1EP3A 2VEKA 1QO2A 1WDWA 3HGSA 2DP3A 2QJGA 2ZZ2A 2DJXA 2DU2A 2RH9A 2ZA3A 2QEZA 3B06A 5A5WA 3GKAA 2WOQA 2HTMA 4AEOA 1DV7A 2B7NA 4FIQA 2QCDB 2YR1A 4M7SA 5AYZA 3W7DA 1QCWA 5F2LA 1K03A 4HNNA 1FXQA 5CPOA 1O94A 2R8WA 5HMSA 1H60A 5DCEA 1LYXA 1PVNA 1XBVA 2NX9A 3LHUA 5D38A 3C2RA 3I7QA 1SO6A 1VRDA 3SW6A 3TSBA 1RD5A 3IV3A 4O4WA 2C15A 2CZEA 3B8DA 3I6RA 5E0KA 3TX9A 4WXZA 5DLCA 3GVGA 3EXSA 2VFDA 3W1QA 3O8AA 4UR7A 1OABA 3GXNA 5D32A 2X1SA 4MFDA 3HBLA 4IX0A 1KFEA 4JY8A 2FIQA 5TBOA 1EWDA 3TMQA 2CLFA 4TIMA 1JJKA 1GG0A 3L2IA 3VCRA 5D33A 2VEPA 5BMXA 3LX9A 2B7OA 4XTIA 1O4UA 1KM2A 2CLMA 1LLWA 4TX9A 4MY9A 4LVFA 1XXXA 4WD0A 1UCWA 3RU6A 3STFA 3SGZA 4AHQA 5K4XA 2ZYFA 2BZNA 1Q6OA 4WQ6A 4ADSA 4WY0F 3M1ZA 4LVAA 1TPH1 4KFNA 1F6KA 5I3JA 2QAPA 1SW7A 6ALDA 3DZ1A 4WY0B 3HG2A 2NUXA 2BTMA 1S5VA 1KFKA 2B0MA 1EP1A 1Z48A 4UFKA 4HKPA 3MBFA 1RV8A 5BNKA 1X6UA 3W7NA 4XKYA 4UXDA 1WX0A 2PRHA 2CW6A 2WO5A 4AVFA 1VCGA 4Y9AA 1GWJA 3D0CA 3B04A 4UTUA 1XBYA 2CZDA 3MUXA 3JS3A 3O6DA 3M5YA 8TIMA 3GDMA 1OYCA 3CTLA 2GUUA 5K7JA 4AF0A 1OJXA 1TPWA 1LOLA 2LLEA 2VEIA 5AHFA 3OVQA 3VFLA 3I65A 3GKFA 3QF0A 2J9XA 4DO4A 4DO6A 3UD6A 1L6WA 5BOOA 3ABRA 1ME8A 1LRQA 4RV8A 1F76A 3Q2DA 1Z44A 5DCDA 3GZ3A 2ZZ6A 4Z0JA 3QZEA 4CQAA 3GAKA 1TPDA 3MP3A 4NJJA 1YDNA 5HQEA 1FX6A 3PG8A 3UNDA 1GVSA 3A22A 1HFBA 2Y89A 4N9EA 4I9AA 3E12A 3IIXA 3W7HA 4WJEA 2WQPA 3NZ1A 3NQ6A 2A4AA 1QO5A 4OV4A 3MI3A 2NZLA 1GVRA 4JYEA 3WJWA 3M5ZA 4EF8A 1ADOA 3NO5A 1WOAA 1TTJA 4PTNA 1H1YA 2BXVA 2OT1A 3R89A 3DFOA 2QKFA 3R2GA 2RDUA 2YYUA 3P67A 3QJAA 1ICSA 5AFDA 5I3IA 3VE9A 1FUYA 1VYSX 1ME9A 4LC6A 3NL2A 3W1XA 3A23A 3M5XA 3HPZA 3WK1A 1XKYA 3PBWA 4K37A 5AOUA 3W2UA 4JTUA 4UMAA 1VZWA 4M5PA 1I4NA 5D2WA 3GR7A 4LV9A 1A5SA 2ZRVA 4NJGA 3N73A 3NQVA 3SECA 1TRIA 4FO4A 4LU0A 2XN2A 4O1CA 4I7VA 4MZYA 2B7PA 4PCFA 4RCXA 5F2IA 4HPXA 2E6AA 5AHEA 1DORA 4GBUA 4ZQCA 1Q6QA 5CZJA 3PULA 3G1AA 1ZAJA 3PY2A 3OHIA 4ICNA 3TA6A 4O1BA 5LHFA 1VYRA 2ZQ0A 3DI1A 3RLVA 1R2RA 1GVFA 1KTCA 2Y7FA 2YSWA 3L0KA 2YGYA 4ONVA 4LS2A 1H61A 3EX2A 3U8GA 4LWWA 3DENA 1TYGA 4QNEA 1WBJA 3P84A 5AC7A 3FKRA 2KZHA 3TAKA 3LI0A 3L21A 3NYZA 2YFOA 1G4EA 1TQXA 3B03A 3CLMA 3GR8A 1BTMA 3G1XA 4ML9A 1I2OA 3C56A 4IMEA 2DZVA 4Y8FA 1VS1A 2P1FA 3UY7A 3BGGA 2J9YA 1F73A 5K4ZA 4YXGA 3BLFA 3STGA 2WPBA 4MJMA 1OX5A 3MYOA 1MO0A 3TAOA 1S5WA 4AXKA 1G69A 2ZA2A 3LHVA 3N9SA 5AC6A 3MW7A 3M44A 3UQNA 1WQ5A 3V75A 2NXHA 3FIGA 4K8EA 1IF2A 3P62A 4N4QA 1LRTA 3G0UA 3MI2A 2UV8G 2C6QA 3DBPA 1JQXA 1IGSA 4JS3A 1HL2A 4AWUA 4FHAA 4NXSA 4KWVA 4MLRA 3LXCA 1AW1A 5AN7A 1ONRA 1NFBA 4O50A 5C55A 4O53A 4M6PA 1ZALA 3CIWA 4UTHA 3QQ0A 4ADUA 1R2TA 1XUZA 1HUVA 1W0MA 4FX6M 4NX0A 1W31A 2G95A 3NQAA 5CPNA 5CG7A 4JIQA 2NLIA 2Z6IA 3MHUA 2Y7GA 4DXVA 2Y7DA 1A5CA 2ALDA 2VOMA 1Q3NA 3HQ1A 3NA8A 3NG3A 1H7PA 1HO4A 1VR6A 1LCOA 2PRMA 1ZAHA 1GOXA 1SW0A 2JGYA 4QAIA 1MEWA 4KKXA 1Q45A 3NQEA 4MPQA 4IUOA 3F4WA 4O19A 3LCHA 2DZWA 1SSDA 3H54A 1SU5A 4JTEA 2E77A 2NXGA 4MUZA 1W5NA 3B0VC 3L9CA 4EWND 1SO5A 3IGUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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