1LBL | Genus

Total Genus 96

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	96
sequence length	247
structure length	247
Chain Sequence	PRYLKGWLKDVVQLSLRRPSFRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAEYKRKSPSGLDVERDPIEYSKFMERYAVGLSILTEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMKDFIVKESQIDDAYNLGADTVLLIVKILTERELESLLEYARSYGMEPLIEINDENDLDIALRIGARFIGINSRDLETLEINKENQRKLISMIPSNVVKVAESGISERNEIEELRKLGVNAFLIGSSLMRNPEKIKEFIL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	The catalytic mechanism of indole-3-glycerol phosphate synthase: Crystal structures of complexes of the enzyme from Sulfolobus solfataricus with the substrate analogue, substrate, and product pubmed doi rcsb
molecule keywords	indole-3-glycerol phosphate synthase
molecule tags	Lyase
source organism	Sulfolobus solfataricus
total genus	96
structure length	247
sequence length	247
ec nomenclature	ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date	2002-04-04

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1lblA00

3VCRA 4EIVA 5K7JA 1H7NA 4UFLA 2VFDA 1H7RA 3NQFA 2A6NA 4K6AA 5F2IA 1GWJA 2ZRVA 5K9DA 3THQA 2Y7GA 1TRIA 3DXIA 3LCLA 3HB9A 3O6DA 2P0OA 3PC0A 1F05A 3I7SA 3P82A 4Z0JA 1KFBA 2FB3A 2XFWA 1GZGA 3G8EA 2YZRA 2HS8A 1LM1A 2A85A 3M5XA 4PEKA 1DBTA 2HS6A 1EEPA 4MOZA 4K37A 2QDGA 3KVJA 3G1FA 5D2WA 4N9CA 3B05A 2VFIA 1EA0A 2TSYA 1I2QA 3UD6A 3M5YA 2ZZ7A 4PL1A 4LWWA 2DZVA 4LY8A 1P5BA 1TCDA 3HGRA 1UBSA 3ABRA 1JRBA 3MYOA 1WOBA 5IBXA 3UWYA 1KLZA 1S3HA 1ICSA 3IIXA 1DKWA 5U4NA 3TU9A 4Y90A 4DQWA 2G5WA 4UTWC 1HL2A 3BG9A 4ADSA 4UUIA 3QZEA 3S6DA 1PIIA 1SZEA 3EEGA 3IV3A 4PODA 1A5SA 4JY8A 2BSLA 3KX6A 4JTGA 1I4NA 5HWJA 3HG5A 1OFBA 5IBXC 3SW6A 4MJZA 4IGHA 1OYBA 1JVNA 2FTPA 2YFOA 5KMYA 4ALDA 1NFBA 4IWWA 2GVJA 3O6CA 4MKNA 4IPJA 3E96A 3ABQA 3ABOA 1FX6A 5AN7A 3LI0A 4GUGA 4K7YA 3C4UA 4O17A 4BR1A 2CWNA 3O06A 3G0SA 2B7QA 2W79A 3PUOA 1S5TA 1YDVA 3NO5A 3LLFA 2RFGA 3I6RA 5LGXA 3MMTA 2ZZ5A 3CLMA 3N3MA 2QUVA 3DKLA 4RXFA 4CQ9A 5FF3A 4BK9A 4G1KA 2GQAA 3SY5A 5HINA 1F6KA 2V5LA 4NQ1A 4YMZA 3P67A 5GVJA 3FLUA 4K8HA 3P74A 5AHLA 3W71A 4N6FA 1D3GA 5G1TA 4MY1A 4LW7A 4R53A 3LCHA 2QUUA 3SJ3A 2PURA 2CZFA 1SZFA 2VEMA 1H63A 3W7RA 5G2HA 3SGZA 4HNTA 3FYOA 3ZR4A 4ZZ9A 1YLVA 1NVMA 3TFXA 1TRDA 1ICPA 3NPXA 3EWBX 4TU1A 2E6DA 1EUAA 3GDMA 1A53A 2O7QA 2V0TA 1BWKA 2JKEA 1NF0A 5D2TA 4K8EA 4EF8A 3W3OA 5CZTA 1YYAA 2Y6ZA 3O8AA 1H61A 2BLEA 3IIVA 2H90A 3FJLA 5I3GA 2G96A 3TCEA 1JULA 2V2CA 1MEHA 4IMFA 2J24A 3M5VA 4JN6A 2CZ5A 1HTIA 1M5WA 1HUVA 1PHQA 1LBLA 4LS0A 3GDTA 5MHBA 4LVDA 4NUWA 4Z1AA 3KVMA 1OX4A 1AW5A 1IGSA 3V75A 4GFSA 5LGZA 3KFTA 1J5TA 5A8GA 4XBSA 4O1CA 2C1HA 3LI1A 3ZFHA 5LHFA 2WOQA 2CLHA 4X2RA 4N2YA 5CPNA 1KW1A 3PG8A 1QPQA 2NUYA 3G8RA 4U4MA 4UTTA 4QNWA 2QAFA 3TSMA 1Q3NA 4NVTA 3TQKA 4QM1A 5AC6A 3GKAA 1KM4A 4O18A 2NV1A 3P80A 4FX6M 3ZWTA 1TIMA 3QW3A 4UTTC 2ISVA 5H91A 5AFDA 2DZUA 3CEUA 4DPQA 5D05A 1SO6A 1RQBA 2NWRA 4U28A 4PTNA 2QEZA 4XTDA 4AAJA 4GUHA 1Q45A 2GQ8A 4LTSA 3P81A 1TPUA 5KITA 3MHGA 3EX1A 4E2BA 1EIXA 5DLCA 2QCDA 5LNUA 1IXPA 4FNTA 1TV8A 1G7VA 2VFEA 1TTPA 3AO0A 1KBIA 5FEXA 3BVJA 2BTMA 3BLFA 3N2MA 2FJKA 2C6QA 1PHWA 3NQEA 1QOPA 4M6VA 3FOKA 5FI8A 1BEUA 3NQ7A 1UUMA 3LM7A 3GDRA 3QQ1A 4M19A 1SPQA 1R2TA 3HG4A 4O14A 5HMSA 2NX3A 2A5HA 1PCWA 1QPNA 4FNUA 4MUZA 1W56A 5EYWA 3BO9A 3DFOA 2Z1BA 4CNPA 3W7JA 1JQVA 1VCVA 3W1LA 3G0XA 2BZNA 4NXKA 4XQ6A 1VZWA 3N9RA 3P60A 1I2RA 1VRDA 4O12A 3S5YA 7TIMA 1W5QA 4UFKA 2VEPA 2Y62A 4GRSA 4WY0F 1O5KA 4N6EA 3C52A 3UZ5A 1KFLA 3W75A 3GAKA 1SQ7A 4A21A 2E68A 5J5RA 2A7NA 2VFHA 2OT1A 3UWWA 4N4QA 1WX0A 3N34A 1GPWA 2B7NA 3TNOA 2Q3OA 5K3VA 1P4CA 1H5YA 1ADOA 1ICQA 3B06A 3TXVA 3UYCA 2QR6A 1XKYA 2CLIA 4Z1CA 3S42A 1OFRA 1MO0A 1WQ5A 3PUDA 4X9SA 4UFIA 1EB3A 3QSTA 5C54A 3L9CA 4O4WA 1OABA 4TMBA 4LVFA 3UWZA 2V30A 5BW6A 4PCFA 3ANYA 1AK5A 3LXBA 4RXGA 3C6CA 3STGA 1QO5A 3EX6A 2I1OA 3AJXA 2CLFA 3L5MA 3OVRA 4MY9A 2DZTA 1FCVA 3MYPA 1SSGA 4LV4A 4IX2A 4A2SA 1M7OA 3OG3A 4FNPA 3LDVA 3M6YA 4RR4A 1HG3A 4FNQA 2GOUA 4NXSA 1H50A 2OX1A 1J4EA 1MXSA 5LHEA 3B0UX 4PC8A 3WJYA 1GQNA 3TC7A 3UZJA 4QIUA 5FEPA 1U83A 3QQ0A 3L5AA 5I3KA 4GJ1A 3S1VA 1X1OA 3TSDA 5BRBA 2CZDA 2DJLA 2QJGA 1GVRA 4PFMA 2EF9A 1TPVA 2ZA2A 3CIXA 1ZAIA 3EX4A 1F7BA 2JGYA 4IXXA 4LUIA 3RK8A 1VYPX 1B3OA 3EKZA 1ZY9A 3UPWA 4UTIA 4CQ8A 3W87A 3GZ3A 4OQVA 1QR7A 2VKZG 5DY2A 3W23A 1KLYA 1WA3A 1UASA 2Q8LA 4K7VA 3THAA 4ADUA 4NJGA 1G69A 1YDNA 4ADTA 4S2BA 2CU0A 5J5DA 3JRKA 3EXRA 3EWWA 4IJBA 3RU6A 4FX7A 1L6SA 4XKYB 3PAJA 4AWTA 1R30A 1I2NA 2X1TA 1YPIA 2X1SA 4TX9A 4O4VA 3QM3A 4UNLA 1T96A 1KTCA 4Z1BA 3NL3A 3A5FA 2P1FA 2Z6JA 3QMSA 4JIPA 4ZQMA 1EWDA 3PULA 3NEVA 3DHFA 3JS3A 3U8GA 3GXPA 5AC8A 3M16A 3KAOA 4FNSA 1K8YA 5TBOA 1MSSA 5F2MA 4GBUA 5KZDA 5HUOA 5F4SA 5FF7A 3TC6A 4JY9A 3NR0A 3FS2A 4LVGA 5G5IA 5DXXA 3DHDA 2WSQA 2EAWA 4LRTA 4IXHA 2R8WA 1PE1A 2VC6A 2J88A 5C2XA 1A5AA 1VLWA 3H53A 1ONRA 4I9AA 3EB2A 1QMLA 1GTEA 4JIQA 5F1UA 1TQJA 1X1ZA 3W2MA 4AMAA 4DELA 3BLEA 6ALDA 4E0CA 3A9IA 3NA8A 3SR7A 3M43A 2GJNA 4IOTA 1SFLA 4ZL1A 1UB3A 1THFD 2AQWA 5BNKA 4LUJA 3BK0A 1WDWA 5LNSA 3BG5A 5LZLA 5E93A 3W7IA 4WD0A 3HGJA 1PL9A 3HJZA 2X1UA 1NSJA 3PSVA 2VOMA 5LNRA 3M1ZA 3LRKA 1QAPA 3G3DA 1KFKA 4OU1A 1OF8A 4LU0A 3NPUA 1KM0A 4LS2A 1T8XA 4DO6A 1F2JA 3NAVA 3L68A 4O11A 3WJSA 5G1YA 4LRSA 3NM3A 3HGSA 4PL2A 4HNVA 1KM3A 2JK2A 3T44A 2ZYFA 4JTTA 3TKFA 3W1MA 3FFSA 5F2GA 4EWND 5A5WA 1WBJA 4UR8A 1K8ZA 4O10A 1YXYA 2HSAA 3DZ1A 1TPFA 3V1PA 1FY6A 1PVNA 3BGGA 1LRTA 1HO4A 3A24A 1VQTA 4JGDA 5CSSA 5FF4A 3CT7A 3GX9A 3CU2A 4JTSA 3WK2A 1BTMA 2DZSA 1Q6QA 1EP3A 1LZOA 4FB7A 1KFCA 1B4EA 2X2GA 3W7DA 4O28A 3GR7A 4O1AA 4NJHA 4HPJA 3GXTA 3W72A 4BI7A 4HT3A 4O54A 4A3UA 1XL9A 1FWSA 1GVQA 4MPQA 3NQ8A 2E6AA 3GYEA 4LV9A 3NVTA 3LERA 5EPDA 5HULA 3W7QA 1EUNA 3K30A 1H7WA 1GYNA 1TMHA 3W7NA 3ATZA 4OWGA 3FKKA 4ZQRA 3W1AA 2C13A 2ZA3A 1UUOA 2DZWA 3TK7A 2FPVA 3PF3A 1TQXA 2A7PA 2NUWA 3PM6A 1ZAJA 4UNKA 1GVOA 2DZXA 5HWNA 1TB3A 2ZRUA 3I7RA 4JTJA 3U2OA 4NNAA 4MY8A 2B0MA 3NNTA 4ZMGA 5FEWA 4FXRA 4TO8A 2GUUA 1O4UA 1SW0A 2C3ZA 3EX3A 4MLJA 4TR9A 2E77A 5CPMA 2ATSA 4O15A 4QJ1A 4DO4A 5D02A 1ZCOA 4GUIA 5K2ZA 5LKYA 3N2XA 3NQCA 2WQPA 2QF7A 4QAIA 5IM51 3OHIA 1K8XA 3TROA 1JCMP 3W7OA 5H2ZA 4O16A 4KFOA 4UTMA 3SFKA 1ZJIA 4R7JA 3WJWA 4JTHA 4M7TA 1W3IA 3LTYA 2VEKA 3DAQA 1XBXA 4WUIA 1IF2A 1B4KA 3MBFA 4RKAA 1XBYA 1LP6A 2C19A 1R2SA 1SUXA 1Q6OA 2Y7FA 4BI6A 2Y85A 3NZRA 3W76A 2YCEA 4MVAA 2ZTJA 3TE9A 4FIQA 4AH7A 4UMAA 1JRCA 4FHAA 2QCEA 1H7OA 1FDZA 2FLIA 4DF0A 4QITA 3EWZA 3P5YA 4LC6A 3CEPA 2NUXA 3EX2A 1N55A 3C56A 3L5LA 2Q8ZA 1X7FA 3M5ZA 3S5NA 3LHYA 1DORA 3C8FA 3MO7A 4KWVA 5D2VA 5BOOA 3QC3A 5HJLA 2Z2UA 2CW6A 4UTHA 1OK6A 3MP3A 4O53A 3PS7A 5AYYA 3W07A 1D9EA 1L9WA 2PCQA 3M44A 5HUPA 2ZQ0A 1VJIA 3TH6A 2E09A 3Q94A 3TFCA 5D04C 3KRZA 1XFBA 4AXKA 3FEMA 3LV5A 1Z41A 1QCWA 3LB0A 3KOFA 3W7CA 1LRQA 3HOJA 3TV8A 1CX9A 4MYAA 3L67A 4POCA 4GNJA 1OFQA 4LS1A 2V2DA 4JR5A 1W31A 5TQLA 5D09A 1C29A 3RNDA 4JX4A 1TPEA 1JUKA 1P0KA 3C61A 2QCGA 4DF2A 2ZTKA 1VC4A 3QH2A 2NWSA 4EF9A 2NLIA 3P8JA 3C2EA 2GVGA 1QPRA 3BPWA 2G95A 2WJZA 2WKJA 3W22A 3DENA 3F1QA 5AHNA 3T40A 2V2HA 1WBHA 2CLEA 1LBFA 3NQDA 1IXOA 1I2PA 3LHWA 3GAYA 4ZVJA 2E6FA 2JBMA 1GT8A 4GE8A 3W85A 1C9DA 1ZALA 1MZHA 1QPOA 3MBDA 2BX7A 3QSRA 3S5OA 3PG9A 1FBAA 1SW3A 1SR9A 1W0MA 2X16A 3LCXA 1W1ZA 1TPC1 4EVZA 3LGEA 3QJAA 1K7FA 3L0NA 5E0KA 1H62A 2WNNA 1WV2A 4WOQA 4EOUA 2V9DA 3GB6A 3GNDA 4P2VA 1RD5A 5EL1A 1GOXA 3O07A 2R14A 3CC1A 4QISA 3EWXA 3N14A 3CTLA 3E49A 4IMEA 3PUEA 3QMRA 1FXPA 4XKYA 3W70A 2B7PA 1NF7A 3TW7A 3HMJG 5CG7A 2QUTA 3EKLA 2YDAA 2JGQA 3ZWSA 1N8FA 5DBUA 1W3TA 3LHTA 3ZS4A 2Y61A 3W9ZA 3RMJA 2I9EA 4A22A 3IIPA 2H8XA 5TIMA 1XC4A 3LOTA 2YW3A 1F76A 3MWAA 2PRHA 3S5ZA 4PA8A 1KFEA 4ZQOA 3W6YA 4Q4KA 4O1BA 1ME8A 3E12A 4MYXA 1OFPA 4OV9A 1O60A 2FDSA 3LCFA 1W8SA 5KTLA 3MI3A 5CGQA 3JR2A 1JR1A 1TPWA 5LSMA 2I14A 1LYXA 2Z6IA 5FESA 4ZQPA 1F73A 4S1FA 2FQIA 1OFOA 4RLIA 2P10A 1R46A 3WJZA 1OFDA 1TJPA 5CKSA 2OZ0A 3MUXA 3W1TA 3LCIA 3VNDA 3DH7A 3L21A 3W1QA 4NZFA 4NZJA 3B03A 2ZZ4A 2QJHA 1KM6A 1ZNNA 4WX2A 1GYLA 3LX9A 1C8VA 2J6XA 5DXYA 3G22A 5L6UA 5D30A 3W7PA 2OCZA 2VENA 4QSHA 4JNMA 1XM3A 4E38A 2OT0A 2Y89A 2DP3A 1G4TA 3FA5A 3O1NA 3P84A 1EP2A 4YLWA 1QDSA 3W83A 4BF9A 3HPZA 2YXGA 1YTKA 3PBYA 4JDYA 4UR7A 3UXDA 2J9YA 4O19A 3UWVA 3STFA 3TW6A 4J9JA 1EP1A 1JCLA 3N73A 1NAL1 2ABAA 3KVKA 3GDLA 1BKSA 4M7SA 3EWYA 4K36A 1R2RA 1TJRA 1VHCA 1I8JA 5CPOA 3LV6A 3W7MA 4XBKA 3G3MA 2NXIA 3S9YA 4I7WA 6TIMA 3TJXA 1OX5A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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