1LBL | Genus

Total Genus 96

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	96
sequence length	247
structure length	247
Chain Sequence	PRYLKGWLKDVVQLSLRRPSFRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAEYKRKSPSGLDVERDPIEYSKFMERYAVGLSILTEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMKDFIVKESQIDDAYNLGADTVLLIVKILTERELESLLEYARSYGMEPLIEINDENDLDIALRIGARFIGINSRDLETLEINKENQRKLISMIPSNVVKVAESGISERNEIEELRKLGVNAFLIGSSLMRNPEKIKEFIL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	The catalytic mechanism of indole-3-glycerol phosphate synthase: Crystal structures of complexes of the enzyme from Sulfolobus solfataricus with the substrate analogue, substrate, and product pubmed doi rcsb
molecule keywords	indole-3-glycerol phosphate synthase
molecule tags	Lyase
source organism	Sulfolobus solfataricus
total genus	96
structure length	247
sequence length	247
ec nomenclature	ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date	2002-04-04

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1lblA00

4TR9A 5CPOA 1QPRA 4LV4A 2GQ9A 3KOFA 1JCJA 4TIMA 2YXGA 1TPVA 2B4GA 1VCVA 4XKYB 3ZR4A 1DKWA 4WY0F 3HG5A 5K9DA 3U8GA 1KFKA 4JTSA 1M7PA 3LXBA 1W56A 2NXIA 6TIMA 3TNOA 2Q8ZA 4UR7A 1TPFA 4XQ6A 3LX9A 1ONRA 4M7SA 4A29A 4E38A 3BPWA 1GJPA 3QSRA 4O1AA 5HULA 3W2JA 2GJLA 4QJ1A 4TO8A 2OX1A 3L0NA 3HG4A 3G8EA 4WXZA 4LS0A 3MHFA 2JKPA 3PBWA 5FF0A 4O28A 4ZQNA 1PL9A 2QCGA 3UNDA 4L4MA 3QPZA 1F76A 3TMLA 2Y89A 2QEZA 3DFQA 1SZNA 3W74A 1RZMA 1YXDA 5HUOA 4FIRA 3PUEA 4ZMGA 3NR0A 2EGZA 3SECA 2AAMA 3NGJA 4HPXA 1N8FA 1EB3A 4LV9A 4O54A 2ZRUA 3WK2A 1YPIA 5F4SA 4Q4KA 5F4WA 5HUPA 4AHQA 2YDAA 5CSRA 2CLEA 4NNBA 3TSBA 4YXGA 4UTTA 2GPTA 4AXKA 3STGA 4RXFA 4MLRA 3IIPA 1AW5A 3TC6A 4UTWA 5DXYA 2NWRA 3VCRA 1FX6A 2R94A 1TCDA 2EF9A 3S0CA 5D2YA 1XKYA 1Q6LA 4DBEA 1XCFA 3WJXA 2HS8A 1WV2A 1KTCA 3HIJA 3EB2A 4EIVA 3MYOA 3GKAA 1F73A 3EXRA 3LB0A 3WK1A 5BOOA 3W7NA 3BW2A 3W75A 3DFOA 4IPJA 4Y9AA 1S5WA 1A50A 1SSGA 1R30A 1TV5A 4N4QA 5CPMA 3FOKA 5AB3A 2A6NA 4LVGA 3LDVA 1W37A 3GXPA 4YMZA 1EP2A 2QAFA 3LLDA 1UUOA 5C6MA 1FCUA 3BV4A 2C6QA 5K9CA 4O57A 2GOUA 4GUFA 4ADUA 1O5KA 2BX7A 3TQVA 5K3VA 5AOUA 4JTEA 5D02A 2NZLA 4UFMA 4HN4A 3NG3A 1HL2A 3QJAA 3QMSA 3VI2A 4JY9A 1VYPX 5EKYA 2Q8LA 3QPYA 3PR2A 2V30A 4BR1A 5AHIA 2I1OA 1MSSA 4ICNA 3F1QA 1TMHA 1RQHA 3MMTA 4JIQA 5HWNA 3HPSA 3I7QA 1LOLA 3OIXA 4UXDA 5FEZA 3T44A 5J5DA 3VKJA 1U83A 1VR6A 4JYFA 3QFEA 2QF7A 4Y6GA 3GZ3A 1EA0A 4N4PA 1X6UA 3FA5A 1I45A 3CIXA 4IX0A 4DO5A 1ZNNA 1B4EA 3D0CA 4MYXA 4PTNA 5LNVA 4LW7A 1UBSA 1EUAA 5D03A 4ZQMA 3JS3A 2GJNA 1ZENA 1IXPA 4JDYA 1V5XA 3PS7A 5AHLA 3RLVA 3T78A 4O10A 1B4KA 4JN6A 4DO4A 4JX5A 5AC8A 5HWMA 3CT7A 2AQWA 3LHVA 5HINA 4UTHA 2TSYA 1GWJA 1N7KA 1ZAIA 4RR4A 4AH7A 2YYUA 2VFFA 3EWYA 5DXXA 2WPBA 1LBLA 3LI0A 2YYTA 1F05A 3LV6A 3P62A 1DOSA 3OVQA 4OV4A 4WZHA 3TUUA 1WDWA 3HJZA 3GDMA 4IMEA 1PIIA 4PC8A 3CHVA 4NX5A 1QOQA 1H61A 3WJZA 3H53A 3GNDA 1A5SA 4W9TA 4ZQRA 4NJGA 4KFOA 2BTMA 3GAKA 4ALDA 1LYXA 3OG3A 3M5YA 1C29A 2ZZ1A 5CZ0A 3LTPA 5IM51 1L6WA 4IMCA 2ZYFA 3E02A 4OBTA 1LM1A 4Z0JA 3G18A 5H2ZA 5LSMA 1F74A 3CEUA 1GG1A 3PAJA 2BWGA 5HWJA 2NLIA 2B7OA 1W31A 5EPDA 3STFA 3Q94A 3KX6A 4MKNA 4Y90A 1W5NA 3TSDA 5BMXA 1XBXA 3EXSA 4R53A 1UCWA 4NZFA 2QJHA 4BWLC 1X1ZA 3FYPA 3EWUA 1JVNA 2WSQA 3A5VA 1SR9A 4MOZA 4PL2A 4QIUA 1Z42A 1LRTA 3BLIA 1OYCA 1KW1A 3KVJA 2NXHA 3TIMA 4J9JA 1OFEA 2A0NA 1YYAA 4YCPA 3RLUA 3MUXA 3DZ1A 1NAL1 3B4UA 1AL7A 3W1MA 4UFHA 3P5ZA 2W0UA 1QNVA 1BKSA 1KM1A 3O15A 3PF3A 4N6EA 2CZEA 4NJHA 3W7GA 4NXSA 4LVBA 3IGUA 1XL9A 4RKAA 1BWKA 1OFBA 2VEPA 2Y70A 3I7SA 1KBIA 3SY5A 2QKFA 1G4EA 1JQVA 4HSOA 4NX0A 3NQFA 4WX2A 5D2XA 4I9AA 3QSTA 2FB2A 3BGGA 4JYDA 4P2VA 3QQ0A 3IEBA 2C16A 1VPXA 1XBZA 3NO5A 5LGZA 4IXHA 1LZOA 4GUJA 1KFEA 5E93A 1IF2A 5U7SA 1J4EA 4FNUA 3C56A 3DBPA 3CEPA 3JR2A 3S5NA 1P0KA 4CQ8A 3TC7A 1TPC1 2G95A 2PCQA 5I3IA 1GVQA 5DLCA 2VEKA 1FWNA 1FY6A 2E6YA 4GNJA 4NNCA 4JEQA 4PFMA 4R34A 4QAIA 4WD0A 1GG0A 4OE7A 3EKZA 3SW6A 1UB3A 4I7WA 2E1DA 1W3NA 1AW2A 5BW6A 1RD5A 3NYZA 1TJRA 4WQ6A 1TTPA 3O1NA 2C18A 6ALDA 2VFIA 5BMWA 5E1QA 1DBTA 1YDOA 3C52A 4GXMA 5D32A 4UIOA 3EKLA 4WUIA 2B7QA 5DCDA 4DEFA 2TYSA 4O4VA 1OX5A 3ATYA 1LLWA 3MP5A 1SZEA 5CPLA 1DJQA 2BZNA 2GVGA 3U6WA 3AO0A 1F5ZA 1LCOA 2PRLA 4FNSA 3UXAA 4PL1A 4UFKA 4HSNA 5AC6A 4DELA 3TDFA 2B7NA 3GXNA 3RMJA 4IMFA 2Y63A 2DP3A 2DZVA 4HNUA 4QISA 4JGDA 2ZQ0A 5CKSA 4JTTA 3HPZA 4PODA 5KZEA 3GB6A 3W2MA 1QDSA 1O5XA 2GQ8A 1O4UA 2V9DA 3OHIA 3W9ZA 2WJZA 1I2QA 3TK7A 1Q6RA 5G1YA 3C3NA 1EWEA 3NPWA 3W6YA 1OF6A 5HJLA 3UXDA 4CLMA 4GBUA 3LGEA 2V0TA 5AYZA 2BXVA 1GYLA 3KVKA 1I2RA 3W7EA 2A7NA 1WQ5A 3LERA 4FF7A 4O0ZA 1D3HA 4JX4A 2Z2UA 3LBMA 4UMAA 4DQWA 5LHEA 1SO4A 4JY8A 1W54A 3GNNA 1GQNA 4FNPA 3LLFA 4HIBA 5HNRA 4MZ8A 2DZTA 3KHJA 5AC7A 4AF0A 3M43A 2H6RA 2ZZ4A 2E6DA 3G1SA 4YL2A 4IGHA 1YDVA 4JIPA 3UWYA 5DCEA 3P80A 5I3KA 4MYAA 2C1HA 3VFLA 4JTFA 2VKZG 4LRTA 2WQPA 1JUKA 4QNWA 3Q2DA 4N9CA 1W5QA 4O13A 1RVGA 5KMYA 4RXGA 4MFEA 2Y85A 3UD6A 3W7MA 1OF8A 2WSRA 2VEIA 5CPNA 3LCIA 1VRDA 3L21A 4H3DA 3BK0A 3VNDA 3RF9A 4XBKA 3UY7A 5I3JA 3VE9A 4FXRA 4JTUA 5I3FA 3N3MA 2VFHA 1YTDA 5D38A 2ZZ5A 2OJPA 1ICPA 1QFEA 2Z6JA 5C5YA 3UPWA 1ME9A 3FYOA 5KINA 4K7VA 5SWUA 1GPWA 1TV7A 3E96A 1K8ZA 1WAUA 3CLMA 2PE4A 2AGKA 5D2TA 2ZRXA 4EVZA 4UNKA 1DQWA 1ICSA 2J6XA 4HT3A 3L5AA 4ONVA 3FFSA 1I2NA 2A2IA 1JULA 2F7FA 3TAOA 3PVFA 1KM0A 4IQLA 4NVTA 1H51A 4DF0A 3MI6A 4K39A 3UQNA 2UV8G 4UFLA 5FEXA 3MYPA 3TXZA 4O12A 2D73A 2E5BA 3SR7A 1JCYA 1ALDA 3NQ7A 4FEZA 4OT7A 3I65A 4IOTA 5DBUA 4O4WA 3W1QA 5FEPA 3LBCA 4UFJA 1K7XA 2FTPA 4CCDA 3FLUA 1LORA 1SFLA 1ZCOA 3PY2A 3C6CA 2WV8A 1RQBA 1EEPA 3O6DA 1GVFA 3W7RA 3LXAA 2ZCGA 3DU0A 3A24A 5KTLA 3M44A 3TV8A 1K7EA 1RR2A 5CZJA 3HB9A 3FIGA 1EIXA 1QPNA 4MJZA 1FUYA 3E49A 5E0KA 1KM4A 3WJWA 2X30A 3CTLA 4N2YA 3UYCA 1H63A 4GUGA 1K8YA 1GT8A 4K8EA 2ABAA 3KAOA 1DL3A 1T99A 3TXVA 3W83A 2GQAA 5EMUA 1OHLA 3QMRA 1K03A 1QCWA 3TE9A 2E5CA 4MVAA 3GK0A 3IIZA 4FNTA 5TBOA 4A2RA 3RU6A 4X2RA 3NPUA 3Q58A 1GTHA 3LRMA 3GDTA 2V2HA 3DXIA 3MW7A 1BTMA 3R8RA 4M6QA 3R12A 1DV7A 1TV8A 1TQXA 2Y7GA 5D04C 4YWIA 4FX8A 4UNLA 1ZALA 1T96A 2V2DA 4BWLA 1PHWA 3FKKA 3NPVA 4DF2A 4NZJA 4JDBA 4N02A 3NZ1A 2WKJA 4IJBA 3R89A 3K30A 4Z08A 2WO5A 4UCGA 3BARA 1WBHA 4LC8A 1KBJA 4MIMA 2ZRYA 1KM5A 5BNKA 3P60A 2XN0A 3CM4A 4EWND 3BLEA 2X1SA 5EBUA 1UASA 4Y8FA 4TU1A 3HGJA 3ZWSA 4QSHA 5I3HA 3EWXA 4O14A 1JR1A 4WOZA 3A9IA 2JGQA 3P5YA 1OX6A 5D2WA 3DGRA 4G1KA 1DVJA 4ZZ9A 3W85A 3C2OA 2QUUA 3CQ0A 1A5AA 3TQKA 4RZ6A 3QZEA 3W22A 4D2JA 5C55A 5F4XA 2H8XA 1VZWA 2RKXA 1FWWA 1JRBA 5DY3A 4QM1A 5F2GA 3RFAA 2IQTA 1SO5A 1W3TA 3HGRA 5K2ZA 1YLVA 3NXFA 2C3ZA 5D09A 4MLJA 3GR7A 2EKCA 4FB7A 4AHPA 4PEKA 3WFAA 1N55A 1HO4A 1F2JA 2CLKA 2ZZ7A 3G3DA 3W7HA 3G1AA 1PCWA 4POCA 1XFBA 3UWQA 2ISSA 2V5BA 1XUUA 2GVLA 4E0CA 3BLFA 4FNQA 3L0GA 2VEMA 1VGAA 2WSYA 4LY8A 4RZ4A 4ZVJA 3LCWA 3P74A 1J5TA 2RDWA 1SU5A 4I7VA 1L6YA 3JRKA 5LNRA 1SW3A 1SQ7A 4C1KA 1WOAA 2ZA2A 3G1FA 5F1VA 4DBDA 7TIMA 2ZRWA 1QPOA 1Z48A 1YPFA 2CZDA 2YCEA 3W2UA 3W1RA 3N19B 5AHNA 3G1HA 1ZHAA 3SGZA 3FKRA 2Y6ZA 4O0KA 1TRDA 3NZRA 3W07A 3W71A 4IWWA 5G4WA 1VLWA 1W5MA 1J2WA 3GIYA 1Z41A 4N9DA 1PS9A 4H4IA 3MP3A 3G1VA 3W84A 4Z1AA 3M5XA 1H7PA 3MO7A 3WK3A 1G4TA 2QUVA 1XI3A 3I7RA 4Z1CA 3BO9A 3LXCA 3QH2A 4A22A 3UZ5A 2RFGA 5KZMA 2ZA3A 2H3BA 3HF3A 2E5DA 4IX2A 1JUEA 2ISVA 5EL1A 1KFBA 1QO2A 2CZFA 1SZGA 2B7PA 2QAPA 2Y62A 4GFSA 2G5WA 4GE8A 5DY2A 3NEVA 3T7VA 2XFWA 3IRDA 4OWGA 4Q33A 2FQIA 1HTIA 3LRKA 3TMQA 1SW7A 1WOBA 1XDLA 3A21A 5TIMA 1TPWA 4JXCA 1OFOA 1Y0EA 3NNTA 3O8AA 4JR5A 4O52A 3W87A 1IIHA 1SSDA 1D9EA 1LTDA 2JKEA 1QR7A 3LCLA 4UFIA 1DHPA 5F2LA 2F84A 4MFDA 4R7JA 4ZQCA 1T0OA 4O18A 4FHAA 4ZQPA 2PRMA 4I7UA 3GX9A 1SZFA 4CNPA 2WNZA 4RZ5A 1V7YA 3CPRA 3PSWA 4X9SA 2QCCA 3A22A 2H8ZA 3DFPA 1Z44A 4JICA 3DAQA 5T26A 5DELA 1THFD 4KFNA 1H50A 3UWWA 2A4AA 1GVRA 2CFFA 2X2GA 2ZZ2A 1FWRA 3LHZA 2ZTKA 3V1PA 3W1UA 3STEA 2A7RA 3C61A 1MEIA 2YFOA 3TW7A 2FLIA 2A85A 3PUDA 2C19A 2VFEA 1R2SA 1R2TA 4P61A 1PV8A 1G4SA 1OFPA 5K4XA 3GXTA 4S2CA 1QAPA 5L6UA 2V81A 1F6PA 3W7OA 1RQEA 1EWDA 1PE1A 1RPXA 4IUOA 1H1YA 1SO6A 3HG2A 3W1PA 1L6SA 3G22A 1H1ZA 4XZ9A 3S8HA 1NF7A 2CLHA 2V5LA 4AVFA 5LZLA 1WYIA 4EF9A 4WXYA 3PUOA 2JKAA 4N9BA 2DU2A 2RH9A 3GLCA 1TTJA 2HTMA 2YW4A 5DBTA 1OFAA 3NQCA 2ALDA 1LROA 2QCHA 4ADSA 4Z1BA 2A5HA 3QEZA 2DZWA 4XTDA 3VE7A 2ZRZA 4ORMA 3MI2A 1FQ0A 3TKFA 3BW3A 1ML1A 4OV9A 1OFQA 2P10A 3DI1A 3T40A 1ZAJA 3DI0A 3G3MA 3L65A 3B06A 3UWZA 1KLZA 2OT0A 5C54A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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