1LBMA

Crystal structure of phosphoribosyl anthranilate isomerase (prai) in complex with reduced 1-(o-carboxyphenylamino)-1-deoxyribulose 5-phosphate (rcdrp)
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
205
structure length
194
Chain Sequence
MVRVKICGITNLEDALFSVESGADAVGFVFYPKSKRYISPEDARRISVELPPFVFRVGVFVNEEPEKILDVASYVQLNAVQLHGEEPIELCRKIAERILVIKAVGVSNERDMERALNYREFPILLDTFDWSLILPYRDRFRYLVLSGGLNPENVRSAIDVVRPFAVDVSSGVEAFPGKKDHDSIKMFIKNAKGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Two (betaalpha)(8)-barrel enzymes of histidine and tryptophan biosynthesis have similar reaction mechanisms and common strategies for protecting their labile substrates
pubmed doi rcsb
molecule keywords PHOSPHORIBOSYL ANTHRANILATE ISOMERASE
molecule tags Isomerase
source organism Thermotoga maritima
total genus 69
structure length 194
sequence length 205
ec nomenclature ec 5.3.1.24: Phosphoribosylanthranilate isomerase.
pdb deposition date 2002-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00697 PRAI N-(5'phosphoribosyl)anthranilate (PRA) isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1lbmA00
1VCGA 4BFAA 3R13A 3M1ZA 6ALDA 3DXIA 4NZJA 1KLYA 5F4XA 4LVBA 2VFFA 1TPC1 1ZY9A 5K4XA 3F4NA 2QAPA 3PBYA 4NXSA 1TTPA 4XTDA 4UTWA 1ME9A 1FWRA 3UY7A 2NWRA 4PL1A 2GJNA 1K02A 4K38A 2CLOA 3G18A 1ALDA 3C6CA 4I9AA 1THFD 1R46A 2EPHA 2FFCA 4IWWA 2P10A 3R89A 3NPUA 2ZTKA 3LCLA 3NQ7A 4AHOA 1O5KA 4LU0A 2H6RA 4JTKA 5A8GA 2ZA1A 4O16A 2ISVA 4Z0SA 4WXYA 3HGJA 5CZTA 1WAUA 2PURA 1YDNA 3G3DA 4G1KA 1SO3A 4KFPA 3WK2A 2YGYA 2C14A 1XFBA 2WO5A 2WSQA 1OABA 1P1XA 2RDWA 3L0GA 3NQMA 4FXRA 1KFLA 1PCKA 5TBOA 4FIQA 3GDKA 3RLVA 4RZ6A 1O95A 2V2CA 3O8AA 4BWLC 1GYLA 4FNUA 4X2RA 3L66A 3G0UA 1ML1A 4LS2A 1Z41A 3B0PA 4TMBA 3BPWA 1H1YA 5LZLA 3KRZA 1I2RA 3EX2A 3STEA 4IPJA 2GVLA 3MUXA 4NNAA 1IXPA 1G4PA 4CNNA 3HG2A 1B4KA 3G1FA 3DENA 1LDCA 3HG4A 1M6JA 4UFLA 1H62A 3DKLA 2J9XA 4JTJA 3QJAA 4O14A 2WSYA 4TIMA 1RQHA 2A2IA 3NL3A 1C8VA 3EWUA 1VCFA 1KM0A 1OYCA 3DH7A 4O54A 4K8HA 1OK6A 3N9RA 3P84A 1X6UA 4I7UA 3DI0A 5D09A 2VEPA 5TQLA 4GXMA 2YYTA 2TPSA 5F2MA 4PODA 1TO3A 2GQ8A 4MIMA 4Y96A 2EKCA 2QUVA 4O4WA 2BZNA 4CCDA 2H8ZA 2ZA2A 1L6SA 4TU1A 3HIJA 4JICA 1W3TA 3LTSA 1XKYA 3O05A 4JX5A 1L9WA 1QWGA 3BLEA 3W86A 4MLJA 2E6AA 4CCCA 2TMDA 1TJPA 1WA3A 2DORA 1SO5A 4AB4A 3MI2A 1W31A 1LRTA 1FWSA 4QM1A 1DORA 2E6DA 1F74A 3QPYA 3TIMA 2AGKA 1K3UA 3TKFA 2IQTA 4IXHA 1VPXA 3W76A 4UTJA 4ADUA 4PFMA 3QSTA 5D03A 3LLDA 2EHHA 4AMAA 1PVNA 1BTMA 5IM51 2V2DA 2UV8G 1TIMA 3TR2A 3EWBX 1OVDA 4JDYA 4AEOA 5K9XA 4JTTA 4RXGA 3W7GA 1W54A 2WV8A 1Q6RA 2PRLA 1DHPA 4MZ1A 3M5VA 4RZ5A 1V5XA 3TSBA 1K8YA 3MI6A 4E38A 1I2PA 3TW6A 2NXGA 3M0ZA 2XFWA 3NQ2A 4S2CA 2G95A 1SZNA 1OFEA 2FIQA 5FF0A 4NVTA 1GG1A 1QPNA 1R30A 4WX2A 4FNSA 3VE7A 4AHPA 5BMWA 4GUIA 2QF7A 4NX5A 3P80A 3CT7A 2ZQ0A 1YXYA 1G4EA 3ZR4A 5DCEA 1GQNA 2ZFAA 3GAYA 3JR2A 3CB8A 4CQAA 4ALDA 4WOQA 2Z1BA 1MEWA 1KBJA 3JS3A 1S5VA 3PSVA 1H60A 4CNPA 3P67A 3B05A 1ICQA 2E5CA 1ZALA 4NU7A 3W1TA 1B3OA 3EWZA 1QAPA 3CM4A 1TQXA 5CPOA 5DXXA 4HN4A 1DV7A 3HF3A 1R2SA 4NJIA 3KFTA 4O4VA 5BMXA 8TIMA 1OFDA 4RZ4A 4PTNA 4TR9A 3UY8A 4MY9A 4N9DA 3N2XA 2ISSA 4H6KA 2BLEA 4UTIA 3FFSA 3FOKA 2FTPA 1LBLA 3QEZA 3TJXA 3NM3A 2DZTA 5U7SA 4ORIA 1W5NA 3PULA 4M6PA 4FEZA 3W7PA 3W72A 4GBUA 1F76A 3RNDA 3MYOA 2VFDA 1K8ZA 2E5DA 4NJHA 2BSLA 1TSIA 5AYYA 3TDFA 1EIXA 2Q3RA 4Q33A 4FX8A 1KM5A 1ME8A 4DO6A 3G8RA 4MYXA 2FPTA 3MHUA 3B06A 1IF2A 3P81A 3W7EA 3LBMA 5D38A 3NG3A 4C1KA 4ZL1A 2O7QA 2NX3A 1D9EA 5H91A 3IIOA 5K9DA 2J88A 3L68A 1TCDA 1W37A 1H7WA 1PIIA 1CW2A 3TQ0A 2WNQA 3UNDA 1FDJA 3DHFA 3S5YA 3MJYA 1XBXA 1KFEA 4QIUA 1PE1A 3L2IA 2J27A 5G2HA 1GVFA 3DGRA 1OF6A 1VYSX 3LHZA 4XKYA 2V9DA 1EX5A 3BW2A 1WBJA 1H7XA 4ML9A 3MWAA 1KFCA 3W73A 3LM7A 3LXAA 5CZJA 2A6LA 4UMCA 3I7QA 3RF9A 2YW3A 1DJQA 4GRSA 3B4UA 3CPRA 1XDMA 4FHAA 4O57A 2CLMA 4PC8A 4PL2A 2Y6ZA 3EX6A 1I8JA 5LNWA 3L9CA 2FQIA 2QCNA 1GZGA 2X2GA 4WZHA 4N2YA 4KFOA 4FF7A 3GR8A 2QJIA 3TUUA 3A21A 1JRBA 3VKJA 3IVTA 4EF9A 2YDAA 1H61A 4KWWA 5AB3A 3PC0A 4HIBA 3SGUA 2VEKA 4RXFA 2B7NA 2P1FA 2QCDB 3L67A 3N73A 3THAA 1EPXA 5AHIA 4MYAA 1EUNA 1SUXA 1XBVA 5AHEA 3M44A 1ZFJA 2HMCA 2CLEA 3KX6A 1YADA 5LKYA 4O1AA 4LUIA 3ATZA 5KTLA 2Y61A 1FQ0A 3LI0A 3PG9A 3EXTA 4EF8A 1PHQA 3NNTA 4LVGA 4UFHA 7TIMA 5C2XA 3GDTA 4JYDA 1KM1A 5F1VA 4KFNA 1JCXA 3FA5A 3NGJA 2W79A 1WQ5A 4MY1A 3PY2A 4I7WA 1AW2A 2RFGA 3W1QA 4O28A 1W3IA 2ZZ6A 4O17A 2VFIA 4O52A 3GKAA 2QEZA 3LERA 3PB2A 2H3DA 3TW7A 4MOZA 3F03K 1SO6A 5A5WA 5D2XA 4JXCA 3ABRA 3W23A 1GVRA 3TNOA 1GVSA 3NL6A 5LNVA 1OYAA 3UXDA 1OK4A 1ZAIA 2ATSA 1DOSA 1I2QA 4HNUA 2NV1A 1SSGA 1LLWA 4DPPA 5AHLA 3A23A 3FKRA 3C3NA 4FIRA 2Z6IA 2HSAA 4M6QA 1PCWA 3TU9A 5I3FA 4AAJA 1UCWA 2YYUA 1XUUA 3CWOX 2DZVA 2V2HA 1F05A 3W75A 3HGSA 3NPWA 3P7YA 2EAWA 1JQXA 2RH9A 1TPH1 1LOLA 1TPB1 4JIQA 2X30A 3IGUA 5BRBA 1A5SA 2BWGA 3W7LA 2A1YA 2VEMA 1U5JA 1L6WA 3IEBA 5HNRA 3KRUA 4LW7A 2J24A 1V7YA 4DELA 3BG9A 4MZYA 3KAOA 5CGQA 4DF1A 1EB3A 1DL3A 3A24A 1T96A 4I7VA 3M5XA 3OA3A 4Z1BA 5HULA 4FNTA 2WOQA 2B7QA 3LCXA 4IMDA 4QISA 4JTGA 1QNVA 1ZAHA 5FF7A 5BNKA 1GG0A 3PS7A 3DZ1A 4AWUA 3PG8A 3W1PA 3W2LA 3S9YA 2QJGA 1S5TA 4Y90A 1G4TA 4M7TA 1HUVA 2GPTA 3CC1A 1JQVA 2ZRXA 2QKFA 1XBYA 1F7BA 1Z42A 2DU2A 2NLIA 3MP5A 4OU1A 5AYZA 4NJKA 1KFBA 4O10A 4OV4A 3TQVA 1MEHA 1VR6A 4K37A 1UUOA 2X1UA 4GWEA 1FX6A 4RJEA 3SECA 1JCYA 1YTDA 5DLCA 3TQKA 4B5NA 3MP3A 3FIGA 1DKWA 4O8RA 2C18A 5AHNA 3W3OA 5FF3A 5HMSA 1DJNA 1KM6A 1WOBA 1FCQA 1EEPA 2Z6JA 2H90A 5K4ZA 3HG5A 1XM3A 3C2OA 3TH6A 4JTUA 3FS2A 1I4NA 1LLZA 1Q3NA 2XN2A 3CEUA 1KFJA 1H50A 1T8XA 2A4AA 2OX1A 1QMLA 3S5OA 2E77A 4WOZA 4JTSA 4OBTA 3O6DA 4LV9A 4UC5A 5K2ZA 2NX1A 1P4CA 4JYFA 1MO0A 1YPFA 3PBWA 2J9YA 2GQAA 3W7HA 1RD5A 3AJXA 1W5MA 1YTEA 2WKJA 4Z08A 4ADTA 3P5ZA 3BGGA 3PUEA 3PUOA 2F7FA 1KM2A 3O6YX 3GZ3A 3LB0A 4O19A 3IRDA 4IGHA 5KZDA 1EP2A 4IMCA 1ZCOA 3P8IA 2DZWA 5AYXA 3IV3A 2C16A 3HOJA 3MP4A 3OHIA 4PCFA 3TAKA 4JTIA 2CFFA 4ZZ9A 3INPA 3N2MA 3NL2A 5E1QA 3UXAA 4OV9A 3G1XA 1D3GA 2C3ZA 3HB9A 1BWKA 4LS1A 3TSMA 3K30A 2C19A 5GVJA 3OBKA 3QSRA 4BR1A 3V75A 2ZRWA 4AVFA 1J5TA 1K03A 5EMUA 3QYQA 4Y9AA 2E68A 4O1BA 4OQVA 2CW6A 2BTMA 3HO8A 3W88A 3CQ0A 1CX9A 1GVOA 2AAMA 2YPIA 1R2RA 3H53A 4LTSA 4RKAA 1TTIA 1GVQA 1LZOA 2Y7FA 4TO8A 5EPDA 3LHYA 4RR4A 4A21A 1GTEA 1DQXA 4CCEA 4XTIA 4LWWA 3TSDA 3SY5A 2PE4A 1F6PA 1SO4A 1AL8A 1FCBA 4W9TA 2Q3OA 1IXQA 3UWWA 3O15A 5FI8A 1EUAA 1X7FA 1HG3A 1XDLA 4H4IA 1HTIA 3C2VA 2WNNA 3NDOA 2OT1A 3W71A 3PF3A 5KITA 3DU0A 4E2DA 5HR6A 4BI7A 1XC4A 1KM3A 4LVFA 4QNWA 3G22A 1OFAA 4AWTA 2GUUA 1IIHA 1JCMP 4JTHA 1P0KA 4UR8A 3NQ6A 5AHMA 1Q6QA 3TJLA 5CSSA 1A5CA 5HUOA 2A6NA 4UTHA 4JX6A 1FWNA 1VGAA 3E96A 3EEGA 2J9ZA 4XZ9A 1LRQA 5CPMA 3M5YA 3W1MA 4LS0A 3G24A 4EIVA 4JY8A 3DBPA 5L6UA 2ZZ1A 1QO5A 1KTBA 4O53A 2Y62A 5AC8A 3N19B 3DFTA 2FPVA 3HG3A 3LHVA 4HKPA 3KRSA 3B04A 3I7SA 4UCGA 3LCFA 1TRDA 2QCFA 3QMRA 2X1RA 3SFKA 1VYRA 4MFEA 3W2UA 3KVMA 1W1ZA 3T78A 4IJBA 1G7UA 1S3HA 3S1UA 3SZ8A 3MBFA 1YXCA 3L0NA 3LXCA 1VHNA 3LLFA 1ICSA 4UXDA 4UIOA 4WY0A 5DXYA 2WQPA 4JEQA 4Z1AA 4U4MA 1C29A 1NFBA 1QDSA 5F4SA 2ZRUA 5AN7A 1M5WA 3PAJA 1OFPA 1VRDA 3EWXA 1GEQA 3LOTA 1MSSA 5KSWA 3P8JA 5I3KA 5TIMA 1S5WA 5LSMA 3BK0A 3G0SA 4LRSA 3GX9A 4LT9A 1I2NA 3W7QA 1A50A 1FBAA 1QOQA 4RCXA 1DQWA 2QUTA 1L6YA 5I3IA 2X16A 4FX7A 2Z0IA 3O06A 1P5BA 3C0JA 3E02A 3TE9A 3C52A 1Q6OA 3NM1A 1QFEA 4IXXA 2YCEA 3FEMA 1B57A 1FWTA 4M5PA 4FX6M 4N6FA 2BX7A 2V5BA 3RK8A 4GUJA 2Y85A 1ZENA 1EP1A 1SR9A 3CLMA 3BLFA 5CZSA 2OZ0A 3MYPA 4M19A 5C54A 2V5LA 1ONRA 2Y7GA 4JX4A 3EWWA 2H3BA 3VI2A 2CZ5A 5D2VA 2ZRYA 1H7RA 3WJSA 4IPIA 3BGJA 4R7JA 1XCFA 1VC4A 3GDLA 1X8FA 2FPYA 4UTLA 2WPBA 2OMAA 1AK5A 1GT8A 2GVJA 3WJYA 2YFNA 2ZYFA 5EKYA 1W3NA 1ZAJA 3Q58A 4PH6A 3S1VA 1TQJA 1JJKA 2Y89A 4LNYA 1GJPA 1HFBA 1LYXA 3W1LA 4O11A 4MFDA 2ALDA 3TAOA 3LV5A 5SWUA 3GIYA 4UTWC 3B0UX 4O15A 4RV8A 1OJXA 3LI1A 1LOQA 3NQAA 4XUGA 1FCVA 4JN6A 3ZFHA 1RZMA 3LCGA 1NF0A 4Z1CA 4BF9A 2GQ9A 1I45A 1H51A 3GVGA 3PWAA 1ICPA 3EX4A 3W7JA 2HTMA 1TTJA 1OX5A 2ZRZA 4IX2A 1VCVA 3USBA 4L4LA 3M47A 3MHGA 3N14A 2V81A 1C9DA 3OIXA 5KINA 5LHEA 1FUYA 1HO1A 3I68A 3HGRA 3QZEA 1NAL1 1SZEA 2CZDA 5D32A 2R8WA 3HPZA 5FF2A 3NL5A 3WJXA 3SJ3A 3KVLA 5G1TA 3N34A 5I3JA 1VS1A 2LLEA 3OVQA 3Q94A 4ADSA 4FNRA 5DBTA 3EKLA 3OVRA 1RPXA 1KV8A 2PRMA 4WQ6A 4C1LA 3A5VA 4YXGA 1AW1A 2QR6A 4O1CA 1YPIA 4UMBA 2A0NA 3VCRA 5BOOA 4E0CA 1KFKA 3EB2A 4O1DA 3GK0A 3P61A 4HT3A 4WD0A 1DVJA 3M7WA 2VENA 1QOPA 1SFJA 3ANYA 3NVTA 2FLIA 3NYZA 4FNQA 3BO9A 3SR7A 4ZQRA 5AC6A 1Z44A 2VFGA 3EWYA 3H54A 2P0OA 2QCMA 3IGXA 5HINA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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