1LOR | Genus

Total Genus 79

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	79
sequence length	209
structure length	209
Chain Sequence	RLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESI

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structures of inhibitor complexes reveal an alternate binding mode in orotidine-5'-monophosphate decarboxylase. pubmed doi rcsb
molecule keywords	orotidine monophosphate decarboxylase
molecule tags	Lyase
source organism	Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus	79
structure length	209
sequence length	209
ec nomenclature	ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date	2002-05-06

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00215	OMPdecase	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1lorA00

3P8IA 3G3MA 3IIVA 3NQ8A 4MZYA 1IXPA 1VJIA 3FKKA 3LHTA 5LNWA 3WJYA 1SR9A 2VEPA 2YFOA 1UCWA 5G1TA 2QCEA 5FEZA 3C6CA 5L6UA 2NWRA 3Q58A 3NQCA 4MZ1A 4CQ8A 4QISA 3UWQA 2Y7EA 3TSMA 2ZZ6A 1NFBA 3LHYA 3OBKA 5CZTA 4QNEA 4LS0A 3IIPA 2RDUA 3QM3A 4NJJA 3S5NA 5KZEA 1TPEA 1KW1A 1R2TA 2E6AA 3HB9A 1OYCA 4O15A 4L4MA 5DCEA 3NVTA 1LM1A 4JTUA 4WY0A 1H63A 1SSDA 2WNZA 5AHFA 3UY7A 2PCQA 1Q3NA 3B03A 4AWSA 1K7XA 1H7OA 4DBEA 3HGSA 1L9WA 1DVJA 2X1SA 1K3UA 2J88A 3W71A 1EP1A 2Z2UA 1FWSA 5D2VA 3W7OA 5C54A 4UMAA 2X30A 3PWAA 3IV3A 2JBMA 4ADSA 3BG5A 3PR2A 3GKAA 2DZTA 1NF7A 4WJEA 3M1ZA 3WJXA 3FLUA 3W7PA 1H51A 5LNSA 4C1KA 4ZQPA 4IUOA 3W87A 2VFDA 4Y90A 2VFEA 4R7JA 3QW4B 2DZVA 2G5WA 4UTMA 1LDCA 4HSOA 1E51A 4BFAA 1A5SA 2YX0A 2E5BA 3NQ2A 4GWEA 1S3HA 3W76A 3LCLA 1VYRA 4ML9A 4PODA 3RLVA 4NXKA 2X1TA 3QEZA 3DFQA 2OJPA 2PRMA 4MY8A 1LYXA 2X1UA 3F4WA 1I2OA 2HS6A 4UFLA 3TQVA 3NPWA 4RV8A 3LB0A 1IXNA 2V2HA 3KXQA 1SO3A 4JX4A 3LCGA 1JCYA 2E5DA 1TIMA 1O4UA 3HIJA 2G97A 1I2RA 4JGDA 2VXNA 1OK6A 5D30A 3JS3A 5HJLA 3M5YA 3MMTA 5DY2A 5F1VA 3UWVA 1OFPA 3DZ1A 3TUUA 1DJQA 1HG3A 1D3GA 1SO6A 4M19A 3TKFA 3IGSA 3NL6A 4JY9A 1FXPA 3OHIA 2ZRVA 3ABRA 3WK3A 2E77A 2GPTA 4LC8A 4X22A 1XCFA 5D04C 4ORMA 1Z48A 1WX0A 3O05A 1QMLA 3NYZA 1TV8A 3MBFA 2H90A 4AVFA 2GQ8A 5AOUA 3ABQA 2PE4A 1KV5A 4LS1A 1H7PA 1JUEA 4HN4A 1F7BA 4ICNA 3W7MA 4HKPA 1ICSA 4Z1AA 3LI1A 3D0CA 1J2WA 5AHMA 2H6RA 2NUXA 5D2YA 3LDVA 3WFAA 1GVQA 1LZOA 1OX4A 4A2SA 2OX1A 2R91A 4ZZ9A 1I2QA 3L9CA 3W7QA 3EX3A 4RZ6A 3B0PA 1BTMA 1HO4A 2CWNA 4Y6GA 5K7JA 4IQLA 3MP3A 5E93A 4HNUA 3IGXA 1FDJA 1XFBA 1F74A 4PTNA 4LOCA 5BMXA 5DBTA 4UR7A 3PF3A 3O07A 1KBIA 2VENA 4PC8A 4JTHA 1B4KA 2WSYA 1GOXA 2OT1A 1J5TA 1BWLA 1SZFA 4JTFA 2C1HA 3GDTA 2I1OA 2ZQ0A 3UD6A 5G2HA 3CT7A 1XBZA 3G1AA 5KINA 1SO4A 1VR6A 1VLIA 1SW0A 4L4LA 1JCNA 1LROA 3M44A 4JYFA 1OFAA 1GVOA 4ADUA 2X2GA 1XM3A 2FFCA 3CEPA 4BF9A 4X9SA 4YLWA 2YYUA 4M6PA 3THAA 1CW2A 4JN6A 3KVLA 3HOJA 2J9ZA 1I2PA 1UJPA 1OYBA 4AXKA 1C29A 3LI0A 4CQAA 1W54A 5EA9A 4IMGA 3NQDA 4MYAA 3F1QA 2A6LA 4GUJA 3I65A 5D02A 4O4VA 3TFCA 1SFJA 1FWNA 1VGAA 2ABBA 3M0ZA 2Z6JA 4K8HA 3GZ3A 4MYXA 4EWND 2EPHA 3R13A 4MLRA 3BLIA 3TMQA 4Z0SA 3BG3A 2VC6A 4QITA 1ZY9A 4A29A 1TRDA 3U6WA 1LTDA 3G8RA 1MXSA 3M5XA 4S2BA 4MIMA 1KM0A 2PC4A 3SJ3A 1TO3A 3DU0A 1O60A 3RLUA 4LRSA 2JGQA 5DXXA 2TRSA 4LU0A 3R8RA 3LOTA 1LBFA 2C19A 3DENA 5CSRA 3P61A 2QJIA 1RQBA 3GXTA 1GVFA 1YPIA 1XI3A 1Q6QA 3DKJA 1YDNA 1JCJA 1TPC1 5DELA 5I3JA 4HNTA 3NQ6A 3VNDA 3PSWA 4EIVA 1OABA 4FHAA 2J27A 2E68A 2NLIA 4LV4A 5C55A 5F4SA 1MO0A 4OWGA 1EUAA 2EF9A 2Y70A 3PB2A 5K9DA 3HGOA 3A22A 2A2IA 1KA9F 3W7JA 3TQ0A 5HWNA 3PBYA 2A7PA 1NEYA 1G7VA 1UASA 3M41A 1KTNA 1W5QA 2QCHA 3TSDA 1ZHAA 3OVPA 3TE9A 2C13A 3E9AA 5F4WA 2WNNA 4M7TA 4GUFA 3LX9A 1S5WA 3NL3A 1Q45A 3W3OA 1G67A 2FTPA 1PV8A 3LLFA 1VYSX 3KRSA 4DPPA 1ZCOA 1OF8A 1TV7A 4WD0A 3NM1A 5D33A 4ZQOA 2VOMA 1AW1A 4GBUA 2ABAA 4IMEA 2QCLA 3MI2A 1TSIA 4Q4KA 4Z08A 1G6CA 4WOZA 4PCFA 1XUZA 3B0VC 3QPZA 3DFSA 3PC0A 3UZJA 2AQWA 3RF9A 4ALDA 5F2IA 1Z44A 2Y62A 3W2LA 1K8ZA 1VS1A 1L2UA 5FESA 4JY8A 4N9EA 4QSHA 3FA5A 4EOUA 1ICPA 3T78A 1KM4A 1H5YA 3CWOX 3W74A 3M5ZA 1TTPA 1VZWA 3BLFA 1FX6A 4IOTA 3BW2A 4YWIA 1XBVA 1QOQA 4FIQA 3L67A 3R12A 3SW6A 2V82A 3W1RA 1EPXA 3C2RA 2FPYA 1V5XA 4WY0F 3TSBA 3UZ5A 3WK0A 4WOQA 1A50A 3N9SA 1GG1A 2YR1A 2WQPA 1PL9A 3G1XA 3LHZA 3KAOA 5C2XA 1W3TA 3DFTA 3S0CA 1IGSA 4FNTA 1GEQA 4N4PA 3LRMA 3S42A 4OV4A 1T96A 4FNRA 3TDFA 1FQ0A 3UY8A 4UIOA 3HQ1A 3NQFA 3GDKA 3ABSA 4O54A 4UR8A 3FYPA 4Q33A 2V2DA 2CLIA 2WSRA 2E5CA 3DXIA 3SIZA 3W7NA 1NSJA 3S1VA 1YTKA 2V5BA 3VE9A 4BR1A 1X1ZA 5D03A 3CEUA 1DORA 1Y0EA 3LTSA 1JULA 3C8FA 1KTCA 3NEVA 2XN1A 3ZR4A 4PA8A 5CPMA 1LOSA 1TYGA 3W86A 3KVJA 5D32A 3W7CA 4WY0B 3W7IA 1F2JA 1SZGA 3A9IA 1KLYA 3C61A 1S5TA 1KFLA 4AHOA 1UB3A 2QCMA 3PM6A 2OCZA 1KTBA 3IVSA 5DBUA 1AW5A 4HNVA 1IXOA 1MEWA 1J4EA 2C14A 2ZRXA 3G18A 3L21A 3TIMA 4P2VA 4LWWA 1FDZA 5HUOA 1EWDA 5AC8A 4N6FA 1C8VA 4UTIA 3GX9A 3SECA 5CZ0A 4RK8A 1L6YA 4UMBA 4POCA 3EEGA 3E02A 3QQ1A 4RX0A 4PL1A 4RKAA 4NNCA 2FB2A 4AF0A 1RVGA 2BLEA 2V30A 3INPA 3LCFA 1YTEA 1TTQA 4UTJA 4DF1A 4O1AA 4XBKA 5DXYA 4I7UA 4MOZA 1YADA 3LRKA 3CLMA 1VRDA 1D3HA 1K8XA 2ZZ4A 3LXCA 4NT0A 4JX5A 4NJHA 1QAPA 3L0NA 4NNBA 1TTIA 3A24A 1MEHA 3LLDA 4KFNA 5SWUA 4O28A 3CPRA 3T44A 4N02A 4XKYA 1PVNA 1YXDA 3L2IA 3TXVA 4WQ6A 1TMHA 5KITA 3EXRA 4YL2A 1TCDA 2GVJA 2J24A 1X6UA 5LGXA 5A5WA 4UTUA 3C2VA 3MWAA 1MEIA 3W88A 2C3ZA 3TA6A 2NX3A 4K36A 3W84A 2NWSA 1JR1A 3W2JA 2FDSA 3NR0A 3ZWTA 4TMCA 5EL1A 3O16A 1R2RA 5LHEA 1YYAA 3T40A 1TRIA 4R33A 1G4PA 2ZZ3A 2Y89A 3UWUA 1P0NA 1OJXA 4Z1CA 4UXDA 2QUUA 1XC4A 2JKPA 4O57A 5CSSA 1TPWA 3VE7A 3LHVA 5HULA 2VELA 3CM4A 2YGYA 4MUZA 1TV5A 3PBWA 5LZLA 3BW4A 3EWYA 1QO2A 3OIXA 3SGZA 3P81A 1ZFJA 3CC1A 1LRQA 5BMWA 1QWGA 3W7KA 2QCNA 3SY5A 1LP6A 4X3ZA 1FBAA 4HPXA 3T55A 2Q8LA 2ISVA 1OX4B 2E09A 1FCQA 5LNUA 3LCHA 3MP4A 5F2GA 3HGJA 3GAYA 1GTEA 2DU2A 1W3IA 3USBA 4FXSA 1AL7A 2A4AA 3LERA 3VKJA 1OYAA 4IXHA 4D2JA 2QCDA 1JQXA 1KM2A 4QJ1A 3WJWA 2JKAA 3P8JA 3CWNA 2QDGA 2A21A 5EKYA 3AO0A 1G4EA 2Q8ZA 4QIUA 5AYXA 2YW3A 4OQVA 2BSLA 3LHUA 1RD5A 3GDMA 4BI7A 1VCFA 4LW7A 1G7UA 1DV7A 1A5CA 2H8XA 3K30A 4IMDA 2CLFA 3BV4A 3E0IA 2BTMA 1OX5A 1W3NA 1A5BA 3EX1A 3LCWA 1GTHA 1RQEA 1OK4A 2E6DA 2GQAA 5TBOA 3ZWSA 3W7EA 4FX7A 5T26A 3NPUA 1N7KA 4MPQA 5LNVA 1AG1O 4UNKA 7TIMA 3A5VA 3HG2A 3QMSA 1KM5A 4A2RA 1FUYA 3BK0A 3QFEA 4O0ZA 4UTHA 2DZXA 1XBYA 3NNTA 1GWJA 2CU0A 3W2KA 2EHHA 2W6RA 2ZZ1A 2ZTKA 3THQA 2DJXA 3HF3A 4LVDA 4IGHA 1W5MA 5G2IA 3N9RA 4K8EA 4AAJA 4NJKA 3SZ8A 1GT8A 4TMBA 1N55A 4DELA 2ZZ2A 2VFIA 3NL2A 3PG8A 1LRTA 4PH6A 2X1RA 4NUWA 2EKCA 4JXCA 4E2DA 1IXQA 3P84A 4OHQA 2CLMA 3NQEA 3NXFA 3S9YA 3BARA 1EIXA 4PFMA 3CB8A 1U5JA 2RKXA 3G3DA 1X8FA 3WK1A 2DZWA 1FWTA 3IIZA 1JJKA 1D9EA 1A5AA 3MHUA 5LGZA 4A22A 1PIIA 3B06A 1W5PA 1SFLA 2BX7A 6ALDA 4JX6A 1OF6A 4WZHA 3HG4A 4XWUA 3I68A 1P1XA 2Y88A 3NGJA 3UPWA 2YCEA 5D2WA 2QCGA 1JUKA 3G1VA 4GUGA 4HSNA 5HWJA 3GXPA 2FB3A 4ADTA 4IMCA 3WJSA 2FLIA 5FEXA 1H61A 5I3HA 4AHQA 4N9BA 3KRUA 3TJLA 3W1TA 3ABOA 3WK2A 4JTSA 5CPNA 2V2CA 3GXNA 1UBSA 3SI9A 3HG5A 2VFFA 1OFOA 4FX6M 1EX5A 1WQ5A 4LV9A 2Y7GA 1DHPA 1O5XA 2HTMA 4IMFA 3L68A 1ZAHA 1LLWA 5C6MA 1V7YA 3G1YA 4CCCA 1Q6RA 4O17A 1GVRA 5AN7A 1JCLA 1OVDA 2FPVA 4FEZA 3QZEA 2O7SA 3P62A 3R89A 4AHPA 1I8JA 3G1DA 1K7EA 5LHFA 3TV8A 3EB2A 4JTIA 2D73A 4WXYA 4GNJA 4KKXA 3FEMA 4MJZA 3QF0A 2I14A 4LTSA 2XN0A 2J9XA 3PSVA 3MI6A 2GQ9A 5KTLA 1AMKA 3W70A 1L6SA 4CQ9A 1OFRA 1ONRA 2NXHA 1VCGA 1F05A 3UNDA 5HINA 3W07A 1EEPA 4JYEA 3LBCA 1H1YA 1FCUA 2BZNA 2A5HA 3G8EA 2QUVA 2NX1A 3G0UA 4BK9A 4IJBA 3GVGA 4LC6A 3W2UA 3C0JA 2ZRUA 1ADOA 1EWEA 1TTJA 1EB3A 1W5NA 3L5AA 4AMAA 3MUXA 4O4WA 2Z1BA 2OT0A 1TQJA 3B04A 1OFQA 5CPLA 3MO7A 2WKJA 3W75A 1PCWA 3EXTA 1OFEA 3W83A 4FNQA 2YW4A 1C9DA 5K4XA 3P82A 1OG0A 1JCMP 3ELFA 2ZDRA 3KFTA 4R34A 3W72A 2ZBTA 3G0SA 4E2BA 3NM3A 4JR5A 4J9JA 4BWLC 2GUUA 1IIHA 3DI1A 4IX2A 4TR9A 4MJMA 5G2WA 3AJXA 3MW7A 3NQ7A 3UPBA 3M9YA 4JTGA 1JRBA 1GQNA 4LRTA 2Y61A 4O12A 1XUUA 4NNAA 2J9YA 2TMDA 5DCBA 1W0MA 3S1WA 4TO8A 3EX2A 5K4ZA 5D05A 3NOEA 1T8XA 3HGRA 5AYYA 2WO5A 5CPOA 3NG3A 1G4TA 3PAJA 2QJGA 1WDWA 2GJLA 4DO5A 2NV2A 1SZEA 1XL9A 4MY9A 4N9DA 3I6RA 2CLOA 5CKSA 3RMJA 4Y96A 3R2GA 2CLLA 4GRSA 4M7SA 5K2ZA 4IXXA 2NZLA 4DF2A 5K3VA 4G1KA 4ORIA 5U7SA 1YLVA 3LM7A 2CZEA 3RU6A 4NQ1A 3S5ZA 1DL3A 3PS7A 3QYQA 1Z42A 2PRLA 1FY6A 3H55A 2ZRZA 5HUPA 3STGA 3MHFA 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4QQ3A 3DFNA 4HNNA 2ZRYA 1VHNA 4LVGA 2VFGA 5J5RA 3TU9A 4DEFA 2A0NA 2Q3RA 1YTDA 1ML1A 4JYDA 2B4GA 5FF0A 3PULA 2QCDB 3NQMA 4KWVA 4DO6A 4ZQMA 3O8AA 2C18A 1F5ZA 1GVSA 4M5PA 3TFXA 4Y9AA 5HQEA 3TX9A 4O1BA 3W1NA 5CGQA 1QO5A 3LBMA 4I9AA 1LORA 3EWXA 2WSQA 4CCDA 1KM6A 3IIOA 3G1FA 3U8GA 4LY8A 4DO4A 1KM3A 3BO9A 1VPXA 2ATMA 3SFKA 4IX0A 3N3MA 4TU1A 3CQ0A 4EF9A 1CX9A 2NX9A 2R94A 2GVLA 3CHVA 5CZJA 1F73A 1TPFA 3W2NA 1H62A 3DHFA 1KFEA 3O1NA 2ZCGA 4RZ5A 1A53A 5FI8A 1PS9A 1F6PA 5I3GA 3MJYA 4Z1BA 3KRZA 4UCGA 4BWLA 2V5LA 4UTKA 2Y7FA 4OT7A 1LRNA 3W1XA 3WJZA 4DF0A 3TAKA 3HPZA 5KSWA 3PVFA 1ME8A 4UTWA 2A7RA 4JICA 1B4EA 3LCXA 2QR6A 3B0UX 5BRBA 3QRHA 5BOOA 4K6AA 1W31A 3S5OA 5G4EA 4YMZA 4UC5A 3FKRA 2ISWA 3TNOA 1LCOA 3P5ZA 4RR4A 3QSTA 4NJGA 1MZHA 4BI5A 3L0KA 4JDBA 2I9EA 1R46A 4UTTC 4JTTA 2WJZA 2OZ0A 2B7NA 3W1PA 3TC7A 4HIBA 3V75A 2OMAA 3CIXA 5HR7A 3W7LA 3H54A 4ZL1A 3TW7A 3JR2A 3STFA 5EPDA 3W1AA 4PL2A 4JTJA 2RDTA 4UMCA 3FFSA 3QPYA 3GYEA 5AC6A 1H60A 4NX0A 2Z0IA 3P7YA 1GYNA 1ZENA 3NZ1A 2Q3OA 1F6KA 3GIYA 2YDAA 1OHLA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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