1LORA

Crystal structure of orotidine 5'-monophosphate complexed with bmp
Total Genus 79

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
209
structure length
209
Chain Sequence
RLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESI

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTIV4 (181-184)S1 (15-19)AH1 (24-34)3H1 (35-37)S2 (40-44)AH2 (45-51)AH4 (77-90)AH3 (53-63)S3 (66-73)TI1 (99-102)S4 (94-98)3H3 (136-138)AH5 (103-116)TI3 (172-175)3H2 (129-132)AH6 (139-149)S7 (176-179)S6 (153-155)AH7 (161-171)TI2 (157-160)S8 (198-201)AH9 (203-207)TI4 (183-186)S5 (119-123)TIV2 (132-135)TIV5 (182-185)AH8 (189-193)TI5 (193-196)TVIII2 (196-199)TVIII3 (208-211)TIV1 (98-101)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
publication title Crystal structures of inhibitor complexes reveal an alternate binding mode in orotidine-5'-monophosphate decarboxylase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords orotidine monophosphate decarboxylase
total genus 79
structure length 209
sequence length 209
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2002-05-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1lorA00
4DF2A 4NZFA 2CLEA 3W2MA 2X1UA 1WV2A 4QITA 4IMDA 3DKLA 2EAWA 2Y6ZA 1H7WA 1LBMA 1TV8A 1VLIA 1JUKA 1K8YA 4QIUA 1OFPA 1QMLA 2CWNA 3DHFA 1T0OA 4JYFA 1VCGA 4YCPA 2Q8ZA 4DELA 1TQXA 1KW1A 3CTLA 2WSRA 1WYIA 2YFOA 3IIXA 3W70A 5AYXA 3UZ5A 1YPFA 5F4XA 2F7FA 4O16A 1SU5A 1H7PA 3PBWA 1VHCA 4MLJA 3SSJA 2E5CA 1PHQA 3NL3A 4GC4A 3RF9A 2Z6JA 2OX1A 2AQWA 4N9BA 3QMTA 1KM0A 3W07A 3W1MA 4JTEA 3INPA 1UUOA 2VEMA 4ADSA 3GK0A 3USBA 3IIZA 1T96A 3QM3A 4O50A 4KFPA 4O13A 2BTMA 4NJGA 3M7WA 5C5YA 4HNVA 4QISA 3PG8A 5E0KA 1Z42A 4JTKA 3U8GA 5AOUA 5J5DA 1J5TA 1HUVA 2BXVA 4NU7A 5LNVA 2QKFA 2H8ZA 4W9TA 4ZZ9A 1W3IA 3E0IA 4IPIA 1TTQA 3MHFA 4BI6A 5D03A 4JEQA 1IGSA 3GDTA 1SUXA 2ZRYA 4O1DA 1C8VA 3SIZA 2Q8LA 3FEMA 2V2CA 3NOEA 2HTMA 2ATMA 2QF7A 5KTLA 4JTGA 4N6EA 3PG9A 4NNAA 2NUWA 1IIGA 4MZ1A 1O95A 1ADOA 3VI2A 4QNWA 2OT1A 4PCFA 4UIOA 5D2YA 1G6CA 4UMCA 1YDNA 1J2WA 1FCQA 4X22A 2ZZ7A 3DFSA 4LNYA 4NQ1A 4AHPA 4NX5A 2ZRXA 3UY8A 3LXCA 1KM2A 1LORA 1UJPA 5D2VA 1BTMA 3BG9A 3W2JA 4CNOA 3EX2A 2LLEA 2Y89A 5DY2A 3GB6A 1G67A 2Z1BA 4M7SA 2V81A 1BWKA 2E68A 2RDWA 2TSYA 1A5SA 1R30A 2YYUA 4FIQA 3W72A 4RZ5A 2QJGA 1DKWA 2GQAA 2CW6A 3TJXA 4Z0SA 3C8FA 3DU0A 4XZ9A 3M16A 4RV8A 4M6VA 5DELA 2DJXA 1SO5A 3CIWA 4A22A 3AO0A 3WJWA 2QJIA 3MUXA 5CPLA 1W3NA 1F05A 2ZA1A 3KFTA 1G7VA 5G1YA 3W86A 4YCOA 4CCEA 1W1ZA 1B9BA 5D2XA 1JCNA 1LZOA 4JTSA 2J24A 4PFMA 1QO5A 2NZLA 4AHOA 1LOQA 3G1XA 4MY1A 2QCMA 4LRSA 4N4QA 4OBTA 4UR8A 2F84A 3G22A 3O16A 4GBUA 3PR2A 1S5WA 1W56A 1Y0EA 3O6YX 3GNNA 3GLCA 1TV5A 3LDVA 2Y70A 5H91A 3Q2DA 2IQTA 4JDYA 3LTSA 2JBMA 5D38A 3GDLA 5TQLA 2AGKA 1LTDA 3HGOA 1QPQA 3TNOA 3S5NA 1SW0A 3MBFA 4GUHA 2V0TA 4LRTA 1R2TA 1WXJA 2H3DA 3O15A 1ICSA 3JS3A 1NVMA 3GXNA 4Y90A 1R47A 1K7XA 4CQ9A 1LBFA 4XBKA 4JDBA 3OVPA 1R2RA 3RK8A 4JN6A 1VCVA 5EMUA 1DJNA 4JD4A 4MLRA 3NPUA 2RKXA 1VS1A 4NJHA 3W7GA 3W6YA 2J9YA 2QCNA 2JKPA 1OX4B 3BG5A 1OHLA 3KVJA 3DI1A 2X1SA 5BW6A 1FQ0A 3DI0A 3QH2A 3TH6A 2G95A 4R33A 5HQEA 1LP6A 4K8HA 3LLFA 2VEPA 2I9EA 3S5OA 3TE9A 3M41A 4LOCA 2X16A 1SZNA 3W7QA 1W5MA 3PAJA 3LXBA 5LKYA 3CWNA 2WV8A 1K02A 2NV2A 3IV3A 2ZZ6A 3TQKA 3DENA 4N9EA 5D04C 3TROA 5CZTA 2R8WA 1OFQA 5K7JA 3PULA 3TA6A 4Z1CA 1FCUA 2R14A 4L4LA 2GQ8A 3KVLA 3NVTA 3BG3A 4WOZA 3E96A 1WBJA 2FJKA 2I1OA 2HS6A 2DZSA 3P8JA 3WK2A 4N9DA 5J5RA 3IGUA 1RR2A 3LV6A 1EX5A 2ISWA 3A24A 1K7FA 1TRDA 5HWJA 4C1LA 3UQNA 2ATSA 3CIXA 4YWIA 4C1KA 2OT0A 1KM6A 2Z2UA 3SECA 3TW7A 4NXKA 4X3ZA 2ZTJA 3WFAA 1ME7A 2DZXA 2QCFA 3EWXA 3NXFA 3TFCA 3OEXA 3MMTA 4NXSA 3FJ6A 1X6UA 4HSOA 4AB4A 3L68A 4CNPA 2Y7GA 2CZ5A 2A85A 1TPWA 3TK7A 1TJRA 2X1RA 1D3HA 3N14A 2CLLA 1JQXA 1V5XA 3G1SA 1WAUA 4DF1A 3O6CA 5LNWA 2QUUA 1SO4A 5KSWA 1H7OA 1F2JA 3G1DA 5AYYA 1GZGA 3IVSA 5BOOA 5DCDA 3PUEA 1RD5A 3NM1A 3O6DA 4MZYA 4LS0A 4BWLA 1JCLA 2A7NA 2C13A 3M43A 2C15A 2VEKA 3L5MA 2CLMA 4FHAA 5I3JA 2CU0A 4K7VA 3L0GA 1ONRA 1W8SA 3PUOA 3NYZA 3W7HA 2DZVA 2ZZ5A 1FWNA 4LUIA 4S2BA 1SW7A 3A21A 3EB2A 1FCBA 4UTWA 3BLIA 2E6DA 3L65A 1SW3A 1DOSA 2KZHA 4JX5A 3NA8A 5HWNA 2QAPA 3PBUA 5DBUA 2YW4A 3UWYA 1SFJA 4FXRA 1XL9A 3HBLA 1GWJA 1H7XA 1KM4A 1ZNNA 2PRMA 1RZMA 3C2VA 1FDZA 4GFSA 5DCBA 4IX2A 3LTPA 3CPRA 4UTKA 2E1DA 5FI8A 3QMRA 3G1FA 4RXGA 3Q94A 4N4PA 3HG5A 3A23A 3L66A 1WQ5A 4FB7A 3CWOX 3GKAA 4UC5A 5U7SA 2QDGA 3S8HA 5D2WA 2Q3OA 3BW2A 3KOFA 4P61A 4I7UA 1FUYA 3GZ3A 3O63A 4WOQA 1H7RA 3PY2A 3LRKA 4BR1A 1QNVA 4WX2A 4UTJA 3W85A 1EP3A 4IOTA 4XWUA 2ZZ3A 3CB8A 3TMLA 5F2IA 2WQPA 3C2OA 1OFRA 1T99A 1Z48A 3P5YA 1P0NA 3NO5A 3ELFA 3PSWA 1K8ZA 1GTEA 1XBXA 3PS7A 3R12A 4RZ6A 3LBCA 1ICPA 3W2UA 4UTMA 1YDVA 4FF7A 1OYAA 4S2CA 2GOUA 3W7PA 2ZQ0A 3DFOA 3S1UA 3ATZA 3OA3A 5AB3A 1R2SA 3BW3A 3IRDA 4LC6A 2B4GA 3QW4B 2GUUA 3N2XA 1JVNA 5K9CA 2VOMA 2XFWA 1JCMP 4ZQCA 3DFTA 3TSDA 2Y85A 3WJZA 1B57A 4OWGA 4IGHA 5SWUA 4EF9A 4RCXA 1I2NA 3QJAA 5K9DA 3KVMA 1SPQA 3RFAA 1YPIA 3M44A 3HG3A 4FNRA 1GG1A 5DXXA 5HNRA 3R2GA 4IXXA 3CEUA 3W7IA 1TPDA 3DXIA 5BNKA 2X1TA 3CEPA 4GXMA 3HG4A 1OFEA 4BFAA 4RKAA 2CZEA 3L67A 5DN1A 1OX5A 1OG0A 4IMEA 2X2GA 4WJEA 3NQ2A 5L6UA 1XXXA 1EPXA 1XBYA 4FNQA 4Y8FA 4JTIA 4GE8A 3HMJG 1LOSA 1SO3A 4MJZA 3LCWA 5AN7A 3W7MA 3IVTA 4O12A 5HMSA 3SJ3A 4RK8A 1N7KA 4JX4A 1TCDA 3E49A 3W1RA 1LBLA 2QCEA 4NJKA 2QUTA 4O54A 1ZAHA 3TMQA 5D37A 3LX9A 4FO4A 4IMCA 4XTIA 4ZVJA 3NNTA 1KM5A 2VFFA 6TIMA 2GVGA 4GUGA 5AHMA 4XTDA 1YTEA 2P10A 3TC6A 2RHGA 3TX9A 4NNCA 1LROA 1TPVA 4G1KA 2H8XA 3HGSA 1VR6A 1KTNA 3W7CA 1ALDA 4DO5A 3EWUA 1EUNA 2VFDA 3MP5A 1JCXA 1KTCA 3SI9A 3ZWTA 5HJLA 4NJJA 1OK4A 2W0UA 5I3GA 1QWGA 3GAKA 1I2RA 1SQ7A 3EWZA 1GYLA 1MXSA 1ME8A 3TR2A 3OVRA 2VC6A 1JQVA 1FWSA 1TV7A 3W2LA 5EYWA 4H3DA 4RX0A 3GVGA 1TPFA 4O1AA 3IVUA 4TR9A 3RU6A 2EKCA 1XM3A 5DY3A 3W84A 3QPZA 1QR7A 3BGJA 1OJXA 3OVQA 2YXGA 3G3MA 3TSBA 2WNNA 4TO8A 1OFOA 1RPXA 2HMCA 3M5ZA 4MJMA 3PB2A 3D0CA 4OGZA 4MFDA 3KX6A 4MOZA 1MEHA 3W87A 1FWRA 1OFDA 3LRMA 3OBKA 1K8XA 4EF8A 3BO9A 1P0KA 1T8XA 2BWGA 3GR8A 4GRSA 3QPYA 1YXCA 2QCDB 2QAFA 2CZFA 4N2YA 4AHQA 3DFQA 1JUBA 3NQEA 4PTNA 1U5JA 1O4UA 5C2XA 4GJ1A 4R34A 4LWWA 1Q6RA 3I7RA 1ZCOA 4DPPA 4RLIA 3SGZA 3UWWA 2Q3RA 3W1XA 5K2ZA 4AEOA 1YYAA 3TC7A 1TREA 3G0SA 3GYEA 1GG0A 4UFHA 3E02A 3EWWA 2NV1A 4ADUA 3P61A 1JR1A 3QZEA 3LHUA 4AWTA 2ZBTA 3C4UA 4EWND 1NEYA 3L0KA 2FTPA 3THQA 3W7NA 1FX6A 1FY6A 1JULA 5FEXA 1A5AA 4MFEA 5AHIA 4CQAA 3V75A 4IPJA 1HFBA 5KINA 4HPXA 1VYSX 4DPQA 1DORA 2CFFA 1OF6A 1SR9A 2PRHA 4N02A 4QAIA 2B7OA 1A53A 2YFNA 2FQIA 3HB9A 2I14A 3JR2A 2FDSA 4KWVA 1AL8A 3HPXA 3O05A 2QCDA 2P1FA 3GDMA 4O15A 5E93A 3DHDA 4Z0JA 4JR5A 4X9SA 3UXAA 4ZQRA 5IBXC 2V2HA 7TIMA 1G4PA 4LVAA 4KWWA 1EB3A 1THFD 4M19A 3OIXA 1F76A 5G1TA 1D9EA 2JGYA 1AW2A 3CT7A 4L4MA 1MEIA 1H61A 3PUDA 4MYAA 5C54A 3TW6A 3BK0A 4N6FA 3B0UX 1LOLA 4DXVA 2PURA 3AJXA 4OV9A 3ABRA 4LV9A 3SY5A 1LRTA 4E38A 4WD0A 3LCFA 1VCFA 1LLZA 3EXTA 2BZNA 3UY7A 4O0KA 4BK9A 1VLWA 3MI6A 4NJIA 1DQXA 4UTTC 2OMAA 1GVFA 2PCQA 2FPVA 5D09A 4GNJA 4LT9A 3EXSA 3M47A 4QNEA 1KTBA 1XC4A 3G8RA 3S1XA 3LV5A 5AYZA 1EIXA 2DP3A 1YLVA 1H50A 3O07A 4WXZA 2C6QA 3W7LA 1CI1A 2V8ZA 3CM4A 1KFLA 1XUZA 5FF3A 4AWSA 4HNTA 2ZRZA 1PL9A 1SZGA 1DHPA 4FNTA 5C55A 2Y7EA 1HO4A 1BWLA 4ORIA 4EIVA 3FFSA 3WJXA 1AK5A 2CLOA 4MY9A 3LTYA 3MI2A 3I7QA 3SR7A 2OZ0A 1M7PA 2CLHA 1P1XA 4JGDA 4OQVA 4AWUA 2GPTA 4P2VA 1WOAA 2TRSA 5LNSA 2NX3A 4Y9AA 4FEZA 4FNUA 4HHPA 3P62A 4S1FA 2ABBA 5A8GA 1O94A 2O7SA 1E51A 3A9IA 4I9AA 3W83A 3W7JA 2HSAA 1VJIA 3C56A 1VYRA 4LUJA 2TYSA 1VHNA 2EGZA 4Y6GA 1F6PA 4DO6A 1L2UA 2VEIA 3R8RA 3C0JA 1KFBA 4XBSA 1OFAA 2J27A 4O8RA 1OF8A 1TSIA 3W1PA 4JIPA 1CW2A 2YZRA 4Z1BA 2ZTKA 2C19A 3HIJA 2WSYA 4O14A 3LHZA 1ZAIA 1G4EA 1J4EA 3BVJA 3V1PA 3NGJA 5F2MA 1DJQA 3UWZA 3GIYA 4LY8A 3BW4A 1H63A 3LCXA 3LI1A 4MY8A 1WOBA 1F7BA 1W5OA 1FWWA 4JS3A 3HPZA 1PCWA 3W1LA 3OHIA 3PBYA 2FPYA 1OX6A 3F1QA 2YX0A 3GX9A 4TMBA 3W7DA 3QFEA 3BLEA 4A21A 2WPBA 3FKRA 1PCKA 1RQBA 3C3NA 3QSTA 3A5FA 5AHFA 2D73A 2FB3A 1GOXA 2JK2A 3NQ6A 5F1VA 5KZEA 3MP3A 1MO0A 3P5ZA 5HR6A 3QF0A 1L6WA 3P8IA 1KM1A 1VPXA 2PE4A 4FX8A 5HINA 3FJLA 3H54A 4O19A 1I2OA 3STEA 5F2GA 4UNLA 4O18A 1GVSA 5AFDA 3FYPA 2V5LA 1L6SA 2JKEA 5KZMA 2ZZ4A 3SW6A 4M5PA 2B7PA 2DZUA 3GR7A 5F1UA 1N8FA 4K39A 5DLCA 3U6WA 3QEZA 3NQFA 2YR1A 3DKJA 2YGYA 2QUVA 1X7FA 5E1QA 3C2EA 3UWVA 2G5WA 3N19B 4KFOA 1KA9F 3UWUA 4LS2A 4GUFA 1TPEA 2WNQA 4PL1A 3LRLA 3PVFA 1YDOA 3HJZA 2GVLA 4JTLA 3C2FA 3GAYA 4JTFA 1OVDA 4RZ4A 4WQ6A 4A29A 4XQ6A 3TSMA 3W23A 4B5NA 4ICNA 3FA5A 3LHYA 1KV5A 4QJ1A 1C29A 1F5ZA 3DBPA 1JUEA 1S3HA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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