1LUCA

Bacterial luciferase
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
355
structure length
326
Chain Sequence
MKFGNFLLTYQPPELSQTEVMKRLVNLGKASEGCGFDTVWLLEHHFTEFGLLGNPYVAAAHLLGATETLNVGTAAIVLPTAHPVRQAEDVNLLDQMSKGRFRFGICRGLYDKDFRVFGTDMDNSRALMDCWYDLMKEGFNEGYIAADNEHIKFPKIQLNPSAYTQGGAPVYVVAESASTTEWAAERGLPMILSWIINTHEKKAQLDLYNEVATEHGYDVTKIDHCLSYITSVDHDSNRAKDICRNFLGHWYDSYVNATKIFRIDYSYEINPVGTPEECIAIIQQDIDATGIDNICCGFEANGSEEEIIASMKLFQSDVMPYLKEKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The 1.5-A resolution crystal structure of bacterial luciferase in low salt conditions.
pubmed doi rcsb
molecule tags Flavoprotein
source organism Vibrio harveyi
molecule keywords BACTERIAL LUCIFERASE
total genus 127
structure length 326
sequence length 355
ec nomenclature ec 1.14.14.3: Bacterial luciferase.
pdb deposition date 1996-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00296 Bac_luciferase Luciferase-like monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.30 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Luciferase-like domain 1lucA00
3FGCB 5LXEA 1YW1A 1TVLA 3B9OA 1M41A 1RHCA 2I7GA 5AECA 4US5A 1NQKA 3C8NA 1NFPA 1LUCA 3RAOA 4UWMA 1FVPA 1LUCB 1EZWA 5DQPA 3SDOA 1BRLA 4US5D 1Z69A 3FGCA 1F07A 4J2PA 2B81A 3B9NA 1BSLA 3B4YA 1XKJA 1BRLB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5DBTA 1JPIA 5FJIA 4IMDA 3S2MA 4RUBA 3ENLA 1ZP3A 3GC4A 3QHOA 1X97A 3MCMA 1ZBCA 1DOSA 1QXLA 4BK9A 1B3ZA 1CT5A 3VIIA 1IWPA 2Y7FA 1QI4A 3K8MA 2A3CA 2P76A 3GHSA 4CNOA 1BGGA 3WQ6A 3O3RA 3XINA 2IW0A 1QBBA 3LZ3A 2QXWA 5C6MA 4UQ9A 1PDYA 3EDEA 3M0LA 3RMEA 3WUGA 3TFXA 4RL3A 3NSMA 2QT3A 3RYSA 1S38A 4NJHA 4XVDA 4RKAA 1J10A 1H61A 5AYBA 3PY2A 5HNTA 1HL2A 3PANA 4UTTC 4XK2A 5A8MA 1GW9A 4NZ5A 5D02A 4U28A 3VMPA 2PGWA 1QW8A 1PIGA 4URIA 2H8ZA 4C6PA 1H1YA 3FA4A 2OZ8A 4LT9A 4V28A 4F0KA 2WBGA 3PBWA 4GPNA 2W79A 4HK7A 1SU5A 3CNYA 1DQWA 1ECQA 2PAJA 3CQ0A 3LLXA 1VH7A 4DJED 2ZKMX 1GOQA 3KWSA 4UMCA 1GT8A 4IGMA 3FLUA 1DJXA 1RP9A 3NZRA 1TJ1A 3BG9A 3S2LA 2YXXA 3WQ4A 4UR8A 3NXLA 2VEKA 1LROA 4GBDA 2Z1BA 1HNYA 3CHCA 4OQVA 5CBIA 3SY5A 1QHPA 1U83A 4AY7A 1XS2A 2Y5JA 3GHUA 3TYUA 2HSAA 1E55A 3KP1A 2VR4A 5EYWA 4JQAA 3TDFA 5G4WA 1N2VA 4N2YA 4AD0A 1GZ1A 2NQZA 3KAOA 3BPWA 3EWDA 4LANA 1L9WA 1CXEA 4Z0SA 1IXNA 3TFCA 1VPYA 2OEKA 4ATLA 2V2DA 3M1ZA 3CJPA 3W7MA 3UW6A 3Q4DA 1XSIA 2QS8A 4AX7A 3GVVA 1E73M 5CC7A 3F4NA 1KKOA 1XPGA 1NDWA 2GGGA 4IZGA 3QVQA 2IPFA 4YN5A 3LNMA 4LV4A 3SQMA 3CBWA 3WEZA 3CIVA 1DQXA 3C3NA 1UD8A 3MUIA 1WKEA 3ITCA 2AL1A 4P8VA 5A2BA 5M1TA 3USZA 2QDGA 3AJXA 3O6YX 1JZ5A 3N2TA 1D3GA 4QSFA 2C3ZA 3W84A 5IDIA 4C60A 5FSDC 5E9XA 5I06A 3I4EA 4Y96A 3OEXA 4KESA 1M53A 3SUUA 1LOQA 1VGAA 1UKQA 4AZHA 1UA7A 4GI4A 4IQDA 3TYZA 3C0LA 3WNLA 2KZHA 5FSEC 1ISYA 3VCNA 3VMOA 4H6EA 3U5UA 3JRKA 3URAA 3EB4A 4JNYA 3VU2A 3WFZA 2IQDA 3PSVA 3CYJA 3LNPA 3LSCA 4PCPA 1XIHA 2J4GA 1F7BA 3N14A 3UZZA 3GU2A 5I2UA 3W7CA 1OX5A 1BVWA 3VNZA 1TJRA 1H09A 1GJWA 4LS0A 1BTMA 1W2PA 1HL8A 2XG9A 1TTJA 4GBUA 4HN8A 4FXFA 3MKKA 2OEMA 2YDAA 1W9VA 4WJ8A 4GIAA 1B4KA 1IZKA 3KLLA 2GJNA 5MF5A 1D9EA 5KZEA 1OK4A 3QOMA 3W7QA 4J5NA 2PGEA 4V15A 4JTLA 4XD3A 3VDHA 3RCYA 1TZ7A 3RDKA 4DXVA 2IMRA 3AAMA 2JF6A 2IKHA 1H7OA 4YTRA 4N0RA 1S2CA 1DXFA 1YW1A 5T91A 2NW0A 2Q8ZA 3NL6A 2W63A 3GFXA 4AMCA 3V0UA 3OZMA 3DUGA 4M6UA 1UZDA 1E72M 2OMAA 1UJPA 3ITGA 2PA6A 5IBXA 3GG1A 2XIIA 4XBSA 3F4CA 4MJMA 2DT2A 2Z6JA 1ZSXA 2PFHA 3H2FA 1Q7QA 3M5XA 1JIBA 1BYAA 4D6EA 1P48A 5CEWA 1B1YA 3NOEA 3VOFA 3U48A 3KHJA 4ZOBA 4MJ2A 3P0XA 1KRAC 1EUNA 3H23A 1CGTA 1IWAA 3M44A 1EJUC 1QDSA 4LU0A 4UFKA 4X9SA 2YDRA 1MEIA 3MDUA 1JF6A 4PCFA 2GDVA 3OTRA 2B7OA 4Q32A 2J7GA 3AROA 1Q2SA 4Q8NA 3B4YA 2EG7A 2WCGA 3QOKA 4UTJA 1ISXA 1OCQA 5EBUA 1RZMA 3L66A 4Z1DA 3H26A 3DYPA 3P8IA 4GFIA 4C6QA 3MU7A 1QMLA 1K8ZA 4DZAA 1UOKA 4HYWA 2X1TA 3WQFA 1R3YA 1V7YA 5E6ZA 3HIJA 4CGTA 3LOTA 4IX0A 4TR9A 3M16A 1TV3A 3RLHA 1V8EA 2YZRA 2QUMA 1AZ1A 1ML1A 4M7TA 3NVDA 1QASA 3NURA 1QVBA 4I8DA 1GEQA 3H53A 1RVGA 4XKMA 2ISDA 5F7UA 3FKRA 2IQTA 5CZTA 4Z2LA 2GGEA 4I7VA 4PMZA 3UJFA 1H7RA 4JYFA 2Z29A 3I7SA 2X41A 3WLQA 3RFAA 1PVNA 3W38A 1Z89A 2FB3A 3QF0A 3S5SA 1PSCA 1O12A 3GNRA 2P3ZA 1IEQA 4ACZB 2GQ8A 3UCQA 1VCGA 3W76A 4ZQMA 4GI8A 2VL4A 3VZZA 2I16A 4GO8A 2G0WA 2BOFX 3V1PA 3W6LA 1KBIA 1M65A 2FH6A 3VKKA 4AYGA 4CVUA 2E3ZA 4GZIA 3A5VA 2ZZ6A 1XSJA 4LY8A 3WUEA 1W3HA 1OG0A 4WY0F 3F5LA 1O66A 5FL0A 2BZNA 5K2ZA 3W7HA 1MNZA 5JIWA 3VNLA 4WK9A 3Q58A 4X60A 4UQEA 2J7CA 4DO5A 2FGBA 4UQDA 3C2OA 3S9ZA 2RAGA 3S9YA 2O92A 1ZY9A 1EGZA 1PBGA 1KLYA 2PMQA 1OIFA 4R7OA 4ICCX 1NFGA 2QUTA 2E09A 3ZLGA 2VX7A 4BA0A 3PJTA 4LUTA 3WJSA 2DEPA 1CXLA 4GE8A 3NA8A 4LV9A 4L65A 4QFUA 1P0KA 3VINA 1IQ8A 3GZAA 3OO2A 2WNZA 1GOOA 2Y85A 4OBSA 3REQB 3BLLA 1V3LA 1CGVA 1J0KA 4UC5A 4PTMA 3PWGA 4N02A 1TJ2A 2NWSA 3VKCA 5PTDA 1OCBA 4GVGA 4LRTA 5TNVA 3OIHA 4OIFA 4V2XA 3VE9A 1TZZA 2CKSA 2H6RA 3H2AA 1RBLA 4HOWA 3M0MA 4X2RA 3THQA 2V2CA 1TMLA 4AF0B 2QCCA 3B0VC 3K4WA 4KRTA 2ZE0A 3CUJA 3VIJA 3M5YA 4GY1A 5ABGA 2PEVA 3HMCA 4LS2A 1XLHA 4Y9AA 4MB3A 4FNUA 4DWSC 2WWDA 4NP7A 3WFAA 2W5FA 4Y9PA 3GXPA 2J8GA 4K37A 3QKEA 4BI7A 3WLIA 2L5HA 1RVKA 2BXZA 3AIRA 1GTEA 3BZGA 3SIZA 1YPXA 2I1OA 5A2CA 3RLGA 3WL1A 5AY7A 2WVUA 1XIIA 3DX5A 4DLFA 3H70A 3VD3A 3KE0A 3PJUA 3HB9A 5C9UA 3EWXA 4IT1A 2J7BA 4M3PA 3BLDA 2WKLA 3SFWA 3U5YA 3HURA 3A12A 1T41A 1V3KA 4AF0A 3C0JA 3B0PA 3UXDA 3LTSA 2WC3A 4KKXA 2ZUTA 4HKPA 4QM1A 3RIKA 1G4TA 4W84A 4BQ3A 4JFWA 3GHRA 4QJ4B 4QCFA 2UY4A 3V35A 1CB7B 4XIAA 1MQPA 4HBKA 4YCOA 4ZTXA 6REQB 3P80A 1W17A 3R13A 4LVBA 3ES7A 4J3UA 4FR1A 2X1IA 3VOIA 2DH3A 1Y0EA 4HOXA 4NX0A 1NP2A 1NOUA 1VLIA 3HV8A 3DKLA 4GKLA 4JEQA 4E5TA 4D6FA 5CLTA 4UQBA 3OU8A 1O5RA 1Q6QA 3G1HA 2NVAA 1IGSA 2DPEA 3VDCA 4LTSA 5SWUA 3UR2A 1EKOA 1S46A 2A3HA 4S23A 2YYUA 3NDOA 2WPGA 3C61A 3MV11 2E4TA 1KTNA 1TWZA 1CDGA 4IGNA 3QFWA 3WUBA 3JZEA 5H8MA 2AQOA 1DXIA 1VCVA 2D2GA 1C3FA 1A49A 5DMNA 4MKSA 5BW6A 4QS6A 2PS2A 1WXJA 2HS8A 1JPDX 4WKAA 2WC4A 5A2AA 3ZSTA 1EIBA 4KWUA 4E2OA 1KFCA 1XQKA 1E6SM 2HVNA 4O52A 4B16A 5DMLA 1E0UA 4IPNB 3ARUA 1RY0A 1UIPA 4PSPA 1BVNP 3E0LA 4RCXA 4HHMA 1ADDA 4OBRA 3QC0A 3NVTA 1JZ3A 2EXOA 4L61A 3P5ZA 1W54A 5C2XA 1J0ZA 4PMNA 3LDVA 4H6QA 2OYKA 5CH9A 2ZZ5A 3QGVA 5AHMA 1XIDA 1A5UA 1KM3A 4PRTA 4DJFA 1VBRA 2E5CA 1UWTA 3ZJ7A 1UP3A 4BWLC 5I78A 3HF3A 4C6FA 2ZX5A 1SZNA 2HEJA 1YE6A 1R2SA 4N42A 2F2KA 2EQDA 2BTMA 3KL5A 3WO8A 1XLJA 2I9UA 3RCNA 2DSUA 1B3YA 1XQLA 2I57A 3G6MA 4O11A 1GVOA 1XC4A 4S3JA 4U2ZA 2OKOA 1ZENA 5BRPA 1WDSA 1X6NA 4MWAC 3WNKA 3FIGA 1S1PA 4LQ1A 3HPXA 4DAIA 4GYFA 1B0IA 4IPJA 1NM9A 4FI4A 1PZ3A 3MC5A 1DWAM 3KTSA 3LMYA 2BOGX 1EGMA 1RK6A 3MYPA 3WJYA 3BGAA 1KCXA 4ENLA 4JEJA 1GQIA 3IIVA 4WIWA 1TO3A 2VYOA 2W9MA 3UY8A 1LLWA 2PZNA 4LAKA 2Y70A 3QJAA 3QXBA 2DIJA 4H41A 4EXAA 4RNFA 3SDOA 2VO5A 3D5HA 5LIWX 1OCJA 3N13A 2CWNA 2FTPA 5KITA 5GQBA 1V51A 3O16A 1VIZA 4E3TA 1SJDA 2WVVB 3P62A 2BVWA 1OX4B 1TVNA 3ANUA 4PZVA 1PHQA 4GQRA 4RJEA 4FNRA 3P81A 3MP3A 1YNYA 4QJ1A 1UIOA 5KEZA 3AS0A 4C5ZA 1E3XA 2FZ8A 2J79A 1G7VA 1QK0A 4TU1A 4CCZA 1V3MA 4LUSA 3O2LA 1IE7C 3CH9A 3R0KA 1M7OA 4RR4A 2NV1A 4D72A 1XG3A 3GG8A 5HJXA 4QISA 2WOQA 3SO7A 1UC5A 1YDOA 2NT0A 3AZRA 2QCMA 4IH3A 4ROQA 4BF7A 3GXDA 4AZCB 4RLIA 3L2IA 1H50A 3AALA 1KWGA 4JX4A 1IEXA 2DORA 2VRKA 1G0CA 1A0DA 3XISA 4HZ6A 2VGFA 4PUUA 4P5UA 5M5DA 3MTWA 1X96A 4HNVA 3S46A 2TMDA 4O1AA 1C8VA 1TG7A 1OX4A 4PB3A 1LDCA 2OO0A 4IMEA 1E6QM 2PDWA 5ABTA 1E51A 4FIQA 2FVKA 2WM1A 4ZQCA 3BW3A 3OLDA 1C93A 4MTVA 3A22A 4E4PA 3CIXA 1YDYA 3EEZA 1JPHA 3F1QA 1KBBA 3M0ZA 3M9YA 4JTQA 4LW7A 4CN6A 2YL6A 2AAAA 1AL8A 3BLPX 4F0MA 4I90A 4F2BA 1H0GA 2DUAA 8RUCA 3LENA 1PAMA 2PWEA 4AZCA 4QJ3B 2VVSA 3EA2A 1HF6A 3FEMA 2QJHA 3GU1A 2QUUA 1BYCA 1KFBA 4WCJA 3H2NA 1KFWA 1S5VA 5EKYA 2ZA3A 1KRCC 3V5FA 4FPSA 3A4XA 3F5KA 2OSYA 2PURA 3SRFA 5DY2A 1S3TC 4QG6A 4WSKA 4JTIA 3H7UA 4XKYA 4NNBA 4Z2IA 3NWRA 4JTHA 2ZRUA 4GH1A 4WXYA 1WQ5A 3G1VA 4D6DA 3HV9A 1MXDA 3SRKA 2ZADA 3UY7A 1K8YA 5EB8A 3ANYA 2X2YA 3QR0A 1HXJA 1MSSA 4IIFA 2PDXA 1O5KA 2TODA 3S6TA 2OB3A 1HJWA 3L65A 5A6LA 4M6VA 2GUUA 4LCQA 2YBUA 3S83A 3TN6A 3VNKA 1REQB 2X42A 1TIWA 3HQ1A 1XSKA 3UPMA 2QUNA 4YYFA 1JG9A 1QOQA 1E0XA 4DEFA 3OOQA 3VNYA 1G4SA 3WQGA 5A6AA 2ZWZA 3EB3A 4HPXA 4XAZA 3AI0A 4MPKA 4ZL1A 1PTAA 4V1YA 1DE6A 1DIDA 5EFDA 1KFKA 1EO7A 3F7JA 2CLOA 3N2CA 1O94A 4FXJA 3CPRA 3GE7A 1QUMA 1JR1A 4YMZA 3LXCA 3PUEA 3OLGA 2W27A 2Y1HA 4PMRA 5MKGA 1KLZA 2WO5A 4TX6A 3PAOA 4EPEC 5GPRA 1ZZMA 3IEBA 1V6VA 2YA1A 4JIIX 1BSIA 2DU2A 4C91A 2GQAA 4M82A 2GJRA 1YPIA 4XBJA 1WZAA 1V93A 3RX3A 3HMJG 4G7FA 3GDMA 3BJTA 1XXXA 5TD4A 1Z7AA 1NU5A 2DIEA 1YKWA 2XYLA 1BRLA 1CWYA 2NV2A 1Z69A 3V7PA 2QV4A 5IFPA 4RNIA 3QPYA 2VZUA 1I6NA 3T4CA 2XTKA 1VPQA 1F3EA 5CAKA 2C13A 1UOZA 2WHMA 2CXGA 4HPHA 3BE7A 1X38A 1G67A 1ONXA 3SQSA 5HUPA 1SZFA 1AJZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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