1M03A

Mutant streptomyces plicatus beta-hexosaminidase (d313a) in complex with product (glcnac)
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
499
structure length
499
Chain Sequence
DRKAPVRPTPLDRVIPAPASVDPGGAPYRITRGTHIRVDDSREARRVGDYLADLLRPATGYRLPVTAHGHGGIRLRLAGGPYGDEGYRLDSGPAGVTITARKAAGLFHGVQTLRQLLPPAVEKDSAQPGPWLVAGGTIEDTPRYAWRSAMLDVSRHFFGVDEVKRYIDRVARYKYNKLHLHLSDDQGWRIAIDSWPRLATYGGSTEVGGGPGGYYTKAEYKEIVRYAASRHLEVVPEIDMPGHTNAALASYAELNCDGVAPPLYTGTKVGFSSLCVDKDVTYDFVDDVIGELAALTPGRYLHIGGAEAHSTPKADFVAFMKRVQPIVAKYGKTVVGWHQLAGAEPVEGALVQYWGLDRTGDAEKAEVAEAARNGTGLILSPADRTYLDMKYTKDTPLGLSWAGYVEVQRSYDWDPAGYLPGAPADAVRGVEAPLWTETLSDPDQLDYMAFPRLPGVAELGWSPASTHDWDTYKVRLAAQAPYWEAAGIDFYRSPQVPWT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Aspartate 313 in the Streptomyces plicatus hexosaminidase plays a critical role in substrate-assisted catalysis by orienting the 2-acetamido group and stabilizing the transition state.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-N-acetylhexosaminidase
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces plicatus
total genus 186
structure length 499
sequence length 499
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2002-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1m03A01
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 1m03A02
1H5VA 1HIZA 2VRKA 1JZ7A 1BG9A 2GJXA 3SURA 4J3UA 5BRQA 1V0MA 1XSKA 3QGVA 3ZMRA 1UH3A 3AQUA 2OWXA 5DMYA 2WHLA 2BNJA 5A2BA 2VZUA 1QNOA 2E9MA 1AMYA 3DHPA 4ACYA 4J27A 4V2XA 3WF4A 5A6AA 4D1JA 5BROA 3WFLA 2V3GA 3W6MA 1EA9C 1K9TA 3ZR6A 5JIWA 3T2QA 3VGEA 1M04A 5D9NA 4B3LA 5KZ6A 1CYGA 1E4LA 1OD8A 1QHPA 3ZSTA 4F9JA 2EBNA 4PUEA 4X0NA 3ZJ8A 3UERA 4OIFA 1VB9A 3AS3A 4IUGA 4JL1A 1KFWA 4BQ5A 1NWRA 2ZUUA 3CZLA 1HF6A 3GDBA 4H8UA 4JCLA 3BAWA 1WO2A 1PX8A 3KL5A 1LL7A 2WMKA 4JZ5A 4C90A 2X0HA 4CKQA 2WCAA 1HP4A 1BYAA 2WSPA 1J18A 3AZTA 3GM8A 2GDUA 2QLYA 2WC4A 5BWFA 2EPKX 4UOQA 4TTGA 1UD4A 2WC7A 2EXOA 2JEPA 2G3IA 1IT0A 1JAEA 1KCKA 3BMVA 1B2YA 1V0NA 1GNXA 2ZUWA 1MW1A 2DIJA 1XD1A 1OIMA 1JF6A 4GXPA 4JHZA 4HA3A 4UQ9A 2VQUA 1H2JA 4J7RA 6CGTA 3AXIA 3VO0A 4OOZA 4MB4A 4MAVA 1JD7A 3JUGA 1QI2A 3OIHA 4J3WA 2E3ZA 1W2PA 3ARRA 4V28A 2GK1A 1NWUA 1JXKA 2QF8A 2WHMA 3UR8A 2ZUSA 2XFYA 3L2MA 5EMYA 3M07A 4EE9A 3SCSA 3IJ7A 1JD9A 2OWCA 1CXIA 3WF0A 2XIIA 3EDFA 3WMCA 3CPUA 1GOIA 3AICA 1UWRA 3EBVA 2XVPA 2BY1A 1UR2A 2A3AA 3AMDA 4TXEA 1H0GA 4UFJA 3TTSA 3VGGA 2BY0A 1BGGA 4N0RA 1C90A 3L4TA 3PTKA 2WB5A 5ECUA 3N13A 3WDIA 3O2LA 4LQ1A 4HPGA 5IFPA 5LA1A 2JALA 5CLTA 2YBTA 3QHOA 2J75A 4PMVA 3F5LA 4WIWA 3M7SA 3EMZA 2BV9A 1E9LA 1XSJA 1RH9A 3KL0A 3KWXA 4CUCA 4XB3A 4AWEA 1CGTA 4BA0A 3ZJ7A 5CPTA 1JYVA 1GJWA 2QMKA 4FLQA 2AMGA 3BAXA 1J12A 2BY3A 4UQAA 3TTQA 1PIFA 3A6OA 2PBOA 1M53A 3DC0A 1PIGA 4AYSA 3ZT6A 8A3HA 3K1DA 5DT5A 2VX7A 3OGSA 3UCQA 3MMWA 3ZJKA 4MADA 4M81A 3SUUA 3S2CA 3VDBA 5CLWA 2O9PA 5C71A 3WEMA 1PZ2A 5FD0A 2PI6A 1E1FA 4W5UA 4P8WA 4QDMA 3UETA 2PBGA 3FAWA 1MW0A 1QBAA 1V0LA 2J8GA 1OSEA 4ML4A 2VRQA 1BAGA 5AY7A 1UHVA 2E8ZA 4J3TA 1HX0A 3WD1A 4MJ2A 1C7TA 3K8MA 4CGTA 5I5RA 3VD4A 2PC8A 4BF7A 2G3MA 4P7LA 4GI8A 2BY2A 2J77A 2WVVB 3AXHA 1ITCA 1TVNA 1CGWA 1JZ3A 5CGMA 1UWIA 1RP9A 3KL3A 1W3LA 5LA0A 4E2OA 4P8VA 4ATLA 1SYTA 1OD0A 1QNSA 2CIPA 3ECQA 4MNKA 3OGVA 4HU0A 1X1NA 2XGIA 2ZX6A 4UFLA 1CLXA 1UD5A 3VGFA 1PJ9A 1W9DM 2WSKA 4FF5A 2VI0A 1JNEA 1V3IA 2DQXA 4RE3A 1GZJA 4W84A 4P7QA 2WMIB 3NYDA 4AD2A 4R5EA 2O9TA 3NSNA 5A6MA 2VMFA 1CLVA 4MNMA 2GSJA 3VIPA 3MKKA 1NQ6A 2FH8A 1IZJA 3VIMA 3PZOA 1PPIA 4W89A 1QHZA 2VCAA 1C8YA 2PWGA 5A6KA 2WYSA 1FH7A 3PZMA 3UEQA 1J01A 3B8SA 4YPJA 1JZ8A 4WF7A 1OT2A 3CTTA 4W88A 5AC4A 3BSHA 5FKYA 2GJRA 2E9LA 1JZ6A 1JIBA 2CYGA 1J0IA 3VX0A 3WNMA 4ZE5A 1E72M 1B3ZA 1WZAA 1GJUA 3AIQA 1V6YA 4XX6A 5A6LA 1V6WA 2DIEA 5BXRA 5CQ1A 4UOZA 1GOQA 1HKMA 1VJZA 1EQPA 5FCZA 2XTKA 2DSWA 4J28A 2E0PA 1KWKA 3AOFA 4AD5A 4PMNA 2QMJA 1J0ZA 4BS0A 4MDOA 4IISA 3DYOA 4MNJA 2Z1KA 1V3HA 4BZYA 1JDDA 3WH7A 3W81A 3VINA 5BRPA 4HZ7A 3DYPA 1BQCA 1LQ0A 1WP6A 3T09A 3WNKA 1CNVA 1B0IA 1E43A 1KGWA 3GXMA 1JI2A 1E5JA 2GJPA 3OLDA 3A4WA 2WAGA 1QNRA 2CITA 4RE2A 1HKJA 3U7BA 1BYBA 4FLSA 1FHDA 4P8XA 2D2OA 4OBRA 4AEEA 1DWFM 3FHAA 1FOBA 2J74A 1DHKA 3DHUA 3BAJA 2JE8A 1B9ZA 4JCMA 2UY3A 3GXIA 1GONA 3WD3A 3TOPA 5HDRA 3WDQA 3EDKA 3FW6A 1DWAM 1J0HA 2ZXBA 3MMUA 2B31A 1JFHA 1H4PA 3WUFA 2OWWA 5AC5A 4PMUA 1CDGA 4PSPA 2D1ZA 2BFGA 3T0AA 1NARA 3W37A 4BCEA 1Q6GA 1CXKA 3WF3A 4M56A 4PN2A 2XWEA 2A3HA 4PSRA 3WN6A 4C91A 1E4NA 2W5FA 3LMYA 3OZPA 4GI6A 1CXHA 3SCNA 4DM2A 3VD5A 2YL9A 1XCWA 1XH0A 4KGLA 1UZ1A 3SIMA 1ODUA 2C0HA 4LPCA 4GZJA 2C8NA 2EJ1A 1AQMA 1E0WA 3AXXA 3UG4A 1ESWA 1LL6A 2JIEA 5LYRA 4WSJA 1DEDA 1S46A 2WKLA 2WVVA 4HOXA 3WDRA 1EDQA 2WWCA 1OCQA 2CKRA 2DDXA 2G3NA 2XVGA 1FH9A 4CN1A 2EPOA 3SUSA 1V02E 1EQCA 4JIEA 4QCEA 4JFVA 3T2PA 1DTUA 3B9AA 4ZEPA 2FHFA 3ZIZA 5C8BB 2NT0A 4GZEA 3QHMA 2OSXA 3PZ9A 3WD4A 2CHOA 2W92A 5AYBA 2BHUA 4B15A 1TCMA 6TAAA 3CZJA 1E0XA 4F79A 3L4VA 5IDIA 3POCA 1JDCA 3CZGA 2DH2A 2WMIA 1RP8A 5GNXA 2DGAA 2WNWA 2YLAA 3AI0A 5FIPA 1EOMA 1NWTA 1E1EA 4EKJA 4PMDA 3MUAA 1UWTA 4KRTA 3NUKA 4ACZB 1CGVA 1K9DA 1QI0A 1V3JA 3AS0A 2ZX5A 2VR5A 5EFFA 2J78A 2WANA 4H7VA 4U2YA 3PZUA 1EH9A 5E09A 5M03A 3IK2A 3RM4A 1E3ZA 4AZHA 3NDZA 1AQHA 4DWSB 1E6ZA 1H11A 4AXNA 4DUXA 1W9UA 4EAMA 1GQJA 1BTCA 1FA2A 4WK9A 2YDRA 3UG5A 1LWHA 3AHXA 2D3NA 1UR9A 2CCRA 3APGA 2V5DA 5BXTA 3WNNA 1JF5A 2J79A 1PZ3A 4U2ZA 3AIBA 1C8XA 1UZ4A 2UY4A 4D71A 1MQRA 5A8NA 3AIUA 3WH6A 3UG3A 4XV0A 3RIKA 1QI5A 3MMDA 3CHEA 1C91A 1RPKA 1HJQA 2WBGA 2PWEA 1HVXA 3BXWA 2J7DA 1VBRA 3AZSA 4N42A 4AC1X 3VIKA 1K9EA 3WY1A 1E6SM 2GVYA 3L2LA 4FLOA 4RE4A 2EO7A 1V3MA 5JIPA 2VR4A 3ARSA 4NZCA 1E55A 1QHOA 5CSYA 1LF1A 1EDGA 3WNLA 5CPSA 5HPCA 3GH7A 3W38A 5BXPA 1N82A 3PTQA 2J7EA 1XV8A 2XVLA 2RGLA 1Q6CA 2DT3A 1V6XA 5M5DA 2ZX9A 4Z2JA 4CU8A 3GXFA 2EPNA 1J0KA 4M29A 5IFTA 4NF7A 2Z1SA 4U31A 4CVUA 3SUTA 2V3FA 3N9KA 3D3AA 4HTYA 3WNPA 2YIHA 2J7GA 2JF7A 1OINA 3N1AA 1MFUA 4D72A 1FHLA 3CIVA 4DUWA 1JAKA 1HJSA 1E71M 1KB3A 4UFKA 1M03A 1ISWA 1ISXA 2F2HA 2XGBA 4H41A 5A6JA 1ZJAA 1HJUA 3W28A 2XG9A 4AZBA 2HVMA 3SCPA 2DT0A 1MYRA 1JZ4A 1QNQA 1HL8A 2FHCA 1SMAA 2VZTA 1R7AA 3AHZA 3W27A 2OYMA 4PTXA 1CPUA 4TUFA 2A3BA 2UWFA 1UA3A 4GIAA 3VIHA 3MU7A 5D8WA 1UUQA 2VURA 3ZJ6A 2AOSA 2JF6A 3WH8A 1VBUA 3VDCA 3WQ4A 4MB5A 4MDPA 2W66A 3SCWA 2FH6A 2J7HA 2OYLA 2QV4A 1VEOA 2J62A 5LA2A 1E4IA 3AJ7A 5BYWA 3G6MA 4LGXA 1W9VA 1ZJBA 2WPGA 4GPNA 5CZKA 4CCDA 3PZQA 3N18A 4H2CA 1VEPA 1ISVA 5A8OA 5DFAA 2IXVA 1JNDA 4FK9A 4HZ6A 1ZL1A 3BCDA 3J7HA 1DP0A 3BMWA 1H41A 3MO4A 2YL5A 5E70A 3IANA 1B30A 4FMVA 3WFZA 2VZOA 2E8YA 1HVQA 4UCFA 4DUVA 3WBAA 1NP2A 3VOCA 5CGTA 3I3BA 3KZSA 3OLIA 4ACZA 3MV11 3WH5A 5IXEA 3WQWA 3ARPA 1M01A 1GUVA 2FGZA 1TUXA 5CXPA 2ZUVA 4A3HA 4AZ7A 2WW5A 2VZSA 3FXYA 4JAWA 3WF2A 5CSUA 1RD6A 4PYSA 1C8QA 2FDMA 2BXYA 4DWSA 3FAXA 4MTVA 1CTNA 4PEEA 4P7RA 4FLRA 3NDYA 5D9PA 3RO8A 4GI9A 4CD4A 4Y7EA 1UKOA 4W8LA 1TMQA 4R27A 1UH4A 2WLZA 3LPPA 4KH2A 2YL8A 3T0DA 1MW2A 4HA4A 1H3GA 5D9OA 5GPRA 3SCRA 4UOJA 4JFWA 1QPKA 3TA9A 2A3EA 3KE0A 4V27A 1UR0A 4AD0A 2A3CA 2YL6A 3DECA 5I0DA 1KXTA 1WCGA 2VNCA 4EANA 2VQTA 4JKKA 2G4FA 1IZKA 3FY1A 3AIVA 1OT1A 4UNIA 1W3KA 3MS8A 4MAZA 2XSAA 4ZXLA 1SMDA 3EMQA 1C92A 4C7DA 4AZGA 4CD6A 2W62A 3UESA 4D6DA 3IAQA 4CU6A 2AAAA 4HOZA 2XYLA 3WQ8A 1JXJA 3ZO9A 3BLKA 4JFSA 4PUDA 3VNZA 2DSUA 4Z2HA 1AQ0A 2F8QA 5A8QA 4W7VA 2DSKA 5ABHA 1LG1A 4A4AA 1BVZA 5A6SA 3VD9A 4UFHA 1U30A 3CZEA 1WZKA 1V02A 2CBUA 4W7WA 7TAAA 2DEPA 4TX8A 1TE1A 1G9HA 4DM1A 4PTWA 1OGBA 4AD3A 3CZKA 4QAWA 5CPQA 1HNYA 4TVUA 1KCLA 3M6DA 3B9EA 3IJ9A 2FGLA 1G5AA 4IPNB 3T0BA 3A47A 1A47A 1UKQA 1UR4A 2YLLA 4AY1A 1BFNA 2VX4A 3KEHA 1JDAA 2V3DA 4D6EA 5A3HA 5A6BA 1P6WA 1YQ2A 3U5UA 1WE5A 3GH5A 1Q4NX 2O92A 4MB3A 2ESCA 4NRSA 4UTFA 2CXGA 3VIIA 3CLWA 2V3EA 2ZOXA 1OGGA 2CESA 2VRJA 1JI1A 1V6VA 3B9DA 2JIWA 1JG9A 3QOKA 1B3WA 4DWSC 3RM9A 2VX5A 3WNOA 4MB1A 5E6YA 2J7FA 3GTNA 2BHZA 2W91A 4P7NA 1CGUA 1QI3A 4KMQA 1BG4A 1E73M 4AZCA 1E4MM 3MV01 4IPLA 4PMYA 2OSWA 3WELA 1K9FA 1VENA 1E40A 3VTRA 3VU2A 3VIFA 1WAWA 2D23A 3EDJA 3MANA 4ATWA 3WUBA 4HPHA 5DO8A 2Y5EA 4D1IA 2XFFA 1WNOA 3MUZ1 3VMPA 3AIEA 4U33A 3VGHA 3GH4A 2VC9A 4H8VA 4W87A 4AZ6A 4AZIA 1CXEA 1GVYA 5FL0A 1HP5A 3VGDA 3WKZA 2WBKA 4D6JA 1B3VA 1OWQA 1XHGA 1FP8A 2XWDA 3II1A 3VKKA 2WCSA 3MUIA 3VUPA 4K68A 1OM0A 1UWSA 4UQDA 1JZ5A 5I2UA 1WZLA 3GXDA 1CIUA 3ARXA 1J11A 4JL2A 3VGBA 1GVIA 2VCBA 4HU8A 4CD7A 4QFUA 5HPOA 2X8RA 1J10A 2JEQA 2GUYA 3VILA 3AHTA 4E8DA 5HXMA 4M1RA 4C7GA 2X1IA 1KR0A 1CECA 4U3AA 3BCFA 3W6LA 3CHCA 3WQ5A 5IHRA 3WMBA 3AIRA 2YOCA 3NSXA 4U3CA 1KXVA 1V6UA 3SEPA 2ZE0A 4GQRA 3FHQA 2W4XA 2QPUA 4HMEA 1G1YA 2D3LA 3RCNA 1GOMA 2WMGA 1FFRA 1BHGA 2ZX7A 3NSMA 5A2AA 2OYKA 2J7BA 2YDQA 3PN8A 3QOMA 2DSZA 2XM2A 4F66A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1H5V A;  1HIZ A;  2VRK A;  1JZ7 A;  1BG9 A;  2GJX A;  3SUR A;  4J3U A;  5BRQ A;  1V0M A;  1XSK A;  3QGV A;  3ZMR A;  1UH3 A;  3AQU A;  2OWX A;  5DMY A;  2WHL A;  2BNJ A;  5A2B A;  2VZU A;  1QNO A;  2E9M A;  1AMY A;  3DHP A;  4ACY A;  4J27 A;  4V2X A;  3WF4 A;  5A6A A;  4D1J A;  5BRO A;  3WFL A;  2V3G A;  3W6M A;  1EA9 C;  1K9T A;  3ZR6 A;  5JIW A;  3T2Q A;  3VGE A;  1M04 A;  5D9N A;  4B3L A;  5KZ6 A;  1CYG A;  1E4L A;  1OD8 A;  1QHP A;  3ZST A;  4F9J A;  2EBN A;  4PUE A;  4X0N A;  3ZJ8 A;  3UER A;  4OIF A;  1VB9 A;  3AS3 A;  4IUG A;  4JL1 A;  1KFW A;  4BQ5 A;  1NWR A;  2ZUU A;  3CZL A;  1HF6 A;  3GDB A;  4H8U A;  4JCL A;  3BAW A;  1WO2 A;  1PX8 A;  3KL5 A;  1LL7 A;  2WMK A;  4JZ5 A;  4C90 A;  2X0H A;  4CKQ A;  2WCA A;  1HP4 A;  1BYA A;  2WSP A;  1J18 A;  3AZT A;  3GM8 A;  2GDU A;  2QLY A;  2WC4 A;  5BWF A;  2EPK X;  4UOQ A;  4TTG A;  1UD4 A;  2WC7 A;  2EXO A;  2JEP A;  2G3I A;  1IT0 A;  1JAE A;  1KCK A;  3BMV A;  1B2Y A;  1V0N A;  1GNX A;  2ZUW A;  1MW1 A;  2DIJ A;  1XD1 A;  1OIM A;  1JF6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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