1M7OA

Plasmodium falciparum triosephosphate isomerase (pftim) compled to substrate analog 3-phosphoglycerate (3pg)
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
246
structure length
246
Chain Sequence
RKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGSYTGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHFERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWAIGTGKTATPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structures of Plasmodium falciparum triosephosphate isomerase complexed to substrate analogues: observation of the catalytic loop in the open conformation in the ligand-bound state.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate Isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 92
structure length 246
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2002-07-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1m7oA00
3W3OA 2HTMA 1TPWA 4UR7A 1IXNA 4FEZA 3VFLA 1TRDA 2CLKA 1GOXA 3G1DA 4FIRA 4O12A 1AW2A 3UZ5A 3HIJA 1ONRA 4MLJA 2VFGA 3JS3A 3SY5A 1BEUA 1GVSA 2Y7FA 1DV7A 1GT8A 4I7VA 1G4EA 3M43A 1Q3NA 2WQPA 3JRKA 5HNRA 1VHCA 3BW2A 3LM7A 3BPWA 4N2YA 2ISWA 2ZRYA 3NZRA 2HMCA 4FHAA 5EKYA 1KFEA 2H8XA 3IIZA 3W74A 4ZL1A 2VEMA 2ABBA 4O0KA 4PL2A 4O4VA 1TQXA 2VFFA 1K8XA 4AMAA 3PBUA 1R47A 1JCLA 2WSRA 4UTWA 3LHVA 5MHBA 1N8FA 1DOSA 1KV5A 4IWWA 1YDOA 4CCDA 2X2GA 3CTLA 4DF2A 2J6XA 2I9EA 5LNSA 3MO7A 5H2ZA 1W5QA 1DORA 3MI3A 2LLEA 5G2WA 1ICSA 4LC8A 4JYFA 2VEIA 1F6PA 4AF0B 4FF7A 5AYXA 1KA9F 3UXDA 3KRZA 2B7NA 4PH6A 3AJXA 3C3NA 4POCA 3W84A 3S0CA 2G97A 2DJLA 1H5YA 2ZA3A 2QF7A 3LCIA 3UWZA 1I2QA 3M5XA 3QSTA 3PULA 4YCOA 1FCUA 4FXSA 2GJNA 1A5AA 1TTQA 4JYDA 3ABQA 2W6RA 3NL5A 4IMDA 1NEYA 5EYWA 1NVMA 1JCJA 4IXXA 3EB2A 2QEZA 4LS1A 2PRMA 4O53A 1TIMA 1AK5A 3A9IA 4HNTA 1EPXA 1KW1A 3OVQA 1L9WA 3BO9A 1GTHA 4N4PA 1WX0A 3EWWA 3TC7A 3TKFA 1PL9A 3PF3A 3C8FA 1F73A 4K7VA 3LXCA 3BV4A 4LC6A 4N02A 1JCXA 1R46A 2CLIA 1L6YA 2VKZG 1EP3A 4UTJA 1UASA 1C9DA 3OVRA 4MIMA 4UMBA 2NUWA 3RFAA 3U2OA 4TR9A 3GDLA 3RK8A 4DBEA 3T44A 3W2LA 1TRIA 2ZRUA 4WD0A 4WX2A 2XN1A 1IF2A 3MYOA 1ADOA 3BVJA 1ZHAA 3KXQA 4MZ8A 4UFMA 2EKCA 2VXNA 1QOPA 3BK0A 3HO8A 3NQGA 3TNOA 3P5YA 1HO1A 2J9XA 3STCA 4MY8A 1GVFA 3FKRA 1KM0A 4WQ6A 4OU1A 2FPTA 4HSOA 3W7RA 3W2NA 4UXDA 3FJ6A 3FJLA 3U6WA 3LX9A 2JBMA 3OIXA 4NJIA 1X1OA 3MI6A 1QO5A 5KZDA 1HL2A 3TU9A 2ABAA 4JR5A 5HWMA 4UTKA 3NPWA 5HUOA 5LGZA 1XDLA 3N73A 3CB8A 1HG3A 5J5DA 2VEKA 1TPVA 2I14A 2F84A 1FQ0A 3DZ1A 3IGSA 1H51A 3IIPA 1JCNA 3TFCA 1W5OA 1MEIA 3MBFA 3P61A 3G8EA 1DVJA 5BNKA 3GDRA 2YGYA 3C2OA 2EPHA 4AEOA 1KLZA 2Y7EA 1R30A 1SSDA 5DELA 4IMGA 5U7SA 2YZRA 1BWKA 2B7QA 5F2LA 3TAKA 2QCMA 1KFJA 4RLIA 1C8VA 4QNEA 3TXVA 3GK0A 4GNJA 5IM51 1WV2A 4NNCA 1OFEA 1H50A 3TROA 3NOEA 5FF4A 2ZZ5A 1I2RA 5I3FA 1YYAA 1YXDA 4ADSA 4UTTA 2WNZA 3LRMA 3A21A 3LRKA 1UJPA 3HGJA 5KSWA 2H8ZA 3SGZA 2Y62A 3UWWA 3LBMA 3QFEA 4LWWA 1W0MA 4GBUA 4MZYA 4HPJA 1EP1A 5LNVA 4UIOA 3MJYA 3UWYA 4BWLC 1G4SA 2PRHA 2RHGA 1GWJA 3RLUA 5CPMA 3HPXA 2QAFA 4Z08A 1NSJA 3W86A 4N6FA 3G8RA 3EKZA 1GPWA 1AMKA 2H90A 1FWRA 5AC8A 1M6JA 3W2KA 3ELFA 1FBAA 2V5BA 3EX6A 2JKPA 1H7NA 4AXKA 4JXCA 1ME7A 5HUPA 3NQMA 1F2JA 4MOZA 4JTLA 4OV4A 2Y89A 4MFDA 3QYQA 5D05A 3GX9A 3KVKA 3NQCA 3F4WA 3DFNA 3E9AA 5LZLA 3ZWSA 3GNDA 3LCWA 3M6YA 1WYIA 4UNLA 4LOCA 2Q8LA 5KZMA 3BW4A 1T8XA 3LERA 4YLWA 3W1LA 2E6FA 4RKAA 5T26A 3BG5A 4LS2A 2OJPA 3EX2A 1MSSA 1TPDA 4H6KA 3W1QA 3CQ0A 3P74A 4S2BA 2ZCGA 3CPRA 3L67A 1EIXA 5A8GA 4JY9A 3GR7A 1MZHA 2CFFA 3O63A 4ADUA 5FF0A 4ZMGA 2A1YA 4GWEA 5CZJA 4ZQRA 1I2NA 4K38A 2A7PA 3DXIA 2C3ZA 2NXHA 5CSSA 3W2JA 2ZYFA 4KWWA 1SQ7A 3STEA 3B0PA 1ZENA 3M41A 5IBXC 3DGRA 2R8WA 1JR1A 4Z1DA 3SIZA 2ZBTA 3N14A 1W5NA 3L5AA 3MYPA 2OMAA 4U4MA 3P7YA 5LKYA 3HGRA 4OT7A 4ML9A 2ZRVA 2TYSA 4Z0SA 3PBYA 4ORMA 2V2DA 1R2TA 4HN4A 1SU5A 2CZFA 1W31A 5DXXA 2E68A 3HJZA 3W73A 1YDVA 3DAQA 5FF3A 4IMEA 3QM3A 1RZMA 2QUVA 5HQEA 1T0OA 3QH2A 4Y90A 1IXOA 3CC1A 4RZ6A 4K6AA 2OCZA 4JDYA 4PTNA 4NU7A 2B7OA 4QJ1A 1EA0A 4FNSA 1GJPA 1OX5A 2WOQA 4FNTA 1SFLA 5AN7A 5EY5A 1TQJA 3TV8A 3B03A 1W3IA 4Z1BA 5A5WA 3OBKA 1Q6RA 3HG5A 2ATSA 2DU2A 3GB6A 3TSDA 4ICNA 1GEQA 2VFDA 3EX3A 3M16A 2ZQ0A 1MEHA 1AW5A 1VZWA 3IGUA 4X2RA 1XC4A 3TMQA 3NAVA 1JULA 3INPA 1ZCOA 1CI1A 4QITA 1H1ZA 4BK9A 3SR7A 3K30A 3W7IA 2VOMA 2FDSA 3W7KA 2QCNA 3IIVA 5K9CA 1M7OA 4LV9A 4O1AA 3IVSA 3SJ3A 6ALDA 2C6QA 1KTNA 4O57A 3CLMA 2O7QA 2YYTA 3S1UA 4E2DA 2E6DA 1C29A 4XZ9A 4K36A 2G96A 4JDBA 2V2CA 1H62A 3ABOA 3NM1A 1FCQA 4AVFA 3FYOA 5F2MA 3WJZA 3DH7A 2DZVA 4UTLA 2CLMA 2B0MA 1SFJA 3CT7A 3LLFA 4LRTA 3TDFA 2A7RA 3PG9A 3DFTA 3VKJA 4LVBA 2E6AA 2ZZ2A 4O17A 1GG0A 3IRDA 4LVAA 3E0IA 1TMHA 3M7WA 3I65A 4CCCA 3PSWA 3TR2A 1IXQA 1T96A 4FNPA 1EWEA 3LB0A 2C16A 1WOAA 4O13A 3VCRA 3MMTA 3CEUA 5AFDA 1OYCA 2G95A 2YW4A 5DN1A 4LV4A 1UBSA 3SFKA 4WXYA 1QPNA 4LU0A 2RFGA 1K7XA 3EX1A 5G1TA 3U8GA 3DFQA 5D04C 4M5PA 1PCKA 5CPOA 2DP3A 5FEPA 4K8EA 2E1DA 3B0VC 3LOTA 4UTIA 3UPBA 3ZWTA 1EUAA 2J9YA 3L9CA 4XKYA 1QDSA 4JTIA 2Q8ZA 1A50A 4EWND 2ZRXA 1OFOA 2C13A 3HG2A 1G69A 1YTDA 3KFTA 3PC0A 3GDKA 2A5HA 2R14A 3TSBA 4NNAA 4GUGA 3H55A 3LCFA 5DXYA 1EP2A 2E6YA 3MHUA 1WQ5A 5K7JA 4TO8A 3N9RA 1G67A 3RLVA 4O18A 4O14A 3OA3A 2J27A 4U28A 3PBWA 3MBDA 1KFLA 1LOQA 3GR8A 5G2IA 3N2XA 3UD6A 4C1LA 4LS0A 4M6QA 1SZGA 3R8RA 2E5DA 1R2RA 4GJ1A 3A23A 2A7NA 3NEVA 3QZEA 1TCDA 3NQ7A 4KKXA 5DBUA 1KM3A 3HMJG 1B3OA 1QOQA 4DELA 4FX6M 3ANYA 4LY8A 4CQAA 3M44A 2V5LA 4X3ZA 2RDWA 3PB0A 2CZ5A 3B0UX 1VQTA 2EAWA 3EWZA 2ZZ3A 4ZQNA 3G0XA 4GUHA 4XTDA 5AHMA 4FX8A 1Q6LA 4A22A 4OQVA 4UFHA 1QPRA 1I4NA 3C2RA 5LNRA 2TSYA 3W70A 5CPNA 3W1RA 1D9EA 1JUEA 3VE7A 4ORIA 1W54A 3DKLA 2P1FA 4OHQA 2ZFAA 5GVJA 1L6WA 1H60A 1UCWA 2Y85A 3GAYA 2BX7A 2FB3A 3IEBA 1Q45A 2TMDA 2WNQA 3RMJA 1FDJA 3WJYA 1M7PA 1OF6A 4RK8A 1KM4A 1YXYA 4PODA 1H7XA 1MO0A 3CM4A 3L21A 2BLEA 5EL1A 3W2UA 1V5XA 3S6DA 3IIXA 4EVZA 1QAPA 3RNDA 4CLMA 4RXFA 1CX9A 1G4PA 5LHEA 2V82A 5BOOA 3MP3A 3QPZA 3WK2A 2NX1A 1I2OA 1YPFA 1ZNNA 2DZSA 4DEFA 1TPB1 3FIGA 4WUIA 2P10A 1TPEA 2Y7GA 3GZ3A 4N9EA 1O94A 3WK3A 4FB7A 3MW7A 4RR4A 2ZRWA 3BLIA 5FF7A 1OJXA 2BWGA 3WK1A 1I8JA 1XUUA 2WO5A 3G0SA 1SPQA 3LTYA 3NQ8A 3CWOX 1VYSX 2NV2A 3G18A 2ZA2A 2DZTA 4ZQCA 3TQVA 3A5FA 1M5WA 4Z0JA 4UTMA 1VGAA 1FWTA 3LCXA 5EMUA 4L4LA 4UFJA 4O52A 3LXBA 1FXPA 4FNQA 4RX0A 2WJZA 1SZNA 2YFNA 3HG3A 5G4WA 4YCPA 2CZEA 2JKAA 2NWSA 3HQ1A 5L6UA 3RF9A 2ZDRA 5KITA 3BG9A 3I6RA 1X6UA 5BRBA 2BXVA 2VELA 3TW6A 3NO5A 5DCEA 2QCFA 1XUZA 1W1ZA 4A2RA 2A6NA 4O50A 3W7NA 3TQKA 3EEGA 1GYNA 2Z6JA 4J9JA 3O6YX 5DCBA 2RKXA 3VNDA 1WDWA 2PE4A 4XBSA 2QCCA 3IVUA 4PFMA 1JQXA 2VFIA 3SZ8A 4JYEA 1DL3A 4O28A 2J88A 1OVDA 4JN6A 4NJGA 4A2SA 1H7PA 4WOQA 1J2WA 4Y6GA 1OFBA 3W88A 3MWAA 3NQ6A 1ME8A 3CEPA 1ICPA 4UR8A 1LTDA 4K8HA 3UQNA 1IIHA 3GDMA 1VC4A 2Z1BA 3W7GA 3KX6A 2ATMA 2A6LA 2WPBA 5HR6A 1O95A 4MY1A 4JS3A 4RCXA 4ZQPA 1RVGA 3LCGA 2YX0A 2FQIA 2QR6A 5K9XA 2QAPA 3O16A 1YPIA 2NUXA 1EX5A 4TX9A 1GVOA 4AWTA 2D73A 2BSLA 5CGQA 1LBLA 1AL7A 3W85A 1HO4A 1P4CA 1G6CA 3W9ZA 3DKJA 3I7RA 2DZPA 4JTTA 2I1OA 3QW3A 1KM6A 1RR2A 1J4EA 3C2FA 3SI9A 4M7SA 4QNWA 3B05A 3QMSA 3V1PA 3N34A 4CCEA 2ALDA 3G3MA 2WSYA 3TJXA 3S1VA 1K8ZA 3M5ZA 5CZ0A 3QSRA 2QUUA 1H7OA 2PC4A 1FXQA 5K2ZA 3YPIA 3STFA 5HWJA 2NXIA 4PA8A 2QJHA 2XFWA 2OT0A 1Y0EA 4QIUA 1K03A 5AHNA 1LROA 2HS6A 1LLZA 4E0CA 3S5YA 4HPXA 4DPQA 4I9AA 2FFCA 3ZFHA 4A3UA 4HNVA 2FB2A 2KZHA 1G7VA 3FFSA 3KVMA 1TV7A 3P8JA 3N2MA 1W5PA 3LV5A 5DBTA 1PIIA 5I3HA 5AHIA 3EWXA 1AL8A 4AHPA 3UWVA 2R91A 2E77A 2ISVA 4R7JA 3O6CA 2V0TA 3NXFA 4NUWA 3E49A 2X16A 1KFKA 1FUYA 4XWUA 5D2WA 2CLOA 2GVJA 1ICQA 1ZAJA 3S42A 3R5EA 3W1TA 1OK4A 4EOUA 3N3MA 3W1XA 3N9SA 2C1HA 4UCGA 1PE1A 5HINA 3HF3A 4LUIA 1IXPA 3TQ0A 3HPZA 3ABSA 4E38A 3VI2A 4JTKA 1QO2A 4GE8A 4YMZA 3TC6A 3DI0A 1L6SA 1SW3A 3W07A 3PSVA 3P82A 1RD5A 7TIMA 3W87A 3B04A 3DI1A 4UMAA 4NJKA 2Q3RA 1VYRA 4WJEA 2EF9A 1A53A 3FA5A 3MUXA 1OG0A 2QKFA 2H3BA 1WAUA 4IQLA 4CNPA 1WBJA 1I2PA 3SECA 1KV8A 3TFXA 4FNUA 1THFD 1LDCA 3NQEA 1VJIA 3LLDA 4A21A 5G1YA 3TCEA 1O5XA 1OFDA 3H54A 1OFRA 5F1VA 1PHWA 3O8AA 1F05A 2QDGA 2A0NA 1ME9A 2Y70A 1W3NA 2ZTJA 4MLRA 4UMCA 4UTWC 3O6DA 4K39A 4M6VA 4C1KA 4NX5A 2X30A 1TPFA 3KRSA 3D0CA 5LHFA 1SZEA 3JR2A 3W2MA 4Y8FA 3BARA 1U5JA 1LM1A 1OF8A 8TIMA 3W83A 4MVAA 4O8RA 3G1FA 1ML1A 5DY3A 3H53A 4MFEA 1KTCA 2NZLA 4ZZ9A 4NZFA 1WA3A 4UTHA 5HR7A 2V8ZA 3BGJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1MNZ A;  3W3O A;  1IXN A;  3VFL A;  3CQI A;  2UY5 A;  2CLK A;  3G1D A;  3VGD A;  4FIR A;  3AMC A;  1KQZ A;  3WD3 A;  3SCP A;  3SY5 A;  4PN2 A;  2ZXQ A;  1TVL A;  1DV7 A;  2Y7F A;  4I7V A;  5CAK A;  2XSA A;  2O4M A;  5LIU X;  1A5K C;  1NTH A;  3G2G A;  3C86 A;  2ZRY A;  4FHA A;  4WCJ A;  2D1Z A;  2FGB A;  1JAK A;  2H8X A;  4QG6 A;  1HKV A;  4DJF D;  4PL2 A;  4O4V A;  1TQX A;  4MDO A;  4AMA A;  3GXF A;  4A8L A;  1C92 A;  2WSR A;  3RDK A;  4KGL A;  4IWW A;  4KCU A;  1YDO A;  2X2Y A;  3AYV A;  4P7Q A;  3VDB A;  3KTX A;  2J6X A;  2I9E A;  1W5Q A;  1DOR A;  3MI3 A;  3EBV A;  3JZU A;  3CHF A;  2XVG A;  5BOE A;  5AYX A;  3QR0 A;  1Q2R A;  3UXD A;  1JI1 A;  4EPD C;  1S3T C;  1RPK A;  2G97 A;  5BWF A;  1W1A 1;  2XH4 A;  2QF7 A;  4DJE A;  4Q8M A;  3ITT A;  3PUL A;  3OLG A;  4YCO A;  4FXS A;  1X6L A;  4FOJ A;  1PBG A;  1QUM A;  1K9F A;  1U33 A;  2W6R A;  1JF6 A;  3RX3 A;  4YTR A;  5HPC A;  3TYA A;  5EYW A;  4NSB A;  4GGB A;  3E0L A;  1NVM A;  4REQ B;  1JCJ A;  2VT0 A;  4LUY A;  1UWI A;  4GQ0 A;  1EL3 A; 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