1M7PA

Plasmodium falciparum triosephosphate isomerase (pftim) compled to substrate analog glycerol-3-phosphate (g3p).
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
246
structure length
246
Chain Sequence
RKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGSYTGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHFERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWAIGTGKTATPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structures of Plasmodium falciparum triosephosphate isomerase complexed to substrate analogues: observation of the catalytic loop in the open conformation in the ligand-bound state.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate Isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 91
structure length 246
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2002-07-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1m7pA00
3EKZA 3PM6A 1EUNA 1K8ZA 1S5TA 3R12A 2W6RA 5D30A 2R91A 4UFLA 3E9AA 5CZ0A 4O17A 3CT7A 3OVRA 2BTMA 3BLFA 3C3NA 1DV7A 1HL2A 5D38A 4ORIA 3M1ZA 1N8FA 1XBVA 2R94A 1KBJA 4UNLA 3O1NA 1R30A 5DCDA 3B4UA 3G1AA 3QJAA 2Y7EA 4CCCA 4N9EA 3ABSA 2DZVA 1DQWA 2VFHA 2Z1BA 3PUOA 3M7WA 3LHZA 2F7FA 3S1WA 1S3HA 2HSAA 3LV5A 1QO2A 4QAIA 4NJHA 1JUKA 2YYTA 3CHVA 3GAYA 3KXQA 1G4TA 3PULA 3GKAA 3FKRA 3NM3A 3S5OA 4M5PA 5EL1A 2JKPA 1O4UA 1I2OA 1W3IA 5A5WA 3MP4A 4O15A 7TIMA 1ZJIA 5TIMA 3VFLA 3D0CA 3CTLA 4FX6M 5EBUA 1HG3A 3BO9A 4HNTA 4JX5A 4UTWC 1KW1A 1NF7A 1Y0EA 1JRBA 1YYAA 2DORA 3A21A 4JYDA 3ATZA 1AW1A 1LTDA 4NX5A 1Z44A 1OF8A 1TPH1 1VLIA 1W37A 3NL5A 3G1VA 1VHCA 4LVFA 1PVNA 1MEHA 4O12A 1WOAA 3G0UA 3NQFA 4M6PA 4IMCA 4FX8A 3G0SA 4IMDA 1B57A 1LOLA 3WFAA 4KWVA 4I7VA 2PE4A 4QJ1A 4MJMA 1W54A 3HQ1A 5U4NA 1S5VA 2H8XA 3L67A 3THAA 1EB3A 3W1QA 3EEGA 1JUBA 1K7XA 1VPXA 1DJQA 3N9RA 2X1TA 3A24A 2B4GA 2H3BA 2P0OA 4Z1BA 1G7VA 1WQ5A 4M6VA 2FPTA 2W0UA 3PAJA 1G4EA 2YFNA 5D09A 5U7SA 4LVDA 4JYEA 4GUGA 3UXAA 1TTPA 3TUUA 4JTGA 2FIQA 4ADUA 1DQXA 3NVTA 2V5BA 3UD6A 4XWUA 1FWRA 3TMLA 4Y8FA 1IXOA 4CNPA 4GE8A 3CIXA 4Y9AA 5AB3A 3DHDA 2DJXA 2A7NA 5HR7A 4DBEA 4IXHA 4B5NA 4LVBA 2Q8ZA 2A7PA 2CZFA 3FFSA 1GZGA 2ZCGA 3SECA 1JCXA 2GQAA 1H63A 4LNYA 2CLKA 2BLEA 3LCGA 3PUEA 3EWXA 4IJBA 4RCXA 2GJLA 4OHQA 4Q33A 1KM5A 5AYXA 3W2KA 4NZJA 2WKJA 1TRDA 3GR8A 4AAJA 5C55A 4PCFA 1AG1O 5FF7A 1D9EA 3O6CA 2BSLA 3ATYA 3MI6A 1DBTA 4JTEA 3PC0A 2ZRWA 3OVQA 1OFRA 2NXHA 2CZEA 3BW4A 1H1YA 4DF0A 2CFFA 4LVGA 4MFDA 2YFOA 2EAWA 2CW6A 2GQ9A 4WZHA 3HPSA 1XM3A 3S5YA 3QPZA 4O10A 2E5CA 1TJPA 3FOKA 1ZENA 1TPDA 5E1QA 2CLEA 5LNVA 1TRIA 4UTTA 4Z1DA 4LC8A 3BGGA 4UTJA 1ZAHA 2QEZA 3NPUA 1KM6A 1DHPA 3UWUA 4J9JA 4TU1A 3L5MA 3BG5A 4M7TA 2Y70A 2C6QA 1ZFJA 1SW0A 3TIMA 2DU2A 3RLVA 2O7QA 4NVTA 1Q3NA 1TPUA 5KMYA 3NQCA 4HPJA 2E77A 2LLEA 3Q37A 1YXYA 4EIVA 1UUOA 3W3OA 1A5AA 1ICSA 1ONRA 3IV3A 4WY0B 4UR8A 5HUPA 3PBUA 5BMXA 2ZZ2A 4EF9A 4K37A 3W6YA 3LXBA 3EXTA 1UASA 4JY8A 2H8ZA 3WJSA 4TIMA 1UUMA 3MHGA 4UUIA 1P5BA 5L9FA 1Q6QA 2I9EA 1A5SA 2E68A 2QCGA 3UWVA 5K4XA 4OBTA 2Y88A 1A5CA 2HS6A 4NT0A 5TQLA 3O06A 2BXVA 2C16A 2JK2A 2FTPA 3NA8A 3QMRA 2JBMA 2ZDRA 1ZY9A 3IEBA 3HGOA 4DPPA 4MY8A 3P61A 1QWGA 3FJLA 4UTHA 1ADOA 5AHMA 2GVGA 3STEA 4NJIA 5CPMA 3QQ1A 1X6UA 4DO4A 4CQAA 1TYGA 3GXPA 1LROA 1O60A 3QM3A 3R8RA 3I7RA 2O7SA 3GDLA 1LORA 3P62A 2QCLA 3W1XA 3P67A 3LTPA 3W85A 4JTIA 3TFCA 4MPQA 3OEXA 3TW6A 4R34A 1GQNA 5F4XA 5L6UA 4UTTC 3JR2A 5HR6A 1Q45A 2RDUA 4UFMA 2E6YA 3F03K 3KOFA 3SI9A 3W87A 4KFPA 2WNNA 5DELA 5F4SA 1KV5A 3TAOA 3UWQA 2J9ZA 4I7UA 3P5ZA 1M7OA 1RV8A 3BLIA 1MSSA 2VFEA 3DHFA 4K36A 1FCVA 1TPC1 4A29A 5AFDA 1K03A 2Q3RA 1RPXA 2ZYFA 3K30A 4DXVA 3IIXA 3DKLA 4ZL1A 1RD5A 4CLMA 2E5DA 1I8JA 1SW3A 4AEOA 4MZYA 1NSJA 3W1UA 1HO4A 1W5NA 2WSQA 1KA9F 1H7PA 1G4PA 3C8FA 1WXJA 3KHJA 4MYXA 3SGZA 3WK1A 1SSGA 1EIXA 8TIMA 2A1YA 4UC5A 4HNUA 2QAFA 3I7SA 1JCJA 2A6LA 2CLMA 1SW7A 2OT0A 1H7NA 2RDWA 2FDSA 2ZZ4A 4NNBA 2QCFA 3W75A 3NO5A 4JD4A 4XTIA 4O4WA 3GIYA 3NNTA 3W7PA 3UPWA 4MZ8A 4OV4A 5AYYA 3W7KA 1DL3A 4XZ9A 3W2MA 3BLEA 1YXDA 2J88A 2YYUA 2Y63A 2ZFAA 2QAPA 5DY2A 3QMSA 1OFAA 4LY8A 1TPVA 2PURA 1VYRA 4WY0F 3G3DA 1BTMA 4GWEA 3GDRA 2FJKA 3O05A 3WJYA 1FX6A 2HTMA 3N19B 2ZRUA 4N9CA 3QFEA 1VRDA 2FPVA 3FYPA 3T55A 3EX4A 3IVTA 4ADSA 3QYQA 1PHWA 2VEKA 3EWWA 5LNWA 1H7WA 3W7GA 1K8YA 3ZWTA 4GJ1A 1DVJA 5D04C 1RQHA 5G2IA 2ZTKA 3RU6A 4NXKA 3UWYA 1SU5A 1B4EA 1FWWA 1LRQA 3EKLA 4DEFA 5K3VA 1M7PA 1I4NA 3DKJA 1RQEA 1XFBA 1JUEA 4UFIA 4ADTA 2V0TA 1RZMA 3PG9A 1FCUA 3GLCA 3V75A 3KVLA 3UYCA 1BWKA 2YW3A 4JNMA 4A2RA 2NV1A 4IUOA 3N3MA 2VEMA 5EKYA 2E6DA 4X9SA 3FKKA 4YCOA 4UNKA 4O18A 4MY9A 5AHLA 1OX6A 3DBPA 1YADA 2ZBTA 3G3MA 3AJXA 2Y62A 3L2IA 1LRNA 2H3DA 4MVAA 4LS2A 1QDSA 3E96A 3T4CA 1OFBA 3GDTA 3IGXA 1PHQA 4X2RA 3W2JA 4I7WA 2PRLA 1OFOA 2ZZ1A 2WSRA 5LHFA 3C2FA 4M7SA 4C1KA 3GXTA 1XC4A 4CQ9A 1SZNA 1W1ZA 3OG3A 1VLWA 4O53A 4WQ6A 2ALDA 3G1YA 4RK8A 1YTKA 2WQPA 3BVJA 1QPNA 3S1VA 1LYXA 4PEKA 3TC6A 4UIOA 3FYOA 3IGSA 5KZEA 3KFTA 3LHYA 3P84A 5EY5A 3M44A 2QCHA 3P60A 3PVFA 3V1PA 1TV5A 3LX9A 1SZGA 2PRMA 4N4QA 3RF9A 1UJPA 3ZS4A 2FFCA 3ABOA 3W7EA 5FEZA 1EPXA 5EPDA 3IGUA 2X16A 4A2SA 4AWSA 1VYPX 1KM4A 1V7YA 3LOTA 3TR2A 5AC6A 3UZ5A 4MUZA 3W7LA 1NFBA 1SFLA 2Q8LA 4D2JA 1LLZA 3L5LA 3E0IA 2GVJA 3P5YA 1JR1A 3KVMA 3TSDA 3EX6A 1KV8A 3QC3A 3LCXA 4LT9A 3LBMA 1IXQA 3W88A 1JQXA 1IXPA 2QF7A 5FEXA 3NQEA 3GR7A 5HULA 3DFSA 3BG3A 3BW2A 2NV2A 4HPXA 3T78A 4PTNA 3O8AA 1GEQA 1KM2A 2GPTA 3ZWSA 3GNNA 4JDBA 1Z42A 2DP3A 5DBUA 3DZ1A 1KFEA 4FNSA 3M5ZA 1HTIA 3TQ0A 2BX7A 2OT1A 3S6DA 1C29A 1OYBA 1H7XA 2C13A 1WDWA 3TCEA 3RMJA 2V2CA 4H4IA 5FI8A 3W72A 2QUVA 3GZ3A 3BARA 2A7RA 4FNRA 4O14A 1ZAIA 3CWNA 2GVLA 3S1UA 1OX4B 4OE7A 3IVSA 4OV9A 4O8RA 1GTEA 4FNPA 1RR2A 4FIRA 3NL2A 3SZ8A 5DXYA 2C3ZA 2ZRXA 4LU0A 2B0MA 3W7JA 4MZ1A 4EF8A 2XFWA 4ZMGA 4IMEA 3UNDA 3P74A 3W1MA 4NUWA 3A9IA 2W79A 3T40A 3LXAA 3HMJG 4EWND 5AN7A 2XN2A 1W56A 4FEZA 1TIMA 2EF9A 1GT8A 1UCWA 1ZCOA 4ORMA 3EWBX 4LRTA 2FB2A 5F1UA 3F4WA 4FNUA 3PBYA 5LNUA 4QNWA 3GAKA 1K7EA 2V2DA 1SZFA 4K6AA 1OFEA 4QISA 4BR1A 2Y6ZA 3NL3A 1XBXA 1H61A 4QM1A 2C19A 3KRUA 3JS3A 3VE9A 5DBTA 3DAQA 4JYFA 1FDJA 3G18A 5EMUA 4N6EA 4UTMA 1VR6A 3CEUA 3P80A 4WOQA 3VE7A 3G1HA 3N73A 1B4KA 2NUXA 2QJHA 2BWGA 4JIQA 3NQDA 2ZRZA 4PFMA 5D2YA 1H7OA 1BEUA 4CCDA 1JCMP 2CZDA 1OHLA 3W70A 1G7UA 1XBYA 4UTKA 4RLIA 4NU7A 2ZZ5A 3R5EA 4RKAA 1F74A 2PC4A 1YLVA 3UXDA 4RX0A 3ZR4A 2VEIA 3NZRA 3WJXA 4FXRA 2YZRA 2WNZA 5D2XA 1OYCA 1P4CA 2I1OA 3I6RA 3MWAA 4HSOA 5G4WA 3B06A 4X3ZA 3W2LA 4IMFA 3TV8A 1CW2A 2X1UA 3F1QA 1LBLA 1EA0A 4JTTA 3C2VA 1ZAJA 4YMZA 3DI0A 3ABRA 2H6RA 3TROA 4QSHA 3GNDA 4DF1A 1WBJA 3W7CA 1EX5A 5G1YA 3C2OA 4PL1A 3L5AA 1GWJA 3DXIA 2ZRYA 3LRMA 5FF3A 5D03A 5K9CA 4IXXA 5I3HA 2ATSA 3NQAA 3QMTA 4LRSA 5HQEA 1QOPA 4FNQA 1H7RA 3PB2A 5FEPA 1IIGA 1W3NA 2Z2UA 1G69A 3TJLA 4LUJA 4UCGA 1WBHA 2CZ5A 1OX5A 2JKEA 1R2RA 4NZFA 3OVPA 3U6WA 4O11A 3G1DA 4DBDA 3W1TA 2Q3OA 3M16A 2ZA1A 1I2NA 2A6NA 1PCWA 5DCEA 1PCKA 5F1VA 2BZNA 4ZQCA 5E93A 1A50A 2NXIA 4GUFA 1GVSA 2QUTA 3HIJA 4AWTA 3ABQA 1LBFA 1OVDA 3N9SA 2VELA 2TSYA 3W07A 3A22A 4JTJA 2A5HA 2A0NA 1QFEA 3P8IA 2RKXA 1SR9A 5AHIA 5G1TA 2OJPA 3LRKA 2PCQA 1SZEA 2B7PA 1UB3A 1THFD 4MFEA 3L66A 1SQ7A 3N34A 3W7RA 1FWTA 1LBMA 4O4VA 3NQ7A 4WJEA 3C56A 2J6XA 3W76A 4AH7A 1SO4A 3B05A 4ZQRA 1JRCA 5DY3A 3TAKA 3MO7A 3NEVA 3M5XA 2NX9A 2X2GA 2ZZ3A 3EB2A 1AMKA 3M43A 5AHFA 4R7JA 4CNOA 1F76A 3L21A 3CU2A 1EP2A 4JR5A 5LZLA 3JRKA 1H51A 3CQ0A 3LHVA 3HPZA 3L0NA 3C0JA 4UMAA 2WV8A 4L4MA 4AVFA 3HBLA 3G1FA 1YPIA 4GUJA 1XL9A 3L0GA 3KRZA 1WAUA 1F5ZA 1D3GA 4POCA 3M9YA 3LM7A 4E2BA 1B3OA 1Q6LA 4JTKA 3W7DA 3CB8A 1KM1A 3MP3A 3MHUA 1UBSA 1YPFA 4HNNA 4RR4A 1VCVA 2CLIA 5K7JA 1XCFA 3LB0A 4AHPA 1H1ZA 1NEYA 3C61A 4NXSA 4DELA 4U28A 1VC4A 3PS7A 1YTEA 3LLDA 2WSYA 2OMAA 2QDGA 2NX1A 4LC6A 4N02A 1QO5A 3L0KA 1K02A 3TU9A 2YPIA 2CLOA 2V8ZA 4S1FA 4TX9A 3USBA 1TPFA 4LOCA 5D2TA 5KZMA 3LERA 3WJWA 2J9YA 2ISVA 4O1DA 1J2WA 3QW4B 3LHTA 3M47A 2CLLA 4JTHA 4P2VA 5KITA 4XTDA 3TXZA 2V5LA 4H6KA 4AWUA 4YCPA 4P61A 1W8SA 2E5BA 2C18A 4PH6A 1YDOA 3TSMA 5GVJA 3GK0A 1T8XA 3QH2A 5K9DA 2WO5A 5D32A 5LKYA 2JGYA 3LLFA 3HF3A 1JJKA 2B7QA 5FF2A 5HWJA 4GRSA 3TMQA 3W86A 5FEWA 1O95A 2EKCA 2QUUA 5EA9A 1KTBA 3W1AA 3EXRA 5CSRA 3B0PA 4IOTA 2OCZA 4GUHA 4O50A 4ZVJA 5TBOA 3ANYA 3DFTA 1EEPA 4IMGA 3LRLA 3HB9A 1TMHA 3H55A 3CC1A 5KZDA 4O1BA 4OQVA 3N2MA 2WPBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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