1ME9A

Inosine monophosphate dehydrogenase (impdh) from tritrichomonas foetus with imp bound
Total Genus 113

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
482
structure length
349
Chain Sequence
AKYYNEPCHTFNEYLLIPGLSTVDCIPSNVNLSTPLVKFQKGQQSEINLKIPLVSAIMQSVSGEKMAIALAREGGISFIFGSQSIESQAAMVHAVKNFKAHNELVDSQKRYLVGAGINTRDFRERVPALVEAGADVLCIDSSDGFSEWQKITIGWIREKYGDKVKVGAGNIVDGEGFRYLADAGADFIKIGIGGGSIITREQKGIGRGQATAVIDVVAERNKYFEETGIYIPVCSDGGIVYDYHMTLALAMGADFIMLGRYFARFEESPTRKVTINGSVMKEYWGEGSSRARNWFEEGVDSYVPYAGKLKDNVEASLNKVKSTMCNCGALTIPQLQSKAKITLVSSVSI
5010015020025030030025020015010050
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTY3H1 (12-14)AH6 (331-349)TIV9 (322-325)O2 (26-459)TI1 (23-26)3H2 (28-30)S2 (35-36)TVIII1 (46-49)S3 (40-41)TII1 (41-44)TI4 (227-230)AH1 (65-74)S4 (49-50)TVIII2 (50-53)S5 (54-56)S6 (77-80)O1 (57-59)TI2 (59-62)TVIII4 (283-286)S9 (287-292)TIV1 (60-63)AH2 (86-98)AH3 (242-253)TIV2 (239-242)S8 (257-260)TVIII3 (262-265)TIV5 (306-309)TIV3 (264-267)S10 (308-311)AH4 (268-281)AH5 (295-304)TII'1 (281-284)TIV4 (282-285)TIV6 (312-315)TIV7 (320-323)TIV8 (321-324)TI3 (98-101)S7 (235-238)S1 (15-18)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Tritrichomonas foetus
publication title Crystal Structures of Tritrichomonas foetus Inosine Monophosphate Dehydrogenase in Complex with Substrate, Cofactor and Analogs: A Structural Basis for the Random-in Ordered-out Kinetic Mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
total genus 113
structure length 349
sequence length 482
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2002-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1me9A00
5EKYA 2ZTKA 1VCVA 4MZ1A 4MFEA 1XFBA 2DZTA 1VYSX 1WBHA 3L66A 3OIXA 3UXDA 4OE7A 3SECA 3THAA 3L5LA 3LOTA 1T0OA 1AK5A 1TIMA 2QDHA 5F2IA 3M5YA 1LTDA 4M6VA 1R2SA 2FPVA 3NGJA 2ZZ1A 1GG1A 1C29A 1KFKA 1DJQA 1AW5A 1SO3A 5D2WA 2Z6JA 1DQXA 1W31A 4JXCA 2GUUA 2A85A 1BWLA 3I65A 3NQ6A 3O06A 3GKAA 3CIWA 4NXKA 3S1UA 2TYSA 1V7YA 3KRUA 4UTIA 3V1PA 3LV6A 2E68A 4LUJA 1KM0A 3W6YA 4GXMA 5LGXA 1GPWA 2PC4A 4YXGA 1DORA 1U5JA 4OWGA 3SJ3A 2PE4A 4UR8A 3TQVA 3QMSA 4JX5A 3B06A 3NL6A 3W1PA 3G8RA 4H3DA 3W7GA 4HKPA 4AEOA 3DFQA 3K30A 3STFA 3TIMA 4ZMGA 3G3MA 1DQWA 3N2XA 1OFOA 4UC5A 3LTYA 5BNKA 1A5BA 2A5HA 3UQNA 4CNNA 2WQPA 2ZBTA 5CZ0A 1JJKA 3BO9A 1SW3A 2I9EA 3CIXA 4N6FA 1H51A 1TV7A 1YXDA 2J24A 4IMCA 4N4QA 4LV9A 2DJLA 2GJNA 5CSSA 4LVBA 2PRHA 2Y85A 5LNUA 4TR9A 1SPQA 3S42A 3L68A 1YLVA 2H3DA 2ZA3A 1FCVA 3Q94A 2OJPA 1C8VA 5FESA 3BW3A 1W3NA 3NYZA 4R7JA 4N9EA 3PUDA 1OF6A 1NF7A 5F4WA 3KRZA 4IPIA 1K3UA 4UIOA 4CNOA 1HO1A 5H2ZA 3GNDA 4M6QA 3W7OA 3TSDA 1PCKA 3BW4A 4Q33A 2GVLA 3FIGA 3GR7A 2QAFA 5FF7A 3GB6A 4M6PA 4PEKA 5DBUA 5KZEA 2YPIA 5CKSA 4ADSA 1GEQA 3CPRA 4UFJA 2NWRA 4JR5A 2QKFA 5KMYA 4MUZA 1VQTA 4GUGA 3N2MA 4MVAA 4XBKA 1F6PA 1MEIA 3MMTA 3N9SA 3ABRA 1JR1A 3TE9A 3LTSA 3DXIA 1KM5A 4K39A 2VEIA 4NUWA 4JYDA 3ELFA 3LHWA 4LC8A 3A22A 5TIMA 4K8HA 3W71A 5HULA 5EMUA 4HNTA 3BVJA 2NV2A 3VI2A 1W5NA 4NT0A 1EP2A 4KWVA 4MKNA 1FY6A 4B5NA 3NL5A 2ISVA 5TBOA 2WNZA 3M6YA 1JCYA 4UFMA 5F2LA 4GUIA 2G97A 3O05A 3ZFHA 4UTKA 3PB2A 1OABA 4JTUA 4FO4A 1VLWA 3S1XA 3T7VA 1TB3A 4G1KA 3A5FA 5U4NA 2X16A 4OV4A 3W22A 3SSJA 4CCDA 4IXHA 1XM3A 1K7FA 3M5ZA 4K36A 4O50A 4N4PA 5AOUA 4EF8A 4QITA 3QPYA 2FPYA 3NQEA 1KLYA 3FKRA 3QC3A 4UR7A 3S9YA 2J9XA 2QUUA 2QDGA 1I2PA 1TTJA 2H3BA 1K8XA 4QJ1A 4R34A 3QMTA 1ICQA 3TSBA 4PFMA 1HTIA 1RV8A 3W73A 4HPXA 5AN7A 1IXQA 1OFPA 2B7NA 1I2QA 1TREA 3QW4B 5J5RA 3C4UA 4ZQCA 2VELA 2CZEA 4ICNA 1XDLA 4FIQA 1PHQA 2J27A 3T40A 4JX6A 4YCOA 3KXQA 5DBTA 3GXNA 1DOSA 1SSDA 3MP3A 1QWGA 3TROA 2A4AA 2V5BA 3LCGA 3KVMA 3U6WA 3FJLA 3W2LA 1TTQA 2KZHA 4QAIA 3LHZA 1BKSA 1FDZA 2WKJA 4WJEA 4HNUA 5KTLA 5D05A 3MHFA 5FEXA 3W7JA 5FF0A 2CZ5A 1IIHA 2C0AA 2J88A 2UV8G 1B4KA 4RLIA 3N14A 1BEUA 1DJNA 1B3OA 1LCOA 5DY3A 2GQAA 3BPWA 3TA6A 3E02A 4OGZA 4RZ6A 1NF0A 6ALDA 3BARA 4UTTC 1JCLA 1D3HA 3P8IA 4FX8A 3TU9A 2Q8ZA 3G1HA 3W7HA 3W76A 3TV8A 1L2UA 3G1VA 4FXSA 4OBTA 3CTLA 3IIVA 3NPWA 1YTKA 4A3UA 1OHLA 1Q45A 3UPWA 1AG1O 1TSIA 5G1YA 4M5PA 3UWZA 3C2OA 3HIJA 4TIMA 1OYCA 3AO0A 3QPZA 1EX5A 1F76A 3RU6A 4IPJA 5SWUA 4Z1BA 3EXTA 3P67A 3LCIA 1ME8A 3TDFA 5J5DA 4TMCA 4IX0A 3T44A 4PH6A 3EWYA 4KFOA 4JTEA 3LRMA 4AHPA 2VC6A 4DELA 2YR1A 4NXSA 4MZYA 2C1HA 4LWWA 4JGDA 4UTWC 3N3MA 3QRHA 2EHHA 3O16A 4LS1A 2ZZ2A 1XUUA 3P8JA 3HPZA 4LVDA 2HTMA 3P61A 3ZWTA 3F4WA 4I7UA 1O95A 3DHFA 3PWAA 4W9TA 3W3OA 1QCWA 4IUOA 3FKKA 4O10A 5D2VA 5H91A 3NL3A 3STEA 2O7SA 1FCBA 4JTHA 1N55A 3MP5A 1LLZA 2QCEA 3DHDA 5K7JA 1FWTA 5C54A 3QYQA 3EX2A 2ZZ7A 5D2YA 4UNLA 4BFAA 2YW3A 1GQNA 4BK9A 2JBMA 1N7KA 1EB3A 3W1AA 3TKFA 3C0JA 2FB2A 3BGGA 3PS7A 3TAKA 1JCXA 2VEKA 2VFEA 2NUXA 4FF7A 2NV1A 3NQAA 2CLFA 1LRNA 3HGJA 4JY8A 1Z41A 1G4TA 5G5IA 2A7RA 5D02A 4NZFA 1EEPA 3EEGA 1NVMA 4J9JA 5I3FA 1THFD 1F5ZA 2ZRYA 5FEPA 1M7PA 4GBUA 1RZMA 2H8XA 4BI6A 3PG9A 3CLMA 3NM3A 2Y70A 3UWUA 2WOQA 2E6AA 2ZRUA 1TQXA 3SGUA 4N9DA 5LKYA 3H55A 3KX6A 1M7OA 4ORIA 2J6XA 2YYUA 2C16A 3W2UA 1G67A 5CSRA 4MYXA 4TX9A 2OT0A 1PIIA 3GLCA 3HGSA 3EWXA 1TPUA 3THQA 3U8GA 2ZZ3A 3Q2DA 5HWMA 3UWWA 3LTPA 3P82A 3W2NA 2QEZA 1SW0A 2E09A 2QJGA 3W7QA 3W87A 2X1UA 1M6JA 4MFDA 4AXKA 2OCZA 2PRMA 4JIQA 3F4NA 1H62A 5AB3A 4NX0A 3B04A 2DZUA 4UMBA 2ISSA 1KM2A 1UUOA 3ANYA 4A2SA 4JICA 1TRDA 5GVJA 1H7OA 3M1ZA 4RX0A 4DEFA 3AJXA 5HINA 3SZ8A 2XN1A 4IMGA 1HO4A 3FYOA 3G3DA 3QQ1A 1ML1A 3KRSA 1WV2A 4AVFA 2V9DA 3VCRA 3V75A 4JTSA 3C61A 1VLIA 2Q3RA 3S6DA 5LHEA 2X1SA 4KFPA 1HG3A 4I9AA 1I45A 1L6YA 1SZFA 1OX6A 5FF3A 1FCUA 3RK8A 4LW7A 3NQCA 3NPUA 4WY0F 5G4WA 2DJXA 3LCWA 2QCLA 3IIXA 4Z0SA 1FWNA 3B03A 4RR4A 3WJSA 3S5YA 3FOKA 4ADTA 3M5XA 3BG9A 1VYRA 3M16A 3NEVA 4NJGA 1I4NA 1TPVA 4O28A 5AHFA 3LM7A 3EKLA 3E49A 3IEBA 4AAJA 4X22A 1IXNA 2C13A 2AGKA 3P5ZA 1RQEA 3G8EA 3NO5A 2HS8A 1FWRA 4Z1AA 1LRQA 4AB4A 4PODA 1VS1A 1ICSA 3IGXA 1Q6QA 3C8FA 3GYEA 3CB8A 2VEPA 3LBCA 3D0CA 1GYLA 2AAMA 1PCWA 2QCNA 3VFLA 3NM1A 3LCXA 4O15A 5AYYA 4AF0B 1EP3A 2CLOA 1ZAJA 1W1ZA 8TIMA 5AHEA 2GPTA 2ZRXA 1Q3NA 2V2CA 5E0KA 1S5TA 5EL1A 2NZLA 2ZA2A 1Z48A 2NX3A 1O5KA 1A53A 1DKWA 3L0KA 4Y96A 4X9SA 1AW1A 3O1NA 1XC4A 3PSVA 3W7PA 4NNAA 2A7PA 3R13A 3BLFA 3Q37A 4A29A 5F1VA 1DVJA 4P2VA 1HUVA 1ONRA 3NQ7A 4IMFA 3NQ8A 4BWLC 1Y0EA 2QJIA 4DBEA 4M7TA 2Y6ZA 1OFDA 3RNDA 2J9YA 4MJMA 2ZRZA 3UD6A 4HSOA 5G1TA 2QUTA 3DU0A 3ZS4A 1VH7A 1Q6LA 1JULA 1SQ7A 4GJ1A 4HSNA 3STGA 1F7BA 3TC6A 2WSQA 3SGZA 5C2XA 4FHAA 1NEYA 2FTPA 5U7SA 3U2OA 3JS3A 5KITA 3EB2A 3QEZA 2EF9A 4U28A 4E38A 4XQ6A 3UXAA 4CCEA 3W75A 5KZDA 4CQAA 5L9FA 5TQLA 4GUHA 3LI0A 5I3HA 5LGZA 2VFDA 1OF8A 2CLMA 3NZ1A 4Q32A 3A21A 1FWWA 1DV7A 3TJXA 3B05A 2QJHA 4FNRA 4N6EA 1YDOA 2FIQA 3W2JA 3R89A 4JTGA 4JX4A 2V30A 5IBXC 3LERA 3FLUA 4AHOA 5C6MA 3MI3A 2OX1A 2FFCA 1JQVA 4E2DA 4PTNA 1W54A 3W7LA 1QO5A 1OX4B 2G96A 3QF0A 1EWEA 2NXIA 3HOJA 1JQXA 3LB0A 1QPNA 1H7WA 1SFLA 4JYFA 3HMJG 3O6YX 2X2GA 2A7NA 5FF4A 3W1TA 1F2JA 1X8FA 3DFSA 3G22A 2JKAA 3CWOX 4WY0A 3FFSA 3M44A 3TXZA 3L0GA 4TU1A 1T8XA 1OFRA 1GVQA 1OFEA 2GQ9A 3P74A 4IXXA 4XBSA 5HUPA 1WAUA 2JGQA 4O1DA 1XKYA 1YPIA 1XI3A 2GJLA 1S3HA 4JYEA 3PBWA 3A5VA 1FUYA 4CLMA 2CFFA 2NLIA 2NX9A 5C55A 1OK6A 5D2TA 3W7IA 3G1SA 5AC7A 1VCGA 4WUIA 3TC7A 3R12A 5AHLA 2VXNA 4O54A 1K02A 3NQ2A 1OFQA 2NXGA 1ADOA 1IF2A 2EPHA 4S1FA 1JCNA 2YX0A 1SUXA 2Y63A 1WOBA 4OHQA 1SZEA 4NNBA 3CU2A 1SW7A 5G2WA 2ZZ5A 1I2NA 1A50A 1JUKA 2E6YA 2NUWA 2ATMA 5K9CA 3NVTA 3LBMA 4BWLA 3IGSA 4Q4KA 4UFIA 1WX0A 4RZ4A 4YWIA 3WK3A 5FEWA 3TUUA 3TXVA 2X30A 1KFCA 1LOSA 3TR2A 2CLHA 1TTPA 3DBPA 3NPXA 4DO4A 1WXJA 3M9YA 3W74A 2QCMA 1KM6A 4LVFA 4MLJA 1ZHAA 4O4VA 4EWND 5I3IA 4FB7A 1QDSA 3QZEA 3NQVA 3LLFA 5DCBA 4AWTA 4IGHA 1VYPX 3FEMA 4QIUA 5BMWA 3N9RA 1G69A 4L4MA 2A0NA 3EX1A 4UFLA 4PL2A 3G18A 5DCDA 2W79A 2QR6A 2WV8A 2B7QA 3CEUA 4DQWA 5IBXA 3NXFA 3S5ZA 3YPIA 1I2OA 2EAWA 4I7WA 3BW2A 1OVDA 5LNSA 1XXXA 2R94A 2ZYFA 3GXTA 4O1BA 3UNDA 2E5DA 3MBDA 2C18A 3IVUA 2PCQA 2YGYA 2FB3A 1KW1A 3PBUA 3GAKA 3W1QA 4YMZA 1M5WA 3MUXA 1C9DA 2ZCGA 3P62A 2ALDA 5AC6A 1RD5A 4FIRA 2P10A 4WOZA 2CLLA 3L2IA 4MYAA 4RJEA 1QO2A 4FX7A 1OX4A 5EBUA 4OU1A 3BGJA 3E12A 1H60A 1W0MA 3BK0A 1X1ZA 5BW6A 2NXHA 1J2WA 4LUIA 4RV8A 4Z08A 4DF0A 4MJZA 3LV5A 5DXXA 1KTCA 5HQEA 5D04C 2A2IA 2P0OA 3QJAA 3T4CA 2ZQ0A 4WZHA 4LT9A 1EA0A 3S8HA 4HPJA 1W5PA 5I3JA 4ZQNA 1EUNA 4P61A 2CZFA 1TQJA 3TAOA 1FDYA 5C5YA 3W9ZA 5F2GA 1KLZA 3IGUA 1H7RA 4O12A 2CLEA 2Z1BA 3O6DA 2W0UA 4NJJA 1R47A 4UMCA 3FJ6A 3RFAA 1TPDA 3GDMA 4BI7A 1ME7A 3GXPA 3P81A 4JTFA 2TSYA 3NNTA 5T26A 3ATZA 3C2VA 5K4ZA 2HS6A 1R30A 3O63A 1XL9A 2TPSA 4XUGA 2X1RA 4CQ8A 3C6CA 3RLVA 4ONVA 3EKZA 4Z1DA 3GIYA 4O17A 4JTLA 3PAJA 3OVRA 1X1OA 3BLIA 1ICPA 1MEHA 2G95A 2QCGA 3PVFA 5KSWA 1XBYA 4O14A 3LHUA 4XZ9A 3IRDA 2Y89A 1N8FA 5LNRA 3P60A 2BLEA 3NOEA 2YW4A 4GE8A 3W7MA 1S5VA 3HG3A 4K7VA 2WPBA 4JTKA 5DXYA 4GWEA 1VC4A 1TPWA 1TPEA 4Y6GA 2YCEA 1H50A 3MYPA 1FWSA 5DY2A 3P80A 4JN6A 3QSTA 4QISA 2F7FA 4LNYA 2YZRA 3OG3A 2B0MA 3QQ0A 3HG4A 4O0KA 1FQ0A 1YDVA 2JKPA 2RDTA 3S1VA 3L0NA 1UB3A 1TV5A 2CLKA 3QM3A 4O1AA 3NDOA 2A6NA 1WA3A 1RVGA 4NVTA 3EX6A 2E1DA 1R46A 1LYXA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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