1ME9A

Inosine monophosphate dehydrogenase (impdh) from tritrichomonas foetus with imp bound
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
482
structure length
349
Chain Sequence
AKYYNEPCHTFNEYLLIPGLSTVDCIPSNVNLSTPLVKFQKGQQSEINLKIPLVSAIMQSVSGEKMAIALAREGGISFIFGSQSIESQAAMVHAVKNFKAHNELVDSQKRYLVGAGINTRDFRERVPALVEAGADVLCIDSSDGFSEWQKITIGWIREKYGDKVKVGAGNIVDGEGFRYLADAGADFIKIGIGGGSIITREQKGIGRGQATAVIDVVAERNKYFEETGIYIPVCSDGGIVYDYHMTLALAMGADFIMLGRYFARFEESPTRKVTINGSVMKEYWGEGSSRARNWFEEGVDSYVPYAGKLKDNVEASLNKVKSTMCNCGALTIPQLQSKAKITLVSSVSI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Tritrichomonas foetus Inosine Monophosphate Dehydrogenase in Complex with Substrate, Cofactor and Analogs: A Structural Basis for the Random-in Ordered-out Kinetic Mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Tritrichomonas foetus
total genus 113
structure length 349
sequence length 482
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2002-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1me9A00
3P62A 1WOAA 3DAQA 4K6AA 3GDKA 2EAWA 2J9YA 3MP3A 4FNSA 2YCEA 5FF2A 4LU0A 4NX0A 3JS3A 2A85A 1SPQA 1FWWA 5K2ZA 2J9ZA 1KV8A 2YX0A 2PCQA 4KKXA 2QCHA 3NZRA 3LM7A 4O12A 1DORA 3KVMA 3HB9A 1GTHA 2YDAA 4EF8A 1CX9A 3EXSA 1OABA 1OG0A 2WSQA 3GZ3A 1JULA 4GRSA 5AFDA 1YXCA 4H6KA 4TR9A 3O16A 3L21A 3NPVA 4GUGA 3L2IA 2NXIA 2GVJA 1RVGA 3HGSA 2RDTA 2WO5A 3EX1A 2FPTA 3B06A 2V2DA 1U83A 3EKZA 3M43A 1OFBA 2ZZ4A 2CW6A 4CQAA 5I3GA 5EPDA 4N9DA 3BLEA 3LCXA 3LXAA 1AL7A 3E96A 2PRLA 2Z6JA 4AMAA 2E68A 1I45A 4TX9A 3M5ZA 2XN2A 3MI2A 1VYSX 1KM2A 2B7OA 3B0VC 1EUNA 2NUXA 4DO5A 2DZWA 3BK0A 3HPSA 4GUFA 5KINA 2VFIA 2J27A 3NPUA 4FF7A 3OA3A 3TW7A 2WKJA 3A21A 2QCCA 3MHUA 1T96A 4UFHA 1DVJA 4JNMA 4JYEA 1H62A 4GXMA 1GVFA 1UBSA 1L6YA 2VELA 5DCEA 4LS0A 3VI2A 1KTNA 4JTIA 2GJNA 3E49A 3LGEA 3DFSA 3W74A 5LZLA 2OJPA 1PIIA 5J5DA 4AHOA 1G4TA 2ZRXA 1TSIA 1H1ZA 1EWDA 3M0ZA 3NQ2A 3DI0A 1MSSA 3M5YA 1C29A 2Y89A 4XTDA 3UZ5A 4M6PA 4U28A 2CLEA 2VFEA 3FYOA 3UPWA 1TB3A 4GUIA 4UTLA 5D37A 4FX8A 3LX9A 5D2VA 3Q2DA 1FX6A 3QFEA 3TXZA 3T44A 1QCWA 3GXNA 3HF3A 3BV4A 3LTSA 3NGJA 3NNTA 1OHLA 3EKLA 5CPNA 4N9BA 3BGJA 5TBOA 1FCBA 4UTWC 4LWWA 1OYBA 1QAPA 4QISA 3W85A 1ONRA 4NXKA 4O1BA 1EWEA 3CWNA 1KTCA 1GZGA 1DKWA 3AJXA 5HMSA 1JQVA 4WOZA 3B05A 3CHVA 5C2XA 5E1QA 2ABBA 1NEYA 3MP4A 1OX5A 3GDRA 1I2OA 4UFKA 3STEA 3EWZA 3OEXA 4DEFA 6TIMA 5DXXA 2A7NA 4YCPA 2QCEA 2OX1A 2D73A 1LYXA 4JX5A 3DFNA 3THQA 1LRQA 3EWXA 4B5NA 4IMCA 3G1HA 1VPXA 3TAOA 4O28A 1LROA 1WXJA 1XFBA 1VC4A 5F2LA 3HBLA 4JICA 5AOUA 1OFOA 1XM3A 4DO6A 1OVDA 1NAL1 1W3IA 3G8EA 3LDVA 3CTLA 5LHEA 3V1PA 1BWKA 1ZY9A 2DZSA 2FIQA 3NYZA 2VFHA 1TPFA 2NXHA 5DLCA 2X1RA 3P5ZA 4CCEA 1YYAA 3W7JA 2CWNA 3TC6A 4A29A 2Y7GA 1K8ZA 4LS1A 5FF4A 3NQCA 2XN1A 3W1QA 1AK5A 2EKCA 3EWBX 4AF0A 1XXXA 1J5TA 4QIUA 1XDMA 5G1TA 4XUGA 4K36A 1F5ZA 2W6RA 4GFSA 3HGRA 2NV2A 1QWGA 3NR0A 4UTKA 4JY8A 4CNPA 1H63A 1I8JA 5DY3A 1KBJA 3W84A 4LS2A 2YW4A 3QQ1A 3G0UA 3PAJA 3ZWTA 3ZWSA 2DJLA 3GR7A 4L4LA 4Q32A 2FB3A 5F1UA 2PE4A 4ONVA 1OYCA 3GVGA 5BNKA 3UQNA 3FOKA 2A4AA 1R2SA 1OK6A 3TE9A 3CC1A 3KRZA 5DBTA 3L5LA 4QNWA 4O1AA 3ANYA 1NFBA 1HL2A 1ZFJA 4N4PA 1H51A 4QQ3A 4UTJA 4Z1BA 3HMJG 4MYXA 1EIXA 2GUUA 4O52A 4MYAA 3A24A 4GJ1A 4LV4A 3LRLA 4O11A 5D09A 3BW3A 4UTWA 2AGKA 3SJ3A 4RLIA 3UWUA 3QW4B 2WSRA 3TA6A 4J9JA 4O54A 3UZJA 1G4EA 4FX6M 3N19B 3L0KA 3MUXA 3PBYA 5T26A 4Y8FA 4K38A 4M7SA 4OE7A 3W1XA 3PB2A 4BWLC 3B8DA 4Q33A 3IVTA 5E93A 5F1VA 1FXPA 3BO9A 4U4MA 1NVMA 1WV2A 3LLFA 5AYYA 3W1TA 5BMWA 4O18A 3HG3A 3HG2A 3VFLA 3W72A 3IIXA 1KM3A 3ELFA 1LRTA 4RX0A 4AWUA 3TQ0A 1UUMA 4OWGA 4CCDA 3UWYA 1BKSA 2O7SA 1K8YA 4PTNA 1F05A 3GDLA 1KFJA 1HO4A 2R8WA 3CM4A 2ZA1A 1GVQA 4LVDA 2WPBA 1TPB1 3UWWA 5HWJA 1W54A 3WK3A 4JTSA 1DQWA 4H3DA 1WDWA 5A5WA 1ZAJA 1OYAA 1GQNA 5I3FA 3W7OA 1SFLA 2FPVA 1IF2A 1X7FA 5K4ZA 1IXQA 4E38A 4OU1A 5CZJA 2WSYA 5CG7A 5G4WA 3M47A 5G2WA 3W2MA 3QJAA 1YTDA 3HG5A 3L68A 2QJGA 3W6YA 2QCNA 3S1XA 1KM4A 4NNCA 1YXDA 1A5CA 3B4UA 3C0JA 1B3OA 1Q6QA 5MHBA 5K4XA 2ZFAA 1JCNA 2NLIA 2ZA2A 1OF6A 2Y61A 1ZAIA 3CEPA 4UFMA 5D04C 1OX4A 4PODA 3DFQA 3KOFA 3PG8A 4RCXA 1O5XA 2CLFA 4M5PA 3UD6A 2X16A 4NJIA 3P5YA 1FBAA 1FWSA 1M7OA 4HKPA 4UR7A 4WJEA 3FJLA 5AC6A 3NXFA 2VKZG 1ME8A 4DO4A 1W1ZA 2JBMA 5G4EA 1R47A 1TPH1 4EF9A 1H7PA 3EWWA 5FEWA 4NZJA 3NA8A 3FEMA 5F4WA 1OFPA 3IIZA 4IGHA 5AHLA 4AWSA 2TPSA 3FKKA 2B7PA 1QPOA 4K37A 1QO2A 4DF2A 2Z2UA 2EPHA 1WBHA 2QDHA 1JCLA 3W7MA 1YTKA 1GPWA 3W1UA 4UTIA 4EVZA 4JDYA 2RKXA 2GQ9A 3GAKA 3TR2A 4JGDA 3LHWA 4N9CA 1N55A 2OT1A 3NVTA 1TYGA 4YL2A 3LBCA 3N34A 3NPWA 5AB3A 3CLMA 1VJIA 2X1TA 4JX4A 3BLFA 4XKYA 3CEUA 4O4VA 2CFFA 1LLWA 2Y88A 1SSDA 5LSMA 3O8AA 4WY0F 4A2SA 1DV7A 4ZQRA 4A3UA 2QCMA 4BWLA 2C6QA 2FQIA 3DGRA 3SZ8A 2J9XA 1RV8A 3G22A 4JTHA 3NQDA 1R2RA 3A5VA 4HPJA 2QR6A 4LVGA 2ALDA 1FWTA 1KV5A 3N2XA 2G96A 3HGOA 2W79A 3W9ZA 1PCKA 4RXGA 3C6CA 3MO7A 2BXVA 4RJEA 1VLWA 4NU7A 3A9IA 5ABTA 2G97A 5HR6A 3L67A 5CZ0A 2V5LA 5LNWA 4N4QA 3F4NA 5HNRA 2BLEA 1I2QA 4EIVA 2A21A 4NX5A 3EWUA 5H91A 1OFRA 3S8HA 2X1UA 4WY0A 4IWWA 1OK4A 1AG1O 2GOUA 1C9DA 3NQEA 5I3KA 2V2CA 1PV8A 2Z6IA 4LRTA 4OV4A 3RF9A 3P60A 3DZ1A 4ZQOA 1B9BA 3WJYA 3JRKA 4EWND 5K9CA 4O0KA 1OFAA 5KZMA 3GLCA 3LB0A 1VCFA 4N2YA 3KHJA 5TIMA 5CGQA 3PWAA 3LHVA 2B4GA 5CPMA 2AQWA 3W7EA 3S42A 4UNKA 4CQ8A 4O14A 2Y6ZA 3LHYA 3QW3A 1JQXA 5E0KA 1HO1A 2V8ZA 3FS2A 2JGQA 2A6NA 2VEKA 4LW7A 1G69A 4POCA 1WYIA 5D2XA 4ZQNA 5F2IA 5FI8A 4PL1A 1FWNA 3RMJA 3RLUA 3A23A 1TPVA 3WK1A 4LV9A 5CZTA 4M6VA 3IVUA 5AC8A 1QPQA 3U8GA 1FQ0A 5C54A 4JDBA 4NT0A 1JVNA 3M44A 3IIOA 2C15A 5AC7A 4AEOA 5H2ZA 3L9CA 4KFPA 4MZYA 1PE1A 5DXYA 3PM6A 5AN7A 4FNQA 2E6YA 4MJZA 3TXVA 3TJXA 3EB2A 2FB2A 3O05A 5AHMA 3OVQA 3UY7A 2DZPA 2ZCGA 3PB0A 4FIQA 4UNLA 5SWUA 4LOCA 3W7NA 2QCGA 1A5SA 3CIWA 1LLZA 2WNNA 1LCOA 3CWOX 1SW3A 4AB4A 4I7UA 1GT8A 1TV5A 5FF7A 1LDCA 4JD4A 3S1VA 4UR8A 4YMZA 2RDWA 1VYRA 1FXQA 3TU9A 2QJIA 3WK2A 1PL9A 3G1XA 3TAKA 4A21A 2C3ZA 3LTYA 1VHCA 1GVOA 1FDYA 1WA3A 5G2IA 1KFEA 2XFWA 2ZTJA 3QMTA 3G3DA 5FF3A 2OZ0A 3C52A 3PUEA 7TIMA 4X3ZA 2A6LA 3U2OA 3W7HA 3OG3A 1XKYA 3TMLA 4HPXA 3MI6A 5L6UA 1ZNNA 3C4UA 1ZHAA 3GDTA 2EF9A 3PULA 2JKPA 3O63A 1G4PA 4OGZA 4PH6A 5AHIA 4Y90A 1WX0A 5LKYA 1N7KA 4ZZ9A 5AYXA 1KFLA 3R5EA 2NX1A 3LCWA 5EBUA 3TKFA 4MZ1A 1P1XA 3E12A 3M6YA 2E1DA 4X2RA 3UXAA 3GAYA 3GX9A 1VS1A 1OX6A 3TDFA 1XUUA 2GJLA 3KX6A 3P8IA 1G67A 4M7TA 2VXNA 4AAJA 1S5TA 4Z0JA 4LY8A 2QJHA 4OHQA 2FPYA 3O06A 2PC4A 2O7QA 1SW0A 1VYPX 1JCYA 1IXNA 3UXDA 2X1SA 2Q3RA 4Z1AA 4K7VA 2FFCA 1I2RA 1KM6A 4DBEA 3L5AA 5HWMA 3IGUA 1T8XA 2GQ8A 3SECA 4DF0A 1D9EA 3ATZA 3P61A 3H53A 3E9AA 3N9SA 2F7FA 3T4CA 4O57A 1Q6LA 2J88A 4RR4A 2ZRWA 1TTPA 2GQAA 3I7RA 1YDNA 2P1FA 4LT9A 3W88A 4LUJA 3MHGA 3H54A 2H3BA 1TJPA 3H55A 3NQMA 3MHFA 2R14A 3QC3A 1N8FA 3DFOA 4Y6GA 1AW1A 1GVRA 3QM3A 3KFTA 4N02A 1H7OA 3LXBA 4O1CA 2JGYA 1GWJA 2E6DA 1MEHA 2ZZ6A 2CLOA 4EOUA 4PFMA 4DQWA 3N9RA 1ZJIA 5LNVA 2NX3A 3HGJA 4XQ6A 3P7YA 3S5OA 1B4KA 1W56A 3OHIA 1GJPA 2EGZA 3W1MA 2FTPA 3B0UX 1NF7A 3IGSA 2AAMA 3SY5A 4QSHA 3QF0A 4IX2A 4YWIA 1J2WA 5D2TA 3EXRA 3MWAA 1TIMA 2CZEA 3C2EA 1T99A 2ZRYA 4ADUA 1H7RA 1H7XA 3S9YA 1TQJA 3LHTA 1GG0A 3C2VA 2NUWA 2PURA 1V7YA 4FB7A 4JTFA 4R7JA 1VQTA 4BI6A 4WZHA 1QOPA 1WAUA 1QO5A 4MJMA 5AHEA 4MOZA 1G7VA 4HT3A 4UFJA 4YXGA 2ZA3A 5EY5A 1W5NA 3W7IA 2V9DA 2YYTA 3EX3A 1O60A 1K7EA 3NQVA 3OIXA 2W0UA 2DU2A 2E5CA 1F6KA 2RH9A 3HPXA 3C2RA 2CU0A 1B57A 1K3UA 4E2DA 3LLDA 2G95A 3B03A 3TFCA 3NL6A 5TQLA 1SU5A 2I9EA 1FCUA 1W31A 2ISWA 1K03A 5DELA 3P80A 1TRIA 4TIMA 3IRDA 3STCA 2Q3OA 5HINA 2CLLA 2Y7EA 1ICPA 1ADOA 3QMRA 1W3NA 4LUIA 2QUUA 2C18A 2WNQA 2TYSA 3BGGA 3G1DA 3NQGA 3B04A 5FESA 4BK9A 5I3HA 4Z1DA 1P5BA 2GPTA 5K3VA 3G1SA 1EP1A 2QUVA 3NL2A 4GE8A 3FIGA 4UMCA 3KRUA 3W1LA 3ZS4A 4UTHA 2ZZ7A 3HPZA 5IBXC 5DN1A 1XCFA 4CCCA 2VOMA 2QKFA 1A53A 2ZQ0A 3GXTA 4NJJA 1KTBA 2QDGA 4ICNA 1R46A 2J24A 1FY6A 4ZL1A 3MYPA 3LV6A 1GVSA 4TMBA 3GKFA 2B7NA 3O6DA 4I7WA 3MI3A 4TMCA 2VENA 4UIOA 3INPA 1F6PA 1I4NA 1LP6A 4CQ9A 1X1ZA 1LOLA 2YW3A 2ZBTA 4RZ5A 3BW2A 5CPLA 2R91A 5F2MA 1HG3A 3ABSA 1LTDA 4IXXA 4IOTA 5EA9A 3QSRA 3HIJA 2E6AA 1YXYA 3BG5A 4LC6A 2NZLA 5CZSA 3VCRA 3Q58A 3GNNA 1VCVA 3S5YA 1LBLA 1ZENA 4FNRA 3LBMA 1SQ7A 5AHNA 2QCDB 4JTUA 3IVSA 1IXPA 4IQLA 4I9AA 3YPIA 2A7RA 3L0NA 1M7PA 1SZEA 2A7PA 2VEPA 3PBWA 4ZQMA 3KVLA 2Y62A 1PS9A 1P0KA 4IPIA 1S5WA 1VCGA 2A2IA 5HR7A 4UXDA 3UY8A 1I2PA 2JKEA 3WJWA 4HNTA 4FIRA 1A50A 4NJGA 4AWTA 5KMYA 4KWVA 4JTKA 4O50A 1YDVA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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