1MEHA

Inosine monophosphate dehydrogenase (impdh) from tritrichomonas foetus with imp and moa bound
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
482
structure length
353
Chain Sequence
AKYYNEPCHTFNEYLLIPGLSTVDCIPSNVNLSTPLVKFQKGQQSEINLKIPLVSAIMQSVSGEKMAIALAREGGISFIFGSQSIESQAAMVHAVKNFKAGFVVSHNELVDSQKRYLVGAGINTRDFRERVPALVEAGADVLCIDSSDGFSEWQKITIGWIREKYGDKVKVGAGNIVDGEGFRYLADAGADFIKIGIGGGSIITREQKGIGRGQATAVIDVVAERNKYFEETGIYIPVCSDGGIVYDYHMTLALAMGADFIMLGRYFARFEESPTRKVTINGSVMKEYWGEGSSRARNWEEGVDSYVPYAGKLKDNVEASLNKVKSTMCNCGALTIPQLQSKAKITLVSSVSI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Tritrichomonas foetus Inosine Monophosphate Dehydrogenase in Complex with Substrate, Cofactor and Analogs: A Structural Basis for the Random-in Ordered-out Kinetic Mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Tritrichomonas foetus
total genus 115
structure length 353
sequence length 482
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2002-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1mehA00
3PWAA 2FLIA 2WKJA 3W2UA 1RV8A 2JGQA 2ZQ0A 5E1QA 3W2NA 1XDLA 2P0OA 3HOJA 3O1NA 3E0IA 2ZDRA 3FYPA 1KFEA 4Y96A 2PURA 4P2VA 1OX5A 3W84A 1RR2A 4UTMA 2QCHA 3W1MA 1M5WA 1FQ0A 1TTIA 4JTJA 2V2DA 4C1KA 1LORA 1EUAA 3LRMA 4A22A 1H63A 3VKJA 5HR6A 1M6JA 4ZQOA 3LI1A 3EWYA 3MW7A 4KWVA 3S5NA 4TO8A 4Z1AA 3WK3A 3S8HA 1CI1A 3NQDA 3GYEA 1C8VA 4FNSA 1GVFA 3DBPA 1LZOA 2ZRZA 2DZTA 5C2XA 3C2OA 3N9SA 3RLVA 4DXVA 1TPFA 5EKYA 3B06A 1Z48A 3KRUA 3NQVA 4O1BA 3FJLA 3DI0A 3WK2A 3RU6A 1SO3A 1Q6LA 5DCEA 5AC7A 2V8ZA 3G24A 2NZLA 3M41A 5CZSA 5CGQA 4BR1A 1JCMP 2Y7GA 4MJZA 1SU5A 2ZZ2A 5K4ZA 5HR7A 2OMAA 4JX6A 3OEXA 2I14A 5D2YA 1TPVA 4M6VA 5AC8A 1YDOA 1H5YA 2Y61A 3U2OA 1GQNA 3B04A 4LS1A 3FEMA 3PVFA 4N6EA 1X8FA 4DPQA 2BWGA 3UWZA 3NGJA 4NXSA 1F05A 3R12A 4XBSA 1QOQA 4A29A 1N8FA 2DJLA 2NWRA 3GDTA 4ZZ9A 1Q45A 1LM1A 3NOEA 4LV4A 4HSOA 2BX7A 3M5YA 4JTFA 2WJZA 5I3KA 2V81A 5F4SA 1LROA 3TKFA 3GAYA 3CPRA 3LLDA 4YXGA 3O6CA 3SZ8A 3GXTA 2G97A 5DY2A 3DI1A 3R13A 4AWSA 4NNBA 2Y6ZA 1F6PA 5BRBA 4NZJA 1H7PA 2TPSA 2W6RA 3LCXA 2A0NA 4IPJA 5LNSA 4M6QA 3ABRA 5I3HA 2AGKA 1W37A 4TMCA 2GJNA 1QAPA 5CZTA 4QNEA 4ZQNA 2NUXA 3NQEA 1ICPA 3LX9A 1KLYA 1QPRA 5CPNA 4M6PA 1DHPA 4M5PA 3GB6A 1F73A 5BMWA 1LLWA 1OX4B 5CPLA 2ALDA 1GVQA 2Z1BA 5DELA 4UMAA 1WA3A 1I2OA 5LNVA 3IRDA 5I3GA 1ICQA 1KTNA 3VE7A 3O15A 1A5AA 4JN6A 1DOSA 3INPA 1H61A 2CZ5A 4DO4A 4MIMA 3L0GA 1TPDA 3TJXA 3DFSA 1VCFA 3NM1A 3G1VA 4UTKA 5I3IA 2A7RA 3W7PA 3W07A 4I7WA 3QC3A 3W75A 3CWOX 3W1AA 2QUVA 1Z42A 3TJLA 3DFQA 5LKYA 3MO7A 1KV5A 3W1PA 1IIGA 4S1FA 3TDFA 3W7GA 5D2WA 4KFOA 4O10A 3EKZA 4XKYB 5K9XA 3W6YA 1P0KA 3F1QA 1SSDA 4IMDA 3T7VA 2A4AA 1QNVA 1LBLA 2YX0A 3CTLA 3NL6A 2CZFA 1LRNA 1Q3NA 3Q37A 1GZGA 3NQCA 1TQJA 1RQBA 5EBUA 5C54A 3P74A 1UASA 3D0CA 4WZHA 3B05A 1TV7A 3NG3A 4ONVA 3GDKA 4UFJA 3KHJA 1F7BA 6TIMA 1MEWA 3IV3A 1ALDA 1TPWA 4DPPA 2RDUA 2YDAA 3UZJA 3HG2A 5LNRA 3W85A 3W83A 3N2MA 1JVNA 6ALDA 1YPFA 2JK2A 4O13A 4XTDA 3CT7A 4CCEA 4JX4A 3G1AA 4NJJA 4XKYA 1WOBA 3M9YA 4AXKA 2RDTA 3I7QA 1JCNA 1PE1A 3NDOA 3L9CA 2ZA1A 1SFJA 1G6CA 4UTUA 1YYAA 3EWBX 4RXFA 1FCQA 4GNJA 4OBTA 4JDYA 2Q8LA 3W74A 4DEFA 2ZBTA 3PR2A 2QAFA 4L4MA 1H7RA 3FA5A 3E02A 3UPWA 3N2XA 1XL9A 3W3OA 4IPIA 1VYPX 4GUHA 4JX5A 4K8HA 3LLFA 3PAJA 4WD0A 3EX6A 1LRQA 1H50A 2A6NA 1RVGA 4GE8A 2WOQA 4PEKA 2E5DA 3PSVA 4YMZA 3C4UA 1S5WA 3O07A 3W71A 3ZS4A 3N3MA 3WFAA 3UWUA 2NXIA 2P1FA 4K39A 4IMGA 4UCGA 3BV4A 4N4PA 3W88A 3C56A 2QCDB 3MWAA 4AF0B 5FF0A 4YCOA 5TIMA 4P61A 4YWIA 4MFDA 2DZSA 4DQWA 2VC6A 1ZAIA 1S3HA 4JTEA 4DF1A 1GOXA 3VFLA 5BW6A 3TUUA 1K7XA 1P0NA 4NJIA 4DBDA 4IWWA 4CLMA 1AL7A 4ZQMA 4QJ1A 4ZQPA 5G2HA 3GVGA 1XFBA 1QR7A 4O1CA 4AEOA 2J9YA 1W54A 3IIPA 2QEZA 4LU0A 4LUIA 4N9DA 1O4UA 3DGRA 3UQNA 1AMKA 3RK8A 3B8DA 3P62A 3V75A 1J5TA 4AF0A 2R91A 4NXKA 3HBLA 2X30A 4LVAA 4B5NA 4K36A 2V0TA 3M44A 4GUJA 2B4GA 4A21A 5U4NA 1DL3A 4DF2A 2ISSA 3W7EA 1DV7A 3E12A 1L6SA 1I2RA 2TSYA 2HSAA 5DLCA 2PE4A 5I3JA 5LHFA 1K03A 1VCGA 3C2FA 3BW4A 1EWDA 1TIMA 5CG7A 3M5VA 4A2RA 2E5CA 3N14A 5HUPA 4XQ6A 2VFEA 3NQGA 2QKFA 1HUVA 1GEQA 4O18A 2RHGA 3W7CA 1QMLA 1VHCA 2V9DA 3NO5A 1OX6A 4JYDA 3L68A 1KM3A 2OX1A 4NJKA 2ATMA 4QQ3A 4JR5A 2FPYA 4N9BA 3UY7A 3MJYA 1AW5A 3TU9A 3TQVA 1NEYA 1SUXA 2CLKA 2VELA 3RLUA 4AMAA 4E2BA 3GX9A 2EPHA 1K02A 2KZHA 3BLEA 3HMJG 1ADOA 4YCPA 1TSIA 4PA8A 4GBUA 3I7RA 2CLEA 4RV8A 4N2YA 4BI7A 4MOZA 5FF4A 3NQMA 3IIXA 2C0AA 5K9DA 4JEQA 1JUBA 1A5CA 3PB2A 4O14A 4XTIA 4ADUA 1X1OA 4JTHA 4WXYA 4QNWA 4O0ZA 1JRCA 3ABQA 3GKAA 1LDCA 5HNRA 5HWJA 3KOFA 3QPYA 4A3UA 2G5WA 3MI2A 4PH6A 1SSGA 5DCBA 5FESA 3MMTA 1B4KA 1UUOA 5HQEA 1I2NA 2C19A 3W2KA 5AYXA 3FOKA 1GYNA 3NQ2A 2Y88A 4RR4A 2F84A 2QUUA 4X2RA 3C2EA 3DENA 1SFLA 1TRIA 2CLMA 3UXDA 2XN2A 1JUKA 5DBUA 1ME7A 5ABTA 1TPUA 2ZRXA 3LHUA 3R5EA 3W1XA 3GK0A 1W3IA 2C18A 3YPIA 5G4EA 3WK0A 4EF9A 1J2WA 1QPNA 5AYYA 1R47A 2C14A 2ZTJA 4JICA 1LYXA 3L0NA 3BO9A 3GDRA 1LTDA 3TMLA 2E09A 2FPVA 3GLCA 3W2JA 1GWJA 3EX3A 4MY8A 1QPOA 1G4EA 3G3MA 1D9EA 2GQAA 1A50A 5A8GA 3W7MA 1GG1A 2DU2A 2RH9A 3QSRA 1TQXA 4NJHA 3I68A 3WK1A 3QPZA 4CNPA 1I8JA 3P7YA 4UTIA 4ZVJA 1RPXA 3R2GA 2A6LA 4IXHA 1SW7A 1GVOA 3W72A 3W7JA 3JRKA 2J9ZA 1NF7A 3LRKA 4X3ZA 2CFFA 2NLIA 4O1AA 1LBFA 1AL8A 4AH7A 2VFGA 4BK9A 3ZWSA 4UTJA 2BLEA 1NFBA 1EEPA 2YYTA 3QF0A 1T96A 3S5ZA 2YW3A 3DKJA 4WOZA 1QCWA 1TPC1 1H7WA 3BG3A 2G96A 3HQ1A 4GC4A 3TSBA 3W7IA 2DORA 4BWLC 1NSJA 3P82A 1O94A 2RKXA 1VLIA 1VYSX 3S1XA 1LP6A 3LXAA 3UYCA 4O17A 5HWNA 1H7NA 4FNRA 3DHDA 5D05A 2C6QA 1O5KA 1KFJA 1ZHAA 2J24A 3L5MA 4HPXA 4O28A 4PL2A 5AYZA 3G1XA 3UWWA 4AVFA 3TXZA 3I65A 3LCHA 2W0UA 4IMCA 1EPXA 1W5OA 3NL3A 1KFBA 3QQ1A 4K8EA 1FDZA 1WDWA 3LCGA 1G67A 1A5SA 3EKLA 1FDYA 1Q6OA 4GUFA 2Q3OA 5G2WA 2CLHA 1XBZA 4ZQCA 4LTSA 3C3NA 4MLJA 3A23A 3FYOA 1QO5A 2ZZ4A 1TV5A 1N55A 1OVDA 1TCDA 5FEWA 3KVKA 4IOTA 2VENA 3BG5A 3LTSA 4FIRA 4JYEA 5DN1A 1W56A 2QJGA 4JY9A 4M7TA 1B3OA 3NPWA 4JYFA 3O8AA 3UNDA 1KBIA 5D09A 4L4LA 1LRTA 3PM6A 1WBJA 2PRLA 1KFLA 3RMJA 1K7EA 4BI6A 3VE9A 4Y8FA 2E6DA 3NPUA 3CEPA 4LVBA 1L6WA 2ATSA 4O57A 3HPSA 2ZA2A 1M7PA 4NNAA 3NEVA 3W2MA 4RZ5A 5DBTA 3IIVA 3DFNA 5F2GA 3OIXA 2CU0A 2E6YA 1OABA 2HS8A 3BK0A 3EWUA 1H1ZA 2A2IA 3CM4A 1R2TA 3G1YA 4GFSA 3L67A 4A2SA 1YTKA 3SR7A 4OHQA 1FDJA 2CLFA 1AK5A 4MY9A 3P84A 3MUXA 1A53A 4NX0A 1W1ZA 3AO0A 4XZ9A 1JR1A 1O5XA 4OT7A 5BOOA 4G1KA 2XN0A 4GJ1A 1HO4A 1XBVA 1OYAA 1XBYA 1YXYA 4IGHA 3STEA 3IVTA 2GPTA 5AN7A 3W23A 1OFOA 1W5QA 4BFAA 1RD5A 5D37A 1G4PA 4IQLA 4MY1A 1VYRA 4UTTA 3I7SA 3P61A 2FTPA 4JTUA 1A5BA 4LV9A 1EWEA 4S2CA 4O53A 1TJPA 1R2RA 4NQ1A 3GXPA 1BWLA 3TE9A 1OJXA 3W1LA 1PS9A 1SZFA 4AHQA 3T40A 1XCFA 1YDVA 3O63A 2QUTA 1B4EA 3A5VA 3A22A 2H6RA 3LHZA 1LOLA 3BGJA 3P8JA 2GUUA 1RZMA 2EGZA 5F2IA 3OVPA 3O16A 3PBUA 4LT9A 3NPXA 5AHFA 3W1RA 5AHIA 2O7SA 3NNTA 2EKCA 4UC5A 2V5BA 3C2RA 4CNNA 4GXMA 1TB3A 3W1QA 2VEMA 5BMXA 2RDWA 2WQPA 1TPB1 4MKNA 1HO1A 2EHHA 1MSSA 3HGRA 3HG5A 4UNKA 3NQFA 3G22A 3DZ1A 3S42A 3SW6A 4IXXA 2X1SA 4JTKA 4LOCA 3QSTA 3GR7A 2A1YA 4M19A 1WXJA 1FCUA 1XUUA 4WX2A 3W1NA 3C52A 2J27A 4EF8A 2WNNA 2R8WA 1FWWA 1Z41A 2JKEA 5DY3A 5F1UA 3LERA 1DJNA 2E6AA 3HPXA 4UIOA 1TREA 1KM6A 1UUMA 3L5LA 1C29A 2VFDA 1GVSA 2WSYA 4YLWA 4JTLA 3S0CA 4LC8A 1KM5A 4MLRA 2ZRWA 2ZRYA 3C6CA 4LRSA 4HPJA 3LTPA 4C1LA 3S5YA 5GVJA 3GXNA 2YZRA 3TC7A 5DXXA 1FX6A 4EOUA 3F4WA 2Y7DA 2NXHA 4DF0A 1BWKA 3GAKA 4WQ6A 4O8RA 1TTQA 1GPWA 1D3HA 2QCLA 3QM3A 2Y7EA 2X1RA 7TIMA 4GWEA 3QJAA 4U28A 3G0XA 5G4WA 3B03A 1I2QA 1K8XA 3CEUA 1GTHA 4HKPA 1IXQA 5FEZA 3LCFA 2QCEA 1KM1A 2PRHA 3I6RA 3KVMA 4N9EA 2GQ9A 2FQIA 1YLVA 3EX2A 3N34A 2FFCA 1JUEA 4JY8A 1JQVA 1YDNA 1DJQA 5CKSA 4WUIA 5IBXC 2QCGA 4MYXA 4JTGA 5D2VA 3FKRA 1FXQA 3LV5A 4H4IA 4Z1BA 4ICNA 2DZVA 4JS3A 1ZAJA 4W9TA 3W7QA 4E0CA 4QSHA 3TH6A 3TW7A 1TTPA 1IXPA 3HIJA 1F74A 3LXBA 2GVJA 5EMUA 1X1ZA 5LGZA 3M6YA 1EP1A 3NQ8A 3C8FA 1G7VA 4E38A 1QOPA 3ATZA 4XUGA 2ZZ7A 1MXSA 3USBA 3ABOA 4MFEA 5C55A 3G8RA 4Y9AA 5TBOA 1HFBA 2TMDA 2H90A 5D33A 1KLZA 2QCCA 2Y89A 4TU1A 1IGSA 2CW6A 5FF3A 1JCJA 1FWSA 3QH2A 1FXPA 1MZHA 2I9EA 4FXSA 4UFIA 5FI8A 4MUZA 1VR6A 4HSNA 4NT0A 5KTLA 1H51A 2GVLA 3W1UA 2BZNA 4FX8A 3NL2A 1MEHA 1PV8A 1RQEA 4EVZA 2J6XA 2B7NA 4AHPA 1W31A 1F2JA 3C2VA 4O4WA 2HS6A 2XN1A 3KFTA 3NAVA 1FBAA 3HO8A 3A9IA 1JCLA 1EIXA 1W0MA 1BTMA 1TJRA 3W7DA 2F7FA 3WJXA 3NA8A 3UXAA 4N4QA 5G1YA 3P8IA 1PL9A 3IGSA 3JR2A 3KX6A 4HT3A 1GTEA 3W87A 3TSMA 1EUNA 5U7SA 2NV2A 1ML1A 1TMHA 3IEBA 3RF9A 5LNWA 4DO5A 3LV6A 4NVTA 3CB8A 3UD6A 3ANYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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