1MZHA

Qr15, an aldolase
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
225
structure length
225
Chain Sequence
MIDVRKYIDNAALKPHLSEKEIEEFVLKSEELGIYAVCVNPYHVKLASSIAKKVKVCCVIGFPLGLNKTSVKVKEAVEAVRDGAQELDIVWNLSAFKSEKYDFVVEELKEIFRETPSAVHKVIVETPYLNEEEIKKAVEICIEAGADFIKTSTGFAPRGTTLEEVRLIKSSAKGRIKVKASGGIRDLETAISMIEAGADRIGTSSGISIAEEFLKRHLILEHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Aquifex Aeolicus Aldolase, Northeast Structural Genomics Consortium Target QR15
rcsb
molecule keywords Deoxyribose-phosphate aldolase
molecule tags Structural genomics, aldolase
source organism Aquifex aeolicus
total genus 86
structure length 225
sequence length 225
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.4: Deoxyribose-phosphate aldolase.
pdb deposition date 2002-10-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1mzhA00
4IMGA 5EMUA 3S1UA 1T96A 1W0MA 2ZA1A 3SI9A 1JJKA 2ZFAA 4ORMA 5EPDA 1OG0A 1QWGA 1KV5A 1DQXA 1KLYA 1V7YA 1L9WA 3W88A 3C4UA 3NQ7A 4K8EA 3G0SA 5HUPA 3TE9A 1GJPA 1N55A 1YYAA 2OT1A 1AK5A 1KFCA 1MSSA 2E6AA 2NV2A 3LTPA 5D2WA 3CTLA 1GTEA 2ZZ5A 4RR4A 1L6YA 4U4MA 5U7SA 4DXVA 1ZHAA 3CT7A 5LNVA 1A53A 3KRZA 4RCXA 1TRIA 1MEHA 2NUYA 2NWRA 3B05A 5KMYA 3IRDA 1A50A 4GBUA 1RQHA 5HNRA 3WFAA 2YCEA 4CNPA 1VYRA 1M7OA 3PVFA 4NJGA 2B0MA 4JS3A 3T78A 1F73A 3PB2A 4FNRA 4JYEA 4ZL1A 3P8JA 5LNRA 3QC3A 3QH2A 5BOOA 4O52A 3MHFA 2B4GA 2QCFA 4N9EA 1Q6RA 3OVQA 1Y0EA 3IGUA 1UBSA 2CWNA 4WJEA 3P5YA 5D2TA 3BW2A 1A5CA 1SFJA 3W73A 2WNQA 3SSJA 2BWGA 4O1CA 2OX1A 1W37A 3F4WA 3TIMA 3E0IA 1QCWA 2ZRXA 1YXYA 3DENA 4R7JA 4MVAA 1JUEA 3N14A 5D2XA 4O54A 3NGJA 1LZOA 2NXIA 3ABQA 2Y88A 5HWJA 1GTHA 1QAPA 3PM6A 3CIXA 4TIMA 1H7NA 1ZNNA 1KTCA 2BZNA 2A85A 4RLIA 5EY5A 1W1ZA 5K9XA 3KOFA 4FX8A 5FF3A 1SFLA 1SZGA 4IJBA 3IGSA 1XUUA 3RLVA 1H7XA 4OV4A 4DELA 4UTMA 4ORIA 4FXSA 3KXQA 2C14A 3O06A 5FF2A 1R2RA 2B7OA 5AC6A 4B5NA 1DVJA 3GKAA 1I8JA 2ZA2A 2E5DA 3ZS4A 3QMRA 2PURA 1VLWA 4A22A 3NL2A 2J6XA 4PTNA 1DJQA 5AC7A 1T99A 2Y7DA 2ZRZA 2CLEA 4QNWA 4LT9A 5C5YA 3CEPA 1LBMA 4OV9A 3PR2A 5AYXA 5K3VA 3TQ0A 3VE9A 3R89A 1D3HA 5D32A 2YXGA 4UTKA 4R53A 5AN7A 2CZ5A 3QJAA 5G2IA 1KTBA 1JRBA 1UUMA 3PG9A 3W7CA 2ZDRA 4JTKA 4UTLA 2TRSA 1PCKA 4UFJA 4Y6GA 4AF0A 5AHEA 1K7XA 4KFPA 4M5PA 4WZHA 3R2GA 1TCDA 2A7NA 2H3DA 3P60A 3MP4A 3LI0A 4DEFA 3P61A 1DBTA 1KTNA 2Z0IA 4XTIA 4K7VA 3PC0A 3WJWA 2Y85A 5EA9A 1X7FA 3C52A 4O10A 4S2CA 5AFDA 3PF3A 3A23A 1K02A 1G67A 3FYOA 3T44A 3Q2DA 4MUZA 2Z6JA 5A5WA 2YSWA 3G1SA 3NM3A 3DFOA 4UTIA 4Z0JA 3HGJA 2E5BA 3IEBA 3GDKA 2GJLA 1O5XA 5AYZA 3TW6A 3BG9A 3IIXA 3ZWSA 2NX3A 1TPB1 3GIYA 3ABOA 4O50A 1KLZA 2A2IA 1F05A 2TPSA 2W79A 3KAOA 3NQDA 3FEMA 3R8RA 3EX6A 1Q45A 3G1YA 3PG8A 4UTTC 1W5QA 4YMZA 1UB3A 4HT3A 4IMFA 4AWSA 1W3NA 4WD0A 3UY8A 1SO4A 1B3OA 4CCDA 5K4XA 3O05A 4BFAA 2YW3A 1OABA 4CQAA 1FX6A 1G4SA 1ZCOA 4M7TA 2P1FA 3EXTA 1OF8A 2ABAA 1Q6LA 4Q4KA 3BLFA 4HSOA 5H2ZA 2D73A 1IF2A 1VYSX 3M47A 4N9CA 5H91A 1BWKA 1JQXA 2A6NA 2P0OA 4LVAA 1TPVA 3O6DA 2E09A 3DHDA 1EEPA 3S8HA 1W5OA 3G8EA 4O57A 1GWJA 5AC8A 1I2NA 1OFOA 1DJNA 3PUDA 3LCLA 1K8YA 3S9YA 2WKJA 3WK2A 1VQTA 5GVJA 2VFHA 4O0KA 2PRMA 1XBYA 3HG4A 4JR5A 1GVRA 2WPBA 1EWEA 3E49A 3N2XA 2C18A 2ZTKA 3EWXA 3GYEA 3G8RA 1FQ0A 5D37A 4X22A 1PHWA 4GNJA 2A0NA 1U5JA 2DJLA 3G3DA 4NNBA 3GVGA 1A5SA 3LXAA 2RDUA 4GUGA 4K6AA 4IMDA 2ZQ0A 1S5TA 1Q6QA 3C2FA 1CW2A 2F7FA 3I65A 2XN0A 2JGQA 5F2IA 4GUFA 1TB3A 1SR9A 3PB0A 2EAWA 4DQWA 4PH6A 1YDNA 4QISA 1TREA 4BWLC 3I7SA 3W2UA 2ABBA 3DFPA 2FLIA 1S5WA 3C3NA 2BX7A 4O28A 1W3IA 1WV2A 1IIGA 2TMDA 4RZ4A 1JR1A 3TQKA 3HG2A 5D05A 4L4MA 2CFFA 1SU5A 4HPXA 1WBJA 1OFDA 4Z0SA 1GOXA 1VGAA 2V30A 2HS8A 4E38A 1FDZA 1V5XA 4IQLA 2RKXA 1I45A 3W74A 1FWTA 3HOJA 4MLJA 2WNNA 4GFSA 1AMKA 3LXCA 3M44A 3SGUA 1YTKA 3N19B 2CLMA 3L67A 3G3MA 3L5AA 5EBUA 3M5VA 1GT8A 1AW1A 1WDWA 4FIRA 3NG3A 1P0NA 2EF9A 3KRSA 1FBAA 2QCLA 3DAQA 3MP3A 3LTYA 4LRSA 5LSMA 5I3FA 1LOLA 3W7PA 3IVSA 4WUIA 4UNLA 2V2DA 3NZRA 4CNNA 1I2RA 4GUIA 4JYDA 2WSRA 3ABRA 3O63A 2GQ9A 1SZFA 3TC7A 3B8DA 1CI1A 2BXVA 2VEKA 5CGQA 3OVRA 3ZWTA 4AF0B 2C1HA 4FIQA 1YDOA 5F4XA 5KITA 2VC6A 3EKLA 1HG3A 4JTHA 4HN4A 1VJIA 2QDGA 4O12A 3ATYA 3D0CA 3GZ3A 3BPWA 2R14A 3DHFA 4MYXA 1HO4A 1IGSA 3U6WA 1ZFJA 4A21A 1WOAA 4MIMA 2Y7FA 4M6PA 1TPC1 1JUKA 3GR7A 1ML1A 1LTDA 3LI1A 2B7QA 2YX0A 3W1MA 3QEZA 1R2TA 1SUXA 1DKWA 4ZZ9A 4IXXA 1JCLA 1L6WA 5ABTA 3I7RA 2B7NA 4KWVA 4MLRA 1EP3A 4JGDA 1JCMP 3V1PA 3HG3A 2Y7EA 4IXHA 3NXFA 3NPVA 1DV7A 1SQ7A 3S1XA 5CKSA 3DI1A 4MZYA 4IX0A 1O4UA 4O0ZA 3SJ3A 4EF9A 2Y62A 3TR2A 1KFLA 4LTSA 1TJRA 3C61A 4QIUA 4XWUA 4DBEA 2WO5A 2Y70A 3FLUA 3ELFA 2NUWA 1NFBA 1GZGA 1QNVA 2HTMA 5G1TA 1FCUA 2A5HA 3QF0A 1W5NA 3GR8A 3MP5A 5CSSA 4BI7A 4UFHA 1FWNA 1SZNA 3MYPA 4FNSA 1TPDA 2BSLA 3LRLA 5IBXC 2Y89A 4HKPA 4JTFA 5BMXA 1F6KA 4I7WA 3UD6A 3OVPA 3MHGA 4Y96A 3W1TA 4I9AA 1XBXA 1TPFA 3HO8A 3WJYA 1LLZA 3GNNA 4JTLA 5FEXA 2FPTA 3EWYA 3G22A 1XDMA 3FA5A 2ZZ4A 3MWAA 3MBDA 5FF7A 2W0UA 2C3ZA 1TV7A 5CZ0A 2ZRWA 4M19A 1TIMA 3S1VA 4X2RA 5HWNA 4PCFA 5I3IA 2NX1A 2YDAA 2NX9A 2YR1A 2FIQA 3CLMA 4JICA 3QSRA 4IMCA 3W1RA 5D2YA 5G2WA 3C56A 1Q3NA 3YPIA 3GXTA 1D9EA 3W1LA 3TKFA 4AHPA 3MJYA 4ZQNA 2V9DA 3FS2A 3U8GA 1G6CA 3RFAA 1HFBA 3GDRA 3FYPA 2PRLA 1RQEA 3M43A 5F1VA 2ATMA 2Q8LA 2ZCGA 4K7YA 2DP3A 3GAKA 4K38A 1THFD 1GYNA 3LLDA 3NPWA 5CG7A 5DELA 1TPH1 4NXKA 3MMTA 4QAIA 3EXSA 3DI0A 2ZZ2A 3G1DA 3QMTA 5TBOA 4ALDA 4ZQPA 4CQ8A 1KM6A 2P10A 4KKXA 4MZ1A 3M5XA 1PIIA 4PODA 3PUOA 4GC4A 4O1BA 3B04A 4O16A 3QM3A 2GJNA 4FNUA 2VFEA 3LCGA 2JKPA 3RK8A 4JTTA 1Z44A 1IIHA 3TAKA 1B57A 3BK0A 5D02A 3W3OA 1WAUA 1EIXA 3LHYA 3NQCA 2Y7GA 2C13A 4OT7A 1VCVA 3MI2A 3N73A 2XN1A 1FUYA 2E6FA 1LRQA 2E77A 4R33A 1L6SA 3F03K 1ICPA 3BVJA 2QCNA 1LOSA 1PS9A 3N3MA 1MXSA 3KFTA 3ATZA 4I7VA 2DORA 3STCA 4HNVA 2B7PA 3GKFA 3PSVA 1S5VA 3PSWA 4BK9A 2CLLA 4UIOA 3O6CA 2LLEA 2GOUA 4UMAA 3GDMA 4G1KA 2GVGA 3HJZA 1VS1A 1F76A 1SW3A 1OK6A 2FTPA 3B0VC 1XL9A 4NNCA 4TU1A 1LCOA 3NQ2A 2QCEA 3W1PA 5LNWA 1UJPA 5D38A 2I1OA 4Z1DA 2G95A 1OJXA 5CZTA 2VELA 3S5YA 1OYCA 5CZSA 4P2VA 3RMJA 1DOSA 5E0KA 4BI5A 5I3HA 1GVOA 3PBYA 1H7WA 1KM3A 2QUVA 2V81A 4NX0A 4JTIA 2JKAA 2Y61A 2NXHA 3L66A 1H51A 1VLIA 1FWSA 1OF6A 1XM3A 1X1ZA 5CPOA 4O4VA 4NXSA 3ZFHA 4Q33A 3NAVA 4IOTA 4JTEA 1R30A 3CEUA 3SGZA 5D03A 4XBSA 3GXPA 5LGZA 1LDCA 2O7QA 4GJ1A 4N9BA 4XBKA 3EX4A 4ZQCA 3MBFA 4PL2A 2A7RA 3S5ZA 3HGOA 3B03A 5KTLA 1U83A 2CLFA 3RLUA 3THQA 4CLMA 3TDFA 4X9SA 1NAL1 3T7VA 1I4NA 1SSDA 3W7NA 3W87A 1VCGA 4UFKA 3W84A 1H61A 6ALDA 3L0NA 4BR1A 2BTMA 1GEQA 2JKEA 1N7KA 3O15A 3M7WA 3W7KA 2ZZ6A 1VCFA 4MYAA 1SW0A 3LHUA 4LC6A 1F6PA 3LV6A 1K8XA 2UV8G 3FKRA 1K03A 1XCFA 3STEA 3C2EA 5BW6A 3P80A 3P5ZA 5J5RA 1KFJA 4JTUA 1SO6A 2CLIA 3NEVA 4ZMGA 3FJ6A 1RQBA 4XKYA 1KFEA 4JXCA 4WX2A 3T4CA 5DXYA 5FEPA 3PBVA 2WJZA 3EXRA 4HIBA 1M5WA 1PCWA 1ZENA 3UQNA 2YW4A 2I9EA 2VXNA 1ZJIA 1JRCA 1SPQA 1VPXA 3SFKA 2OT0A 5LKYA 5IM51 2VFFA 2QDHA 3IIZA 5C55A 3UPWA 4EIVA 3RF9A 3QPZA 1HL2A 2OCZA 3W1UA 5I3KA 5EL1A 3SW6A 4A3UA 1LROA 2J24A 5T26A 1N8FA 4LVGA 3LLFA 1FCBA 1RV8A 3IVTA 3W7LA 4O1DA 5I3JA 3OEXA 1F2JA 3UY7A 2QAFA 4TX9A 4UTJA 3MI6A 4FEZA 3EWZA 4WY0A 1LRTA 2E6YA 1OFQA 4QQ3A 5L9FA 2DZTA 4ONVA 3E12A 4YL2A 3P81A 4YLWA 3IIVA 1UCWA 3VFLA 4K36A 4XUGA 3QZEA 2GVLA 2WOQA 1FDYA 3S5OA 4N4QA 3UWWA 2H8ZA 3E9AA 1GG1A 5DXXA 7TIMA 4MKNA 5EKYA 4FNQA 3B06A 3WK0A 2X16A 3W2KA 3W2NA 1G7UA 5DCDA 1EA0A 3AJXA 3S1WA 3R5EA 4TO8A 4RZ5A 1H7RA 1ONRA 4ICNA 4DF0A 2FJKA 2Z6IA 4JY9A 1TQXA 1SO5A 1TPEA 4Y8FA 2EHHA 5BMWA 2QCDA 1FCQA 4EWND 4UFLA 4NJKA 3W7GA 3LV5A 4NJIA 3F4NA 1KBJA 4GUHA 1KM0A 3TROA 3LRMA 4ZVJA 1TTIA 4M7SA 1QO5A 2PE4A 3C2RA 3C8FA 3VI2A 3VKJA 4A2RA 3W1AA 2QR6A 1PHQA 1TV5A 2QJHA 3P82A 4KWWA 3LHVA 4O8RA 2AAMA 3BO9A 2CZEA 4AMAA 3KRUA 3BGJA 3RU6A 4QJ1A 3JR2A 2DZUA 1RZMA 1TTPA 2DZPA 3B4UA 2TYSA 3LM7A 1F7BA 4GWEA 1OK4A 2ISWA 5HUOA 5AB3A 2VENA 4W9TA 2G97A 1Q6OA 3O6YX 4OQVA 3UZ5A 3EWBX 2ISVA 2QJGA 2RH9A 3F1QA 3HBLA 1OFRA 1YADA 2G5WA 4K37A 3G0XA 1KW1A 3A21A 3M5ZA 4LVFA 1PV8A 2DJXA 4NJHA 4OU1A 1OX4A 4WOQA 2QKFA 1YDVA 4PFMA 2RHGA 3H55A 4NZFA 4K39A 2ZA3A 3I6RA 3QSTA 3QPYA 3A5VA 1VYPX 3CHVA 1QPNA 4FNTA 2ZBTA 1K7EA 4LV4A 4JTSA 3NR0A 2JGYA 2ZRUA 1TMHA 3W76A 2WSYA 1LOQA 4WXYA 5HR6A 1TO3A 3TU9A 4DO6A 3EX1A 3UWYA 3TFCA 1NF0A 2VOMA 3W7QA 3W2JA 3TA6A 1OYAA 3LHTA 5FI8A 3P74A 4N9DA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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