1MZHA

Qr15, an aldolase
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
225
structure length
225
Chain Sequence
MIDVRKYIDNAALKPHLSEKEIEEFVLKSEELGIYAVCVNPYHVKLASSIAKKVKVCCVIGFPLGLNKTSVKVKEAVEAVRDGAQELDIVWNLSAFKSEKYDFVVEELKEIFRETPSAVHKVIVETPYLNEEEIKKAVEICIEAGADFIKTSTGFAPRGTTLEEVRLIKSSAKGRIKVKASGGIRDLETAISMIEAGADRIGTSSGISIAEEFLKRHLILEHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Aquifex Aeolicus Aldolase, Northeast Structural Genomics Consortium Target QR15
rcsb
molecule keywords Deoxyribose-phosphate aldolase
molecule tags Structural genomics, aldolase
source organism Aquifex aeolicus
total genus 86
structure length 225
sequence length 225
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.4: Deoxyribose-phosphate aldolase.
pdb deposition date 2002-10-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1mzhA00
2VOMA 3I7SA 1O4UA 2VFDA 2BX7A 3IGXA 5F2MA 3B04A 1B4EA 2CZFA 5AHNA 2GJLA 2JKEA 4QQ3A 4X3ZA 5F2IA 1I2PA 2V0TA 3C6CA 5U4NA 4FNUA 1A5BA 1XL9A 2GVGA 3MYOA 1OABA 2NZLA 2OJPA 3GX9A 3G3DA 5DY2A 3S9YA 3QJAA 3PR2A 1VLWA 1CI1A 3FKKA 1EWDA 2V2DA 2V30A 3UZJA 5IBXC 3E0IA 1B4KA 1XI3A 3DFTA 4UFHA 5F2LA 3UWZA 3W71A 5EKYA 3G1VA 3STFA 1QPNA 3ABRA 4XWUA 4XQ6A 1RQEA 1YYAA 4N9CA 3VI2A 1LBMA 1A5SA 3QSRA 3P5YA 3NEVA 4AF0A 2ABAA 3S5NA 3C4UA 3M6YA 2CLIA 2Y6ZA 3BVJA 2JKAA 2Q3OA 4N4PA 2EHHA 3QSTA 3STCA 4CCDA 2ZYFA 3TW7A 2QCNA 3MI3A 1HL2A 3TFCA 1T8XA 1I45A 3NQCA 2DJXA 1SFLA 2GPTA 5HR7A 1XBXA 1E51A 3DXIA 4MY1A 2ZZ1A 3NGJA 4LS1A 4XKYB 4A3UA 1H7RA 4BI5A 4E2BA 3EXSA 3LLFA 1KM0A 1R46A 2A5HA 3BLEA 1L6SA 1MEHA 3QW4B 2X16A 3C52A 4PFMA 3IVSA 4AHQA 5HQEA 2NLIA 4M5PA 1AL7A 3BV4A 1X7FA 4E2DA 3HG5A 3Q2DA 3UQNA 1RD5A 4CQ9A 1I2OA 1OX6A 5KMYA 5DCBA 4Q4KA 2CU0A 5CSSA 3FYOA 2RKXA 3IVUA 3Q94A 5HINA 3I6RA 3W7DA 5AC7A 2W0UA 1TYGA 1ICSA 4AEOA 3NQ2A 4C1KA 3USBA 3QQ1A 4ZZ9A 4BI7A 2R8WA 3DFSA 1YPFA 4IXHA 4PTNA 5AFDA 2X1UA 3ANYA 2EGZA 3JR2A 1S3HA 1R30A 2V5BA 2QEZA 2CZ5A 4ALDA 1AG1O 3M7WA 4S1FA 2V2CA 1FBAA 3INPA 2VKZG 5D30A 3W7HA 1KLYA 2H8ZA 2XFWA 4NVTA 1Z48A 3GZ3A 3PBUA 1LCOA 4UCGA 3P84A 4CNNA 2ZA2A 1OF6A 3LB0A 1A50A 5I3JA 1GOXA 4IUOA 2RHGA 1JR1A 1KM3A 2FPTA 1H1ZA 1SO3A 4LV9A 4LW7A 1VCFA 3N19B 1UB3A 1U83A 4LUJA 1DJNA 4EF8A 3RNDA 2RDUA 3KRUA 5AC8A 1Q6OA 3DKLA 1EUAA 5LNVA 3TMLA 4GC4A 3QF0A 3T44A 2GOUA 4MLRA 2BXVA 2B7NA 3V1PA 3DGRA 5G2HA 4E0CA 1VS1A 2Z0IA 3G0UA 2CLKA 3B4UA 5D2TA 4QAIA 4K37A 3KHJA 1XBZA 2YCEA 3G3MA 2YSWA 5F2GA 1UJPA 2BWGA 1QR7A 3W84A 1HTIA 4X9SA 3CLMA 4PEKA 2QDHA 4ZQNA 3BW3A 3UZ5A 2J9YA 2TRSA 4LRSA 5G1YA 4EF9A 3WK2A 3G1SA 5HMSA 3HGJA 4CQ8A 1IXNA 4O53A 4JYFA 2CLHA 1KLZA 3NQVA 1H7PA 5C5YA 3RLUA 1NF0A 3HGRA 3NOEA 1C8VA 3SI9A 1M5WA 2QCDA 4ADTA 3EX1A 4LC6A 3CEPA 3KRSA 4Z1AA 1HUVA 3IIOA 1RPXA 3KRZA 2YYTA 2ZRYA 3NNTA 1F2JA 4GJ1A 2X1TA 2WNZA 4O1CA 5A5WA 2J6XA 3W9ZA 1XFBA 2IQTA 4HKPA 1GYNA 1EUNA 3G24A 5F4XA 5CZJA 3MUXA 3G22A 2LLEA 4CCEA 4CCCA 4U4MA 4BWLA 1P0NA 4UFLA 4M6PA 4HSNA 5HULA 1I2QA 4HNUA 3NVTA 3R13A 1G4EA 3GR8A 3O6CA 3W74A 1ICQA 4R7JA 1GPWA 1OX5A 1Y0EA 5F4SA 5KZMA 3IGUA 3W7NA 2FB2A 2H3BA 3DU0A 2WV8A 1BKSA 3M44A 2C18A 2VFEA 4Y8FA 4WY0F 5BMXA 3NZRA 5SWUA 2DZTA 1VQTA 4UC5A 3FA5A 2WSYA 3W7IA 2E5CA 4Z0JA 3SZ8A 2TYSA 3BG9A 1JCMP 2F84A 4GFSA 3NQ8A 2CZDA 2QJGA 4AMAA 1YTEA 1EPXA 3EWBX 1MXSA 1SZFA 4O15A 3UY8A 4C1LA 5FF3A 4WQ6A 4RR4A 3V75A 3LX9A 4JS3A 5LNRA 5KSWA 1T96A 3N9SA 1FXPA 1ONRA 3TUUA 3TU9A 4RCXA 4D2JA 2QCEA 1MZHA 2ISSA 5DXXA 1XDLA 2R91A 1LRNA 4ICNA 3HMJG 4MJZA 4O1DA 5D04C 3F1QA 2GJNA 3BG5A 4AVFA 1EX5A 2C3ZA 1LOQA 2I9EA 2ZZ6A 4MIMA 1JJKA 1YLVA 2WOQA 3GVGA 2G5WA 3PBYA 4MLJA 2G96A 1GVFA 5BMWA 2YW4A 1PE1A 1TTPA 4H4IA 3W2KA 1KTNA 3QH2A 4MOZA 4NXSA 1J5TA 1O5KA 4R34A 1KV5A 2ZBTA 4NJKA 5D33A 4JX4A 4NNCA 1K3UA 3LTSA 3U6WA 3P67A 1VR6A 1BTMA 1TPWA 5AHIA 4YLWA 5FEZA 2C1HA 2RH9A 2HS6A 5CGQA 3MBFA 3CPRA 1TPVA 3W07A 2PRHA 3IIZA 4QISA 3PULA 5AB3A 4TO8A 4A2RA 4KWWA 5BOOA 3LOTA 4IX2A 1AW2A 4WJEA 1WBJA 4IWWA 5E0KA 4XBSA 1KBJA 2WSRA 2ISVA 1GT8A 5DCEA 3TX9A 1RQBA 1XBVA 4FF7A 1W54A 1TV7A 3L9CA 4I7VA 4FB7A 3KXQA 5H91A 1S5VA 3LERA 5GVJA 3TSBA 1LOSA 5FESA 4E38A 1QPQA 2ZTKA 3N2MA 4BR1A 1LORA 1L2UA 5J5DA 3I7QA 8TIMA 3B0VC 4O12A 4ORIA 5D2XA 1FX6A 4UMBA 4Y90A 3HJZA 3LHTA 3NPWA 1KA9F 5IBXA 3T7VA 1WYIA 5K9DA 4J9JA 3TK7A 3W75A 3M43A 1J2WA 3L5MA 3TJLA 3I7RA 4MPQA 4NZFA 4UFKA 3LCGA 3STEA 4LRTA 4CLMA 3NQ6A 2NUYA 4JDYA 4Z08A 5G4EA 1F6PA 3GK0A 5AHEA 4JTSA 1W56A 1KFLA 2V9DA 1K7XA 5EYWA 1SO6A 2NX1A 3PF3A 5KZDA 3F03K 1TCDA 3GXTA 1NAL1 1GTEA 3MJYA 3DZ1A 3M1ZA 1OFRA 2QCGA 1JVNA 3L21A 1LRTA 4MVAA 3W7QA 4FEZA 3PVFA 4A21A 3LRMA 3TIMA 1F74A 2QDGA 5ABTA 2O7SA 2J88A 1THFD 1JCNA 1OG0A 3TKFA 5LZLA 1M6JA 4W9TA 3NL6A 2P0OA 3DENA 2H8XA 3C56A 1H7WA 5TQLA 3HIJA 4BK9A 1LBLA 4O54A 3FLUA 4GUFA 2PURA 4UTWC 3L0KA 3G0SA 3GB6A 3FS2A 2X30A 1A5AA 3P80A 3L68A 4BFAA 5FEPA 1I2NA 1VPXA 4X22A 3W2LA 3ABOA 1DBTA 3NAVA 2R14A 3QQ0A 1BWLA 1ME9A 3C2FA 2YZRA 3UWWA 5I3KA 3QMRA 3QPZA 2X1SA 5DBTA 4LV4A 1U5JA 1VH7A 5CKSA 3KFTA 2VFGA 3I68A 3THQA 2QUVA 4WY0B 4AHPA 4AXKA 2TSYA 4QNWA 3NR0A 4GBUA 3UY7A 3IIVA 3IRDA 1EP3A 3FJ6A 5E93A 4ADUA 4DELA 3OG3A 2XN1A 1PCWA 2E6DA 3W1RA 3T55A 1ICPA 1P5BA 1Q6RA 5AHFA 1JUKA 1VHNA 2Q8ZA 1HG3A 4IOTA 3TMQA 2A85A 4R33A 3EWXA 3QEZA 4UTKA 2X2GA 1FDZA 3R89A 3G1DA 4NNBA 3TW6A 5K2ZA 1C29A 3WK3A 2JKPA 4DF0A 2C15A 4GRSA 4FXSA 3HPZA 3FOKA 3MI2A 2ZZ3A 4O16A 5D05A 1N8FA 5HJLA 1XDMA 3NM1A 3SGUA 4JYEA 2PE4A 3TE9A 1H62A 2B7OA 4JXCA 4ZQPA 3U2OA 4EIVA 5E1QA 3NQ7A 2QCLA 4P61A 4AF0B 4QNEA 3CT7A 4UTTC 3VKJA 1K03A 3W7EA 4M7SA 3TCEA 4JEQA 3CB8A 3O63A 1K8YA 5G1TA 3NPVA 5HR6A 1WQ5A 2GVJA 1H5YA 1LZOA 1VLIA 4RZ5A 2EAWA 3HQ1A 4MJMA 1SQ7A 4WOQA 2WQPA 4OE7A 2ZRZA 4JTUA 5HWJA 4NJGA 3WJYA 4IMDA 3EKLA 2ZTJA 5BW6A 3LHWA 1IIGA 2RDTA 2FPVA 4HHPA 2NUWA 4NNAA 1LBFA 4RXGA 4Z0SA 1DJQA 1JULA 4O1BA 4FX6M 3W22A 3G1YA 2P10A 4PL1A 4X2RA 5FF2A 1W3IA 4EVZA 4O4VA 1LP6A 3P61A 3GXPA 5FEXA 3TQVA 1P4CA 3NQGA 1XKYA 4KFPA 5G4WA 1WA3A 2NXIA 2VEKA 3PB2A 4JY9A 2EKCA 4M6VA 1OX4A 1MO0A 3TH6A 3GKAA 2VFIA 4QSHA 3W1QA 3LRKA 2Y63A 2YFOA 1G4TA 1TJRA 2FB3A 3W7PA 4OHQA 3G1AA 4FIRA 3S42A 3S5YA 4FXRA 5J5RA 2DZWA 3TXZA 5CPMA 2W6RA 3HBLA 1DHPA 1HO4A 1AK5A 3EWYA 1RVGA 3P62A 2H6RA 1KM6A 3LCWA 4NZJA 2FIQA 4UTHA 2ZRWA 2QR6A 1Q6QA 1QWGA 3JS3A 4JIPA 3TC6A 4WOZA 2ZRVA 5LSMA 3M5ZA 4S2BA 1SO5A 3KOFA 2BZNA 2XN0A 2O7QA 1DV7A 4IQLA 1W37A 2B0MA 4MY9A 3PBVA 3EX6A 1KM1A 4UMAA 4IPIA 2E6FA 1TTQA 3HB9A 1VC4A 2ZRXA 4PODA 3NO5A 1L6YA 3L2IA 5HWNA 1YXYA 4XUGA 2V82A 4OGZA 3PG8A 4O8RA 3NQMA 3S1VA 3W1TA 2OCZA 1TPFA 3MW7A 5K9CA 4EOUA 2VEMA 1QNVA 3C61A 2ZCGA 3H53A 3NQAA 1Z44A 1TIMA 3NL2A 1ML1A 5LGXA 4O14A 2DZXA 1QOQA 2YW3A 4JX5A 4IJBA 3IV3A 3R2GA 2BTMA 1GEQA 4HN4A 3T4CA 3C0JA 5C55A 4UUIA 3VE9A 4JX6A 4ZQRA 2HS8A 3HG2A 3PSVA 4UNKA 3BW4A 5CPLA 1SO4A 4AAJA 1GG1A 3PS7A 3LDVA 4OBTA 5H2ZA 1TPB1 3L66A 3CM4A 1O60A 2WJZA 1FWRA 1OHLA 1VJIA 2C14A 3T78A 3SJ3A 3LBMA 1CW2A 2WO5A 3K30A 3A22A 3R12A 1JCXA 3C3NA 3G0XA 3TFXA 2OT1A 2QCDB 1WV2A 1YXCA 1R2RA 2XN2A 5CZTA 5F1VA 3A5VA 3H55A 2CLMA 3OVQA 4JN6A 1TQXA 4QITA 3TA6A 3BO9A 1QPRA 3KVKA 4MFDA 2GQAA 1FY6A 2ZDRA 2NXGA 2PCQA 4YMZA 1G67A 3W1PA 1TV8A 1TQJA 1W31A 3NA8A 4ZQOA 3DFNA 5HUPA 1GVSA 1UASA 1W5MA 4FX7A 3A23A 3QYQA 1A53A 1EEPA 2FTPA 2ATMA 2Y85A 3UPBA 1EIXA 6TIMA 4N4QA 5D2VA 3CWOX 1TMHA 3L5AA 3B06A 3E9AA 2VFFA 1OJXA 4JR5A 3Q37A 2V81A 4DF2A 2NUXA 2NXHA 2DZSA 3MO7A 2QCMA 4PA8A 4ONVA 4MFEA 2CLOA 1DVJA 3L5LA 3O15A 3E49A 1H7OA 4O57A 3SSJA 1GZGA 2DJLA 2JBMA 3TSMA 3LCIA 4A2SA 3ATZA 2AGKA 4DO5A 3O1NA 1VYPX 3QRHA 4JDBA 1FQ0A 1A5CA 1Q45A 1IF2A 3HGOA 4HIBA 4IMGA 4DF1A 1OYBA 3EX2A 3MHUA 4JIQA 4QIUA 1K02A 1KFBA 3BK0A 4N9DA 2BLEA 2NX3A 4O50A 1ZAHA 3CQ0A 1K8XA 4JTHA 1KBIA 1P1XA 3PAJA 1B3OA 1H7NA 5D37A 3W3OA 5LKYA 4JTFA 1H51A 4ADSA 5I3FA 2WSQA 5D38A 2A4AA 3W7CA 4XTDA 2Y7FA 4OU1A 2ZZ7A 3CEUA 4XBKA 2QAPA 3P74A 3GNDA 1V5XA 2R94A 5D2WA 3R8RA 1ZENA 2CLEA 4IMCA 4UTLA 4P2VA 4LY8A 1GWJA 4UXDA 1RR2A 1EA0A 1OF8A 3MYPA 1Z42A 3CIXA 3P8JA 3G18A 1GJPA 3CHVA 5BRBA 5LNSA 4UFIA 2V2HA 4JD4A 3LLDA 1ZALA 4GE8A 1H61A 4MUZA 3M5VA 3NQFA 3LI1A 4H6KA 1X8FA 4ZVJA 3HPSA 3W76A 3UNDA 3TNOA 3GR7A 1CX9A 2E6YA 5D03A 3S8HA 3F4NA 4NJHA 1QAPA 4A29A 2WPBA 4UTWA 4WX2A 1SU5A 3SY5A 1W8SA 3W6YA 3M5XA 1OK4A 4OV9A 1R2TA 3G1FA 3M16A 4NX5A 1JQVA 3BGJA 4UR8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3VCC A;  2VOM A;  3I7S A;  4DJE C;  1HJX A;  3IGX A;  3WLS A;  2VDI A;  4QQ3 A;  3VKK A;  5F2I A;  2O9O A;  5LXX A;  4W4Q A;  3UF9 A;  2I57 A;  4DVO A;  1AD4 A;  3OU8 A;  3AIV A;  3QJA A;  2I5Q A;  3PR2 A;  3T4W A;  1S1P A;  1L8P A;  2WMI B;  1BSI A;  5FD0 A;  3DFT A;  4UFH A;  4FOK A;  1K1D A;  3UWZ A;  3G1V A;  3STF A;  2P88 A;  3BLO A;  1S38 A;  2BHU A;  3ABR A;  5CGT A;  2R1K A;  4HU0 A;  4XQ6 A;  1RQE A;  1IGW A;  4QCE A;  4N9C A;  2PDF A;  1LBM A;  1UR2 A;  4Z17 A;  3FHA A;  3TLL A;  2ABA A;  3M6Y A;  2Y6Z A;  3BVJ A;  2JKA A;  4Q7N A;  2EHH A;  4AD1 A;  1ZP4 A;  2ZYF A;  4S3E A;  3TFC A;  1T8X A;  5HXM A;  2DJX A;  2W4X A;  5A8Q A;  3MJM A;  3WF0 A;  1XBX A;  1VRX A;  1PAM A;  3DXI A;  1BXN A;  3IK4 A;  1XLE A;  4LS1 A;  4XKY B;  1H7R A;  1XIC A;  3LLF A;  1KM0 A;  3CBW A;  1ISZ A;  4R85 A;  2X16 A;  4PFM A;  3CH9 A;  1E4M M;  4AHQ A;  3A6O A;  1V8E A;  2A3H A;  3UXK A;  5DCB A;  3W37 A;  4Q4K A;  4K2S A;  4WDU A;  3IVU A;  5EMJ A;  3Q94 A;  3BOL A;  5AC7 A;  4N7Q A;  1JFH A;  3NQ2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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