1MZHA

Qr15, an aldolase
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
225
structure length
225
Chain Sequence
MIDVRKYIDNAALKPHLSEKEIEEFVLKSEELGIYAVCVNPYHVKLASSIAKKVKVCCVIGFPLGLNKTSVKVKEAVEAVRDGAQELDIVWNLSAFKSEKYDFVVEELKEIFRETPSAVHKVIVETPYLNEEEIKKAVEICIEAGADFIKTSTGFAPRGTTLEEVRLIKSSAKGRIKVKASGGIRDLETAISMIEAGADRIGTSSGISIAEEFLKRHLILEHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Aquifex Aeolicus Aldolase, Northeast Structural Genomics Consortium Target QR15
rcsb
molecule keywords Deoxyribose-phosphate aldolase
molecule tags Structural genomics, aldolase
source organism Aquifex aeolicus
total genus 86
structure length 225
sequence length 225
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.4: Deoxyribose-phosphate aldolase.
pdb deposition date 2002-10-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1mzhA00
1DQXA 5C5YA 3O05A 2NUWA 5F2MA 3Q37A 3RFAA 3E49A 4IXHA 2BLEA 3PUDA 1YXYA 4Z1BA 3M5VA 4M6VA 3YPIA 2B4GA 1GQNA 2EPHA 2VEIA 3CU2A 3QEZA 3UY7A 2Y62A 4GUGA 4JN6A 1H50A 4WY0F 3UPBA 3FJLA 1GJPA 3CWOX 1GT8A 1XDMA 4L4LA 3W6YA 1LOLA 2QUTA 3UWUA 2G5WA 3IGUA 4E38A 1GVOA 4I9AA 1ZHAA 3L9CA 2BX7A 1PCWA 1QPRA 1JR1A 3NQ2A 2ZZ3A 2CLIA 3KRZA 3BW3A 3GXTA 1KM2A 4WXZA 4ZQOA 2VFGA 2CU0A 3KVMA 4WJEA 5FI8A 3QF0A 1GWJA 4DQWA 3C52A 4UNKA 3TCEA 1WX0A 3E0IA 3KHJA 3NQFA 2WJZA 4NVTA 3IVSA 3S6DA 3VFLA 1B4EA 4GUHA 5KZEA 3LHZA 4KWVA 1ZENA 1KFBA 4UCGA 1IGSA 3WJSA 2J6XA 1FWRA 1W5NA 4WQ6A 2ZA1A 4FX7A 1R2TA 3JS3A 4IX0A 2B7OA 4JX5A 3OVPA 2QR6A 1DV7A 1SQ7A 2ZZ1A 3MYOA 1SFJA 5DCBA 4E0CA 4AXKA 1PVNA 3P82A 3EX4A 1QWGA 3OBKA 2Y7DA 1K7FA 4GE8A 3SJ3A 4Y6GA 5LNWA 5AC8A 3L5MA 4GRSA 4OV4A 1EX5A 3DFSA 4MOZA 3W7EA 2FPYA 3I68A 2VXNA 1H63A 3LXAA 2RDUA 4KFNA 3GAKA 3W1NA 4HT3A 1RD5A 2HTMA 3G1FA 3IRDA 4K38A 4CNPA 2PRLA 1Q6QA 3B06A 4IOTA 3LHUA 4FNTA 4TR9A 1XUUA 4JR5A 3NXFA 3HO8A 2HSAA 4AHPA 2J9ZA 1JQVA 1QMLA 3L5AA 1AG1O 4N4PA 3W2KA 3AJXA 4JTFA 4R33A 4EVZA 4GNJA 4IMDA 3O63A 4PC8A 6ALDA 1L6YA 2ZZ5A 3UWWA 3O6CA 4NXSA 2QCHA 1TPEA 2X2GA 3S8HA 2ABBA 3PWAA 2YZRA 5AC7A 1MEHA 4N9DA 3MW7A 5CG7A 3RNDA 1K03A 3THQA 2P1FA 1H61A 3N9SA 1RPXA 1SZFA 2PE4A 3IIZA 1DJNA 1H7WA 1E51A 2WOQA 1QOPA 3PBUA 2JBMA 3TQKA 5C55A 4Q4KA 1SUXA 2H90A 4S2CA 3CWNA 4CLMA 4PL1A 4EF8A 2E6AA 2B7NA 4O15A 3QRHA 5HR7A 1T96A 3W7MA 4UUIA 4Z0JA 2CLOA 4S1FA 2YX0A 3L68A 3NZ1A 1SW3A 1TQJA 1F6KA 5F2LA 1H60A 3MO7A 1OHLA 5CPOA 4MY9A 4GFSA 2ABAA 3P62A 2E5DA 1UUOA 2V0TA 1HUVA 2ZYFA 3TFCA 2QCLA 4JTKA 1YADA 3W7GA 4CNOA 3TW6A 4Y90A 1PIIA 4O1CA 2XFWA 1L6SA 3OIXA 2A0NA 4BI6A 5KZDA 1LBMA 3O07A 4NU7A 2QUUA 2C6QA 3EWZA 3CIWA 2CLEA 2H8XA 3EX2A 2A6LA 1OFEA 4YMZA 2ZFAA 5I3IA 1FCQA 4MLJA 4NJKA 4O52A 5D09A 1K8YA 4YWIA 1WBJA 3INPA 3O6DA 3ATZA 3SY5A 1IXQA 3GDKA 4ALDA 1J4EA 1N55A 1ME8A 2ZZ2A 2A21A 3N3MA 3QSTA 4GUJA 5I3HA 1GZGA 4IXXA 1DHPA 4DPQA 1ZCOA 2J24A 4NJJA 4TIMA 1A53A 3W7DA 2XN2A 3DGRA 4TMBA 4JXCA 4RX0A 4KFOA 3G8EA 1FWTA 1KBIA 3P5YA 1EUAA 3HG3A 2CZ5A 2A7NA 3QMSA 4BF9A 1LRQA 3ZWSA 5K4XA 5EBUA 1XXXA 4I7UA 3OA3A 1K02A 1F7BA 1P5BA 3PS7A 4O50A 2WNNA 1TQXA 4ZQPA 5HWJA 5AB3A 2RKXA 4FB7A 1IXOA 3DFNA 3OVRA 1JUKA 1FWNA 4LVGA 3A24A 4PH6A 2Z2UA 4M6QA 1VC4A 1WDWA 4JDBA 4O57A 4WD0A 2X1TA 1OFRA 1W5MA 5T26A 1JQXA 5DN1A 1DQWA 3C2FA 5K3VA 2H3DA 4QQ3A 1PV8A 1TPUA 1XBZA 4NJGA 1QR7A 1G4EA 4KWWA 1A50A 4UIOA 3TQ0A 1ZJIA 3H54A 2FB2A 2CZFA 3MJYA 4RZ4A 2GUUA 2F84A 5CSSA 1FX6A 2CLFA 4AHQA 3UZ5A 5E93A 3USBA 2H3BA 3DZ1A 4QNWA 3NPXA 3QW4B 4O16A 4MZ8A 4MZYA 2GOUA 2YCEA 4O54A 3FKRA 4Z1CA 4UFLA 1J2WA 3W74A 3QM3A 3UNDA 2R14A 3NVTA 4GBUA 1EP3A 5D2WA 4XBSA 1GYLA 2CZEA 1SO6A 1BWKA 4NZJA 5A5WA 1KFKA 5K7JA 1W8SA 5I3JA 3QPYA 3W7IA 4TU1A 4XTDA 3NNTA 1O60A 4M7SA 3Q58A 3W3OA 1M6JA 3I65A 3G1AA 4AWTA 2QDGA 1OABA 3QH2A 1TV7A 1Q3NA 3NEVA 1T8XA 5G1YA 4JY8A 2R94A 3NQMA 4JICA 1EWDA 3HG2A 3WK3A 5AC6A 4RXFA 2EF9A 4UTJA 4PL2A 1XFBA 4GUFA 3IIXA 3S5ZA 1B57A 4JTJA 1G69A 4IMEA 4N9EA 2YYTA 2JGQA 4ZL1A 1KLZA 3M7WA 2Z6IA 1D9EA 4UTTA 4GJ1A 1I2OA 4CQ9A 1I2QA 4HKPA 2P10A 3ZWTA 1RQEA 3BVJA 1W56A 3QZEA 3NQ7A 4IX2A 3EX1A 5D2YA 2X16A 1THFD 2CZDA 1QO5A 2PURA 2DZTA 1DBTA 3TR2A 2V30A 2V5LA 4N6EA 3M5ZA 3T44A 5K9DA 2YPIA 1IIHA 4UTUA 1I4NA 2R91A 1H7XA 1W5OA 1NVMA 2V2HA 3CEUA 3IVTA 1A5SA 1TRDA 4Z08A 5G2HA 3KVKA 1HL2A 3S5NA 5LGXA 2JKAA 2E09A 1KFJA 3GR8A 4LT9A 1HO4A 5G2IA 1UUMA 1H1ZA 3W2NA 4E2DA 4UNLA 1TCDA 1VQTA 3PUEA 5AHEA 1WXJA 1O95A 4MYXA 2YXGA 2TPSA 4MY8A 2I1OA 4RV8A 3M41A 2VEKA 1SU5A 3G22A 3G0XA 5LGZA 5DXXA 1JUBA 4CNNA 1N7KA 5HQEA 1OFQA 4DO4A 4I7WA 1I2PA 3L21A 3C8FA 1PS9A 3FLUA 5DY2A 3NAVA 5H2ZA 1OJXA 2QCFA 1OVDA 5AHNA 4ZQRA 3DFTA 2DP3A 2V2CA 1VCFA 3W86A 5K2ZA 3G0SA 5K9CA 3U8GA 2V9DA 2Y89A 4AAJA 1BEUA 2A5HA 4ADUA 3S9YA 1GG1A 4OT7A 2G96A 4FXSA 1TPWA 5AYYA 3JRKA 4UTIA 3I7RA 2UV8G 3S5YA 1ME7A 3NM3A 1RR2A 1FXPA 4FIRA 1TPB1 3BGGA 3M1ZA 3LTSA 4HPXA 4LNYA 2IQTA 3LDVA 4XZ9A 1PHWA 2J88A 3W2LA 1XUZA 4CCEA 2ZRUA 5CSRA 3T40A 1TB3A 1XDLA 4AF0A 1QNVA 5HULA 1OX6A 3PM6A 1IIGA 3LCLA 3LB0A 3SW6A 4MFEA 4XUGA 2QAFA 4HNTA 3BG5A 1DVJA 1B3OA 1U5JA 3MHUA 3CPRA 1VZWA 2O7QA 3LCXA 1UBSA 4H3DA 3OG3A 4FEZA 5BOOA 4JTHA 1G7UA 2ISVA 1AW5A 3PC0A 4XWUA 1Q6LA 2DZXA 3MP3A 1ZNNA 4LUJA 1TREA 3LCGA 3KX6A 3DH7A 5FF4A 4A21A 3ZFHA 4DELA 3LHTA 5F4WA 4LY8A 2E6YA 4ZVJA 5D2VA 2NWRA 3W85A 4H6KA 4MYAA 1J5TA 4Y9AA 1QO2A 4Z0SA 4OQVA 2A6NA 4K7VA 5HMSA 1WA3A 1H5YA 5J5DA 3W7HA 4MPQA 4LS1A 4K36A 2ZDRA 4M5PA 2A4AA 2Q3RA 2G97A 5HUPA 3UWZA 3B04A 3HG4A 3MWAA 3WK1A 2R8WA 1P1XA 1NAL1 3LM7A 3KVLA 2JK2A 5LNVA 3P80A 3BW4A 4OV9A 5EA9A 1C8VA 5CPMA 1CW2A 1DJQA 3MYPA 4NJHA 1IXNA 1AW2A 3DFPA 5DLCA 4EOUA 3RLUA 4D2JA 3TSDA 1OX4B 3TAKA 4X3ZA 3PUOA 4H4IA 4I7VA 1AMKA 4DO6A 2B7QA 5D04C 1YDOA 1R2SA 3G1XA 1X6UA 3NZRA 3CEPA 3NQ6A 3GYEA 1FQ0A 2PC4A 3NPWA 3TH6A 3W1TA 5F4XA 3MHFA 1BTMA 1EP1A 3LXBA 3P81A 4RR4A 1LROA 2EGZA 4OBTA 1JCNA 5LNRA 4DXVA 1JCXA 4YCOA 1HFBA 3GB6A 4O10A 4IPJA 3EXSA 4CCDA 3THAA 3W71A 2DZVA 3BARA 5BMWA 2NXGA 3NM1A 1GPWA 3MBDA 2NXIA 1D3HA 2W0UA 3M0ZA 1XL9A 1XCFA 4HSOA 4JGDA 4M19A 1C29A 4N02A 1F76A 4O18A 2V82A 2QF7A 5K4ZA 1L6WA 2YW3A 1NEYA 1UJPA 4MKNA 4OGZA 4LTSA 2ZRXA 3W7PA 4R53A 2RHGA 2V8ZA 5F2IA 3UQNA 5LKYA 3RLVA 2YFNA 3SR7A 1YXDA 3L0KA 3A9IA 3G1DA 3HJZA 3MMTA 1K8ZA 1MSSA 1SPQA 1RQBA 5E0KA 3RF9A 3E12A 2Z6JA 3LTPA 4XQ6A 5LHFA 2QCDB 4IGHA 5DCDA 5BRBA 2OCZA 1VHNA 3SSJA 2NX9A 1GVSA 2PRMA 4PFMA 3ANYA 1VYRA 1OFAA 3O15A 1MEWA 3IEBA 3G3MA 4LW7A 3TNOA 3S1VA 3FIGA 1GVRA 3C56A 4JYEA 8TIMA 2DORA 4ONVA 1U83A 1EPXA 2ZRZA 5DCEA 3GDMA 2DU2A 5K9XA 5G2WA 4WY0B 1B9BA 2GJLA 3IIVA 1T0OA 4QIUA 3EX6A 1R47A 4NX5A 1TTJA 1TIMA 3U6WA 4NX0A 5CZTA 3VI2A 4BFAA 3ZR4A 4O0KA 5SWUA 1UB3A 3FYPA 4HNVA 2QJHA 3RU6A 2FFCA 3TXZA 2A85A 3CB8A 4O1AA 5G4EA 2E1DA 2JKPA 1ONRA 4O53A 1JVNA 3NG3A 4YCPA 3W1MA 1FWSA 4K37A 3DFQA 1ICQA 5D38A 3W1RA 4U4MA 5I3FA 4DEFA 1YXCA 3SI9A 2ISWA 1LBLA 3DI0A 4O13A 1PE1A 2CW6A 3PULA 4IQLA 3G1YA 3QFEA 4TMCA 5EKYA 2WNQA 5FEXA 3TKFA 1TYGA 2VFIA 1AK5A 3GNNA 4FNQA 3A23A 3H55A 2HMCA 4B5NA 4O28A 3A5VA 2ZTJA 3LLDA 4UTWA 3P67A 5CPNA 1P4CA 3Q2DA 1FDJA 3SIZA 4DF0A 1H62A 3RK8A 2BTMA 3LHVA 4JY9A 1A5AA 4X9SA 4QISA 3W07A 3QC3A 2NUXA 4UFKA 2QJGA 2ALDA 4NXKA 3DHDA 1TMHA 2C1HA 2E68A 3EWXA 5L6UA 4W9TA 4ORMA 5AHFA 5FF3A 4PCFA 5D32A 2Z1BA 1F05A 4UTWC 1IF2A 2FPTA 2OMAA 3NQ8A 5DBTA 1JCLA 5FF7A 4BI5A 3MUXA 4WUIA 4O4VA 4UTLA 1VRDA 2YGYA 3W7KA 2V81A 3LHWA 4MFDA 4FNSA 2QAPA 4JYDA 3HGRA 3P8JA 5J5RA 5DBUA 2Y6ZA 4LOCA 5KITA 3G0UA 2VOMA 1SO4A 3GAYA 1CI1A 1TV5A 3CT7A 4MZ1A 4JNMA 5U4NA 5DELA 1OFPA 2A2IA 1O5XA 3OEXA 3N73A 1RQHA 1YTKA 3LERA 3I7SA 1VH7A 3W72A 3CM4A 3TROA 1KLYA 1H1YA 3BO9A 4G1KA 4HSNA 3UWYA 1LRNA 3C61A 3W1AA 3HPSA 4AWSA 1LM1A 1NF7A 4UFIA 3HMJG 4O8RA 2X1SA 3GDRA 3C2EA 1G4PA 4YL2A 1LTDA 4N9BA 1W3NA 1MZHA 4Y96A 2WSYA 3W23A 4FF7A 2H8ZA 1ML1A 2FLIA 1OF8A 4A22A 1R46A 2RH9A 3H53A 1GOXA 2Y7EA 4IWWA 5I3GA 1K7XA 2RDTA 5LSMA 4ICNA 3BW2A 1AL8A 3LRMA 1I8JA 3HGSA 3ELFA 4YXGA 4X22A 3PAJA 4LU0A 5EPDA 4EIVA 1TV8A 4N6FA 4LS0A 2Y61A 3PBVA 1ICPA 4K8EA 3W22A 5G1TA 1V5XA 3IV3A 1ALDA 3SGUA 2C15A 2C14A 5KZMA 1MEIA 3Q94A 3P74A 2VFFA 1SZEA 3NQCA 4XKYB 5EYWA 3TQVA 5D05A 1SW0A 1QFEA 4LVDA 3PBWA 3FJ6A 2TRSA 4UFHA 2F7FA 1Q6RA 1P0NA 3B0UX 4WXYA 1KA9F 3HF3A 3SECA 1TPVA 3NQEA 1TTIA 5HUOA 3VCRA 4WX2A 3L2IA 1G67A 1JCJA 2Y7FA 3CTLA 4LV9A 4FO4A 1ZAJA 4O4WA 1NSJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1DQX A;  4EPK A;  1J0I A;  3GHU A;  5F2M A;  5EML A;  3Q37 A;  2XDF A;  3TOP A;  3GNX A;  3AIS A;  1GJU A;  1JXJ A;  1R0M A;  3DX5 A;  3UY7 A;  3LG3 A;  1HL9 A;  4XSM A;  4WY0 F;  3UPB A;  4QG6 A;  4C7D A;  3CQK A;  1GJP A;  4H9T A;  3CWO X;  3RO8 A;  2BV9 A;  2G5W A;  4E38 A;  1RA5 A;  1LL4 A;  1ZHA A;  4GNV A;  2VGB A;  4AIE A;  7TAA A;  3T0C A;  3KRB A;  3NQ2 A;  2ZZ3 A;  2CLI A;  1OG6 A;  3U2C A;  4H9V A;  1RJR A;  2VFG A;  1MXD A;  1P0D A;  2OQY A;  3URQ A;  5FI8 A;  3K13 A;  3E0I A;  4I3G A;  2ACU A;  1V79 A;  3IVS A;  3S6D A;  1B4E A;  1L0P A;  2CET A;  3WLO A;  5DML A;  1H4P A;  3LHZ A;  4DXK A;  3IJ9 A;  1E6Q M;  2J6X A;  3PNZ A;  4WQ6 A;  2ZA1 A;  4FX7 A;  1C90 A;  3UR8 A;  2B7O A;  1G5A A;  4NAS A;  1KO0 A;  3ES7 A;  2ZZ1 A;  3MYO A;  5DCB A;  4PCN A;  4AXK A;  4DAI A;  1BSI A;  3P82 A;  4ZFM A;  1UQY A;  3S9Z A;  4AD4 A;  1BVN P;  2V5J A;  5LNW A;  3GU9 A;  3S4T A;  4H9Y A;  4XAF A;  2VR4 A;  1EX5 A;  4MOZ A;  3B4Y A;  1JL8 A;  1IYX A;  1HKV A;  3FST A;  4GZI A;  4KFN A;  3BZJ A; 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 1JI2 A;  4GG9 A;  1ZB5 A;  1PTG A;  3RLH A;  3FXG A;  5KZD A;  3V4B A;  5CH9 A;  2C6Q A;  3EWZ A;  3FJN A;  3CIW A;  2CLE A;  4PB3 A;  2A6L A;  3AU2 A;  3UZZ A;  4AX6 A;  1FWA C;  2BXZ A;  5DMY A;  3QPE A;  2E25 A;  1FCQ A;  3SM0 A;  4NJK A;  4O52 A;  4L80 A;  3U2Z A;  3WD3 A;  3MY9 A;  4WKH A;  3O6D A;  1IXQ A;  3GDK A;  1N55 A;  1D7K A;  2HIS A;  1LWH A;  3N3M A;  1LQ0 A;  4X9Y A;  3QST A;  5BRQ A;  5JVL A;  2J24 A;  4J3V A;  4NJJ A;  1A53 A;  3W7D A;  3DGR A;  4TMB A;  4JXC A;  3WBW A;  1KBI A;  2EPK X;  3P5Y A;  4TX8 A;  5LA1 A;  1DTN A;  1DJX A;  1C91 A;  3PK7 A;  2CZ5 A;  3QMS A;  3GG1 A;  4MWA C;  3ZJ8 A;  1QBB A;  5FAJ A;  2IPW A;  4BY3 A;  5JQ9 A;  2PUZ A;  3VIG A;  4I7U A;  2BBF A;  2E3Z A;  1P5B A;  1XYB A;  1JG9 A;  4ENL A;  3WG6 A;  5AB3 A;  1IXO A;  3OVR A;  2WHM A;  2C1I A;  2INE A;  4LVG A;  2ZDS A;  2YDS A;  2ZXQ A;  4KIE A;  4IIC A;  5IHS A;  1W5M A;  3OGS A;  1DQW A;  3VNL A;  3N12 A;  2H3D A;  3WX7 A;  1W1I E;  4NJG A;  3LGD A;  1A50 A;  1Y7V A;  1FX6 A;  4AHQ A;  4F2T A; 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