1NEYA

Triosephosphate isomerase in complex with dhap
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
247
structure length
246
Chain Sequence
ARTFFVGGNFKLNGSKQSIKEIVERLNTASIPENVEVVICPPATYLDYSVSLVKKPQVTVGAQNAYLKASGAFTGENSVDQIKDVGAKYVILGHSERRSYFHEDDKFIADKTKFALGQGVGVILCIGETLEEKKAGKTLDVVERQLNAVLEEVKDFTNVVVAYEPVAIGTGLAATPEDAQDIHASIRKFLASKLGDKAASELRILYGGSANGSNAVTFKDKADVDGFLVGGASLKPEFVDIINSRN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Optimal alignment for enzymatic proton transfer: Structure of the Michaelis complex of triosephosphate isomerase at 1.2-A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords triosephosphate isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 87
structure length 246
sequence length 247
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2002-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1neyA00
4IX0A 4NT0A 4WJEA 3P5ZA 5E0KA 3NQAA 1F6KA 4MFEA 2Y63A 5E1QA 4CNPA 3R8RA 4NVTA 1Q6LA 2UV8G 3TU9A 2QCGA 1W0MA 5AC7A 2V81A 2WJZA 1OFPA 1LZOA 4BR1A 1PHQA 1OYAA 2TRSA 3SSJA 4DF1A 5AB3A 5I3HA 4LOCA 1RPXA 6TIMA 1VYRA 3CPRA 4HNTA 1HUVA 4LV4A 3Q94A 1RVGA 3CEUA 3N2XA 3P5YA 2ZRVA 3LOTA 1A50A 3FYPA 4AHPA 3DI0A 2ISSA 3M5VA 3MP5A 3DU0A 1KW1A 1YTKA 1AG1O 4UTWC 1I2RA 2QCNA 3W2JA 1ZNNA 3DZ1A 2BZNA 5LHEA 5LNVA 3L9CA 3MYOA 4IQLA 4UTMA 4IPJA 2GJNA 2VOMA 5DBUA 1XDMA 3MBDA 4A2RA 3P60A 4IMEA 1TV7A 1WA3A 3P82A 5U4NA 3O6DA 1GTHA 5LNWA 2ZBTA 5F4WA 3LCHA 1F73A 1DV7A 2FTPA 1S3HA 2YYTA 3M5ZA 1LBLA 2C19A 2E5CA 5DXYA 1EP2A 1SU5A 2EF9A 1KTBA 1K7XA 3WK3A 4AMAA 4OT7A 1X6UA 2CLOA 3TROA 5TIMA 2Y7GA 4YXGA 1OYCA 2B7NA 4I9AA 2QCDA 1M7OA 4DELA 3R5EA 3O1NA 3WJYA 1KBJA 4N4QA 4W9TA 4Y9AA 1HO4A 4MLJA 4O50A 4O1BA 1K7FA 2E6YA 2A7NA 3S1UA 3QF0A 3PSWA 2TYSA 1DBTA 4FB7A 4AXKA 1H1YA 2DP3A 3VKJA 3EB2A 4BWLC 1VHCA 3R12A 1FXPA 2V8ZA 2F7FA 2P0OA 1XDLA 1JUBA 4QNEA 1QOQA 4JIQA 4MZ8A 4UC5A 1MEHA 5LSMA 1YADA 2ZZ5A 1YYAA 1ZAJA 3UNDA 1MEIA 3GVGA 1UUOA 1Z48A 1I2PA 1P0KA 1LDCA 3OHIA 3PB2A 4N02A 4WOZA 3L0NA 3QH2A 1H60A 3W7NA 4RLIA 4FNPA 4E38A 1Q6RA 2WNZA 3HG3A 3HGJA 3ZR4A 1WYIA 3EX1A 1MO0A 4YWIA 2AGKA 2A21A 2CZFA 4RV8A 3B05A 2QCCA 5AN7A 3W07A 3GR8A 1NF0A 3NO5A 2ZZ2A 3E0IA 3NNTA 3V75A 3B0VC 2GUUA 2Y61A 4Q33A 2PE4A 4O13A 4DXVA 3FJ6A 3A21A 1I2QA 4YCPA 1TSIA 1X8FA 1KM1A 3QZEA 3TA6A 1TREA 4K7YA 1JCNA 3NQCA 4LVFA 1AL7A 2NXIA 4UTTC 2ABAA 3G1SA 3CM4A 2QCMA 2QJIA 1EP3A 1G4SA 1DL3A 2A7RA 4ZQMA 1TPVA 3NL6A 1WAUA 3P62A 4BF9A 2PC4A 3IV3A 3B04A 4M7SA 1GT8A 3LLDA 3T78A 3M16A 1H7XA 4ZQPA 1R2SA 3P8JA 2ZDRA 3GDLA 4EVZA 4OWGA 3A9IA 2BXVA 3UY7A 3GR7A 4LW7A 3BW2A 2H3DA 5CSRA 3EX3A 2CLIA 3C56A 3S6DA 4JX5A 2Y6ZA 4NJHA 4FX8A 4YLWA 3TW6A 4C1KA 3PG8A 1WBJA 1J4EA 2O7QA 1ZY9A 4LY8A 4GBUA 4JY9A 3MBFA 1T0OA 4FNUA 2VFGA 4JTFA 3EXRA 1OFBA 2WSYA 3ATZA 3BK0A 3E12A 1XBXA 4O54A 3W2KA 2NLIA 3F1QA 3BW4A 4NJKA 2G97A 5SWUA 2H90A 5H91A 1JJKA 1QDSA 1VS1A 1S5VA 1AK5A 8TIMA 2V2CA 3LRLA 1FCUA 1ALDA 3GNNA 5HJLA 3G1YA 2PRLA 4MPQA 3DFTA 1F74A 4JIPA 4K8HA 3W1AA 3FJLA 3O07A 5K4XA 1H7OA 5LKYA 1K8ZA 1XBVA 3HG5A 4U4MA 2CLEA 2ZFAA 4M5PA 3WK2A 5K4ZA 4C1LA 2J24A 4WUIA 3PAJA 1KM2A 2AAMA 4K39A 3W84A 2A5HA 4X3ZA 1W37A 1WOAA 3O06A 3LCFA 4RZ4A 4FNSA 1O60A 3INPA 5D32A 2JGYA 1FWWA 1OX6A 5EL1A 4PEKA 5K9CA 4KKXA 3G0XA 3LV5A 3QPYA 4M19A 3EWZA 1YXDA 3UQNA 3G24A 4UUIA 3QPZA 4UNLA 1F7BA 3CEPA 3L68A 3GAYA 5G2HA 4R33A 3CIXA 4CQ9A 2P10A 3SI9A 1PS9A 3DXIA 4QIUA 7TIMA 1W1ZA 1VCGA 4PODA 3W1NA 4PH6A 3TKFA 4DO6A 4PL1A 4ZL1A 5KZEA 3LHYA 3W1UA 1GEQA 2ABBA 2ZZ1A 3FKRA 5D09A 3DHFA 3FEMA 3W2MA 4LV9A 4XBSA 2WKJA 5G1TA 4FX6M 4PC8A 1LRNA 2V2HA 4K38A 3M9YA 3C2FA 3D0CA 3TQ0A 3VE9A 2VFEA 3MJYA 4P2VA 4MY9A 1GQNA 4H4IA 4R7JA 3VFLA 4OU1A 1VRDA 4O28A 5CPMA 1U5JA 3IVSA 2ZZ6A 2X1RA 2QCFA 4UTWA 4PA8A 3EX6A 3LCLA 1T96A 2ZZ3A 3IIOA 3LHVA 4NNCA 4RXFA 3G18A 3LXBA 3YPIA 4JX6A 5FF4A 1SO6A 1IIHA 4UFKA 4NUWA 3EWXA 3E02A 3U2OA 1QR7A 5LGZA 1J2WA 1SZNA 1THFD 2C15A 1K3UA 4WY0B 4IXHA 3BLEA 1B9BA 1QWGA 3VE7A 5FF7A 4UFIA 4QJ1A 1K8XA 1OF8A 4Y6GA 2QUTA 3W86A 5TBOA 1LORA 4P61A 4NNAA 3LRMA 4N6FA 5CZTA 1KFEA 2E5DA 2C13A 3EXSA 3MI2A 1KM6A 3LDVA 4GWEA 3RFAA 2A85A 2NWRA 1JCLA 2ZCGA 1T8XA 3TXZA 3M43A 2NXHA 3NM1A 3BO9A 5ABTA 5CSSA 3TQVA 1ZCOA 4A22A 4YCOA 2OX1A 2QF7A 1H51A 1X7FA 3GKAA 3CLMA 2CZDA 3A23A 2VKZG 3P8IA 3HO8A 5HULA 2W6RA 2JGQA 4DF0A 4CNOA 3UXAA 1IXPA 4O19A 2Y88A 2J88A 3A22A 4XBKA 5CPNA 3BV4A 1X1ZA 3EXTA 4LVGA 1OYBA 4G1KA 4AH7A 1SFLA 4AEOA 4UTUA 4NJGA 5L6UA 3F4NA 1TRIA 3UYCA 3RNDA 3BG3A 3W71A 4O4VA 4UTKA 4LTSA 5K2ZA 1FWTA 5HWNA 4O12A 3W83A 3UWYA 4HPJA 3LHTA 4JTUA 4IOTA 4EOUA 3N14A 5AC6A 2FB2A 3NM3A 3W7CA 1DOSA 3TNOA 4TMCA 2E77A 3CB8A 1VLIA 2Y7EA 3QSTA 4CLMA 1DQXA 2ZRXA 3B0PA 3CWOX 1F2JA 3KVLA 3KOFA 4N4PA 4HNUA 2I14A 3S42A 2WNQA 1K03A 2Q8LA 4GUGA 2Q3RA 4UTTA 4MYXA 1TIMA 4NU7A 4OV4A 2YZRA 5DY3A 3W87A 3MHUA 2Z1BA 3NZ1A 3H53A 1MZHA 1O95A 4O1CA 2VEMA 5KTLA 1ZFJA 2VFIA 3ZFHA 3UY8A 3E49A 2V0TA 3W7EA 3NR0A 3GIYA 5IBXC 4CCDA 2QUUA 4JDBA 1UCWA 1YDNA 3IVUA 3QW3A 1YXCA 1FCVA 5KITA 2CLFA 3STCA 1HG3A 4Z1AA 4ICNA 1AMKA 1JR1A 1VYPX 2Y7DA 1VCVA 4MFDA 3RF9A 3CWNA 2FQIA 2YDAA 1JCXA 3DFPA 1DHPA 4EF8A 1UBSA 2O7SA 1AW5A 1VPXA 1VGAA 3WJWA 2NX1A 1BWLA 3W1MA 1DJNA 2Y89A 5HR7A 3RLUA 4L4MA 5AYXA 1B4EA 3S9YA 3RU6A 3SR7A 1FDJA 4OBTA 1KFBA 3G3MA 1A5AA 2VEIA 2X2GA 3C2EA 3W22A 1HTIA 3FKKA 3JRKA 3JR2A 1R30A 3P81A 3SY5A 1IIGA 1YTDA 5HR6A 2ZZ7A 4RX0A 3W7HA 5GVJA 1KLYA 1LYXA 2GQ8A 3P67A 5LZLA 3G8EA 4GUFA 5AOUA 4JS3A 3PVFA 3M1ZA 4IJBA 3DBPA 4RCXA 3HJZA 5DCBA 2GJLA 3V1PA 1GG1A 2Y70A 4ALDA 1QPNA 1L6SA 3W88A 1D3GA 2KZHA 1OK4A 2G96A 3SFKA 1OF6A 1L9WA 3UWQA 1YLVA 3I7SA 1IXOA 3HOJA 2WV8A 3UWZA 2C14A 5G4EA 1NVMA 1VQTA 3NVTA 1SR9A 4JTSA 4ADTA 2JKPA 1OJXA 5F1UA 3W85A 4DPPA 3A5VA 3IGSA 3HG4A 3QW4B 3TW7A 2C3ZA 4H6KA 2OT0A 1FXQA 2R8WA 5C6MA 2X16A 4JNMA 2ZA1A 5DELA 1ZHAA 2C1HA 3NQMA 2A4AA 1JCMP 4JY8A 5F4XA 2AQWA 4QNWA 2QKFA 1Q6QA 1OX4A 2Z2UA 2XN2A 4NXSA 3QRHA 2ZTKA 5FEPA 4I7UA 1QMLA 4AWTA 5EY5A 1LTDA 2WQPA 4IGHA 1H5YA 3KVJA 4RJEA 4A29A 4MKNA 4RZ5A 3B4UA 2B7QA 3QMRA 4ADSA 4Z1BA 4UIOA 1O5KA 3S0CA 2NXGA 3FOKA 1P5BA 1L6WA 3N9RA 2CLKA 2X1TA 2H8XA 2HTMA 3C52A 3G8RA 3QM3A 3LXCA 1TJPA 4UR8A 4XTDA 3I6RA 2B7PA 3ABSA 3NGJA 4WXZA 2HS8A 1IXQA 3M47A 4K7VA 4UTJA 3RK8A 1AW2A 3ZWTA 4HNVA 3WK0A 3LCGA 3BG9A 3HGRA 5C2XA 4WY0A 3W7PA 4MYAA 1FQ0A 1TPB1 1J5TA 2E1DA 1Y0EA 5BW6A 3SW6A 3HBLA 2XN1A 3LI0A 2X30A 5CPLA 2DORA 1EP1A 4O18A 1EWDA 2A6NA 2ZRUA 4TO8A 3LBMA 4JTGA 5HQEA 3W7RA 1W54A 3IGXA 2Z6JA 1XBZA 4K36A 3C8FA 3MYPA 3P84A 1SSDA 5F2IA 2E6DA 1W5QA 3B8DA 2NZLA 4MVAA 3NYZA 3G3DA 4XKYA 1JQXA 1SW0A 1R2RA 3KFTA 3L65A 4JTJA 3PM6A 2Q3OA 4O15A 2ATMA 3KVMA 3W7OA 1TPH1 3NQDA 3P80A 2WSRA 4U28A 3KX6A 1D3HA 3EWYA 4TU1A 3NQEA 1S5WA 3S5YA 1ICPA 4O4WA 4WZHA 4UXDA 3M6YA 1I8JA 3A24A 1H7NA 3AO0A 3NPWA 4D2JA 3S1XA 4QISA 3LV6A 3B0UX 1OFAA 5E93A 2GQ9A 3GDMA 1LOSA 1I2NA 5CZJA 3DFOA 4AF0A 5EA9A 3G1AA 5MHBA 3LI1A 4UTHA 4S1FA 4XZ9A 4JR5A 3O16A 1KFJA 4GRSA 5KINA 4YMZA 1C29A 1SZGA 1X1OA 3CT7A 4DBDA 1TV8A 2R94A 5DCEA 5DN1A 5CKSA 1JULA 3W6YA 1E51A 1H7RA 2Q8ZA 1G69A 1DKWA 3BLIA 3C2OA 4OQVA 4ML9A 4S2BA 1TMHA 1EUAA 3F03K 4RXGA 1TV5A 1G6CA 4IWWA 4WX2A 4MJZA 3W7JA 1NEYA 4GUJA 3TMQA 4POCA 2J9YA 1F5ZA 4EF9A 4FEZA 2YFNA 3HIJA 1Q45A 1I2OA 2DJXA 2FJKA 1IF2A 3TR2A 1JCYA 4AB4A 2V5LA 1EX5A 2ZQ0A 1LOLA 3FYOA 3K30A 5D2TA 3VCRA 2WPBA 3W2NA 2CZEA 3I7RA 3STFA 5EKYA 2Y62A 1A5SA 5BMWA 1F76A 3TSBA 3IIXA 4X2RA 2E6FA 3GDKA 4BK9A 1TQXA 5D30A 4ORMA 4BI6A 3NZRA 5F2MA 2ZA2A 4O10A 2B4GA 2V5BA 4O14A 3G0UA 1TTJA 2CU0A 2TMDA 3TJLA 3PF3A 4O16A 5FESA 3NOEA 3LCIA 5K7JA 4X22A 3ABRA 4KFPA 1VH7A 3MMTA 1LP6A 3WJXA 2P1FA 3CHVA 3M5XA 4O8RA 5AC8A 5FEXA 4Z0SA 2A7PA 3R13A 4PL2A 1SPQA 4MOZA 2QUVA 3W70A 2DZPA 2QAFA 2VFHA 3NG3A 5EBUA 5H2ZA 3C0JA 3NQ6A 1PIIA 4DQWA 1OK6A 3IRDA 5D37A 3HQ1A 3SZ8A 1UJPA 4FO4A 5TQLA 1R46A 4NJJA 3C4UA 1B3OA 1WBHA 2CW6A 3W74A 3QQ0A 4K8EA 1OFQA 4JD4A 3SIZA 1F05A 5BOOA 2CLLA 3PUOA 1Q3NA 1AW1A 3LERA 3PBWA 3DH7A 3LGEA 3FFSA 4NNBA 5I3FA 4M6QA 2GVJA 1JQVA 2NV2A 4GUIA 1H7WA 4WXYA 4K6AA 4NX5A 1SO5A 3S5OA 3TH6A 1G67A 4NX0A 4E2DA 2C16A 4DPQA 2QCEA 2VC6A 3C3NA 3G1XA 5D2YA 3BVJA 5J5RA 4FHAA 1RV8A 3IIVA 2J9ZA 2FIQA 3LTYA 3U8GA 3CC1A 1KBIA 4MZYA 5AHMA 3W7DA 5KZMA 2QCDB 4FIQA 3C2RA 1XL9A 4UMBA 4LS1A 2XFWA 3T40A 1YDVA 1W56A 3KRZA 4Y8FA 2DZSA 4IMDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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