1NF7A

Ternary complex of the human type ii inosine monophosphate dedhydrogenase with ribavirin monophosphate and c2-mycophenolic adenine dinucleotide
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
505
structure length
454
Chain Sequence
TSYVPDDGLTAQQLFNCGDGLTYNDFLILPGYIDFTADQVDLTSALTKKITLKTPLVSSPMDTVTEAGMAIAMALTGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKKYEQGFITDPVVLSPKGIISSRDIDFLEHDCFLEEIMTKREDLVVAPAGITLKEANEILQRSKKGKLPIVNEDDELVAIIARTLKKNRDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDVVVLDSSQGNSIFQINMIKYIKDKYPNLQVIGGNVVTAAQAKNLIDAGVDALRVGMGSGSICITQEVLACGRPQATAVYKVSEYARRFGVPVIADGGIQNVGHIAKALALGASTVMMGSLLAATTEAPGEYFFSDGIRLKKYRGMGSLDAMIKVAQGVSGAVQDKGSIHKFVPYLIAGIQHSCQDIGAKSLTQVRAMMYSGELKFEKRTSSAQVEGGVHSLHSYEKRLF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structure of Human Inosine Monophosphate Dehydrogenase type II complexed with the MPA/NAD analog C2-MAD
rcsb
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase 2
total genus 110
structure length 454
sequence length 505
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2002-12-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1nf7A00
1JCXA 3FS2A 2P10A 3G1AA 1EB3A 4MY8A 5G2IA 4A3UA 4B5NA 3H55A 3HG4A 1TPEA 2QAFA 1AMKA 5DLCA 2Q8LA 4AHPA 3NO5A 3PUEA 4JGDA 3CTLA 5D04C 1OG0A 2J88A 2C0AA 4PL2A 3L9CA 1F6KA 5LGZA 1UUMA 3CEUA 3LI0A 4FNSA 3FKRA 4KWVA 2AGKA 1A5SA 4ICNA 5AYZA 2BTMA 1PCWA 4KFOA 3A5FA 3IIVA 3W1MA 4LY8A 4ORMA 5IBXC 4HNNA 1A5BA 3NOEA 4UNKA 3DBPA 3W84A 3BLFA 2NUXA 4HHPA 4TO8A 1KM6A 1OK4A 4JX4A 3W75A 5D33A 1TJRA 3GB6A 3LXBA 2V8ZA 4LRSA 1PVNA 2WNQA 1QFEA 4UFKA 2VXNA 1TJPA 3TK7A 3NQCA 3PAJA 1W5OA 1KM3A 5MHBA 5H91A 1P0NA 4N02A 4IXHA 1H63A 1H51A 3OG3A 3NVTA 4CCDA 5LZLA 2TRSA 3GNNA 1QPOA 3SECA 3W88A 3PR2A 3LCFA 2NUWA 3NPVA 3BW3A 1I2NA 2QCNA 4N4PA 4M7TA 2Q8ZA 3EXSA 2JGYA 4CCEA 3BARA 3UY7A 2Y61A 5DXYA 3G3DA 3QM3A 2A1YA 4YL2A 5F4WA 1L6SA 1MZHA 5IBXA 1VYSX 1IXNA 3P74A 3L5LA 1DHPA 2NWRA 3G8RA 2Y6ZA 1VR6A 4DO6A 4UFJA 3ATZA 3TW6A 3DKLA 3QMSA 4LVFA 4FNQA 4Y9AA 3PUDA 1FDJA 5FI8A 3MI3A 4NZJA 3W76A 5KZDA 2OCZA 1ZHAA 3A23A 3QH2A 1H7WA 3G1SA 2DP3A 3WJYA 4O11A 4WOZA 1FQ0A 3QW3A 3W22A 1A50A 1TPVA 4IMEA 4MOZA 1IXPA 2QCFA 1KTCA 3B4UA 3E9AA 4IX0A 3WK1A 4FHAA 2X1UA 2Y7FA 5FF4A 4K7VA 1Q45A 5CZSA 3W71A 4LVBA 1FCQA 2FLIA 5KZMA 5CSRA 3CQ0A 1SPQA 5LSMA 1SSGA 2FDSA 4X9SA 1KM2A 3K30A 2BZNA 3B0UX 1DORA 3IGXA 3CC1A 2C14A 3NPXA 4M6PA 1TRIA 3BLIA 4HN4A 3O6YX 3FFSA 1P0KA 3A21A 3MHFA 2H3BA 2ZRXA 4JTHA 1MSSA 2Y85A 1TPWA 5C6MA 4LV9A 4XTIA 3KX6A 1EUNA 3W3OA 5K9CA 4JTUA 3UZJA 3TSDA 4GBUA 3DHFA 3N2MA 4ZQMA 4NU7A 3S1WA 1O94A 3T4CA 4ZVJA 1FCUA 2QCDB 2J9XA 3Q2DA 1XUZA 3CEPA 3PG8A 3UWVA 1JCYA 3SGUA 4FNTA 3NQGA 2XN1A 5AOUA 1DVJA 2F7FA 2Y62A 3PB2A 4MY9A 3C52A 3IGSA 4N6EA 2WO5A 4WZHA 4UXDA 4AWSA 4FXSA 1J2WA 1KM5A 4AH7A 2DZXA 5J5DA 3TDFA 2ZZ4A 3LHUA 4TIMA 2KZHA 3QFEA 4LNYA 5FESA 1NFBA 3DFPA 4OE7A 3GVGA 1SZNA 4GUHA 4ZQOA 1WX0A 3DAQA 1GTHA 3EWZA 4U4MA 4UMAA 1GTEA 1ME9A 2ZA2A 1FDYA 1Y0EA 1ZY9A 2C19A 2NLIA 4RZ6A 3TROA 5I3IA 3LCWA 3HQ1A 4ONVA 2A0NA 3W7EA 3I7RA 2B7QA 3W7GA 5C5YA 5L9FA 3G1XA 4EIVA 3LV6A 3FLUA 4TMCA 3W07A 3W1NA 1EP3A 4O16A 4A29A 3LTPA 1H60A 3QSRA 2G5WA 4O1CA 1XC4A 3PWAA 4LUIA 3VFLA 1D3HA 2B4GA 2FJKA 3PS7A 2ZQ0A 4JX5A 2VEMA 3DI0A 4WXZA 1YDOA 4RCXA 3O63A 1TIMA 5BOOA 3NPUA 3VKJA 2ZA3A 3TV8A 2WNNA 2ZZ2A 3KVJA 4NX0A 3MWAA 1PIIA 4IMDA 4O4WA 5K2ZA 5FEWA 1Z44A 4GXMA 3LHTA 4HT3A 5D32A 1R46A 1NF0A 3C4UA 2ABBA 2ISWA 2F84A 4Y90A 2A7RA 4BK9A 3M16A 4JNMA 2WPBA 1LLZA 3F1QA 3TUUA 2IQTA 1TRDA 5AFDA 3CPRA 1GVFA 2DZSA 4LS1A 3N9SA 4H6KA 2PCQA 4MFDA 2E6YA 2VFGA 2Z6JA 2GOUA 1WQ5A 4FIQA 3O6CA 3N14A 4K39A 1IIGA 1FCVA 1VJIA 1XBYA 1S5WA 3QF0A 2ZZ1A 3NL2A 1P1XA 1MEWA 3ATYA 2NX1A 2V82A 3LCIA 3Q58A 3TAOA 4UC5A 3UWZA 3YPIA 5CG7A 1GJPA 3Q37A 3W1QA 1TPDA 3B0PA 3ELFA 3FJLA 3NZ1A 1XI3A 4IOTA 5FEZA 1K8YA 3W1RA 5D37A 3IIPA 3P82A 1VRDA 4E2DA 1ZAJA 1QO2A 4WY0B 5D2WA 5EMUA 2R14A 3MI2A 4QNEA 3RK8A 1WAUA 2A21A 5GVJA 3GIYA 4GUIA 1M6JA 3W2UA 4YCOA 1OF8A 2ZZ7A 1MEIA 3UD6A 1OX5A 1TPB1 1J4EA 3UWWA 4AWTA 5E1QA 2EKCA 2W0UA 2NX9A 3UWUA 5D2YA 4JTSA 5LHFA 2ABAA 4M19A 3TIMA 2PRLA 4HNVA 4YWIA 1W37A 4AEOA 2E5BA 4RZ4A 3S6DA 1XKYA 2H6RA 2WJZA 4O14A 4HIBA 3ABOA 3O05A 4ADUA 1O95A 3E12A 2A5HA 3N3MA 3SFKA 1O4UA 3TXZA 4UTTA 1SZFA 3SZ8A 1JQXA 1RQBA 4L4MA 2GVGA 1HFBA 1SUXA 3B03A 2BSLA 5C54A 2YCEA 3HO8A 4XWUA 4DO4A 1I2OA 4O18A 3S5ZA 1WXJA 3G22A 4TMBA 1K03A 4AF0B 4ORIA 4GUJA 3HG5A 1GVQA 5D02A 1X7FA 2Y7EA 4RLIA 3LX9A 3KXQA 2ALDA 3LGEA 4HSOA 1K7EA 1ZNNA 3OA3A 4O1DA 2VKZG 4NZFA 3W73A 3M1ZA 1XBVA 1G4TA 4O12A 4JY8A 3O1NA 1NEYA 2H8XA 3GDRA 3P8JA 4O10A 1OYBA 3TC7A 1XL9A 2WKJA 4CNNA 1Q6OA 4IJBA 1OFQA 3M5XA 3L5MA 2DZUA 2YX0A 1W3IA 2A7PA 4IWWA 5EBUA 4FIRA 2P1FA 3GAYA 1W5MA 2Q3OA 4KKXA 1W5QA 3IGUA 4K7YA 2FIQA 4BI6A 3HPXA 4NJGA 4JTLA 4MZ8A 4LV4A 1WA3A 4MYXA 2OT1A 1KBJA 3LHZA 1EP1A 1IGSA 2CZ5A 3NNTA 1Q6LA 3EX4A 1SZGA 4RXGA 2ZZ6A 1JR1A 2WV8A 4ZL1A 3EWXA 3G1FA 3TE9A 1OABA 2NV2A 1IF2A 3F03K 4MIMA 3EWYA 3B0VC 3LLFA 1TTPA 4IMFA 3P7YA 3I68A 1W8SA 4XKYB 1H1YA 1QDSA 2V2CA 3S0CA 2V0TA 5HNRA 5HWJA 4UFIA 1QOPA 5HMSA 4LC6A 4UUIA 1R2RA 4TU1A 4WXYA 3W1XA 1G6CA 5BW6A 1LP6A 2FB2A 4XBKA 1RR2A 4XQ6A 1QNVA 3TFXA 1TB3A 3W7DA 3ABRA 3W7PA 3CLMA 3UWYA 5DY3A 3QPZA 1ZENA 4R53A 4QJ1A 3TJLA 3E02A 3S9YA 2JKPA 1QPNA 4E2BA 4G1KA 3B05A 3M9YA 4O8RA 3G1DA 4WUIA 1OFAA 1B3OA 3GDLA 3GXPA 2GUUA 2FPTA 5U7SA 3L5AA 4FX7A 3SW6A 4A21A 1AW1A 4CCCA 1EPXA 1GVOA 3HB9A 4K8HA 4ZQRA 2FQIA 2Y70A 4PL1A 3HF3A 5HQEA 1A5CA 3T44A 3I6RA 3RNDA 4BR1A 3MBFA 3TQ0A 2E6AA 3RU6A 4UTJA 3NM3A 3P60A 2ZA1A 1X1ZA 3P5YA 4JS3A 4O13A 2OMAA 2DZWA 2I9EA 1KFJA 4WD0A 4CQ8A 3BG5A 2OJPA 4W9TA 1G4PA 4AWUA 3VE9A 3MHGA 5DBTA 4GUGA 4LT9A 4YXGA 4UFLA 1VPXA 3QQ1A 1DV7A 2QJHA 2YFNA 3BGJA 3ZS4A 4H4IA 4R7JA 1W54A 1TV7A 2NUYA 4A2RA 1F76A 3AJXA 1TV5A 5F1VA 2J9YA 3W1AA 3STCA 2C16A 2VELA 4DPQA 3P61A 5SWUA 1H7NA 3C2RA 3SR7A 3CWOX 3IRDA 2ZRVA 3C8FA 2H8ZA 3OEXA 4ZZ9A 5LGXA 1KTNA 5C2XA 3JS3A 5G2HA 5TQLA 2Y63A 3HGSA 4LU0A 4O28A 3NQ6A 1UCWA 3SY5A 1HTIA 1KTBA 1VCFA 4UCGA 1DBTA 3NGJA 1QR7A 4CQ9A 6TIMA 1F7BA 4FO4A 1LRNA 4K6AA 4NNBA 2CZFA 5D2TA 3MJYA 3GDMA 4WOQA 4L4LA 1WYIA 1SO3A 1VCVA 1GQNA 1LZOA 3TR2A 1SQ7A 2DJXA 2CZDA 4DQWA 1T0OA 3O8AA 1I4NA 5ABTA 4MYAA 3L2IA 2BLEA 5D38A 2R91A 1KLZA 2C6QA 2YW3A 1VZWA 2EAWA 3DENA 1X1OA 4IPIA 3P62A 2I1OA 4UR8A 3VCRA 4AVFA 5DELA 1G67A 3P80A 1YXYA 3PBVA 3QYQA 1WBHA 1EUAA 4O17A 3TCEA 1JCNA 1TPUA 2VFIA 5CZ0A 3C61A 1OVDA 3W7JA 4WJEA 5HWNA 1VGAA 4Z1DA 5DXXA 3L21A 1UB3A 3W85A 1VCGA 4XUGA 2D73A 4Y96A 1PE1A 2AQWA 1YPFA 3GYEA 1K02A 4OQVA 1ICQA 1R2TA 4OU1A 3NZRA 1L6WA 1OJXA 5CZJA 1K3UA 3RLVA 3WK2A 2EGZA 1LBLA 4JTJA 3ABSA 5HR7A 1JQVA 4MUZA 3HJZA 4NX5A 5HWMA 2A85A 1OFDA 2JKAA 1VH7A 4XTDA 3PBUA 1VS1A 3BK0A 5F4XA 1TTIA 1GT8A 4UR7A 2QCHA 3HPSA 2VFFA 3NQMA 2XN2A 4YMZA 1BKSA 1D9EA 1IIHA 3NPWA 6ALDA 3LXAA 2J27A 1W31A 4DBDA 4RJEA 4HPJA 3FYOA 1GG1A 1W1ZA 4PA8A 4E0CA 4WQ6A 5FF3A 5HUOA 3T7VA 2UV8G 4X22A 4XZ9A 2B7OA 3N73A 3DZ1A 1N7KA 3CIWA 3TW7A 3VNDA 3D0CA 4JR5A 4GE8A 3EWUA 3LCHA 3QPYA 3M7WA 4JTGA 4PODA 5F2IA 5BMWA 3RLUA 2QKFA 4Q33A 3N34A 1HL2A 2C13A 1XBZA 2B7NA 3W2KA 2QCLA 3DI1A 1SW3A 3MP5A 1GYLA 2FPYA 3PC0A 5I3HA 2E6FA 3G3MA 5TIMA 4DF0A 3HMJG 1JUBA 4UFHA 4LOCA 4IMGA 5F4SA 1G4EA 5KINA 3TJXA 1UUOA 1WV2A 5LNSA 4FF7A 4O52A 5FF0A 3I7QA 3W2LA 4QM1A 1NAL1 4JTTA 3NQ2A 2PE4A 1IXQA 3KAOA 3MW7A 2V81A 3W74A 4AB4A 1G4SA 4S1FA 3FEMA 1JUKA 3NAVA 3R12A 1J5TA 3R13A 7TIMA 3EXTA 4AHOA 3PSWA 2HSAA 3N19B 2A4AA 5CPOA 1WBJA 1YYAA 4JIPA 5G1TA 2TYSA 1G7UA 1F73A 1YTDA 1TYGA 3B06A 2CFFA 5CSSA 1JUEA 4NT0A 3G0XA 4EVZA 2ZDRA 3SGZA 3DGRA 4OT7A 2H3DA 3HGJA 5LKYA 1GPWA 3W1PA 2ZCGA 5LNWA 1C8VA 3G24A 3PM6A 4KWWA 1LCOA 5LHEA 1VLIA 3N2XA 3L68A 1ZFJA 1K7XA 3LTSA 3QEZA 3V75A 3W2MA 2QCMA 4JEQA 1YXDA 3TQVA 4TX9A 3FYPA 2XN0A 1Q6RA 4N9CA 2O7QA 2E77A 4GJ1A 2NXIA 3HG2A 4MZ1A 2J6XA 3W72A 1QMLA 5A5WA 5CKSA 4QAIA 2QCDA 3NDOA 2VC6A 1XDMA 4QQ3A 1GVRA 2YSWA 2NV1A 1D3GA 1N8FA 1EEPA 5BNKA 4HSNA 1OFEA 3LCLA 1BWLA 5K3VA 2R8WA 3FA5A 2FFCA 1WDWA 1XDLA 5D05A 5G4EA 2E09A 5FEXA 1B9BA 4I7UA 3GXTA 4O15A 3EX1A 5G5IA 1QPQA 4YCPA 3CM4A 3MP3A 3DXIA 1FWNA 2W79A 2Y89A 4TR9A 1NSJA 4PEKA 2QJGA 3EKLA 5F2MA 3QSTA 1CI1A 1TPFA 1XBXA 4DF1A 3KOFA 4AXKA 4Y8FA 2RKXA 1DL3A 1FWTA 3GNDA 3W23A 3NR0A 1OFOA 2GJNA 3SI9A 5TBOA 2I14A 3P8IA 1DJNA 1TTJA 2C18A 5EA9A 1GEQA 4RZ5A 4ALDA 4R33A 2EF9A 4RK8A 3T55A 3MUXA 1KM1A 1TPH1 3MP4A 1SSDA 3HGRA 3G1HA 2C15A 4JYDA 1ZJIA 1FXQA 1QO5A 2V5BA 4PCFA 5AHMA 1H7OA 4FNRA 2ZTJA 3M5ZA 1TTQA 2ZBTA 1OHLA 2B0MA 4NXSA 2Z0IA 1KFBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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