1NQKA

Structural genomics, crystal structure of alkanesulfonate monooxygenase
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
362
structure length
345
Chain Sequence
MSLNMFWFLPTHGDGHYLGTEEGSRPVDHGYLQQIAQAADRLGYTGVLIPTGRSCEDAWLVAASMIPVTQRLKFLVALRPSVTSPTVAARQAATLDRLSNGRALFNLVTGSDPQELAGDGVFLDHSERYEASAEFTQVWRRLLQRETVDFNGKHIHVRGAKLLFPAIQQPYPPLYFGGSSDVAQELAAEQVDLYLTWGEPPELVKEKIEQVRAKAAAHGRKIRFGIRLHVIVRETNDEAWQAAERLISHLDDETIAKAQAAFARDNLEISPNLWAGVGLVRGGAGTALVGDGPTVAARINEYAALGIDSFVLSGYPHLEEAYRVGELLFPLLDVAIPEIPQPQPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of the protein Alkanesulfonate monooxygenase from E. Coli
rcsb
molecule keywords Alkanesulfonate monooxygenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
total genus 115
structure length 345
sequence length 362
ec nomenclature ec 1.14.14.5: Alkanesulfonate monooxygenase.
pdb deposition date 2003-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00296 Bac_luciferase Luciferase-like monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.30 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Luciferase-like domain 1nqkA00
1BRLB 1Z69A 4US5A 3B9OA 4UWMA 1BSLA 1LUCB 1RHCA 5DQPA 1YW1A 1TVLA 5AECA 1BRLA 1NQKA 3RAOA 3B9NA 1EZWA 5LXEA 1LUCA 3B4YA 3FGCB 2B81A 4J2PA 4US5D 1F07A 1XKJA 1FVPA 2I7GA 3SDOA 1M41A 1NFPA 3C8NA 3FGCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XIBA 2PWDA 5JH1A 4B3KA 1GOQA 3AIVA 3U6WA 4UMBA 4QFUA 1F76A 5FL0A 1Z9AA 3OVGA 3SAZA 2J9YA 1OK4A 3MUAA 2XVPA 5G4EA 1CGTA 2HWGA 4HJFA 4CUCA 1KM0A 3GQYA 3HMCA 3FJLA 3R5EA 3RM4A 5C2GA 4HU8A 4GUGA 4HNNA 4L56A 1S1PA 5EU9A 3PVFA 3LHUA 4OUIA 4JX6A 3LX9A 2XIJA 5BOFA 1BWKA 4PTWA 3RNDA 2VD8A 3CL6A 1R9ZA 1M7OA 4AD1A 4RCXA 4LBSA 3TLQA 2ZZ6A 4JNYA 3VA8A 1MVYA 2FZBA 5D9MA 5MKGB 1DEDA 2XVGA 3WMBA 3T0CA 1WA3A 3EEZA 2A7NA 2D24A 1MZHA 3UWEA 1VQTA 1AQ0A 3PBVA 2GWNA 2XHYA 4FF5A 3PB2A 3TE9A 3REQA 4P61A 4D6GA 3LY0A 5D9PA 3UXKA 3BAXA 4C7GA 1JQXA 3KBWA 5EFFA 3MW7A 4JTIA 3S9ZA 1NWTA 2BODX 4TX9A 4EVZA 3RLVA 4NYUA 3AC0A 1UUMA 3U9IA 1SFLA 4XWUA 1BQGA 5LHFA 1Z6KA 2OWCA 4DJED 4QHRA 3WKZA 4NT0A 4PGLA 3EXTA 3CIWA 2B0MA 1B3OA 3KS5A 1W3JA 4CLMA 4IGNA 3TX9A 2G3JA 1AD4A 1PYFA 4LAMA 3TYBA 1UKSA 4MVAA 1H61A 2QPXA 1L6FA 3EX3A 5DN1A 1KBIA 1JCYA 4LF1A 1I2PA 4HNCA 1G69A 2VRJA 1NOFA 1YE4A 1MFUA 4C6FA 3ARVA 2GQ9A 2X7WA 4C91A 2BVTA 2DIEA 3UG8A 3VXGA 4E3TA 3CZLA 1Q6FA 1HJVA 5HQMA 1J0ZA 4ZQCA 4JTCA 7A3HA 3LI0A 3L5LA 4DUOA 3DC8A 3LBMA 5U7SA 2PRLA 4I90A 2O0TA 3EDDA 4MUPA 3VFCA 4RE2A 3AZSA 4U33A 4LOCA 1TFVA 3PJTA 1CXKA 2IXVA 2XSXA 1EC7A 4GRSA 4UOJA 4JL2A 1IF2A 3N2OA 3IRDA 4MZ1A 1S2VA 4XB3A 1POKA 4Z17A 4FXJA 3S5OA 1X8FA 5C9XA 3LBCA 1WUEA 5EMMA 5AHMA 1NF7A 4GGHA 3I6EA 3II1A 2HROA 5AVNA 1AJ2A 1E4NA 3G0UA 5E5CA 5CH9A 1ZAHA 5A6KA 1D7KA 4NZ5A 4EF9A 3NDZA 3PN8A 3OTRA 2GSEA 4GNKB 3HQ1A 3CNYA 3BJFA 1Z3NA 3L67A 2Z25A 4MSSA 3N1AA 3M0LA 5CBJA 3TNOA 2ZZ4A 3TTEA 4ZSTA 4L1WA 4UCGA 1WZKA 3R13A 4JZ5A 5H91A 3VOCA 2P76A 2V81A 3B0XA 4MNMA 3W6LA 4FP1A 1XIEA 1H7NA 4XBSA 1YNPA 3TSMA 2J88A 2XM2A 1CGYA 2Z1WA 4WXZA 3P82A 1DQWA 2W91A 3FFSA 2OWXA 1S2AA 3J7HA 2WAGA 3LTYA 3E0FA 4JTTA 4MFDA 3PUDA 2OPJA 1SFJA 3WEOA 4B5TA 3W7GA 1C92A 1FOBA 2OZ3A 3N6QA 1KO0A 1C3FA 3OA3A 4LYRA 2VZTA 4S3JA 5EB8A 3DECA 1KXHA 3VK5A 4QJ4B 1SO6A 3FAWA 1EQCA 3G1RA 1OK6A 2B7PA 2I57A 3L4TA 5KZ6A 3VNIA 4PMUA 1Q66A 4ZOCA 1OCBA 3Q4DA 3H4GA 4XK2A 1JZ4A 5I03A 4B5VA 1S46A 4NVTA 2Q02A 3JZEA 2GJPA 2YCIX 3T9PA 2PDJA 3L2MA 1AD1A 3BLDA 4MYXA 4QJ1A 1B9BA 3NO5A 3KZPA 1KCKA 3POHA 1UWSA 3BL3A 1NFGA 3N29A 2J25A 1GPWA 4LUYA 4AQLA 4OE7A 3HTWA 4ZSUA 3NL2A 3IJDA 4B15A 3MUY1 4F48A 4ZQMA 5KZDA 4EF8A 2J7EA 3UR8A 3VCRA 1MQPA 5EYWA 3RX2A 3THCA 5KITA 3V35A 3CUGA 3C0QA 2XZ9A 3F7JA 1CXHA 4Y2WA 2R1LA 3A47A 1V4YA 2OFJA 1VFOA 1A5OC 1EGVA 1OX5A 4Q33A 1KRBC 5CSUA 5ABEA 5L9FA 2R9RA 2YLAA 1Z41A 4CNTA 4AF0A 3RHGA 4GFSA 3LBOA 4W85A 1W9XA 1E6RA 4IFKA 3AYSA 1MNZA 3JRKA 4R85A 2V67A 2VO5A 5HPCA 1VPYA 1TIWA 3ABXA 3ZJ6A 3ARQA 3N17A 5FJOA 4D8LA 4XD5A 3W22A 1Q6GA 4K36A 2DZUA 4PCFA 1AVAA 4F2TA 4ACZA 3RCNA 4S3AA 3WMLA 4ATWA 3AUOA 5CEWA 3N2TA 4TO8A 1ICQA 7REQB 1LRTA 5K9DA 1ISWA 3IIPA 5HAOA 1X6NA 4DPPA 3IK4A 2FPTA 3FA5A 3ZLFA 4AXKA 4F8XA 4M6VA 4F0SA 1ZAJA 2AKZA 7ODCA 1XR2A 4V15A 3PZGA 1VPXA 4WUIA 3L4WA 1ZCCA 4WK9A 4DBSA 1RCQA 4UTTC 3SGZA 2DJLA 2WZHA 3W6YA 2GK1A 1YTKA 3IVSA 1OYBA 1I45A 1R2SA 2QJJA 2ZTKA 1FKXA 1G6CA 1GOKA 2QR6A 2WNWA 4B5SA 3AALA 1Z32X 1KWKA 2OQYA 3LTPA 2PU1A 3R2GA 2VWTA 1NH6A 2E5DA 1EIBA 3IIOA 3WQVA 4PUDA 2GUUA 3TN3A 4A3YA 2V5JA 4PMZA 3B0PA 4AB4A 9CGTA 1DBTA 2A7RA 1HO1A 2B7NA 4J28A 4AHPA 4ZXLA 3S6DA 2NWSA 1W5NA 3IAQA 4H8HA 4A35A 3JUGA 1XLHA 3IRSA 4DI8A 2HE8A 2ZICA 1BGAA 1REQB 4V27A 4ZB0A 1WBJA 2BB0A 3NQMA 2B81A 1K9TA 3VKKA 2CBJA 2OX1A 4H8NA 2G3MA 4E5TA 1AH3A 2C3ZA 4H4IA 5FF3A 3UY8A 3KS6A 3SIMA 4DM1A 2IQTA 3HQNA 3VCCA 4JICA 1YW1A 2C16A 3SGUA 2G3FA 3CL8A 3PTMA 1CXLA 4H9YA 3PZOA 2BVYA 4NX0A 4Y9NA 3CZ8A 2PDXA 3W7HA 4DO7A 2G4FA 1UP3A 3QRHA 4PUWA 4INFA 4TU1A 5F2IA 1TWSA 5JIWA 1N55A 3U7VA 2WYSA 4DB7A 1E1FA 2X0HA 2C79A 4CNSA 3TW7A 1UKQA 2ZX5A 3GNOA 1E6QM 2Y62A 1XPGA 1UZHA 5A94A 1NELA 3NTYA 5IHRA 3U2CA 4DBDA 1FHLA 1W2PA 5I3FA 2BASA 4Z2JA 4U5IA 4H9VA 3T2QA 1PDZA 1SSGA 4RV3A 1O68A 3NM3A 2AMGA 3F5LA 3T0AA 1EUAA 4YCOA 1J0IA 1JFHA 1H3GA 2V9DA 1MW0A 2Z24A 4WY0F 2WXDM 5EBAA 2QDDA 5CPTA 3TKFA 3V5OA 4Q7NA 2ZIDA 3S0CA 3CBWA 1W1B1 1P7TA 3AIBA 3L5AA 4QP0A 1FWEC 4S3DA 2L5HA 2QJGA 3W2LA 3CAWA 3G18A 3VGGA 5G1YA 1XLCA 3I4KA 2UZ9A 1BTMA 2A6NA 1EA0A 4ZVJA 2WVVA 1WP6A 2WSPA 1BGGA 4Z1YA 5L6UA 3TQVA 4KH2A 4C1NB 1JCNA 2Z2UA 4TXEA 2HBVA 1BWLA 3ERPA 4C6NA 3UQNA 3A24A 4IG2A 4UWMA 2D2JA 1XSIA 2XYLA 3GKAA 1TPDA 5HDRA 3VNMA 2E68A 1UKOA 3FHQA 1CCWB 3GZAA 3S2CA 1UIPA 2EG8A 4LTSA 5CSRA 4DM2A 4N2YA 4Q8VA 1ALDA 2QHAA 2PTWA 2VCBA 3POCA 2PF8A 1MUCA 1W8SA 5LA2A 2JBMA 3B04A 5DCBA 1HXJA 4WHBA 1UCWA 1XS2A 2J4GA 1G9HA 2VX5A 3SCVA 4CQCA 1U33A 2QAPA 1JJKA 1IWAA 3LB0A 2G5WA 3D6NA 4OV9A 2O7SA 3QR0A 3BTNA 4I3GA 2AQOA 3T42A 3R1ZA 1JCTA 3OBEA 4O17A 2ZX7A 3WSUA 4QISA 5E0CA 2PZ0A 3B8WA 3WUBA 1EJ7L 1VBJA 1XDLA 3SCNA 1W9UA 3FW6A 3GR7A 3LN3A 4ZODA 1TPH1 1X1OA 1IQ8A 4ZO7A 1SMAA 2WLYA 3K5XA 2V82A 4RJEA 1E9YB 1TPVA 2CKRA 2EKGA 1H2JA 3Q2DA 3VNDA 1QJWA 4YHGA 2WHLA 3AIUA 1VIZA 1ODUA 1XGDA 3BOLA 5TAOA 3N2CA 1LP6A 1XYAA 3OGRA 4G5DA 1LQAA 5AVHA 1FDJA 1XFBA 3ATYA 3TNBA 1PZ2A 1MW2A 6TIMA 5TF0A 1XLDA 2DSWA 4NRRA 3U2OA 3AMGA 3C5QA 1DKWA 5D33A 1XC4A 2I17A 1LLWA 3HG4A 4UQ9A 4WOZA 2YPIA 4UNLA 3QPYA 2A5HA 4IMFA 4HHPA 3E0IA 3UWVA 3K46A 3SGGA 1FH8A 1DTNA 3KZSA 2D0HA 2VM8A 3U5YA 1L8PA 2OQHA 1I2RA 2OZTA 5FF2A 2DZSA 4AIOA 1PIGA 3QSRA 5EPDA 2PE4A 5FACA 3P84A 2BHZA 1QW8A 3LERA 2B4GA 2NV2A 4A8NA 4OOUA 4FPSA 4Q22A 2ZA3A 4LUSA 4D2JA 4PCSA 2V8ZA 2GOKA 2YCLA 4JHOA 1GVIA 1KA9F 4LANA 3TXZA 1QVBA 3VNLA 4KW2A 3PWIA 5A2BA 2PU0A 5I06A 3QC3A 1XLGA 4LS0A 1QNSA 2QPUA 1I2OA 4GA8A 4ZEPA 4GJJA 3SY1A 4GYPA 5AC6A 1OFAA 4MPKA 3M46A 2OR2A 4Q8WA 4RE4A 2YBVA 3KTCA 1WDRA 4GI8A 5KSWA 4IIGA 4EANA 4NI8A 4I9AA 3LENA 2X8RA 2H8ZA 5M5DA 1ZJBA 2QUTA 1H7RA 5BXTA 1CECA 1E5NA 3LUTA 2J6VA 1SJDA 1TVNA 4US5A 1UPMB 1IYXA 4QGCA 1V02E 3WD3A 4B9ZA 2ABAA 3GIPA 4K1GA 3DYOA 3VFLA 2NUXA 2PDUA 3TK7A 1DXFA 4L7ZA 3P5YA 3SN0A 4AEOA 3O05A 3A5VA 2P88A 4CN4A 3CXOA 2E67A 3N2MA 4GVHA 2ISWA 4TOQA 2QF8A 4EOUA 5D2YA 1BF6A 2HRWA 1QHPA 2CYGA 4QLKA 1DQUA 3K4WA 3QPEA 1HFBA 3XINA 3UEQA 2A3BA 2VOTA 3G1HA 2ZYFA 2QCDB 3F2DA 4ERIA 1VHCA 4HKPA 3GH5A 2DUXA 2A3LA 2NX9A 3ECQA 1YDVA 3SFKA 3SO7A 2CU0A 1AMYA 2QEZA 4GG9A 5HATA 3KHJA 3LPFA 4HYVA 2BTMA 3DIPA 1A3HA 4HHHA 3ZT7A 1HIZA 2I1OA 4HNOA 2Z00A 3DXIA 3E74A 3CO4A 1WXYA 1HZYA 1EO7A 5FEWA 1ZHAA 4FSAA 2PDYA 3THQA 3NOYA 4L6OA 4ZA0A 1MW3A 1QWKA 3WJWA 3OLEA 4NG3A 5K3VA 2FJUB 3PC0A 3QYQA 4KFPA 3DHPA 3VDGA 3VD4A 4ML9A 3IANA 5HA7A 1IWBA 5SWUA 1QI3A 1K9FA 2AGTA 2VC7A 1CX9A 2XN2A 1RLDA 3H24A 1E72M 3E2RA 1R5YA 2Y8UA 1W1VA 3FS2A 5I3KA 3P8IA 4HA3A 4KKXA 4TMCA 3SUSA 4LWWA 4JYFA 2FVKA 1JAEA 1JEZA 4LC6A 3CUJA 2HISA 2R1NA 4RK8A 4JEJA 1KFEA 2EPOA 3N11A 1W8GA 2BDQA 1XIHA 1FWFC 3MMDA 1SUXA 3GY1A 2BY0A 3BJTA 3VIJA 3ITLA 1LYXA 5BRBA 3G1XA 1I1WA 2WPBA 4NJIA 2VGBA 1WAUA 3BCDA 4AU0A 3ARYA 3FKKA 4JTKA 1PJ9A 1VYPX 3K30A 2XZ7A 1M1BA 3NAVA 1ESWA 1QATA 4NI3A 4KEZA 2W63A 4PCTA 4C6DA 1JDCA 3PZVA 4L4MA 1B54A 3AHTA 2CBVA 1S2WA 1W9DM 1F6PA 1BEUA 3MUIA 4PL1A 5BXRA 4ZQPA 5CZ0A 3IACA 3F2BA 2NX3A 3P5ZA 4GC3A 4LUTB 1A5LC 3CYJA 4FEZA 2E8ZA 3QV7A 2D2OA 3KRZA 2VQUA 1CB7B 4PB4A 1ZY9A 1OIFA 4GNVA 1EDGA 1UBSA 4C6CA 3VX0A 2DVTA 5C6MA 4V2XA 1PKNA 1XWYA 2QNEA 2A4AA 2E4TA 2ZUTA 5EMJA 2X0YA 2OT0A 3NQ7A 4WCJA 1U1HA 2GFTA 4UFIA 5CG0A 1I6NA 4C1KA 2Y1HA 3SSZA 3S2JA 2ISFA 5HINA 4TMBA 2X0SA 1B30A 3FDKA 1AFSA 4B5NA 1SM9A 3RF9A 1V6VA 3WF3A 2BFGA 4DY1A 3TFCA 2RUSA 3EX6A 3C52A 4M7SA 5E93A 4FLSA 3IJ9A 4QG6A 1FXPA 1UIOA 2RHGA 3T8QA 3RRAA 1ONWA 1QNOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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