1O7AA

Human beta-hexosaminidase b
Total Genus 182
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
500
structure length
483
Chain Sequence
PALWPLPLSVKMTPNLLHLAPENFYISHSPNSTAGPSCTLLEEAFRRYHGYIFGTQVQQLLVSITLQSECDAFPNISSDESYTLLVKEPVAVLKANRVWGALRGLETFSQLVYQDSYGTFTINESTIIDSPRFSHRGILIDTSRHYLPVKIILKTLDAMAFNKFNVLHWHIVDDQSFPYQSITFPELSNKGSYSLSHVYTPNDVRMVIEYARLRGIRVLPEFDTPGHTLSWGKGQKDLLTPCYSKLDSFGPINPTLNTTYSFLTTFFKEISEVFPDQFIHLGGDEVEFKCWESNPKIQDFMRQKGFGTDFKKLESFYIQKVLDIIATINKGSIVWQEVFDDKAKLAPGTIVEVWKDSAYPEELSRVTASGFPVILSAPWYLDLISYGQDWRKYYKVEPLDFGGTQKQKQLFIGGEACLWGEYVDATNLTPRLWPRASAVGERLWSSKDVRDMDDAYDRLTRHRCRMVERGIAAQPLYAGYCNH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title The X-Ray Crystal Structure of Human Beta-Hexosaminidase B Provides New Insights Into Sandhoff Disease
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-HEXOSAMINIDASE BETA CHAIN
total genus 182
structure length 483
sequence length 500
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2002-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF14845 Glycohydro_20b2 beta-acetyl hexosaminidase like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1o7aA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 1o7aA01
4U33A 1XSIA 4H41A 2CBUA 1WO2A 3VDHA 4AD4A 1B30A 2CITA 1L8NA 5A6MA 3WH8A 1BGGA 1WP6A 3CIVA 3T0BA 1HT6A 3PZOA 4MNKA 4AD5A 4JZ5A 3SCVA 1JIBA 1QVBA 1E1EA 2XPKA 1BHGA 1V6WA 4UQAA 5A6AA 2EXOA 4AZ5A 3NDYA 4WKHA 2WXDM 3EDEA 4IPNB 1ISWA 3WMSA 3B8SA 2E3ZA 3UEQA 3GXFA 3WQWA 2XGBA 4PSPA 2XWEA 1GOQA 1JF6A 1R86A 2CBJA 1LJYA 1P6WA 1M7XA 1EXPA 1BYDA 4LQ1A 1W9DM 1UWUA 1BPLB 2WMFA 3KL5A 1MWOA 5ABEA 5BYWA 1ZBCA 3K8LA 4P7NA 1CECA 1MXGA 8A3HA 3TA9A 3CUJA 4UOJA 3ARTA 1KGXA 1CEOA 2ESCA 2VMFA 1TZ7A 1HJWA 4IM4A 4Y7EA 2IUZA 1GQJA 2JFEX 3AMGA 1PX8A 1UKPA 4AD0A 3VD7A 1J0YA 1CZ1A 1RP8A 5EFFA 1VFUA 1C92A 3W81A 3ZT5A 5BROA 1ODZA 1BYAA 4PTMA 3TTOA 3VMNA 4V2XA 2PBOA 4GI6A 1JD9A 3ZT6A 1W3JA 3G6MA 1JAEA 1V3KA 3ZIZA 2YJQA 5CSUA 2O92A 1TCMA 3ALGA 4ML4A 1X1NA 1IZJA 1E70M 2VZVA 4FMVA 2GSJA 3WN6A 4D6HA 6A3HA 1ZS2A 4ZE4A 5LA0A 5M5DA 2DH2A 1VBRA 2V5CA 3WUBA 3EDKA 3VMPA 1GUVA 4H04A 1KCKA 4JFUA 2O9PA 3VIPA 3F5LA 1CLVA 1KWGA 3ZQ9A 4C91A 4UQ9A 3WDHA 2J7HA 1TFVA 2WVVB 2YDSA 4IPLA 1JGIA 3WL1A 4PUEA 4HZ8A 3SCPA 1V02A 2VURA 2WC7A 4S3JA 4W8LA 3RMEA 1J10A 5I78A 3W6MA 1AMYA 1ZB5A 2XSAA 3CO4A 3N18A 3TONA 2CIPA 2B31A 4UQCA 1LL4A 3VDAA 3SUTA 3QOKA 2J75A 3BAXA 1UWTA 4OZOA 1UH4A 1FA2A 3IJ9A 2BFGA 1UG6A 3T0DA 4LYRA 4HOWA 3OZOA 4GZJA 4RL3A 2WVUA 4Z2KA 2W61A 4B15A 1BG9A 1QI4A 1QW9A 2DQXA 5D8ZA 3QHNA 1E6ZA 4GINA 4UZUA 3AZTA 2UY5A 2DSWA 4ACYA 1TUXA 5E6ZA 1B3WA 4D6GA 4AEEA 4MB5A 2FGZA 5HNNA 1U30A 3CZLA 4V27A 1W1YA 2GDUA 4W86A 3J7HA 3K4DA 4U5IA 3OB8A 1KCLA 2WB5A 4ATWA 3RO8A 2WBGA 5KEZA 4CD5A 2VZSA 3TTYA 4UFMA 5A6LA 4JFSA 1MW3A 1QNQA 1ZBKA 2NSXA 3MS8A 3UESA 4J3WA 1EO5A 4M81A 1HNYA 1PZ2A 3IAQA 3BCFA 4B9ZA 3NJ3A 3ZT7A 3VILA 1V08A 4OJYA 1QHPA 1W32A 4H8VA 2JE8A 4JCLA 1CGUA 3NSNA 3OA5A 1IV8A 2OSXA 2V3FA 4JKMA 3B9EA 2YOCA 1B3ZA 4J3UA 4MB3A 2ZUVA 1UZ1A 2CHNA 1AVAA 1WAWA 2WVSA 4D6DA 1CXEA 4AXNA 4UTFA 1D7FA 3MV11 2ZUMA 1PEZA 2C7FA 3VNYA 2BY3A 2J7EA 1WZAA 5ABGA 1UKOA 2FH8A 4KGJA 9CGTA 3ZJ7A 1HKKA 1X6LA 2A3EA 4AYSA 3KE0A 1ZBVA 2UY4A 1U2YA 3AFBA 4GI9A 3WDRA 2ZWZA 1WDRA 2NW0A 3WFZA 1R85A 2D23A 1ISXA 1F4HA 4L4OA 3VX0A 1OBAA 1JFHA 2G41A 1Q6DA 2CBIA 3WSUA 3ARXA 1EA9C 1LWHA 3WF1A 1E3ZA 1DWJM 5CGTA 3W37A 2JEQA 2VX4A 1UH2A 1H09A 5DF0A 1QNPA 1HP5A 4QCEA 3SEPA 2XFFA 1WZLA 4HA4A 5A8PA 4ACZB 3QHMA 1H4PA 3O6AA 2BHUA 1V3JA 1JXKA 2G8ZA 2GJXB 3MO4A 1HJSA 5FIPA 1SYTA 3EDFA 4QLJA 2OYMA 4ZXLA 5GQBA 1E6XM 4PMRA 3ARWA 4CCEA 1R7AA 1GNXA 4TX6A 5D9NA 3FHAA 4GZEA 1VENA 1HJUA 4R27A 1KXQA 3WDPP 2DDXA 3WD1A 2X2YA 2O9RA 3AIVA 4MB1A 3ZO9A 3ARYA 4Q7NA 3ARSA 1UZ4A 5JIPA 1TG7A 1VEOA 2VT0A 1BTCA 4MNLA 5HDRA 1PZ3A 2CETA 4OOZA 4CU7A 1J0IA 2DSUA 3ZMRA 1H3GA 1NP0A 1MYRA 2DPEA 3KL3A 5JBFA 1X6NA 3CBWA 3WY1A 3KZSA 1OWQA 4WSKA 3PZQA 4GQRA 2DH3A 2X0YA 1M01A 4C90A 1C7SA 2VR5A 3K46A 2OLHA 1E43A 1H41A 2QLYA 1K9FA 3N04A 3IANA 4WLCA 3AHTA 1ESWA 5HPOA 2YA1A 1TA3B 3QGVA 2D0GA 1OCQA 4AZGA 1HVQA 3BAIA 1QI2A 4HPGA 1ZL1A 2XVLA 3W26A 5I5RA 4H8HA 3W29A 3GTNA 1KBKA 3BMVA 3WF0A 3RJYA 1V6YA 4HP5A 1V3IA 2YL8A 3GYCA 4WF7A 2G3MA 4NSBA 2NT0A 3MSDA 3QOMA 3DECA 1V02E 3ZJ6A 1QHOA 1E15A 2G3IA 2VTFA 1VRXA 2ZXAA 3SUVA 3WUFA 4D71A 1I75A 2WPGA 4D1JA 1JDAA 2GJRA 2VRKA 4FLOA 5CLWA 1H49A 3GBDA 1BSIA 3BAKA 3L4VA 1I1WA 5FCZA 1EHNA 4X0NA 5I79A 3WQ5A 3L4ZA 3GM8A 1CBGA 1CXKA 4BCEA 4J3VA 2GFTA 1HL9A 1PPIA 3K8KA 1VBUA 1O6IA 1ZBWA 4N0RA 1GVIA 3CHDA 1HXJA 4D6EA 3OBAA 5C70A 4D72A 4MAVA 3N1AA 3T08A 4CU6A 5A8NA 4HPHA 2OWCA 3CZ8A 3WNOA 4ATLA 1CTNA 2UY3A 1DWGM 4J28A 4LGXA 3SCUA 1G1YA 1MFVA 4RE3A 3W0KA 2XVNA 5I77A 1NWRA 5HBFA 5GNYA 1FFRA 2XTKA 3NUKA 5E0CA 2WSKA 4J3XA 2FHFA 4NZCA 4TVUA 1SMDA 2ZWYA 3DYOA 5JUVA 1WPCA 1EOMA 1MQQA 5I24A 2JF7A 3VDCA 3WUEA 2EJ1A 1OSEA 3A6OA 2BHYA 5ABFA 2WAGA 1KQYA 3W4RA 2QHAA 4NI3A 1IT0A 1ECEA 5FOOA 5DT5A 4JFTA 3VGGA 1CXHA 4W5UA 3W25A 3W82A 3ECQA 4UNIA 1WZKA 1J11A 1NWSA 4CN1A 4HOXA 1JZ5A 1E0VA 1CGXA 3T0AA 3N11A 4F9DA 1EGZA 3EMZA 1L0PA 4W7WA 4R5EA 2XWDA 4Q22A 2Z1SA 1EQPA 1C8QA 1V03A 4JFWA 3UCQA 4U2ZA 2DT1A 2DT3A 2ZX9A 5DEZA 1MW2A 4KRTA 4HZ7A 3AHYA 1FP8A 1XC6A 5A1AA 1V0LA 2ZX8A 1TMQA 1JNDA 1B9ZA 2WMKA 3AS3A 1VJZA 3ARVA 5EMYA 4K68A 5A8QA 3EDDA 1QPKA 7A3HA 3OIHA 2WYSA 3AI0A 3PZGA 4P8XA 4P8WA 5GNZA 2CYGA 3WDQA 3CTTA 4F66A 3M07A 2WKLA 3ARPA 1JI1A 2Z1KA 3PN8A 3O9NA 1XH1A 3OLIA 3QR3A 4PMDA 4CD6A 2CKSA 2X8RA 1D3CA 3N12A 1VFOA 1MW1A 4P7RA 3RIKA 1XYZA 2BV9A 5FL1A 4WIWA 1K6AA 1NQ6A 8CGTA 4M82A 1FOBA 3AIUA 2J74A 1JZ2A 2WKGA 4PMXA 3VD3A 2DGAA 5A6BA 4W84A 4EK7A 3VX1A 1TA3A 3AROA 2YLAA 2ZUUA 2WHJA 1YHTA 4WJXA 5A95A 1SMAA 1UD4A 4X0VA 4MDOA 7TAAA 1B0IA 1DTUA 5BRQA 3S2CA 1B31A 5D8WA 4CN4A 1XYFA 2W62A 4DUVA 1JDDA 1J01A 3SURA 1W2PA 1UKSA 2WCAA 3L2MA 4MJ4A 4M8UA 4P7QA 2ZUTA 1VF8A 1NOUA 2D24A 2GUYA 3K4AA 4AZCA 3W38A 1NOFA 1ITXA 1E0XA 2WMJA 2YKKA 3WEOA 4MJ2A 2FHCA 3VGBA 4OIFA 3F5JA 3PZVA 1BGAA 3AHZA 3GH7A 2XUCA 4BA0A 1JZ3A 3OLEA 4IUGA 4WKFA 3LPFA 2PF0A 3T2PA 1N82A 2DEPA 2DSKA 2JIWA 1BYCA 1DWAM 3AIEA 2J4GA 2WMGA 3FN9A 3W6LA 2V38A 1C93A 1VEMA 5DMYA 1XRVA 4MADA 1BVNP 3GZAA 5BRPA 3RM8A 5EB8A 4PCSA 4W93A 1WNOA 2XVKA 3AIWA 3MANA 2VCBA 2EQDA 3BMWA 2J62A 4EANA 4ZXOA 4W7VA 1W3LA 2PB1A 3WUGA 3FY1A 4BZYA 1KR0A 1VFMA 3W24A 4UFJA 1E4MM 1DEDA 2J7FA 2D1ZA 3AIRA 4X9YA 3SCRA 3L4TA 3N13A 2PWGA 4Z2LA 2FDMA 4OOUA 4TVCA 3U7BA 2E40A 4AD2A 1E56A 1PAMA 4JAWA 1KXVA 2BVDA 3WNKA 3PBGA 4CKQA 1WB0A 2E4TA 4CCCA 2ZXQA 1QW8A 4J27A 4OUEA 3NDZA 5A94A 3SIMA 3UG4A 1CDGA 1AQMA 3VGEA 1GOKA 4PMNA 1Q4NX 2JEPA 2WC3A 2F8QA 3PZIA 1H5VA 5KZ6A 5AYIA 3UR8A 1E6NA 4XX6A 1EIBA 3NIYA 2ZIDA 3CUHA 4DM1A 1XV8A 1E55A 3K1DA 3CUIA 1G5AA 4TVDA 1TVNA 4W85A 1JYXA 2EEXA 4PMYA 4TXEA 3AXXA 1GONA 3T2QA 4PMVA 1JZ8A 4DWSC 4AC1X 4WSJA 2BVYA 4GKLA 2IXUA 3L4XA 1TVPA 2XSBA 2YL9A 2VX7A 2GDVA 3II1A 4HMEA 2WCSA 1W3KA 2CHOA 5AYBA 1FH8A 5TD4A 5IFTA 4PMZA 1OT1A 1KFWA 4Z2HA 3EBVA 3BH4A 1JYVA 3L4WA 1LG2A 1A3HA 1LWJA 4C7FA 3VNZA 1RP9A 1QNRA 1M04A 5I23A 2OYKA 2BS9A 1GVYA 3PZ9A 4JHOA 5IDIA 4CCDA 3WEZA 3THDA 1KGWA 3PHAA 1NWTA 4HMDA 4MAZA 1HN1A 2G3NA 2YDRA 4M24A 4JKLA 3WH5A 3VMOA 3SCWA 4A3HA 2D22A 2XGIA 1CLXA 5LA2A 3WH7A 3U7VA 2WANA 5ABFB 2VCAA 3PZNA 1QNSA 2OWXA 1LG1A 1JG9A 3WNMA 1ITCA 3IJ7A 3MKKA 2E8YA 3CHCA 1XD1A 2RGMA 3PTQA 1OGBA 1UWRA 3WF2A 5A3HA 4PMQA 3CGTA 1US3A 3VPLA 4LPCA 3LPPA 1V6UA 1OGGA 3GXDA 4JIEA 4AZHA 5CSYA 1B3YA 4CD7A 4YN5A 5E09A 4HOZA 4AIEA 1FHLA 3PZUA 4PTXA 2FHBA 1QI0A 2VCCA 2JIEA 1WDSA 1TR1A 2YLLA 2Y24A 4PBGA 4MDPA 2YL5A 3VD5A 4XV0A 1FH9A 3HU7A 2BXZA 5A6SA 1E40A 4NRRA 3RILA 1R87A 1UR0A 1OT2A 7CGTA 1JI2A 3T2OA 3WF4A 1OIFA 3POCA 2YBTA 1JFXA 2FH6A 4P8VA 2WNWA 3B9DA 1XCWA 3ZR6A 3AISA 2WCGA 3ZSSA 5IHSA 1UD2A 4HMCA 1E4NA 2WMHA 1UA3A 3U5YA 1DP0A 2QV4A 4ZEPA 2W4XA 1HJXA 3PTKA 1UD5A 1C8YA 1E4IA 2XFYA 3CLWA 3ARUA 4TX8A 3VDBA 4H7VA 1J0KA 4HA3A 3VM7A 1CYGA 3VD4A 4AD1A 1HP4A 3BAYA 3CUFA 1NWUA 4UOQA 2A3BA 2E8ZA 4AISA 5CLTA 1JNEA 1UR1A 1ZU8A 3N15A 4PSRA 4JKKA 1RH9A 1V0NA 4PMUA 2VR4A 1CNVA 4AEFA 4HU0A 1UD6A 4FLQA 4U3CA 3VIMA 2E9BA 3WH9A 4BQ2A 2J7CA 3GBEA 5I2UA 2YIHA 4U3AA 1W1VA 3MV01 3GH4A 5BXSA 3AS2A 1S46A 1ODUA 1F4AA 3GDBA 3AHVA 1GQKA 3WDJA 4XUYA 4TUFA 1BF2A 3BLKA 4QP0A 3RM9A 2ZE0A 4GIAA 1W3HA 4DWSA 1HJVA 3FAXA 3NYDA 4MNJA 5EFDA 2GK1A 5E0FA 1BFNA 1UYQA 5CPSA 3FNDA 1UWQA 4OBSA 2WHKA 2D20A 3B9AA 1KXHA 1CPUA 4C7DA 3MU7A 4AZCB 4U2YA 2EPOA 1Q6GA 3E1F1 3MSGA 1XSJA 2DT0A 1BAGA 4CD4A 3MMWA 4A3YA 4M1RA 4HA1A 2C0HA 3WBEA 2EPNA 4GXPA 1AQ0A 4CVUA 2VNCA 2D2OA 4KGLA 4BQ5A 2G4FA 4YPJA 2OWWA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4U33 A;  1XSI A;  4H41 A;  2CBU A;  1WO2 A;  3VDH A;  4AD4 A;  1B30 A;  2CIT A;  1L8N A;  5A6M A;  3WH8 A;  1BGG A;  1WP6 A;  3CIV A;  3T0B A;  1HT6 A;  3PZO A;  4MNK A;  4AD5 A;  4JZ5 A;  3SCV A;  1JIB A;  1QVB A;  1E1E A;  2XPK A;  1BHG A;  1V6W A;  4UQA A;  5A6A A;  2EXO A;  4AZ5 A;  3NDY A;  4WKH A;  2WXD M;  3EDE A;  4IPN B;  1ISW A;  3WMS A;  3B8S A;  2E3Z A;  3UEQ A;  3GXF A;  3WQW A;  2XGB A;  4PSP A;  2XWE A;  1GOQ A;  1JF6 A;  1R86 A;  2CBJ A;  1LJY A;  1P6W A;  1M7X A;  1EXP A;  1BYD A;  4LQ1 A;  1W9D M;  1UWU A;  1BPL B;  2WMF A;  3KL5 A;  1MWO A;  5ABE A;  5BYW A;  1ZBC A;  3K8L A;  4P7N A;  1CEC A;  1MXG A;  8A3H A;  3TA9 A;  3CUJ A;  4UOJ A;  3ART A;  1KGX A;  1CEO A;  2ESC A;  2VMF A;  1TZ7 A;  1HJW A;  4IM4 A;  4Y7E A;  2IUZ A;  1GQJ A;  2JFE X;  3AMG A;  1PX8 A;  1UKP A;  4AD0 A;  3VD7 A;  1J0Y A;  1CZ1 A;  1RP8 A;  5EFF A;  1VFU A;  1C92 A;  3W81 A;  3ZT5 A;  5BRO A;  1ODZ A;  1BYA A;  4PTM A;  3TTO A;  3VMN A;  4V2X A;  2PBO A;  4GI6 A;  1JD9 A;  3ZT6 A;  1W3J A;  3G6M A;  1JAE A;  1V3K A;  3ZIZ A;  2YJQ A;  5CSU A;  2O92 A;  1TCM A;  3ALG A;  4ML4 A;  1X1N A;  1IZJ A;  1E70 M;  2VZV A;  4FMV A;  2GSJ A;  3WN6 A;  4D6H A;  6A3H A;  1ZS2 A;  4ZE4 A;  5LA0 A;  5M5D A;  2DH2 A;  1VBR A;  2V5C A;  3WUB A;  3EDK A;  3VMP A;  1GUV A;  4H04 A;  1KCK A;  4JFU A;  2O9P A;  3VIP A;  3F5L A;  1CLV A;  1KWG A;  3ZQ9 A;  4C91 A;  4UQ9 A;  3WDH A;  2J7H A;  1TFV A;  2WVV B;  2YDS A;  4IPL A;  1JGI A;  3WL1 A;  4PUE A;  4HZ8 A;  3SCP A;  1V02 A;  2VUR A;  2WC7 A;  4S3J A;  4W8L A;  3RME A;  1J10 A;  5I78 A;  3W6M A;  1AMY A;  1ZB5 A;  2XSA A;  3CO4 A;  3N18 A;  3TON A;  2CIP A;  2B31 A;  4UQC A;  1LL4 A;  3VDA A;  3SUT A;  3QOK A;  2J75 A;  3BAX A;  1UWT A;  4OZO A;  1UH4 A;  1FA2 A;  3IJ9 A;  2BFG A;  1UG6 A;  3T0D A;  4LYR A;  4HOW A;  3OZO A;  4GZJ A;  4RL3 A;  2WVU A;  4Z2K A;  2W61 A;  4B15 A;  1BG9 A;  1QI4 A;  1QW9 A;  2DQX A;  5D8Z A;  3QHN A;  1E6Z A;  4GIN A;  4UZU A;  3AZT A;  2UY5 A;  2DSW A;  4ACY A;  1TUX A;  5E6Z A;  1B3W A;  4D6G A;  4AEE A;  4MB5 A;  2FGZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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