1OF6A

Crystal structure of the tyrosine-regulated 3-deoxy-d-arabino-heptulosonate-7-phosphate synthase from saccharomyces cerevisiae complexed with tyrosine and manganese
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
351
structure length
350
Chain Sequence
GAEEDVRILGYDPLASPALLQVQIPATPTSLETAKRGRREAIDIITGKDDRVLVIVGPCSIHDLEAAQEYALRLKKLSDELKGDLSIIMRAYLEKPRTVGWKGLINDPDVNNTFNINKGLQSARQLFVNLTNIGLPIGSEMLDTISPQYLADLVSFGAIGARTTESQLHRELASGLSFPVGFKNGTDGTLNVAVDACQAAAHSHHFMGVTKHGVAAITTTKGNEHCFVILRGGKKGTNYDAKSVAEAKAQLPAGSNGLMIDYSHGNSNKDFRNQPKVNDVVCEQIANGENAITGVMIESNINEGNQGIPAEGKAGLKYGVSITDACIGWETTEDVLRKLAAAVRQRREVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the Double Complex of the Tyrosine Sensitive Dahp Synthase from Yeast
rcsb
molecule keywords PHOSPHO-2-DEHYDRO-3-DEOXYHEPTONATE ALDOLASE, TYROSINE-INHIBI
molecule tags Lyase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 138
structure length 350
sequence length 351
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 2.5.1.54: 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase.
pdb deposition date 2003-04-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00793 DAHP_synth_1 DAHP synthetase I family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1of6A00
3TA6A 3PR2A 4AXKA 2VKZG 4O17A 2O7SA 4O1DA 1L6YA 5AYZA 3TX9A 6ALDA 1F2JA 2Y70A 3IIVA 1WV2A 3NL5A 3TC6A 1H61A 3EX1A 2ZQ0A 3P7YA 5D05A 4BI6A 5CZ0A 3DBPA 4E0CA 4IMFA 3L0NA 4NX0A 2FJKA 3OVQA 3HQ1A 3KVJA 4AWTA 4AEOA 3CIWA 5I3GA 2W6RA 3SFKA 1LBMA 4R7JA 3OBKA 5E93A 1G4PA 2ZRYA 3M5XA 1JQVA 1P4CA 4ICNA 1T0OA 3QZEA 1RVGA 3U8GA 3LTSA 4GUGA 2QDGA 3ABQA 4JDYA 5AHMA 2B4GA 3STCA 3IGSA 1UUOA 4OWGA 3UPBA 1EIXA 3NL3A 3W2UA 3LDVA 3HGRA 1G7VA 1LRTA 1QNVA 1D3GA 3LRLA 1QR7A 2VFIA 4HIBA 1H50A 5DELA 1FXQA 1NEYA 3G0UA 3TC7A 1HO4A 4KFPA 4QM1A 5DY2A 1ZAJA 3STFA 3MYPA 1YDVA 2V81A 5D2XA 3M9YA 4KFNA 3TSBA 3OIXA 4JIPA 4JTKA 1SZEA 4LS2A 4XQ6A 2CWNA 4DO5A 5CZJA 5LGZA 1A5CA 4UTLA 3W2NA 1IXOA 4CQ9A 4JYFA 3W23A 3MI3A 5L6UA 2BZNA 2NXGA 1UASA 2A6NA 1KM5A 1OFPA 1F5ZA 2E5DA 3S1WA 2R8WA 3CEUA 1NFBA 3HIJA 3N73A 3B04A 2TSYA 3UQNA 2J9XA 5HMSA 2V0TA 5KZDA 3EEGA 4DPQA 1LLWA 1JCMP 3TUUA 3KOFA 3TQ0A 3UWWA 4AB4A 3UPWA 3S6DA 3HG5A 2EPHA 2YX0A 3KVKA 4POCA 3FKRA 2WSQA 1Q3NA 1TV8A 2NWRA 1HL2A 3TJXA 1D3HA 2P0OA 1W8SA 3QFEA 3WJSA 4N9EA 1KTNA 4K7YA 1DL3A 4WY0A 1YLVA 4R34A 1DQWA 1TYGA 3W1PA 4GE8A 4LV9A 1P0NA 5LNVA 4GUFA 1YXCA 1JR1A 1QOPA 3NQ6A 4WY0B 2JKPA 2EAWA 4Z1CA 2QJHA 1VHCA 2BX7A 2H3DA 1GYLA 2YFNA 3EWWA 4AMAA 4Y90A 2KZHA 2QAPA 3SECA 1P5BA 2QCNA 1ZY9A 1VC4A 3L2IA 1H7PA 4XBSA 1J5TA 5E0KA 4NJHA 3C56A 4RKAA 2C6QA 3DFOA 5EMUA 4BWLA 4UTUA 1TB3A 2GOUA 3G3MA 4N9CA 2YW4A 3GR7A 5AFDA 4YXGA 1KW1A 5HR7A 4WQ6A 2YGYA 1ZJIA 3GDTA 4UFHA 3RK8A 1IF2A 5HULA 1SUXA 3E12A 2E09A 1KM0A 1B4EA 1T96A 1OYCA 4QIUA 4JD4A 3TW6A 4ZQPA 3NGJA 4C1KA 3T40A 1IGSA 2FTPA 1H7OA 1QO2A 2YR1A 5CG7A 4OV4A 1TPC1 4LUJA 4ZZ9A 3W7LA 4N6FA 3E0IA 2A6LA 3PULA 5LNRA 4QJ1A 1X1ZA 3K30A 3NM3A 3VNDA 1ME8A 1PCWA 5AC8A 4D2JA 3DKLA 1I2PA 2ZBTA 2ZZ3A 3B03A 3KRZA 3UWUA 1W5PA 2CLOA 3FJLA 3A22A 3H53A 4JTUA 3S1VA 3W87A 2VC6A 2X1RA 1ICSA 2J88A 3W7JA 4TMCA 1H7NA 3IVTA 2DZTA 3PBVA 1D9EA 5AC7A 3C4UA 3PBUA 1SPQA 3GNNA 3VKJA 4CQAA 3P80A 3CTLA 2Q8ZA 1ICPA 4YWIA 1JCYA 2FPTA 3NVTA 2YW3A 3HPSA 1EUAA 2C15A 3DH7A 1ADOA 3S5ZA 2Z2UA 4FB7A 4N02A 1W5OA 4WZHA 3LBMA 1R30A 1KFBA 4FHAA 3WK2A 4I7UA 3MHGA 5LZLA 2A21A 2ZRVA 1BTMA 4JR5A 4BI7A 1XM3A 4IX2A 2E1DA 3B0PA 1VYSX 4XTDA 5MHBA 4ZQOA 5C6MA 3A9IA 4O28A 2C13A 1Z44A 4WUIA 3NL2A 3B4UA 3GDKA 4O13A 4O14A 4O1BA 2C14A 2QKFA 5AB3A 3W7EA 1OFAA 1A5SA 2CLFA 3TFCA 4O15A 3W7OA 2E77A 1OK4A 1DJNA 4O4VA 2P1FA 3P67A 2Y7EA 1RQHA 2CW6A 2HSAA 4UFKA 2ZRWA 1H63A 1SO3A 4DO4A 4IMCA 3FOKA 1SU5A 3G24A 3GKFA 3U2OA 3CHVA 3P74A 3BARA 1LM1A 3NQ7A 4JXCA 4UUIA 3SY5A 1L2UA 4X22A 3RFAA 4JTHA 2FPVA 2C1HA 1VGAA 1GVRA 1TSIA 4OQVA 4WD0A 3JRKA 5D38A 1SW0A 1LTDA 1QOQA 3NOEA 3EX6A 4UMAA 5CPNA 3A23A 4JGDA 4FF7A 1F6KA 1H1YA 4JTFA 3MP4A 3HBLA 3FLUA 3EB2A 5FEZA 3ZFHA 4H6KA 4WXZA 3JS3A 1PL9A 1NVMA 1S5TA 1S5VA 4FNTA 2ZA3A 3SGUA 3DHDA 1WOBA 1JJKA 2B7NA 2YYTA 5HJLA 1M5WA 3QSTA 3RMJA 1ZALA 4N4QA 4O57A 4P61A 5EY5A 2RDUA 3NQEA 4LC6A 2CLEA 2CLIA 5FF7A 1JRBA 3W2JA 4PODA 4UTIA 2AGKA 1UB3A 4LVDA 2J27A 2GJLA 1Z42A 2RDTA 3QPZA 2G95A 5CSSA 1DQXA 3CU2A 4AHPA 1O60A 1CW2A 2ZZ2A 2R14A 1XC4A 1FQ0A 3G22A 1KM1A 3GYEA 4S2BA 3TROA 2QF7A 4LTSA 5EL1A 3G1YA 2WNNA 1SSDA 4NNBA 2ZYFA 1OYBA 2NWSA 4JY8A 3O07A 2P10A 3MP3A 1OX4A 1GQNA 5HWMA 3QQ1A 5CSRA 2A2IA 2WQPA 2JGQA 1OX4B 3GB6A 4UR7A 4CQ8A 1E51A 1JULA 2LLEA 2E6AA 4LS1A 4AWUA 3SZ8A 1UCWA 3N14A 4LS0A 4KWVA 1AW1A 1ME9A 2A0NA 4NZJA 3PWAA 5TIMA 1WX0A 1LOQA 1QPNA 3KVMA 1DBTA 1XBZA 2DORA 1LBFA 3WJWA 1GVQA 4BWLC 1LROA 1ZHAA 3NO5A 3T7VA 4ADUA 3E96A 2OX1A 3CLMA 2Z6JA 1W3NA 2FPYA 4BI5A 2OCZA 4UTKA 2QUUA 4IPIA 5D2WA 1J4EA 1SFLA 1VLWA 4U4MA 4WX2A 2GJNA 4KWWA 1XUZA 4IGHA 2BTMA 4PC8A 5LNSA 1FX6A 3TFXA 3WJZA 2YYUA 1RR2A 3PBWA 2VXNA 3QRHA 4QSHA 4R53A 1R46A 2VFDA 4JTSA 3MYOA 1WYIA 2QCMA 1F76A 4X3ZA 4DBDA 4N9DA 1AMKA 1HUVA 3Q37A 3IVUA 3Q58A 2V30A 3G18A 3HB9A 3M5YA 4AF0A 2GVGA 4DO6A 4MKNA 1K8YA 3S5YA 1VS1A 2CZDA 1JUKA 4M7TA 5KMYA 2GVJA 3NPUA 2J6XA 1OJXA 3LI1A 2V2CA 1TQXA 2NLIA 5CKSA 4C1LA 1OFEA 3CEPA 3GX9A 4ZVJA 1W0MA 4M6VA 4S2CA 4E2BA 1L9WA 1YXDA 2DZUA 2Z6IA 3HF3A 1KFLA 3EXRA 3BG9A 1PV8A 1N8FA 4JX4A 4EF9A 4IMGA 3EWYA 5F4WA 2YPIA 3S1UA 4LU0A 1LOLA 3DKJA 3IIZA 1EP3A 3UXDA 1FXPA 4TO8A 3EX4A 4CNPA 3T55A 3LB0A 3BVJA 2Z1BA 3NQMA 2QCFA 4JY9A 4BFAA 3NQAA 5FEWA 1TCDA 3H55A 1FWRA 3NQ2A 4EOUA 3TCEA 3QW3A 1QMLA 4H3DA 1ZENA 3N9RA 4DEFA 2R94A 1F74A 3NA8A 2I1OA 3W86A 4NT0A 5DXYA 2X1TA 3P60A 3NPXA 4HSOA 1GZGA 1O94A 1KM2A 2FQIA 2ZFAA 1N55A 1C8VA 5F2IA 5D2TA 3L9CA 3W76A 5IBXC 1WOAA 4MPQA 2W0UA 5LNUA 3PUEA 4IXHA 3FYOA 1VRDA 2FDSA 2BLEA 3W7HA 3LCLA 1AG1O 3TSDA 3DI0A 4FIQA 4QITA 1GJPA 2VEIA 3W7KA 3BW3A 4AAJA 4GUJA 3WK0A 3BLIA 3EXSA 3MMTA 1KTBA 3NL6A 5L9FA 4N6EA 1TIMA 4JNMA 4LWWA 4GFSA 3LLFA 4IX0A 3LCFA 3WK3A 5LKYA 3ZS4A 4LRSA 2EGZA 4Z1BA 3DU0A 5HUPA 3LRMA 1RQEA 1W3IA 3MBDA 3BO9A 1SO5A 2DJXA 1K8ZA 2Q3OA 3IEBA 2HTMA 4O1CA 4UTJA 1I2OA 3C0JA 5D33A 3CWOX 1WXJA 2QUVA 5KZMA 4GXMA 1HO1A 1XDLA 3P82A 4XUGA 3QMRA 2B7QA 3EXTA 1O4UA 1Q6LA 5BMXA 5FF3A 3Q2DA 5EA9A 3LHWA 1WBHA 3MWAA 2CFFA 3I7SA 3OA3A 4Z0JA 4O53A 3VE9A 4MY8A 4K8HA 4O18A 2IQTA 2VELA 1B9BA 1X8FA 1F05A 4JS3A 4WJEA 4HHPA 5G2IA 4UTMA 3NQ8A 1G7UA 4TIMA 4PTNA 6TIMA 3A5VA 3S5OA 2Y61A 3W7PA 2ABAA 1KBIA 3I65A 1A50A 2QAFA 3U6WA 2FLIA 2WO5A 1LBLA 1NF0A 2Y7GA 3HGJA 2EF9A 1OF8A 4LT9A 3L68A 1VCFA 1TPVA 5D04C 4DF2A 2TRSA 1OFBA 2V82A 1FCQA 1TTJA 3G1HA 3G1DA 2HMCA 2ATSA 3C2FA 5I3HA 3WK1A 4K38A 3C52A 3IGXA 3G1FA 2FIQA 1FWNA 2C0AA 1G69A 4TMBA 1VHNA 3PAJA 5KZEA 3BPWA 3B0VC 3RLUA 3N2XA 3S0CA 4X2RA 3BK0A 4N2YA 3G1VA 3GVGA 3W88A 4LOCA 3UD6A 4JN6A 4U28A 4FX8A 1M7PA 1PIIA 4JIQA 4I9AA 4MLRA 4O19A 4UCGA 5EBUA 1O5XA 1GEQA 1ZCOA 4NQ1A 3A5FA 2ZZ7A 4PH6A 3NNTA 4NXKA 1W5NA 4EWND 2ZZ4A 4A2SA 5AOUA 3W71A 5CGQA 3FA5A 1PE1A 2TYSA 3R89A 1QPRA 1Q6RA 3W7QA 3PG9A 3CB8A 1FWWA 2WPBA 5C54A 2Y63A 3W1RA 2Y88A 3KXQA 5D02A 3HGOA 1K7EA 3BG3A 1Q45A 4RXFA 4UFIA 1OG0A 1TPDA 1K3UA 1SR9A 2QCDA 4P2VA 3F4WA 4OBTA 1FCVA 1IIHA 1PS9A 3W1NA 1QFEA 5KITA 5LSMA 2JGYA 2QCDB 3PY2A 2WSRA 5A8GA 4PA8A 3O6CA 5C5YA 4GJ1A 3UWVA 3V75A 2FB3A 4QQ3A 3CT7A 4XKYA 3LHYA 3B05A 3O6YX 3W7MA 1TPEA 5K9XA 3TXZA 4HSNA 3LI0A 3QSRA 5BMWA 1LRNA 5D2YA 4Q4KA 4PL1A 4JTJA 1OX5A 3DXIA 1TTIA 4NX5A 3G3DA 4YMZA 1TPH1 2C3ZA 1ME7A 3IGUA 1EP2A 3B8DA 1ONRA 3GDRA 2X16A 3QEZA 2GQAA 1BWKA 5DXXA 1SZGA 5G1TA 3BG5A 4ORMA 1W31A 3ZWTA 4WY0F 3BGJA 5CZTA 2BWGA 5GVJA 3RNDA 4O52A 4DELA 3W07A 3TSMA 1KTCA 1MZHA 4JTTA 2Y7FA 2X30A 2VFGA 3ABSA 4M7SA 5D30A 3UYCA 5AHNA 4NU7A 4RZ6A 1C9DA 3GAKA 1FDJA 3LTYA 3SIZA 2Z0IA 1GWJA 1UJPA 3TMQA 5KSWA 5F2GA 3LGEA 3BW4A 3FIGA 3TQKA 3HOJA 4A22A 3TJLA 1KFKA 1W37A 3QF0A 3W70A 2NXHA 1HTIA 4M6QA 3NG3A 4OHQA 3NQGA 1GPWA 2DZPA 1I2QA 5H91A 3CWNA 2H3BA 1S3HA 2CLMA 3P84A 4LRTA 3BLEA 4AHOA 1LCOA 1ICQA 1VYPX 3TDFA 1GTEA 2QJGA 3GR8A 3GZ3A 5D32A 5IBXA 2H8XA 3PVFA 1SW3A 1EX5A 1H7RA 3L5AA 4RXGA 5F4SA 5HQEA 3W22A 4ADTA 3NDOA 3O1NA 1RQBA 4MLJA 4YL2A 1KFCA 3MHUA 1AW2A 1M7OA 3M47A 1SO4A 4OU1A 2CZ5A 2WKJA 3L0GA 4UFJA 4W9TA 3ATZA 3SGZA 3KRSA 4O4WA 1KFJA 4FNQA 3C61A 3P81A 3PBYA 1K8XA 2YSWA 3IIXA 3YPIA 1YXYA 1XFBA 4MOZA 4HPXA 2QCGA 5F2MA 1XL9A 1LOSA 1CI1A 4Y9AA 3KX6A 3O16A 2V2DA 1V7YA 1QDSA 1KM3A 4K7VA 3F03K 4UTTC 5KINA 3ANYA 4LVGA 3TIMA 5FF0A 1ZFJA 3HGSA 4QNWA 2UV8G 2OT1A 3G1AA 2OJPA 3PSVA 2ZZ5A 3PUOA 2I14A 4I7WA 3A21A 2VEPA 1VJIA 1TV7A 2QR6A 4UXDA 3W7CA 3UNDA 3Q94A 4MY1A 3SJ3A 3UY7A 4O54A 1OK6A 2GQ9A 2NV1A 3MW7A 3R5EA 3MBFA 1DKWA 3T44A 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 4R33 A;  2DZW A;  2H8Z A;  4MJM A;  2E5B A;  1JCX A;  2D73 A;  3G8R A;  1X7F A;  1W54 A;  1K7X A;  2PUR A;  4RK8 A;  1OF6 A;  4MVA A;  3LCH A;  4TU1 A;  3LCG A;  5G4W A;  3V1P A;  1EUN A;  3MJY A;  3FEM A;  4ADS A;  3LCW A;  1YTK A;  1OFD A;  2YXG A;  3TU9 A;  2X2G A;  4JDB A;  4K6A A;  4NJK A;  3TML A;  3W1A A;  1QPO A;  3A24 A;  1G4S A;  1FDY A;  4RZ5 A;  3GND A;  3M7W A;  4YLW A;  2O7Q A;  4A29 A;  3MO7 A;  3W75 A;  3GAY A;  1B4K A;  1W3T A;  3L5L A;  3W7D A;  2PRL A;  4HPJ A;  3OHI A;  5F1V A;  3N19 B;  1W56 A;  1LZO A;  1VPX A;  3UWQ A;  3ZWS A;  4GRS A;  5DY3 A;  3QQ0 A;  3THQ A;  4JYD A;  4JYE A;  1FCU A;  3W1M A;  3W72 A;  4IWW A;  3W73 A;  3VI2 A;  4RX0 A;  5K7J A;  5EYW A;  5FF4 A;  3T78 A;  4TR9 A;  4O0K A;  1H7X A;  2E6Y A;  4MYX A;  3G1X A;  1H5Y A;  5G5I A;  2VOM A;  3BW2 A;  1W1Z A;  3M0Z A;  2NUY A;  3CPR A;  4O10 A;  3EWX A;  4MY9 A;  5I3K A;  5ABT A;  1MXS A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3TA6 A;  2Q8X A;  4AXK A;  2OLH A;  4O17 A;  2OGJ A;  3IIV A;  3TC6 A;  2HNE A;  4BJH A;  2ZQ0 A;  4AWE A;  2O9R A;  4P7R A;  3BC9 A;  4BI6 A;  3WH6 A;  4IP7 A;  3DBP A;  3L0N A;  4NX0 A;  4WKF A;  4YNG A;  2NLY A;  3OVQ A;  1S46 A;  3HQ1 A;  3TYA A;  1ZS2 A;  7ODC A;  3RM8 A;  4Q22 A;  3SFK A;  5E93 A;  5EMK A;  1RHC A;  1O5Q A;  1P4C A;  1T0O A;  4QS5 A;  3H7V A;  1YHT A;  3MC5 A;  1CTN A;  4UQE A;  3STC A;  4LF2 A;  4JL2 A;  3W2U A;  1EIX A;  1J0Z A;  1D3G A;  4H9M A;  3LRL A;  5HXM A;  1CGW A;  4GZJ A;  5REQ A;  1H50 A;  1NEY A;  1HO4 A;  3KS5 A;  4KFP A;  3AIB A;  2W63 A;  1OG6 A;  1XH0 A;  4H2C A;  4XK2 A;  3MMW A;  2ZXQ A;  1J01 A;  4KFN A;  1R9Y A;  4JIP A;  4JTK A;  1U33 A;  5DMN A;  4LS2 A;  4YHG A;  4W86 A;  3AAL A;  4W5U A;  1RY8 A;  4FXJ A;  4F40 A;  1B30 A;  1IXO A;  4CQ9 A;  4OKD A;  3BAK A;  3HN3 A;  3TTO A;  1EDT A;  2A6N A;  1EPV A;  4H41 A;  5TNV A;  1OFP A;  4JCL A;  2CXE A;  3DHP A;  3B04 A;  3AMK A;  1RY0 A;  6XIM A;  5KZD A;  3CIV A;  5CH9 A;  5A6K A;  4J7R A;  1YQ2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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