1OG0 | Genus

Total Genus 126

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	126
sequence length	352
structure length	344
Chain Sequence	GAEEDVRILGYDPLASPALLQVQIPATPTSLETAKRGRREAIDIITGKDDRVLVIVGPCSIHDLEAAQEYALRLKKLSDELKGDLSIIMRAYLWKGLINDPDVNNTFNINKGLQSARQLFVNLTNIGLPIGSEMLDTISPQYLADLVSFGAIGARTTESQLHRELASGLSFPVGFKNGTDGTLNVAVDACQAAAHSHHFMSVTKHGVAAITTTKGNEHCFVILRGGKKGTNYDAKSVAEAKAQLPAGSNGLMIDYSHGNSNKDFRNQPKVNDVVCEQIANGENAITGVMIESNINEGNQGIPAEGKAGLKYGVSITDACIGWETTEDVLRKLAAAVRQRREVNK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal Structure of the Mutant G226S of the Tyrosine-Regulated 3-Deoxy-D-Arabino-Heptulosonate -7-Phosphate Synthase from Saccharomyces Cerevisiae Complexed with Phenylalanine and Manganese rcsb
molecule keywords	Phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase, tyrosine-inhibi
molecule tags	Lyase
source organism	Saccharomyces cerevisiae
total genus	126
structure length	344
sequence length	352
chains with identical sequence	B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature	ec 2.5.1.54: 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase.
pdb deposition date	2003-04-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00793	DAHP_synth_1	DAHP synthetase I family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1og0A00

1KFCA 2NUWA 4AEOA 4RJEA 5F2LA 5BMWA 2C0AA 1GWJA 4O28A 4O50A 3U2OA 4BWLA 3R13A 4RK8A 3NQMA 3PBUA 3W76A 1WYIA 2OT0A 4Y6GA 4ZQMA 3WJWA 1XCFA 1XL9A 2FLIA 1YYAA 2VFGA 3G22A 2A6LA 1YLVA 2AAMA 3LLFA 1SW7A 4RR4A 5J5DA 4ZQCA 2YZRA 3DFQA 2ZZ6A 3P61A 2YYTA 1KLZA 1OK4A 5FF0A 4MJZA 1DVJA 1H51A 3W1RA 4PFMA 3HIJA 4O1AA 3ANYA 2GVJA 3G0SA 3M16A 4MFEA 2ZDRA 1KFKA 1X8FA 1X6UA 2JKAA 3EB2A 4GFSA 4UTMA 3R5EA 3TROA 3W73A 4Z08A 4X22A 1AW5A 4NNCA 2C13A 4XBKA 4TO8A 2Q8LA 4WY0F 5LNUA 4N6EA 4L4LA 3GLCA 3LB0A 3PUEA 4GE8A 3F4WA 5DCEA 5I3FA 4MY9A 3LHWA 2Y63A 3E96A 2Q8ZA 1N8FA 3UY8A 2XN2A 3M5XA 4MLRA 1H7XA 1OYBA 2RDWA 4I7WA 3L5MA 5HR7A 1GG0A 4NU7A 4QITA 2ALDA 4AXKA 2OCZA 3HO8A 5K9CA 2QR6A 5AB3A 3L5AA 1BKSA 3UPWA 1LLWA 2C15A 2E09A 2J9YA 3HGJA 4BFAA 1WBJA 3C56A 3STCA 3FOKA 4YLWA 4Y9AA 4JICA 2NX3A 3OA3A 4U4MA 1Z42A 5I3GA 2ISVA 3TUUA 4BWLC 5DXYA 3L21A 4IMEA 4OBTA 2A0NA 3OIXA 3NAVA 4IXXA 5AN7A 3GK0A 1O5XA 2FPTA 2ZCGA 4O52A 4IMCA 3TMLA 2BTMA 1RZMA 4CQ9A 2GUUA 4WQ6A 4ZQOA 3GDLA 5TQLA 2YPIA 4XTIA 2NV2A 2X1RA 1C8VA 1DQXA 3LI0A 3M1ZA 1GTHA 1YXDA 5LHEA 1EIXA 3DGRA 5U7SA 1YTEA 1CI1A 4AMAA 4JXCA 3PG8A 1OF8A 2ZA2A 3PB2A 4GUGA 3QPYA 3NPWA 1VLWA 3W1XA 4UTHA 1BTMA 1SZGA 1LM1A 2ZZ5A 3GR7A 5FF4A 1YXYA 4AWUA 1UJPA 1O5KA 3W7JA 1HFBA 4TX9A 1G4EA 4FNRA 3S42A 2WO5A 1FXPA 5D30A 2PRMA 1RV8A 4OE7A 1W0MA 3O07A 3GDTA 3NZ1A 2QUUA 4RLIA 4YCPA 3B0VC 2RDUA 2JBMA 2C19A 3QW3A 5E93A 1SW0A 5HWMA 2RHGA 3K30A 1EA0A 1Q6OA 2P0OA 2VC6A 3NQ6A 1NF7A 4UFIA 2H3BA 5K9XA 2ISWA 1IXPA 1OG0A 3STFA 1TPH1 1TPEA 3MO7A 4GBUA 2A7NA 2HS6A 2H90A 1YADA 4RCXA 3WJXA 2YYUA 4CCCA 3PBWA 3W6YA 1QPRA 3W7RA 3W9ZA 3N9SA 3G3MA 1LRTA 4UR7A 2HS8A 1EP1A 2VEPA 2ISSA 1YPFA 2B7NA 3LBMA 1TPFA 3FKKA 1KTNA 3KFTA 1DOSA 3QZEA 4QSHA 5DN1A 4NJKA 3S1UA 3M0ZA 5HR6A 1VZWA 4JTIA 1FUYA 4BI6A 3N34A 3EX1A 8TIMA 1OABA 3L0NA 3G3DA 3INPA 2W79A 4WOQA 4I7UA 1FCQA 5G1TA 3W7IA 3LCXA 5G1YA 5D2YA 5CZ0A 3HPSA 3BLIA 1TPUA 2CW6A 5K2ZA 4KWVA 2OJPA 4LVAA 1W54A 1X1OA 3S1WA 4JEQA 2C16A 1K7FA 1TTQA 4IXHA 2FJKA 4AHOA 3CIXA 1YDNA 3USBA 5D33A 5IBXA 5DELA 3S8HA 1JCJA 2G96A 2WSQA 4A21A 4X2RA 3S5YA 1K02A 1MXSA 1K7XA 5F4WA 1DJNA 5CZJA 2E68A 2EKCA 5J5RA 1UASA 4IMGA 1LOQA 2VEKA 2QF7A 1KM0A 4ZZ9A 1QPOA 3VFLA 5BNKA 1DQWA 5KZMA 3S9YA 4LS2A 3W85A 3TJXA 3NPXA 1A50A 3T40A 1BWLA 3GYEA 4YWIA 1FWSA 2PRHA 4MFDA 4HNNA 2PRLA 3KXQA 2NXGA 2FDSA 1JCYA 3PWAA 1LBFA 3TQ0A 1DORA 5FF3A 3W83A 1R30A 2QCLA 1OF6A 4Y96A 3LX9A 5FEWA 3W74A 4LT9A 3WK0A 2QCCA 5EMUA 4LVFA 3CM4A 3G18A 3O1NA 2V81A 1R46A 4HNUA 1T8XA 2NLIA 2CLEA 3H54A 4AB4A 1XBZA 1F74A 3IIVA 4UMBA 3TMQA 3WK2A 2LLEA 2FFCA 3IIPA 3UWYA 2E77A 4DF2A 5GVJA 1Q3NA 1K7EA 3W2JA 1R2TA 4W9TA 3BW3A 4XTDA 4JTJA 4FX8A 4UMCA 5G4EA 2H8XA 3M41A 5BRBA 1MSSA 1F2JA 5AC6A 3LTPA 1JJKA 2CZDA 4CNOA 4UIOA 1ZALA 3KX6A 1PCWA 4IX0A 2QCDA 1AW1A 4GUFA 3I68A 5BW6A 2D73A 1ZY9A 4FNPA 1PE1A 3LXBA 1FDJA 3QQ1A 4O54A 3N2XA 2CZFA 2CU0A 4ML9A 5IBXC 3H55A 3EKLA 5DCBA 5D2TA 3ABQA 1DHPA 1H7OA 1JULA 4H4IA 5D32A 5L9FA 4AWTA 1YTDA 3L66A 4HPJA 3CWOX 3VE7A 5LGXA 4O0KA 1S5TA 2BXVA 3MYPA 3NQFA 3NVTA 3MI6A 2E5BA 2ZRVA 1K8ZA 3W2UA 3UWQA 3KHJA 2VKZG 2WPBA 3TAOA 3MWAA 2A85A 4WXYA 1B9BA 1NF0A 4NNAA 3EX3A 5HULA 1W5OA 3WJZA 3O06A 3NXFA 3G0UA 1Z41A 4UTLA 3BG5A 3LHUA 3T55A 3P84A 3D0CA 3W70A 4FNUA 3NL3A 3TDFA 2CFFA 4PODA 1SZEA 1KM5A 3OVRA 1J2WA 4N9EA 2QDGA 3HG4A 5DCDA 3A9IA 2X1TA 4H3DA 2F84A 5I3IA 3TQKA 4DF0A 3IVTA 4NJIA 1TCDA 5LNWA 1OHLA 3R8RA 3L68A 4UUIA 3WJSA 2VENA 1KTCA 3M47A 1P4CA 1X7FA 3W2MA 1FY6A 4UFMA 3F03K 4IQLA 4TIMA 1OYCA 1C29A 2B0MA 3UXDA 3UWVA 3O16A 3QSRA 5CPOA 3PULA 4Z1AA 1IGSA 2YFNA 4UTKA 4GRSA 3CTLA 3EXSA 1Q6LA 2W0UA 2V82A 1UBSA 3EWYA 3W72A 3QMSA 3P5YA 2CLKA 2I1OA 3BO9A 4DPQA 3TXVA 2NUYA 3W7KA 3HOJA 3CLMA 2E6DA 2R94A 1W31A 2JK2A 3C2OA 2RDTA 1XUUA 3FA5A 2ZRWA 1TV7A 2BX7A 4RX0A 1IXQA 1VS1A 4M19A 3ZWTA 1THFD 3N19B 4ADSA 3O05A 3LBCA 4JDYA 3W1PA 3MI2A 4GXMA 3SR7A 3SSJA 3RK8A 3DZ1A 1WAUA 4A3UA 3N3MA 1DL3A 3QF0A 4O8RA 3AO0A 3QW4B 4O11A 1ICQA 4Y8FA 3W1MA 1VR6A 1VGAA 4HT3A 1SR9A 3UYCA 3BG9A 4IWWA 4GC4A 2VFIA 3PC0A 2J27A 1ZJIA 2YCEA 5AHFA 2VXNA 1MEIA 3STEA 4IUOA 5D2XA 3EWBX 1B4EA 3HPZA 1Q45A 2XN1A 2Y85A 2WSRA 4IJBA 2AGKA 1RQHA 1TTJA 4HSNA 3ABOA 2GJNA 3RLVA 2CLOA 4TMCA 3MHGA 2E6AA 2Z1BA 3TR2A 1QNVA 1H5YA 3P7YA 3LHZA 3ELFA 3NL5A 5AYZA 1ICSA 3PF3A 5D04C 1I2RA 3FJLA 3LV5A 4A2SA 3QJAA 1OX5A 3NM3A 4ORIA 3KAOA 5A8GA 3LERA 3E9AA 1TB3A 1TJRA 3P60A 3L67A 1BWKA 4KKXA 1PHWA 4K39A 5EA9A 5G2IA 4OT7A 3IIOA 3DU0A 5AC8A 3QH2A 1GT8A 1FWWA 4N4PA 1G4SA 1QO5A 2FB3A 3T78A 3W7PA 3L9CA 1WA3A 3NQGA 2RFGA 1PS9A 1U83A 1W37A 4C1KA 2BWGA 4XZ9A 3W88A 3NNTA 3NQ8A 2X1UA 5G4WA 4YCOA 2RH9A 1VYSX 3STGA 1VYPX 1SW3A 2DZTA 1CX9A 3B05A 1ZNNA 2AQWA 2Z2UA 3QC3A 4O10A 2RKXA 3R12A 4CQ8A 2CWNA 3FYOA 2YFOA 4EWND 1M7PA 3B06A 1CW2A 1WXJA 1R2SA 4E38A 5CPNA 4S2CA 4M5PA 4K7VA 5FEZA 2YW3A 1G4TA 4MPQA 3NQDA 2DZVA 1M7OA 2Y7DA 4HPXA 4DXVA 1C9DA 2XN0A 3DBPA 3WFAA 1ZENA 3W7DA 3DFSA 3IV3A 3C2VA 2VFDA 2JKEA 2V8ZA 1T0OA 4R53A 2UV8G 3VNDA 1GVFA 3O15A 1GPWA 3L0KA 2E6YA 5SWUA 4EVZA 3DKLA 3SZ8A 1NSJA 1MEWA 3M44A 1YDOA 4Z0SA 3EX4A 3LCFA 5LZLA 3O63A 3LTSA 2A5HA 5EKYA 4JTGA 3UWWA 4UFHA 1LOSA 2ZYFA 1XBXA 4O17A 1TTPA 1F7BA 2A1YA 1OFRA 4NQ1A 2A7RA 5AFDA 3NYZA 3MHFA 1LORA 2V2DA 3P8JA 4JYDA 1TRIA 3PSWA 1F76A 4N4QA 1NFBA 4Q32A 3UQNA 4K7YA 5KTLA 1XBYA 1N7KA 2C1HA 5FF2A 4TMBA 1RR2A 3BARA 4N6FA 1LDCA 3BPWA 5TIMA 4JS3A 5HNRA 2DJLA 3JR2A 2QDHA 3UNDA 4DBEA 4NXSA 4CQAA 1XDMA 3GZ3A 4H6KA 4IGHA 3C52A 4UR8A 1Y0EA 2DP3A 4OHQA 1BEUA 1FWNA 4RKAA 1P1XA 1ME8A 2ZFAA 2NV1A 4OU1A 2VEMA 4QIUA 3W07A 2B7QA 4CCDA 4FNQA 3SJ3A 4IMFA 3KVMA 1Q6RA 1TYGA 3GX9A 3OG3A 5IM51 5D2VA 3LV6A 4OV9A 5F4SA 3M7WA 1W56A 1RQBA 4MZ8A 5E1QA 4JYEA 1FWTA 3C2FA 5C54A 1HO1A 4K37A 1XXXA 3VI2A 3RU6A 3GIYA 3GNNA 4WOZA 1RPXA 4AHPA 1KM3A 3F4NA 4J9JA 4JX6A 3TAKA 1SSGA 4JYFA 3W22A 4NX0A 4GUIA 2HTMA 1OFAA 3VKJA 6ALDA 1GEQA 1WX0A 1SPQA 1P5BA 4NZJA 4XKYB 5K7JA 3KRUA 3GKFA 4IOTA 1SSDA 3IVUA 1LZOA 1KFJA 2VFHA 3CB8A 3RFAA 3PVFA 1AW2A 3B04A 5FI8A 3EWZA 5LKYA 1S3HA 1KFLA 5L6UA 1PCKA 4O19A 1VQTA 4LRTA 1ICPA 1KA9F 3BK0A 3PM6A 1GOXA 4O14A 1KTBA 3W75A 3E0IA 4FXRA 1ZFJA 4UFKA 3PAJA 4JY9A 2BLEA 5LNSA 2G5WA 4POCA 3NM1A 4X3ZA 1JQXA 2J6XA 5G5IA 3EX2A 1XKYA 3NPUA 1ME9A 2QCMA 3O6CA 3TNOA 1FCBA 3WK1A 3PS7A 1GJPA 4IPJA 1WOAA 3BW4A 3MUXA 3W7GA 4MJMA 4WX2A 1SZNA 4FX6M 5K3VA 2CLLA 3B03A 3G8EA 4M6VA 1W3NA 3W87A 3NA8A 1E51A 4HNVA 1W5NA 3W3OA 3DFNA 4MY1A 5E0KA 2WNNA 3N14A 4MYXA 4Z1BA 1QFEA 2Y88A 4MVAA 5CPLA 1KLYA 2WNQA 5G2WA 3VCRA 4D2JA 1YXCA 2X30A 4NJJA 5CSSA 3SECA 4UTUA 4ALDA 3A24A 2EAWA 1YPIA 1KV8A 4WJEA 3RLUA 4ZQRA 4FIQA 1SQ7A 4FNSA 4CLMA 3G1YA 1H1ZA 1AL8A 2W6RA 3W7MA 1KFBA 1W1ZA 3JRKA 3S5ZA 2DZSA 1IF2A 3AJXA 4DQWA 3E49A 1TV5A 4O53A 3U6WA 1KM6A 1LBMA 4AWSA 3EKZA 1I2PA 1D3GA 5AYXA 1TPVA 3S5OA 4HKPA 3ZR4A 5HUPA 1EPXA 4K36A 2WQPA 4IMDA 3KOFA 1YDVA 4Q33A 3GKAA 1GYNA 1AG1O 2F7FA 4LC8A 3DAQA 2NXIA 2P1FA 1OX4B 1D3HA 1SO5A 2YDAA 4K8HA 5AYYA 1FCVA 3CIWA 3L0GA 1UUMA 4JGDA 4UTIA 3JS3A 3TC7A 1VHCA 1M6JA 1ONRA 4XQ6A 5DBTA 5K4XA 2FQIA 1QOQA 1O60A 4JTEA 1QR7A 4LUJA 2JGYA 2YGYA 3NEVA 2ZZ7A 3RMJA 2GQAA 2B4GA 3B0UX 2A21A 2FTPA 1VRDA 1ADOA 4C1LA 3QYQA 3GDRA 1JCLA 3HG3A 1D9EA 1H63A 1MZHA 2TPSA 1WDWA 4N2YA 1PHQA 4QNWA 1FX6A 3W7QA 1OFOA 3G8RA 1ZAIA 3TFCA 4QJ1A 1LROA 3FKRA 3CEUA 5I3KA 3O8AA 5CSRA 3DHDA 2ZZ1A 3CU2A 3DI1A 3I6RA 3SY5A 3UY7A 3EXTA 1GVQA 3NGJA 2QJHA 3HG5A 1LOLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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