1OHLA

Yeast 5-aminolaevulinic acid dehydratase putative cyclic reaction intermediate complex
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
340
structure length
340
Chain Sequence
MHTAEFLETEPTEISSVLAGGYNHPLLRQWQSERQLTKNMLIFPLFISDNPDDFTEIDSLPNINRIGVNRLKDYLKPLVAKGLRSVILFGVPLIPGTKDPVGTAADDPAGPVIQGIKFIREYFPELYIICDVCLCEYTSHGHCGVLYDDGTINRERSVSRLAAVAVNYAKAGAHCVAPSDMIDGRIRDIKRGLINANLAHKTFVLSYAAKFSGNLYGPFRDAACSAPSNGDRKCYQLPPAGRGLARRALERDMSEGADGIIVKPSTFYLDIMRDASEICKDLPICAYHVSGEYAMLHAAAEKGVVDLKTIAFESHQGFLRAGARLIITYLAPEFLDWLDE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title X-Ray Structure of a Putative Reaction Intermediateof 5-Aminolaevulinic Acid Dehydratase
pubmed doi rcsb
molecule keywords DELTA-AMINOLEVULINIC ACID DEHYDRATASE
total genus 123
structure length 340
sequence length 340
ec nomenclature ec 4.2.1.24: Porphobilinogen synthase.
pdb deposition date 2003-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00490 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1ohlA00
3KFTA 3C3NA 1U5JA 1KM3A 3QMRA 2V82A 4KFPA 3W75A 4GUGA 1H7NA 1LRQA 1G4EA 3QSRA 1JRBA 1MZHA 1TPVA 4BI5A 3EX3A 2FFCA 3EXSA 3KVMA 1RPXA 1TV8A 3N9SA 5HINA 3W87A 3GDTA 5E1QA 2FJKA 3M5YA 2NWSA 2WPBA 1ZY9A 3HBLA 2E6DA 5D09A 2Y6ZA 3LM7A 3W7IA 1M7PA 1EP2A 3NO5A 3LX9A 1F6PA 3CM4A 2QEZA 1NSJA 2QDGA 3I65A 4FB7A 5FEWA 2J9YA 2QAPA 2ZRWA 5DBTA 2CLHA 3BLIA 3RF9A 3P62A 1H7OA 2B0MA 2YCEA 2VFEA 1TTJA 1WBJA 1Q3NA 1TPUA 3A21A 4K36A 4L4MA 2E5BA 1OK4A 3NQ7A 3G0XA 3MW7A 4FX6M 5HMSA 4LNYA 4XBKA 2OCZA 4Z1AA 3DFPA 4JY9A 5DXXA 3NPUA 3LGEA 1QCWA 1JUBA 5AYZA 5K9DA 5J5DA 4Z0JA 3LDVA 3I68A 3HF3A 2AQWA 1K8YA 4WY0B 2QCGA 5I3FA 1L2UA 2NUXA 1K02A 1GVRA 1YDVA 4K38A 3WFAA 2QCNA 1DVJA 5F4WA 4ZQOA 4A3UA 4B5NA 2DZSA 3MI6A 3OVRA 1GYNA 3NQ6A 2PURA 2X1UA 2XN0A 4IPJA 4JX4A 4QQ3A 2ZDRA 4ADTA 2BSLA 3G1DA 4JTFA 3SY5A 1B57A 4MZ1A 3W2JA 3QW3A 4O1CA 3TA6A 3W76A 5E93A 1F74A 4JTUA 3ZS4A 5AFDA 2YSWA 1B4KA 3GIYA 1GYLA 2V0TA 4AH7A 3BG9A 4M6VA 2BXVA 3TH6A 1K03A 5HWNA 3S1WA 2A7RA 3W84A 3BGJA 4NNCA 4NQ1A 4JIPA 5LNRA 1HUVA 4UTMA 4NXKA 1VRDA 3PB0A 1JCYA 3DHDA 1W8SA 4FNUA 1VYPX 4AVFA 4WX2A 3MI3A 2EHHA 2ZRVA 3KOFA 1B3OA 5D04C 1VHNA 3THQA 3C61A 3P80A 1T8XA 3LXCA 1NF7A 1OX5A 1LBMA 3OVQA 3BGGA 1KTCA 3LTSA 1SW7A 4YCOA 3F1QA 3DFNA 5CKSA 5I3GA 1GVFA 5HR7A 1YTKA 3S5YA 3GR7A 3HG5A 1HL2A 1KTNA 1YTDA 1LROA 3HIJA 3QFEA 4WQ6A 1Z44A 3PAJA 3MYOA 4O19A 5D2WA 4WOZA 1VYRA 4NNBA 1K3UA 2QJHA 1Z41A 1F7BA 3DKLA 5HUPA 3UZ5A 3E96A 3PBUA 2ZRYA 3CIWA 5KSWA 1BWKA 1AL7A 3TFCA 3EXTA 1Q45A 3LHWA 2O7SA 1SO3A 3SSJA 3P81A 1SQ7A 2X30A 2NX1A 5LGZA 5K2ZA 1WAUA 2Q3RA 1JCXA 3IVTA 4Y8FA 3P5ZA 1X1OA 1H7PA 3TC6A 1DJQA 3EX1A 2YFNA 1J5TA 3ATYA 3NZ1A 4E0CA 2ZZ7A 5F2GA 4J9JA 3JS3A 1X8FA 4UUIA 1W5OA 3BPWA 1ZFJA 4MLJA 3GDLA 5T26A 4S2CA 3VE7A 3PUEA 3CQ0A 1RQBA 3PVFA 3O16A 4JDYA 4M7TA 4O52A 3WJSA 3MHUA 3UWYA 3UWQA 5HQEA 2C6QA 2ZZ5A 3GDRA 2VEPA 4PL1A 3M0ZA 3W7KA 4I7WA 4FNQA 2W6RA 2BLEA 5D2XA 4NJIA 3BO9A 3W1TA 4QNEA 4O1BA 4N9CA 4FX8A 3GKAA 4Z1BA 1XDLA 3C2RA 2E6AA 4E2BA 1YPIA 3ZWTA 5FEXA 4DPPA 3QQ1A 1MEIA 1JRCA 4QJ1A 4IWWA 3I7SA 2DP3A 3ANYA 3MMTA 1WOBA 3HGSA 1TIMA 3IGXA 3P74A 3C2FA 5K9XA 1PHWA 1XFBA 2NXHA 2ZTKA 4UMBA 1GOXA 4Q32A 4EWND 3PSWA 4RXGA 2HMCA 5E0KA 4DEFA 3C8FA 1KM5A 2H8ZA 1H1ZA 2PRLA 5I3HA 3O63A 4UMAA 2Y89A 3PS7A 3HQ1A 1YYAA 5TIMA 3UWUA 2HSAA 4JDBA 4DF2A 3N2MA 3LHTA 1JJKA 1ZNNA 3SW6A 1GEQA 3BG5A 2Y7GA 5KZEA 3S42A 2JKEA 3S5ZA 5F1UA 5DCDA 3W22A 1TSIA 3E12A 1EP1A 3LXBA 2WV8A 3U2OA 2HS6A 4I7UA 3FIGA 4N9DA 2JGQA 1XCFA 3LV5A 4A2SA 2A85A 4JICA 3TCEA 3IIPA 3KAOA 4HNNA 3BV4A 4S2BA 4D2JA 1VS1A 3GXPA 3H54A 4MVAA 2VFGA 3N73A 1J2WA 1QO5A 4GXMA 5DY3A 4FNTA 4GC4A 2E77A 4WXYA 3TXVA 4N2YA 3GDKA 1HG3A 5C2XA 2YYTA 3R5EA 3C4UA 3N34A 3K30A 3B0VC 1H1YA 3W9ZA 4LTSA 2DU2A 5DY2A 5EPDA 3R12A 4LU0A 3GNDA 1O5KA 4GUFA 4IMGA 4BK9A 1XUZA 4QSHA 1TPC1 1QNVA 4DF0A 3DZ1A 1DQXA 5DCBA 3Q37A 3G18A 3PUDA 1GT8A 3L0GA 2ZA1A 5DN1A 1H62A 3QC3A 1XC4A 1T0OA 1D3HA 1FXPA 3NR0A 1JULA 5K7JA 4UTTA 4FNPA 3TE9A 3WK2A 3OVPA 4QM1A 5K4ZA 1KBIA 3S1VA 2H6RA 4JR5A 1TTIA 4JTGA 2KZHA 2QCMA 2Z1BA 3O6CA 1SZNA 3LLFA 4FO4A 3T40A 1W54A 4OWGA 4IUOA 3BARA 4M6QA 1KM0A 4C1KA 4O4WA 1CW2A 3LTPA 4R33A 4GNJA 4MYXA 1Q6QA 1SFJA 1TPDA 4XZ9A 1SO4A 2C14A 2ISSA 2RDTA 3LI0A 4HN4A 3OG3A 1O4UA 3SZ8A 1OFPA 2ZBTA 3LCHA 2E09A 3L5AA 3TSMA 4AHOA 5FESA 1S5TA 2G5WA 3T44A 2E5CA 2GOUA 3BLEA 5LHFA 3IVUA 2VFDA 4YLWA 2H8XA 3WJXA 1FDYA 4IOTA 3P8IA 4ORMA 2X16A 4MPQA 5DBUA 2I1OA 4LV9A 1T96A 1UB3A 1FX6A 5BMWA 1H7RA 3W2UA 1OYCA 5C5YA 4Y96A 1X6UA 3M16A 2B7PA 4FXSA 1SO5A 1XKYA 4DBEA 3N2XA 5AHIA 2RKXA 1FCUA 3W72A 4HNTA 3ABQA 4O12A 5KMYA 3TX9A 4MFDA 5LNWA 2Y62A 3C6CA 1RZMA 3BK0A 3VCRA 4XBSA 1MEHA 1QO2A 2ZRZA 4UFHA 2QUVA 3FYPA 4MZYA 4AHPA 4HNUA 1F05A 3L65A 3TJLA 1O60A 1Q6LA 2QCCA 1VLIA 3KRZA 1WYIA 2AAMA 1BWLA 3H55A 1GTHA 3L21A 5FEZA 1TV7A 2FPYA 5DCEA 2FB2A 3S5OA 3UWVA 4KKXA 3CLMA 1M5WA 4NUWA 4UNKA 4Y90A 4EF8A 4O4VA 4MOZA 2QUTA 1YDOA 3NZRA 3LRKA 3UD6A 3S8HA 3O1NA 1PS9A 3W70A 2J24A 3RU6A 1YTEA 5G2IA 1PCWA 1ZAJA 3C2OA 3I6RA 3W23A 1EA0A 1W5MA 4CQAA 3WJZA 1TCDA 1S5VA 1QR7A 3OIXA 2YGYA 3G1YA 2G97A 3G24A 3JRKA 5BRBA 3ABRA 4R53A 3EWUA 4LVAA 5TQLA 4LY8A 3UWZA 4H4IA 3A22A 1SSGA 4HKPA 1H7WA 2JKPA 2BX7A 3R2GA 2GPTA 3DKJA 4FF7A 4LVGA 1YXDA 3LCIA 2A5HA 3MP4A 4CCDA 3QM3A 4NJKA 1YADA 1TQXA 2ZZ4A 3E0IA 2Z6JA 2AGKA 3CU2A 1S3HA 2JBMA 4G1KA 4MYAA 3NL3A 1XL9A 1LORA 3LXAA 2RFGA 3KHJA 2JKAA 2OT0A 2J27A 3M9YA 4RV8A 4WD0A 3AO0A 2X1SA 1Z42A 2A21A 4MKNA 1JR1A 4Z1DA 4BF9A 1MSSA 4HIBA 3S6DA 4ZMGA 3M47A 1VCFA 4Q33A 5HWJA 3IVSA 1E51A 3UY8A 1NAL1 4UTJA 4KWVA 2VELA 1GVQA 3NGJA 4E2DA 2C15A 2EKCA 3TJXA 4OV9A 3SJ3A 4RZ4A 4OV4A 4UTLA 2DZXA 2C18A 4W9TA 4JYFA 2C0AA 2J88A 4NZFA 5A8GA 3LCXA 1XBZA 3STCA 4BR1A 5F4XA 3QH2A 3RLUA 3Q58A 4JYDA 3MYPA 3FEMA 3LLDA 1KFKA 4BI6A 2V5BA 4UCGA 5EMUA 3B05A 5D32A 1F2JA 4N6EA 4ZQCA 2ABBA 4LUJA 2QCEA 3SR7A 1OF6A 1JVNA 1HFBA 3ATZA 2QJIA 2CLFA 4MFEA 4RX0A 3RFAA 3QRHA 1LCOA 3RMJA 2X1TA 3WJWA 1ONRA 4UFKA 4RK8A 4WZHA 1VHCA 4EOUA 3NPXA 2H90A 2FLIA 5I3IA 2FTPA 4DO5A 3DH7A 1IF2A 3W1AA 1RVGA 3IGSA 1YLVA 3W7LA 3G1VA 4IMFA 3SFKA 3TMLA 4NJJA 4AB4A 2Y63A 2QKFA 3W7MA 3W7DA 1K7EA 3BLFA 1MEWA 1PV8A 2NV1A 3TUUA 3SECA 5LNUA 4WY0A 1QMLA 2ATSA 4NJHA 1BKSA 2A7PA 1UASA 4QNWA 1SR9A 3P61A 5EY5A 3ELFA 4K39A 3TSDA 2R8WA 2EF9A 1H5YA 3MUXA 4RXFA 1DORA 3O6YX 2FIQA 4JEQA 1L6SA 3NQVA 4ALDA 3M44A 1R30A 3PY2A 3G0SA 3TQVA 1W3TA 3SIZA 2EPHA 4NVTA 3RNDA 1YDNA 2Q3OA 5AHNA 1G4TA 1SZGA 1KA9F 4UFMA 4TR9A 5AOUA 3W2MA 5HULA 5H2ZA 1DKWA 3W7JA 2NWRA 3NL2A 5F2MA 3IGUA 3B03A 3W7CA 5CGQA 2PRHA 3L0NA 4YMZA 3NQ2A 4DBDA 1V5XA 1OHLA 1EB3A 1ZHAA 3NQCA 2CWNA 2GVLA 1KTBA 1LRTA 1O94A 4ICNA 5CG7A 1P1XA 1EEPA 5IBXC 2PCQA 3USBA 1SPQA 2QCHA 4JTIA 4LS1A 4O14A 2FQIA 2C3ZA 3LERA 3NVTA 3MI2A 2WJZA 4GRSA 3LCGA 4ADUA 4KWWA 1IXPA 2PC4A 4FNSA 4TMCA 4JY8A 3LCFA 1ICQA 5EA9A 3QPZA 4PL2A 4JX6A 4K37A 3TR2A 1W5NA 2ZFAA 2CZ5A 3FYOA 2WSRA 3SGZA 5D33A 3VFLA 3GDMA 3W7OA 3W1UA 3G1XA 2Y7EA 2GVGA 5HJLA 5C6MA 1JUKA 5AC6A 2C1HA 3OEXA 3KXQA 3HOJA 2NUYA 1LLWA 5CPNA 3ABSA 1N8FA 1A5BA 5KZDA 1I45A 3FA5A 5LKYA 1FY6A 1GVSA 3QMSA 4O18A 1KV5A 3B0UX 4O15A 3SI9A 2VFHA 3O15A 3VE9A 2C16A 5G2HA 3P82A 1DHPA 2E6YA 3P7YA 3W1RA 1FDZA 2CW6A 2DZUA 1LRNA 1LBFA 4WY0F 5G4WA 2V9DA 4UXDA 3S1XA 1DL3A 1SFLA 2Y70A 3FKKA 1G69A 2WO5A 1G7UA 3TQKA 1OFBA 4IXHA 2ZRUA 4I9AA 1THFD 4Z1CA 1NVMA 4MZ8A 4CNPA 5U7SA 1A50A 4Y9AA 4JYEA 1C29A 1QWGA 1P0NA 1FCQA 1WDWA 4O28A 2R94A 3U8GA 2XN2A 1S5WA 2ZZ6A 3W73A 4TX9A 1A5CA 1EX5A 5CSRA 5LSMA 1K7FA 3EKLA 1FBAA 3HG2A 4FHAA 1RV8A 4UMCA 3W1MA 2PE4A 2DJLA 1I2NA 3L0KA 3LTYA 1UUMA 3CTLA 3W88A 1VGAA 1KFCA 2ALDA 3LV6A 1R47A 3MJYA 4AEOA 3SGUA 3E02A 1ICSA 1EWEA 3P67A 3PSVA 3LCWA 5EKYA 1OFDA 2JGYA 2XN1A 2I9EA 3TSBA 3C2EA 3FJLA 5I3JA 4OQVA 2V81A 3CT7A 2CZDA 1F73A 4MIMA 3CEUA 1NFBA 3C56A 5KINA 5D2YA 4GJ1A 3T7VA 3W85A 3B4UA 1J4EA 2CLIA 3IEBA 3NL5A 2DORA 2VFFA 3C0JA 3QF0A 5ABTA 3FOKA 3DI1A 2WSYA 1XUUA 5HWMA 3T4CA 5CZSA 1QDSA 4MJZA 4O1DA 3W7GA 3TW6A 4OT7A 5C55A 4UFLA 4IJBA 4K6AA 4M7SA 3GXNA 4FNRA 2CLKA 1SUXA 1TV5A 5FF4A 3HJZA 1QAPA 4NXSA 1VLWA 4DF1A 2A7NA 4LC8A 5G1YA 2V5LA 3L5LA 4JX5A 3UXAA 1OF8A 1EPXA 1O95A 4HT3A 4ORIA 5AN7A 1RR2A 3GX9A 1GTEA 4ADSA 3NEVA 1LLZA 2ZA2A 5D38A 5HUOA 4X22A 4LS0A 4UC5A 4TU1A 4IMDA 3UY7A 4MJMA 4O8RA 3FFSA 1TJRA 3C52A 4BWLA 4GUIA 5FF7A 3YPIA 5AB3A 1K7XA 3L67A 1PHQA 3PBWA 5EL1A 4UR7A 4CCCA 5KZMA 5AYXA 3GB6A 1ZJIA 3Q94A 1TTPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3LRM A;  1XBV A;  4UNL A;  1OX4 B;  3UQN A;  3L9C A;  3NNT A;  4N4P A;  1U83 A;  3MBF A;  3W1X A;  5AC7 A;  4JTJ A;  4LS2 A;  4DEL A;  3PR2 A;  2I14 A;  2VOM A;  1DQW A;  5CZJ A;  1TJP A;  1VQT A;  1DV7 A;  3GYE A;  3M5X A;  3IIO A;  5BOO A;  5IM5 1;  3TAK A;  4O57 A;  3QPY A;  1X7F A;  4AWU A;  2H3D A;  4UTW C;  1G4S A;  1I2O A;  3A9I A;  1OX4 A;  3S9Y A;  4POC A;  1GG1 A;  3A24 A;  2YZR A;  3IIZ A;  1OJX A;  3P60 A;  4BFA A;  1KFJ A;  3M41 A;  2DZP A;  3W7E A;  3V1P A;  3N9R A;  3W74 A;  5K3V A;  3R8R A;  5AHE A;  1AW5 A;  3G1F A;  4X2R A;  4U4M A;  2E1D A;  3UPW A;  2YYU A;  1FCV A;  3LI1 A;  1OX6 A;  4E38 A;  1TPE A;  5J5R A;  3HO8 A;  1UBS A;  1KM2 A;  2NUW A;  3HB9 A;  3W86 A;  1C8V A;  1ME9 A;  3PM6 A;  3W71 A;  1P5B A;  3I7R A;  3B04 A;  2ZZ2 A;  3NQE A;  3MWA A;  2DZW A;  1AG1 O;  5CPO A;  1YXC A;  5CSS A;  5CZT A;  3MHF A;  5A5W A;  1AK5 A;  1QFE A;  3EKZ A;  5TBO A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3C3N A;  3KL3 A;  3QMR A;  4PMQ A;  1PKM A;  4GUG A;  1V0N A;  3EX3 A;  4QJ3 B;  1RPX A;  4ERG A;  3U0H A;  4E3V A;  2W63 A;  3W87 A;  4KMQ A;  3VX0 A;  1F9C A;  3EYP A;  2NWS A;  3QHM A;  4JKL A;  2HBX A;  4PUN A;  3IUH A;  1ZY9 A;  4AC1 X;  3H2A A;  2E6D A;  2Y6Z A;  4NIL A;  3AJ7 A;  1F3X A;  3NO5 A;  4RV3 A;  4GCA A;  2OEJ A;  3OQE A;  2CLH A;  1E1E A;  2YCE A;  1C8Q A;  1TTJ A;  5T91 A;  1TPU A;  4K36 A;  3EOU A;  2OZT A;  2X41 A;  5HMF A;  3OB8 A;  5A6B D;  3NQ7 A;  3PFM A;  4S3D A;  5HMS A;  3FST A;  5ABF B;  3NPU A;  3LGE A;  2IMR A;  3LDV A;  4J2P A;  2BOD X;  4HP5 A;  1GVR A;  1BXB A;  1EBH A;  3S9Z A;  3WFA A;  2VC5 A;  4ZBC A;  1E70 M;  3R7M A;  1JFH A;  2PUR A;  3BAI A;  4IPJ A;  5ABF A;  3CXO A;  1ZS2 A;  3A13 A;  3BE7 A;  3SY5 A;  3NOY A;  1B0I A;  2QQ6 A;  2ASH A;  4A6G A;  4O1C A;  5E93 A;  4GAC A;  4JTU A;  5AFD A;  1B4K A;  2V0T A;  4AH7 A;  3BG9 A;  4M6V A;  4RZB A;  3TH6 A;  4FLR A;  1K03 A;  2IPG A;  2ICS A;  5HWN A;  4Q4O A;  3A47 A;  4H7V A;  4JIP A;  5LNR A;  3AWO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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