1OHLA

Yeast 5-aminolaevulinic acid dehydratase putative cyclic reaction intermediate complex
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
340
structure length
340
Chain Sequence
MHTAEFLETEPTEISSVLAGGYNHPLLRQWQSERQLTKNMLIFPLFISDNPDDFTEIDSLPNINRIGVNRLKDYLKPLVAKGLRSVILFGVPLIPGTKDPVGTAADDPAGPVIQGIKFIREYFPELYIICDVCLCEYTSHGHCGVLYDDGTINRERSVSRLAAVAVNYAKAGAHCVAPSDMIDGRIRDIKRGLINANLAHKTFVLSYAAKFSGNLYGPFRDAACSAPSNGDRKCYQLPPAGRGLARRALERDMSEGADGIIVKPSTFYLDIMRDASEICKDLPICAYHVSGEYAMLHAAAEKGVVDLKTIAFESHQGFLRAGARLIITYLAPEFLDWLDE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-Ray Structure of a Putative Reaction Intermediateof 5-Aminolaevulinic Acid Dehydratase
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule keywords DELTA-AMINOLEVULINIC ACID DEHYDRATASE
total genus 123
structure length 340
sequence length 340
ec nomenclature ec 4.2.1.24: Porphobilinogen synthase.
pdb deposition date 2003-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00490 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1ohlA00
1RVGA 3OEXA 1UJPA 2QCDA 1EP2A 3EB2A 3L9CA 4GNJA 3KXQA 3MBDA 2C16A 2X16A 4FEZA 2J9YA 4E38A 2J27A 4YLWA 4JTTA 1KM1A 3MYOA 3S9YA 3NL5A 3O06A 1C9DA 2Y61A 3P60A 4IX2A 1FCVA 4AB4A 2VKZG 5FF7A 3E12A 4QNEA 4XWUA 1TPWA 1MO0A 1OX4A 2PCQA 5HUOA 2C0AA 4LT9A 2QJGA 1OFEA 7TIMA 4PL1A 2CLEA 2DORA 3LLFA 5ABTA 3G1VA 2G97A 2YPIA 2DZWA 3SIZA 4IPIA 4UTLA 2NZLA 1OYCA 3P62A 1ICPA 3G0UA 4M6VA 1TPUA 2QCDB 4IUOA 3BG3A 1IXNA 4BI7A 1H62A 1UUOA 4XBSA 5KITA 4O13A 3HB9A 4MLJA 1FXPA 2CWNA 3SR7A 1UUMA 4A3UA 4JTEA 4Y90A 4O4WA 3LDVA 3M16A 4JYEA 3FJLA 3VNDA 3NQ7A 4FNPA 1RZMA 2HS6A 3S6DA 2XN1A 2V2CA 5FESA 2E68A 2QDGA 2CLKA 2DP3A 5AHNA 1YLVA 2RDUA 2YX0A 4JYFA 4UR7A 5DCBA 3EWBX 3QMSA 3N2XA 1GVFA 4AH7A 2B7QA 1IIHA 2WSYA 4LRTA 2ZBTA 1C8VA 4KKXA 5KINA 2I1OA 2QJHA 5AN7A 2VFFA 5FI8A 2BX7A 4BR1A 4AXKA 1HUVA 4UNKA 5CSRA 1QOQA 1AW2A 1Z44A 2FLIA 1XUZA 3DKJA 3A21A 1W5NA 2WSRA 1OJXA 2QAPA 1A5BA 3FOKA 3STEA 3UWUA 3DHFA 4OV9A 1A5CA 4XQ6A 4EVZA 3DGRA 2P1FA 1EP1A 3GDKA 1RQHA 3KOFA 4E2DA 3PULA 1DHPA 5CSSA 5D05A 2GVGA 1YPIA 3HPXA 1FDJA 2JKAA 3SJ3A 3TH6A 2E6FA 3PBWA 4IMDA 3HG4A 1U83A 4LV4A 3LHWA 5D02A 4N9CA 1KW1A 2G96A 4RZ4A 3B0VC 1T8XA 1QFEA 3L5LA 4LU0A 3QM3A 4MLRA 3NVTA 1A50A 3QC3A 4UIOA 1OF6A 3LCIA 2XN2A 1XFBA 4OV4A 3PF3A 1F76A 2VEPA 3QH2A 4MJMA 3DKLA 3G24A 2A4AA 1H5YA 2W0UA 3RMJA 3ABQA 1V5XA 3O05A 3TDFA 3WK3A 2ZFAA 1YDVA 3PWAA 5HULA 3OVQA 2V82A 1OX6A 2CZFA 4O28A 3SSJA 3LI1A 3ATZA 4FIQA 1TTPA 4JICA 2G95A 2QUTA 4RXFA 1L6SA 1I8JA 3NQ2A 3HPZA 4DQWA 5AC8A 1VHNA 3W7NA 3O6YX 4QISA 1DV7A 3TSMA 3UPBA 1QWGA 4UR8A 1JUEA 1EP3A 2Y85A 3W75A 3W87A 4N4PA 3TR2A 1YXDA 1CI1A 3UXAA 2QCEA 3ABRA 3T55A 1NF7A 4FIRA 3CPRA 3TU9A 1BWKA 5CPNA 4QM1A 3MP3A 4JTHA 3V75A 4HN4A 1S3HA 1LZOA 5F2LA 2Y89A 2QUUA 5CGQA 3PBYA 1XC4A 3TC7A 1LLZA 4FNRA 4I7WA 4JD4A 4Z0JA 1T0OA 2PE4A 4O15A 3QQ1A 2QCFA 4LTSA 1WAUA 4UMCA 1QPNA 5C54A 1F73A 3B8DA 4EF8A 5G2IA 1VRDA 3W85A 3P8IA 3DENA 2P10A 3S1VA 3GKFA 5AB3A 1QNVA 2HS8A 4HPXA 3LCXA 5DBTA 4CNOA 4YXGA 4W9TA 2H8XA 3W1RA 4DO6A 3U8GA 4WY0A 3QSTA 2YYUA 3IVTA 3P5YA 3R13A 3D0CA 3GKAA 3UPWA 3A23A 3MW7A 2FPVA 4L4MA 4LS2A 1B3OA 5F1VA 4K7YA 3NQ6A 1H7NA 3P67A 5AHFA 1QDSA 1GVOA 3M47A 1DBTA 4HSNA 4K7VA 4K38A 1O5KA 3PSVA 2VEKA 2QR6A 1GYNA 1KM4A 8TIMA 1FCQA 4UTHA 2Q8LA 3IRDA 1P1XA 2FPYA 4FNSA 2QF7A 5DCDA 3DFTA 4IQLA 5EMUA 1VJIA 3LTPA 4A29A 5L6UA 1DQWA 3FKRA 4WY0B 5G1YA 5F2GA 3OA3A 3R8RA 2WQPA 1GG0A 4HSOA 3H54A 1DQXA 1EUAA 2E5BA 5I3GA 5DELA 1KM3A 2BZNA 5G2WA 4DBEA 1PVNA 5CZSA 1Y0EA 1VHCA 1H1ZA 4QIUA 1RPXA 2TPSA 4ZL1A 1XBXA 1W8SA 4IWWA 2QCNA 2Z0IA 4GUFA 5LNUA 1TRDA 1SSGA 4Q33A 3EWUA 2JBMA 1F05A 2QUVA 3I7RA 3ZWTA 2ISWA 3WJSA 1YDNA 2E6DA 4MY1A 5BOOA 3TMQA 4Z1AA 2ZCGA 4QQ3A 3BO9A 1W1ZA 1OFQA 3V1PA 1H60A 1FWWA 3GDRA 3W7DA 2C13A 3E02A 2V5LA 4MYAA 1KFKA 4IJBA 1JRCA 2TRSA 5A5WA 1XL9A 5J5DA 3G1DA 3UZ5A 2CZDA 4UMAA 2RH9A 1OFDA 3HG2A 3S1XA 1FWNA 2WV8A 4IXXA 1JCYA 1PIIA 2YFOA 3O8AA 1GEQA 3ANYA 4ALDA 3DFNA 3PB2A 4MPQA 5G5IA 5A8GA 1OABA 1L6YA 1QR7A 3UXDA 4WX2A 4ORMA 3STGA 1W56A 4UFJA 3N3MA 4EWND 5I3FA 3EXTA 3S1WA 1B4KA 1Z48A 1QOPA 1SO4A 3CQ0A 5FF0A 1G69A 4GC4A 4RCXA 1Z42A 4A2RA 3NO5A 4NQ1A 1M5WA 4Q32A 2H3DA 2RKXA 1ZAHA 3EX2A 4NJKA 4NNAA 2QAFA 3MJYA 3W7JA 1YYAA 1TPVA 2R8WA 1TPFA 2YDAA 3UWQA 3ZR4A 2UV8G 4LVGA 4UTJA 1RQBA 3RLUA 3IGXA 2RHGA 3BGJA 4K39A 1XDMA 2FTPA 3W76A 1OVDA 3NL3A 1UASA 5D2XA 2BXVA 5HQEA 2W6RA 2ZRWA 4TO8A 3C56A 4JN6A 2E6AA 4Z08A 3W2KA 1JCNA 3LHYA 3KHJA 4QAIA 4EOUA 1TPEA 4YL2A 1JRBA 4AHOA 1L9WA 1WBHA 3THQA 1SR9A 1YTEA 4UTTA 4JXCA 4BWLA 3W86A 5D09A 2GVLA 3I7SA 1D3GA 1ZCOA 2CW6A 4Z1DA 2A6NA 3TFXA 1VLWA 4NZFA 4U4MA 1B9BA 3CC1A 3EX6A 3OBKA 3NPVA 5LHEA 3PC0A 3B04A 1HG3A 4NJJA 4QJ1A 4M7TA 1FWTA 3HGSA 4O54A 1KTBA 4RK8A 2E1DA 2AAMA 3EWWA 3LTYA 4Y6GA 2I14A 4X3ZA 4NT0A 1B57A 1GTEA 1KM6A 1I2NA 1NFBA 4RXGA 3H55A 2ZRVA 1YXCA 1VYRA 4O1CA 2VC6A 4OBTA 1JVNA 4MKNA 1WV2A 1L2UA 3TX9A 5DBUA 4O52A 3Q58A 1TB3A 4C1LA 4LUJA 1GT8A 1ME8A 4RZ5A 3TA6A 4M6QA 1SZEA 3GLCA 3W7LA 1EWEA 1VYSX 3P80A 4FB7A 2R91A 3ABOA 2Q8ZA 1EA0A 4N6EA 3HQ1A 1GOXA 2FQIA 3TK7A 3P82A 2HMCA 4O50A 4WUIA 5FF2A 2NWSA 3QW3A 4O53A 4O0ZA 4WXZA 4RR4A 2ZDRA 1PHWA 4GXMA 3QFEA 3RU6A 3W23A 1ML1A 2NWRA 1GQNA 1FXQA 1JCJA 5DCEA 4QITA 4G1KA 1SO6A 3G3MA 3OIXA 5LHFA 2V30A 3TC6A 5HINA 3EKZA 2EKCA 3BLEA 3CIWA 4ZQNA 1X6UA 2A0NA 4O57A 3LHZA 5U4NA 1SUXA 3MHGA 2BWGA 3EX1A 5LNVA 4K36A 4NNBA 1BEUA 3M6YA 3MI2A 5IM51 1NVMA 4MFEA 5CZJA 1LRNA 1R47A 2OZ0A 1PCWA 1WYIA 5DXYA 3MWAA 4O14A 4CCCA 4ZZ9A 3E9AA 3THAA 3S1UA 2OCZA 2ISSA 2CZ5A 5G4EA 1EWDA 2ALDA 3RNDA 3CHVA 5G4WA 1LORA 4DELA 3L66A 2PRLA 5D2WA 1KFBA 3FIGA 2W79A 3W1TA 3FYOA 1H51A 4UFHA 3RLVA 1XI3A 1Q45A 3W1AA 1VLIA 3AJXA 2E09A 3M41A 2QEZA 3WFAA 2DU2A 3A5VA 2H3BA 5AYXA 1R2SA 1AK5A 2GUUA 3TE9A 1EB3A 5D2YA 3G8RA 2AQWA 1P5BA 1TV5A 4JTKA 4IMEA 2Z6IA 1WOAA 1GTHA 2VEIA 2X2GA 4NZJA 3W1XA 3P74A 2Y63A 3TMLA 1I45A 1VQTA 1OX4B 5HNRA 3G3DA 4D2JA 4FX7A 2X1SA 3Q2DA 2B7NA 3W7OA 4CCEA 4LY8A 3TROA 3EWXA 3WK0A 4AAJA 1TTJA 3VI2A 4ZMGA 4NU7A 4U28A 2Y7FA 3MI6A 1QPQA 1KLZA 1IIGA 2QCHA 2ABAA 3SW6A 1CW2A 1G7VA 1XBVA 1TIMA 3FS2A 3T7VA 3HGJA 4NXKA 3A22A 4CCDA 4KFNA 4J9JA 4FNUA 1N55A 4FHAA 3KFTA 3CIXA 1R2RA 1AW1A 4Z1BA 4NX0A 3G0SA 2HSAA 2RDWA 2PRMA 5I3IA 1KFCA 5G1TA 1H7XA 3LGEA 3UNDA 5LNSA 3QMTA 3SGUA 4XBKA 2NV1A 3P61A 4LV9A 1O4UA 2AGKA 2VFHA 3AO0A 1OYBA 5KZEA 5K9CA 2GJLA 4WOQA 4S2CA 1HTIA 3MI3A 4BK9A 4O11A 1LOQA 3MP5A 1OFRA 3M1ZA 5EYWA 3L0GA 4LW7A 3MO7A 4IMCA 1WA3A 1YADA 3MYPA 3GB6A 3NQDA 2VELA 3S42A 2QDHA 4OWGA 3LB0A 5KZMA 3NR0A 5AHEA 3PVFA 1MXSA 4PCFA 2Y6ZA 3F4WA 3C2EA 4O4VA 3P81A 1W5QA 3N14A 2VXNA 5D37A 2ZZ5A 1VPXA 1J2WA 4WZHA 4AHPA 1H7WA 1G4TA 2QJIA 3W2MA 4YMZA 1SZGA 3C2FA 5TQLA 4UXDA 3I65A 3FKKA 1IXOA 2FPTA 3LCWA 5D38A 1F5ZA 3UWWA 1LYXA 2NV2A 3W70A 1KFEA 1K7XA 4HIBA 5K4ZA 1GVRA 3PUOA 1VCGA 2LLEA 2WPBA 2Y62A 2NUYA 1A5AA 5LZLA 2Y88A 1HO1A 3G1HA 4HNNA 3TW6A 4DPPA 3SI9A 1W5PA 1EEPA 1TO3A 1OFAA 3TXVA 4JTGA 2D73A 3BARA 2OMAA 2DZTA 1DKWA 1K8YA 5K7JA 3CB8A 4N6FA 1ALDA 4O1BA 3GK0A 4AEOA 1SQ7A 2QCLA 3TAKA 1JUBA 3B0PA 4K37A 3ZS4A 4GUGA 3MP4A 4OU1A 3S8HA 1JQVA 3VFLA 4YCPA 3BG5A 3NQGA 4NX5A 2FDSA 5FF4A 4CLMA 1K7EA 3TJLA 1OK4A 3TQKA 2CLOA 3C52A 2ZQ0A 4IOTA 5U7SA 2YCEA 1R30A 3CT7A 4RKAA 3WK2A 1ICSA 3G1SA 1FWSA 2V5BA 3UQNA 1TREA 1R2TA 1WXJA 1I2PA 4MUZA 5DY3A 1FWRA 2CLIA 5BW6A 3BV4A 1GZGA 2JKPA 4O10A 2V0TA 4ZQMA 1G7UA 3NZRA 3W22A 1F6KA 4CQ8A 4H6KA 3W1MA 2JKEA 1K03A 3YPIA 4FO4A 1ME7A 1A5SA 3A9IA 3TW7A 3EWZA 1NF0A 1KV8A 4TR9A 2OX1A 4NVTA 2ABBA 3LTSA 3M0ZA 1QPRA 2DZUA 4TMCA 3N2MA 4TX9A 5AHMA 1W5MA 5D04C 3W7HA 4A22A 3HOJA 3NQEA 3M43A 4P2VA 2C3ZA 1KM5A 1QMLA 2J9XA 4MJZA 3W7MA 3H53A 1OHLA 3SY5A 1OFBA 3IIPA 1W3NA 1ZY9A 3C2RA 4UMBA 2YFNA 5BNKA 5C2XA 1OG0A 3T4CA 3O07A 3G1AA 4FX6M 1F7BA 1SPQA 5D33A 3DBPA 1UCWA 4FXRA 1TRIA 4CNPA 1KFJA 1LP6A 1QO5A 1XM3A 3NZ1A 1K8ZA 4JR5A 3PBUA 3NPXA 2YSWA 1Z41A 3W74A 4MZYA 5H2ZA 1TMHA 5LGZA 3MMTA 4MY8A 1IXPA 4E2BA 1XKYA 1CX9A 3TUUA 4UTKA 4UTTC 1IGSA 3N19B 5KZDA 4BWLC 1PS9A 3OVPA 2A5HA 4I7VA 3C61A 4S2BA 2DJLA 4DF1A 3R5EA 2HTMA 2GQ9A 3W72A 5LKYA 3QYQA 3LCHA 2CU0A 2J6XA 4JDYA 2Q3OA 1AL8A 1B4EA 1W31A 3EWYA 1QAPA 2VFDA 2QCCA 4JTIA 3TFCA 4UCGA 3G1FA 2RDTA 1I4NA 1YXYA 4L4LA 1VC4A 2GQAA 2GVJA 5IBXC 3IVSA 4WY0F 5K9XA 2B7OA 1KTCA 2BSLA 2E5CA 1P0KA 5F1UA 1X1ZA 2E77A 2FB3A 3FFSA 3WJZA 5CG7A 3W1QA 5AYYA 3W83A 3NQFA 5D30A 2NXIA 4DF0A 3W71A 2OT0A 3IIZA 1ZAJA 5EY5A 4UTWC 2WNZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3OEX A;  4UQD A;  2QCD A;  3H26 A;  4PMD A;  3EB2 A;  4NAS A;  2WJE A;  3KXQ A;  2X16 A;  3GR4 A;  2J27 A;  2VGB A;  5JMU A;  3T0D A;  1KM1 A;  4Y9P A;  3NL5 A;  2Y61 A;  1S39 A;  3P60 A;  4IX2 A;  5BXP A;  4BKN A;  2PCQ A;  2OKT A;  2QJG A;  2ZUN A;  1VIZ A;  5JH2 A;  4A4A A;  1O5Q A;  3G1V A;  2G97 A;  2YPI A;  2NZL A;  4GHR A;  4M6V A;  2PDF A;  2WLZ A;  2Z1S A;  4S3D A;  3BG3 A;  1IXN A;  2NT1 A;  4XBS A;  4MB3 A;  4DUW A;  1PTA A;  2CBI A;  1OGB A;  3B9N A;  1FXP A;  2CWN A;  1VEP A;  4A3U A;  1LG1 A;  4J35 A;  3VC5 A;  4O4W A;  3LDV A;  4TUF A;  2GFT A;  1EDG A;  4LF2 A;  3FJL A;  3VND A;  2IKJ A;  4FNP A;  2V2C A;  1UH3 A;  3S2L A;  2WZE A;  1RJQ A;  1YLV A;  4F0S A;  2P53 A;  5AY7 A;  1FWA C;  4IM4 A;  3QZA A;  1SJD A;  1JPI A;  2WAG A;  2B7Q A;  1GQK A;  1C8V A;  1PZ1 A;  5AN7 A;  1S5N A;  2BG5 A;  2GQ3 A;  2VFF A;  2BX7 A;  3PPC A;  4GC3 A;  4L6D A;  2IQ0 A;  4UNK A;  1AA1 B;  1RBA A;  1AW2 A;  3ZVH B;  1CEN A;  3LLX A;  3A21 A;  3PBG A;  2AL2 B;  3STE A;  3UWU A;  1NDV A;  1Q85 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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