1OK4A

Archaeal fructose 1,6-bisphosphate aldolase covalently bound to the substrate dihydroxyacetone phosphate
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
NLTEKFLRIFARRGKSIILAYDHGIEHGPADFMDNPDSADPEYILRLARDAGFDGVVFQRGIAEKYYDGSVPLILKLNGKTTLYNGEPVSVANCSVEEAVSLGASAVGYTIYPGSGFEWKMFEELARIKRDAVKFDLPLVVWSYPRGGKVVNETAPEIVAYAARIALELGADAMKIKYTGDPKTFSWAVKVAGKVPVLMSGGPKTKTEEDFLKQVEGVLEAGALGIAVGRNVWQRRDALKFARALAELVY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of an archaeal class I aldolase and the evolution of (betaalpha)8 barrel proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE CLASS I
molecule tags Lyase
source organism Thermoproteus tenax
total genus 90
structure length 250
sequence length 250
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2003-07-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1ok4A00
3LXCA 5G1TA 3SW6A 5AFDA 3W9ZA 3UZ5A 2Z6JA 2CZDA 5KZEA 4Q4KA 1K7XA 3TC6A 1SO6A 3LI0A 5AB3A 1W5OA 2ISVA 1WBJA 3QPZA 4JYFA 2YFNA 1XC4A 3NPUA 7TIMA 2TYSA 2R14A 2ZZ2A 1W3TA 3DH7A 3UZJA 1D9EA 2A7RA 3LXAA 3G1VA 2VOMA 4KKXA 3CEPA 1ML1A 2BXVA 5KSWA 4AHOA 1TTIA 4FHAA 1L6WA 4GXMA 5DELA 5DLCA 3L21A 1DORA 2WSYA 2Q3RA 4LS2A 4NUWA 1IXPA 1GQNA 1SO4A 4EF9A 1HTIA 1BWLA 4ZL1A 4O11A 4LS0A 3Q94A 1SFJA 1BWKA 1SFLA 1MO0A 2H8XA 1XUZA 2EAWA 2EF9A 4Q33A 3R89A 2NXGA 5EMUA 4JXCA 1OFPA 1DBTA 2YX0A 2HMCA 3NQCA 4FIRA 1FDJA 2YDAA 1H7NA 1FWRA 4OWGA 4M6VA 1H60A 3KVJA 1SW7A 4XBKA 1F6PA 3NPXA 4UXDA 1TPB1 1O4UA 2NXIA 2CLIA 1TPEA 4WY0A 3L67A 3RFAA 3MO7A 4N4QA 5HQEA 3W70A 2O7QA 3RU6A 1KM4A 4FNPA 4OGZA 3UY7A 3OVQA 4Z1AA 1PS9A 3W6YA 3MP4A 1GVFA 1H7WA 2C16A 4WUIA 2JKAA 3PG8A 3QYQA 5D02A 4RX0A 3STFA 3A23A 1SSGA 3LCFA 4UTWA 2ZBTA 3NM3A 5CZTA 3TNOA 5HR7A 1PCKA 1YXDA 1Q6RA 1VZWA 2YR1A 3LXBA 4JTJA 3MI6A 3OG3A 3W1LA 1TQXA 1DJQA 2AQWA 3EWWA 4OQVA 2KZHA 5LGZA 5K9XA 3QMSA 3W1UA 4RZ6A 5K7JA 4FIQA 5KZDA 2VFEA 3MHFA 2ZFAA 1K8XA 1Y0EA 1OHLA 4ZZ9A 1Q6QA 1NAL1 5LNRA 4AWUA 2CFFA 4XZ9A 3SFKA 1LRQA 3W7MA 2DORA 3RF9A 4NJHA 4POCA 2QR6A 3CQ0A 3S0CA 4HNTA 1TPWA 4FNQA 2QAPA 2A6LA 4UTUA 2NUWA 1PL9A 2CLHA 5F2GA 3QSRA 4R34A 1A50A 5FF0A 2A1YA 4NJJA 1IIHA 3M1ZA 1YDNA 1AL7A 1X8FA 4O14A 4DBDA 2Y61A 2OX1A 1FCUA 3A22A 1ZY9A 2C1HA 1ONRA 1O94A 1T99A 3W7GA 3B0VC 3HPSA 3W88A 4MVAA 3C0JA 4XTIA 1B3OA 1VYRA 1XDLA 3TV8A 3AO0A 3QQ0A 4U4MA 1B4KA 4QNWA 2YYUA 2A85A 4YWIA 3FEMA 1FBAA 2BWGA 4BR1A 3LCIA 2E09A 3ABQA 2G5WA 2NUYA 3GNDA 3S1WA 4UFMA 1QWGA 3RK8A 3DAQA 2NWRA 3HBLA 5I3JA 5K4ZA 4IMCA 4JIQA 4KFPA 3I7RA 3IVSA 3CLMA 2J9XA 2QDGA 3M7WA 4ADUA 2TRSA 1L6SA 1W1ZA 3BG9A 3W7JA 2R8WA 5FF3A 5FF7A 2A5HA 2CLOA 4Z0SA 3W75A 3PULA 3DXIA 5EKYA 2FLIA 4GJ1A 1TPH1 1FXPA 3LHTA 5AHMA 4GRSA 1XDMA 3EXSA 3UWWA 3IIZA 3QPYA 3P81A 2FB2A 3DFTA 4LW7A 3BK0A 3GZ3A 1EWDA 2EHHA 3MYPA 2X16A 1LRTA 2TSYA 3F4NA 1LOSA 2ZTJA 3ZR4A 4LOCA 3LERA 3C56A 1FCVA 5DY2A 1KV5A 4PCFA 4DF1A 1OF8A 3C6CA 1UB3A 1G67A 3NQEA 3OVRA 5AHNA 3RLVA 3G0SA 3Q58A 2OMAA 2ZA2A 3O6DA 1PIIA 1YPIA 1EIXA 2H90A 2WNZA 4TMCA 2DZWA 1JCLA 1VYPX 1NSJA 3W7QA 4L4MA 4UTLA 3KVKA 3NQ2A 1KBIA 1FDZA 3TROA 1I45A 1KLZA 1LOLA 1KFCA 4QAIA 1OFOA 4PL2A 3NQGA 3LCWA 4JTSA 2PRMA 1JUBA 4Z1CA 1CI1A 1YTKA 4UNKA 3W2MA 1T96A 2J27A 4IPIA 4ICNA 3EX6A 3FJ6A 1VLWA 3U6WA 4EVZA 1AL8A 1OABA 3MWAA 1UUMA 3IGSA 2J6XA 3U8GA 4RXGA 5CZSA 1H5YA 3NL6A 4H6KA 4OE7A 4NJKA 2YW3A 1GVRA 3IV3A 1G4EA 4R33A 1F7BA 2QCFA 3PWAA 5BMWA 3QZEA 1VRDA 3T40A 3FYPA 3P61A 4IXXA 4LVAA 3T55A 5IBXC 3FKRA 2V2HA 2ATSA 1EEPA 4O13A 1OFDA 5FEWA 1T0OA 1X1ZA 3W7NA 3JS3A 3BLIA 5I3KA 1GTHA 3N2MA 4WX2A 2EPHA 2C18A 3A24A 3F03K 5FI8A 1FDYA 3LBCA 2CLKA 3GLCA 4EF8A 5C54A 3PBYA 4LVFA 4WY0B 4I7VA 3VE9A 3A5FA 3B06A 3W1RA 3DHFA 1FWSA 2OCZA 4HHPA 2QF7A 3C2VA 2I14A 4TMBA 2P0OA 4JTEA 1G4SA 4HSOA 2C19A 3W07A 4FO4A 3G3MA 4Y8FA 1RR2A 4HNUA 3B4UA 4DPPA 1GJPA 2DP3A 4JGDA 2GOUA 2LLEA 2ZCGA 1N8FA 2ZRUA 1HG3A 1WX0A 2YXGA 4PC8A 2QCNA 2W6RA 4LT9A 3DGRA 2C15A 1R2SA 5D2YA 3CB8A 4CNNA 4FX6M 4BWLA 4RV8A 3IIPA 4UCGA 3W2NA 1FX6A 3LI1A 5I3GA 1J4EA 4Y90A 4EIVA 1QPQA 1KM2A 3EXRA 4K7VA 3M16A 2VFDA 1VHNA 2I1OA 3FOKA 4O19A 5BOOA 3HJZA 1SZGA 2V30A 5HUPA 5IBXA 4AHPA 2NWSA 4FXSA 3PS7A 5D09A 4NNAA 1OX4A 3TK7A 5KITA 1R46A 3GKFA 3N19B 4NJIA 1ME8A 3TKFA 5SWUA 1QFEA 2Y7GA 3N3MA 1XKYA 1DL3A 4K8HA 3SJ3A 1OVDA 2QCCA 3I68A 3NPVA 1TB3A 1VQTA 3GAYA 4MY9A 1J2WA 3IEBA 1J5TA 1YPFA 2Y62A 3P62A 1NF0A 2CLEA 3E12A 4UTMA 4NXSA 2WSQA 4WXZA 3I7QA 3P8IA 1KTCA 3M0ZA 1QO2A 3L5AA 2CLLA 2E6YA 3PVFA 1EP3A 3CTLA 2RH9A 4RXFA 1SO3A 4YXGA 5EL1A 3PG9A 4RJEA 3TQVA 3TXVA 2WOQA 3IIXA 4O8RA 1JUEA 4NXKA 1Q6LA 3W2LA 3BG5A 3E02A 4LNYA 2ZRZA 3MI2A 3V75A 4N9EA 5C55A 1W3IA 3DBPA 3O6YX 2Z2UA 4ORIA 2WPBA 5AHIA 3S1VA 1FUYA 3E9AA 3BO9A 5DCBA 4MY8A 3WK2A 1KFEA 1RQEA 4HN4A 3QEZA 1LBLA 1R2RA 3DFOA 3C2FA 3NEVA 2FQIA 3KRSA 4JDYA 3GNNA 2QCDA 3W23A 2ZQ0A 2PE4A 5C2XA 1H7OA 3S5OA 1C29A 2F7FA 1YXYA 4NVTA 5DY3A 3G1XA 3I7SA 1GPWA 3VE7A 5DCEA 5L6UA 2B7NA 2WSRA 1KFLA 3R12A 2EKCA 3O8AA 4XTDA 1FY6A 4NNCA 3NZ1A 1GTEA 2B7OA 3P84A 3CU2A 3MUXA 3G0UA 2JK2A 5K9DA 3N2XA 1IXNA 3W85A 3B03A 2BTMA 3H53A 4HPJA 1WAUA 2C3ZA 3SECA 1CW2A 1VCFA 2E5DA 3ATZA 3TSBA 3MYOA 3HB9A 4O1DA 1JJKA 4YL2A 3N9SA 5HNRA 2V5BA 5BNKA 3SI9A 1ICPA 2Y6ZA 1TRDA 4ZQOA 1ZNNA 3O63A 3LRKA 5KTLA 1PHWA 2E77A 3KXQA 4WD0A 4PODA 4M6PA 1LM1A 4GUHA 1H7PA 3LRMA 4KWWA 4LS1A 4PTNA 4ADSA 3G1SA 1D3GA 3LHUA 4UIOA 3GDRA 3B05A 3NL5A 5AYZA 3LV5A 3M5VA 1LCOA 4M7SA 1KM6A 5AHLA 5H2ZA 1O60A 3IIVA 4DO5A 4N2YA 1M7PA 4K36A 2H3DA 1TMHA 5D2XA 3STCA 4N9BA 4UTHA 5H91A 3ABOA 3IGUA 3TX9A 1XBXA 4LV9A 2GVLA 1F74A 1SR9A 2ZZ6A 2P1FA 4FX7A 4QM1A 3C8FA 1SZEA 3GKAA 1VHCA 4P61A 2GQ8A 3W3OA 1D3HA 1GG1A 4CCEA 1NF7A 3PUEA 3R2GA 5F1VA 2ZZ1A 1C8VA 4NT0A 4LTSA 1JVNA 2ALDA 1QNVA 3H55A 1WV2A 3TJXA 3WJWA 3SY5A 1UUOA 2A4AA 4G1KA 3GVGA 3PBWA 3NG3A 1I2PA 5EBUA 2NZLA 3LV6A 3MJYA 4Z1BA 1LP6A 4JTIA 4RKAA 4Y9AA 1S5TA 3S42A 4BF9A 5HR6A 3HOJA 3HG2A 3S5YA 1OJXA 3UXDA 3UWQA 2WNNA 4O16A 5F4XA 3KRUA 2A7PA 3MI3A 1RPXA 1VGAA 3E49A 4D2JA 1TV5A 3WK0A 3DI0A 3P74A 4PFMA 3TH6A 4LUJA 4O1CA 5T26A 3GXTA 1P1XA 2V2CA 4MOZA 1XBVA 1F6KA 5A5WA 3W72A 3C61A 5CPNA 5LNSA 1ZJIA 3MHGA 4HIBA 1GVQA 1TQJA 1FQ0A 1OK4A 1OX4B 2GJLA 1HO1A 4UMAA 5CGQA 2NV2A 4FEZA 1ZFJA 4IX0A 4XBSA 3PSWA 1ZAHA 3PUOA 2VENA 4DF0A 3MBFA 3ATYA 1SO5A 4YCPA 4PA8A 3W7HA 2ZTKA 2VXNA 2JKEA 1ICSA 4UNLA 2DJLA 4UC5A 3BLEA 1H63A 4AF0A 4JY8A 1TPFA 1UBSA 3MP3A 3NO5A 2DZTA 2PRHA 1WOAA 3W86A 5AN7A 4UTKA 5LGXA 1UJPA 4HPXA 3TAOA 4A21A 4DO6A 2E1DA 2ATMA 4MFEA 5BRBA 4ZQPA 2V82A 3NR0A 4O53A 3EWBX 1Z41A 1DV7A 4IMFA 1W5PA 3NA8A 5CG7A 3W1MA 3O06A 4RZ4A 4AXKA 3ZS4A 2ZA1A 3LHZA 2QUTA 2YGYA 2AGKA 4O1BA 1IGSA 5U7SA 2ABBA 3PAJA 4ORMA 4ZQMA 2H8ZA 1I8JA 5E1QA 4A2RA 2Y7FA 4YCOA 1F5ZA 3G1HA 4KFOA 4UR8A 3LHWA 3WJYA 1R2TA 3HGJA 4MJZA 2ZZ4A 2RKXA 3KFTA 3ZFHA 3H54A 3GYEA 3W84A 4MFDA 3I65A 3L66A 2C14A 3W7DA 3B8DA 3EX4A 4GFSA 3LCXA 3T7VA 5KMYA 4GC4A 3TXZA 5DCDA 5TIMA 2VEPA 3T44A 1LBFA 4AEOA 4UMCA 2QAFA 1GWJA 2QCDB 1LDCA 4JYDA 1H1ZA 4MPQA 4LVGA 3IIOA 3GAKA 1W54A 3TW7A 3HPZA 5HWMA 1FCQA 4WZHA 3FIGA 4BI7A 4EOUA 1I2RA 4TR9A 3BPWA 3PB0A 1B57A 2QJIA 5D2VA 1JCNA 4S1FA 4QSHA 1EUNA 5D32A 2VFFA 2YZRA 5HUOA 2X2GA 4X9SA 3QF0A 2YPIA 3EX2A 2FPTA 1F73A 3L65A 2TMDA 1K8ZA 3W74A 1TSIA 4LU0A 3G3DA 1G4PA 1IXOA 2P10A 3K30A 3I6RA 4C1KA 2NLIA 1KA9F 3NGJA 1KM3A 2NX1A 3CWNA 3QW4B 3IRDA 2AAMA 4RR4A 5D04C 4OV9A 2QUUA 1ZHAA 4QITA 4QIUA 5DN1A 3L0GA 4NX0A 4NJGA 1K8YA 1QO5A 4C1LA 3KX6A 1KV8A 4YMZA 1FXQA 4P2VA 2CW6A 3IVUA 1DKWA 4UMBA 1K7FA 1LLWA 3EWUA 1OFAA 3PB2A 2VFGA 4AHQA 4Z0JA 3OEXA 3F4WA 2ZDRA 3W7KA 5L9FA 4TIMA 4U28A 1ME7A 2WV8A 5LSMA 5D30A 3O07A 2Y89A 3M5YA 3B0PA 1JRBA 4JIPA 4ML9A 2VEIA 3IGXA 4LUIA 3HF3A 3FKKA 3GDLA 1HFBA 4N9DA 4CLMA 1V7YA 1YDOA 3ABSA 2Z1BA 4Y6GA 1O5XA 2CZFA 2YSWA 2B4GA 4W9TA 2Y7DA 1P0KA 2ZA3A 3KOFA 2J9ZA 4ZQCA 1G6CA 3G8EA 2QCLA 3DU0A 3W1TA 1A5CA 1A5SA 3EEGA 3TAKA 2VELA 1RQBA 1X6UA 3NQ7A 2J9YA 3WFAA 3EX1A 1TREA 3C52A 1W31A 5AHEA 3G24A 4Z1DA 2QCGA 5F4WA 1K7EA 1YYAA 3CEUA 4YLWA 3G1DA 4JTKA 5G4WA 4DBEA 1Z42A 4UR7A 1LOQA 1OFQA 4IXHA 3NQFA 3P67A 5K3VA 4ALDA 4S2CA 4QJ1A 3HG5A 3PSVA 3TE9A 1X7FA 1ZAJA 2FFCA 2DZSA 2GQAA 3QW3A 3UD6A 3W1PA 3E96A 5HINA 3LX9A 1KBJA 3PC0A 3UWUA 3NXFA 3L0KA 3GDTA 3TUUA 1S3HA 2O7SA 2DZVA 1KM1A 1KFJA 2FDSA 3TC7A 1JRCA 1JR1A 3HPXA 3L68A 3MBDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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