1OVD | Genus

Total Genus 115

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	115
sequence length	311
structure length	311
Chain Sequence	MLNTTFANAKFANPFMNASGVHCMTIEDLEELKASQAGAYITKSSTLEKREGNPLPRYVDLELGSINSMGLPNLGFDYYLDYVLKNQKENAQEGPIFFSIAGMSAAENIAMLKKIQESDFSGITELNLSCPNVPGEPQLAYDFEATEKLLKEVFTFFTKPLGVKLPPYFDLVHFDIMAEILNQFPLTYVNSVNSIGNGLFIDPEAESVVIKPKDGFGGIGGAYIKPTALANVRAFYTRLKPEIQIIGTGGIETGQDAFEHLLCGATMLQIGTALHKEGPAIFDRIIKELEEIMNQKGYQSIADFHGKLKSL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Lactococcus lactis dihydroorotate dehydrogenase A mutants reveal important facets of the enzymatic function. pubmed doi rcsb
molecule keywords	DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE A
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Lactococcus lactis
total genus	115
structure length	311
sequence length	311
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2003-03-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	1ovdA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1ovdA01

4DQWA 2CLOA 5DXXA 1QOPA 2VFIA 4MVAA 1GYLA 2R91A 1I4NA 4XBSA 1UUOA 4WOZA 4ZQNA 2VC6A 3MO7A 4B5NA 1VCGA 2J9ZA 1PS9A 3N9SA 4WOQA 1NSJA 3QMRA 3A5VA 1G4TA 3EWYA 3C52A 2A4AA 3VE9A 2ABAA 1OX4B 3IEBA 5I3KA 3R89A 1MEWA 1QR7A 4PCFA 4UXDA 4FO4A 1MZHA 3AJXA 1KM0A 2WSYA 4LU0A 4P2VA 4DO5A 3RMJA 3EXSA 3QFEA 2PURA 1OFQA 1W0MA 3VE7A 3C2EA 1W3TA 1EB3A 2F84A 4UTJA 4NJHA 2AAMA 4UTTA 3GNDA 4I9AA 3P82A 1YYAA 3BLIA 3W72A 3LB0A 3NQ7A 4K7VA 2NUXA 3LBCA 3UWWA 1A5CA 3NZ1A 1SFLA 1ICPA 1NVMA 2ZZ5A 2H8XA 3B4UA 3G1YA 3W7LA 1H50A 3F4NA 3THAA 3K30A 5D2YA 2FPYA 4NQ1A 2FDSA 4JR5A 1Q6RA 2PE4A 2NLIA 3W70A 3QC3A 4YLWA 2TRSA 2Y7FA 3FS2A 4MLRA 4NNBA 4RXFA 5F4WA 4ZQOA 1XC4A 1TV7A 2XN0A 3OVPA 5LHFA 2DJLA 4JDBA 5F4SA 3UZ5A 3KX6A 2QCCA 3NQAA 3GDKA 1ZAHA 1YTDA 4CCDA 2C0AA 3HBLA 4N6FA 4UIOA 1TIMA 3DBPA 1RQEA 3WJYA 1S5TA 3GYEA 4UR8A 3L5AA 1U83A 1P1XA 1D3HA 5C2XA 3PVFA 1ZAJA 2EAWA 1DQWA 1ME9A 3G1FA 2H90A 2GQ9A 3PB0A 4DO4A 5EYWA 2ZZ7A 3WJZA 1YXCA 2CZDA 3IVSA 4FNTA 2Y89A 4MJZA 2Z6IA 2E6AA 4LS0A 2BX7A 3KFTA 4O1AA 5K3VA 1H61A 1ZHAA 3W1TA 4ZZ9A 1QMLA 5IBXA 1ALDA 3SFKA 4O11A 3LV5A 2FFCA 2ZZ2A 4X3ZA 1QFEA 2DZVA 2EPHA 3G8RA 1AG1O 1Q6QA 3L66A 4AWSA 1G69A 4O10A 5I3HA 2B7PA 4E2BA 4X2RA 1SO5A 1HUVA 5KSWA 1VPXA 3P7YA 3QEZA 1JCJA 3M7WA 2VEMA 1TPH1 1QWGA 2QCDB 1O5KA 2AQWA 3C0JA 4UMBA 3UWYA 2XN1A 4DELA 2OJPA 3S1VA 1GT8A 1SW7A 4UMCA 2ZRUA 1TPVA 4RV8A 2Y6ZA 4TMCA 2R94A 2ZRYA 5CPMA 3A22A 3C2FA 1ME7A 5G1YA 3IGUA 3S5ZA 5AHLA 4ZL1A 1X6UA 1OF8A 2Z1BA 1QAPA 4O18A 5K4ZA 4K7YA 3C2VA 3W6YA 4AHOA 3TROA 4UCGA 1IIGA 4LWWA 2E68A 3C6CA 4DBDA 3LOTA 2JK2A 5U7SA 2QCEA 4YL2A 1FCUA 5F1UA 3CEUA 4R33A 1EPXA 3W7CA 3L21A 4UFLA 1O94A 4Z1AA 2BTMA 4NXKA 2TPSA 4AH7A 1XDMA 3HG2A 1AW2A 2Y70A 2RDUA 1MO0A 1YTKA 4NT0A 3HOJA 1M7OA 3QRHA 1FDJA 4O50A 1W5QA 5FF2A 4PH6A 1TMHA 3G1AA 4OV9A 3L9CA 5LNWA 3W7RA 3M16A 4Y9AA 4J9JA 3I7RA 3G3MA 4RKAA 4HSOA 4MYAA 5D03A 4XKYB 3NQCA 4UFHA 4LNYA 2OMAA 5HJLA 3W9ZA 3TE9A 2A7RA 1I2NA 4MZ8A 1W1ZA 1SO4A 2G97A 2PCQA 4NUWA 4JTKA 3NDOA 4ADSA 4RZ4A 4X22A 2P1FA 4HNVA 1TO3A 1S5VA 2C1HA 3GR8A 4JIPA 3R12A 3FLUA 4CNOA 2A2IA 3R5EA 3Q37A 2HSAA 4O4WA 3S0CA 3W84A 1K8YA 1H5YA 3ATYA 2NUWA 2NX9A 5HUOA 4K37A 2JKEA 1A5SA 4KFOA 4WXYA 1LYXA 4W9TA 3BGGA 3W1XA 5EL1A 5D38A 1QNVA 4GUHA 1E51A 4R34A 3EXRA 2HTMA 4TU1A 3Q2DA 1KW1A 4MZYA 3LHWA 2GJNA 4JY8A 1RZMA 4LW7A 3QPYA 3W22A 1VRDA 2FIQA 1GEQA 3KRZA 3DI0A 2FLIA 2P0OA 3BPWA 4NNCA 2VELA 2G95A 1KTCA 3P67A 1F76A 1UBSA 4IQLA 3L0GA 3SGUA 3LHTA 4M6PA 3NA8A 5F4XA 3T40A 2IQTA 2YX0A 3M41A 1H60A 3KVLA 1QPOA 1WXJA 1ZFJA 1JRCA 4LUJA 1ZY9A 3ZWTA 1SSGA 1FCVA 4FF7A 1KV5A 1ONRA 2XN2A 3DFNA 4CQAA 1H7WA 4IMGA 3ZFHA 4RLIA 3G1SA 5FESA 3TC7A 3DXIA 5LGXA 3W7JA 5C54A 2DZWA 2VFEA 4AB4A 5LHEA 4DBEA 1Q6OA 5I3IA 3UXAA 4WX2A 3LI1A 1Z42A 5G2HA 1W5OA 3CTLA 1OFEA 4POCA 1OJXA 1N8FA 2CLIA 4KKXA 4UFIA 3W07A 1B4EA 1XI3A 3M5ZA 2E5BA 2QCNA 3M9YA 4MZ1A 5D2VA 2QDHA 5C6MA 2CLKA 1QO2A 3G3DA 3P60A 1OFDA 4JN6A 3FOKA 1Q3NA 2WKJA 1EUNA 1XBVA 3LRMA 3G0SA 2J27A 2QCHA 3S1WA 3TJXA 5D05A 2FPTA 5E0KA 3N2MA 3WK1A 3DHDA 3S5YA 1TREA 4AWTA 3W85A 4TX9A 4NX5A 3W2JA 2DU2A 4A29A 2YGYA 3TC6A 4K8HA 1SR9A 4LC8A 4DO6A 3T7VA 1HO1A 3QQ1A 4IX0A 3A9IA 4MIMA 2ZRWA 1XXXA 3IVUA 3I6RA 3NPXA 4JYDA 2YZRA 1JCYA 4UTWA 3UYCA 1RQBA 3NL5A 2TYSA 4EIVA 1YXDA 3P5ZA 1OX6A 3PG8A 1VCVA 1HFBA 4HSNA 2YDAA 2Y88A 1X1ZA 3WK3A 1TCDA 3LM7A 1M7PA 3TFCA 3LI0A 4UC5A 4AF0A 2NZLA 4HKPA 3LCGA 2D73A 1AL7A 3CPRA 5CG7A 4FX6M 3NG3A 2H3BA 1H51A 1RVGA 3B06A 3Q94A 1FXQA 3LBMA 3LDVA 4NX0A 1XUUA 3PC0A 1XBXA 3L67A 4NXSA 3DU0A 1K3UA 1ICSA 1KFLA 2FPVA 1QPRA 4LV9A 5G2WA 1XFBA 1IXPA 4Z0SA 1H63A 3IGSA 2C3ZA 3L2IA 3EWXA 4N4QA 5F2MA 2FTPA 3IIXA 4Y90A 1EP2A 1X7FA 3GIYA 4AXKA 3PB2A 6ALDA 1YTEA 1UCWA 3WJSA 3W83A 3FYPA 4JNMA 2QEZA 3MHGA 3P8JA 1DORA 3W1PA 4E0CA 2QCGA 5FF0A 4XUGA 4OV4A 1DJQA 1JRBA 4LT9A 1FCQA 3QZEA 1OFAA 1QDSA 3CB8A 3UPBA 2VXNA 4ALDA 1LOLA 2P10A 2X1RA 2CLFA 1GVSA 3HO8A 4UFKA 3T4CA 5HR6A 5CSSA 1H62A 1X8FA 5U4NA 3GKFA 3QPZA 2CLLA 4FNSA 2BSLA 1BKSA 3I7SA 1I2PA 4C1KA 1ME8A 1VHCA 3LCWA 3LV6A 3OHIA 5DN1A 4CQ9A 1TTQA 1OFRA 5DELA 4ADUA 3S8HA 4Y6GA 1PCWA 3G0UA 2B7OA 3KXQA 5D2XA 1UUMA 2I9EA 1GOXA 4M6QA 5F2LA 3IIOA 1GPWA 4O15A 4U28A 4BI5A 4O54A 3UWZA 5HWMA 3M44A 4OU1A 1CW2A 2DZTA 2GVJA 1TPC1 4AMAA 1KM4A 4BWLC 2X1SA 4D2JA 5AHMA 3ZR4A 3M47A 8TIMA 5I3GA 1OX5A 4CCEA 3B03A 3LLDA 4WXZA 3TQ0A 1OYCA 3M43A 3TQVA 1YDOA 5AN7A 3M5VA 3ABRA 5D04C 2OT1A 3UPWA 3STCA 2C13A 2ZA2A 2ZA1A 4PODA 1A5BA 2JKPA 1KBJA 2CFFA 4GE8A 2YPIA 3W2NA 1KM6A 5LNRA 1DL3A 2J9XA 1C9DA 5FEZA 4IGHA 5E93A 1F6PA 5K4XA 4GXMA 1MXSA 5J5DA 1S3HA 4OGZA 1GTHA 1F73A 2CW6A 2WV8A 4O16A 1PV8A 2CU0A 3MI3A 1O4UA 3NO5A 4JX5A 4X9SA 2WNNA 4AWUA 2QCFA 2CZ5A 3NQ2A 5KMYA 2G96A 3UWQA 2YYUA 5LNUA 4PL1A 3LTSA 2BZNA 3JR2A 2BWGA 4QIUA 5G4EA 3MJYA 3W7QA 3WJWA 3TKFA 2X30A 1DOSA 1I45A 2ZZ4A 3NQVA 1FXPA 3GB6A 2JGYA 2VEPA 1YXYA 2V5LA 4CLMA 3OEXA 4DPQA 1I2QA 2ATSA 4O13A 3DFOA 3LX9A 3HGRA 3KOFA 4FNQA 1VYSX 1M5WA 3NOEA 3SIZA 5A8GA 1GVRA 1T8XA 4TR9A 4GUGA 1LOQA 3EWUA 1OYBA 2QJIA 4LVBA 1VR6A 1K02A 2E77A 4A22A 3LXAA 3TAOA 1SZNA 5CZTA 4K36A 4NZJA 1A5AA 1SQ7A 4OT7A 1ZAIA 4YXGA 1G67A 1TQXA 2Q8ZA 3GXTA 1SZGA 3KHJA 3TSDA 4UTKA 1OG0A 3TW6A 3F4WA 3BK0A 3W2MA 2OZ0A 4IXHA 4UR7A 4NU7A 2WJZA 1S5WA 2RHGA 3W2UA 3ELFA 3H53A 4WZHA 1H7NA 4FNRA 5K9XA 4FX8A 4S2CA 1F6KA 3HQ1A 2ZDRA 1SO3A 1IGSA 5AYYA 2I14A 4E38A 3W7PA 3UNDA 1EP1A 1ICQA 3BO9A 3PS7A 3W1AA 3T44A 3N19B 4JTLA 3W7OA 1RR2A 3EB2A 2H3DA 3LHYA 4N6EA 3I68A 3FKRA 3Q58A 4QSHA 1KM2A 2Y61A 3NQ8A 5AC7A 4IXXA 2ZCGA 4AHPA 3E9AA 5D30A 4G1KA 3PBUA 3HMJG 1GVFA 1R2RA 3PUEA 5CKSA 3TA6A 3M0ZA 4M6VA 3DGRA 4YCOA 3L5MA 3MI6A 2Q3OA 3VKJA 1VLWA 5D2TA 2J88A 4R7JA 4AEOA 3FJ6A 4NZFA 4EWND 1W3IA 3HIJA 1DBTA 3DENA 1JUKA 3GDRA 3UXDA 3QMSA 4R53A 4HT3A 2A7NA 5FEPA 5KINA 1IF2A 3O1NA 4O12A 3LTPA 3QM3A 3E12A 4A2SA 4JX6A 1AMKA 1K7XA 1KFKA 3O8AA 3SW6A 1QOQA 4ZQRA 3TFXA 3UY8A 1LLWA 3P81A 1GJPA 1DJNA 5HINA 4FX7A 4Z08A 3DZ1A 1MEIA 1PL9A 4C1LA 1LBFA 3CQ0A 2YSWA 2KZHA 3L65A 4RJEA 3W87A 3W74A 4LS1A 2B4GA 1I2OA 4NNAA 4DEFA 1H7XA 2ISWA 4TO8A 4JTTA 3TK7A 5AOUA 2PRMA 1KTBA 1LRNA 4MPQA 1LROA 2VFGA 4JGDA 4OHQA 3S42A 3I65A 1GVQA 1H1YA 3IIPA 2O7SA 3TSBA 4NJGA 4TMBA 3QSTA 1SW0A 2X1TA 4Y96A 3TR2A 4IPJA 5K7JA 1X1OA 2A5HA 2C19A 3C3NA 1F05A 3MP3A 3O6YX 1G4SA 4HPXA 1BWKA 4LVFA 3NPUA 2GVLA 1M6JA 3KVJA 1L6YA 3EXTA 2JBMA 2WPBA 1CX9A 1T96A 4BI6A 3MHUA 2VOMA 3B0PA 3TQKA 2QJGA 3N3MA 4N4PA 3KVMA 3EKZA 2VENA 2VEKA 1Y0EA 1EEPA 4XBKA 3NM3A 3EX1A 4JS3A 4MJMA 4GWEA 1O5XA 5BRBA 2V9DA 2NX3A 3CM4A 5D37A 5DXYA 1OABA 2VFDA 3LCIA 4UTTC 1P5BA 1KFEA 1VJIA 1R2SA 1JUEA 3M5YA 3DFPA 4U4MA 3GAKA 4HHPA 3UWVA 1VCFA 3W7HA 4UUIA 3EWZA 3FFSA 3GAYA 2QCMA 5ABTA 4Q32A 1TV8A 2QJHA 4OBTA 3L0NA 1FDZA 2EGZA 1HL2A 4RR4A 5HWJA 1JCMP 5AC6A 1QPQA 3TW7A 4RCXA 4DXVA 3GXNA 5D32A 5EKYA 2Q3RA 3H55A 3NPWA 3C4UA 1TQJA 3G18A 1FWRA 3L5LA 1DQXA 3HGJA 2PRHA 4UNLA 2WSQA 1JCNA 1KLYA 3RU6A 1JQXA 1K03A 5LNSA 3RLVA 5D02A 3W3OA 1H7RA 1K7FA 3PAJA 1O60A 2E09A 2C16A 3BG3A 3W1NA 3SGZA 1WOBA 2CLEA 5EY5A 5IBXC 1OX4A 3O16A 2ATMA 4QITA 2C18A 4A21A 3W7DA 3TDFA 3HGSA 3C61A 2YYTA 3P80A 2WO5A 1W3NA 1Z44A 4LC6A 2Y7EA 2FQIA 3LHVA 1DKWA 1QCWA 1JVNA 2E5DA 3CEPA 5G1TA 3NQEA 4IX2A 1PHQA 3G24A 1TPWA 3MHFA 4N9DA 4O0KA 4O28A 5HQEA 5AB3A 3NZRA 1OYAA 3VFLA 4A2RA 1TRDA 2NWSA 3SI9A 1WX0A 3EX3A 2ZYFA 4WUIA 5AHEA 3HF3A 2RKXA 4WD0A 3PUOA 5LGZA 4JICA 4PA8A 3DKJA 4O17A 2C15A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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