1PIIA

Three-dimensional structure of the bifunctional enzyme phosphoribosylanthranilate isomerase: indoleglycerolphosphate synthase from escherichia coli refined at 2.0 angstroms resolution
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
452
structure length
452
Chain Sequence
MQTVLAKIVADKAIWVEARKQQQPLASFQNEVQPSTRHFYDALQGARTAFILECKKASPSKGVIRDDFDPARIAAIYKHYASAISVLTDEKYFQGSFNFLPIVSQIAPQPILCKDFIIDPYQIYLARYYQADACLLMLSVLDDDQYRQLAAVAHSLEMGVLTEVSNEEEQERAIALGAKVVGINNRDLRDLSIDLNRTRELAPKLGHNVTVISESGINTYAQVRELSHFANGFLIGSALMAHDDLHAAVRRVLLGENKVCGLTRGQDAKAAYDAGAIYGGLIFVATSPRCVNVEQAQEVMAAAPLQYVGVFRNHDIADVVDKAKVLSLAAVQLHGNEEQLYIDTLREALPAHVAIWKALSVGETLPAREFQHVDKYVLDNGQGGSGQRFDWSLLNGQSLGNVLLAGGLGADNCVEAAQTGCAGLDFNSAVESQPGIKDARLLASVFQTLRAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Three-dimensional structure of the bifunctional enzyme phosphoribosylanthranilate isomerase: indoleglycerolphosphate synthase from Escherichia coli refined at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords N-(5'PHOSPHORIBOSYL)ANTHRANILATE ISOMERASE
molecule tags Bifunctional(isomerase and synthase)
source organism Escherichia coli
total genus 166
structure length 452
sequence length 452
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 1991-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00218 IGPS Indole-3-glycerol phosphate synthase
A PF00697 PRAI N-(5'phosphoribosyl)anthranilate (PRA) isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1piiA01
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1piiA02
1W3NA 1L9WA 3P60A 2C13A 2PCQA 4ZQCA 2A21A 4MYAA 3B06A 3BW4A 3G3DA 1M5WA 4UTJA 1JULA 4UTTA 3HPSA 4BWLC 3I7RA 1LOSA 1R2RA 3KRSA 1H7NA 3TMQA 3UWZA 2E5CA 3F03K 4QAIA 3PUDA 4QM1A 1DOSA 4XKYB 4W9TA 1TCDA 4RZ5A 3MMTA 1OG0A 5HUOA 3DFNA 1YTDA 3GDKA 4FIQA 4Q4KA 4NU7A 1OFDA 3DXIA 1JQXA 4XZ9A 3KFTA 3ATZA 2VEKA 4O18A 1DBTA 3EX6A 1JUEA 4UIOA 3LRMA 4IMGA 1M7OA 4I9AA 3C2FA 3NQGA 3W1UA 2OCZA 4IQLA 1J4EA 4PA8A 3ZWSA 3HG4A 3N73A 3N9RA 3HOJA 3W1RA 1A5BA 4XQ6A 3O16A 1FCBA 5AFDA 4JX6A 3PC0A 4CCCA 2X1UA 1XI3A 3CQ0A 5D32A 1AG1O 1Q6OA 3A23A 4Q33A 6TIMA 3W1MA 3LV6A 1SZEA 2WJZA 5FEZA 2V2HA 4R34A 1LRTA 3M41A 1JQVA 1PVNA 3CM4A 2EHHA 1OX6A 4RKAA 1XL9A 2J27A 2X30A 3M5ZA 1ZCOA 5EL1A 2KZHA 3ABQA 2VEIA 5K9XA 1QOPA 4OV9A 1LORA 2JBMA 2ZZ5A 2ZZ6A 3TCEA 4QQ3A 3P84A 3LB0A 5DBUA 4NJKA 1D3HA 4O0ZA 5CPOA 2NUXA 2O7QA 1H7XA 1XM3A 1TV7A 4Z0SA 3NL5A 4X22A 2JK2A 3VKJA 1QPOA 3QSRA 4O17A 4LS1A 4IUOA 1RR2A 3T7VA 3H53A 4FX7A 1WA3A 1ME7A 2QKFA 3LHWA 3GK0A 3I7QA 5HWMA 1B4KA 3LM7A 1TPFA 3L9CA 4JTIA 3HGOA 3PULA 5I3IA 4JN6A 2EF9A 3DGRA 1RPXA 3B4UA 1H7WA 1KA9F 3DI0A 2V9DA 3N2XA 4LRTA 2Z6IA 3W1AA 4MFEA 4DELA 3UPWA 4NX0A 3HB9A 3PAJA 1HO4A 3S1XA 4N4QA 4O1CA 3TW6A 3S42A 1YPFA 3LI0A 4MOZA 1WX0A 1KM1A 1SR9A 2OZ0A 4A3UA 1TV8A 3DENA 3R13A 5AYYA 1KM0A 3NQEA 4POCA 4JXCA 5G2HA 3OBKA 4MJMA 2PURA 1IXPA 2PC4A 2CZDA 2ZTJA 3STGA 1VS1A 1QR7A 2CLFA 1JUBA 3C4UA 3H55A 4XUGA 4FNQA 1KM5A 2YXGA 4LVDA 4Y8FA 3KAOA 2W6RA 3HIJA 3ABSA 3P81A 3TROA 1KTBA 1TPH1 2Y7GA 3L2IA 3PSWA 3GAKA 4UTIA 4LTSA 4WQ6A 2DJXA 4MZ8A 1NVMA 2WQPA 4QNEA 3QSTA 1I2OA 5AC7A 2PRHA 2A7PA 1JCJA 2QAFA 3F4NA 3NPXA 3HBLA 3NYZA 3F4WA 1P1XA 3WK1A 2E1DA 3S5NA 4K38A 2YW4A 2ALDA 5K3VA 3UQNA 4WXYA 4LVBA 4O10A 3SECA 2YX0A 3N14A 3MUXA 4WXZA 5E93A 3TE9A 2Y6ZA 5AYXA 3I68A 1H62A 1L2UA 1TPWA 3P5ZA 3DFPA 5IM51 2B0MA 4JR5A 2HS6A 3LXAA 3RFAA 4ONVA 3LHUA 2FLIA 4YL2A 5L6UA 3CWOX 3FIGA 3PVFA 1P0KA 3GNDA 2W79A 2GQ9A 1VLWA 3TQVA 3EB2A 4FIRA 3D0CA 1X8FA 3MI6A 1OHLA 5F1VA 1D9EA 2WOQA 1WDWA 4GUGA 1OFRA 2I9EA 1V7YA 3EX4A 5FI8A 1QO5A 1YTEA 1P5BA 3HMJG 2A7RA 3P61A 1SUXA 3UWQA 1W56A 3L65A 1X6UA 4XWUA 5U4NA 1OFBA 1DJNA 3NM1A 3G8RA 3LHYA 4I7WA 2CLOA 3KVLA 4NZJA 3W23A 3C2VA 3DI1A 1VC4A 3PS7A 1KFBA 4O57A 3NQCA 1RV8A 1T8XA 1HFBA 4NQ1A 3HG2A 3THAA 1XBVA 3BG5A 3NG3A 5L9FA 4IPJA 4NJHA 1ZHAA 1GVSA 5C5YA 2QDGA 3S0CA 4H6KA 3NPWA 1TTQA 1XKYA 3STFA 4DPPA 5C2XA 4WZHA 4A2SA 4DXVA 4MYXA 3C56A 3GXPA 3Q94A 3G8EA 4AVFA 3GDMA 2Z0IA 3UYCA 1GOXA 1SU5A 4HPJA 3E12A 3EWYA 4JS3A 4C1KA 3TQKA 2ZRUA 3KXQA 1XBYA 5AHMA 1EA0A 1G4EA 4CNPA 1SZFA 3W83A 1QOQA 3PB2A 4JX5A 1RZMA 1B4EA 4E38A 4FNSA 4XBSA 3EXSA 1GVRA 4N9EA 1GG1A 2FFCA 5HULA 2DORA 1H1ZA 1TB3A 4MZ1A 4BFAA 3Q2DA 4DO4A 3TR2A 3GDTA 4ADUA 2C3ZA 1O4UA 1JUKA 3P8JA 1A53A 1K7EA 5DELA 5F2MA 2NX3A 2VEMA 3LHVA 3JS3A 5D33A 1ONRA 3GXTA 3RNDA 5FF7A 3LLFA 1K03A 5D2YA 1SO4A 5D04C 3PBYA 3UY8A 3SJ3A 3WJXA 1LDCA 3NZRA 5DLCA 5G1TA 2QCDA 1QAPA 3CIWA 2O7SA 4LUIA 3T78A 4RJEA 1MXSA 4NX5A 4S2CA 2R94A 2ISSA 1R2SA 3NQVA 5D03A 2QDHA 1FDYA 3PUEA 2A4AA 4LC6A 2WO5A 5K4XA 2VFGA 1WOAA 2Y89A 3CPRA 1FWRA 2E5BA 3PBVA 4PH6A 1KFJA 3GKFA 2R8WA 1XXXA 3FA5A 2NZLA 1OYAA 5D05A 3W1PA 2J24A 1VZWA 1MEWA 2ZA3A 1T0OA 4JYFA 4JDYA 3W2KA 4O0KA 1KM4A 2E6FA 1I8JA 1X7FA 2H90A 1FDJA 3O6YX 1TPB1 4AF0A 1SO3A 3KVJA 3PB0A 1OFPA 4LV4A 4O14A 3LXBA 2E6AA 1AL7A 5CGQA 1FWWA 4RXGA 3WK2A 4DBDA 1F76A 2ZA1A 1WXJA 5CG7A 1YXDA 1IGSA 1F6PA 4RZ6A 4UUIA 2Q3RA 2CLIA 3NAVA 1MZHA 2NLIA 2YYUA 3C8FA 1SSGA 3HF3A 3QFEA 4YCOA 1XC4A 1TREA 2X2GA 4JX4A 3N19B 4PL1A 3B04A 3BLEA 1TYGA 4AWSA 3HO8A 3G24A 4FO4A 4JTKA 4XBKA 3LRLA 2QUUA 4UFJA 1IXQA 2ZRVA 3MP4A 5LHFA 2H3DA 5DXYA 2E6YA 3S1WA 4FX8A 4KWWA 2EGZA 1KBJA 5D30A 2ISVA 1TTJA 5AHFA 4GUFA 2E6DA 4LU0A 1ICSA 5D2WA 1AMKA 4JTHA 3NQ6A 5HQEA 5AC8A 1Y0EA 4P2VA 3FYOA 5HJLA 3G18A 4HNUA 2H3BA 3MI2A 4A21A 3EX1A 3TUUA 5CZ0A 1O5KA 3LCXA 5FF0A 1W1ZA 2QCCA 4RZ4A 4JDBA 4H4IA 1SFJA 1SO5A 1THFD 1B3OA 2FPYA 3IGSA 4NNCA 4CQ9A 2JKEA 3Q37A 3CLMA 1VYPX 3IIOA 3C52A 4TMBA 5GVJA 5I3HA 3G1FA 3S1VA 1ZAJA 1ZNNA 1BWKA 1Z48A 3NQDA 1OFQA 3NQMA 2Y61A 3A24A 3NXFA 3NNTA 4ML9A 1CI1A 2C6QA 1TMHA 2G96A 1EWDA 3C6CA 2V5BA 5I3KA 3W7EA 4LS2A 2OT1A 4QNWA 2WPBA 3W2NA 1QPRA 3UNDA 3FYPA 4UFKA 5EBUA 1OX4A 2JGQA 2Z1BA 3MYPA 3P74A 4BI7A 1C29A 1G4PA 4MPQA 3KOFA 5LKYA 4LY8A 3W7MA 5LNWA 3INPA 5BNKA 5MHBA 3NVTA 4MLRA 1PE1A 2GQ8A 3R8RA 2YR1A 4GE8A 4WD0A 3DFQA 3QM3A 3G1AA 1EEPA 3TIMA 3LXCA 4N9BA 5DCBA 1ALDA 1JJKA 2VKZG 2QEZA 4QITA 2E5DA 3FKKA 1R30A 3WJSA 1XFBA 3LERA 2QCEA 1AW5A 4N9CA 1DL3A 4M7SA 3NQ2A 1WV2A 3RK8A 5EA9A 4B5NA 1EB3A 3G1YA 1C9DA 1EWEA 3W75A 1EUNA 1O5XA 5K9DA 3EKZA 1OJXA 1XUUA 2CZFA 4IOTA 1F7BA 1G7VA 1S5TA 4YMZA 1LROA 1U83A 3BG9A 4U4MA 3B03A 1GG0A 5C55A 2GOUA 4O53A 3RLVA 3IV3A 3TK7A 3HQ1A 2H6RA 3L21A 4EIVA 3FJLA 3UXDA 1NSJA 3FOKA 3L5MA 3NGJA 3QQ1A 3W84A 4PL2A 5K9CA 5FEWA 3LV5A 3LHTA 2GUUA 2QUTA 3SSJA 2OX1A 4MZYA 1DQWA 1V5XA 3GDRA 4O1AA 4UNLA 5A5WA 3NO5A 4ORMA 3LCLA 1GT8A 4GWEA 5K4ZA 1VYSX 1YYAA 3E0IA 4AAJA 2JGYA 2CLMA 3NM3A 3AJXA 2A6NA 1TO3A 2NXHA 3QMSA 3HG5A 3ZR4A 3KHJA 1VH7A 4JTFA 2Y62A 4O1DA 3QJAA 3NEVA 1SPQA 4HSOA 1VPXA 1MEIA 1FWTA 3KRZA 3DH7A 3IIVA 4HNVA 1K8YA 1XBZA 1L6YA 1LLZA 3K30A 4LVGA 2F84A 3W2LA 3TSMA 3PM6A 3FLUA 1F6KA 1K02A 1H63A 1PCKA 1PCWA 2VEPA 3SW6A 2RH9A 1OFOA 1GVOA 1ZFJA 3P80A 4N2YA 1Q6QA 5FF2A 2F7FA 1H60A 3IVSA 4ZVJA 5C6MA 4N02A 3I7SA 5KINA 1A50A 1JCMP 2B4GA 2RFGA 1N7KA 1VJIA 1A5CA 1JRCA 5C54A 4Y6GA 3DKJA 3LCFA 4NVTA 2P10A 3NDOA 5KZMA 4UMAA 3W7CA 2Y63A 5FEXA 4BF9A 4AHQA 1LCOA 5E0KA 1G4SA 2ZZ3A 1TRDA 5F4WA 2A2IA 3L5LA 3HJZA 2DZSA 3HG3A 1RVGA 3SGUA 5D2XA 3EWXA 4JTEA 4UTTC 2H8XA 5LHEA 3KRUA 3EWZA 2NUYA 2OJPA 3GZ3A 3W73A 1DQXA 4LNYA 2BZNA 1BEUA 5K7JA 2OT0A 3FKRA 4TIMA 2NWSA 2YYTA 3E96A 3IGUA 3R5EA 3P5YA 4H3DA 1CW2A 3LLDA 1UBSA 3A9IA 5AB3A 4JYDA 3CU2A 1J5TA 2WNNA 5KSWA 3RMJA 5DBTA 4IMCA 2EKCA 4IX0A 2FDSA 2TPSA 1KBIA 3PSVA 4TU1A 4OE7A 3E9AA 1LM1A 1CX9A 2DZVA 1YTKA 4C1LA 1GEQA 1LBMA 4DPQA 1OX5A 3N9SA 4NUWA 4S2BA 4E0CA 3L0GA 2BWGA 2QF7A 1E51A 4IPIA 3W3OA 3BLIA 5F4SA 3HPXA 4ZQRA 1FCQA 3ABRA 3W7PA 4O4WA 2C14A 1GVFA 1R2TA 3PBWA 4YCPA 4J9JA 3W1NA 2ZTKA 3W6YA 3PY2A 3S6DA 4BK9A 5FF4A 3IVUA 1TQXA 2ZYFA 4TR9A 2B7NA 1GYNA 3GIYA 3LBCA 1J2WA 2YFOA 3KX6A 2ISWA 3SI9A 2RKXA 3T4CA 4UTLA 2FIQA 4O50A 4IJBA 1LBLA 4O13A 5G2WA 3B0VC 4FNRA 3STEA 1TIMA 1W3IA 1RQBA 1WQ5A 3M0ZA 5A8GA 2WKJA 5H91A 4RLIA 5F2IA 2TMDA 5CZTA 3LCGA 4NJIA 3M5YA 5K2ZA 1YXYA 2ZBTA 3L67A 1PHWA 4WY0F 2TSYA 1MO0A 2UV8G 2FPVA 3A22A 3W2JA 1H7OA 2B7QA 5CPNA 1QNVA 1HL2A 3QW4B 1KV5A 3M5XA 3TQ0A 3TJLA 3GYEA 2QCMA 2YCEA 2R91A 3W70A 4IMFA 2RDTA 4JTTA 1QDSA 3DFOA 4M7TA 1TPEA 3BO9A 1NAL1 5SWUA 1OYBA 3I6RA 1TRIA 2X1TA 2BSLA 2Q8LA 1G69A 4CQ8A 1ZAIA 3ZWTA 3P7YA 2QJHA 2QJIA 3GR8A 3P67A 4DF0A 3W7GA 3G1SA 2TRSA 8TIMA 2CW6A 4DO6A 1NFBA 3M47A 2YSWA 1QCWA 4QSHA 3M5VA 1Z42A 1JCXA 3USBA 4WY0A 4YWIA 1EIXA 1W5OA 1KM3A 1R46A 1TTPA 1DVJA 3NQ7A 3LCIA 2VFHA 2QCNA 2J9XA 5TQLA 2J9YA 2FJKA 3S1UA 3DBPA 3HGRA 4DBEA 3QMRA 4LS0A 4GUJA 3W07A 3W9ZA 3DFTA 3V1PA 4UNKA 1IXNA 4S1FA 3GR7A 3BVJA 1N8FA 3QYQA 3W7LA 5LSMA 1Q6RA 5H2ZA 4M19A 3MO7A 3PUOA 3UD6A 3GAYA 4DO5A 4HPXA 1HG3A 3E49A 3QQ0A 5CSRA 5CPLA 1NF0A 2V5LA 2YGYA 6ALDA 1S5WA 1DORA 1XUZA 4UFMA 1Z41A 4KFOA 1FXPA 1I2NA 1FY6A 1TJRA 3P82A 4X2RA 4HN4A 3BPWA 1ML1A 2Z6JA 3RF9A 4EF9A 3CT7A 4ICNA 1MSSA 1BKSA 3MI3A 4WOZA 5KZDA 1EP1A 5IBXA 3TFXA 4A2RA 3SFKA 3OA3A 2ABAA 1W31A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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