1PIIA

Three-dimensional structure of the bifunctional enzyme phosphoribosylanthranilate isomerase: indoleglycerolphosphate synthase from escherichia coli refined at 2.0 angstroms resolution
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
452
structure length
452
Chain Sequence
MQTVLAKIVADKAIWVEARKQQQPLASFQNEVQPSTRHFYDALQGARTAFILECKKASPSKGVIRDDFDPARIAAIYKHYASAISVLTDEKYFQGSFNFLPIVSQIAPQPILCKDFIIDPYQIYLARYYQADACLLMLSVLDDDQYRQLAAVAHSLEMGVLTEVSNEEEQERAIALGAKVVGINNRDLRDLSIDLNRTRELAPKLGHNVTVISESGINTYAQVRELSHFANGFLIGSALMAHDDLHAAVRRVLLGENKVCGLTRGQDAKAAYDAGAIYGGLIFVATSPRCVNVEQAQEVMAAAPLQYVGVFRNHDIADVVDKAKVLSLAAVQLHGNEEQLYIDTLREALPAHVAIWKALSVGETLPAREFQHVDKYVLDNGQGGSGQRFDWSLLNGQSLGNVLLAGGLGADNCVEAAQTGCAGLDFNSAVESQPGIKDARLLASVFQTLRAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Three-dimensional structure of the bifunctional enzyme phosphoribosylanthranilate isomerase: indoleglycerolphosphate synthase from Escherichia coli refined at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords N-(5'PHOSPHORIBOSYL)ANTHRANILATE ISOMERASE
molecule tags Bifunctional(isomerase and synthase)
source organism Escherichia coli
total genus 166
structure length 452
sequence length 452
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 1991-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00218 IGPS Indole-3-glycerol phosphate synthase
A PF00697 PRAI N-(5'phosphoribosyl)anthranilate (PRA) isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1piiA01
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1piiA02
4QNEA 2B7PA 2WNQA 4W9TA 3TJLA 4DBEA 3UWWA 5LGZA 4OE7A 3DHDA 1I2PA 3PM6A 1EUAA 2DZUA 2GQ9A 4NU7A 3G1HA 1A53A 1EWEA 2H90A 3GDTA 2JK2A 1GQNA 5K2ZA 1GVSA 5LNRA 3P8IA 4K37A 4QISA 3MJYA 4UTTC 1ZAJA 1TPVA 5K9DA 4LVAA 1EPXA 1IGSA 3W7KA 2NWRA 2H8XA 2X16A 3LV5A 5I3GA 1GG0A 4IQLA 1ICQA 4KWVA 5D32A 2VKZG 3EWWA 4ZQCA 4CCEA 3W85A 2ZZ6A 1LP6A 4RXGA 4AH7A 1K02A 2CLFA 2I1OA 4N9BA 1L6SA 2C16A 3TKFA 1SR9A 2RFGA 3C2OA 4P61A 4P2VA 4NVTA 4NUWA 3FJLA 2VC6A 3DHFA 3P84A 2FQIA 3SSJA 2P10A 4HPJA 3LTPA 5D02A 3R5EA 3DBPA 1TQXA 1OK6A 5CGQA 1GT8A 3UZ5A 1LLWA 2X1TA 5TQLA 3IGSA 1YDNA 1AL7A 3OHIA 3W83A 3G3MA 5EBUA 3PB0A 2PRMA 1OFRA 5FEWA 5BRBA 3AJXA 1PVNA 3M43A 2NX9A 2AGKA 3TU9A 2VEPA 2YR1A 3IVSA 1K03A 5DLCA 4UTUA 3DKLA 3PS7A 4O14A 3C2VA 3WK1A 4QAIA 1W0MA 4UTWC 2J9ZA 3TX9A 4UTJA 2DU2A 4RZ5A 1F5ZA 3NQVA 3QMRA 3O1NA 1H7XA 3QQ1A 4O18A 2CLIA 1N55A 4QQ3A 3BG9A 2RDTA 5AYYA 2ZRVA 3NQ6A 1H7PA 4C1LA 3PSWA 4PA8A 3USBA 1GEQA 2A7PA 1KW1A 4Y90A 2WJZA 4RKAA 1V7YA 4JGDA 5CZJA 1DBTA 1AW1A 5BNKA 2QJHA 3MYPA 4N2YA 5EKYA 3E49A 1LOSA 4DELA 4BI6A 1THFD 3BK0A 3EWZA 5D04C 1YDOA 2ZYFA 4PH6A 1TIMA 3QC3A 3LXBA 3QSTA 2QDHA 3C2FA 2QCLA 4RCXA 5MHBA 4NJHA 3EX3A 3MO7A 3TFCA 4UC5A 4MFDA 5D2WA 3GAYA 3CB8A 4AHPA 1JUKA 3M5YA 5KSWA 3QPYA 4K36A 4N4QA 3Q94A 3K30A 3W7GA 4DF1A 1AW2A 1H7WA 1A5BA 2CWNA 3C3NA 4E38A 2Q3OA 6TIMA 1S5TA 2V5LA 4I7WA 3TE9A 7TIMA 4K8EA 4MUZA 5KINA 2ISVA 6ALDA 1GTEA 3WJXA 5IBXC 3TIMA 3VI2A 1L6WA 4Y9AA 1I8JA 1SFJA 3MI6A 1WA3A 2YXGA 4WOZA 2QUVA 1RQEA 2HS6A 4HSOA 3HG2A 3STCA 2Y89A 1FWWA 2CZFA 2GPTA 2PRLA 1W5NA 1YTDA 5D2XA 1DV7A 3GKAA 2CLEA 2B4GA 1NVMA 1GVQA 3SR7A 2ATSA 2VOMA 1FCBA 3GXPA 1WDWA 3G1XA 3TUUA 4Y8FA 4A21A 3W1UA 2GVJA 3IV3A 3LHVA 3QH2A 2YSWA 3BVJA 2QCCA 3H55A 1IXQA 4LRSA 5LNWA 3O6DA 3L5MA 1ZALA 1IIHA 4IX0A 1DL3A 2QCMA 2Y7EA 3MI3A 4XZ9A 1VHCA 1AMKA 4FIQA 5CSSA 4GWEA 3CT7A 3GXTA 4QIUA 1P4CA 1PV8A 2E09A 4Z0SA 1VQTA 3P74A 4NT0A 1DQXA 1W8SA 2VFDA 3A9IA 4MY8A 3NPXA 3F4NA 3CHVA 1YYAA 4X2RA 4TMBA 1TRIA 4MKNA 5D2YA 3W2UA 1FQ0A 4RZ6A 3HG4A 4A29A 8TIMA 1O94A 1VYSX 1YTEA 4AWUA 3SGUA 3MYOA 5CKSA 2H3BA 3G3DA 4GNJA 1WOAA 3HPZA 3QQ0A 3G1YA 1ICSA 1SSDA 3C0JA 3ABRA 3G18A 2OCZA 3MBFA 1K8YA 1PS9A 2WV8A 4O1DA 2KZHA 1KBIA 3LHZA 4UMBA 5DCEA 1LCOA 1LRQA 5I3KA 3VCRA 4LRTA 3W9ZA 2TSYA 5C54A 1Z41A 3C4UA 1FDZA 3EWYA 2GVLA 3BO9A 3OG3A 5HJLA 2D73A 1F7BA 5D30A 3W86A 1N7KA 3MWAA 5FESA 3ABOA 4TR9A 5E93A 5DELA 1EP1A 1OG0A 3BPWA 2YGYA 1LBFA 2ZCGA 2DZPA 1ZY9A 4O53A 1M7PA 3V75A 3W6YA 1NF7A 1E51A 4HNUA 1WYIA 3W1XA 3L0KA 2F7FA 1KA9F 2FTPA 1QPQA 1KFLA 2J27A 4JEQA 1GTHA 3W84A 3DFNA 1JULA 3HG3A 4YWIA 3KOFA 2Y88A 1G7VA 4OV4A 3TMLA 1EUNA 4X22A 2DZVA 5U4NA 4XKYA 3LCIA 3PB2A 1HG3A 2ZRWA 1QR7A 1VYPX 4M5PA 3QFEA 5DN1A 1FWNA 2ABBA 1SO3A 1Q6QA 4NNAA 3U6WA 1SW0A 4IUOA 1ZHAA 4GUJA 4O52A 2E77A 4Z08A 2QDGA 1TCDA 3KFTA 4JTSA 4O54A 3A21A 1W5PA 4UFKA 1T96A 1SQ7A 4ZZ9A 1JQXA 4EF8A 3S1WA 4XUGA 1VPXA 1WX0A 4CQ9A 1GVRA 4ADSA 4E2DA 2QCHA 4EOUA 3W07A 4ZQNA 2OX1A 4WY0A 4YL2A 3UPWA 4ICNA 1I4NA 1A5AA 1SZEA 4GJ1A 1TV8A 2WSRA 3DXIA 5F4XA 1ME8A 4UUIA 2E6DA 3S1UA 3SFKA 3P60A 4FHAA 4LVFA 4HN4A 5DY3A 1B3OA 2FB3A 4JN6A 3P81A 4MLRA 4PC8A 3UD6A 1O5KA 3G1DA 3NM3A 1U5JA 2A1YA 3HO8A 3W73A 1QAPA 3HJZA 2G95A 2ZDRA 5I3FA 1Q6RA 3M16A 4IMCA 2QEZA 2CLMA 4O17A 3OEXA 1PHQA 1L2UA 4NZJA 2VFEA 5F4SA 3NQAA 3ABSA 3CC1A 3RU6A 4GXMA 5CZ0A 3NQGA 3O8AA 1WBJA 3RNDA 2J9XA 3N19B 1UJPA 4J9JA 1OYAA 3BLFA 1O4UA 2NXHA 5AYZA 1GZGA 1RQHA 2AAMA 2I14A 3LCWA 3SECA 3B04A 3NL3A 3EWBX 4O12A 5HR7A 5E0KA 4AVFA 2V2CA 1OX6A 3W75A 1P0NA 1WV2A 1L9WA 2EAWA 3LRLA 1KLZA 4K7YA 1X8FA 4K7VA 4KFOA 4ZMGA 1CW2A 1KTNA 5FF2A 3G1SA 3QZEA 4IOTA 4S2CA 3TROA 3GKFA 5HWMA 3TFXA 3TSDA 3KVJA 5KZDA 2QCDB 3M41A 5DCBA 3GVGA 2YX0A 3O63A 3SGZA 3SIZA 3UWUA 1Q3NA 2RH9A 3CWNA 1IXPA 1N8FA 2DJXA 1SO5A 4UTLA 1M6JA 4MPQA 3IGUA 4X3ZA 3S9YA 1TTPA 4L4MA 1D3HA 3PG9A 3T78A 2ZA1A 2FFCA 5G4EA 4UFJA 1NAL1 2NUYA 3EX2A 4LTSA 3WJSA 5HUOA 5CPLA 5D2TA 5DBUA 4NNCA 3L2IA 1Z48A 1G4SA 4BI7A 1LORA 3NDOA 1QPNA 5DXXA 2DZWA 1W3NA 4CCCA 1H50A 3NO5A 3O05A 1HFBA 4HSNA 3NAVA 2OMAA 3FIGA 4OU1A 4BWLC 1MSSA 1MEIA 4ZL1A 4ZQMA 4FF7A 1OJXA 1HO1A 3HGRA 3S0CA 3BGGA 3LGEA 1FUYA 5LSMA 1VJIA 2VFIA 1QPRA 4PFMA 4MZ8A 1WAUA 2BWGA 5DXYA 3EKZA 3EXRA 4UFHA 5LNSA 4LOCA 3L68A 4LV9A 2QCFA 4AMAA 2JGYA 2ZQ0A 1S5VA 1ZCOA 3NOEA 5D09A 1SO4A 3W7HA 1KBJA 5I3JA 4KFNA 4JR5A 1Q45A 3W1PA 3S1XA 1SZFA 2NX3A 1R47A 2Z1BA 3CQ0A 1FWRA 1QMLA 4FNPA 3W70A 3QYQA 3VE7A 2FJKA 4JTTA 2R94A 5FI8A 2J9YA 3A5FA 3PULA 1FCUA 3E96A 2QCEA 4O28A 2EKCA 3HOJA 4CQ8A 2B7NA 2ZRUA 1PIIA 4ZQRA 1JR1A 2ZZ7A 4O13A 2E5CA 2FB2A 1MEHA 3WJZA 4DPQA 1LDCA 3P80A 3NZ1A 1FWSA 4MZYA 3F03K 5EL1A 5G4WA 1NSJA 3HGSA 3IIVA 1U83A 5H2ZA 3WJWA 3DFTA 3HGJA 2C19A 4NNBA 3THQA 4DO4A 3VFLA 3M5VA 3IIPA 4S2BA 3B0UX 2XN1A 3C6CA 1WOBA 2VELA 3HBLA 4UCGA 1OX5A 5A5WA 3B0PA 1RV8A 3VKJA 5E1QA 3CPRA 4WOQA 3CU2A 2V82A 3L66A 3DH7A 3TMQA 4TMCA 3W22A 3GDLA 2ZA3A 4NZFA 3T4CA 2FPYA 1QWGA 2V9DA 3G22A 1XUZA 2IQTA 4WX2A 3B4UA 3P8JA 1W3TA 3TC6A 1LLZA 2I9EA 3LLDA 1EB3A 1EEPA 4ADTA 2R8WA 3GXNA 1R2TA 4QSHA 3N3MA 1L6YA 3WFAA 4DPPA 1X6UA 1G4TA 5LGXA 3UPBA 2C13A 4Q32A 3B0VC 2PC4A 3W7JA 1R46A 1QCWA 4Z1AA 1XM3A 4FB7A 5H91A 3C56A 2OZ0A 1XCFA 4HT3A 3TAKA 1W3IA 4MVAA 4KFPA 4RV8A 4FO4A 4LVBA 4RJEA 3MP4A 4XQ6A 3YPIA 4GBUA 4DQWA 3O6CA 3QMSA 3ABQA 2YW3A 2VENA 4OV9A 3NQ2A 2A7NA 3G1AA 4M7SA 1OFEA 2ATMA 2QUTA 1O60A 1ZNNA 3DGRA 2YPIA 2PURA 4IXHA 3CEPA 2A6LA 1W56A 3ATYA 4A2RA 3DFSA 1LYXA 1AL8A 3I7RA 1I45A 4O1AA 3RMJA 4RZ4A 1OX4B 3W1RA 3TW7A 1KFEA 2NUXA 3O6YX 4O11A 5AYXA 1QO2A 3W2NA 1OFBA 4HNNA 3W7MA 3GR8A 3GB6A 1O5XA 2JKAA 3Q2DA 2BX7A 1ADOA 1EX5A 4YLWA 1AK5A 3LB0A 2WO5A 3CIWA 4AWSA 1PE1A 2FLIA 3WJYA 3LERA 5D03A 5K4ZA 3UZJA 4ALDA 2V2HA 4IWWA 1UASA 4O16A 4AAJA 3W1AA 1H61A 2OJPA 5KZEA 3G1FA 3LXAA 5EY5A 1ZAIA 5D05A 2ZZ5A 1T8XA 4POCA 2CLLA 4FX6M 1SPQA 1K7EA 5FF4A 1ICPA 4DO6A 2C14A 4CQAA 3KRUA 4MJZA 4GUHA 5AFDA 1TPFA 2QAPA 1EP2A 3OVQA 4FNRA 5C6MA 2CZDA 5HULA 2NXGA 4FNTA 5BW6A 3PUEA 1QDSA 1JCNA 3MP5A 3W7DA 1YADA 4BF9A 1TJRA 4UR7A 2Q3RA 3TQ0A 3UWYA 2ZZ4A 4DF2A 3NQFA 4GUGA 1P0KA 2R14A 3TXVA 3W7RA 3RF9A 1EWDA 4K38A 5TIMA 1WBHA 4HHPA 1ONRA 1MZHA 4N02A 5EA9A 1VC4A 4AWTA 4MY9A 3EWUA 5CG7A 3LCFA 2Y7FA 1PL9A 1H1ZA 5L6UA 1UUOA 1QOQA 5FF7A 4NX5A 1K7FA 4XBSA 3FA5A 3KX6A 1H7NA 2YW4A 3C61A 4UTWA 3CWOX 5HINA 4GFSA 3BLIA 4X9SA 4XTDA 2A5HA 1JCLA 2H6RA 3EX6A 3MW7A 4LNYA 2QAFA 3FS2A 3T40A 1F05A 4BI5A 1VCVA 3LHUA 2JKEA 1W31A 3IVTA 3IVUA 4I7UA 4PL2A 1KFJA 4U4MA 5K4XA 1Q6LA 1PHWA 1KFCA 1SZGA 1OYCA 3I68A 2P1FA 1JRBA 2YYUA 1P5BA 1FCQA 4RR4A 3AO0A 4Z0JA 1VR6A 5BMXA 1F6PA 2A2IA 2Y63A 3PBVA 3FKKA 4NX0A 2Y7DA 3UNDA 1LBMA 3R2GA 3BLEA 2NV2A 2C1HA 2O7SA 2A7RA 2QCDA 1J4EA 5A8GA 4EWND 1B4EA 1LZOA 1FDJA 2ZRZA 3ATZA 4YCOA 2J24A 2J88A 1KFBA 2XN0A 4A3UA 2FIQA 4DEFA 4UFIA 1K8XA 1TSIA 3FYPA 4CNPA 1TB3A 3DFOA 1ALDA 2WOQA 3L5AA 3A22A 5K9CA 3PSVA 3O07A 4GUIA 3FFSA 2G5WA 5D2VA 5IBXA 4Z1BA 3TV8A 2V0TA 4JIQA 3CTLA 2EGZA 3PWAA 1S3HA 5KITA 1KV5A 2B7OA 3IIZA 4UTIA 3W2LA 4BFAA 1OK4A 2LLEA 3CM4A 2VFHA 3INPA 3LBMA 3GX9A 4CLMA 5D38A 4IMGA 4N9CA 5AHLA 1OFPA 3N2XA 1VYRA 2QCGA 3UY7A 4M6VA 4Z1CA 2CU0A 1TREA 3M5ZA 4QNWA 4GC4A 3W7OA 4MLJA 1H63A 2Y7GA 3I7QA 1UCWA 2QUUA 4AF0B 1OFQA 2JKPA 3OBKA 4CNNA 3G1VA 3LOTA 4HPXA 1HTIA 1V5XA 3LXCA 5CZTA 3T7VA 4NJIA 1VZWA 3THAA 3NNTA 3W7CA 2TPSA 1KV8A 3P5ZA 5BOOA 3BW2A 1KM4A 3NXFA 1JCJA 2CW6A 4UNLA 4O1BA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3MMU A;  1BVN P;  2WNQ A;  1ZJH A;  1AVA A;  2P50 A;  2EJ1 A;  4X2P A;  2D69 A;  4GCX A;  4C6C A;  3DHD A;  1I2P A;  3PM6 A;  4M82 A;  5CAH A;  3BMX A;  2ZX7 A;  5GPR A;  3G1H A;  1A53 A;  3GR4 A;  1MWO A;  3GDT A;  1GQN A;  1UD4 A;  2Z29 A;  1R3Q A;  3QGA C;  1C93 A;  4K37 A;  2QUN A;  1BRL B;  4LVA A;  1I1X A;  2HRW A;  3W7K A;  4I6V A;  2X16 A;  3LV5 A;  3FK4 A;  4N7Q A;  5I3G A;  1GG0 A;  3ZT7 A;  1MRA A;  3EWW A;  4ZQC A;  4CCE A;  3E3H A;  2ZZ6 A;  4W5U A;  4IJR A;  1A0E A;  1K02 A;  2DT1 A;  4FMV A;  5TF0 A;  2X8R A;  3TKF A;  1SR9 A;  2RFG A;  3V4B A;  4P2V A;  3AYV A;  3PZI A;  2WMJ A;  3MU7 A;  3HZ3 A;  1Q65 A;  1OK6 A;  5H6H A;  1GT8 A;  1R7O A;  3UZ5 A;  1W9X A;  5DRC A;  2OXN A;  3IGS A;  1YDN A;  4MB3 A;  3OHI A;  3W83 A;  5EBU A;  3PB0 A;  2PRM A;  2DQX A;  1L8P A;  5BRB A;  3M43 A;  4XUY A;  2PZN A;  2FMO A;  4B3L A;  4MKS A;  2J9Z A;  1M53 A;  3TX9 A;  4KWU A;  4QQ3 A;  4GX8 A;  1BVZ A;  2RDT A;  5AYY A;  1LL4 A;  1GGO A;  3USB A;  3SUU A;  2WJZ A;  4L65 A;  5CZJ A;  4JZ5 A; 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