1QCWA

Flavocytochrome b2, arg289lys mutant
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
410
structure length
385
Chain Sequence
TKEDIARKEQLKSLLPPLDNIINLYDFEYLASQTLTKQAWAYYSSGANDEVTHRENHNAYHRIFFKPKILVDVRKVDISTDMLGSHVDVPFYVSATALCKLGNPLEGEKDVARGCGQGVTKVPQMISTLASCSPEEIIEAAPSDKQIQWYQLYVNSDRKITDDLVKNVEKLGVKALFVTVDAPSLGQKEKDMKLKFSKFIDPSLTWKDIEELKKKTKLPIVIKGVQRTEDVIKAAEIGVSGVVLSNHGGRQLDFSRAPIEVLAETMPILEQRNLKDKLEVFVDGGVRRGTDVLKALCLGAKGVGLGRPFLYANSCYGRNGVEKAIEILRDEIEMSMRLLGVTSIAELKPDLLDLSTLKARTVGVPNDVLYNEVYEGPTLTEFEDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Kinetic and crystallographic studies on the active site Arg289Lys mutant of flavocytochrome b2 (yeast L-lactate dehydrogenase)
pubmed doi rcsb
molecule keywords FLAVOCYTOCHROME B2
molecule tags Oxidoreductase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 135
structure length 385
sequence length 410
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.2.3: L-lactate dehydrogenase (cytochrome).
pdb deposition date 1999-05-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01070 FMN_dh FMN-dependent dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1qcwA01
3IIVA 1TQJA 3GK0A 5I3KA 4ZQMA 4NU7A 2Z6JA 4WXZA 5D03A 1EB3A 3O06A 4HNNA 2QF7A 3HB9A 2GQ9A 2Y61A 2E5DA 4PL2A 5EY5A 3TJXA 3W87A 1OF8A 1KM0A 1B3OA 4TIMA 1KBJA 1VYPX 2JBMA 1OG0A 1VHNA 1BEUA 3UZJA 3IRDA 3W2NA 1JRBA 3RU6A 1F5ZA 4B5NA 1F05A 1FY6A 1I4NA 4NQ1A 1XBXA 1PCWA 3OHIA 4S2CA 3NA8A 4PFMA 5AC7A 1P1XA 1SQ7A 4BR1A 2DJLA 2VFEA 3RMJA 1F7BA 4IXHA 3P74A 2QAFA 3STFA 3N14A 3B0PA 5L9FA 2PURA 5KSWA 3W23A 4UNKA 3O07A 2LLEA 2RHGA 1QCWA 3QW3A 1JJKA 5AHNA 2JKPA 1PVNA 1Z42A 4TX9A 5DY2A 1SZFA 2HMCA 2QCHA 3W75A 5EKYA 3G0UA 4QIUA 3E9AA 3ZFHA 1TPB1 3ZWSA 3WFAA 2ZTJA 1B4KA 1TMHA 3G1DA 5LHFA 1ICSA 1VS1A 1Y0EA 1R2TA 4HPJA 4ADTA 2C14A 2QCEA 3L0KA 1I2NA 1VLWA 2X1SA 3FIGA 5BMXA 1ZAIA 4MY9A 4ZZ9A 1S3HA 4ZL1A 4MYXA 5U4NA 4TR9A 1JUEA 2OT1A 1Z41A 4FF7A 4GRSA 2NUYA 1QMLA 3BW3A 3CHVA 4UTIA 4O0ZA 4FNSA 1KBIA 1Z48A 3PBYA 4FXSA 1QOQA 1WBHA 3IV3A 4UMCA 3WK0A 3LHWA 1GT8A 2QDGA 2RDTA 5FF2A 1WYIA 4IMDA 1XL9A 4UTKA 1P0NA 1Q6LA 4HIBA 5BMWA 4Z1AA 1TV8A 3G22A 4ICNA 4AVFA 4O18A 2DZTA 5I3FA 5BRBA 2QDHA 2QJHA 2CLOA 3W70A 3L9CA 4FIQA 3WK1A 1TRDA 3O6DA 1HO1A 1SO4A 4QJ1A 1QDSA 3GVGA 1F6PA 5D2XA 2TYSA 4FO4A 1XM3A 4JTFA 4M6PA 3HPXA 2Q8ZA 1XUZA 2ZZ7A 5CPNA 3EWUA 2Z2UA 1Q6QA 4PODA 4JXCA 3WJSA 3W7CA 2EHHA 2NV1A 3F4NA 1Q6RA 3DFPA 3W86A 3LERA 3TC6A 2Q3RA 4OHQA 3G3DA 3EWZA 5BW6A 3M41A 1LORA 3IIXA 5AYZA 4N4QA 3U6WA 4FXRA 3WJWA 3SIZA 1FCBA 3S5ZA 2DP3A 3I7RA 1TPEA 4N4PA 2X2GA 2X16A 3PB0A 4K7VA 3TKFA 5K7JA 2YX0A 2E77A 1KM2A 1FCVA 4MUZA 5AOUA 4PA8A 1E51A 3KVKA 1ALDA 1F73A 2XN2A 4MJMA 4N2YA 1TPFA 2YSWA 4UTLA 3GLCA 3JS3A 3BLFA 3TC7A 3PVFA 3P67A 3W88A 3NQ6A 1K02A 3UWZA 3R89A 2VFIA 1TV7A 2XN1A 3C2OA 4O16A 1RV8A 1F6KA 1ADOA 1ICQA 3PBWA 3DFOA 4JDBA 4Q32A 2VC6A 1RQHA 5G1TA 2V81A 2X1RA 1QPRA 1EA0A 2WQPA 4R7JA 4AHQA 3C2FA 4JTGA 2V8ZA 5J5RA 3EX4A 3LXAA 2TMDA 3LHYA 1LCOA 1H7OA 2EGZA 1VRDA 1Z44A 3W6YA 3CLMA 5FEWA 1TQXA 1GPWA 2J6XA 4Y96A 1KFLA 4YCOA 1S5VA 5HWMA 2GJLA 3G1SA 1ML1A 4LRSA 4HT3A 5CPLA 1XFBA 3M43A 4MPQA 3LCLA 3P5YA 4LUIA 3T7VA 2B7OA 5D2YA 3NQGA 2FIQA 2DU2A 5A5WA 3LHVA 3DFTA 3GNDA 5FESA 3THQA 3UXDA 3C0JA 2PRHA 3T40A 2QCFA 3G1FA 3LBCA 1EEPA 1MSSA 3TU9A 3LHUA 4RV8A 3FKKA 2YCEA 3NM3A 5FI8A 3JRKA 1RPXA 2A7RA 2VFDA 3TSMA 4PC8A 3LB0A 3MW7A 3S9YA 2OT0A 4KFPA 5HWJA 4GUHA 5CZTA 4UNLA 4OU1A 1G4TA 3G18A 2A1YA 1A5AA 4XZ9A 5F2GA 4RJEA 2DZPA 1XDMA 3NL6A 1K8XA 4JTEA 3KRSA 3LTSA 2QUTA 1LROA 5CPMA 3CQ0A 1JCLA 2CLKA 3BPWA 2OJPA 2ZDRA 1CW2A 1YYAA 1NFBA 3L0GA 1OFQA 2V0TA 4WY0A 3NQ2A 1CX9A 3NQMA 3PF3A 2P10A 4POCA 2A6NA 1VR6A 1BWLA 4CCCA 5HMSA 3W1UA 4FX7A 2VFFA 5EA9A 4GJ1A 1SPQA 3FS2A 2ZCGA 2CZEA 1YDVA 2YFOA 3LTPA 1KTCA 2A2IA 3A23A 1H50A 1G67A 3R8RA 3O63A 3TDFA 5AYXA 2E6DA 3LRMA 4EVZA 3GX9A 5A8GA 1W37A 3DHDA 1VC4A 1TB3A 4H3DA 3IEBA 1C8VA 3GKFA 4H4IA 3OG3A 2DZWA 3IIZA 4HN4A 4E0CA 2ZZ6A 2NXHA 1SW7A 4A2RA 1EUNA 4UCGA 4Z08A 2DJXA 1K7XA 1QFEA 3O15A 3QF0A 5LKYA 3DKLA 4O12A 3PAJA 5F2LA 1ZALA 3O8AA 4LY8A 4IGHA 2FPYA 5SWUA 4O15A 2ABAA 3S1UA 4JTLA 5D2WA 2E6FA 1NVMA 3W1XA 2NXGA 2PCQA 4ADUA 1VGAA 1X7FA 1V7YA 4U28A 3W2MA 4UFIA 1YLVA 1H61A 1SZEA 4FHAA 4WY0B 3P8JA 3W84A 3NL3A 4N6FA 3VI2A 3M1ZA 2ZZ5A 4IOTA 5G5IA 2FDSA 4O1DA 1H63A 1YPFA 3YPIA 1BWKA 4NVTA 1IXNA 4Y90A 1EIXA 1EWEA 1SO5A 3SGZA 2C18A 3P80A 1KTNA 4KFNA 4TMBA 4W9TA 1C9DA 1UASA 4FNQA 3UNDA 2CZ5A 5D32A 2YR1A 3GB6A 2IQTA 1DQWA 4IXXA 5KITA 3LHZA 4X22A 1XBZA 1I2QA 4O52A 3QMSA 2TPSA 3LI0A 5ABTA 1W31A 4PCFA 3G1AA 1EP3A 3IVTA 2V5BA 2W6RA 1AW1A 4DF0A 1VQTA 2WNNA 3C4UA 1ZJIA 2GQ8A 3KXQA 2E6YA 1FDYA 3F03K 2QCCA 2PRMA 2NXIA 4K8HA 1PHWA 3TNOA 1M6JA 5MHBA 2R14A 3EX3A 5TQLA 2FB2A 4LOCA 1HFBA 4N9DA 5AHIA 4O4WA 1WAUA 2VEKA 4DF1A 1JCYA 4QAIA 3GAKA 1OHLA 1GG0A 3KVMA 4MIMA 5DXYA 5KINA 3GXTA 2DZUA 2ZA1A 3M44A 5H91A 3DZ1A 3S5YA 1TPUA 2YYTA 1A5SA 1IIGA 2I1OA 5LSMA 2Q3OA 1P5BA 3TW6A 3H55A 4JD4A 2RDWA 2ZQ0A 3ZR4A 3C2RA 1FXPA 1ZHAA 4LU0A 3LHTA 1AMKA 3S0CA 1EP1A 2NX3A 4FIRA 3NEVA 4XQ6A 1QO5A 1KW1A 2CW6A 5DCBA 5DLCA 2QJIA 2RFGA 4H6KA 3P5ZA 4JR5A 1LBLA 5F4SA 3ZS4A 2J9YA 4LS0A 4CNNA 1WOAA 4UTWC 5FF3A 3G24A 1O5XA 3IVSA 1GZGA 1YDOA 4LVDA 5D37A 3NR0A 3QH2A 4XTDA 3N2MA 5F1UA 3TMQA 3A9IA 1OFEA 1OVDA 1R46A 2V2CA 4LNYA 1D9EA 1ZY9A 2ISWA 1OX5A 1W5QA 2XFWA 4WQ6A 1GVOA 2H6RA 4MVAA 2FPTA 7TIMA 2ZA2A 5DBUA 3IGXA 4MZ8A 2B4GA 5CZJA 3NPXA 3LCXA 3MO7A 4K8EA 5FEZA 3O6YX 4J9JA 3RNDA 2ZRZA 1ZCOA 2E68A 1XUUA 3H54A 1DQXA 2YDAA 3M9YA 3LTYA 4DELA 3HGJA 3SSJA 1H7WA 3EX1A 5HINA 2J24A 1SUXA 4N9BA 4ORIA 1LM1A 3S1WA 3L68A 1SZNA 1GJPA 1FWTA 2WKJA 5CG7A 3MHFA 2AQWA 3L0NA 3UPWA 3LLDA 2Y89A 4X3ZA 2VFGA 1M7OA 1KA9F 4HHPA 5EBUA 2EF9A 3ABRA 4XWUA 3N19B 3KRZA 2Y6ZA 3BV4A 5AHFA 3NYZA 2F84A 4RKAA 1I2PA 1DV7A 3GDRA 3R13A 2EKCA 1H5YA 5KZEA 1FX6A 2ZZ2A 1T96A 1EX5A 4M6QA 1YTEA 5TBOA 4CQ9A 1N7KA 4KKXA 1JCMP 2VOMA 3DU0A 1FDZA 5EPDA 3TK7A 1TIMA 3L65A 4KWVA 4NXKA 4JGDA 3QQ1A 3W22A 1J5TA 2ZA3A 1WDWA 2BTMA 4XTIA 1GYLA 2CU0A 3I7QA 3QYQA 1EP2A 3LCFA 2BZNA 2WSQA 3U2OA 3N73A 3F1QA 2GVJA 3A24A 4RR4A 4CQ8A 3NQAA 4GXMA 3MP4A 3W7JA 1VPXA 4UMBA 3CPRA 3QQ0A 1JR1A 5DCEA 3NNTA 3RLVA 5IBXC 3UPBA 3GNNA 3QMRA 1RR2A 2QR6A 1LYXA 3T78A 2GOUA 3R5EA 3QSRA 1XKYA 2CZDA 3UXAA 3B03A 1K7FA 4QNWA 4CCEA 3I65A 3W7RA 2FFCA 3TA6A 3W07A 5FF4A 5F4WA 1PE1A 4AMAA 3PBVA 4LS1A 4Z1DA 1LOQA 1M5WA 1XCFA 1Q45A 3G1XA 4JYDA 3HG4A 4O4VA 3L21A 3ANYA 4KFOA 4PL1A 3TX9A 4ZQOA 2CLEA 3W7PA 1W5NA 4LC6A 2Y7GA 1G6CA 1R30A 4WY0F 1Q3NA 1DL3A 3UZ5A 1NAL1 4DO6A 4YCPA 5TIMA 1V5XA 1LDCA 1ME8A 4RCXA 1WQ5A 5D2TA 2WPBA 3GKAA 4R34A 4E2DA 4RZ5A 4RLIA 1WXJA 1KFKA 5LNSA 3ELFA 4X2RA 3QC3A 1LRTA 4RK8A 5G4WA 2X1UA 1FUYA 3NQDA 1WA3A 2ZTKA 3SY5A 1ZFJA 3FJLA 3KVLA 2R8WA 4ADSA 1W3IA 4E38A 1N8FA 3UWQA 1QOPA 3UWVA 3W7NA 1O60A 4GUFA 1TPDA 1FCUA 4UIOA 4Q33A 5I3JA 2FPVA 3W83A 1FCQA 3EXSA 3MMTA 3NQEA 4UFMA 2QCDB 4FX8A 2I9EA 5G2HA 1A5BA 3QEZA 3TROA 5HJLA 2NX1A 4MKNA 1MEHA 2WO5A 4N9CA 5D38A 1RVGA 1GVRA 2J27A 5DELA 3TFXA 2QAPA 3PUEA 2V2DA 3C2EA 2VEIA 4WUIA 1HL2A 1LZOA 1FBAA 1H1YA 1SSDA 5C6MA 2ALDA 4JX4A 1UBSA 4FNPA 4AWUA 1XXXA 2H3BA 3BO9A 2B7QA 4O11A 3LRKA 3NPVA 1GVQA 3B0UX 2QJGA 2VENA 3LXCA 3TAOA 1UUMA 1B57A 3BLIA 3HBLA 4WXYA 4ZQPA 4ZMGA 1JCXA 4LVBA 4EF8A 2V2HA 1SU5A 2CZFA 4MY1A 1H62A 3W7MA 4O10A 5G1YA 2EPHA 2AAMA 4GUGA 3IIPA 4K39A 4XBKA 3P61A 1HUVA 4JTJA 4MY8A 2G95A 3BARA 3GR7A 4FB7A 5DXXA 2P0OA 1VYSX 4ONVA 3T44A 2ATSA 4YWIA 4WJEA 3WK2A 4UTTC 1Q6OA 2BXVA 3HG2A 4K36A 3G1VA 2G97A 2NLIA 3TQKA 4NT0A 4PEKA 3S5OA 1OFAA 3NQ7A 2OX1A 2C16A 3IGSA 1YPIA 2Y7FA 3CIWA 3W72A 4AB4A 4XKYA 3UY7A 2ZZ3A 1NEYA 1W0MA 4GC4A 3SR7A 4AHOA 1QPNA 5T26A 1J2WA 1ICPA 1W3TA 1W1ZA 3W7LA 3FEMA 3LBMA 1LBMA 2RDUA 1O5KA 3DI0A 3PWAA 1BTMA 3W1QA 1O95A 3NQ8A 3QRHA 1UB3A 2W79A 3HOJA 3Q58A 1BKSA 2WNQA 2Y85A 3FKRA 4OQVA 3MI3A 3MYPA 2A4AA 1FDJA 1AG1O 4O54A 5G2IA 3HPSA 3USBA 3Q94A 1IGSA 4QNEA 1XBVA 4AWTA 5DN1A 2DZXA 5K9CA 3S42A 2TRSA 3HG5A 1AK5A 3LXBA 3QJAA 5AYYA 1YXCA 4Z1BA 3Q2DA 3MP3A 4HSNA 3MJYA 3PY2A 3N34A 1QWGA 3W71A 4BF9A 3TQVA 5HQEA 2ZRUA 1TTPA 1ZENA 3ABSA 3A5VA 3B06A 3LDVA 2YZRA 3BW2A 3CC1A 2ISVA 3MWAA 5HNRA 1JQVA 2CLMA 5AN7A 2Y63A 4DPPA 1QPOA 3A5FA 1SZGA 4OGZA 4DF2A 3W3OA 1GG1A 1T99A 4M5PA 4Q4KA 1OK4A 3PG9A 2DORA 2O7SA 3W1MA 1GWJA 1TSIA 4LC8A 4WOZA 3TQ0A 3W7HA 5FEPA 1RQEA 1TJRA 1W54A 4DEFA 1ME7A 3BK0A 4UTMA 1EWDA 4U4MA 2A0NA 4AXKA 3CEPA 3HJZA 2QEZA 5DY3A 4XKYB 5AHEA 3EWBX 3W7IA 1OYCA 4ZVJA 1P4CA 2PC4A 4JNMA 5F4XA 3SFKA 3FYOA 4DBDA 3UWWA 1K3UA 3IGUA 3NOEA 1MEWA 4NZFA 5HUPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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