1QCWA

Flavocytochrome b2, arg289lys mutant
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
410
structure length
385
Chain Sequence
TKEDIARKEQLKSLLPPLDNIINLYDFEYLASQTLTKQAWAYYSSGANDEVTHRENHNAYHRIFFKPKILVDVRKVDISTDMLGSHVDVPFYVSATALCKLGNPLEGEKDVARGCGQGVTKVPQMISTLASCSPEEIIEAAPSDKQIQWYQLYVNSDRKITDDLVKNVEKLGVKALFVTVDAPSLGQKEKDMKLKFSKFIDPSLTWKDIEELKKKTKLPIVIKGVQRTEDVIKAAEIGVSGVVLSNHGGRQLDFSRAPIEVLAETMPILEQRNLKDKLEVFVDGGVRRGTDVLKALCLGAKGVGLGRPFLYANSCYGRNGVEKAIEILRDEIEMSMRLLGVTSIAELKPDLLDLSTLKARTVGVPNDVLYNEVYEGPTLTEFEDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Kinetic and crystallographic studies on the active site Arg289Lys mutant of flavocytochrome b2 (yeast L-lactate dehydrogenase)
pubmed doi rcsb
molecule keywords FLAVOCYTOCHROME B2
molecule tags Oxidoreductase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 135
structure length 385
sequence length 410
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.2.3: L-lactate dehydrogenase (cytochrome).
pdb deposition date 1999-05-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01070 FMN_dh FMN-dependent dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1qcwA01
1LBMA 4DF2A 3PY2A 3P5YA 5G1YA 4PL1A 3P8IA 2NV1A 3L2IA 5D2TA 2HS8A 1ZY9A 2FTPA 3EB2A 3GAKA 2DZTA 3NQAA 4N9EA 1DORA 3TR2A 1FX6A 4Q32A 2ZRYA 4ADSA 5FF2A 3W7QA 1TIMA 2ZRWA 5HJLA 5J5RA 1W31A 1AK5A 4JDYA 2ISWA 4AVFA 3TH6A 1YXYA 4QJ1A 3JS3A 3PUOA 1O94A 3GVGA 2PE4A 3IGUA 3MP3A 4HHPA 2ZA3A 4IMEA 4FNQA 1OX5A 3KVMA 2RH9A 4I7WA 4CQAA 2Z6JA 4ZVJA 3W85A 2QKFA 1SO3A 1H7XA 2EGZA 2X1SA 3F03K 1O5XA 3G3DA 3S0CA 4FIQA 5AN7A 4QAIA 4WZHA 1IXNA 3HJZA 3TSDA 1ZNNA 5FF0A 2Y62A 5SWUA 4IUOA 3MHFA 1JR1A 1Q6QA 4X9SA 1MO0A 3N14A 4Y6GA 3NQVA 3QW4B 3A24A 2VELA 1FUYA 1G4TA 3C3NA 1W5MA 3ZWTA 1AW2A 1TPUA 1QNVA 2G95A 1W5NA 4WOZA 1OFEA 4MY9A 1XFBA 4AH7A 4A21A 3TW6A 1VCGA 5DN1A 1FWNA 3NQDA 4R34A 2ZDRA 1W5PA 1I2OA 4AEOA 2JKPA 3HBLA 3Q94A 2ZRZA 4HPXA 4ZL1A 4BR1A 4H3DA 2QUUA 3MMTA 1R2RA 2QCCA 3M1ZA 3T40A 1PVNA 3RK8A 1OK6A 3B03A 3M5YA 2WSQA 3O1NA 1P5BA 1JVNA 1UASA 5D02A 4B5NA 3W1QA 3QH2A 4KFPA 4O17A 2B7QA 1K8YA 3EWBX 5G2IA 1RVGA 3HMJG 1YDNA 1ZCOA 1EP2A 2HMCA 5EL1A 5FEWA 4WOQA 2YCEA 3FYOA 1KFKA 4XKYB 5DCDA 3T4CA 4A22A 3CM4A 3ZFHA 2NUYA 5G2HA 2E68A 2C14A 4JTHA 3RNDA 3WJYA 4S2CA 1A5CA 1I2PA 1OYCA 6ALDA 5CPNA 2J9ZA 2H3DA 3GXTA 1TQXA 2R14A 3C2OA 4YXGA 1OK4A 5CZTA 3GB6A 2QCDA 2VFGA 1EIXA 1FDZA 4LC8A 5G4EA 1UUOA 3M44A 1H7WA 2I14A 1JUKA 1GVQA 1FBAA 2Y85A 1FQ0A 2KZHA 3LM7A 1N8FA 3G1HA 4NX0A 4N9DA 2QUTA 1XBYA 2W79A 1SPQA 1TTPA 4MOZA 1P0KA 4JIPA 3QJAA 3LB0A 1IIHA 3NEVA 3CB8A 3MI2A 5AFDA 1S3HA 5HNRA 1JRBA 1QOQA 3Q37A 2NLIA 2ZZ2A 4PEKA 3L5AA 2ZRUA 1OHLA 2F84A 3HGSA 3STFA 1KM3A 2EAWA 4TO8A 4UR8A 3UWVA 3C6CA 5L6UA 2QCLA 2B7NA 3GAYA 2XFWA 3S1UA 1JJKA 3OVQA 2X2GA 3GXNA 3TQVA 5AOUA 1WDWA 5F4XA 5D2YA 2QCNA 3IIVA 2ALDA 1F74A 3NL2A 1GT8A 3CWOX 1KW1A 3C2VA 1W5OA 2H8ZA 4QITA 3FJ6A 4LUJA 3LHVA 2X30A 2J9XA 4RCXA 4HKPA 3C8FA 2DZUA 4DELA 3R2GA 1K8ZA 2FDSA 5KSWA 4OE7A 3Q2DA 1Z41A 1CX9A 2LLEA 4NJJA 5KZEA 4FNUA 1A53A 4YWIA 1IXPA 4AHOA 2CLMA 2CZ5A 4UMBA 2J6XA 1OFBA 3PBWA 1SZGA 3WK0A 4JX6A 3N2XA 3GIYA 3QMSA 4X22A 4H4IA 1NFBA 1DHPA 2BZNA 1B57A 3WK3A 3FEMA 3IGXA 3HG4A 4AMAA 4HIBA 4OQVA 1TMHA 3FFSA 2CLEA 4BWLC 4PCFA 2VENA 4FHAA 3HPSA 4GUJA 3FJLA 2W6RA 1XI3A 4OV9A 2TRSA 2G96A 3I7RA 3N34A 3EXTA 1H63A 2A0NA 5HR7A 1KFLA 2A7RA 1E51A 4AWUA 4FXSA 2CU0A 1HO4A 3DKJA 3G0XA 1BKSA 1J4EA 5AC6A 1G6CA 3PBUA 4LY8A 3F4NA 5TIMA 1TREA 2NX3A 4N02A 4UXDA 2YR1A 1WV2A 1LROA 2VEPA 2CZFA 3MP4A 2XN0A 4WY0B 2Y6ZA 4N9BA 2C0AA 4OBTA 2QDHA 3THAA 2ZA2A 1TYGA 4NJHA 1OF8A 2JGYA 5DY3A 5HWNA 5CZSA 3WJZA 1DOSA 3GXPA 2ZZ7A 3TK7A 1O4UA 3W7KA 4EWND 4HT3A 1O60A 3IIOA 1SW0A 1TTJA 1R30A 2A7NA 2NUWA 4K7YA 2WSRA 3TV8A 1GJPA 3IV3A 3DFTA 5CG7A 5C54A 1KM4A 3MHUA 4BI5A 1M6JA 2GVJA 3DKLA 4K7VA 4WY0F 5HR6A 4RR4A 1KTBA 4FX7A 3VFLA 3C2FA 3LXCA 4O14A 1AG1O 4O0ZA 3BW3A 4CCEA 4GE8A 2A21A 3L5MA 4UTWC 3IVUA 4ICNA 3W7NA 1YXDA 4AHPA 1H7RA 3G18A 3W87A 3W72A 4UCGA 4EIVA 3DFQA 3UY7A 3B05A 4QM1A 4M5PA 2AAMA 1W54A 4O1AA 3NPWA 3PBYA 4HNTA 4GUFA 2CW6A 1OVDA 3B0VC 2I9EA 1P0NA 4IQLA 2NXIA 5HUPA 3W76A 1ME9A 1TPFA 3HPXA 1LRQA 2VOMA 2VFIA 1SUXA 3TQ0A 3W86A 4K38A 5K3VA 4W9TA 3NA8A 4O52A 3W84A 4KFOA 3KRSA 1BEUA 2C1HA 4RZ4A 3CWNA 4NNAA 4JYDA 3A9IA 1WOAA 1TB3A 3BGJA 1LBLA 5I3HA 5LGXA 3WJWA 4O50A 4JS3A 2QCFA 5EBUA 3EEGA 2GJLA 3MP5A 3NQEA 3MO7A 3BO9A 5FF3A 1YTDA 3ABQA 4WX2A 4G1KA 1H1ZA 4NJKA 4TR9A 3PF3A 1KFCA 4NJGA 1LTDA 4CNNA 4XZ9A 1TPDA 1K7XA 1LM1A 1Q6LA 1S5VA 2A6LA 5A8GA 2ZBTA 4AXKA 1HFBA 3O15A 3BK0A 5D2VA 3U6WA 5DCBA 3M5VA 1TQJA 4BWLA 2CLLA 3UWUA 3G3MA 4JTIA 1YYAA 3W23A 3SIZA 1K8XA 1FWSA 2YPIA 1Y0EA 1IF2A 3N9SA 4JTEA 5F1VA 3W2NA 5CSRA 2QJGA 2J24A 1KM1A 3ELFA 4QSHA 3I7SA 1B4KA 1M7OA 3FLUA 3INPA 1YLVA 3QMTA 5CPOA 5AHIA 4E2BA 4JNMA 4L4LA 4DO6A 4JTTA 2FPTA 2J9YA 1OX6A 4KWWA 4MUZA 1JCYA 4MJZA 1UUMA 3A23A 3LOTA 3TC6A 2FLIA 2C3ZA 4UTKA 2WKJA 4EF8A 3UPWA 5C2XA 5E93A 1JRCA 2JK2A 5LHFA 1TO3A 2BWGA 5KZMA 2P10A 1LLZA 4A3UA 3UNDA 3QQ0A 3NVTA 4LRTA 4QQ3A 5T26A 3CC1A 3V75A 2BTMA 1JQXA 3PG8A 3PM6A 4FX6M 3CLMA 1K03A 4CCDA 3SR7A 2DJXA 1SFLA 3LLFA 3TCEA 1GVRA 1TJRA 3NXFA 1ALDA 3EX6A 4RK8A 1W5QA 1D3GA 3BG5A 1VLWA 4NQ1A 2E5BA 1W56A 3LI0A 1EWDA 5CKSA 3QW3A 3W3OA 1C9DA 1OX4A 3NL5A 4UTWA 3HF3A 1H50A 4S1FA 1LCOA 4RXFA 3PWAA 2V2CA 2ZZ3A 3LGEA 3ABRA 4OV4A 4ML9A 4NVTA 3W7CA 1LRTA 3W73A 2QAPA 1GEQA 1UBSA 5D09A 4LUIA 2Q8LA 3ABOA 3W7RA 4ZQRA 3PSVA 4E2DA 3W7LA 3W1MA 1R2SA 1WBHA 1XC4A 1VR6A 4DO5A 1ZENA 1F2JA 3PUEA 1G7UA 2GVLA 4RJEA 4MYXA 3L65A 1PHWA 3PAJA 5C55A 1L9WA 3LV6A 4Q33A 4CNOA 3NYZA 2QCMA 4PA8A 3TKFA 3R8RA 2EF9A 2WPBA 2H3BA 1JCMP 3FYPA 3LV5A 5LHEA 3W88A 1FY6A 2Z6IA 2I1OA 4OWGA 4JTSA 2C16A 4MPQA 2YW3A 4JR5A 3LCGA 2FJKA 3NNTA 2DJLA 4FX8A 3C2RA 1YTEA 2VFEA 5F2GA 3T44A 4IMCA 2OT1A 3RU6A 4D2JA 3LCIA 4HSNA 4DEFA 3GR7A 3I68A 2YXGA 1VYSX 3LTPA 2Z2UA 2TPSA 3QQ1A 3PB2A 1QCWA 3NGJA 1ICQA 1VLIA 1GYLA 1W37A 3HQ1A 2DU2A 4O19A 5ABTA 5F2LA 1I2QA 4JTUA 3P81A 3N19B 3PB0A 1N55A 1OFOA 3G8EA 2PURA 1NEYA 4ZQMA 4UMAA 1BTMA 3G8RA 3I65A 3TX9A 4ZQCA 3HG3A 2EPHA 4POCA 3BLEA 4TIMA 4GNJA 2X1TA 4IX2A 1UB3A 2C19A 2VEIA 1EUNA 5LNVA 1A5AA 4JIQA 4NUWA 3STEA 4XQ6A 1LORA 3RFAA 3G22A 2YZRA 4XTDA 3P62A 1PCKA 1T0OA 2CLOA 1GZGA 1TV8A 4A2SA 5LKYA 4C1LA 3PR2A 1I2NA 1DBTA 4GFSA 4YL2A 1VHNA 3NPXA 3QYQA 1L6WA 4K39A 1QDSA 4JTGA 3LHTA 2NXHA 4YCPA 1F05A 1XBZA 3L0NA 4DBDA 5BMXA 4IPJA 1K7FA 1ADOA 4XBKA 1KM6A 2A85A 5L9FA 2OX1A 3S5YA 3GDRA 1OABA 1HG3A 2VEKA 3SECA 1EP1A 1T96A 1MEHA 5MHBA 2WNZA 3NR0A 1KFBA 3NL3A 3QC3A 3DU0A 1OFQA 5CPLA 4MYAA 1DVJA 1FXPA 4YLWA 3ZWSA 2ZYFA 1H7OA 4O1DA 2FFCA 4K37A 3A5FA 4GUHA 5CZJA 1KTNA 1ZAHA 4IXHA 1L6SA 3FS2A 3PC0A 3M7WA 4UFHA 1WA3A 4O4VA 2A5HA 2CLHA 3NDOA 1G67A 1RZMA 5LSMA 2UV8G 1XCFA 1Q6OA 3HGJA 2QCDB 4UFIA 4KWVA 3PBVA 4LC6A 1G7VA 1OJXA 3PS7A 2QJHA 3HGRA 3W2MA 1DJNA 1CI1A 1IGSA 3W7EA 4HNNA 2CWNA 3GDLA 1RPXA 5FEXA 3VCRA 2WJZA 2X16A 4GRSA 2V9DA 5K2ZA 5GVJA 1RQEA 1VJIA 3BW4A 3BLFA 1VQTA 2V5LA 3QM3A 3EXRA 4QIUA 1YXCA 5K9DA 2AQWA 1XDMA 3EWZA 1G69A 1ZFJA 2O7SA 3O6CA 2ABAA 3DXIA 2BSLA 4P61A 4PFMA 5FESA 4KKXA 2QR6A 3TFXA 3IVTA 2A1YA 3OEXA 3SJ3A 3EX2A 2R8WA 4Z1BA 2OT0A 4TU1A 1H7NA 1QO2A 1KFJA 3HGOA 3TAOA 4BI7A 2OZ0A 2NWRA 4MZYA 3TJXA 3R5EA 4A29A 4MIMA 3S1XA 3IGSA 4BFAA 2ATMA 4WQ6A 5U7SA 4NZJA 1V5XA 4LS1A 5EPDA 3L5LA 1I8JA 3LCXA 1A50A 3M6YA 1T99A 1XM3A 5D30A 2FB2A 2PCQA 4C1KA 1DQXA 4LT9A 3NM1A 3HIJA 3SI9A 4X3ZA 3BGGA 2ZQ0A 1W8SA 5AC7A 2VC6A 2V82A 3GNDA 4JICA 1SFJA 1DJQA 3NQ6A 1S5WA 4UTJA 5AHMA 1GTEA 2GQAA 2PRLA 3M41A 3STGA 3GYEA 4LOCA 5K4XA 3IEBA 4JY9A 1Q3NA 3GDKA 4MLRA 2NX9A 1EEPA 4AF0A 3SZ8A 3TXVA 3K30A 2E6YA 1EP3A 1G4SA 2Y70A 2NV2A 4LU0A 3C61A 5G1TA 2GOUA 3H54A 3GK0A 3KX6A 2TSYA 3EWXA 4OGZA 4LVDA 4JY8A 3DHDA 4CQ9A 3DI0A 3M5ZA 1HO1A 1M7PA 2YSWA 3S5NA 3TAKA 1H60A 3B8DA 3BW2A 2C6QA 3FKKA 1QOPA 5IBXC 4K8HA 2VFDA 1M5WA 3H53A 4AWTA 5H91A 4RKAA 3P67A 1K02A 2GQ9A 4JTJA 4MFEA 1AL8A 1OFRA 3L0KA 1QPQA 1SW7A 4BF9A 3F1QA 2FIQA 2DZVA 1D9EA 1MZHA 5I3GA 4N4PA 1GWJA 4ADTA 5K9XA 3LTSA 1OFAA 1NVMA 4A2RA 3N73A 2CLKA 1TPVA 4UUIA 3E02A 1VGAA 2VEMA 2E5CA 3LHUA 5I3IA 3LRMA 1NF0A 3THQA 3W70A 2DZXA 2ABBA 3NOEA 3A5VA 1XUUA 3TNOA 3UXAA 4P2VA 3OA3A 3ABSA 1RV8A 2JKAA 4O18A 3LRLA 2QF7A 3NQ8A 2V0TA 3C0JA 1R47A 1K7EA 2NUXA 3NQ7A 4FNSA 1H1YA 4UTIA 4XTIA 4ONVA 3G1AA 5FEZA 3OVRA 1LOSA 3FKRA 3W7JA 1SZEA 3DH7A 3NQCA 4E38A 3MBDA 4UTUA 1EUAA 3JRKA 4LWWA 2DZSA 3I6RA 1XDLA 1LYXA 3QSTA 2JBMA 3F4WA 4NXKA 4FO4A 2YX0A 4GJ1A 2WV8A 4ZQPA 3W6YA 2QJIA 2ZA1A 3W7PA 3STCA 3O16A 1A5BA 1L2UA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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