1QDSA

Superstable e65q mutant of leishmania mexicana triosephosphate isomerase (tim)
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
SAKPQPIAAANWKCNGTTASIEKLVQVFNEHTISHDVQCVVAPTFVHIPLVQAKLRNPKYVISAQNAIAKSGAFTGEVSMPILKDIGVHWVILGHSERRTYYGETDEIVAQKVSEACKQGFMVIACIGETLQQREANQTAKVVLSQTSAIAAKLTKDAWNQVVLAYEPVWAIGTGKVATPEQAQEVHLLLRKWVSENIGTDVAAKLRILYGGSVNAANAATLYAKPDINGFLVGGASLKPEFRDIIDATR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The ionization of a buried glutamic acid is thermodynamically linked to the stability of Leishmania mexicana triose phosphate isomerase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
molecule tags Isomerase
source organism Leishmania mexicana
total genus 93
structure length 250
sequence length 250
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 1999-07-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1qdsA00
2O7SA 1IIGA 8TIMA 2Y88A 1JRBA 2FPVA 2R94A 3EWYA 1G67A 3B4UA 3KVMA 3M43A 1KM4A 3HBLA 1DJQA 1H5YA 5BOOA 4GE8A 4O19A 4YCPA 4MOZA 2RDTA 1TJPA 1N55A 4C1LA 4JDBA 5G5IA 1PVNA 3EWUA 4CQ9A 3IVSA 4CLMA 1WX0A 2C14A 1B57A 5U4NA 3STEA 5I3KA 4DF1A 3L67A 5D2XA 5KITA 1QPOA 1JQXA 4OE7A 3U6WA 1I2QA 1LP6A 2CLLA 1SR9A 3P8JA 1ML1A 2TYSA 2CW6A 1HO4A 3G18A 3GKFA 2Y85A 3W2LA 4O1AA 3UWZA 3F03K 3P5YA 3OIXA 3VCRA 3QC3A 1YXCA 1AG1O 4TX9A 3OA3A 3W07A 3ZR4A 1GTHA 1YADA 1JULA 1LBLA 3W85A 3TJXA 2P1FA 5HULA 3TIMA 1ICPA 2Y7GA 3LI1A 3KXQA 4JS3A 3LCXA 1T96A 4Q4KA 1MXSA 1TMHA 3DKLA 1XKYA 2GVGA 4PEKA 4M6PA 4Z0JA 3GX9A 3TSBA 1FDJA 1X1OA 1OFDA 3MI2A 5D2TA 3W7LA 4Z08A 2Q3OA 5MHBA 3ABSA 4IMDA 3N2XA 3QZEA 4QISA 3DU0A 4O0ZA 1OYBA 1A5BA 2FFCA 3E0IA 3V75A 4CCCA 2FDSA 4N9CA 5D02A 4LS2A 3IRDA 2QCCA 1QMLA 2VFDA 4EOUA 3JS3A 1W0MA 1TTJA 1Z48A 1W54A 4A3UA 1WYIA 3SW6A 4FX8A 4HSOA 4E0CA 1ZAHA 1OX4B 2X1UA 3DFTA 4OHQA 3E49A 3JRKA 2ISVA 1IXPA 2TMDA 2NX1A 1G69A 2DZTA 2NUWA 2R91A 3W9ZA 1K8XA 4MFEA 1XDLA 4EF9A 4O1BA 4QJ1A 5E0KA 3BG5A 4NX0A 3TROA 1VZWA 1ZAIA 2E6FA 4LS1A 1NEYA 3IIVA 1X7FA 2W79A 5KMYA 1SZFA 4UTWC 5K7JA 1UUOA 3LBCA 1KV8A 2V5BA 4H3DA 3DGRA 4DELA 1DORA 3QF0A 5J5RA 3FJ6A 1VCVA 3A21A 4MFDA 3QSTA 4A2SA 4UXDA 1TO3A 5G1TA 4ZZ9A 3W1MA 2QCDA 3L65A 2ZRWA 5E93A 3UZ5A 1MSSA 1SU5A 3QFEA 4JTKA 4YL2A 3CB8A 1VS1A 3U2OA 1W5PA 2CLMA 1LRQA 3G1AA 3M5YA 4W9TA 5FEWA 3HGOA 1W8SA 3PR2A 1DKWA 3W2NA 3HPXA 3BVJA 3VE7A 5DY2A 1FCQA 3GVGA 4QNWA 3W87A 3I7RA 4ZQOA 4ZQNA 3M44A 3QEZA 3CEPA 2PRHA 3HOJA 3H53A 1QDSA 1R30A 2C1HA 1H60A 1EX5A 2YPIA 5BRBA 5KZMA 2B7NA 2YCEA 3GNDA 5F4XA 3HG5A 3T40A 1UASA 4WJEA 1SPQA 5FF0A 2NUXA 2I14A 5C6MA 3UY8A 4O8RA 2X1SA 2F7FA 1SW3A 1DHPA 3NL2A 1W5NA 3ABOA 4LTSA 3GYEA 1OFAA 3B0UX 3MBDA 3TXVA 4X2RA 3JR2A 3CWOX 3NL5A 2YZRA 3CU2A 3FEMA 2AQWA 4RLIA 5GVJA 3LBMA 1V7YA 5FESA 1K8YA 1RD5A 2YSWA 4IPJA 4O52A 3W7GA 3L5MA 2V30A 2Y70A 3KVJA 4AVFA 3EXTA 3A5FA 1JCNA 4LC6A 4O4WA 4LRSA 4POCA 2FLIA 2VFGA 2ATSA 2I1OA 3F4WA 1J5TA 2CFFA 4FO4A 1SUXA 4O16A 2PRMA 1O5XA 1OK6A 1H50A 1XI3A 1KM1A 3QH2A 3LHTA 3CM4A 3C3NA 1O94A 1Z42A 2DZSA 2I9EA 3GNNA 4PC8A 3DAQA 3FJLA 4O17A 1Q3NA 3GR8A 4M7TA 1R47A 2QJGA 2V2HA 4DQWA 3ZS4A 1KM6A 4LVGA 1AW2A 1TYGA 4HHPA 4CCEA 3BLIA 4KWVA 4X22A 1F6PA 4X9SA 1L6SA 4ORMA 2NX3A 2DZUA 4DF0A 4OQVA 3W75A 5U7SA 1GZGA 4JTJA 1JUBA 1S5TA 1ME9A 4CNNA 1C29A 1EWEA 3TCEA 3C2FA 5DCEA 1QOPA 4WOQA 5I3JA 1LORA 1I2OA 5FEZA 4WD0A 2W0UA 1MEWA 2CLHA 3NQDA 1VYSX 4PL2A 1OF8A 2H90A 5HNRA 2ZRZA 4JTFA 5HINA 4WY0F 1YTDA 2BLEA 4ADTA 1XC4A 4RZ5A 3W72A 4NNCA 4ADUA 1LROA 3AO0A 3TQVA 4H4IA 4DPQA 1G4EA 3DHFA 4IGHA 3ATYA 3TK7A 1ZAJA 5F1VA 1JCXA 3LXBA 1XL9A 2JGQA 4LW7A 3W74A 2Y6ZA 3I6RA 4FEZA 3LCGA 3PUOA 4M6VA 1VYRA 1OFRA 4EVZA 1H51A 1LYXA 2RHGA 1KBJA 4JXCA 3GXNA 2CZEA 4N9BA 2Z6JA 3QQ1A 2CLEA 2RDUA 4LVAA 1LLWA 4JD4A 1B4EA 3MYOA 3L0KA 5EPDA 4BF9A 4UC5A 1C8VA 4GRSA 2FJKA 1PHQA 2YYUA 2C6QA 4U28A 3AJXA 2X1TA 3EWWA 2ZA3A 5LKYA 3GXTA 2OT1A 2TPSA 2ZRUA 3SSJA 1SQ7A 5K4XA 3A22A 2ZZ6A 2VFHA 3M9YA 2QJHA 3LV5A 4AWUA 2E6AA 4KFOA 1FY6A 4EF8A 4GC4A 3IVTA 1OG0A 5FEPA 3S1XA 3G0UA 4I7UA 1TPC1 3EWXA 3DFSA 1GT8A 1O60A 3CPRA 4JYEA 1FXQA 1KTCA 3UWVA 5K9DA 1R2RA 3I7QA 4TU1A 3M47A 3W7JA 3O6DA 5CZ0A 3DI0A 4ML9A 3EX3A 1KM5A 1GVRA 3G24A 4PCFA 1CI1A 1KFBA 3UD6A 1XBVA 3SR7A 4XTIA 3LOTA 2RKXA 1GVQA 4UTKA 1FWSA 4WY0B 3LB0A 3WK3A 2C15A 3LHUA 4E2DA 3N3MA 5AHNA 1I2PA 2QR6A 2YW3A 3MHUA 4JTTA 1G4SA 3VFLA 3NQ7A 3E02A 4PTNA 4RR4A 3B8DA 3CTLA 1T99A 3PB0A 4Y9AA 3FS2A 3W7EA 3PUDA 2CLIA 3TH6A 4JY9A 1XDMA 5I3GA 4FB7A 2VOMA 5EBUA 1AMKA 1OABA 1XBZA 1KM2A 3LRMA 5F2LA 3A24A 5CZTA 3W7IA 1DBTA 2VEKA 3EKLA 3HO8A 3TAKA 2H8XA 3OVPA 4UTJA 1QO5A 4QM1A 3A9IA 2V0TA 1FX6A 4N4PA 1RPXA 2QCGA 3W3OA 4NJHA 3BW4A 5A8GA 2NX9A 3B05A 4N6FA 3L5AA 3S6DA 3GB6A 3NQ6A 4TR9A 4JTLA 3PBWA 5AHMA 2G96A 2WQPA 1TCDA 3O15A 3DENA 3MP5A 4ICNA 3QQ0A 4RZ6A 3PG9A 3B06A 4MYXA 1U5JA 3B03A 1TPDA 2WPBA 4NU7A 3ANYA 1GTEA 1JQVA 3NG3A 4IPIA 3BK0A 3F1QA 3BGGA 3W2MA 4LY8A 4DXVA 1FCBA 3MJYA 3S1VA 1W5OA 2C18A 1KLZA 3R8RA 3B0VC 3ZWTA 2CLOA 3SGUA 4BWLA 2YX0A 3L21A 5AHFA 4LVBA 5KSWA 3PY2A 1JJKA 4G1KA 1K03A 3P8IA 4JX5A 4FNQA 5D03A 4WQ6A 3G0SA 5H91A 3SI9A 5DBUA 1A5AA 3BARA 2PC4A 3N14A 4YMZA 3QMTA 1LOSA 2WSRA 4E38A 1ZY9A 5AHEA 4AWTA 4FXSA 3S5YA 1VLWA 3GDLA 1FWNA 4IXXA 2DJXA 2V2DA 1YDVA 3KVLA 4JR5A 5LNWA 3M41A 2H3BA 3G1FA 1M5WA 5DCBA 1YLVA 3T78A 3UXAA 1H7WA 4UTHA 3HPSA 1KLYA 1HL2A 1W3NA 4UMBA 1FUYA 1EUAA 3FLUA 4MJMA 1OYCA 4AMAA 1EP2A 4J9JA 2V9DA 2CLFA 3P60A 3KAOA 1P4CA 4A29A 3LCWA 3BPWA 5E1QA 1W5QA 2ABAA 3HGRA 5DXXA 3G0XA 4Y6GA 4UMAA 1AK5A 4WXZA 4NXKA 4RXFA 3DZ1A 1FBAA 4K36A 4O54A 5LZLA 1X8FA 3GDTA 2ISWA 5FF7A 3EWBX 2ZTKA 3TXZA 4HNUA 3NM3A 4ZQCA 4LVDA 4KFPA 1OX4A 5HUPA 3GAYA 2CZDA 3MWAA 3PSVA 3LI0A 4GNJA 1M7OA 3W1NA 1FWRA 4TIMA 3INPA 1PV8A 6TIMA 4LS0A 4KFNA 4DO4A 2CWNA 5LHEA 3NL6A 1O95A 2ZRXA 3P80A 1S5VA 4PA8A 1H61A 4AXKA 3HG3A 4ALDA 1QWGA 2WNNA 3V1PA 1YXDA 3KRUA 3LCLA 1P0NA 4RXGA 3CHVA 2ZRVA 2V8ZA 2QCLA 3B0PA 2FIQA 4UFMA 4N9EA 5A5WA 4S2CA 1W37A 1EWDA 4HNNA 3UWWA 4HNTA 2NXIA 2QKFA 5SWUA 1DL3A 2Y7FA 1OVDA 3GLCA 4PFMA 1A50A 5F4WA 3N9RA 3ELFA 3TW7A 4BI6A 5HR7A 2KZHA 2NUYA 1TPFA 4N9DA 4Q32A 4O50A 4GJ1A 1XXXA 2HSAA 5G2WA 3TW6A 1AW1A 3C52A 4R33A 1TPVA 3GAKA 3KRSA 5C54A 4XTDA 3PWAA 3HIJA 5CSRA 4IJBA 1GYLA 4GWEA 3CWNA 4YLWA 5D32A 1ONRA 3DFPA 4QITA 4DO5A 1VCGA 1H7NA 3MW7A 2E5CA 5DBTA 4FX7A 2WNQA 5LSMA 3LM7A 2GVLA 1A5SA 1WXJA 4WOZA 3DI1A 2CZFA 2J9YA 3OG3A 4GFSA 3CLMA 3G3DA 4N6EA 3NZ1A 4P2VA 5IM51 1WA3A 4XZ9A 3E96A 4JYFA 3S1UA 2E5DA 2GPTA 1LDCA 1UCWA 1KV5A 1KTNA 1WOBA 4YXGA 3LTYA 3NQFA 1KA9F 3PAJA 4O12A 3C2VA 4LC8A 3H55A 1VPXA 3TC7A 4C1KA 5EKYA 5I3IA 2NWRA 3LCHA 5C5YA 3CIXA 4JICA 3TC6A 2ZZ5A 4EWND 4ZQPA 4AF0B 1D9EA 3GXPA 2YDAA 2E1DA 1VYPX 1QNVA 3OVRA 2ALDA 3VNDA 3PF3A 1TQXA 1WBJA 3MHFA 4XUGA 2FB3A 1Z41A 1TSIA 2FB2A 1GG0A 1W5MA 5AYYA 3MI6A 2QAFA 4FXRA 4DBEA 4HIBA 2HS8A 4X3ZA 3P62A 1SO5A 3M6YA 3UY7A 1VCFA 1WQ5A 2J88A 5HUOA 2WV8A 5KZEA 2A7NA 1KFKA 5IBXC 2P0OA 4JTHA 3PC0A 2H8ZA 3W88A 2ZZ7A 2PCQA 1OFEA 4KKXA 3R12A 3NNTA 5D38A 3STCA 5KINA 2VXNA 1G4PA 2F84A 4IMEA 3G1XA 5G4EA 3W6YA 3UQNA 4RJEA 3W1UA 2ZTJA 1GQNA 4K37A 3WJZA 1R2SA 4M7SA 2W6RA 5DELA 4JX4A 1A53A 3RLVA 4TMCA 2Y7EA 4NNBA 3GKAA 4K39A 3L9CA 1PL9A 1LZOA 3D0CA 2J6XA 2VC6A 5K3VA 1NVMA 2AAMA 4JY8A 3DXIA 2GQ9A 3LHYA 1HO1A 1PIIA 3Q37A 4AB4A 3O05A 3NL3A 4QAIA 2EGZA 2VKZG 3STGA 1H62A 3SIZA 3SJ3A 1GVOA 4B5NA 4QIUA 1SO4A 4MYAA 4A2RA 3NQCA 3E12A 2ABBA 2QEZA 3NGJA 2DP3A 1ICQA 2QCNA 3RU6A 5FI8A 2Q8LA 1SSDA 1ICSA 4MLRA 4OGZA 3IGSA 4UUIA 3KOFA 3DH7A 1Q45A 3O07A 4FX6M 4NJGA 3TJLA 3B04A 3W7CA 4R34A 4I9AA 1SSGA 4K8HA 4LVFA 2QUVA 3W7QA 3L0NA 4O4VA 1DVJA 1VQTA 3LHVA 4EIVA 3LXAA 5FF4A 3N9SA 2Q3RA 3W2JA 2B7PA 4UTLA 3SY5A 1ZALA 4UFHA 1PHWA 1OX5A 1LLZA 1VR6A 4M5PA 5AYXA 4FNRA 1VHCA 4R7JA 2Z1BA 2OX1A 2R14A 1RR2A 2QJIA 4O10A 4MJZA 5CPMA 3P5ZA 2VEPA 4XKYB 1L9WA 4PODA 2R8WA 2V82A 2VELA 1WOAA 3MBFA 3EX2A 2QDHA 1QPQA 4HKPA 1I4NA 1JUEA 2NLIA 2QCEA 3EEGA 1Y0EA 5I3HA 4D2JA 1TJRA 1BKSA 1IXQA 3NM1A 5HWNA 2EHHA 4DPPA 1XBXA 1NF0A 3H54A 1HG3A 5C2XA 1FDZA 4O14A 2JKEA 4IX0A 4UTWA 3TKFA 4DF2A 2EF9A 3QYQA 5AFDA 4JIPA 2P10A 3BLEA 3NQVA 4IMGA 1S5WA 3LXCA 3MP3A 4WY0A 1FCUA 4AWSA 1VRDA 4O0KA 5KZDA 4L4MA 3L5LA 2C13A 4IUOA 3CIWA 4HN4A 1EB3A 2A0NA 3O16A 1Z44A 3E9AA 3EXSA 4IMFA 3HB9A 3NPWA 2YFNA 2BX7A 3LLFA 4UTUA 3PB2A 1I2RA 5IBXA 2GUUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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