1QMLA

Hg complex of yeast 5-aminolaevulinic acid dehydratase
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
342
structure length
328
Chain Sequence
MHTAEFLETEPTEISSVLAGGYNHPLLRQWQSERQLTKNMLIFPLFISDNPDDFTEIDSLPNINRIGVNRLKDYLKPLVAKGLRSVILFGVPLIPGTKDPVGTAADDPAGPVIQGIKFIREYFPELYIICDVCLCEYTSHGHCGVLYDDGTINRERSVSRLAAVAVNYAKAGAHCVAPSDMIDGRIRDIKRGLINANLAHKTFVLSYAAKFSGNLYGPFCYQLPPAGRGLARRALERDMSEGADGIIVKPSTFYLDIMRDASEICKDLPICAYHVSGEYAMLHAAAEKGVVDLKTIAFESHQGFLRAGARLIITYLAPEFLDWLDEEN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title MAD Analyses of Yeast 5-Aminolaevulinic Acid Dehydratase. Their Use in Structure Determination and in Defining the Metal Binding Sites
pubmed doi rcsb
molecule keywords 5-AMINOLAEVULINIC ACID DEHYDRATASE
molecule tags Dehydratase
total genus 77
structure length 328
sequence length 342
ec nomenclature ec 4.2.1.24: Porphobilinogen synthase.
pdb deposition date 1999-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00490 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1qmlA00
4IXXA 5I3GA 2Y63A 3G1FA 3N3MA 1JUEA 3UY8A 1S3HA 4DO6A 5CZJA 4E2BA 1C8VA 1QOPA 4GBUA 1SO5A 3SECA 5I3FA 4JXCA 3RU6A 2CZFA 3TC6A 3DAQA 2XN0A 1ZENA 4YLWA 5F2MA 1GYLA 1VYSX 3W72A 3HB9A 3I65A 1GVSA 3N14A 3KVMA 4IUOA 2BTMA 2E5DA 4RK8A 1T99A 3O1NA 3TH6A 5C6MA 3OVRA 3S1WA 1S5WA 1Q6QA 3MP5A 2E68A 1Y0EA 4UTKA 4UC5A 3W7QA 5DELA 2GQ8A 1ZNNA 3T44A 2VFDA 3MI6A 1A5SA 1VQTA 3LOTA 4MPQA 3LTSA 4UTTA 1JVNA 3R2GA 4X22A 4TR9A 4FIRA 4UMBA 1H51A 1G6CA 3KHJA 2ISWA 4I7UA 3OA3A 4WY0A 2OT0A 2HTMA 2NLIA 3RLUA 1S5VA 1YXYA 4CQ9A 1X7FA 3O6CA 4TMCA 2E6DA 1RVGA 3HG3A 1WBHA 1FDZA 2CLOA 3GDTA 3GKAA 3RMJA 5SWUA 5I3HA 3EXRA 3M9YA 2ZTKA 3W2UA 5LNWA 1TYGA 1W5OA 3CB8A 4FHAA 3HGRA 3BW4A 5FI8A 1NEYA 1N8FA 2GQ9A 1GYNA 1PHWA 4LS1A 5CKSA 1MZHA 5D32A 1WDWA 5C55A 3EX1A 3G1XA 3L5LA 2TYSA 3ATYA 1KM3A 3UWVA 2GVLA 5HMSA 1W0MA 3NPVA 1XKYA 2PRLA 3HPZA 1MSSA 3H54A 3PR2A 4KWWA 3I7RA 3SIZA 2G5WA 3O6DA 3MI3A 4JDYA 1VGAA 2E77A 1PS9A 3W7JA 1W1ZA 3ZWTA 1TQJA 3WK1A 1XI3A 3UPBA 2Q3OA 4TX9A 2A0NA 2J9YA 2JK2A 1KM0A 2B0MA 2OZ0A 1X1OA 1EWEA 2V2CA 4UNLA 1QAPA 2PRMA 1GG1A 1DQXA 4O10A 4UR7A 3PUOA 3OEXA 2GVJA 1YADA 5CZTA 1KBIA 4LU0A 1BEUA 1HO1A 3B8DA 3PB0A 2OMAA 3WK0A 2Y88A 1TTJA 3VFLA 1ZAJA 4C1KA 3IIOA 1GEQA 1JRCA 4LRTA 1P0KA 2YGYA 1LYXA 3E0IA 1G7VA 1YLVA 4N6EA 3W1LA 4AH7A 1TREA 3NNTA 5K3VA 5IM51 1KFBA 3E12A 2DP3A 1WBJA 4O18A 3KOFA 4XKYB 2ZQ0A 1F6PA 5LGXA 1SU5A 4JTIA 3PBWA 3DH7A 1EA0A 1J2WA 3PSVA 4L4MA 2P0OA 1P0NA 1YTKA 4FO4A 4PA8A 4O53A 5BOOA 1GG0A 3R5EA 2E6FA 3CC1A 4XBKA 5CZSA 1X6UA 5CPNA 4BWLA 3T55A 3FJ6A 1V7YA 1K8ZA 3PUEA 2CLMA 3CHVA 4Z1BA 4UFHA 2QJGA 3TXVA 5L6UA 1B4EA 2GPTA 3VE7A 1ZALA 3E49A 3F03K 5F1VA 3CLMA 2H90A 5IBXA 4UUIA 1JCMP 4UTLA 2GUUA 3C2FA 3R13A 4QNEA 3QQ1A 3QZEA 3EWWA 2C19A 4EIVA 4UTHA 3SR7A 3LHYA 2JKAA 1OFPA 1TV5A 5DBTA 4HNNA 3M47A 3M5XA 3L0NA 1IXNA 3UXAA 4K8EA 1I2NA 3N9SA 3LB0A 4OWGA 4RV8A 2V5LA 2B7PA 3QEZA 4NZJA 4UFJA 2YXGA 3P5ZA 2QCLA 4WQ6A 2FFCA 3ANYA 3TSMA 1DHPA 5D2WA 4LUIA 3F4WA 3GXTA 1F6KA 2E6YA 3IGSA 3UXDA 3LCXA 4KFOA 4JY8A 4RZ5A 1OX6A 2YR1A 4IMFA 1G4EA 2NUXA 5DLCA 5DXYA 4LUJA 4GXMA 4ORMA 4E38A 3P81A 1VJIA 3FOKA 3M6YA 3DBPA 1LBMA 4FNTA 5AHEA 5BW6A 4NUWA 1EEPA 2ZRWA 3UWQA 4AEOA 1G67A 3H53A 4PH6A 1SR9A 1EP2A 3W2JA 1LORA 3GR7A 3P61A 3EWUA 4ONVA 2X30A 1M5WA 1AW5A 2OX1A 1TJRA 2J9XA 1TPFA 1YTEA 1NVMA 1ME7A 1JUKA 3G24A 1BKSA 3L21A 5TIMA 4IWWA 2WJZA 4TO8A 2W0UA 2RDWA 2CLIA 4N02A 3W1PA 5D2TA 1ZY9A 5F4SA 2CU0A 4JYFA 3NOEA 2ISSA 3ATZA 1VHCA 4UFMA 5HWJA 3S1XA 3ELFA 4JTJA 1EB3A 5K9DA 4GUFA 3W7IA 1LTDA 4GUHA 1W31A 1GT8A 4FX7A 1RPXA 4MIMA 5AHIA 1KBJA 4CNNA 3NQCA 4RXFA 3RNDA 2BXVA 1W3TA 1JUBA 2CW6A 3MI2A 3W1NA 5D33A 5F2IA 3C8FA 1KTBA 4WOZA 2QJHA 1B57A 1T96A 1ADOA 2ZZ3A 4TU1A 1ICSA 2VEIA 4AHQA 3W1QA 5EL1A 4CNPA 4EVZA 4UTJA 2V2DA 3QW3A 2E09A 5TQLA 1H63A 2A5HA 4O12A 5DCEA 2QKFA 3G1DA 2QDHA 3QF0A 3NQEA 3PF3A 4O17A 1M7PA 1OFBA 3G3MA 2ZTJA 3NAVA 2X1UA 3FA5A 1OF6A 3BPWA 3QQ0A 1PCKA 3P84A 3DFTA 4AB4A 1ME8A 5DXXA 4ZQPA 3L67A 3L68A 1H60A 1TPB1 3A21A 5HR6A 1Z42A 5D2YA 3EXTA 4HIBA 1MEHA 1SZFA 3AJXA 5AN7A 2YFOA 2RDTA 1UJPA 3W76A 4LTSA 5HNRA 1OJXA 4MLJA 3O15A 2PURA 2JBMA 1H5YA 2YX0A 3TAOA 3VCRA 4BI7A 1OYCA 2TRSA 3W07A 4JR5A 1LBFA 2VFEA 3AO0A 4I7WA 5D38A 5F2LA 4FXSA 2QCMA 5KZEA 1HO4A 4NNAA 3E96A 3B03A 1ICQA 2PRHA 5FESA 1SSGA 3CWOX 3M16A 3LGEA 1IF2A 3IVUA 5DCBA 3MBFA 3P62A 2C3ZA 4IX2A 3PM6A 2VKZG 1FDJA 3PC0A 2WNZA 3N19B 1KTCA 2F7FA 4OGZA 4BI6A 4UTWC 3W84A 3HMJG 3JR2A 4UCGA 3ABRA 3NL3A 5AHMA 3NQ8A 1UUMA 3EWXA 1WOAA 1XUZA 4WUIA 3S6DA 5FEPA 3SZ8A 1XM3A 2ABAA 2RKXA 3A22A 4CCCA 3O16A 3U2OA 5KTLA 3I68A 1XFBA 3M1ZA 1LROA 1QWGA 1FDYA 1RQHA 2VFIA 5H2ZA 1F2JA 2X1SA 3DHDA 4MZYA 1TQXA 3TQKA 2ZZ4A 3G3DA 3W2MA 3LHWA 2C14A 3Q2DA 2QAFA 1AW2A 2ZRXA 1W3NA 5AHLA 4DQWA 1JULA 3M0ZA 4O15A 3MBDA 4NQ1A 3KRSA 3U6WA 2BSLA 4IMDA 3QMTA 1GOXA 1O4UA 3WJYA 1RR2A 3PG8A 3MHUA 1SQ7A 1SFLA 3HG2A 4NZFA 1E51A 1JRBA 3Q58A 2CLHA 2UV8G 4Y90A 3HIJA 1KV5A 3WJSA 2HS8A 2ALDA 3TW7A 4JTTA 3O06A 3GX9A 1QO2A 4JX4A 1GQNA 2GJNA 3BW2A 1I2QA 4O28A 4FNRA 5DN1A 2DJLA 3CPRA 2DZVA 1K02A 1QPRA 4BR1A 4IPIA 1PCWA 3IGUA 4IGHA 3TDFA 5J5RA 1LOLA 3R8RA 2B4GA 3CTLA 1LZOA 3N2XA 3BARA 3LBMA 1ZCOA 4O19A 1R2TA 3INPA 2WSYA 4XBSA 5DBUA 1KM1A 3FKRA 3QMRA 4ZQMA 3STGA 1OK4A 1VH7A 5LNVA 1D9EA 2ZA1A 2ZZ2A 2C15A 1W56A 3LV6A 2A6LA 2OT1A 4BI5A 1W5PA 1I2RA 2Y7FA 2ZA2A 3IGXA 1WQ5A 4PL1A 1VCGA 4LC6A 4HHPA 3B05A 3GXPA 1EUNA 5KINA 3NQMA 4JN6A 4Z0JA 2X1RA 7TIMA 4H6KA 2QAPA 3DHFA 5K7JA 1SW3A 3EKLA 2DZWA 1K03A 1M6JA 5AFDA 4NXKA 3DFQA 1OYBA 2E5CA 3THQA 4LY8A 1XBVA 2VXNA 3QPZA 2EKCA 2QEZA 3LHZA 2W6RA 4GWEA 3FJLA 3SJ3A 1Z44A 2JGQA 2R94A 2RFGA 4GUGA 4WY0B 1OFEA 4O4WA 1HG3A 5G4EA 3O63A 3G1SA 1UASA 3ABOA 1H61A 3LCHA 5BNKA 4PEKA 1VYPX 1YXDA 1DL3A 1OHLA 1IXQA 3W74A 4ZMGA 3W2KA 2YFNA 1H7RA 4OV9A 3V75A 2WNQA 4PCFA 1G4TA 5EA9A 4QQ3A 1JCJA 1M7OA 3W7PA 1W3IA 2CZEA 1GPWA 3NR0A 4RCXA 3R89A 2DZUA 3W7CA 4QIUA 1C29A 3WK2A 3PULA 5D02A 1I8JA 4NJIA 1SFJA 2CZ5A 4ZZ9A 5AB3A 4Q4KA 2ZRZA 1KA9F 1KFLA 3ABSA 3STFA 1AG1O 4CQ8A 3A5VA 2QUTA 3L0KA 4DF1A 2E1DA 4M6QA 4M7TA 1RQBA 2C1HA 1PHQA 4AWUA 2NX3A 3GAYA 4JTKA 3PAJA 3HGOA 3LRMA 4DBEA 2YZRA 4K39A 3E9AA 1NAL1 1K7FA 4O1BA 4A21A 4ZL1A 3L2IA 3EX2A 2NWSA 5G5IA 3LHUA 1SW0A 3GDMA 1FUYA 4X2RA 3N34A 1O60A 2J27A 3DKJA 2ZZ7A 5K9XA 3STEA 4JGDA 4DXVA 2PC4A 3NG3A 1I4NA 3PSWA 5D37A 2FTPA 2GQAA 3TNOA 2ZYFA 4OT7A 1G69A 3UWUA 4OU1A 5D05A 5U4NA 3G0UA 1KFCA 1PIIA 1H7XA 4KFPA 1TPH1 3VNDA 3CEUA 1KLYA 1KM4A 3W71A 3KVLA 3T7VA 3ZR4A 4GUJA 3IV3A 2FPVA 1FWRA 4YXGA 2NV1A 3TFCA 1FXQA 1OFRA 3G1HA 1YXCA 3U8GA 4U4MA 4JTHA 1TTIA 4Y8FA 4JX6A 1WOBA 4A29A 3BGGA 2F84A 1YTDA 2NXGA 5AOUA 4L4LA 4LVDA 3W7LA 2BLEA 2YCEA 3BLEA 5HULA 4R7JA 4Z08A 3S8HA 2ZZ6A 1QFEA 2DZTA 3N2MA 4WXYA 1THFD 4PL2A 1QCWA 4QITA 1XDMA 1H62A 2G95A 4TMBA 4I7VA 3FFSA 4JTFA 2FPTA 3PUDA 4S1FA 1FCQA 2CLLA 2C16A 2DORA 1CI1A 3BG9A 2G96A 3W23A 1LRNA 3OVQA 4GE8A 1JJKA 1KM6A 2V82A 1FXPA 1ZJIA 1OX4A 4RX0A 1G4PA 1HUVA 1AW1A 2X1TA 2YDAA 3K30A 3NQVA 2AGKA 1TCDA 2V0TA 4O16A 2A4AA 1OVDA 4JD4A 1SPQA 1U83A 1SZGA 2FB3A 3NQ2A 5AC8A 2BWGA 1OF8A 1X8FA 3BV4A 4UR8A 5FF3A 4HNVA 2AQWA 3M7WA 1KM2A 2A1YA 2DJXA 1QR7A 2Y7DA 3G8RA 5G1YA 4DO4A 5EY5A 4JIPA 3KVJA 3TCEA 5LNUA 1P4CA 5D30A 1EP3A 3MHGA 3QW4B 1XBZA 4PC8A 2WO5A 3GKFA 5DY2A 4POCA 3G18A 3NQDA 1T0OA 4PODA 3DFSA 4O1CA 3GLCA 1D3GA 3SGZA 2NX9A 4FXRA 4BF9A 3M41A 1P1XA 3CEPA 3PWAA 4LV4A 5CSSA 5KMYA 1VS1A 3NPWA 3S42A 4G1KA 2CLFA 1QPQA 4AF0A 3W2LA 4FF7A 3C2VA 3F1QA 2VEKA 2EAWA 1SZEA 3GNDA 3BG5A 3DZ1A 4FNSA 1AL8A 4WZHA 1DKWA 4HNUA 3NQGA 3LXAA 3IIPA 3MW7A 3IIXA 3GR8A 2QCDA 1OK6A 5BRBA 1FBAA 3BLIA 4YL2A 2I9EA 4O57A 3FKKA 4QSHA 3HQ1A 2FPYA 2C13A 4WD0A 1RD5A 1WXJA 3PS7A 1A5AA 4M19A 4RXGA 3W7MA 4R34A 2Y61A 3LCFA 3GDLA 4AWTA 4A22A 3FLUA 3C2EA 1QOQA 2A7PA 4JTGA 1Q3NA 3DFNA 3O6YX 1F74A 4UTIA 4GC4A 3L5MA 3BLFA 3TMQA 1EWDA 3C56A 3W73A 2A21A 3CU2A 5CG7A 3ZS4A 5LZLA 3QPYA 3PY2A 1LCOA 4LVGA 1Z41A 1YYAA 5LNSA 2EHHA 3LI0A 4UXDA 3W7EA 1P5BA 3W9ZA 3TAKA 1F73A 1R2RA 1K7XA 1R46A 3MHFA 4LS0A 3PBVA 2EF9A 4P61A 3TSDA 3QYQA 4EOUA 2QF7A 2DZPA 4K6AA 5EBUA 2Y85A 3GAKA 5C2XA 3MMTA 3GDRA 2VENA 3P74A 1PL9A 3FIGA 1WX0A 1GZGA 5FEWA 1NF0A 2TSYA 4DO5A 3TFXA 2NXIA 4NT0A 4ZQOA 3HF3A 5I3KA 4JEQA 1DQWA 3WFAA 1VLWA 3G1YA 1H1ZA 3QM3A 4IMCA 4JX5A 1IXOA 1EX5A 4HN4A 1L9WA 1XL9A 3MP4A 3O07A 4Y6GA 4K37A 3WK3A 4C1LA 1EUAA 1YPFA 2Q3RA 4O1DA 2Q8ZA 4A3UA 1VLIA 1L2UA 2QCHA 3DU0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4IXX A;  4EE9 A;  4R5E A;  1DP0 A;  1ZBV A;  1S3H A;  4LNC A;  1E9Z B;  5CZJ A;  3KWS A;  1QOP A;  3K8M A;  1SO5 A;  2BOG X;  1LL7 A;  1ZS2 A;  3TC6 A;  2O9R A;  3GYC A;  2EJ1 A;  4LJ3 A;  1GYL A;  5CC5 A;  3W72 A;  3E74 A;  3I65 A;  1Z89 A;  2YOC A;  1GQJ A;  2BTM A;  1QHO A;  2OZ8 A;  1BD0 A;  3BIC A;  3OVR A;  5C6M A;  4GVF A;  1Q6Q A;  4G6C A;  3MI6 A;  1VQT A;  4DWS B;  5BU9 A;  1JVN A;  3U3H A;  2GJX A;  4TR9 A;  1KXV A;  1H51 A;  4GYF A;  2ISW A;  3RPT A;  3UJF A;  1GW1 A;  3OA3 A;  2NLI A;  3KL0 A;  1RCX B;  1ECE A;  4GXP A;  3SCP A;  4NIL A;  1WKD A;  3GH5 A;  2GYI A;  1E0U A;  3GKA A;  2J62 A;  5LNW A;  3W82 A;  4H9Z A;  1AFS A;  2GQ9 A;  1GYN A;  1KKR A;  4J35 A;  4MWA B;  3GUW A;  3L5L A;  3H24 A;  4RNF A;  1EHA A;  1CXI A;  3NPV A;  5JIP A;  2X05 A;  3AIS A;  3PR2 A;  4KWW A;  1HQT A;  3KUM A;  1OCQ A;  2G5W A;  1KCK A;  4FOJ A;  2X41 A;  4JDY A;  1VGA A;  4AST A;  1XI3 A;  1RCQ A;  3Q67 A;  4XZW A;  4I5R A;  1B3W A;  3G1R A;  3R58 A;  1F6Y A;  4XAY A;  1FHV A;  2OZ0 A;  1X1O A; 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