1QNPA

The 3-d structure of a trichoderma reesei b-mannanase from glycoside hydrolase family 5
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
ASSFVTISGTQFNIDGKVGYFAGTNCYWCSFLTNHADVDSTFSHISSSGLKVVRVWGFNDVNTQPSPGQIWFQKLSATGSTINTGADGLQTLDYVVQSAEQHNLKLIIPFVNNWSDYGGINAYVNAFGGNATTWYTNTAAQTQYRKYVQAVVSRYANSTAIFAWELGNEPRCNGCSTDVIVQWATSVSQYVKSLDSNHLVTLGDEGLGLSTGDGAYPYTYGEGTDFAKNVQIKSLDFGTFHLYPDSWGTNYTWGNGWIQTHAAACLAAGKPCVFEEYGAQQNPCTNEAPWQTTSLTTRGMGGDMFWQWGDTFANGAQSNSDPYTVWYNSSNWQCLVKNHVDAIN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Three-Dimensional Structure of a Trichoderma Reesei Beta-Mannanase from Glycoside Hydrolase Family 5.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-B-D-MANNANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Trichoderma reesei
total genus 138
structure length 344
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 1999-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1qnpA00
1FP9A 3EDEA 2OWXA 4CUCA 1CGWA 1B3ZA 3VIFA 1J0HA 3KZSA 1ZL1A 3AIWA 1TE1A 3RILA 1B2YA 3GYCA 4BCEA 3EMCA 2W92A 4TOQA 3WQVA 3G6LA 2WHLA 1OT2A 2VT0A 3SCTA 4WLCA 3WDHA 1EQCA 1DWHM 5JIWA 3VPLA 1HP4A 1OIFA 1Q6CA 5CLTA 2OYMA 3ARWA 1UHVA 4UQDA 3VMOA 5CZKA 4GXPA 1HL9A 1VFOA 1W2VA 1ZU8A 1CNVA 2VZSA 1GOQA 4PMDA 3BAKA 3OZOA 1G5AA 1LWHA 4A3HA 2NW0A 1CXIA 5D4YA 3FAWA 2OWWA 4W86A 2WMIA 1E3ZA 3UG4A 3HMCA 2A3BA 2CNCA 2E8ZA 4AISA 1E0XA 2VJXA 2DPEA 5FCZA 3OG2A 4OOUA 2ZX5A 3MUY1 2J75A 4AZBA 4E2OA 1XCXA 4MB1A 4UR9A 1HIZA 1PZ3A 1XH0A 1UUQA 1J0KA 4D6DA 4P8VA 3ZQ9A 3AOFA 3MV11 2DSZA 2YLLA 2VUYA 1CGUA 1E43A 2FHFA 6A3HA 2J7BA 3B9DA 3CGTA 4J7RA 3A4AA 1R86A 3WUGA 3W82A 3VOCA 2EPKX 1EDQA 2VCAA 4PTWA 4QAWA 1GQLA 3VD5A 4LGXA 4AZ6A 4FF5A 4PCTA 1JZ5A 3N17A 1B3VA 1C8XA 3AMKA 1VEMA 1EH9A 3UG3A 3T0DA 5HPOA 3N04A 1ZB5A 3OLDA 5EFDA 3VIIA 1CTNA 4JFWA 4MAVA 4HMEA 3RPMA 3TONA 1RPKA 4JAWA 3WD3A 4HZ8A 2DT0A 4Z2HA 2X1IA 2DT1A 3BSGA 4J3TA 1QI2A 1EGZA 1V0MA 2BHYA 1QNQA 1ECEA 3AMCA 2YIHA 3WL1A 2J74A 1W3HA 4V2XA 4MJ4A 1UWSA 2VRKA 5JUVA 4H8HA 1JZ4A 1JD7A 5CPSA 1TR1A 1UKQA 2G3JA 5JBFA 1LF1A 1UZ1A 2J7EA 5KEZA 3DECA 1HNYA 1NWRA 1BVNP 4FLRA 1EDTA 2XVKA 1JZ8A 1H49A 4FLQA 2X0YA 1ISWA 3EDDA 1E6RA 1VEPA 4WK9A 1B31A 1M53A 3U57A 2YL5A 3BMWA 3PN8A 1UWTA 3NIYA 4AEEA 5A94A 3OZPA 3ZOAA 1O7AA 1GQIA 3W4RA 1W3JA 1UD2A 4C7DA 2IXVA 2YBUA 1XCWA 1PX4A 1EO5A 4HTYA 1UH3A 1JNEA 3WQ5A 2XHYA 2XGBA 1V0LA 3CHCA 2PWHA 3VIHA 1KR1A 3PZIA 1CBGA 1DTUA 1E56A 3N9KA 1UR4A 3A6OA 1C8YA 3WH7A 4A3YA 3VUPA 1WO2A 3VMNA 1JYNA 3IAPA 3PZMA 2CHOA 4B9ZA 1KB3A 1V02A 8CGTA 3OGRA 3WMCA 1TCMA 4AZ5A 4R5EA 1BYCA 3AHXA 4PTMA 4D6CA 1K9EA 1JFXA 5A2BA 3VD3A 3DC0A 1IZJA 3VNYA 4M29A 4RE4A 5BWFA 4W88A 4PYSA 3KL0A 3SCVA 1J18A 2W63A 4P8XA 2BVDA 5ABFB 3MUAA 3IANA 4U3AA 2A3AA 1CDGA 1CWYA 2V3GA 3ZJ8A 5I79A 1WP6A 2CYGA 2XTKA 1JZ3A 5AC5A 2W66A 4X9YA 1JDDA 4BQ3A 1C3FA 5BXTA 5LA2A 2ESCA 3CPUA 3VGBA 4PMQA 4WKHA 4F9DA 3B8SA 4UFKA 3TTSA 5ABHA 1QI4A 2QMJA 2J8FA 1CZ1A 2PC8A 3U5YA 3CUJA 4QFUA 2YA2A 4IPLA 3D3AA 5I5RA 1GUVA 2E0PA 4OBRA 1V3LA 1ZBKA 1WNOA 2OSYA 4M80A 4TUFA 3GNPA 4WKFA 2EEXA 4W93A 1HVQA 2BXZA 2E9BA 5IFTA 4DWSA 1TVNA 1I1WA 1ZBCA 3SCOA 1QW8A 2XWDA 3K8MA 3ZT6A 1BG9A 1LLOA 3AFBA 4H41A 3VIMA 1XSKA 2UY3A 2WYSA 4NZCA 4W7WA 3VGHA 1R85A 3S2CA 5CPTA 1Q6GA 1V08A 1WZKA 3UCQA 5A8MA 4HZ6A 5CG0A 1UKOA 3A4XA 3BCDA 1JG9A 1A3HA 4H7VA 3VDCA 4ML4A 4HA1A 2XIIA 2VZOA 2ZUWA 3WY1A 3WEOA 3B9AA 2VI0A 3WDPP 5AC4A 3T0BA 3OA5A 1UD4A 1LWJA 2ZX7A 1VJZA 5TD4A 2WPGA 3BCFA 1W1PA 5LA0A 2D0FA 3GXMA 2XVNA 3SUSA 3WENA 2ZXBA 5BROA 2DSKA 4PTXA 3WDQA 1D2KA 1OD8A 1TZ7A 4GQRA 2EJ1A 2FH6A 1MQRA 4HMDA 5ABEA 3OB8A 4DUVA 4P8WA 1UWQA 1CXLA 4KRUA 3ARUA 2CBUA 1V0KA 1HP5A 1FHLA 1UKSA 2D23A 5EB8A 3VTRA 3DYOA 1E9LA 1JI2A 1ISZA 4IUGA 1CEOA 1R7AA 3F5LA 2CBIA 2DSWA 4NRSA 1EXPA 5AYIA 5GNXA 3VNZA 1TMQA 3L4WA 1OWQA 3GBEA 4L4PA 1L8NA 3NSNA 2G4FA 4B16A 4AD1A 3E1F1 4MNJA 4CD5A 1E0WA 1QNOA 1PEZA 1W3KA 2DT3A 1C93A 4U2ZA 3QHOA 2X05A 2F2HA 1AVAA 3ALFA 1SR0A 3WEMA 3OIHA 1V6UA 3VMPA 1I1XA 4M24A 2J4GA 2BXYA 1LL6A 2J79A 2A3CA 2JEPA 5LA1A 4JCMA 1W9PA 1QI0A 1EOKA 3AS0A 3ZM8A 3VU2A 1VEOA 4W85A 2G3NA 1JI1A 1V3IA 3RMEA 2WKLA 4JKMA 1VFMA 4GINA 5HPCA 5I77A 3M46A 1L0PA 3CMGA 3IJ8A 4U2YA 3LPGA 3K4AA 4TXEA 1HJQA 1G9HA 2CITA 1BVZA 1QPKA 2E9LA 1B1YA 3W27A 3MO4A 1CXHA 1GORA 1TVPA 2HVMA 1FFRA 5HXMA 4CN4A 3GH5A 1DWAM 1EA9C 1M01A 1HN1A 3SCPA 1BTCA 1V6XA 2PWDA 3DYPA 4CCEA 1NWUA 4K68A 4WF7A 1JDAA 1GVIA 5GNYA 3VGEA 4KGJA 4S3JA 1TG7A 3PZOA 2W4XA 5IHSA 4AZCA 1GZJA 1GVYA 2VVNA 3F5KA 2GK1A 1PZ2A 3N13A 1GQJA 1MQQA 1WDQA 3GXIA 3BLPX 1IZKA 4D71A 4F66A 4ZXOA 4LPCA 2V38A 3F4VA 2X09A 4UFHA 3W28A 1HX0A 3CZEA 4WIWA 3APGA 1PIGA 3WFLA 2JE8A 3ARRA 1M04A 2WZEA 1I75A 2NT0A 3AIEA 2WC7A 4UFIA 4PBGA 4W89A 4CKQA 3CLWA 1AMYA 2HISA 3W0KA 1C8QA 1Y7VA 4MAZA 4HZ7A 4Z2KA 5CQ1A 3VDHA 1V3JA 3QR3A 1EO7A 3HU7A 1BAGA 5DT5A 3QHMA 5HBFA 2GJXB 2GJPA 3L4ZA 2PBGA 4AW7A 5E6ZA 4BS0A 1JL8A 1H1NA 1J9YA 2CXGA 2VNCA 4HU8A 1E0VA 4JFUA 3POHA 1XHGA 4OKDA 2YLAA 3I3BA 4J3SA 3ZJKA 4H8VA 2WVVA 4Q22A 2D1ZA 4AD3A 4BF7A 1QBAA 4GZJA 1YQ2A 3FN9A 4C7FA 1EIBA 2V3EA 7CGTA 1OT1A 3SUTA 4MJ2A 2PWEA 1H4PA 4TTUA 1DWFM 1GOWA 2ZOXA 4HOZA 2CIPA 4AIOA 1KCKA 1CGTA 5EFFA 1H0GA 1FOBA 3W24A 1EHAA 9CGTA 4J3WA 4HU0A 4YHGA 3OGSA 3A4WA 5I24A 1MXGA 4GZIA 5EMYA 3AI0A 1UG6A 3WKZA 5I78A 1UQYA 1JAKA 4L4OA 1KXHA 2AMGA 1R7OA 5A8PA 4JKLA 5CSYA 3D5HA 1B90A 2QF8A 2WWCA 2Z1KA 1W9XA 3WSUA 1GHRA 2NT1A 3CHEA 3ZO9A 2AAAA 4BQ2A 5A6AA 3POCA 7TAAA 1E73M 3ZR5A 2WLZA 1BGAA 1KFWA 1XH1A 2Y5EA 3MANA 2J25A 2OSXA 3IJ7A 2XSBA 2XSAA 2FH8A 3TTQA 1JZ6A 1E1EA 3K1DA 3ZT5A 1ZBVA 1DHKA 4M8UA 4UQAA 4WSKA 3UESA 4JKKA 3RO8A 2DSUA 3T09A 1XV8A 3SCRA 3VM5A 3T2OA 2D3LA 4J27A 4X0VA 1GJUA 4DWSB 2QLYA 4BQ5A 1CXKA 2XIBA 1A47A 1GOOA 4ZENA 5E6YA 2X0HA 3NCOA 4WSJA 3O9NA 2WAGA 3WDRA 1UZ4A 4QP0A 1Q4NX 2ZICA 5E70A 3WF2A 1HKMA 1V3KA 2YJQA 3WEZA 3CUFA 1BYAA 3WL0A 3UETA 5A95A 3CHFA 1QOXA 3WNMA 3CHDA 3BH4A 2DH2A 4DM1A 2CCRA 1CECA 3CTTA 2Z1SA 4UOJA 3RJYA 4NF7A 2XM2A 1W2PA 4PMRA 3I3DA 2VCBA 5IHRA 3GH4A 1UR0A 4CCCA 2VX6A 1U30A 2OWCA 1E4MM 2BY0A 4AMCA 1E6ZA 3WF3A 1VF8A 3FNDA 1E5JA 2BHUA 1VRXA 4E8DA 1YHTA 1HJVA 4PCSA 2JIEA 4OJYA 4DUWA 3SUVA 1NM9A 3BMVA 1QBBA 1FHDA 4GKLA 1ITCA 4MB4A 3WBAA 4JHOA 2YOCA 1MW2A 2FGZA 1WDPA 1KR0A 1P6WA 2VL4A 3CMJA 2EPMX 3VD7A 1NH6A 1G01A 3ZIZA 2DEPA 3WUFA 5DF0A 1JFHA 1KQZA 3WH6A 2WZHA 3NDYA 2WSPA 3VM7A 4P7NA 1KCLA 1NP2A 3FY1A 4HPGA 1C91A 2XG9A 1QI3A 4LXFA 2PI6A 3BSHA 3VO0A 3WNPA 4GZEA 5IFPA 2XWEA 3A3HA 4UQ9A 3N15A 2Y2WA 2D20A 2EBNA 2WWDA 4M1RA 3QGVA 1FA2A 1AQMA 3N1AA 1VENA 3AXXA 3AHYA 1KQYA 1V3MA 3AMGA 4UZUA 5D8WA 1V6WA 1JYWA 1DWIM 1JXJA 3WNKA 2FGLA 3KWXA 5GNZA 1C7TA 1GOMA 1VBRA 5FL0A 1JZ7A 4CCDA 3MSGA 1V02E 5GQBA 1HJUA 4W8BA 3B9EA 1B0IA 1MW1A 4MNKA 2J7FA 4PTVA 3MMUA 2WLYA 4IISA 5M5DA 5C71A 1E55A 1XRVA 2EPLX 1V6YA 2WK2A 2YBTA 4QCFA 3WDJA 5A69A 3AHVA 2TAAA 3BGAA 7A3HA 1W9BM 2X2YA 2PB1A 2NSXA 1BYDA 2VCCA 4U5KA 3II1A 2BHZA 2E8YA 2VZVA 2WMKA 4CGTA 3AYRA 3EDKA 3AQUA 4XUYA 4ZXLA 5I3DA 4AWEA 1LJYA 5A6BD 3WQ6A 3T2PA 4AXNA 4HP5A 2QV4A 2G3MA 3CZKA 2ZUNA 1X6NA 1H2JA 3WUBA 2J8GA 1OGSA 4AZ7A 3AJ7A 4AZCB 5FD0A 4S3KA 4PUDA 4JL1A 2GK1B 4Y7EA 3PZUA 1MVYA 2ZUSA 4H2CA 3K8LA 3WD0A 3AYSA 1ZJAA 1GW1A 4RE2A 1UR1A 3U5UA 2ZXQA 2BS9A 1EHNA 5A8NA 4U33A 1JGIA 2VC9A 1E6QM 2O9RA 4AD4A 3ARPA 3SIMA 3WF0A 3DHPA 1UOKA 1E72M 3K8KA 1NOFA 4CD8A 3ZSSA 4JL2A 3N12A 1K9DA 3PZGA 3F5JA 2E3ZA 3N18A 2DGAA 1B9ZA 1UR2A 3FHAA 5CXPA 3RJXA 3ARSA 3SURA 4D6JA 1US2A 4GO9A 4NI3A 1HKKA 2C0HA 3SCNA 3MUIA 3ECQA 5HNNA 5D9OA 4MB3A 1D3CA 2CHNA 2VX7A 1JYVA 3ALGA 3GNRA 4PUEA 3THCA 5JBEA 4PRWA 4EE9A 1FH7A 1SFSA 4EK7A 1UWIA 4PSRA 5EBAA 4W5ZA 1J11A 3VDAA 2VZUA 4D6FA 1KWGA 4V27A 2W5FA 2PWGA 1J0IA 2WNWA 2D3NA 3SCWA 5BCAA 1ZS2A 3MMWA 2XFFA 3MV01 3WQ4A 4PMYA 1OSEA 4HOWA 3ZT7A 2O9TA 2XUCA 4WKAA 3UEQA 1AQ0A 4PMUA 3VILA 2WM0A 3AMDA 4AD5A 4ZFMA 5GPRA 4W8LA 1UH2A 3M7SA 1W9DM 4P7LA 4E8CA 1RH9A 4UTFA 1D7FA 1UD8A 5IDIA 4GPNA 1U33A 4HMCA 3WNOA 1LG2A 2J7CA 1MFUA 5A6JA 4D72A 3J7HA 1PX8A 4Z2GA 3ARXA 3NDZA 1HKJA 4EKJA 2C8NA 5DT7A 5I2UA 1E5NA 4CU7A 1Q6DA 1CGVA 3WQ8A 4PMOA 4AD2A 2WW5A 1UR8A 1R87A 1UR9A 1R8LA 1BQCA 1UQZA 3WNNA 5M3WA 2JF7A 2VMFA 1H41A 4W7UA 3WD2A 1NQ6A 3BXWA 4LYPA 2WMIB 2D0HA 4IM4A 1QHOA 3WH5A 1LL7A 1UKTA 2WZIA 3CIVA 5A3HA 4MB5A 4P8UA 4AZGA 1H3GA 4P7OA 5BXRA 3CO4A 4AYSA 1CYGA 5A2AA 4UQCA 3SUWA 4KMQA 1CGYA 1IT0A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1FP9 A;  3EDE A;  2OWX A;  4CUC A;  1CGW A;  1B3Z A;  3VIF A;  1J0H A;  3KZS A;  1ZL1 A;  3AIW A;  1TE1 A;  3RIL A;  1B2Y A;  3GYC A;  4BCE A;  3EMC A;  2W92 A;  4TOQ A;  3WQV A;  3G6L A;  2WHL A;  1OT2 A;  2VT0 A;  3SCT A;  4WLC A;  3WDH A;  1EQC A;  1DWH M;  5JIW A;  3VPL A;  1HP4 A;  1OIF A;  1Q6C A;  5CLT A;  2OYM A;  3ARW A;  1UHV A;  4UQD A;  3VMO A;  5CZK A;  4GXP A;  1HL9 A;  1VFO A;  1W2V A;  1ZU8 A;  1CNV A;  2VZS A;  1GOQ A;  4PMD A;  3BAK A;  3OZO A;  1G5A A;  1LWH A;  4A3H A;  2NW0 A;  1CXI A;  5D4Y A;  3FAW A;  2OWW A;  4W86 A;  2WMI A;  1E3Z A;  3UG4 A;  3HMC A;  2A3B A;  2CNC A;  2E8Z A;  4AIS A;  1E0X A;  2VJX A;  2DPE A;  5FCZ A;  3OG2 A;  4OOU A;  2ZX5 A;  3MUY 1;  2J75 A;  4AZB A;  4E2O A;  1XCX A;  4MB1 A;  4UR9 A;  1HIZ A;  1PZ3 A;  1XH0 A;  1UUQ A;  1J0K A;  4D6D A;  4P8V A;  3ZQ9 A;  3AOF A;  3MV1 1;  2DSZ A;  2YLL A;  2VUY A;  1CGU A;  1E43 A;  2FHF A;  6A3H A;  2J7B A;  3B9D A;  3CGT A;  4J7R A;  3A4A A;  1R86 A;  3WUG A;  3W82 A;  3VOC A;  2EPK X;  1EDQ A;  2VCA A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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