1QNPA

The 3-d structure of a trichoderma reesei b-mannanase from glycoside hydrolase family 5
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
ASSFVTISGTQFNIDGKVGYFAGTNCYWCSFLTNHADVDSTFSHISSSGLKVVRVWGFNDVNTQPSPGQIWFQKLSATGSTINTGADGLQTLDYVVQSAEQHNLKLIIPFVNNWSDYGGINAYVNAFGGNATTWYTNTAAQTQYRKYVQAVVSRYANSTAIFAWELGNEPRCNGCSTDVIVQWATSVSQYVKSLDSNHLVTLGDEGLGLSTGDGAYPYTYGEGTDFAKNVQIKSLDFGTFHLYPDSWGTNYTWGNGWIQTHAAACLAAGKPCVFEEYGAQQNPCTNEAPWQTTSLTTRGMGGDMFWQWGDTFANGAQSNSDPYTVWYNSSNWQCLVKNHVDAIN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Three-Dimensional Structure of a Trichoderma Reesei Beta-Mannanase from Glycoside Hydrolase Family 5.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Trichoderma reesei
molecule keywords ENDO-1,4-B-D-MANNANASE
total genus 138
structure length 344
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 1999-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1qnpA00
4PTMA 1U2YA 1HL9A 4PMRA 3QHOA 1JNEA 2YDSA 3AHTA 1VF8A 4JCLA 2VL4A 3M07A 3GNPA 2XVPA 1KGWA 2BV9A 4W85A 3DHPA 1WDSA 1H09A 4UFHA 3VIMA 2VR5A 2J78A 1Q6EA 5IDIA 1BTCA 4W89A 3D3AA 4D6JA 1W32A 1DWHM 2V5DA 3GM8A 1QI3A 4BQ2A 3WD2A 1M7XA 2G3JA 4PTVA 4N42A 1QI5A 3WUEA 1VFFA 3CTTA 1XGZA 3TOPA 1J01A 1HKKA 1TR1A 1GOQA 2VX7A 1VAHA 2WSKA 5E0FA 2YLAA 1JL8A 3T2PA 1QPKA 3THCA 4AWEA 2G8ZA 4HU8A 4ZFMA 3OLEA 3THDA 1J0IA 1FP9A 1RH9A 4NZCA 4W8BA 3WL1A 4HTYA 1DWJM 2F8QA 1E55A 2XSBA 4DM2A 2DEPA 2CNCA 2PI6A 2YA0A 4P8UA 2BHUA 1JNDA 4MAZA 3WQVA 1E40A 4TX8A 1GUVA 2XVLA 5A69A 4PEEA 1BYCA 2WHMA 1DEDA 4GZEA 4QLLA 2J62A 3SCNA 2CERA 3IJ9A 1HP5A 2YA2A 4AY1A 1OIMA 2ZX5A 3WELA 2O9PA 2VQUA 1XCWA 4MB3A 4BQ4A 3IAPA 5HBFA 1QHZA 4W5ZA 3B9AA 4QCFA 3CGTA 3W27A 6TAAA 2WLYA 3UR7A 4JCMA 2BVTA 2BHZA 3ARXA 5A95A 1BG4A 2WXDM 5E6ZA 4PTWA 4F8XA 1E71M 1JXKA 3WBAA 1KGXA 5IHRA 3K8MA 1WDRA 1TFVA 1G1YA 1OB0A 1EHAA 2QPSA 3WQ5A 3TTYA 4L4PA 2BY0A 2E0PA 4C7FA 5DFAA 1JZ4A 1LG1A 2J7GA 3WH8A 2XM2A 3U5UA 4PMOA 3EMZA 1QHPA 3BAYA 1I1WA 2DGAA 3VPLA 2J79A 2O9TA 1GW1A 5AY7A 5LA0A 2GVYA 4UFKA 4AD3A 1W1TA 5ABHA 2ZXDA 1Z32X 3AOFA 3IANA 3WEZA 3N15A 4RE2A 1JXJA 2X0YA 4HMEA 2CBVA 3QR3A 1WPCA 3WH7A 2OSXA 1GVYA 3WNLA 4GQRA 3WMSA 1QVBA 2VRQA 3VIFA 3CUFA 3AICA 1GOKA 4MB5A 3M46A 3BGAA 4OJYA 4KGJA 1D7FA 1CGXA 1G94A 2J75A 4W88A 1FH7A 5AYIA 1CWYA 1UR1A 3FW6A 1K9DA 3WBEA 1EQCA 3N04A 1C8XA 3WNNA 2YJQA 3VDAA 3GDBA 3MMUA 2WHKA 2BHYA 3F5KA 5C71A 4HMCA 5HPOA 3QOMA 4HPHA 3VU2A 1C8YA 4PUEA 4JL2A 3WH5A 3A6OA 3CZJA 1UA3A 1H5VA 3AI0A 1E6NA 3AS2A 4K68A 4ACZB 2J8GA 1KGUA 1YHTA 4FK9A 3BH4A 3SCOA 2W4XA 1XD1A 3MANA 5A3HA 1CLXA 4CCEA 5FKYA 1WDQA 2AMGA 3ARUA 3KL0A 5I5RA 1W9UA 1DWAM 3SUTA 3CUGA 4PRWA 1C3FA 3MUY1 4HOWA 1ZBKA 2E3ZA 5DEZA 3S6TA 5CSUA 1NOUA 1UH4A 4U5KA 2DSVA 2A3BA 2F61A 2VZVA 4EAMA 1H1NA 3L4VA 5I0DA 2BY2A 3POHA 1D2KA 1MQRA 2WMFA 1GPFA 3CMJA 1GJUA 1OT2A 1IT0A 2EO7A 3AYSA 3PTKA 2XHYA 3BAKA 3CIVA 1M04A 2ZWYA 4P7LA 4AYSA 3NDYA 3L4ZA 5JIWA 1XYZA 4ZEPA 1D3CA 1HKMA 3ARRA 2VOTA 1VFOA 3CZ8A 2WZHA 5BCAA 1O7AA 3NSMA 2OYKA 1KBBA 3W29A 1JFXA 3GXFA 5CPQA 4BS0A 4FLOA 1MW0A 1MQPA 5I3DA 1WAWA 4AZHA 4BQ3A 1C7SA 2E8ZA 1UQZA 3T2QA 4FLSA 4KH2A 3O9NA 4HOZA 2XJ7A 3WQWA 4W86A 2J4GA 2V3EA 1W2PA 3AISA 1DTUA 4P7QA 3FN9A 3KL5A 3TONA 3MS8A 2XGBA 4CD8A 3TTOA 4HU0A 2WC4A 3BAIA 3UR8A 2G4FA 2D0FA 4XZBA 4W8AA 1E15A 3BAJA 3AMKA 4EE9A 3VIKA 2G3IA 8A3HA 1Q6GA 1QNPA 2X0HA 1GONA 4M29A 4IPNB 3VMNA 5BROA 3BSHA 3RIKA 2PC8A 2GFTA 1EOKA 1Q6FA 5JBEA 4PMYA 4TX6A 1KFWA 2XTKA 2W67A 1E3ZA 4AIOA 2D2OA 3BLPX 1ISWA 5FL0A 1G5AA 3RM9A 4X0VA 2BXZA 2CCRA 1QI0A 2CHOA 2DDXA 1KQZA 2FHBA 3HN3A 1UH2A 3W81A 5ABEA 3LMYA 1E6SM 3NUKA 2GJRA 3AZTA 1CLVA 1L8NA 3OZPA 4D72A 2VTFA 1PX8A 3ZO9A 1CXEA 3PZQA 5DMYA 1NP0A 1C93A 2JALA 4WK9A 1ZS2A 3A3HA 1CXKA 3WUGA 2VZSA 4AEFA 4J7RA 1PAMA 1GVIA 1UZ4A 4PYSA 5CPTA 4AZIA 3WUBA 3ZOAA 2XSAA 1BYBA 2DT0A 1HJSA 4U3CA 1W91A 3A4WA 3AXIA 4TOQA 5GNXA 1P6WA 3AXXA 2Z1SA 1JF5A 2JF6A 2VRKA 2DSWA 2GSJA 2D20A 2WKGA 2WBKA 2V3GA 1WDPA 4MDOA 2WKLA 3SUUA 5ABFA 3L4WA 3VMOA 5E0CA 1OGBA 5A6AA 3SUWA 2YL5A 1CGUA 1V3MA 4Q22A 1VB9A 5A8NA 1E0XA 1ODZA 4CVUA 5BRQA 1L0PA 4Z2IA 4H8VA 1QNQA 1WZMA 3AS1A 3ZJKA 1AQMA 2XVNA 4UQ9A 3CZKA 5I2UA 4QLKA 2WMIB 3VIPA 2WCGA 1CGTA 1R7OA 1SYTA 5A2AA 2J7HA 3CBWA 5E6YA 2GUYA 1ZJAA 3IK2A 1BQCA 2WHLA 4H8HA 5D4YA 3GTNA 1DHKA 1RP9A 3LPOA 2WZEA 4PMVA 4J3UA 4AZ7A 1OINA 5LA2A 2BY3A 5F7UA 1K9FA 1E0VA 1UR4A 1V0KA 5EFFA 6CGTA 3I3BA 1NWSA 1N82A 3WF3A 3TTQA 3VIOA 4TTGA 3VX1A 1V03A 4W93A 4IPLA 4HZ7A 3WQ6A 4JKLA 4D71A 1VFMA 3CUIA 4D6HA 1HVXA 4AZCB 3PZTA 1MQQA 2X1IA 3EYPA 4GI6A 4ZXOA 2FGLA 1UD4A 2DT1A 3T0DA 2DIEA 3PZUA 4UOZA 1V6VA 2DT2A 1VBUA 1W1YA 2DSKA 2WC3A 1TUXA 1V6WA 2WZIA 3EDKA 3AHXA 4OIFA 3G6LA 4U5IA 4NF7A 3FAWA 3MUIA 1EO7A 4U2YA 4Q7NA 3E1F1 3DC0A 5I6SA 1SR0A 3IJ7A 3BLKA 4P8VA 4UQEA 3VTRA 5BXTA 1W2VA 2DPEA 2VVSA 1FA2A 1UOKA 1X1NA 2ZX6A 1GOIA 1UWRA 1UD6A 2WANA 1CDGA 2ZUTA 4FLRA 1HJUA 4U31A 1AVAA 1JGIA 1BYAA 2EBNA 1R8LA 3AS0A 3L2MA 1PPIA 4WKFA 4AZBA 1H0GA 5D9NA 2VC9A 3RILA 4LX4A 3II1A 3CPUA 1KQYA 4MNKA 5I77A 3SCRA 5CJ5A 1X6LA 3PHAA 3ZT6A 4F9DA 3DECA 3ZMRA 2EPNA 3VNYA 4OZOA 5A6LA 1JYWA 4M82A 4FLQA 1JDDA 2YA1A 2VJXA 4Z2HA 3OGVA 8CGTA 1KXQA 3WF4A 3WD1A 2JIEA 1EDTA 1CXIA 1W9PA 4GKLA 5GPRA 2Y8KA 3LPPA 2IXUA 3WD0A 1ECEA 1GORA 2D0HA 4YN5A 4F79A 1B3WA 1XCXA 2E40A 1GHRA 2WCAA 2GJPA 2WMIA 1DP0A 1OGSA 2ZUSA 2V5CA 2E9MA 3WDRA 1CGWA 4JHOA 5A6KA 4HP5A 3ZT5A 1J12A 2V3FA 5D9MA 3T0AA 1CGYA 3UESA 3SURA 3VGBA 1TVPA 1OCQA 2ZX8A 3VGHA 3VD3A 2XFRA 3AIVA 1GOMA 1ZB5A 1NH6A 3WH6A 3MUAA 1VEPA 3QGVA 5HXMA 9CGTA 2NSXA 3AZSA 3WL0A 1XD0A 1UKSA 2EPOA 1WE5A 1V3KA 2A3EA 2QF8A 2ZUVA 4JIEA 4DWSA 2YBUA 3GH4A 1OD8A 1OD0A 4OKDA 4D6CA 3GH7A 3EDEA 3AIWA 5M03A 1OT1A 1JI2A 1E4LA 2WVSA 5IFPA 3DYMA 1DWIM 3O2LA 4XB3A 4E8DA 3VDHA 4B9ZA 3GBEA 3CHEA 5BXRA 4QDMA 1KWGA 4J3WA 4PTXA 1J0HA 1WKYA 2VUYA 4BCEA 3W53A 4CCDA 5CLWA 3OZOA 4A3YA 5LYRA 7CGTA 1AQHA 3EMCA 2J7EA 2J8FA 1H0IA 2HISA 2W61A 5D8WA 1QNRA 2J25A 3VILA 3AMCA 4DUXA 1V0NA 3MMWA 5D9PA 3WKZA 2VR4A 1KCLA 1VEOA 2OYMA 1ZL1A 4JFVA 2YDRA 2FH6A 1VJSA 3OGRA 2ZXAA 2WW5A 3WNKA 1AQ0A 3UERA 3S2CA 1HKIA 3W24A 1W9BM 1MFVA 2FDMA 4UOJA 2CXGA 5FOOA 3A4XA 1FFRA 1J9YA 1XV8A 3WQ4A 3U57A 2JIWA 2CETA 1BF2A 6A3HA 4KMQA 4QAWA 5D8ZA 1MYRA 1J0JA 2JE8A 3ZR5A 4JFWA 3MUZ1 5A6MA 4C7GA 4WLCA 2D3NA 2WWCA 4D6GA 2QMKA 3OGSA 4OOZA 2DH2A 4ZE4A 5CZKA 5A8PA 3T0BA 1J0KA 2MANA 1CPUA 3ARQA 2YOCA 1C91A 4JKMA 3CHFA 2GJXB 3KL3A 4FF5A 5C70A 3CUJA 3VGFA 2EXOA 1ISYA 4W87A 1IZJA 3DHUA 4PSPA 2VT0A 3WN6A 3ECQA 1E9LA 1EXPA 2CESA 2VCAA 5BWFA 3AYRA 2XIBA 3MMDA 4MAVA 1J0ZA 3WDJA 4YPJA 3RJYA 3VO0A 1WCGA 3L2LA 3QHMA 1H2JA 2D1ZA 4KRUA 1O6IA 4P7OA 4LYQA 4E8CA 3W37A 4MB1A 3OLDA 2W5FA 1BVNP 1CGVA 4TVDA 4XX6A 1HX0A 1UG6A 4UQAA 1EHNA 2IXVA 4E2OA 1WP6A 4JFUA 2XVGA 2J7CA 5EBAA 4WF7A 1B9ZA 2WM0A 2DSZA 4GZIA 3GNRA 1UUQA 4XUYA 5HOSA 2W66A 1HN1A 2J7DA 3ZM8A 2CBIA 4LGXA 2CITA 4NRRA 4UQDA 1LLOA 4AZGA 4CKQA 2QPUA 5M5DA 1LL7A 1BHGA 4PMXA 1JZ6A 1E5JA 1CXHA 3VNZA 2O92A 3K8KA 1H4PA 5HDRA 1BGGA 1TVNA 2E9BA 2Y2WA 3SUSA 3N11A 4ATWA 4M24A 1JFHA 3VKKA 2YKKA 4B15A 2ZUWA 3PZGA 1OBAA 3RPMA 4UQCA 1C92A 2FGZA 3AIQA 4TTUA 3SCQA 1CENA 1XSKA 2XG9A 1PEZA 1I1XA 2TAAA 3ARTA 5A6BD 4CN1A 1Y7VA 3M7SA 4CD5A 3RJXA 3APGA 1UH3A 2XUCA 2FHFA 3MV01 5CGTA 5I79A 3U7BA 1GZJA 5ECUA 2ZX9A 3BAWA 1MW1A 4X0NA 4GXPA 2YL6A 2EEXA 4PMNA 1F4HA 1G9HA 2AOSA 2W63A 2CBJA 2YDQA 4UR9A 3BC9A 2G3NA 1UKQA 1HJVA 3VX0A 3BMWA 1BSIA 3MSDA 4NI3A 1KR0A 1V3IA 1B3XA 3I3DA 1WNOA 2O9OA 2PWDA 3WDQA 1XC6A 4D6EA 5CPSA 3AIBA 1RP8A 4HA1A 1V02E 1HKJA 3TP4A 1A47A 5A8MA 3VD7A 4LQ1A 4Z2GA 3ALGA 4AXNA 2FHCA 1NM9A 3FY1A 5JBDA 4AD2A 4Z2JA 3BAXA 3AROA 1CEOA 1UD8A 1KBKA 1NWTA 5GNZA 3AMDA 3I3EA 4AC1X 1VBRA 2UY5A 4OUEA 3WEMA 2D0GA 2VI0A 1XRVA 2E4TA 4MPKA 1E1FA 1BVZA 3GNOA 2BFGA 3L4TA 3RMEA 4R5EA 5BYWA 4J3VA 4D6DA 1E43A 4FMVA 4JKKA 1QBAA 3RDKA 3W0KA 5AC5A 5HNNA 2WK2A 1DWGM 4OBRA 3PN8A 1TA3B 5E09A 2PWEA 4ACZA 4PMZA 5LA1A 1V3HA 3CO4A 3AJ7A 3SIMA 1M03A 3GXDA 1UWIA 5JUVA 3AHYA 4PUDA 4LYPA 3RO8A 3WUFA 1ODUA 1E0WA 1WZKA 4M81A 3K8LA 1HJXA 2OWXA 4J28A 1FHLA 5I23A 1K9EA 1Q6DA 3PTQA 3WMBA 3AIEA 2NT0A 4AD1A 2RGLA 3PZMA 3FHAA 4Z2KA 3NJ3A 4JFTA 1QHOA 1VFUA 3UEQA 1LL4A 2QHAA 4D1IA 1HVQA 1XH2A 5A6JA 1HJQA 3BCFA 5FIPA 1QW8A 1E3XA 5AYBA 3MV11 2UWFA 1TZ7A 4UFLA 1FH8A 4S3KA 1JYNA 3PZIA 2PWHA 1E4NA 1Q4NX 3WQ8A 3VUPA 1KXVA 5JBFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4PTM A;  1U2Y A;  1HL9 A;  4PMR A;  3QHO A;  1JNE A;  2YDS A;  3AHT A;  1VF8 A;  4JCL A;  2VL4 A;  3M07 A;  3GNP A;  2XVP A;  1KGW A;  2BV9 A;  4W85 A;  3DHP A;  1WDS A;  1H09 A;  4UFH A;  3VIM A;  2VR5 A;  2J78 A;  1Q6E A;  5IDI A;  1BTC A;  4W89 A;  3D3A A;  4D6J A;  1W32 A;  1DWH M;  2V5D A;  3GM8 A;  1QI3 A;  4BQ2 A;  3WD2 A;  1M7X A;  2G3J A;  4PTV A;  4N42 A;  1QI5 A;  3WUE A;  1VFF A;  3CTT A;  1XGZ A;  3TOP A;  1J01 A;  1HKK A;  1TR1 A;  1GOQ A;  2VX7 A;  1VAH A;  2WSK A;  5E0F A;  2YLA A;  1JL8 A;  3T2P A;  1QPK A;  3THC A;  4AWE A;  2G8Z A;  4HU8 A;  4ZFM A;  3OLE A;  3THD A;  1J0I A;  1FP9 A;  1RH9 A;  4NZC A;  4W8B A;  3WL1 A;  4HTY A;  1DWJ M;  2F8Q A;  1E55 A;  2XSB A;  4DM2 A;  2DEP A;  2CNC A;  2PI6 A;  2YA0 A;  4P8U A;  2BHU A;  1JND A;  4MAZ A;  3WQV A;  1E40 A;  4TX8 A;  1GUV A;  2XVL A;  5A69 A;  4PEE A;  1BYC A;  2WHM A;  1DED A;  4GZE A;  4QLL A;  2J62 A;  3SCN A;  2CER A;  3IJ9 A;  1HP5 A;  2YA2 A;  4AY1 A;  1OIM A;  2ZX5 A;  3WEL A;  2O9P A;  2VQU A;  1XCW A;  4MB3 A;  4BQ4 A;  3IAP A;  5HBF A;  1QHZ A;  4W5Z A;  3B9A A;  4QCF A;  3CGT A;  3W27 A;  6TAA A;  2WLY A;  3UR7 A;  4JCM A;  2BVT A;  2BHZ A;  3ARX A;  5A95 A;  1BG4 A;  2WXD M;  5E6Z A;  4PTW A;  4F8X A;  1E71 M;  1JXK A;  3WBA A;  1KGX A;  5IHR A;  3K8M A;  1WDR A;  1TFV A;  1G1Y A;  1OB0 A;  1EHA A;  2QPS A;  3WQ5 A;  3TTY A;  4L4P A;  2BY0 A;  2E0P A;  4C7F A;  5DFA A;  1JZ4 A;  1LG1 A;  2J7G A;  3WH8 A;  2XM2 A;  3U5U A;  4PMO A;  3EMZ A;  1QHP A;  3BAY A;  1I1W A;  2DGA A;  3VPL A;  2J79 A;  2O9T A;  1GW1 A;  5AY7 A;  5LA0 A;  2GVY A;  4UFK A;  4AD3 A;  1W1T A;  5ABH A;  2ZXD A;  1Z32 X;  3AOF A;  3IAN A;  3WEZ A;  3N15 A;  4RE2 A;  1JXJ A;  2X0Y A;  4HME A;  2CBV A;  3QR3 A;  1WPC A;  3WH7 A;  2OSX A;  1GVY A;  3WNL A;  4GQR A;  3WMS A;  1QVB A;  2VRQ A;  3VIF A;  3CUF A;  3AIC A;  1GOK A;  4MB5 A;  3M46 A;  3BGA A;  4OJY A;  4KGJ A;  1D7F A;  1CGX A;  1G94 A;  2J75 A;  4W88 A;  1FH7 A;  5AYI A;  1CWY A;  1UR1 A;  3FW6 A;  1K9D A;  3WBE A;  1EQC A;  3N04 A;  1C8X A;  3WNN A;  2YJQ A;  3VDA A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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