1QNPA

The 3-d structure of a trichoderma reesei b-mannanase from glycoside hydrolase family 5
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
ASSFVTISGTQFNIDGKVGYFAGTNCYWCSFLTNHADVDSTFSHISSSGLKVVRVWGFNDVNTQPSPGQIWFQKLSATGSTINTGADGLQTLDYVVQSAEQHNLKLIIPFVNNWSDYGGINAYVNAFGGNATTWYTNTAAQTQYRKYVQAVVSRYANSTAIFAWELGNEPRCNGCSTDVIVQWATSVSQYVKSLDSNHLVTLGDEGLGLSTGDGAYPYTYGEGTDFAKNVQIKSLDFGTFHLYPDSWGTNYTWGNGWIQTHAAACLAAGKPCVFEEYGAQQNPCTNEAPWQTTSLTTRGMGGDMFWQWGDTFANGAQSNSDPYTVWYNSSNWQCLVKNHVDAIN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Three-Dimensional Structure of a Trichoderma Reesei Beta-Mannanase from Glycoside Hydrolase Family 5.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-B-D-MANNANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Trichoderma reesei
total genus 138
structure length 344
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 1999-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1qnpA00
1VBUA 2W62A 3VM7A 2DSKA 1OD0A 2J25A 3BXWA 3WMSA 2WW5A 5BRQA 3NSMA 2C8NA 4C7FA 2EPOA 4U2YA 5A6BA 4D6DA 3WUGA 3WBAA 1U33A 3BAIA 4YN5A 2BNJA 4B9ZA 5CPTA 1W3LA 4KRTA 1ODUA 1W9UA 1XD1A 4DUXA 2PWHA 1EDQA 1XCWA 4NZCA 3U57A 2VL4A 4F9JA 1FOBA 4HOWA 1JI1A 3AIVA 5A6LA 4AEFA 3SCTA 4AYSA 2GDUA 1BTCA 1EDTA 3T0AA 4JCMA 4P7QA 2V38A 2EPNA 2WMGA 3VILA 3W24A 4P7OA 3WF1A 2VMFA 6CGTA 1KXHA 2XVGA 5A2AA 2WZHA 1HKJA 4TUFA 4DM1A 2YDQA 5CG0A 3VDAA 1CIUA 2Y8KA 5C71A 3UCQA 3PZOA 1HVXA 3VD9A 2WMIA 4XV0A 1LQ0A 3WNOA 2CBUA 2XSAA 4M1RA 4JHZA 4F66A 1E4NA 1OIFA 3NIYA 1GORA 2CBVA 3AIEA 1HP5A 2WMIB 4MJ4A 2GJRA 5CPSA 1CGYA 3VIHA 3OGRA 4FLRA 2WMFA 4JHOA 4JFUA 4WKFA 1WNOA 1B2YA 2BS9A 5BXRA 1MXGA 3WFZA 3WDHA 1C7SA 4H8HA 4JKMA 1F4AA 2DT0A 1QNPA 3UG3A 3GXMA 5A8OA 3AHXA 1E4LA 3SUTA 3ARXA 2YLLA 3RJXA 4JKLA 5HNNA 4ATLA 2CESA 5A8MA 4P8VA 1V08A 3ZIZA 1GOWA 1GUVA 2UWFA 1UR8A 4AXNA 3ZJ6A 3T09A 1VFFA 1HJQA 1C91A 1LF1A 3SUUA 3L4XA 1HNYA 5IXEA 4XB3A 4FK9A 4GI9A 1MW1A 3I3EA 3O9NA 3KL3A 4J3VA 1GNXA 2CEQA 4MB3A 1UR9A 2UY5A 3ZJ8A 3VOCA 4LYQA 3VX0A 4ZXOA 4Z2GA 2MANA 1CGUA 5A8NA 1MQPA 2ZXDA 3ARUA 3WH6A 4J7RA 3LPFA 2G41A 1FFQA 3POHA 2CKSA 3VGGA 5JBFA 1VEPA 4UOQA 1CECA 2FGZA 5A6SA 3AXHA 2VURA 2VOTA 2XGBA 5A2CA 1ZU8A 5CSUA 1Q6DA 1W91A 2EEXA 1H3GA 1GJUA 4U5IA 3W0KA 2VCAA 2OSXA 3RM8A 1QNOA 1RPKA 2QF8A 2V3GA 1D2KA 1LG2A 1QNQA 2OWXA 2NSXA 2DEPA 1KR0A 1J0JA 3AZSA 1W3KA 3W53A 2WANA 5ABGA 2RGLA 4AMCA 2WC3A 3W29A 1TE1A 1R8LA 1V0LA 2JE8A 2ZX6A 1TR1A 3CZEA 4JCLA 4Q7NA 3CUGA 2W67A 3AZTA 2O9OA 1E6ZA 3OLIA 1E71M 1C90A 1X6LA 1XHGA 4CU6A 2A3AA 3A47A 2D3LA 1BG9A 2CXGA 3CUFA 2XVLA 2QMKA 1SMDA 1VFOA 1LJYA 1E4MM 2JEPA 4R27A 2WHKA 3T2OA 2X1IA 1EA9C 3BSGA 4NRSA 2E9MA 1QBBA 3PTKA 2J62A 3MSGA 2J47A 2QV4A 3AMCA 5A1AA 1ZL1A 4PTVA 1QI5A 3UEQA 3BAXA 1V3KA 2BVTA 2WHJA 3AFBA 2QHAA 3B9AA 5A6BD 2VQUA 1TFVA 4MDOA 1JZ6A 5M3WA 2WC7A 4JFWA 2NT0A 2E9BA 1UR0A 1WZLA 4UOZA 3A3HA 3D3AA 4NF7A 2J78A 4PMDA 1E55A 1W3HA 3MMUA 1FP9A 2J79A 2CHOA 4YHEA 3VDCA 2BXYA 3QHNA 2EQDA 3VGHA 1GONA 5JBDA 3AJ7A 3AYSA 1UHVA 1HJWA 1KCLA 4U5KA 4GPNA 1ISVA 1HX0A 4XX6A 2Y2WA 5BRPA 3GBDA 1JZ7A 2PF0A 2UY2A 3SCWA 4X0NA 2WMKA 4GQQA 4PCTA 4U2ZA 3U7VA 3CLWA 4B9YA 1QVBA 1KWGA 4KWUA 5IFPA 3AQUA 3JUGA 4X9YA 3AROA 3EDKA 5KEZA 4W7VA 1KBBA 1FHDA 4AD2A 2JIWA 1HKIA 3RPMA 3CHCA 3EBVA 1IZJA 4MAZA 1CDGA 3VNYA 2YOCA 1XC6A 1H0GA 1VAHA 1UWSA 1FP8A 2D0HA 4AZIA 1HKMA 3MKKA 3GDBA 3BCDA 4ACYA 1GJWA 3A4WA 2X0YA 4MDPA 4JL2A 4DUVA 3G6LA 1ISZA 2A3EA 3SCSA 1ESWA 1K9DA 1UWIA 3VIKA 2G3NA 3GXFA 1QI3A 1EO7A 3BLKA 1NOFA 5E0CA 1WPCA 5CQ1A 3AMLA 5HOSA 3FHAA 5FKYA 1UZ4A 4GXPA 4D6HA 1KXVA 4M24A 4ZE5A 4NRRA 3K1DA 2BFGA 3ALFA 3AYRA 2OSYA 3A4XA 2OWWA 4B16A 1BFNA 4M29A 1ZBKA 2BY0A 2JEQA 3CZKA 4CCDA 4D72A 3U5YA 2DSWA 5ABEA 4HZ6A 2VRKA 3PTMA 1E6NA 1Q6FA 1JZ5A 2GSJA 3HJEA 3BAKA 3L2MA 1E6PA 2PI6A 2YLAA 2BHUA 2V3FA 5BXTA 3EDFA 4MJ2A 1TVPA 4E8CA 1GVIA 3AMGA 5JBEA 2CKRA 4OOUA 4CN1A 4BQ3A 4Z2LA 1EGZA 5I0DA 4UFIA 3RIKA 4PN2A 4M56A 3ZSTA 1ITCA 3SEPA 3GNPA 2D24A 3WELA 3RMEA 3VPLA 1CGXA 3GH7A 4BCEA 2CITA 3MMDA 4MNLA 1US2A 3VGEA 2F8QA 1KFWA 3ARTA 3VIMA 2ZIDA 2WZEA 3B9EA 1OINA 1M03A 1UKOA 4QLKA 4DWSA 1OB0A 2J7HA 1NWUA 1TG7A 1WB0A 3KZSA 3K4DA 3FAWA 3G6MA 4J27A 1EOMA 4M82A 4UQBA 3WL0A 4DWSB 3W38A 2J7FA 3VTRA 1V02E 3MSDA 3WENA 3IJ8A 4U3CA 1B3WA 4UNIA 1EH9A 2DT1A 1G94A 1C8XA 2E8ZA 4QCFA 2C0HA 1DWAM 2ZICA 3M7SA 2ZUUA 1O7AA 1J0YA 9CGTA 1BAGA 3AXXA 1G1YA 2WAGA 5A2BA 3OIHA 4JZ5A 1W2VA 5GNZA 4Z2KA 1ZBVA 1VIWA 1I75A 5A6KA 3EMQA 1E0WA 5ABFA 1JXKA 4AZHA 2WZIA 1V6YA 3DHPA 3VGDA 5HBFA 1E6RA 4ZE4A 1KQZA 4P8XA 1QPKA 2Z1KA 1WDSA 3RCNA 3DHUA 5ABFB 1CXKA 1CNVA 2VCBA 1EIBA 3GZAA 4P8UA 4UFMA 4C7DA 3AHVA 3AIUA 2OYMA 4W8AA 2WHMA 3TOPA 1F4HA 3ZO9A 3VD7A 4KRUA 2CPUA 4GI8A 1DWHM 3EDJA 4EANA 4URIA 3VO0A 3SCQA 4GI6A 3GXDA 1DP0A 1GZJA 1B1YA 2V5CA 3OGVA 4OOZA 5IFTA 1ZBCA 4ML4A 1WKYA 5I23A 1R87A 1ZB5A 1MXDA 3SCUA 1JAKA 1HXJA 3N11A 1HJSA 2WVVA 1KXQA 2GJPA 1WZKA 2J8FA 3WNMA 5A6JA 4UFJA 1IT0A 1ITXA 3PN8A 2J75A 3ZM8A 3NJ3A 3W26A 5E6ZA 3WNKA 2WVVB 1WO2A 1JYNA 1UQZA 4TXEA 3CGTA 2GDVA 4UR9A 1WZAA 4Y7EA 3FY1A 3PZGA 1LL6A 2E3ZA 1PX3A 3PZVA 4AD3A 1CLVA 1VFUA 2Q8XA 2XM2A 3PHAA 4CGTA 4TTGA 3ZT6A 1QOXA 1MYRA 1QNSA 1ZJBA 1GQLA 4JFTA 2BVDA 4HZ7A 2WPGA 5CXPA 1SR0A 1OT1A 4V27A 4ZEPA 1HJVA 1WCGA 2XGIA 3UETA 5DF0A 1RP9A 1SMAA 4B3LA 4QFUA 2WMHA 4QAWA 2AAAA 2J7DA 5EFDA 2VQTA 3WQWA 2QPSA 1JNEA 2BY1A 3APGA 2YKKA 4AWEA 1LG1A 3WH7A 2YL9A 1YQ2A 5GPRA 5HPOA 4CUCA 2WC4A 4KGJA 1E0XA 1R7AA 3BAJA 2GJXA 5I5RA 1CYGA 3K8LA 4WK9A 2RGMA 3WUBA 4DUWA 1CENA 1DHKA 1B90A 2AMGA 4PMYA 1M53A 3TP4A 1A47A 2GJXB 1W9PA 5DMYA 4W8LA 3WQ5A 1CBGA 3CZGA 1J10A 1L0PA 2YDRA 4PCSA 1Q6GA 3AISA 2F2HA 4U33A 5FD0A 1BSIA 3LPGA 3W81A 4D6GA 1BYDA 2FGLA 2VJXA 2E0PA 3K46A 2ZWYA 4NSBA 2WM0A 4MPKA 3WDIA 1NWRA 3FNDA 2Y5EA 1BGAA 1UH2A 1VFMA 4AZCA 3FAXA 5TD4A 4BQ2A 2WSKA 4MTVA 3CZ8A 2BY3A 1OSEA 4UQ9A 1UD8A 2A3BA 1C7TA 2ZE0A 4CN4A 1PX4A 2XM1A 1A3HA 1MFUA 4AD1A 4AZCB 3TTQA 1ZJAA 4CKQA 1MW2A 1UD6A 3KEHA 3N17A 3TTOA 3BLPX 3F5JA 3WF2A 3AMKA 1J0KA 3OZOA 3I3BA 1BYAA 2G3JA 1H0IA 3ARQA 1Z32X 3SCOA 2D1ZA 3WNLA 2OYLA 5CPQA 4R5EA 4MNMA 2CCRA 5AC4A 3QHOA 5E0FA 1H09A 3AIWA 3MUAA 3WIJA 3WEMA 3AS3A 2VZTA 3MO4A 2J7BA 3VD4A 1XH2A 1JDDA 4RL3A 3WD1A 4TOQA 3IANA 2X05A 4S3JA 1G01A 2WYSA 2WK2A 1UG6A 3WN6A 1S46A 2WVUA 3M6DA 5FL1A 4UQDA 5BROA 4J3WA 1M7XA 2ZOXA 5BXSA 2X0HA 2AOSA 1FH9A 3QOMA 1NM9A 3HN3A 1BYBA 3MS8A 4HZ8A 4X0VA 4CD8A 3WH9A 3KL0A 1UD4A 1JF6A 3LMYA 2X2YA 5FCZA 1DWIM 1UD5A 5E9AA 1ZBWA 2X8RA 1DWGM 3GNRA 2VVSA 4HP5A 2WNWA 5DO8A 5JIWA 1VBRA 1UWUA 3VIIA 1ZS2A 3AS0A 1VEOA 3VGBA 3BAYA 1E70M 3QOKA 1BG4A 2DIEA 1W32A 1QNRA 5A6MA 1K9EA 1FHLA 7CGTA 2ZX5A 3VUPA 1KCKA 4D6FA 2BV9A 2J8GA 4HOZA 2E9LA 4GKLA 1ISXA 1LLOA 3J7HA 4HU0A 3LPOA 1XH1A 4UZSA 3WQ8A 3WF4A 1LWHA 3FXYA 4E2OA 1VB9A 2XFRA 4CVUA 1GVYA 8CGTA 2YBTA 2XFYA 4JL1A 1W1PA 4NI3A 1DWJM 4W7WA 1CPUA 1NARA 1JI2A 4P7LA 1H41A 1GCYA 4W7UA 1B30A 4FLOA 2BVYA 4GO9A 4DM2A 2VCCA 4GZEA 4YHGA 5GNXA 3PZ9A 3WUEA 1GQKA 2IXUA 4OBSA 1DEDA 1PAMA 5I24A 3VD3A 4HA3A 1Q6CA 2G3MA 2VUYA 3UR8A 2GK1A 1C3FA 2EO7A 1JF5A 3ARVA 4WKHA 3WMCA 4CN6A 3BH4A 1Q4NX 4PTWA 4A3YA 1G0CA 1AVAA 2GK1B 4BF7A 3K8KA 2CERA 1XH0A 1E6QM 1PBGA 4OBRA 2W63A 4M81A 2ZX8A 1OGSA 3WD4A 3B9DA 3AIQA 1VJZA 2XIBA 2VR4A 2VT0A 1E6XM 1EO5A 1QI0A 3ZSSA 2WWCA 4TX8A 1OBAA 1GOOA 4GQRA 3THDA 1BGGA 1UH3A 1UOKA 2XHYA 1LL7A 4HMEA 3EMCA 5D4YA 3A6OA 2B31A 5A3HA 1EDGA 2VZSA 1KBKA 1UWTA 4P8WA 2WHLA 2XTKA 1QHPA 3NSNA 1HJXA 3VDHA 4D1JA 2PBGA 2YA0A 1OGBA 1W9BM 1OGGA 1K9TA 4RE4A 1KWKA 1VF8A 3EYPA 1OIMA 2BY2A 4PSRA 3S6TA 1OD8A 2WCAA 4JFSA 2VZVA 3W25A 2FHCA 2JIEA 1J01A 4AW7A 1JFHA 2W91A 5GNYA 4WIWA 1CGWA 4N0RA 4U3AA 1V0MA 5FOOA 3MV11 2YJQA 3VMPA 3PTQA 1V3IA 3WEZA 4JKKA 4FLQA 1CTNA 4MB5A 3T2PA 1E3ZA 2W61A 3EDDA 1IZKA 1UR1A 3OGSA 1BF2A 2D23A 4AC1X 4WF7A 1LL4A 1JD9A 5C8BB 2O9TA 1HKKA 4J3SA 3CHFA 4BS0A 4LGXA 1V6VA 2OLHA 5CLWA 3UERA 4E4PA 2PWDA 5CGTA 1MW3A 1UWQA 2VVNA 3N9KA 3N04A 4Q22A 5FIPA 1I1WA 5KZ6A 2XJ7A 4UZUA 1XCXA 2D0GA 2YDSA 2PWGA 3NDZA 1JD7A 1CXFA 1H1NA 1FH8A 2DH3A 2FHFA 2ZXBA 1EOKA 4ACZA 3VU2A 1QBAA 3OZPA 3RILA 1JAEA 3VMNA 5CGMA 1J9YA 2YA2A 3KE0A 4QCEA 1RH9A 2VX4A 3OLEA 3CHEA 3N12A 3VIFA 5A95A 3BMWA 2NW0A 4ACZB 4IPNB 4J28A 1CGTA 4GZJA 2CBJA 2DSZA 5D9OA 1KGWA 3K8MA 3PZQA 4IUGA 5HDRA 1MFVA 4D6EA 2WBKA 1B3VA 1W9XA 4D1IA 5BXPA 4U31A 2W92A 5D8ZA 5I79A 2VRQA 3E1F1 1TZ7A 2ZUMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1VBU A;  2W62 A;  3VM7 A;  2DSK A;  1OD0 A;  2J25 A;  3BXW A;  3WMS A;  2WW5 A;  5BRQ A;  3NSM A;  2C8N A;  4C7F A;  2EPO A;  4U2Y A;  5A6B A;  4D6D A;  3WUG A;  3WBA A;  1U33 A;  3BAI A;  4YN5 A;  2BNJ A;  4B9Z A;  5CPT A;  1W3L A;  4KRT A;  1ODU A;  1W9U A;  1XD1 A;  4DUX A;  2PWH A;  1EDQ A;  1XCW A;  4NZC A;  3U57 A;  2VL4 A;  4F9J A;  1FOB A;  4HOW A;  1JI1 A;  3AIV A;  5A6L A;  4AEF A;  3SCT A;  4AYS A;  2GDU A;  1BTC A;  1EDT A;  3T0A A;  4JCM A;  4P7Q A;  2V38 A;  2EPN A;  2WMG A;  3VIL A;  3W24 A;  4P7O A;  3WF1 A;  2VMF A;  6CGT A;  1KXH A;  2XVG A;  5A2A A;  2WZH A;  1HKJ A;  4TUF A;  4DM1 A;  2YDQ A;  5CG0 A;  3VDA A;  1CIU A;  2Y8K A;  5C71 A;  3UCQ A;  3PZO A;  1HVX A;  3VD9 A;  2WMI A;  4XV0 A;  1LQ0 A;  3WNO A;  2CBU A;  2XSA A;  4M1R A;  4JHZ A;  4F66 A;  1E4N A;  1OIF A;  3NIY A;  1GOR A;  2CBV A;  3AIE A;  1HP5 A;  2WMI B;  4MJ4 A;  2GJR A;  5CPS A;  1CGY A;  3VIH A;  3OGR A;  4FLR A;  2WMF A;  4JHO A;  4JFU A;  4WKF A;  1WNO A;  1B2Y A;  2BS9 A;  5BXR A;  1MXG A;  3WFZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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