1QNQA

The 3-d structure of a trichoderma reesei b-mannanase from glycoside hydrolase family 5
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
ASSFVTISGTQFNIDGKVGYFAGTNCYWCSFLTNHADVDSTFSHISSSGLKVVRVWGFNDVNTQPSPGQIWFQKLSATGSTINTGADGLQTLDYVVQSAEQHNLKLIIPFVNNWSDYGGINAYVNAFGGNATTWYTNTAAQTQYRKYVQAVVSRYANSTAIFAWELGNEPRCNGCSTDVIVQWATSVSQYVKSLDSNHLVTLGDEGLGLSTGDGAYPYTYGEGTDFAKNVQIKSLDFGTFHLYPDSWGTNYTWGNGWIQTHAAACLAAGKPCVFEEYGAQQNPCTNEAPWQTTSLTTRGMGGDMFWQWGDTFANGAQSNSDPYTVWYNSSNWQCLVKNHVDAIN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Three-Dimensional Structure of a Trichoderma Reesei Beta-Mannanase from Glycoside Hydrolase Family 5.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-B-D-MANNANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Trichoderma reesei
total genus 133
structure length 344
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 1999-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1qnqA00
5LYRA 4JKMA 1ODUA 1OD8A 2WANA 3WQ6A 2CYGA 2VR4A 3G6LA 1V6WA 4TVUA 2WMGA 2XFYA 4M80A 4H8UA 4P8UA 5E6YA 3E1F1 1TA3B 3D3AA 2DT0A 5FCZA 3WY1A 4UZSA 3N15A 4XZWA 3VMOA 2VZSA 1V3IA 4KGJA 3RJXA 1HVXA 3CHCA 2Z1KA 2WZHA 4JL1A 3MUZ1 1W91A 1ISVA 1CPUA 3AHTA 4WJXA 3SCSA 2G3NA 2BHZA 1UH3A 5IHSA 2ZUNA 3TTSA 4HU0A 3MS8A 1E3XA 3J7HA 1MW0A 1E15A 3ARWA 3K8KA 2EPOA 5E0FA 1CLVA 3W29A 4AZ7A 1X6LA 3FY1A 4W84A 4FK9A 3TOPA 1M7XA 4HA3A 1QBBA 3EDJA 4AXNA 1FP9A 2EQDA 3OLEA 3BH4A 1LF1A 3N13A 1J9YA 2X8RA 1GHRA 3MUIA 2FGZA 3PZUA 1I1WA 4J3SA 2YOCA 2VVSA 1UKOA 3W28A 1GJUA 2BY2A 3VIPA 5EBAA 4TVCA 1UR2A 3WEZA 2AOSA 3GH7A 1E9LA 4CKQA 1ZBVA 2ZUUA 3BGAA 4YHEA 2C7FA 1UA7A 3D5HA 3FHQA 4WK9A 1CWYA 1C91A 2VVNA 3NSNA 1EO5A 3EDEA 1JZ5A 4AYSA 3T0BA 2GK1A 2JF7A 1QHZA 3WEOA 1JI1A 3VD9A 1FP8A 4W85A 1D7FA 1QVBA 3MMUA 2VMFA 3A47A 2QHAA 3SIMA 4JFSA 3VNYA 4F9JA 2J62A 1JFXA 3VIMA 2GVYA 4TVDA 3CZLA 1E4IA 2WCGA 2QMJA 3ZT7A 2W62A 3IAPA 4TX6A 1KBBA 2JEQA 1R7AA 4PMVA 3B9DA 4ZXOA 4JL2A 2ZOXA 4PUDA 1JAKA 1W9PA 2V3FA 1TVPA 1B1YA 4W87A 5BXRA 4HPGA 1UZ4A 3WMSA 3CUGA 1G0CA 1LWHA 1VJZA 1KGXA 4U5KA 3THCA 3WUEA 4D6CA 1UD5A 1XH1A 1V3LA 2YDSA 1BGGA 2WSPA 1XV8A 1JI2A 2IXUA 2DSUA 4UOQA 4AEEA 1LQ0A 1OIMA 4HMDA 3AICA 4QLJA 3DYMA 3EYPA 1TA3A 1K9DA 2V5DA 1WAWA 1P6WA 4UFJA 1DEDA 3W37A 4LYQA 2J25A 3BC9A 2DSKA 3NSXA 1UWQA 3WSUA 1M03A 1H1NA 1V6UA 1JD9A 1LG2A 1W9XA 3AS2A 3ARZA 2W66A 2WCSA 2VURA 3WD2A 2A3HA 1BQCA 3GH5A 2WVVB 1MQPA 1EDTA 2O9TA 1E4LA 2D3LA 3WFLA 4QDMA 1W3JA 1PX4A 1WNOA 4M29A 5LA2A 3MUAA 1DWFM 2ZXBA 2FGLA 1UYQA 3W4RA 4EKJA 1GUVA 3BCFA 1W1YA 4U3AA 1JYWA 1GOKA 3WQWA 2VQUA 2HVMA 4PMDA 4KWUA 4PCSA 3K46A 3VMNA 2ZICA 1KGWA 2E3ZA 1RP9A 4AD4A 2EPNA 3WH7A 1E6ZA 2ZXQA 3AZTA 4GZEA 4DM1A 1E6SM 1B3XA 3VIJA 3AIBA 2XIIA 2DT1A 3QHOA 3N04A 4D6GA 5I2UA 1BF2A 4R27A 2CBIA 5FL1A 4BQ2A 1XH2A 4CU7A 1QW8A 2E9MA 2VRQA 3W6LA 3PZTA 2EPMX 1W9VA 2ZX9A 1NWRA 7TAAA 1HKKA 3AS0A 1BG4A 1J0IA 2XGIA 1A47A 5I24A 3O6AA 1OINA 1J12A 4U5IA 3AIUA 2WLZA 5I77A 4UFMA 5CG0A 4QAWA 3T08A 1WDQA 2DDXA 2VCBA 1C8QA 3WH6A 3VINA 4Z2HA 3L4VA 2W4XA 2ZXAA 1WDPA 1CXEA 1Z32X 1Y7VA 3W25A 3VIIA 3ZOAA 1CZ1A 1H4PA 2WPGA 3ZR5A 5A8PA 4EANA 3ALGA 4HMCA 4J28A 4N42A 2ZIDA 2Y4SA 5I0DA 4ML4A 3CTTA 3VM7A 1WO2A 4OBRA 1W3HA 1J0JA 2E8YA 2CIPA 2VC9A 3BAXA 2X0YA 2YDQA 2ZUSA 1W2VA 4KGLA 3RM8A 5GNYA 4DUXA 2OLHA 5BRQA 2WVTA 2Z1SA 3LPFA 1KQYA 1NARA 1I75A 3UG4A 1VJSA 3AMLA 3PZVA 4MJ4A 1EIBA 2PBOA 2W92A 1BVZA 1UOKA 2BNJA 1J01A 2GFTA 5E70A 3CHFA 2PWHA 5I6SA 3OIHA 4DWSB 1V3MA 1AMYA 3VGEA 2X05A 1QHPA 2CHNA 3UCQA 2BHYA 1VRXA 1LLOA 1Q4NX 4BA0A 1AQMA 2CBVA 1WB0A 1LJYA 1TMQA 1KWKA 1B3WA 4FLRA 2VZOA 2VRJA 1CGYA 3PTQA 2X0HA 1EHAA 4MNKA 2CKRA 3CUFA 1PIGA 1ISXA 3POHA 2WVVA 1V3HA 4FLSA 1Q6FA 3W24A 1EOMA 3BMWA 4LXFA 9CGTA 4PMNA 4JFUA 1XC6A 2ZUMA 2G8ZA 3N1AA 3RCNA 4F66A 1ODZA 3AYRA 4CCDA 3VDHA 4JKLA 1J0YA 3FAWA 1KB3A 2A3EA 5E09A 2XVPA 5I79A 1V3JA 1V6XA 2WCAA 3MKKA 1XSIA 3WL1A 2ESCA 1KWGA 1JG9A 1CGVA 1M04A 3VDCA 4QFUA 2PWEA 3UR7A 3ZQ9A 1JL8A 1E0XA 2DQXA 4AZ6A 3K4DA 3ZR6A 2TAAA 4TUFA 4MNJA 3NUKA 7A3HA 1JYNA 1US2A 3WUGA 2VZUA 1E1EA 1DWHM 5EB8A 1KBKA 3DHPA 2YL9A 2WMHA 4W8BA 2D24A 4PTMA 4AD5A 4D72A 3HMCA 4GINA 3WH5A 3VUPA 2Y8VA 1UWRA 1E1FA 4IISA 4ZEPA 1VEPA 1M53A 5DF0A 2XFRA 5M03A 1EGZA 3HJEA 4MNMA 1J11A 1PZ2A 2W63A 1JZ2A 4ZENA 3CUIA 1O7AA 2AAAA 3I3DA 4W88A 2J8FA 4JFWA 1UH2A 2DT3A 3NSMA 2E9LA 4U2YA 1V02E 3EBVA 2OYLA 4HOWA 3UG5A 1HT6A 2O9RA 3VGBA 1C8XA 3S2CA 1OSEA 4GPNA 4AWEA 1E73M 1RP8A 4OOZA 5IFPA 3EDFA 5CSUA 5A8OA 4NI3A 3GBEA 4W7VA 1UQYA 2PF0A 1MYRA 3AXXA 1WKYA 4JHOA 3GNRA 2Y24A 4GZJA 1WZLA 5AYBA 4WIWA 5I23A 2XJ7A 3AHVA 1WDSA 1UR8A 1BYAA 1KGUA 5ABHA 1HJXA 1CGXA 4KRTA 1QI5A 3VGDA 1JGIA 1BYCA 1C3FA 1EOKA 4XUYA 3ARRA 4E8DA 2QPUA 5IDIA 3CIVA 4F8XA 2XVGA 4P8XA 4JHZA 4NSBA 3ZMRA 1J10A 3IAQA 4DWSA 4D6JA 3LPGA 3T2PA 5TD4A 1EQPA 1BVNP 1US3A 3U7BA 3CUHA 4H2CA 1R85A 1GJWA 1NWTA 1H41A 2J7CA 1UQZA 3VD5A 3ZO9A 1XSKA 2CNCA 5ECUA 3PZQA 2F61A 1ISWA 3L4XA 2MANA 4QLKA 3B9EA 4QCFA 1IZKA 5DT5A 3PZGA 3FNDA 1K9FA 1V3KA 3CMGA 4MB1A 5GNZA 3A4WA 1FHLA 1UKQA 5C71A 4PTWA 3A4XA 2WMKA 1FA2A 4CU6A 2BHUA 1V0NA 4P7NA 1CGUA 5FOOA 1W1VA 2O92A 4H04A 1AQHA 4TTGA 3GDBA 4IUGA 3N18A 1R7OA 5D8WA 5CGMA 4J3WA 3QOKA 1ITXA 1DTUA 3OGRA 4M56A 4D6EA 1W1PA 4MNLA 1UD8A 2D0HA 3WDHA 5ABGA 4AZGA 4AIEA 1UR9A 5EMYA 5BXTA 4UQBA 4GI9A 1ZJBA 4H8HA 3VNZA 4UCFA 4IM4A 1HL8A 1W1TA 1QOXA 4Q7NA 1FOBA 1OB0A 1CEOA 3A3HA 4HMEA 3MV11 3UERA 1D2KA 2HISA 2ZWYA 2FHBA 3RM4A 3HU7A 5JBDA 2YBTA 2CHOA 1KR1A 3I3EA 1LL6A 2F2HA 3G6MA 1LWJA 6TAAA 4CN6A 2JALA 2J78A 4S3KA 3SUSA 1TZ7A 4M82A 3OGSA 4D1JA 1UWSA 3VVGA 2XM1A 4HP5A 1CXHA 1ZJAA 5FKYA 2YBUA 1KXQA 2WC3A 4ZFMA 3W27A 3WD1A 3IK2A 1HL9A 1ZS2A 3GM8A 4D6DA 1MW1A 4GQQA 1CYGA 2VX7A 4ATDA 1EA9C 4WKAA 3K8LA 3TP4A 4MJ2A 4PBGA 1GQKA 4J3UA 2OWCA 3M46A 1Q6DA 2OYMA 1V6VA 1J18A 3UG3A 3VGGA 2J79A 3SUWA 2VJXA 1ZB5A 2VX5A 4DUVA 4J27A 1SFSA 2VNCA 4DWSD 1E72M 1C92A 1E71M 2PB1A 2EPKX 3FN9A 2YLLA 1E70M 1GNXA 5CLWA 2FH8A 3MMWA 5CGTA 1JDCA 3UETA 4MDOA 2QF8A 1U33A 4PSRA 3AZRA 2D22A 4W89A 4HU8A 1XD1A 1UR0A 2J4GA 4C7FA 1IZJA 2GDVA 1U2YA 1UWTA 2YDRA 2EO7A 1K6AA 3WF2A 2BVYA 2Y2WA 3VTRA 3OB8A 1HN1A 4JAWA 4CN4A 3CGTA 1HKIA 4PTXA 4M81A 1U30A 3SUVA 3JUGA 3VOCA 1HKMA 4FLQA 4W8LA 3VIGA 3VGHA 2F8QA 5JBEA 1E6RA 3OLDA 4B3LA 2VZVA 2NW0A 1W2PA 3VD3A 2WKLA 1NOWA 5A2AA 1HJWA 3ZT6A 1WP6A 1V0KA 1UHVA 2IXVA 1VB9A 5AY7A 1M01A 5CLTA 3GZAA 4QLLA 1E40A 2D0FA 3ARYA 1WZAA 1TG7A 3AJ7A 3PZNA 3APGA 3MSGA 4AIOA 2YL5A 3F5JA 4ACZB 3DC0A 3II1A 3AHXA 4PMXA 2XUCA 1GQIA 3WH8A 4CN1A 2DGAA 2BXYA 2DH3A 3BMVA 5JBFA 3L4YA 1C7TA 1OT1A 3EMCA 3WEMA 3AROA 3AFBA 2D2OA 5JUVA 2XG9A 4PEEA 4C7DA 3N11A 2VR5A 3F4VA 1GVYA 3VIOA 3W6MA 2OYKA 3EMQA 1V08A 4V2XA 2C8NA 1VIWA 5HPOA 5CJ5A 1CDGA 3BAWA 3VILA 2VL4A 2J7DA 4PMZA 1XHGA 1UG6A 5BROA 3FXYA 1KXVA 1S46A 2ZX7A 5CQ1A 2VO5A 2UY5A 1KFWA 5CZKA 1DHKA 5JIWA 3CMJA 2CXGA 4W93A 3WNNA 3L2LA 5KZ6A 1VENA 2J74A 5HXMA 3FHAA 4BF7A 3POCA 4E2OA 2CBJA 2B31A 4JIEA 4AZ5A 4H7VA 3CZJA 4ZE5A 1CGTA 1JZ4A 1W9UA 1HF6A 1VBUA 5IHRA 2QV4A 1CENA 1KXTA 1E43A 3BAYA 2NSXA 5LA1A 3BSGA 1G1YA 1WCGA 3UEQA 3WF1A 4Q22A 3DHUA 1ESWA 1XYZA 2XGBA 2YJQA 5GPRA 5BYWA 2C0HA 1JZ3A 4F79A 1EQCA 1CIUA 1SYTA 3AMKA 1E6NA 2VTFA 4J3XA 4F9DA 2DSVA 2O9OA 1MQQA 1JXKA 4V28A 3CHEA 1CECA 2ZE0A 4AD1A 2FHFA 3W81A 3WQ5A 3KL5A 2GJXB 4Z2IA 2BY0A 4YHGA 2ZXDA 4TXEA 1UD4A 1UZ1A 1HJVA 3WL0A 5A3HA 2Y5EA 5I78A 3CUJA 3WUFA 4RL3A 5A2CA 3ZJ7A 4AZCB 1JNEA 1X6NA 2BV9A 5FIPA 4ZXLA 3NIYA 1E55A 5FD0A 2BXZA 5A69A 4GI8A 1MW2A 2QMKA 4JCMA 2WVUA 4GIAA 1EDQA 3L4UA 4MADA 2VQTA 2E9BA 2VRKA 1UA3A 3WFZA 3QHMA 1QI4A 5C8BB 1JNDA 2BFGA 1GOMA 2J75A 3TTOA 2VX6A 2XIBA 1B3VA 4ACZA 1TVNA 4B15A 1H11A 4UFIA 2XTKA 3L4TA 5GQBA 1QI3A 4HZ7A 4AZBA 1JAEA 2XVKA 2WC7A 5DFAA 1HX0A 2DIJA 4NZCA 3RDKA 7CGTA 2WLYA 4P8WA 1RPKA 1DP0A 4CD8A 4RE2A 5IXEA 3O2LA 1NWSA 3EDDA 3BAJA 1HP5A 2UWFA 3KZSA 4LQ1A 1K9TA 1KXHA 3VPLA 5FL0A 5M17A 4OZOA 3GH4A 3GXDA 5I3DA 1B31A 2J47A 4J3VA 1V03A 4GO8A 3TTQA 1BLIA 1OIFA 1LG1A 3W53A 2EXOA 2WSKA 1LL4A 3M7SA 1C8YA 4E4PA 1JIBA 3WUBA 1EO7A 3MUY1 2A3BA 6CGTA 3MV01 1MFUA 2WXDM 5BCAA 3MMDA 5BXSA 1UKTA 2WBKA 1VF8A 4HZ8A 1PBGA 3RJYA 3VO0A 3CBWA 1MQRA 3OZOA 5E0CA 4JCLA 2XWDA 1QHOA 1VAHA 3L2MA 1GW1A 1HJUA 3VDBA 1HIZA 4PMRA 1JZ8A 3GNPA 2VT0A 4UFKA 3W26A 1OGBA 3ZIZA 2X1IA 4UFLA 2WZIA 1OT2A 1CXIA 4EE9A 5BWFA 3RPMA 3AYSA 1PIFA 1ZBWA 2WW5A 1R8LA 2WZEA 4OIFA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5LYR A;  4JKM A;  1ODU A;  1OD8 A;  2WAN A;  3WQ6 A;  2CYG A;  2VR4 A;  3G6L A;  1V6W A;  4TVU A;  2WMG A;  2XFY A;  4M80 A;  4H8U A;  4P8U A;  5E6Y A;  3E1F 1;  1TA3 B;  3D3A A;  2DT0 A;  5FCZ A;  3WY1 A;  4UZS A;  3N15 A;  4XZW A;  3VMO A;  2VZS A;  1V3I A;  4KGJ A;  3RJX A;  1HVX A;  3CHC A;  2Z1K A;  2WZH A;  4JL1 A;  3MUZ 1;  1W91 A;  1ISV A;  1CPU A;  3AHT A;  4WJX A;  3SCS A;  2G3N A;  2BHZ A;  1UH3 A;  5IHS A;  2ZUN A;  3TTS A;  4HU0 A;  3MS8 A;  1E3X A;  3J7H A;  1MW0 A;  1E15 A;  3ARW A;  3K8K A;  2EPO A;  5E0F A;  1CLV A;  3W29 A;  4AZ7 A;  1X6L A;  3FY1 A;  4W84 A;  4FK9 A;  3TOP A;  1M7X A;  4HA3 A;  1QBB A;  3EDJ A;  4AXN A;  1FP9 A;  2EQD A;  3OLE A;  3BH4 A;  1LF1 A;  3N13 A;  1J9Y A;  2X8R A;  1GHR A;  3MUI A;  2FGZ A;  3PZU A;  1I1W A;  4J3S A;  2YOC A;  2VVS A;  1UKO A;  3W28 A;  1GJU A;  2BY2 A;  3VIP A;  5EBA A;  4TVC A;  1UR2 A;  3WEZ A;  2AOS A;  3GH7 A;  1E9L A;  4CKQ A;  1ZBV A;  2ZUU A;  3BGA A;  4YHE A;  2C7F A;  1UA7 A;  3D5H A;  3FHQ A;  4WK9 A;  1CWY A;  1C91 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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