1QNSA

The 3-d structure of a trichoderma reesei b-mannanase from glycoside hydrolase family 5
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
ASSFVTISGTQFNIDGKVGYFAGTNCYWCSFLTNHADVDSTFSHISSSGLKVVRVWGFNDVNTQPSPGQIWFQKLSATGSTINTGADGLQTLDYVVQSAEQHNLKLIIPFVNNWSDYGGINAYVNAFGGNATTWYTNTAAQTQYRKYVQAVVSRYANSTAIFAWELGNEPRCNGCSTDVIVQWATSVSQYVKSLDSNHLVTLGDEGLGLSTGDGAYPYTYGEGTDFAKNVQIKSLDFGTFHLYPDSWGTNYTWGNGWIQTHAAACLAAGKPCVFEEYGAQQNPCTNEAPWQTTSLTTRGMGGDMFWQWGDTFANGAQSNSDPYTVWYNSSNWQCLVKNHVDAIN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Three-Dimensional Structure of a Trichoderma Reesei Beta-Mannanase from Glycoside Hydrolase Family 5
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-B-D-MANNANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Trichoderma reesei
total genus 139
structure length 344
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 1999-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1qnsA00
2HISA 3VGGA 3II1A 1CGVA 4CCDA 2FH6A 1QPKA 3TTOA 2XVLA 4EANA 3IK2A 2ZICA 8CGTA 3KL5A 2XFYA 3T0DA 1RP9A 1UZ4A 1M04A 4DWSD 2W63A 2OSXA 4CD7A 3ZSSA 1NQ6A 2EEXA 1OGSA 3WD3A 1VJZA 3WELA 1AMYA 1BVZA 1JG9A 3WH7A 1XD0A 2J7EA 4HA3A 1XRVA 2Y2WA 4PTXA 1E4NA 1XSJA 1OCQA 1CLXA 4MJ2A 1JAKA 2PI6A 4BQ5A 3CHFA 4KGJA 4L4PA 1ISXA 2E9MA 3BLPX 2WMIB 1LL4A 3ECQA 3VOCA 1DHKA 2WHKA 2CBVA 3BMWA 2D0FA 1OBAA 4J7RA 5D9MA 4PSRA 4URIA 1I1XA 1UD5A 5LYRA 3OBAA 4HZ6A 5FKYA 4TVDA 4WKFA 2X0HA 4GPNA 5JIPA 1WAWA 1CNVA 1GORA 3EBVA 2A3EA 2VUYA 2E40A 5A8MA 3PZVA 1UKOA 2WMKA 3AHZA 2GVYA 4DUXA 2VC9A 3RIKA 1BF2A 1XYFA 3AMCA 1W91A 1JD9A 4BS0A 3RM4A 4CD4A 3W38A 2ZE0A 3PZQA 2WLYA 2WMGA 1TFVA 1XH0A 4PMXA 1JNDA 3AS2A 3K4DA 4H8VA 4ML4A 1WKYA 4X9YA 1EO5A 4PMQA 4AZ6A 2FHBA 4J3WA 5FIPA 5CLTA 3BAJA 3W37A 1XH1A 4GZIA 3A4XA 2XGIA 3UERA 4D6FA 4D6IA 4HZ8A 2D22A 5GNXA 3EDKA 1H41A 3GBDA 4AZ5A 2BHUA 1U33A 4GI6A 1CXIA 5BCAA 3CMJA 2XPKA 1JFXA 3A6OA 1JZ6A 2DDXA 2JFEX 3CUHA 5CQ1A 5BROA 3GZAA 3WNLA 2OSWA 1CGWA 4D1JA 1DWJM 2CXGA 1J0IA 3G6LA 4JCLA 4JL2A 4X0NA 2W61A 1UKPA 4OZOA 2A3CA 3W29A 2W67A 4IISA 4UQCA 1Q6FA 2DEPA 1KXTA 4UFHA 3BCFA 1ZS2A 4KWUA 1V03A 5I78A 3BGAA 3WEOA 2ZOXA 3A47A 1QNRA 4K68A 1UWTA 3SCQA 2QPUA 3KL3A 1CYGA 1J0JA 3VGBA 3VM7A 4GO8A 3W28A 5M3WA 2ZX9A 3VM5A 4N42A 4V2XA 1QNSA 3PZMA 1HL8A 4DWSB 1XC6A 4HMCA 4B9ZA 4DM2A 2J7GA 4OOUA 4L4OA 4UCFA 3NDZA 5C8BB 3CUGA 2O92A 4P7NA 2C0HA 2GFTA 1IV8A 4EE9A 1V6XA 4C7GA 1E6QM 3TTSA 2RGLA 5IHSA 5AYIA 1B0IA 3W81A 1U30A 4JFWA 1OWQA 5BWFA 2J47A 4XV0A 3SCRA 4AD2A 1HKKA 1JZ8A 1KGUA 4Z2KA 1HXJA 4HMEA 5A6BD 5E6YA 1UA3A 2XYLA 4MJ4A 3O9NA 4U3AA 3WMCA 2ESCA 2F61A 3L2MA 4CU8A 1OT2A 4JFUA 2YKKA 1WCGA 4RE3A 2E8YA 2JALA 1UH2A 4PMVA 4F9DA 2PC8A 1K9EA 4J28A 1XHGA 1MQRA 4UFIA 2CYGA 4V27A 5I0DA 1V3KA 4W8AA 2XUCA 1LG2A 2WHJA 3SCUA 2VZOA 1NWRA 3PZUA 2O9RA 2BY3A 3DYPA 3WUBA 3GH4A 1C90A 3TTYA 1TR1A 3VDHA 3UEQA 2A3BA 2PWGA 2D20A 3N15A 4W7WA 4ACZA 3VIOA 4U2ZA 3OG2A 4CU7A 2WK2A 3AXIA 4ACYA 4KH2A 1KXVA 5HDRA 1W2VA 3QHOA 1PIGA 3AS1A 3ZT6A 3D3AA 4D71A 3PZ9A 2XVKA 1V6WA 1OIFA 2WB5A 4JFTA 2VCAA 5A95A 4OJYA 1O7AA 1GQJA 3MMUA 5A6JA 1ODUA 1XGZA 3B9AA 3UR7A 3EDJA 3UG3A 2J7CA 1EDQA 3AOFA 2J8GA 2BY1A 4TTUA 1OT1A 1PX8A 1TMQA 3BXWA 2GK1A 1JYWA 1G94A 1ZL1A 3VIMA 4F66A 2DSKA 4WKHA 1KQYA 1NWSA 3CZLA 1C92A 1CGYA 4NZCA 2J77A 5A8PA 2J7BA 4MDOA 2VCCA 4UTFA 1KGXA 4AD4A 1X1NA 2BHZA 5IHRA 2CERA 2VO5A 1UYQA 2GJXB 2X2YA 2QV4A 3N1AA 3AYRA 1GOIA 3W0KA 1DEDA 4CVUA 3DHUA 4W84A 4UQAA 2DSVA 3TONA 5BXTA 2QF8A 1JD7A 1B3ZA 5HOSA 1F4AA 1FHDA 4ATWA 3FN9A 2UY3A 1QI4A 5CJ5A 1E70M 5FL0A 3BC9A 3U5YA 1HP5A 3N12A 3T2OA 1D7FA 3RO8A 1KR1A 5HNNA 3AISA 1J12A 3BAIA 3VTRA 4IPNB 1GCYA 2O9OA 3F5KA 1BGAA 2BXYA 2Y4SA 4BA0A 2E9LA 3AZTA 2O9TA 4AIOA 2ZX8A 1PPIA 2WCGA 1FOBA 2YIHA 2GDVA 5LA2A 3AIUA 5A6MA 3DYMA 1GZJA 1KQZA 4TUFA 1J9YA 2VOTA 4AZCB 1MVYA 1E55A 1VB9A 2WHMA 2WMIA 4JKKA 2BV9A 3LPFA 2VX7A 4OBRA 3THDA 1H3GA 1JNEA 4QLKA 4JIEA 1M01A 3QR3A 5HBFA 1JZ4A 1V3IA 2XTKA 3VD5A 1B2YA 4AEEA 2FHCA 1ISVA 3HJEA 3WUEA 1SFSA 4RE2A 3BH4A 1QBAA 3CUFA 1FFQA 1DTUA 2BY0A 3NJ3A 1MXDA 2JEQA 4QDMA 2IUZA 6TAAA 1HF6A 1HJVA 4B15A 1GHRA 2ZXAA 1D3CA 4U5IA 2PWDA 2WSKA 4S3KA 1TCMA 2TAAA 3WF4A 4F9JA 3VD4A 2VR5A 3A3HA 1V3JA 2AMGA 1W3LA 3VILA 2WBKA 3ARZA 2D0GA 1LJYA 2X0YA 1HNYA 4PEEA 4FLSA 4FLQA 4WLCA 2X1IA 4W7VA 2GSJA 1HJXA 5DO8A 4AZHA 1QBBA 1W3HA 1SYTA 4D6JA 1OD8A 1HKIA 3FHAA 3QHNA 4HOZA 3EDFA 2E3ZA 4NI3A 2X05A 2XM1A 1JGIA 3CHCA 5E70A 4AEFA 1H2JA 2ZUSA 3WDQA 3VD7A 5M17A 4AC1X 1OM0A 2D0HA 1NP2A 3MUAA 1W2PA 3MUY1 4OUEA 3WBEA 3ALGA 3WDRA 1M53A 3M46A 3PZNA 4JFVA 1V3HA 1YHTA 5I24A 2ZIDA 3E1F1 2JE8A 5AY7A 3BMVA 4PMYA 2ZX5A 4BQ2A 1V08A 1TVPA 3LPPA 2CBUA 2E0PA 1KGWA 2V3GA 1FH8A 3VPLA 3WQ5A 1AQHA 3VNYA 4HU0A 3WMSA 1V0LA 1S46A 1NOUA 4CN6A 1ISYA 3ZR6A 1W32A 2CHNA 1JDCA 3SUWA 3I3BA 2YLAA 4AD1A 3KZSA 4H8UA 4DWSA 5AYBA 3AMLA 4BF7A 3DHPA 3ARXA 3F5JA 5E0FA 3CZJA 4CD6A 2NT1A 1W9BM 3QOMA 1BFNA 3CZGA 4AY1A 5LA1A 3WNMA 2CHOA 3SUTA 1TE1A 1P6WA 1VENA 1B3WA 1IZJA 1E6ZA 4NRSA 2J62A 1EA9C 3MUZ1 3VMPA 2VURA 1J18A 2WXDM 2YDRA 2WNWA 1HIZA 5A6SA 2WYSA 1VIWA 5ABHA 1NH6A 1X6NA 1CWYA 3WIJA 4D6DA 1BG4A 1LG1A 3BAYA 5M5DA 5AC5A 3PZOA 3FY1A 2VJXA 1B30A 2EBNA 4W5ZA 4XZWA 4DWSC 5GNZA 4PMNA 1TG7A 3VDCA 4P8XA 3CZEA 1UD8A 1E0XA 3L4YA 5LA0A 3ARWA 2BS9A 4LYQA 3WNKA 3WN6A 5A8NA 1CTNA 3AZSA 3WKZA 5A2CA 4B3KA 5ABEA 2WWDA 4J3XA 1NP0A 1FHLA 4UOJA 2IXUA 3MV11 3SUSA 1GW1A 3PZTA 3T0AA 3S6TA 1UWSA 3OLDA 3IJ8A 1RP8A 2CIPA 3CO4A 3CHDA 3U7VA 2XFRA 2WVVB 1ISZA 1E6PA 2E9BA 4GINA 4BCEA 9CGTA 1UQZA 4Q22A 4NSBA 1KCLA 1QNQA 1G0CA 3UR8A 3VIPA 2X09A 1GPFA 2PBOA 5CPSA 1JI1A 4B3LA 4F79A 4AZ7A 1BTCA 5I23A 8A3HA 5CPQA 1GQKA 4AWEA 4IPLA 4JKLA 2ZX7A 3GXMA 4P7RA 1QOXA 3ZJ8A 2Y24A 4UQ9A 1UUQA 2D3LA 2ZXDA 3FW6A 3GTNA 4KRUA 2E4TA 5D8WA 2VMFA 1HP4A 3ZJ7A 4Z2IA 5E0CA 1JYXA 4AISA 1E4MM 3EDEA 3ZQ9A 1V3LA 2CEQA 1MW3A 5I79A 1J10A 3APGA 2ZUMA 1CENA 3ARPA 1HJQA 4TXEA 3AMGA 2WMFA 2GJXA 2FDMA 1D2KA 7A3HA 2PF0A 1NOWA 3NIYA 1J01A 1DWIM 1CXFA 3WFZA 3OZOA 1C8YA 1X6LA 1VEMA 4PTWA 4GZEA 5EBAA 4FLOA 3EMQA 4Y7EA 3OLEA 2WVTA 4HOWA 2OWCA 1GOKA 2EXOA 1HT6A 1JDDA 3AIRA 4W8BA 3NYDA 2ZUNA 1UKQA 3CUJA 1RPKA 5A6BA 2VX4A 5E6ZA 3GM8A 3K8LA 4A3HA 4GI8A 3AS0A 4TVCA 4UFMA 2VQTA 5IXEA 4OBSA 1UH4A 5M03A 4AZCA 1MFVA 3WF3A 3IJ9A 2OWXA 3WDIA 5A3HA 4WSKA 1GVIA 3QHMA 1GONA 4JKMA 3TP4A 3ZT7A 1AQ0A 2F2HA 1EGZA 1TVNA 1V02A 1XV8A 5I3DA 3ZJ6A 3WMBA 4Z2HA 5KEZA 3GBEA 1FH7A 3BSGA 5JBEA 5GNYA 1C8XA 3L4WA 1W1YA 2ZUUA 3W82A 4RL3A 3AROA 1GUVA 4DUWA 4J3UA 5E9AA 4ZXLA 2WVSA 2DSWA 3WDJA 1WDSA 2D1ZA 3RCNA 3WL0A 4UZSA 5HXMA 4MNLA 4U31A 1QNPA 3ARQA 1KR0A 3ZSTA 6CGTA 4W8LA 4W7UA 2J4GA 3L4ZA 5A8OA 1E0WA 1JDAA 2WWCA 1GQIA 5CXPA 1GJWA 3L4UA 3OLGA 4R5EA 1XSIA 3TTQA 4AZIA 5GPRA 5A6LA 1HKMA 4C7FA 4AD5A 2QHAA 4UOQA 1EQCA 2BNJA 1EH9A 5JUVA 1HKJA 5I77A 3VKKA 3AIBA 1JZ3A 1NARA 1RH9A 3VMOA 3W6MA 4AXNA 1JXJA 3U5UA 1KB3A 1M7XA 2VVSA 1B3VA 3CUIA 1E73M 1ISWA 1R85A 3VDBA 2MANA 3FXYA 3GH7A 3RMEA 1SMAA 4M29A 3A4AA 3ZMRA 3WDPP 5EFFA 2CETA 3UESA 1CLVA 5DF0A 1GOMA 3WD1A 3S2CA 4CD8A 1SR0A 4ZE4A 1PZ2A 3WQ8A 3WFLA 3WNPA 3PHAA 3PZGA 4MNKA 3VIIA 5IFPA 2F8QA 3VIGA 4TX8A 3SURA 3BAKA 1IZKA 4GI9A 2FGLA 2HVMA 2DH2A 2XSBA 3BAXA 2DT1A 1HVXA 1FP8A 1V6UA 3WL1A 1VJSA 1OIMA 4WSJA 4TOQA 3W6LA 1GOOA 1JZ2A 1QHPA 1PX3A 1E3XA 3VMNA 2VQUA 4MNJA 5BRPA 2G41A 1UR4A 2ZWZA 5A6AA 4XZBA 4QLLA 3J7HA 3PTKA 1J0HA 4OIFA 1HN1A 1VRXA 5C70A 3EMCA 4P7QA 2VRKA 1UR2A 3K46A 3AI0A 4HTYA 1H0GA 5BXRA 1OB0A 4GZJA 2E8ZA 3L4XA 4LQ1A 3QGVA 5A94A 5ABFB 3IANA 4CN1A 1VFUA 3W4RA 1ZB5A 3DECA 3QOKA 3WNNA 4UFJA 1AQMA 1XCXA 3L4VA 3FAXA 4HU8A 5BRQA 1MQQA 2UWFA 2CKSA 2XIIA 3CMGA 3GDBA 3W53A 4AD3A 3GNPA 3AIQA 3WQWA 1ODZA 1Q6GA 2W91A 4MB3A 1CGXA 4CD5A 1U2YA 1OINA 2JF7A 3WY1A 3BAWA 3OB8A 3PN8A 1R7AA 3ARRA 3AS3A 5D4YA 3AJ7A 1G9HA 1UD6A 1OGGA 4UNIA 1E40A 4E2OA 1FFRA 3WF1A 3SCPA 1LQ0A 1K9FA 2VX5A 4M82A 3AIWA 1K9TA 4DUVA 3POCA 3ALFA 3CLWA 4D6HA 4FF5A 4ZEPA 2ZX6A 3MO4A 1BQCA 5IDIA 3VINA 2G3NA 1E1EA 1E4LA 1PAMA 2WVVA 1B3XA 1E9LA 2AOSA 4E8DA 4EK7A 3MSGA 4QAWA 1V0MA 4TTGA 4OOZA 2PWEA 3KWXA 3OZPA 1HL9A 2VTFA 2XVNA 1PX4A 3UG5A 2YL9A 1O6IA 4IM4A 2XVPA 3CH9A 3KE0A 2ZUVA 4AIEA 1C7TA 2XVGA 1MYRA 2NT0A 4H41A 2NW0A 5CSUA 5A69A 1TUXA 2W66A 3N11A 3WDHA 2OYLA 1WO2A 1BSIA 1E0VA 3PZIA 1WZAA 2YOCA 4H2CA 2CBIA 4HZ7A 4P8VA 1AVAA 3OGVA 4PMUA 5BXSA 5CGMA 2VNCA 5D9PA 3WH9A 3GXDA 3OIHA 3SCNA 4DM1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2HIS A;  3VGG A;  3II1 A;  1CGV A;  4CCD A;  2FH6 A;  1QPK A;  3TTO A;  2XVL A;  4EAN A;  3IK2 A;  2ZIC A;  8CGT A;  3KL5 A;  2XFY A;  3T0D A;  1RP9 A;  1UZ4 A;  1M04 A;  4DWS D;  2W63 A;  2OSX A;  4CD7 A;  3ZSS A;  1NQ6 A;  2EEX A;  1OGS A;  3WD3 A;  1VJZ A;  3WEL A;  1AMY A;  1BVZ A;  1JG9 A;  3WH7 A;  1XD0 A;  2J7E A;  4HA3 A;  1XRV A;  2Y2W A;  4PTX A;  1E4N A;  1XSJ A;  1OCQ A;  1CLX A;  4MJ2 A;  1JAK A;  2PI6 A;  4BQ5 A;  3CHF A;  4KGJ A;  4L4P A;  1ISX A;  2E9M A;  3BLP X;  2WMI B;  1LL4 A;  3ECQ A;  3VOC A;  1DHK A;  2WHK A;  2CBV A;  3BMW A;  2D0F A;  1OBA A;  4J7R A;  5D9M A;  4PSR A;  4URI A;  1I1X A;  1UD5 A;  5LYR A;  3OBA A;  4HZ6 A;  5FKY A;  4TVD A;  4WKF A;  2X0H A;  4GPN A;  5JIP A;  1WAW A;  1CNV A;  1GOR A;  3EBV A;  2A3E A;  2VUY A;  2E40 A;  5A8M A;  3PZV A;  1UKO A;  2WMK A;  3AHZ A;  2GVY A;  4DUX A;  2VC9 A;  3RIK A;  1BF2 A;  1XYF A;  3AMC A;  1W91 A;  1JD9 A;  4BS0 A;  3RM4 A;  4CD4 A;  3W38 A;  2ZE0 A;  3PZQ A;  2WLY A;  2WMG A;  1TFV A;  1XH0 A;  4PMX A;  1JND A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2HIS A;  3VGG A;  3II1 A;  1CGV A;  4CCD A;  2FH6 A;  1QPK A;  3TTO A;  2XVL A;  4EAN A;  3IK2 A;  2ZIC A;  8CGT A;  3KL5 A;  2XFY A;  3T0D A;  1RP9 A;  1UZ4 A;  1M04 A;  4DWS D;  2W63 A;  2OSX A;  4CD7 A;  3ZSS A;  1NQ6 A;  2EEX A;  1OGS A;  3WD3 A;  1VJZ A;  3WEL A;  1AMY A;  1BVZ A;  1JG9 A;  3WH7 A;  1XD0 A;  2J7E A;  4HA3 A;  1XRV A;  2Y2W A;  4PTX A;  1E4N A;  1XSJ A;  1OCQ A;  1CLX A;  4MJ2 A;  1JAK A;  2PI6 A;  4BQ5 A;  3CHF A;  4KGJ A;  4L4P A;  1ISX A;  2E9M A;  3BLP X;  2WMI B;  1LL4 A;  3ECQ A;  3VOC A;  1DHK A;  2WHK A;  2CBV A;  3BMW A;  2D0F A;  1OBA A;  4J7R A;  5D9M A;  4PSR A;  4URI A;  1I1X A;  1UD5 A;  5LYR A;  3OBA A;  4HZ6 A;  5FKY A;  4TVD A;  4WKF A;  2X0H A;  4GPN A;  5JIP A;  1WAW A;  1CNV A;  1GOR A;  3EBV A;  2A3E A;  2VUY A;  2E40 A;  5A8M A;  3PZV A;  1UKO A;  2WMK A;  3AHZ A;  2GVY A;  4DUX A;  2VC9 A;  3RIK A;  1BF2 A;  1XYF A;  3AMC A;  1W91 A;  1JD9 A;  4BS0 A;  3RM4 A;  4CD4 A;  3W38 A;  2ZE0 A;  3PZQ A;  2WLY A;  2WMG A;  1TFV A;  1XH0 A;  4PMX A;  1JND A; 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