1QO2 | Genus

Total Genus 88

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	88
sequence length	241
structure length	241
Chain Sequence	MLVVPAIDLFRGKVARMIKGRKENTIFYEKDPVELVEKLIEEGFTLIHVVDLSNAIENSGENLPVLEKLSEFAEHIQIGGGIRSLDYAEKLRKLGYRRQIVSSKVLEDPSFLKSLREIDVEPVFSLDTRGGRVAFKGWLAEEEIDPVSLLKRLKEYGLEEIVHTEIEKDGTLQEHDFSLTKKIAIEAEVKVLAAGGISSENSLKTAQKVHTETNGLLKGVIVGRAFLEGILTVEVMKRYAR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structural Evidence for Evolution of the Beta/Alpha-Barrel Scaffold by Repeated Gene Duplication and Fusion pubmed doi rcsb
molecule keywords	water
molecule tags	Isomerase
source organism	Thermotoga maritima
total genus	88
structure length	241
sequence length	241
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 5.3.1.16: 1-(5-phosphoribosyl)-5-
pdb deposition date	1999-11-01

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00977	His_biosynth	Histidine biosynthesis protein

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1qo2A00

3GLCA 2A85A 4HIBA 3BW4A 3KVLA 3MI2A 5HMSA 1HO4A 1DJQA 4AF0B 1WA3A 1RQBA 1VHNA 1W5PA 4RR4A 3EX6A 1RZMA 2J6XA 2RFGA 4NZJA 1JQXA 5KZDA 3LGEA 2NXGA 5F2LA 1YXDA 2QCLA 3B4UA 3WJXA 1OK4A 4UFLA 1L6SA 3DGRA 1KTBA 5CPMA 2JKEA 1VR6A 3R5EA 3D0CA 2GVLA 1G67A 3LB0A 3F4NA 1M5WA 1O4UA 5EY5A 2WNNA 2DJLA 1R30A 1OJXA 2ZTJA 3QYQA 1FDJA 2DZVA 4CQ9A 1JQVA 1LORA 2E5DA 3GVGA 4N6EA 4PEKA 3W9ZA 3GDTA 1W3TA 1I2RA 1OYAA 2BX7A 2YZRA 1TV7A 3HO8A 4PA8A 3N73A 1RVGA 4LT9A 3VI2A 1AMKA 3T44A 1F74A 2DORA 2XN1A 4FNPA 2Q8LA 3IVSA 1G6CA 4K8EA 1W0MA 1VYRA 1TV5A 5HQEA 7TIMA 4NNBA 3CIXA 4UTKA 3N34A 1O94A 2NUWA 1DORA 5HWNA 4K38A 3S1WA 1KFJA 4OWGA 3W73A 4O1DA 1RQHA 1W5MA 4JTIA 1VCFA 3YPIA 1TTIA 1MEIA 3GDMA 1F5ZA 4A3UA 3KRSA 4RV8A 4FNSA 4XTIA 3EXTA 2DZPA 1LOLA 1L6YA 3EXSA 3EKLA 2PRLA 2CZDA 2YPIA 4ZVJA 2QCHA 6ALDA 1WAUA 2QR6A 2E6FA 2OT1A 4O52A 3TJLA 1NF7A 5TIMA 3B0PA 2QAPA 3CB8A 3DAQA 4HPJA 4RZ4A 3PS7A 3VCRA 4YCPA 2QCEA 2RDWA 2BSLA 4S1FA 3L0NA 3TSMA 3M1ZA 1F6KA 4A29A 3BLIA 1GG1A 1FDYA 1FBAA 2OJPA 3A9IA 4JDYA 4I7UA 4Y6GA 5AHFA 1HG3A 2TMDA 3W7PA 1O5KA 3W7DA 4M7TA 3W1LA 1XFBA 1W56A 4GUHA 1YDNA 3TFCA 1FWTA 3NPXA 3GNDA 1TIMA 2JGQA 3L21A 3W2KA 5AHIA 2ZA2A 5C2XA 3G1SA 3AO0A 1QMLA 1VLIA 3LX9A 2A5HA 5C5YA 3EWBX 5E93A 3MI3A 3LCGA 5GVJA 1XUUA 3P62A 2X1TA 1ICSA 1LBLA 3PSVA 3M5XA 3TK7A 3O06A 1FUYA 3DZ1A 4IX2A 4MOZA 1TB3A 1H7RA 4AAJA 2ZRZA 3NEVA 4QQ3A 1KM5A 4JX5A 1YLVA 2RDTA 4MJZA 3PY2A 1SQ7A 3I65A 4IPJA 3L5AA 3IIOA 4LWWA 3WJZA 4ALDA 5D09A 1ZFJA 3O6CA 1OK6A 1WQ5A 2Z6IA 3R89A 3L5MA 3T55A 4HHPA 5KINA 1SU5A 2Y89A 3MBDA 3KFTA 4NZFA 1UCWA 2C6QA 3HPZA 5DBTA 4POCA 2VFIA 1U83A 2CLEA 2VXNA 1DOSA 4EF9A 3NQVA 2HSAA 1O5XA 1T0OA 3LXAA 1WV2A 3NZ1A 1Z48A 4UTTA 1K8YA 4FHAA 3DHDA 3NQMA 1JRCA 5T26A 4WQ6A 2CLFA 3WFAA 3UPWA 4R33A 1X1OA 5HJLA 2Q3OA 4O1AA 4PODA 5KZEA 3P82A 3UWZA 2GVGA 2CW6A 2AAMA 1X1ZA 2NWRA 2H8XA 3VE7A 1IF2A 3G1DA 1EUNA 1Q6QA 2CZ5A 3GZ3A 4MFEA 1AG1O 5D2TA 2JGYA 4HNUA 3NL3A 5G1YA 4NQ1A 2BXVA 1H61A 4YL2A 4MIMA 1TPUA 3LCXA 3QF0A 1WXJA 3G22A 2WPBA 5CG7A 1VH7A 2FIQA 3BG9A 4E2BA 1IXOA 4TX9A 3DH7A 2NWSA 4KKXA 5FESA 4O8RA 3B04A 1NAL1 4FF7A 1O60A 2Z0IA 3TA6A 4YWIA 3T40A 5G1TA 1YADA 2QCCA 3FIGA 4EWND 1R2SA 2DZTA 3L66A 5FF4A 3IIZA 4QM1A 4ONVA 2A4AA 1I2OA 4RXGA 3V1PA 3ELFA 2H90A 1ZCOA 3P8IA 2GOUA 4OE7A 3A23A 1F73A 3NQAA 4HSNA 1Z41A 4FXSA 3M43A 2ZRYA 3OEXA 1H63A 2TPSA 3SGZA 4RK8A 3USBA 5G4EA 2VEMA 4DBDA 5AHNA 3MWAA 1W5OA 3UWWA 1Q6OA 2ZZ5A 2OMAA 3CHVA 3MW7A 4K8HA 3QQ1A 2W0UA 3WJSA 4CNOA 2A7NA 1HFBA 1K3UA 4TMCA 2Y62A 4LS0A 5I3JA 2Y7DA 4ZQRA 1JCLA 3MP4A 1YDVA 3HG4A 4RCXA 4E0CA 2QDHA 2Z2UA 1TPVA 4WXYA 1BKSA 5G2HA 1A5CA 1W5NA 3HOJA 1VQTA 3W2LA 1TPEA 1ICPA 3W1QA 5AC8A 1LYXA 3GAYA 1GYLA 1FCUA 4QAIA 3KVJA 3GDRA 1PCKA 1KBIA 1ME8A 2PRHA 3W7LA 1EP2A 2DZUA 2C1HA 5C55A 3SFKA 1G4EA 4EF8A 3TC7A 3ZWSA 3UWYA 4FNRA 3FLUA 4O53A 2CLKA 2HMCA 3KXQA 3TQKA 1SR9A 1TTQA 1WDWA 2DJXA 4D2JA 3Q58A 5LNVA 1OFPA 1TPFA 2X1UA 5HULA 1J4EA 4GBUA 4FNTA 2Q3RA 3LM7A 4QNEA 2ZRUA 3LHZA 1ONRA 1EIXA 1ICQA 1A50A 4N4PA 5LZLA 3OG3A 1Y0EA 4HKPA 4JX4A 1T8XA 4XQ6A 4PCFA 3TC6A 3W74A 1AW1A 3NAVA 5HUPA 2ZZ4A 4JYEA 1QR7A 1PHQA 1WYIA 5DELA 1XDLA 3BGJA 4IMGA 3G24A 3FJ6A 1W37A 4MLJA 3BK0A 4MPQA 2ZZ3A 3O6DA 3Q94A 5HR6A 3SJ3A 5DCEA 3TQVA 5K2ZA 2ZZ2A 3EB2A 5CKSA 3WJWA 1KW1A 4NX5A 3DI0A 3W1MA 3MO7A 5KMYA 3I6RA 3R2GA 2VEKA 2C14A 1K02A 3QW3A 2VFHA 3HPSA 3RFAA 3C52A 3HGRA 4YXGA 3LCLA 3EX1A 3BV4A 5AHEA 2B7NA 2CLHA 4LUJA 4RX0A 4MYAA 2H3DA 3FA5A 4FIQA 1M6JA 1XUZA 1LRNA 3BARA 3GX9A 4CNNA 3EEGA 1H7PA 3MMTA 3HGJA 3UZJA 3C2RA 2ZRVA 4ML9A 4LUIA 2WNZA 5I3IA 5F4XA 4X9SA 1ZJIA 1ALDA 2NLIA 4IUOA 4K39A 3GR8A 4AHQA 4MUZA 1BWLA 1SSGA 3PB0A 1LBFA 2VFGA 1MXSA 3W7CA 3PG9A 5AYZA 1YDOA 4Z0JA 2E6DA 3KOFA 3HB9A 2R91A 1AL8A 1E51A 1VZWA 3EWXA 3B0UX 1EP3A 2FPYA 1FXQA 3OVPA 4R7JA 2IQTA 2XFWA 4KFPA 3ZWTA 4PC8A 3C0JA 2PE4A 4OV4A 5FF2A 1LZOA 3H55A 4RZ5A 1THFD 1SUXA 3UZ5A 3CLMA 2VKZG 2ISWA 4JTTA 4JIPA 1DBTA 3UD6A 1GJPA 3LCIA 5AHMA 3DU0A 4LS1A 3NPVA 2C16A 1TJRA 2YFOA 3SSJA 2CLMA 2Z1BA 4NXSA 1W54A 1H7NA 1K8XA 3W2JA 4HSOA 4MYXA 3BVJA 4IOTA 3NL5A 2GQ9A 2DZSA 2ZBTA 2QCNA 1G4TA 5CPNA 2R8WA 3GXPA 2W79A 3W1RA 2QUUA 2V0TA 4O28A 1WOBA 2H3BA 1I4NA 1HO1A 3P74A 3H54A 4BI5A 1F7BA 4Y90A 3LHTA 3LBCA 3QRHA 5F1UA 2J88A 3VFLA 4N9DA 3W7GA 3P5YA 3LRKA 3CEUA 4JTSA 1LOSA 3S8HA 2NZLA 3M5YA 3RNDA 2QAFA 4UNLA 3I7SA 4TO8A 3PAJA 5AN7A 1ZNNA 4JTFA 3IGSA 1XBXA 2AGKA 3CEPA 3TSDA 1ME9A 1QPRA 3MP5A 4O1BA 1D9EA 1KBJA 1EEPA 5E0KA 3MYPA 2TRSA 4JGDA 4DQWA 3G8RA 3B03A 1H5YA 2YX0A 4A22A 3O07A 1R2TA 1I45A 2YYUA 3PC0A 2W6RA 3HG3A 2Y7FA 2VEPA 3O15A 4DPQA 3JR2A 4LVDA 2YFNA 4IXXA 4UMBA 1JCYA 4WY0A 3WK0A 3FOKA 3HJZA 4UTMA 3G18A 2E6AA 2DZWA 1KFLA 2PCQA 5FF0A 1GG0A 4K36A 1VS1A 1OYCA 1XBYA 3C2OA 5SWUA 1QFEA 2CFFA 1OVDA 3M5ZA 1DQWA 5DCBA 2YYTA 3F03K 3EWZA 2FB2A 3UQNA 1OFEA 4DF0A 5AYYA 4M6QA 4N4QA 1FQ0A 4YCOA 4P2VA 2V8ZA 1J5TA 1VRDA 4O19A 3NNTA 1IGSA 3R8RA 3DFQA 4O54A 1T99A 2C13A 4N02A 1TPC1 5LSMA 4ADUA 4L4MA 5HNRA 3F4WA 2Q8ZA 3BLFA 3Q2DA 3QW4B 3HMJG 3IGUA 1Z42A 1FY6A 1KM4A 3G1FA 1S5VA 4TMBA 1H51A 2WJZA 5CZTA 3W71A 3N9RA 1H7OA 3QJAA 5C54A 2QJGA 3FYOA 1SO6A 3QM3A 5I3HA 1FCQA 3KX6A 2FLIA 3N3MA 4EIVA 2TSYA 3NXFA 3LTYA 1OFBA 2GQAA 4MJMA 2D73A 4XWUA 5CGQA 2X16A 4N2YA 1TPH1 1FWRA 2JK2A 4LS2A 4MZ1A 4BI7A 1YTKA 4MY1A 1CX9A 3PBYA 4JNMA 2NXHA 1KFCA 4JEQA 5CSSA 2ABBA 1B3OA 2ZZ6A 2EF9A 1YTEA 2CWNA 3R13A 2YW4A 5L9FA 3IVTA 3LERA 3S1XA 3GB6A 4NJGA 4LTSA 3G1XA 3LCWA 4DEFA 5EYWA 3LCFA 5KZMA 4H4IA 1TTPA 4L4LA 2Y63A 5LGZA 4NUWA 4M6VA 5LHFA 4Y96A 1SZNA 3P61A 3JRKA 2Y61A 3DI1A 4WY0B 3ZS4A 2B7PA 1H7XA 3HF3A 1SPQA 4Z1CA 4LVGA 1R47A 1LLZA 3G0UA 3B06A 4FX7A 3IIXA 4ZQOA 1F05A 3GXTA 3GKAA 3LHWA 4HN4A 5FEWA 3NQEA 3PSWA 1L6WA 4WOQA 1IIGA 3DHFA 3INPA 4RJEA 3C2VA 2ZA3A 3S5ZA 4UFIA 4IMFA 4LRSA 2FJKA 3W70A 3O16A 5L6UA 2QEZA 3PBVA 2A0NA 2X30A 3BPWA 3UY8A 5D02A 4LNYA 1JCJA 1LBMA 3E02A 3NQFA 4HNNA 4JICA 3E96A 5TQLA 3A5FA 3S5NA 3S9YA 1UUMA 3G0XA 4NXKA 4ORMA 2Y6ZA 2XN0A 4CCEA 3HQ1A 4UFHA 3NPWA 3IIVA 3TU9A 1VCVA 5BMWA 2ZCGA 5IM51 1I2QA 3G3DA 5LGXA 1PCWA 2NX1A 2CLIA 2RHGA 4AB4A 4GC4A 4NNAA 5K4ZA 4FB7A 1RPXA 2WOQA 4BI6A 4A21A 1QO5A 2J9XA 1LDCA 4NJKA 1RV8A 3KVKA 5BW6A 4B5NA 2V2HA 3QSRA 3KHJA 4FEZA 4JYFA 2BLEA 1J2WA 1QPOA 2YXGA 1ADOA 1GZGA 2V81A 1IXQA 1YXYA 2OX1A 5EBUA 3TXVA 3CU2A 1DL3A 4IX0A 1UBSA 3PWAA 4XBSA 1P0KA 3WJYA 4QISA 1FX6A 1W1ZA 4LVBA 3CM4A 1TPB1 1BTMA 5F4SA 4UXDA 3FKRA 3NQ8A 1G7VA 1ME7A 2O7QA 2VEIA 2VENA 4IMDA 2FQIA 3BO9A 1FCVA 4K37A 3NR0A 3HG5A 2YSWA 4GRSA 4WD0A 1FWSA 2QCFA 4CCCA 3G1YA 4GUFA 4Z08A 5D33A 1KV5A 2Z6JA 1TQJA 3W86A 1SW3A 2QCGA 4ZL1A 4I9AA 3ZR4A 1F2JA 2BZNA 2Y88A 5DXYA 3S6DA 2LLEA 3PF3A 1W3NA 1P0NA 3L68A 3QPZA 1V7YA 1A53A 3S5YA 4UTJA 3TUUA 4W9TA 1W8SA 1X6UA 3G8EA 5FF7A 4H3DA 2V9DA 3MP3A 1SW7A 1IXPA 4HPXA 3CWOX 2GJNA 4DELA 3W7KA 2VFDA 4NT0A 1UJPA 3R12A 3W07A 3B0VC 3TIMA 2HS8A 4LV4A 4CQAA 1OHLA 4UUIA 4GUJA 3EX2A 2HS6A 1KTCA 3G1VA 2V5LA 3NM1A 4Q32A 3A24A 3L0KA 1WOAA 4MY9A 3MJYA 4O13A 4G1KA 3NQGA 2ZZ7A 3Q37A 1LROA 4LY8A 2V2CA 3M41A 2EHHA 1MSSA 2X1RA 2ISSA 4MKNA 1FWWA 2C15A 3M44A 5DY3A 3G1AA 3LI1A 2P10A 4O14A 1TCDA 1EB3A 4JTEA 1OFQA 3KRUA 4NX0A 3NOEA 3FYPA 3LTPA 3QMRA 3MUXA 3U8GA 1F76A 3NA8A 3OA3A 3N9SA 4DF1A 3O1NA 1PE1A 1WX0A 2F84A 3O63A 1OF6A 2C18A 1Q6LA 3QMTA 4UTLA 3TQ0A 2JBMA 4AHPA 1L2UA 3STEA 5DY2A 3C56A 3TMQA 3UXAA 4JDBA 4KFNA 2ZFAA 4O1CA 5AYXA 1SZGA 1VC4A 4ZMGA 1SZEA 3DFSA 3NZRA 4OGZA 3TXZA 3QMSA 4E38A 2A6NA 2QJIA 4CQ8A 3FJLA 3IEBA 4WOZA 3UWQA 1DJNA 1KFEA 1XXXA 1U5JA 4M6PA 2JKAA 1NEYA 2X1SA 1Z44A 1XCFA 2V82A 4RZ6A 5CPOA 4JY9A 3W88A 1KV8A 5CPLA 3O05A 4XZ9A 3LCHA 3EWUA 1QPNA 2QF7A 5LNSA 1PHWA 1ZALA 5I3FA 1B57A 4GWEA 5D2XA 1OYBA 5HINA 4FO4A 3IRDA 1X8FA 1B9BA 5G2IA 1SSDA 4K7YA 2HTMA 4O17A 2WQPA 4M19A 3W72A 3G0SA 5FEXA 3NQDA 3QZEA 1R46A 3M0ZA 3QQ0A 4UTWC 4TU1A 2GJLA 1ML1A 2OZ0A 3GK0A 2H8ZA 2QCMA 3FS2A 1TPDA 1VYPX 1D3HA 2BTMA 4OT7A 1VPXA 4K6AA 4WX2A 4N9BA 1TMHA 3N2MA 4KWWA 4ADTA 2CZEA 3MHUA 3LLFA 4Z1DA 8TIMA 2B4GA 2NV2A 1A5SA 5IBXC 3L2IA 2I9EA 3VNDA 1NSJA 2WO5A 1AW2A 1I8JA 1NVMA 4R53A 5LNUA 4NJHA 2PURA 5DN1A 4U28A 4A2SA 1YXCA 1EP1A 3L65A 3WK3A 4AWSA 1SZFA 5U4NA 3B8DA 5K7JA 3W1UA 4GXMA 2ISVA 4JTGA 3PULA 4O15A 1TRIA 4JR5A 2OCZA 1GT8A 3SECA 1YPFA 3CIWA 3GIYA 5KITA 1KTNA 3H53A 3M9YA 1W31A 3W1AA 5BNKA 2A21A 3DKLA 3OVQA 3W1NA 4CLMA 3V75A 3RLUA 2FPVA 4HT3A 5D37A 4UFKA 3HIJA 3GR7A 1GVFA 1PS9A 3ANYA 2B0MA 4IJBA 5C6MA 3FEMA 2Y7EA 1OABA 1EA0A 1ZAIA 1VYSX 1GYNA 3TCEA 1IIHA 3NGJA 5MHBA 1P1XA 1FCBA 3CPRA 3CTLA 3K30A 3LHUA 5J5RA 1NFBA 2VC6A 1FWNA 5A8GA 3UYCA 1SO3A 1O95A 2ZDRA 3ABSA 4O12A 2J9YA 4DO6A 4O50A 4NVTA 2NXIA 3CC1A 3STCA 4Y8FA 3TSBA 3M5VA 4IGHA 3OHIA 4MVAA 1GEQA 5D2VA 4S2CA 4O10A 2PRMA 4N6FA 4TR9A 3HBLA 3W2NA 3PBWA 1OF8A 1X7FA 3MYOA 5DCDA 3NL6A 3C4UA 4DBEA 3S1VA 3NO5A 4ZZ9A 3PUOA 4JN6A 5G4WA 3W23A 1G69A 2G95A 1DVJA 4S2BA 5K4XA 4QJ1A 4ZQNA 3ABOA 4BF9A 4DXVA 3TAOA 5EPDA 1GVRA 5FI8A 1QAPA 1JR1A 3GNNA 4MZ8A 1VJIA 4WXZA 4Q33A 1A5BA 4K7VA 3SW6A 4DO4A 1PIIA 4IPIA 3LRMA 4JYDA 3W76A 1Q6RA 2G96A 4I7VA 5CZSA 1XM3A 3C8FA 2QJHA 4R34A 4H6KA 3A21A 1JCMP 1GPWA 2ATMA 3CQ0A 3TJXA 3W2UA 2E5CA 2WNQA 1SFJA 3DKJA 3T78A 2NUYA 2CLLA 3HGSA 4LU0A 5D30A 1K03A 1LTDA 5J5DA 1QWGA 4O11A 3KVMA 1PL9A 5LHEA 3NQ7A 2WSQA 1B4KA 4M5PA 5LNRA 1S3HA 1OX4B 5E1QA 3C2EA 3IV3A 1NF0A 3W7HA 3EXRA 3BG5A 2FTPA 3SIZA 3W1PA 1KA9F 3E49A 4ZQCA 3QC3A 4IXHA 2EPHA 1GVSA 4ADSA 3QPYA 3DFNA 3LI0A 1TV8A 1UB3A 5DBUA 5HR7A 1DQXA 3VE9A 1KM2A 4PL1A 3NPUA 3QEZA 4WJEA 3W7RA 4BWLC 1OFAA 2QCDA 5EA9A 1W5QA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1QO2A

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