1QOPA

Crystal structure of wild-type tryptophan synthase complexed with indole propanol phosphate
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
267
structure length
265
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLAIIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGAENRGPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Wild-Type Tryptophan Synthase Complexed with the Natural Substrate Indole-3-Glycerol Phosphate
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
total genus 99
structure length 265
sequence length 267
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 1999-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1qopA00
1R47A 4Y90A 3WJXA 1KM1A 3WK3A 4UTWA 3WK0A 1XUUA 5KINA 3UXDA 4LOCA 3IIZA 4UTLA 5FF2A 5BOOA 1VCGA 1YYAA 2Y6ZA 5EA9A 3WJYA 3TIMA 3LCGA 3W07A 3HGOA 3JRKA 1GVQA 4R33A 2YSWA 1PS9A 3B0UX 1FXQA 3QZEA 2X1RA 1TMHA 1RZMA 4GUIA 3BARA 2A0NA 1QAPA 3GNDA 3W1RA 3S0CA 2JKPA 3N9SA 3VI2A 4NZFA 3P7YA 4AHPA 2DZUA 3LLDA 4J9JA 2A7PA 1ZALA 2LLEA 4M6QA 5L6UA 3GIYA 3RU6A 3F4WA 3TKFA 1L9WA 2ZZ5A 1OFBA 4EF8A 5C5YA 1F05A 4QNEA 1X1ZA 5G2IA 4BFAA 3NZRA 1NF0A 5I3FA 2JKEA 4MFDA 2WNNA 5EYWA 5L9FA 4N2YA 1FCVA 3UWYA 2A2IA 4RJEA 1M7OA 3ATZA 4JYFA 4LVDA 1F74A 3I68A 4LV4A 3NDOA 4W9TA 3EXTA 5FEWA 1UUOA 1F7BA 1X7FA 3LHUA 1L6WA 1QNVA 3A24A 1TRIA 4MJZA 4YXGA 1PCWA 1YXYA 1PHQA 1NVMA 1QDSA 4UTHA 3TU9A 1FBAA 2ZA1A 4CNOA 2ZBTA 2B7NA 3DI0A 2V5LA 4I9AA 1OFDA 3DFNA 4QAIA 4AHOA 3BW4A 5H2ZA 5HUPA 1TQJA 3BG9A 1OYBA 2ABBA 3B04A 3GX9A 3GVGA 1FWRA 1OX4B 3ABSA 1WBHA 5KTLA 4I7UA 3S1VA 2ZZ2A 2X2GA 2Y61A 1ALDA 3EWYA 3W1XA 2G5WA 2RDTA 3W7JA 3W7LA 4YL2A 4JD4A 3PSVA 1LTDA 2VELA 2ZRXA 2J6XA 5U4NA 3S5YA 3TSDA 5F2LA 5K3VA 3LHVA 2TSYA 3STGA 4AF0B 2GUUA 1TYGA 1VZWA 3BG3A 3PBYA 2QKFA 7TIMA 4DEFA 2A7RA 4X22A 3SGZA 1ZY9A 3EWBX 5CG7A 2QCHA 3QSRA 3LXAA 3OIXA 3G1DA 3W7KA 3GR7A 3W71A 1YPFA 3ZFHA 2JGQA 4GRSA 3TAOA 4DBEA 5HNRA 3FJ6A 2BSLA 3LX9A 4JTFA 2FB2A 3HPXA 5FF4A 3LBCA 4ZVJA 2YW3A 3TA6A 3LERA 3S5ZA 1DVJA 4AAJA 4EF9A 1VYRA 5D09A 4FHAA 4HPXA 5E0KA 4ZQPA 2YGYA 2NWRA 4O54A 3PWAA 2QJGA 1EP1A 1TV7A 1J5TA 3LCHA 1RQEA 3S6DA 3NQFA 3GDKA 5LNSA 4O11A 1TPDA 2ZA3A 3NM1A 3VE7A 5K7JA 3P84A 4NZJA 1DBTA 2D73A 2QCFA 5EY5A 1R2SA 3N34A 4UUIA 1KM3A 5EKYA 2Y7DA 3ABQA 4NQ1A 3G8RA 4YLWA 3WJWA 5SWUA 3C3NA 3O6YX 5LKYA 3C61A 3MYOA 3W1PA 4UTJA 4WXYA 1OFPA 2J24A 1N7KA 3UZ5A 3G8EA 5F2GA 3NL3A 1NFBA 2ZRWA 5HWNA 2DZTA 1GOXA 4HNNA 3TXVA 3NQMA 1OJXA 2R94A 3GLCA 4GUFA 4XKYB 3CB8A 4PEKA 1ZENA 5LNVA 1VC4A 3LCWA 4ML9A 5CZ0A 4IPIA 2ABAA 4XWUA 2HTMA 3Q58A 4GE8A 2X1UA 5DY3A 2Y85A 1M7PA 2DU2A 4N9DA 4UMBA 4GFSA 4IX2A 5FI8A 3B03A 4UFLA 5D30A 1XCFA 4KFPA 3CU2A 4LS1A 4N02A 1VH7A 3W7OA 3M6YA 1O5XA 2V8ZA 5C2XA 2Z2UA 4O1BA 4Z08A 2CLIA 3SGUA 4JEQA 4ZQOA 1X1OA 3EX2A 1KM0A 2Y89A 3C6CA 4ORIA 2W0UA 1W5OA 4JN6A 3W7IA 3SR7A 3W76A 3L5LA 4OV9A 1XFBA 4O12A 2PRHA 3PC0A 3FJLA 2J9ZA 2PURA 1KV5A 2ZFAA 3EX6A 4HNUA 3UPWA 3G3DA 2WSRA 4XTIA 1JCYA 3LHZA 4JTSA 3W72A 5D2XA 4TIMA 5HULA 3W7EA 3LB0A 3PBWA 2CU0A 5G5IA 8TIMA 2JBMA 2DZVA 3EEGA 1W37A 1XBVA 1SSDA 5CPNA 2NUWA 3W7QA 3TQVA 2BWGA 1Q6QA 1JCJA 4UNKA 2ISVA 3G24A 5AN7A 4NJHA 3NQAA 4AB4A 1W3TA 2FPYA 3PAJA 1IGSA 2A85A 4UTUA 4I7WA 5AHIA 1QFEA 2C15A 1Q3NA 3NPUA 5C54A 5D03A 3B0PA 2DZXA 2W6RA 1OABA 1W5NA 3G22A 1G4SA 3W23A 2C14A 3KVKA 1FX6A 3FS2A 2H90A 1GYLA 3TK7A 4JTEA 2E6YA 2WKJA 1CW2A 1C9DA 4RLIA 4FNSA 3KRSA 4XKYA 1SZFA 3HMJG 1FWNA 4GBUA 4UFHA 1XL9A 3GNNA 2YDAA 3TQ0A 3W73A 5I3IA 5J5RA 1FDYA 1F6KA 3JS3A 1VCFA 4XZ9A 1HO1A 3S5NA 1W5PA 3TROA 2ISSA 4IMCA 4GC4A 2VXNA 2VEKA 2BX7A 4ADTA 3BO9A 3I7QA 2OT1A 1P1XA 4QQ3A 4JTUA 3BG5A 3NYZA 5CGQA 4K8EA 1AW5A 3IIXA 1OFOA 4LT9A 2DORA 4LY8A 4PFMA 3LCLA 3G1HA 4R7JA 4C1LA 1EP3A 4WQ6A 3PB0A 3IV3A 3QQ0A 4AWSA 2EKCA 5FEPA 1XUZA 5LNUA 2Q8ZA 4LRTA 1KTCA 2FJKA 1IXNA 2C3ZA 4HSNA 3UY7A 1PIIA 3LI1A 2GQ8A 2E5DA 4E2DA 1R30A 3BPWA 2A1YA 1HO4A 3PUOA 3W7RA 1XBXA 3NQ7A 2Y7GA 3NL6A 3E49A 3MBDA 3VCRA 3KVJA 2V2CA 3C2EA 4POCA 3GR8A 1TTIA 3MWAA 4TU1A 2O7QA 3WJSA 3O15A 4ZMGA 3UXAA 3PR2A 5IM51 3G1XA 4NT0A 2V0TA 3A22A 3PULA 3KFTA 1IIGA 4NU7A 3MJYA 1A5AA 4Y96A 3MP4A 4OHQA 4UR8A 2C16A 1A5BA 1TPFA 1TJRA 4AXKA 3MMTA 2QR6A 1QMLA 2GQ9A 3G0UA 5DXXA 4AEOA 3CWNA 5AYYA 1VYPX 1ICSA 4JX4A 4UFJA 4ZL1A 3ZWTA 1JVNA 4O13A 5F4XA 2EPHA 4LUJA 5D05A 1G4EA 4MY1A 2NX9A 2Q3OA 3EXSA 1SSGA 5F4WA 3M44A 3L9CA 1O60A 2A5HA 1FQ0A 1GTEA 4NNAA 2DJXA 3DFQA 4O8RA 2Z1BA 1EA0A 2E6AA 3QMTA 1SW3A 3LXBA 5AHNA 1THFD 1IXQA 1W3IA 4AWTA 3TX9A 1PVNA 1MZHA 4N9BA 1PV8A 4FXRA 2VFIA 3IGUA 4CCEA 1LOLA 1B57A 3P8JA 2ZZ6A 1EIXA 3UD6A 1JULA 4XBSA 3VFLA 4I7VA 1EP2A 2J88A 3LOTA 2ZTJA 4CQAA 3FYPA 3GDLA 3N2XA 2J27A 4LRSA 4FX8A 4CQ8A 3NPWA 3T7VA 2VKZG 3DHDA 4WZHA 2VFFA 1A5SA 1R2RA 1BEUA 1B9BA 4WJEA 5D38A 1VS1A 2DZWA 3G3MA 3T40A 1CX9A 1SO5A 4O15A 1H1YA 4LVGA 3TV8A 1SU5A 3EX3A 1LDCA 2JKAA 3E02A 1TPVA 1KM6A 1S3HA 5HR6A 2B0MA 2AQWA 2YFOA 2ZRVA 4FXSA 2A6LA 4HHPA 4DELA 4LC8A 1XDLA 1LRNA 3W1TA 2E6DA 1XC4A 4Q33A 3MHGA 1FDJA 3LHWA 2F84A 5AC8A 4ZQNA 1MEWA 3TDFA 3KX6A 2ISWA 1A53A 3U2OA 1GEQA 3IEBA 1BWKA 3FFSA 2E5BA 1QPRA 3W7DA 5LSMA 1KM4A 5H91A 1SPQA 1UBSA 2HSAA 4O52A 4JX6A 2OT0A 1VPXA 4O4WA 4RX0A 5D2TA 1WA3A 2G96A 4QNWA 5G4EA 1GWJA 3N2MA 4MZ8A 4BI5A 3PB2A 4JIPA 1H7PA 2CZDA 2BLEA 3GDRA 5CPLA 3C2OA 1PL9A 1ICQA 3GYEA 4MFEA 1TREA 3ZS4A 1JCNA 1YXCA 1Z48A 4UMAA 2Y63A 3TQKA 1QPOA 2QF7A 1ZNNA 1GVRA 4U28A 1OG0A 3LV6A 5FEZA 1GG0A 2H8XA 4QM1A 4PL2A 3UNDA 5AB3A 1N55A 2CLOA 3UZJA 4LNYA 3NOEA 2YX0A 3S1XA 3W2KA 4UC5A 2XN2A 3SY5A 2EGZA 3M5ZA 1W8SA 4UR7A 3STFA 4Z1CA 5D2WA 3ZWSA 4JTLA 1XKYA 1M6JA 3G18A 1YDNA 4K39A 1BKSA 4JX5A 3CLMA 3MI2A 3QF0A 1U5JA 3OVQA 4MYXA 1SR9A 4O17A 1X8FA 3QMRA 3DBPA 2NXGA 3W22A 3F1QA 3IVUA 4X3ZA 2E6FA 3LCFA 5BRBA 4M19A 2PE4A 3WK2A 2FLIA 3C8FA 5I3HA 1DORA 1HTIA 3GB6A 1S5WA 5DCEA 2TPSA 3B05A 1O95A 4ORMA 4O28A 3CHVA 5T26A 3S5OA 1H5YA 2YW4A 3NZ1A 4MUZA 2TMDA 4N6EA 2GPTA 1T8XA 2CZ5A 3N14A 2Z6JA 1I2PA 3EKLA 2CLEA 3G1SA 1GVFA 4LC6A 2O7SA 1ME8A 2VFDA 5HMSA 3OBKA 2H6RA 3TXZA 4HT3A 3BGJA 1ZAJA 2ALDA 2QEZA 3DAQA 4WUIA 4RV8A 4HSOA 1LOSA 1LP6A 3LHTA 1SQ7A 1H7RA 1ZAHA 4DO6A 5F4SA 1JCLA 5TBOA 2ZZ7A 5KITA 4NX0A 4LS2A 1JRCA 3OA3A 1LCOA 2WSQA 1GPWA 2CLHA 3GXNA 5MHBA 1KBIA 3W1MA 4NX5A 4E0CA 5HR7A 3IIOA 1Y0EA 4LV9A 3W1QA 3KXQA 3NEVA 3KVLA 2QCNA 3W70A 3QJAA 3W7PA 1ZHAA 3EWWA 2P0OA 4Z0JA 4Y8FA 4P61A 4GJ1A 4Y6GA 2ZRYA 2QCEA 2B4GA 4AWUA 3W84A 3STCA 4NNBA 1SW7A 3L0GA 3UYCA 3SJ3A 4K7YA 3EB2A 1OX5A 3C56A 4MLRA 1XXXA 5G4WA 1TTPA 4RCXA 4CCDA 2V2DA 2WQPA 1JUBA 2R8WA 2BTMA 4ZQMA 3OEXA 1SO4A 1NAL1 3HF3A 2XFWA 1LLZA 3P74A 3TFXA 3IIVA 4FNPA 2NX1A 1ZCOA 5HWMA 2GJLA 1K7XA 2I14A 5GVJA 4JTGA 5BW6A 1TCDA 1RQBA 1H61A 4RR4A 4GUJA 1WQ5A 1D3GA 1YADA 1X6UA 3NPVA 1FWTA 1FDZA 1GT8A 2VEMA 5AYXA 1G7UA 1WOAA 1UB3A 2QUVA 1UUMA 4MVAA 3CM4A 5CZSA 2PRMA 4Z1BA 5HQEA 1KLZA 3LM7A 3S1UA 2FFCA 4P2VA 4O18A 3DXIA 4JDBA 4OBTA 1S5TA 1RD5A 3M1ZA 1DOSA 4IGHA 1JQXA 2Y62A 3DFPA 1TV8A 1YDVA 5G2WA 2C0AA 4LTSA 3UY8A 5DCBA 2VOMA 1FCBA 1G7VA 1VR6A 5CZTA 3EWXA 5KSWA 2NV2A 3UWUA 4OU1A 4UFIA 4G1KA 1DQWA 2GVGA 1L6YA 1K8XA 2V82A 1KV8A 2WPBA 5HWJA 4O57A 4Z1DA 1TSIA 3TJLA 4EWND 3CT7A 1HG3A 2ZZ4A 3GKFA 3O06A 1MSSA 4PTNA 1ONRA 1H51A 2HS8A 3E9AA 1XBYA 1YTDA 3FYOA 1OFQA 2Z0IA 2RKXA 3A23A 1EPXA 3O07A 3VKJA 2QCMA 5CSRA 1KFKA 4L4MA 5EPDA 1Q6RA 3DH7A 1TPH1 2ZCGA 3HBLA 4Z0SA 4GXMA 3M43A 4O0ZA 1LBMA 3USBA 2RH9A 2FQIA 3A9IA 2W79A 2R14A 1I2QA 2H8ZA 1WAUA 1XM3A 3MBFA 3M0ZA 4RXGA 4A29A 1W54A 1GZGA 1J4EA 4M7SA 5AHFA 1L2UA 1EUNA 5G1TA 2ZYFA 4WXZA 2QDHA 4N9CA 5C55A 4EVZA 4FIRA 1SUXA 5K9XA 3Q2DA 2VFGA 1I8JA 3BK0A 3ZR4A 1EWDA 1QWGA 1VJIA 1W56A 5AHEA 1OHLA 3QM3A 1XDMA 1GQNA 1RPXA 2P1FA 3K30A 1H7NA 2VFHA 5FESA 4IXHA 1WOBA 1OFAA 4FO4A 1W31A 1W3NA 3O63A 3A5VA 3HG3A 3LTYA 1SZGA 3TNOA 4AHQA 1ME9A 3V75A 3DFSA 1EUAA 1VCVA 1MEIA 5CKSA 4H6KA 1I2NA 3T4CA 3PSWA 3TSBA 1O5KA 2FTPA 2A6NA 3SSJA 3HG4A 4HPJA 4GUGA 3TW6A 1WYIA 1IXOA 4JIQA 1ML1A 3QH2A 2VEPA 5DELA 2B7QA 1NF7A 1OX6A 1RQHA 2ZRZA 1TJPA 2G95A 3OVPA 4JTTA 2ZDRA 3RF9A 4JGDA 1QR7A 4MZYA 1TPWA 1KW1A 2R91A 2VENA 4FNTA 1VGAA 1H7XA 3C4UA 3FKKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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