1QOPA

Crystal structure of wild-type tryptophan synthase complexed with indole propanol phosphate
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
267
structure length
265
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLAIIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGAENRGPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Wild-Type Tryptophan Synthase Complexed with the Natural Substrate Indole-3-Glycerol Phosphate
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
total genus 99
structure length 265
sequence length 267
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 1999-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1qopA00
4O1BA 3TV8A 2NV2A 3PG9A 3GDRA 3T4CA 3DH7A 2DP3A 3N2XA 3OHIA 1O4UA 2ZTJA 3IIXA 2X1TA 4ZQPA 1CI1A 4LRTA 2NLIA 1R2SA 1VR6A 8TIMA 3EWUA 2C15A 2GUUA 3N9RA 4JTHA 2YX0A 4PODA 2XFWA 4HNUA 4BF9A 3G1DA 2ZRVA 3GXTA 3DHDA 3JS3A 1SZEA 3TNOA 3MI6A 5BW6A 2ATMA 3FFSA 4EF8A 3C2OA 3GB6A 3PUEA 3NQ7A 1DOSA 3TJLA 1Y0EA 3NQVA 3LXCA 1GYLA 3OG3A 1UUOA 4GE8A 3G24A 1LLWA 3ATZA 3HPZA 3F4WA 2ZRXA 4EWND 1YLVA 4FNPA 3BO9A 1VH7A 4DO6A 4NNBA 2B7QA 3BGGA 1WYIA 4K7VA 1XBZA 1UCWA 4O11A 3W87A 3A23A 5I3GA 2WO5A 4UFKA 1AL7A 4Y6GA 1S5VA 3LLFA 3PUOA 4OBTA 3FKRA 2TMDA 3W7JA 5H91A 3GDTA 4WZHA 1UB3A 5AYXA 1B4EA 1GTEA 3NPWA 1LBMA 3MI2A 5K9XA 3NQDA 3I65A 2VXNA 5AN7A 4JTKA 3W1TA 1F5ZA 1VHNA 1FWWA 5J5RA 1PE1A 4CCCA 3G1FA 3CHVA 3QJAA 4CCEA 3QYQA 3S5NA 5AB3A 1Q45A 4L4MA 4AVFA 3UWWA 5LNRA 3LX9A 1ZCOA 3LGEA 4PH6A 3I6RA 3P5YA 2B0MA 2RDTA 4OWGA 4Y9AA 1WOAA 3W7KA 3IGUA 1P0KA 3KVJA 5EMUA 3LCIA 3IVUA 2Y61A 3SR7A 4JX4A 2RKXA 4KKXA 1QFEA 2PRMA 1EUNA 5FESA 1XI3A 4LVFA 2JKPA 4JX6A 1QAPA 1PCWA 3W1QA 1ONRA 3CB8A 2VEMA 2E1DA 1KTNA 3TA6A 4MLRA 1GT8A 3ATYA 4LC6A 3BW2A 2QDHA 1R2TA 1SSGA 4H4IA 3R13A 3O6DA 5C6MA 5AHEA 1F74A 1B3OA 4NQ1A 2Y6ZA 4WQ6A 2YYTA 3EWZA 5CG7A 2E5BA 1W1ZA 4TO8A 4AF0B 2G96A 4YWIA 4WX2A 4OE7A 1K8ZA 3P8JA 3HGOA 1G67A 4Q4KA 1W5PA 1Z44A 1SZFA 5D2TA 5KITA 2RH9A 4ZZ9A 3SZ8A 3GKFA 5CKSA 1AG1O 2H6RA 2TRSA 4UTUA 4GBUA 3O8AA 3NQEA 4A2RA 4R7JA 3EX1A 3TFXA 5LNWA 2GQ9A 3E12A 1W8SA 2HS6A 5LSMA 2O7QA 2UV8G 1YYAA 2BSLA 3DZ1A 3E49A 2Y63A 4ALDA 3EX6A 3LHTA 4Y8FA 4UFIA 2FB2A 4K8EA 4R33A 4X9SA 5EY5A 1DJQA 4JNMA 2A1YA 2NXHA 2QCFA 3PG8A 4O10A 3S5OA 3MO7A 4QIUA 2YR1A 3FYPA 1G6CA 2CU0A 1CX9A 1TV8A 1HO4A 4MVAA 2A21A 4P2VA 4FXRA 4MYAA 4JTIA 3NQ6A 5E1QA 5G2WA 3DKJA 5A5WA 2V2DA 3TAKA 1MEWA 3CEUA 3MP5A 4O50A 3UXDA 1VQTA 2CZFA 4O52A 3L0GA 3BW4A 5C2XA 2V9DA 3CM4A 1BKSA 2GVLA 3KXQA 4CNPA 4UTTC 5HUOA 3GNDA 3R2GA 2EHHA 3AJXA 3E96A 4UMBA 1MXSA 1YXDA 1JR1A 1H7RA 1SFLA 2B7PA 5F2MA 2WSQA 4RXFA 3NM1A 1OX4A 4LV9A 5HQEA 1G4EA 1TCDA 3R5EA 2ZBTA 3LTSA 4K38A 1KM5A 5G4WA 1GVSA 1LCOA 1C9DA 4GUFA 4JXCA 1DVJA 1ZAJA 3KHJA 3QH2A 3A22A 3STGA 1G7VA 4MZ8A 3TR2A 2FPVA 3P81A 4GUJA 2CLMA 2ZFAA 1JJKA 2CLEA 1KM3A 2CW6A 3W76A 4QNEA 3QFEA 4NX0A 4E38A 4Z1AA 3CWNA 5A8GA 3UZJA 2AGKA 4PTNA 4AEOA 3MW7A 1Q6OA 2YSWA 1N7KA 3W7IA 1Z42A 2ZRZA 4MJMA 3KVKA 4GWEA 5F4SA 3EXSA 1GVOA 3HQ1A 3BV4A 4DPQA 3GLCA 3L5MA 4NNCA 3R8RA 3UWQA 4K37A 3SW6A 1OYBA 1TPDA 3TQKA 4XBKA 3HB9A 1S5WA 1OFQA 3T55A 2LLEA 4O0KA 2YYUA 1MEHA 3WJZA 1H7XA 5HR7A 4O16A 1NF7A 1T0OA 1B9BA 5SWUA 1KTBA 3LI0A 3RLVA 3EWYA 3FJ6A 1YXCA 1YADA 2NUXA 2FPTA 1QDSA 2QKFA 2X1RA 3NR0A 4WD0A 3VKJA 4LOCA 1KFLA 3W1AA 1OFRA 2OT1A 4YCOA 4O8RA 3HPXA 3TSDA 2OMAA 2RFGA 3Q58A 2CZEA 4FNSA 1ML1A 3VE9A 3OVPA 3UQNA 3KRSA 4N6EA 4HKPA 5DBUA 2PC4A 2WSRA 1GG1A 2BZNA 3W85A 2ABAA 2Q3OA 3TCEA 3LXBA 1K02A 2V30A 4RZ6A 4FF7A 4ORMA 3S9YA 1KBIA 3QSRA 4X22A 3ZWTA 4O18A 2C3ZA 4UNLA 1FWNA 3NAVA 3TMLA 1THFD 1JRCA 4GFSA 2C0AA 2J9YA 4UTKA 5DXXA 2E6AA 3W07A 4QNWA 3LCHA 1H51A 2WNQA 3FIGA 2DZVA 5G1TA 3M9YA 4Y96A 1YTDA 3L9CA 2BXVA 3LTYA 3N3MA 4LTSA 5G5IA 2WNZA 4UIOA 2QCHA 4WOZA 3A24A 2C1HA 4O57A 3STFA 1VPXA 4GJ1A 4PC8A 1TIMA 5I3FA 3EX2A 1QO2A 4S2BA 4LVDA 3C61A 3RLUA 3W7OA 4UMCA 4OU1A 4EIVA 5AYYA 3VNDA 4NVTA 3C2RA 3FA5A 5LNUA 2FQIA 3DU0A 3PBVA 4BWLA 5BOOA 3W75A 1H60A 1TTPA 5IBXA 5IM51 2HMCA 3IV3A 4FX8A 2E5DA 1I2RA 4I7WA 4ORIA 5DCBA 1W56A 4OQVA 5BMXA 3TSBA 2FPYA 3NPUA 3TXZA 3LHYA 5G1YA 5CPNA 5D02A 1NVMA 5I3JA 3LXAA 1ICPA 3K30A 2A6LA 4Z1CA 3W83A 3S6DA 2RHGA 2Q8LA 5MHBA 1OF8A 3G1SA 1OK4A 1ZJIA 4NU7A 3W1UA 2P1FA 1RVGA 4NJIA 1VYPX 4AWTA 3QMTA 2VFHA 1ME9A 1XKYA 3PY2A 4NXKA 1WOBA 3NA8A 3W1LA 3EWBX 3B03A 3A21A 4AXKA 4ZQRA 4M5PA 4JDYA 5EL1A 4MOZA 3VI2A 4GUIA 5HNRA 3S8HA 1I2NA 3BG3A 4ZQOA 2QCLA 4LW7A 5KMYA 2WV8A 1CW2A 1WV2A 1KA9F 1WBHA 1TREA 5CZSA 4ICNA 1GOXA 2YDAA 3V1PA 3GXPA 4LVAA 3FLUA 3TSMA 3L68A 4YCPA 3QPZA 2EAWA 4UFMA 3TK7A 3DXIA 3RFAA 2NX1A 1KW1A 2Y62A 4FB7A 4DBEA 3GDKA 1NAL1 3QM3A 1MSSA 3ABRA 4RJEA 2VKZG 2EPHA 4LC8A 3U2OA 1LM1A 3F1QA 1RQHA 5U4NA 3C8FA 1OF6A 4BR1A 3LB0A 1WDWA 4DELA 1HL2A 4X3ZA 3GAKA 4WY0A 1VS1A 3G0SA 4IPIA 1SUXA 4CCDA 3HJZA 2XN2A 4TIMA 3B0VC 4FX7A 4MJZA 4NJKA 2QF7A 1UUMA 4QITA 5FF3A 3ZR4A 2ZQ0A 4DO5A 4JTGA 1W5MA 2QR6A 5CZTA 4MFDA 2ZCGA 4WXZA 2J24A 3PM6A 4TU1A 3G0XA 4M6VA 4JICA 1MO0A 4UMAA 3S0CA 3W23A 4Q33A 1RV8A 1AL8A 3W7MA 4TMBA 1SW3A 2V2CA 1U5JA 1LBFA 2GJNA 2WSYA 2Z2UA 4O13A 1LORA 3NQAA 4PEKA 4K39A 1T99A 4RCXA 1F6PA 1RQEA 4Z0JA 3IEBA 3W74A 3T78A 3W88A 1K3UA 1YTEA 2CLOA 2VELA 4R34A 3TKFA 2ZZ5A 5TQLA 1QPOA 3A5FA 2TSYA 3KOFA 4S2CA 3WK0A 3DI1A 1XXXA 3IIVA 3LTPA 1ZFJA 4NJGA 2I9EA 3M5ZA 1NFBA 1YDVA 4UR8A 1KM2A 5EBUA 3W2JA 3QF0A 3WK1A 3QEZA 4MZ1A 2Z0IA 3M16A 3M41A 3O6YX 3EB2A 3KAOA 2DZUA 4DQWA 1TV5A 3P60A 1GQNA 1JVNA 2NZLA 1L6WA 2HTMA 5HWMA 2ZZ6A 2CLHA 4O12A 1R46A 3TROA 3B0PA 4LRSA 4DBDA 4BI5A 4H3DA 2J88A 2QEZA 4W9TA 5K4ZA 4NJHA 4FIRA 2KZHA 3BLIA 3BG9A 1LZOA 2QCCA 3O6CA 4O4VA 3W1PA 3HG5A 4L4LA 3ZWSA 4E0CA 1X7FA 5AFDA 2X30A 1DKWA 1ICQA 4LNYA 2H90A 5AHNA 5BRBA 5D30A 3SECA 1SU5A 4N9DA 2A5HA 5F2GA 1VRDA 3DAQA 4CQ9A 1W5NA 1S5TA 3DFOA 4IPJA 1WQ5A 3LHUA 3KRUA 2XN0A 4POCA 2AAMA 3EX4A 5G4EA 4XZ9A 4JYDA 1IGSA 1Q3NA 1LBLA 1QMLA 4MKNA 4WJEA 2ZA2A 3GIYA 2BX7A 4QJ1A 3HG4A 3GK0A 2NV1A 2WJZA 2YGYA 2YPIA 4EVZA 2OZ0A 3LDVA 4IX2A 3JR2A 1AW1A 2DZTA 5KINA 2NWSA 1I2OA 1C29A 4HNVA 3N34A 3HGRA 3NQGA 2DJXA 4QAIA 2ZZ1A 1ADOA 3W72A 5AHMA 4JEQA 1FWTA 1WX0A 3B8DA 4A3UA 5DLCA 4BFAA 3LRLA 2QCDA 3L65A 5BMWA 3TC7A 5CPMA 1MEIA 1BEUA 2GQ8A 1ZNNA 4JDBA 4XKYB 3JRKA 4AHPA 1IXQA 4XUGA 4JIQA 1FDZA 4HPJA 2V5BA 3NGJA 4MY8A 3SFKA 5DCEA 1YDNA 2A7RA 4AAJA 1SQ7A 2ZRWA 1X6UA 1LRTA 1EPXA 1TB3A 3ABQA 2PE4A 3UWUA 1AK5A 3NM3A 3P80A 1O5KA 4AB4A 3USBA 4UTTA 1F6KA 5D33A 2EF9A 1EUAA 3B0UX 4IWWA 4K6AA 3QW3A 4PA8A 4CQ8A 2FLIA 5I3HA 1SR9A 2OX1A 1UASA 1F7BA 1OFEA 1PVNA 3NPXA 3UZ5A 3S1UA 1OFAA 1L2UA 2R94A 3HGSA 1VCVA 1NF0A 1SSDA 3S1VA 4GC4A 2Z6IA 3G3MA 4M7SA 1KTCA 3IVSA 4KFOA 3U6WA 3PBUA 3E02A 3PF3A 4M19A 3ZFHA 3MHFA 3PR2A 4IXHA 3L2IA 3LRMA 2FJKA 1X1ZA 5EKYA 1K7EA 2TYSA 3L0KA 2FB3A 2Q3RA 1EWEA 3B05A 1LDCA 2YCEA 3MJYA 4AHQA 1HFBA 2J27A 5I3KA 2ALDA 1RQBA 3MP3A 1TPUA 1MZHA 4WY0F 1E51A 2E6FA 5D38A 1HG3A 1KM6A 4O1CA 2ZTKA 3QPYA 3W1MA 4BI6A 4GNJA 4JTLA 1WBJA 5FF2A 5LNSA 3STEA 3MYPA 5EYWA 2E6YA 2H8XA 1NSJA 1JCJA 2OT0A 1K8XA 4LS0A 3MP4A 5LKYA 3G0UA 2HSAA 5AC8A 1VZWA 1ME7A 4HT3A 1F05A 4ZMGA 3ZS4A 3W7GA 4RK8A 1K03A 3C3NA 3EWWA 1FCVA 2HS8A 3RMJA 3UWVA 1F76A 3WK2A 3GDMA 1FX6A 1LOQA 1RPXA 3HG2A 5F4WA 3SSJA 5CPOA 1XM3A 3G8EA 1QO5A 5D2YA 2YXGA 1EIXA 3O07A 1KFKA 1VCFA 1YDOA 1TQJA 3M43A 5EA9A 4ZQMA 3W73A 4N9BA 3FEMA 3LCXA 1Z48A 5FEPA 4UTWA 2J9ZA 4JY8A 3FYOA 1GVFA 3G1VA 3PULA 1XDMA 5C54A 1XL9A 5CPLA 4TMCA 1H50A 3DFPA 4MY1A 3W7EA 1TPB1 1GYNA 3NQMA 4U28A 3CLMA 4O0ZA 3G22A 4LY8A 3CU2A 4IMCA 1OHLA 4OT7A 4AF0A 1TRIA 1KV8A 1S3HA 5D04C 1QPNA 1LYXA 5AOUA 2NWRA 3DBPA 3CIXA 3PBWA 5C55A 1OG0A 3Q37A 1A5SA 1FCUA 1QOPA 3M5VA 3TMQA 4CLMA 4N2YA 2E68A 3LCWA 2CLIA 2WQPA 2DORA 4O28A 3CIWA 1SFJA 2Y85A 1SO5A 2Y88A 3CQ0A 3L0NA 5TBOA 3QRHA 2Y89A 1T96A 3QMRA 3W2UA 4AWSA 4UTIA 3CPRA 3WJYA 3P8IA 3GZ3A 3S42A 4XWUA 4XKYA 5U7SA 2ISVA 3W22A 1GEQA 3N9SA 2E5CA 4K7YA 3LCFA 4KFPA 4LUIA 3UWZA 2CLLA 3PB0A 4UTJA 4D2JA 1OFDA 2V2HA 5D09A 2GVGA 1KBJA 3QQ1A 3W9ZA 4FEZA 3B4UA 3LRKA 2JGQA 3KX6A 1GG0A 3IRDA 1TQXA 4JTSA 4YMZA 1FCQA 4G1KA 3N73A 4YLWA 3DFNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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