1QR7A

Crystal structure of phenylalanine-regulated 3-deoxy-d-arabino-heptulosonate-7-phosphate synthase from escherichia coli complexed with pb2+ and pep
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
343
structure length
338
Chain Sequence
LRIKEIKELLPPVALLEKFPATENAANTVAHARKAIHKILKGNDDRLLVVIGPCSIHDPVAAKEYATRLLALREELKDELEIVMRVYFEKPRTTVGWKGLINDPHMDNSFQINDGLRIARKLLLDINDSGLPAAGEFLDMITPQYLADLMSWGAIGARTTESQVHRELASGLSCPVGFKNGTDGTIKVAIDAINAAGAPHCFLSVTKWGHSAIVNTSGNGDCHIILRGGKEPNYSAKHVAEVKEGLNKAGLPAQVMIDFSHANSSKQFKKQMDVCADVCQQIAGGEKAIIGVMVESHLVEGNQSLLAYGKSITDACIGWEDTDALLRQLANAVKARRG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of phenylalanine-regulated 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate-7-phosphate synthase from Escherichia coli.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PHENYLALANINE-REGULATED 3-DEOXY-D-ARABINO-HEPTULOSONATE-7-PH
molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
total genus 119
structure length 338
sequence length 343
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.5.1.54: 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase.
pdb deposition date 1999-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00793 DAHP_synth_1 DAHP synthetase I family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1qr7A00
2BWGA 1GWJA 5AHNA 2XN2A 3TC6A 3LRKA 1O60A 1MXSA 1GYLA 1FQ0A 2AQWA 2DZSA 4LTSA 4QAIA 4LW7A 1KFKA 1W5QA 2DU2A 1WBJA 1L2UA 2J9ZA 4AHPA 1EWEA 1OJXA 4K8EA 4EOUA 1H60A 1BTMA 4O57A 3ABQA 4O1BA 4XKYA 4NJHA 4MKNA 2Z6JA 4UFHA 1SO3A 3CM4A 3EWWA 2A6LA 3H53A 3LBCA 4O18A 1AW2A 4Z1DA 1DHPA 2FQIA 2F84A 4AWSA 4A29A 4FB7A 2HSAA 3IIZA 1QPNA 3I6RA 3W1TA 1K03A 4N9DA 1EIXA 1AL7A 4OWGA 2OT1A 1LOLA 4CLMA 3L9CA 1MEHA 1YXDA 1NAL1 1SFLA 1TQJA 3W83A 2ISWA 1OX4B 4S2BA 3L21A 1IXPA 3OG3A 4RCXA 3C2OA 4MUZA 1X1ZA 3G0XA 3A5FA 4L4MA 4NNCA 2RDWA 4YL2A 5D04C 5LNWA 3MHUA 3BGJA 3G1VA 4P2VA 4O50A 1G7VA 1DORA 5D09A 3QW4B 3KFTA 2CFFA 4JTSA 5HUOA 3EX4A 3N2XA 1ME9A 4XBKA 1OFQA 3GNDA 3L66A 1WX0A 3HO8A 5FF0A 3LHUA 3NQVA 3WJZA 3LHTA 1Q6LA 4GC4A 2E1DA 1ZY9A 2BZNA 5FF3A 2WQPA 4AAJA 5BMXA 5FF7A 2VKZG 3CHVA 1JR1A 2DZUA 4DPQA 4LS0A 2PRMA 1BWLA 2JK2A 3NQAA 2C0AA 4JXCA 5CPNA 2GJLA 1WV2A 1XBZA 2O7QA 1Z48A 4W9TA 3BLEA 3JRKA 3EKZA 5TIMA 1LTDA 3IVSA 5I3HA 3LBMA 4IWWA 3BK0A 3DENA 1VH7A 4M7TA 4IUOA 3I7QA 2HMCA 3L5AA 5F4SA 1KM4A 3P67A 4K37A 3LHYA 2GQ9A 3TX9A 2JKPA 4Q4KA 1F6KA 4QISA 4XWUA 5HUPA 1HO1A 5I3KA 1AK5A 3STCA 5F1VA 5CPMA 3TCEA 2E5BA 1VHCA 2ZRYA 1N7KA 3W6YA 4JTFA 1TCDA 1XI3A 1R2SA 3RFAA 3N19B 5BOOA 2TPSA 3R5EA 3C61A 3F4NA 3MUXA 4JD4A 4JYDA 3HGSA 4E2BA 4RKAA 3NQ8A 2A21A 4IMFA 3IEBA 4IJBA 3UXAA 2X1SA 1SZEA 4K7YA 1K8YA 3W2LA 3TMQA 1Z44A 2EKCA 3B0UX 3KRUA 4PFMA 2C6QA 5AHIA 1NF7A 3HOJA 1SW3A 1R47A 2PURA 5F2IA 4I7UA 3LCFA 3PWAA 3HQ1A 3IVUA 3TAKA 5K9CA 1RV8A 2QUUA 1AMKA 1TPFA 3GR8A 3PF3A 2OMAA 3S1WA 3MI3A 5LGXA 4GJ1A 1TTIA 1GEQA 2NXIA 1HG3A 1QDSA 4PA8A 3W1MA 1OFDA 1JUBA 5G1TA 1GZGA 2Z1BA 1RZMA 4ZVJA 2WSQA 2FB2A 3TDFA 4S1FA 1W5PA 3W87A 5BNKA 3QYQA 4EWND 4K7VA 4BK9A 3W7OA 4KKXA 2RDUA 3IVTA 3NOEA 4MJZA 4GUFA 3KRSA 3TQ0A 5DBUA 1SZGA 3SGUA 3G0SA 4JTIA 3LOTA 5DXXA 2HS8A 1RPXA 3W22A 4LWWA 1IGSA 3P84A 5J5DA 4MPQA 1OX4A 3P61A 4BI6A 1M7OA 1G67A 2NUWA 2QJIA 3SW6A 4UTKA 4AEOA 5H91A 3EX2A 3THAA 2VFHA 5BMWA 6TIMA 2NWRA 3T44A 4FNUA 5AFDA 5EA9A 3PUOA 5LNVA 3TC7A 3B06A 1BEUA 1KBJA 4UTTC 1TQXA 1K7EA 2WJZA 2ZZ4A 4CQ8A 2X2GA 3M1ZA 1SR9A 3QM3A 5LHFA 5FEPA 5CKSA 3I65A 3C0JA 1SW0A 3GB6A 2J9XA 3M5VA 2Y63A 4MZ8A 3MBDA 3CPRA 3VFLA 4WX2A 4ALDA 2PE4A 1GVSA 1I45A 1L6YA 3PBWA 3QFEA 3GXPA 3P5YA 2DZXA 4JTGA 3PAJA 4FNTA 4RLIA 4LY8A 1UUMA 1D9EA 3E02A 2DZPA 4MIMA 1H51A 5K9DA 4FX6M 1LRQA 2RFGA 3TQVA 2Q3RA 2QCNA 5AC8A 3QMRA 4MY1A 1W0MA 3DKLA 3DGRA 3NQ2A 3W1RA 3VCRA 5AC7A 4O1AA 3KVJA 1YDOA 5D2WA 3GKFA 2OT0A 3DH7A 1S5VA 1VCGA 3GIYA 1KV8A 2ZRZA 3SECA 2ZQ0A 3DU0A 5KTLA 2C16A 1PIIA 4ICNA 2CLHA 2VFIA 1VRDA 2V9DA 1UUOA 3LCWA 5F1UA 2R14A 4O16A 3LCIA 4ZZ9A 1H1YA 4UR7A 1ZFJA 3NL6A 2GVJA 4NVTA 4ZQMA 4YXGA 2YYUA 5FI8A 4RK8A 1OYAA 4NJJA 3F1QA 2BXVA 1W31A 1I2OA 1TTPA 2QEZA 2YPIA 4MLRA 2ZTKA 3C4UA 1ZNNA 3KVKA 2J24A 3EWYA 3LXAA 2NV2A 3I68A 4HSNA 4XKYB 3PSVA 1GG0A 3THQA 2RKXA 1W1ZA 2Y7DA 4JTHA 2A1YA 1VCVA 1XXXA 4DO6A 4JR5A 3R13A 4TR9A 3L0NA 1OHLA 1ZAIA 4RZ4A 4NT0A 1EUNA 4O0KA 3UWWA 5K4XA 4LT9A 2WV8A 1W3NA 4PCFA 3KVLA 3F4WA 2DJXA 4RV8A 2V81A 3O06A 1GVOA 5HMSA 1W3TA 3M43A 1CX9A 3NQ6A 3BLFA 1T99A 1VYSX 3E49A 1KM6A 4HNVA 4YCPA 2ISSA 2QJGA 2H3BA 4A2RA 2VFEA 4E0CA 3JS3A 4IOTA 3N9SA 2H3DA 4UFJA 2XN0A 1NVMA 3B04A 3PB0A 3W7LA 3OIXA 4ZQCA 2ZRVA 3EWBX 4FNPA 3ZFHA 4LV9A 4FXRA 3TXZA 5EBUA 5FF2A 3W74A 4R33A 5K3VA 2OCZA 4NJKA 3W9ZA 2G97A 4KFNA 4NJIA 3TR2A 4EF8A 2FDSA 3UXDA 1B4EA 3O16A 2GUUA 2DORA 3GLCA 4JY8A 3C2VA 4UTWC 3LHWA 2VELA 1KV5A 4XTDA 1JCYA 3CEUA 1LBMA 2BSLA 4IQLA 4QITA 5CPOA 4ADTA 4IXXA 3W7JA 3G1YA 1OX5A 1EWDA 5EMUA 2PCQA 2YSWA 5HJLA 3AJXA 4NU7A 3NL5A 3Q94A 2ISVA 3G24A 1UJPA 1YYAA 3BVJA 3B03A 4UC5A 3UZJA 2Y85A 2ZA1A 5G4EA 5GVJA 1ZALA 3QMSA 3H54A 3TQKA 4JYFA 4HT3A 5IM51 2ABAA 1AL8A 4N2YA 3BO9A 4QNWA 2FIQA 4KWVA 4WY0B 1H7WA 4GUGA 3LCXA 3O6DA 1W5OA 4NNBA 3INPA 2I1OA 1J5TA 3BW4A 1AW1A 3O15A 3Q58A 4H4IA 1Z41A 1FWWA 5J5RA 3GZ3A 1IIHA 3B0PA 1EX5A 4N4PA 4JDYA 3FLUA 1ONRA 2BTMA 4AMAA 1L9WA 2CLKA 3O63A 2V2HA 1L6WA 3B05A 2CLOA 4O19A 3W1XA 3RF9A 3UWUA 4UFLA 2CLMA 1UCWA 4XBSA 4JS3A 2V5LA 4DXVA 4RXGA 2C13A 1JCNA 4K38A 3HJZA 1H5YA 4JDBA 3MP3A 3DI0A 3HPXA 3L68A 3N73A 4KFPA 4CNPA 4OV9A 1Q6OA 4A3UA 2FLIA 1WYIA 3BV4A 3W73A 3EB2A 5DCBA 4JTEA 1PVNA 1OK4A 1P5BA 1V7YA 5K9XA 1PV8A 5TQLA 3FFSA 1A5BA 3G1XA 2IQTA 3EKLA 4K39A 1F05A 3S6DA 2ATMA 2LLEA 2A2IA 2CWNA 3BGGA 4MY8A 2WSYA 1YDVA 1T96A 1JULA 2B7NA 3LI0A 3EX6A 3QQ0A 3PSWA 1VPXA 1W5NA 1F74A 4MLJA 4FF7A 5ABTA 1OFOA 2VFFA 1PL9A 2V0TA 3K30A 4M19A 1RQEA 1KM3A 4HSOA 3TXVA 4MZYA 1KW1A 2VEPA 1YXYA 5BRBA 2QCFA 5D33A 2E09A 1OG0A 4PTNA 3N3MA 4RX0A 6ALDA 1WOAA 2A6NA 4BR1A 3LHVA 4MJMA 3TU9A 3S5ZA 3LRLA 2Q8LA 1W8SA 1FXPA 2PRHA 1MEWA 4N9BA 5D30A 3VI2A 3W1UA 3TIMA 3R89A 1OYBA 3QRHA 3AO0A 5L9FA 4U4MA 3NGJA 2ZBTA 4O10A 3I7RA 4JEQA 3LTPA 3VE9A 3IIPA 3C3NA 1XDMA 4EF9A 3NZ1A 2VC6A 3MO7A 1OFPA 3NPWA 3NYZA 3W1AA 1PE1A 1JUEA 1VGAA 3CB8A 3TV8A 3UD6A 2JGYA 3P8IA 4O54A 3UY7A 2ZA3A 1TPDA 2VFGA 2G95A 7TIMA 1TREA 1FDJA 1SPQA 2YCEA 4FIQA 4JIPA 2E6DA 4QJ1A 4WXZA 1I2NA 4OT7A 5AHLA 1TPUA 3C2FA 3L0GA 3O6YX 4RZ6A 3JR2A 5L6UA 3W2NA 4POCA 3NNTA 2DJLA 4OQVA 4Q32A 1D3GA 4GUHA 3NPXA 3W7EA 4X9SA 2ZYFA 1R46A 1DJQA 4UUIA 4M6QA 5F4WA 3NA8A 1MO0A 5EY5A 1WXJA 2R8WA 3W7CA 4NQ1A 4RZ5A 3W7KA 2P10A 4TX9A 1M6JA 2TRSA 4L4LA 1XL9A 3S0CA 1GYNA 1OK6A 1TSIA 5KITA 4PODA 3MHGA 5FESA 4YCOA 1ZENA 4WY0A 3T78A 1ICQA 1FBAA 3ANYA 3EWUA 4DBDA 3G18A 3GXNA 4O13A 1GG1A 3E12A 4K6AA 1QCWA 3NPUA 3W76A 4AWUA 1TB3A 4TU1A 4NNAA 3LXCA 2R91A 3P7YA 4FHAA 2Q8ZA 2A7PA 4WQ6A 3GR7A 3WK1A 4FX8A 1VLIA 4PC8A 4MOZA 1D3HA 3UYCA 4JX5A 2QAFA 2DZVA 1JRCA 3G8RA 4UMBA 1JCMP 2GVGA 4B5NA 2V2CA 1NSJA 4OGZA 4UXDA 3UPBA 3MBFA 3P62A 3NG3A 3L5MA 3HIJA 3MP4A 3QEZA 3DKJA 1P0NA 2QUTA 4UCGA 3HPSA 3S1UA 3P82A 3NM1A 3A5VA 2QF7A 4I7VA 2Y7GA 2CLIA 3W2UA 4BI5A 2QCHA 5A8GA 3PUEA 3PBUA 1H7OA 4AF0A 1DQWA 2V2DA 1SU5A 4LUIA 1HUVA 1VHNA 2ZZ1A 5HR6A 5DY3A 4M6PA 1FWTA 3E9AA 3T7VA 1F73A 1LBLA 1TV8A 1HFBA 1GOXA 3NPVA 3CT7A 1OFBA 3PM6A 3B8DA 4LS2A 3W07A 3WJXA 3TW6A 1YTEA 3DHFA 4HKPA 3NM3A 1GVFA 4UTUA 4DF1A 2YZRA 1SZFA 1CW2A 3OHIA 1H63A 4JN6A 5AYYA 3WK0A 3NL2A 2C15A 2JKAA 4MY9A 2W6RA 1H7PA 4IPJA 1H62A 5C55A 2A0NA 1FXQA 2Y6ZA 3M5ZA 1TPC1 1VYRA 4RXFA 4BWLA 2FB3A 3E96A 1QPQA 5G4WA 3HG5A 1YPFA 5D05A 3HF3A 3STFA 3BLIA 3USBA 3LXBA 3S5NA 1QO2A 2I9EA 4AB4A 3BG3A 4IMEA 3V1PA 1S5TA 2CW6A 3M9YA 3PVFA 1X6UA 1MZHA 1GPWA 1TPVA 4FNSA 3LB0A 3NQ7A 2HS6A 4R7JA 8TIMA 2WNNA 3W88A 1M7PA 4UFKA 1G4SA 3UWZA 5I3FA 4M7SA 3KRZA 3L0KA 2WKJA 5CG7A 4TIMA 3S1XA 1TTQA 4Z08A 3DFQA 3QC3A 1O4UA 1IXOA 3BW2A 1EUAA 3W2MA 1F6PA 2JKEA 4YMZA 5C54A 1XBVA 4NXSA 1W37A 5D03A 1ADOA 5T26A 1K3UA 4QM1A 2ZTJA 4O1DA 3LHZA 3R2GA 4ORIA 4E38A 3O05A 4UFIA 1FWRA 1SW7A 3QPZA 4BFAA 4A22A 2PRLA 3KHJA 3NQFA 5HWNA 1XC4A 4JICA 3S1VA 2B0MA 1SZNA 3OVQA 3CWNA 1Y0EA 2Y70A 4IGHA 1GVRA 1NF0A 4LS1A 1QPRA 3L65A 3HG2A 5G5IA 1YPIA 1F76A 2A85A 1OFEA 3FYOA 3HG4A 1VCFA 4IMCA 3SSJA 3TKFA 4DO5A 5FF4A 3HGOA 3LERA 3OVRA 2QCCA 5LZLA 2P1FA 1SSGA 1LLWA 3PULA 3GAYA 4R34A 5D2XA 3W7GA 3GX9A 4HIBA 5CSRA 4ONVA 4ZQRA 1LBFA 4CQ9A 3NVTA 5KMYA 3LCGA 2ZZ2A 3KX6A 4MYXA 1PHQA 3RLVA 1B9BA 1K7FA 4JX4A 3G1SA 3CU2A 1ME8A 3W7QA 1WOBA 2B7QA 2VEKA 2VFDA 3PS7A 3HGRA 1ZAJA 2ABBA 1JQXA 2E68A 4C1KA 3I7SA 3O6CA 2C18A 2Z6IA 5CZJA 1TYGA 3IGXA 1JUKA 1C8VA 3EXRA 1OABA 3W7IA 5DY2A 5HWMA 2H90A 1B3OA 2AGKA 2E5CA 1Q6RA 1TO3A 3KVMA 2H6RA 3LTYA 3GDKA 2YW3A 3C8FA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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