1QWG | Genus

Total Genus 94

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	94
sequence length	251
structure length	251
Chain Sequence	MKAFEFLYEDFQRGLTVVLDKGLPPKFVEDYLKVCGDYIDFVKFGWGTSAVIDRDVVKEKINYYKDWGIKVYPGGTLFEYAYSKGKFDEFLNECEKLGFEAVEISDGSSDISLEERNNAIKRAKDNGFMVLTEVGKKMPDKDKQLTIDDRIKLINFDLDAGADYVIIEGRESGKGKGLFDKEGKVKENELDVLAKNVDINKVIFEAPQKSQQVAFILKFGSSVNLANIAFDEVISLETLRRGLRGDTFGKV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	The structural determination of phosphosulfolactate synthase from Methanococcus jannaschii at 1.7-A resolution: an enolase that is not an enolase pubmed doi rcsb
molecule keywords	(2R)-phospho-3-sulfolactate synthase
molecule tags	Lyase
source organism	Methanocaldococcus jannaschii
total genus	94
structure length	251
sequence length	251
ec nomenclature	ec 4.4.1.19: Phosphosulfolactate synthase.
pdb deposition date	2003-09-02

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF02679	ComA	(2R)-phospho-3-sulfolactate synthase (ComA)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1qwgA00

1TPUA 3C56A 1R2SA 4IMEA 3L68A 1ZY9A 4K7YA 4UCGA 4TX9A 3WK1A 3BGJA 2I1OA 3CPRA 3MHGA 3P8IA 3M41A 3B4UA 4JN6A 3W22A 2NX9A 3UWVA 1IXQA 3TQVA 1AL7A 5CPOA 4PTNA 4DF0A 4NVTA 2DZPA 3HGOA 2H3DA 3O8AA 1N55A 2QUUA 3A9IA 3LGEA 2E5DA 4AWSA 4RX0A 2A6LA 4GE8A 3TQ0A 4AF0B 1T99A 2P10A 4IMGA 3EWXA 2I9EA 5F1UA 3IVUA 3W2KA 2CW6A 2Y88A 5U4NA 3LLDA 1EWEA 4JDBA 2NX3A 4MZ1A 4K37A 1XDMA 1H7PA 1TPC1 3W87A 4L4LA 1QCWA 1W0MA 2CZ5A 4PC8A 3LB0A 3A22A 4JTTA 4YCPA 1OYCA 4A29A 1HO1A 4MFDA 3P84A 4Y9AA 5AHIA 3FKKA 1FWNA 3W7DA 5FEZA 3LM7A 1PCWA 1DJQA 2NUWA 1MEWA 1EIXA 3B0UX 4RXGA 4FNUA 2NUYA 1I2RA 4LWWA 4UTKA 2CZDA 3GKFA 3S8HA 2B7PA 3B06A 5J5DA 4Z08A 5FF0A 2ZRVA 3IRDA 3BW4A 2J27A 1OF6A 3L65A 3S0CA 3AJXA 3W88A 2GPTA 3NL2A 3K30A 4UTLA 4Z1CA 2ZYFA 1KV8A 2E5BA 4Q32A 3SFKA 3S5OA 2VEMA 3I65A 2CLKA 4AEOA 5L9FA 1TSIA 4UTWA 4YMZA 1YADA 3BK0A 3ABQA 1GG1A 3S1VA 3IIVA 1XBZA 4DXVA 5HR7A 1YLVA 5FF7A 1LDCA 3WK3A 3LHVA 1YDVA 1YPFA 4HT3A 4R34A 3JS3A 5HWMA 3N73A 3AO0A 2AGKA 1EPXA 1GVSA 1TMHA 3VCRA 5LZLA 1ICQA 3T44A 1DQXA 2ZZ3A 1AG1O 4XTDA 2V0TA 1QPOA 1KBJA 1EP2A 2WQPA 4MFEA 2V5LA 4M6VA 3IIXA 3DI0A 1PHWA 2V5BA 3NQEA 2LLEA 1KM4A 3TX9A 3C3NA 1BTMA 4JR5A 4QJ1A 2WPBA 2YGYA 3NPXA 2FPVA 3TW6A 3P62A 3EXSA 2VFHA 4NJGA 5BRBA 3E96A 5K9XA 4WXZA 4FO4A 4ADTA 3JR2A 2EKCA 3HGRA 5C2XA 3HG4A 2C18A 3C2RA 3G24A 3MYPA 2CLFA 1RR2A 1SZEA 2A4AA 3BG5A 4WUIA 3QMRA 4CQ8A 2HTMA 4JXCA 4DBEA 3ABSA 3GKAA 1QPQA 2BLEA 4IPIA 3S1WA 2OZ0A 2HS8A 3MBFA 3NZRA 1WOAA 3GYEA 5CZTA 1QOPA 3ZS4A 3NQMA 3B03A 5AYZA 2Q3OA 2WSQA 1KM2A 3TV8A 2C0AA 1H1YA 2X1RA 4UR7A 2QJGA 2A7RA 3NQAA 2CFFA 2ZA3A 3LXAA 4OU1A 1XXXA 4GUJA 3PG9A 5EMUA 4QNWA 4DF1A 4WQ6A 2E77A 3OHIA 4HNVA 2ZZ7A 1SW7A 3GNDA 1SO3A 2B7NA 4QISA 1AW2A 1CW2A 5FI8A 4BI6A 4BK9A 1W5OA 1WXJA 1VLWA 4O12A 4JTHA 2NV1A 3MI2A 2Z1BA 3S5ZA 3THQA 5IBXA 1WBJA 4UMCA 4BWLA 1TPH1 4GRSA 4LRSA 2WOQA 5D2TA 3WJZA 5LGZA 1TTQA 2PC4A 2Y89A 4AHPA 4NZFA 3LCXA 5FEWA 3VE9A 1W5MA 3MO7A 1EA0A 4IMDA 5BOOA 5FF3A 4LVDA 3HG3A 5HJLA 3W2NA 3G8RA 4MOZA 3LHZA 1H5YA 3ABOA 3HJZA 4HNUA 2R94A 4IGHA 4PL2A 4R53A 4ORIA 2FFCA 3DAQA 1RQHA 2G97A 2WJZA 2QAFA 5T26A 2NLIA 1GWJA 3L2IA 1ZENA 3KAOA 1EEPA 4OE7A 4XBSA 4FX7A 5D2VA 1TRIA 1JCXA 3GK0A 3B0PA 3NQCA 1SW0A 3F4WA 4RKAA 3HMJG 3FIGA 1OHLA 3GB6A 3O63A 1L9WA 1OYBA 2OT1A 1YDOA 1VPXA 4DO5A 2GQ9A 4GWEA 5LSMA 2A6NA 1FBAA 2V8ZA 1S5TA 4XWUA 4O50A 5DELA 1OFPA 3G8EA 3PBWA 1SQ7A 2PRHA 1SPQA 2A7NA 4I7VA 3NPVA 5TQLA 5D32A 2OJPA 4QIUA 3G0SA 3GAKA 3GR8A 2BWGA 2J6XA 5E0KA 3S5NA 1W3IA 4Q4KA 1OFAA 4LS1A 4J9JA 3QSRA 4O54A 3CEPA 4LTSA 2E1DA 5G2IA 3DFNA 3M6YA 5HULA 2CLIA 3MHUA 2HMCA 3C2FA 2BTMA 3STFA 3TMLA 1J4EA 4NJHA 3N34A 3W1LA 3QW4B 4TMCA 3TJLA 3W23A 1KTBA 1LM1A 1F76A 1L6YA 4NJKA 4O18A 4A2SA 5D30A 1VCVA 2VKZG 1WYIA 1V5XA 3ANYA 2HS6A 3QRHA 2VOMA 3TFXA 2CLLA 3GDMA 1BEUA 3GNNA 4K8EA 1QO5A 3TNOA 3NL5A 1ONRA 2FLIA 4I9AA 3HPXA 4JTEA 3G0UA 3P5YA 4UTTC 1TTJA 5HUOA 3KFTA 4MJMA 4XTIA 4CLMA 3EX4A 3W7JA 3ZWTA 2QKFA 1H61A 1YYAA 3KOFA 3ZFHA 4P61A 4ADSA 3W7EA 3IEBA 4FXRA 3KXQA 4OV4A 3L5AA 4IJBA 5TBOA 2YDAA 3RLUA 4WOZA 2ZQ0A 1H60A 5ABTA 3S9YA 3QMSA 3W1XA 4FX8A 1J2WA 1PE1A 2WSYA 2CLMA 2E6FA 4Z1AA 2YSWA 3C52A 2O7SA 4DF2A 2ZBTA 3MJYA 1W56A 1I2NA 3ZR4A 3EX1A 1SSDA 3DENA 4GNJA 3M47A 3I68A 1XI3A 1JR1A 3S5YA 4ML9A 3BPWA 3IGUA 4NXKA 3NOEA 1O4UA 4O13A 1TQXA 3MMTA 1F6KA 2J9YA 4MUZA 4NNAA 1SO5A 4DQWA 2EAWA 5KMYA 1W1ZA 3W3OA 5C5YA 1QWGA 5H2ZA 1TV8A 2Y70A 1R47A 1QR7A 4O1CA 3MYOA 3C6CA 2ZA2A 1SUXA 2WNZA 3A23A 3IVSA 4FNSA 1JUEA 1TJRA 3NVTA 1G7VA 3B04A 2AAMA 3NM3A 4CQAA 3TK7A 4LC6A 3I7SA 1QNVA 3P81A 2X16A 4ZVJA 3PBVA 2QCDA 4O17A 4UTMA 2E6YA 3BG3A 2ALDA 2GVLA 1VS1A 3TUUA 5F2IA 3WFAA 3NGJA 4UXDA 3CEUA 3RMJA 4JS3A 5G1TA 2Q3RA 1R30A 3O06A 1LZOA 1GVOA 3MI3A 4JEQA 2H90A 1G4EA 2ZZ1A 4MZYA 4O0KA 3RU6A 2GJLA 2D73A 3W2MA 4IX2A 4AH7A 5LNUA 1T0OA 1DORA 3THAA 1MEHA 4GUFA 1GOXA 3STCA 4ZL1A 1FUYA 3F03K 1UCWA 3LCLA 5CSSA 3W1QA 1X7FA 2QCMA 4ADUA 2ZZ5A 1OFQA 4GFSA 1OFEA 4C1KA 5C6MA 1NFBA 5BMXA 5G4EA 1P0NA 2YW4A 2B7OA 3VNDA 3INPA 3P67A 2WV8A 3QSTA 1IXPA 2EHHA 4N9CA 3IGXA 4Y6GA 1U5JA 1VRDA 3W70A 4AXKA 3W7IA 1TCDA 5MHBA 3T78A 4IXXA 5AB3A 1WA3A 1JCLA 1TPB1 3FJ6A 1FCUA 2H8ZA 2YFOA 3UWUA 5DCDA 3RNDA 1F2JA 4O28A 1I8JA 3DBPA 1B57A 3C8FA 3GDRA 2JGQA 4K39A 1WV2A 3CQ0A 4MYAA 1DL3A 3TXVA 2QF7A 3RFAA 3TC7A 2A0NA 3GXTA 2DZTA 1P0KA 4S1FA 2NWRA 5FF2A 3GLCA 1AW1A 1N7KA 3L67A 3SR7A 3I7RA 3M5VA 1JRBA 1XBVA 2DJXA 1HFBA 4MZ8A 3I6RA 5AN7A 3FOKA 1HUVA 5CKSA 1OK6A 4ONVA 1S5VA 5BMWA 2X1SA 8TIMA 4JYDA 3HG2A 3HB9A 1KA9F 1C9DA 5A8GA 1EWDA 5EBUA 1QMLA 1SZNA 1SSGA 2EGZA 4BI5A 1JCJA 2QAPA 2NZLA 4OHQA 1WBHA 3KVJA 2GVGA 1JULA 1IIGA 4K7VA 1PIIA 2Y63A 1KM0A 3EX2A 3L5MA 4NX5A 5LKYA 3E02A 3LTYA 5L6UA 3DFSA 1K7EA 4N4QA 1SO4A 4YLWA 3R12A 4JYEA 4CQ9A 3M5ZA 2W79A 1F73A 4WY0A 3CIXA 2E6DA 4KWVA 3LCFA 4A21A 1GTEA 4LV9A 4N9DA 1W37A 3ELFA 4M19A 1ZNNA 1W54A 4FNRA 2Y7DA 4UNLA 1KFLA 1EP3A 4K38A 5FESA 3NQFA 3A24A 3RF9A 1Q6QA 3BLFA 5K9DA 3R8RA 1O94A 4DO6A 1ML1A 4IMCA 4UTTA 3SGZA 1QPRA 5CPMA 1MXSA 2QUTA 1OFDA 3NDOA 3G1FA 3CM4A 1H63A 5EL1A 3IGSA 3LCGA 4NZJA 2G95A 3W1AA 1X1ZA 4MY9A 2QCEA 1M7OA 1B3OA 1UASA 5DXXA 2WNNA 4RXFA 2RDWA 2CLHA 4Z0SA 1FCBA 3W7OA 4LW7A 4O15A 3QZEA 4IX0A 1H7NA 3UY7A 3CWOX 4EIVA 4FX6M 1YXCA 4FB7A 1IIHA 3NQGA 3G0XA 2G96A 3P8JA 3MP4A 3U6WA 3I7QA 3DFPA 3TJXA 5DBTA 1MO0A 1VHCA 2H3BA 3W7PA 4E2DA 1A5AA 2Z0IA 1A5SA 1AK5A 1SZFA 3LV6A 3O16A 3R2GA 5D09A 1Z41A 4S2CA 2DZUA 4JGDA 1WOBA 3TH6A 3MI6A 1FQ0A 1XDLA 4OGZA 4JTUA 3GXPA 2V2CA 1NAL1 1TV7A 2Y61A 3O07A 3QF0A 4FF7A 4I7UA 3S1XA 4I7WA 2X1UA 1DVJA 1K8ZA 2TPSA 3D0CA 3TA6A 1DKWA 3UY8A 3NR0A 1B4KA 3NG3A 4GBUA 1QO2A 2ZDRA 4NQ1A 5K4ZA 2DORA 3W2JA 3M0ZA 1FCVA 3L9CA 1H7OA 1I2QA 3GR7A 1TPFA 2FJKA 3OVPA 4FIRA 1VYSX 3CLMA 1ADOA 5DCEA 5D04C 4JTIA 3LTPA 3LBCA 3W9ZA 1OK4A 4QAIA 3PAJA 2Q8ZA 1GJPA 4DPPA 4WXYA 1G69A 3E49A 2ISVA 3TXZA 1ZHAA 3H53A 4H3DA 1JJKA 3FYOA 1TB3A 4R7JA 2VEKA 1B9BA 2QUVA 3NL6A 3FS2A 4NJJA 3ATYA 3YPIA 3C61A 1FDZA 1GEQA 3EX6A 3HPSA 6ALDA 1I2PA 3EEGA 3W84A 3TFCA 5K4XA 1FXPA 1GYNA 2FPYA 5IM51 2Z6JA 4EOUA 1UB3A 3HPZA 5LNRA 1H62A 3NA8A 3G1SA 3SZ8A 3S42A 1GVRA 1IXOA 3GX9A 4ZQPA 5G1YA 1KW1A 3KRZA 4IXHA 1F7BA 5F2GA 2TYSA 3A5VA 2QDGA 1WQ5A 2VXNA 3PSWA 2ZA1A 3PR2A 1FY6A 1XM3A 3NQ8A 3CU2A 2C19A 3ZWSA 3G1HA 2FQIA 3CC1A 4FNQA 1OJXA 3TE9A 2UV8G 4UFHA 4UMAA 3QW3A 3KHJA 1Q6OA 2TSYA 4JICA 4NUWA 4WZHA 4LUJA 4RJEA 3PS7A 2GQAA 1NSJA 1YTEA 4UFJA 1L6WA 5EKYA 5BNKA 2A7PA 3EWBX 1YPIA 4HNNA 1LBFA 3UYCA 3QJAA 1VGAA 3GXNA 1RQEA 2A5HA 1EX5A 5AC7A 3H55A 2ZZ2A 5K7JA 4TMBA 2R8WA 3FJLA 3TSBA 2QR6A 4UC5A 3O6DA 4K6AA 2G5WA 3PG8A 2WO5A 3SY5A 2RH9A 4M5PA 3L0GA 3R89A 1LLWA 4LY8A 1KBIA 4JX4A 2NXIA 4XKYA 3U2OA 1J5TA 2BX7A 4IUOA 1NF0A 1EUAA 2P1FA 2V2DA 3M1ZA 3GDLA 5G2HA 4JTKA 3W73A 4DELA 3P60A 4PODA 3G3DA 3L5LA 3GAYA 3LX9A 2ISWA 2V82A 3CT7A 5AC8A 3T40A 4MIMA 3LI1A 3BO9A 4M6PA 3O05A 3L0KA 1Q6LA 1D9EA 4TIMA 3BLEA 2NUXA 2XN1A 2ATSA 4QM1A 2ZRZA 4HNTA 3C0JA 3PSVA 2RDTA 2V30A 3VFLA 1RV8A 3NQ7A 4HPJA 2XN2A 3NAVA 4WJEA 1BWLA 1E51A 1OYAA 5F2MA 2Y6ZA 4E38A 1W3NA 1YXYA 3EKLA 3LXBA 4MYXA 1XKYA 3C4UA 4Z0JA 5K9CA 3QYQA 4FNPA 4O8RA 3PUOA 2B4GA 1I2OA 2VFEA 1MSSA 3M44A 4AVFA 1O60A 2O7QA 2QCHA 3GDKA 1K02A 1YTKA 5BW6A 2BZNA 3SJ3A 3W85A 2I14A 2DP3A 3KRUA 2FB3A 2H8XA 1LOLA 1W8SA 3LRLA 4R33A 2DU2A 2FIQA 3M9YA 3TAKA 1O5KA 1GG0A 4NU7A 2RDUA 2X2GA 3HBLA 3NYZA 3KVMA 2ZRUA 4JTLA 4BF9A 2ZTJA 1SR9A 3MP3A 4X2RA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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