1R2SA

Crystal structure of rabbit muscle triosephosphate isomerase
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
PSRKFFVGGNWKMNGRKKNLGELITTLNAAKVPADTEVVCAPPTAYIDFARQKLDPKIAVAAQNCYKVTNGAFTGEISPGMIKDCGATWVVLGHSERRHVFGESDELIGQKVAHALSEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVVFEQTKVIADNVKDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLRGWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Closed conformation of the active site loop of rabbit muscle triosephosphate isomerase in the absence of substrate: evidence of conformational heterogeneity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase
molecule tags Isomerase
total genus 89
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.2.3.3: Methylglyoxal synthase.
pdb deposition date 2003-09-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1r2sA00
3TMQA 1VRDA 1XDMA 1LLWA 3G3DA 1JVNA 1YDOA 3HO8A 1T99A 3KVKA 5DBUA 3GIYA 2JKAA 5DXYA 1H1ZA 4MYXA 3W70A 1Q6QA 2E6FA 4IUOA 4MFDA 2X1RA 3RFAA 1JR1A 4BI6A 1SFJA 3WK3A 2V9DA 4QNEA 4ZL1A 3NAVA 4E0CA 3EXSA 1H7NA 4GUFA 3TCEA 5LNSA 4JTEA 4WX2A 4LWWA 2ZZ1A 3RF9A 1YTKA 1JRBA 3DI0A 3SFKA 3JR2A 1KM5A 3MP3A 4LU0A 5IM51 2OZ0A 1S5TA 2ZZ6A 5FF3A 1VGAA 3PG8A 4GFSA 3M5ZA 4LRSA 4BF9A 4RJEA 3DZ1A 3MHFA 4M6QA 3PBUA 3C2FA 3R12A 3W7RA 1W5PA 5F2GA 3L0KA 1F73A 4MYAA 4UMBA 3NQDA 2VXNA 4HNNA 3BLFA 3DI1A 3L5LA 3THQA 4IX2A 3W74A 1ZCOA 4I7WA 1DHPA 4NVTA 3ATYA 4JNMA 3C6CA 4JY9A 4RZ5A 3MI6A 1TQJA 2CWNA 1XBYA 1H5YA 3C56A 2Y62A 4UC5A 5K4ZA 1GEQA 2O7SA 4GC4A 2QUUA 3TV8A 4UTKA 3BW2A 1H61A 4M7TA 1IXPA 4JX6A 3K30A 5DELA 3DFSA 3S1VA 2Y63A 4XBSA 1JCLA 1OYBA 1Q6OA 1RR2A 3L5MA 2Y7DA 3S9YA 3NQVA 1GVRA 3VE7A 5F1VA 1OVDA 1EIXA 3P8JA 3H53A 4FX7A 4H4IA 5KINA 4ZQPA 3W88A 3RU6A 4C1LA 1G4SA 2NUYA 3STGA 4UXDA 1LBLA 2C0AA 1T8XA 3NEVA 4O4WA 1XM3A 1OX5A 2XN1A 5I3KA 3G22A 4A2RA 3P81A 3IRDA 1GZGA 4N6FA 5LKYA 5I3IA 4S2BA 5BMWA 1DJNA 2ZZ5A 3R2GA 3M5VA 2XN2A 4RX0A 1N8FA 4XKYA 3S0CA 4A2SA 5U4NA 2FDSA 3B0PA 4UMCA 3P82A 4O1DA 1WBJA 3RNDA 4C1KA 5C5YA 3HGOA 4ZMGA 3NM3A 1F05A 3BARA 3OG3A 1VR6A 1W3NA 1LRNA 3W7PA 1EUNA 3DGRA 3D0CA 2ZQ0A 1SSGA 3QMRA 4HNTA 4UMAA 5L9FA 1F76A 1NVMA 4UNLA 5E93A 3W1PA 3I7SA 4Z1CA 3KXQA 2E5DA 1RV8A 5E1QA 4N6EA 1DL3A 3P7YA 3SI9A 1ZHAA 3PB0A 3QJAA 1EUAA 3F4NA 3SY5A 4O4VA 3P5YA 4AWTA 3MP4A 4OWGA 2PRHA 5AYZA 3DENA 1L6SA 4UFLA 1IIGA 2JKPA 3W2JA 1G4PA 3NA8A 3NL5A 3RMJA 5C6MA 3N2XA 1THFD 4XWUA 4HSOA 1N55A 4E38A 2H3BA 1G4EA 3DBPA 4DPQA 2Z2UA 2QCDA 4HPXA 2A1YA 3MUXA 1TPVA 2ZDRA 2WNZA 3O8AA 1K8YA 1KBJA 3QQ1A 2ZA1A 2ZZ3A 3FKRA 1YTDA 1GT8A 2PURA 4AF0A 1KM0A 1UBSA 1FWTA 1NSJA 1TPEA 2GJLA 4JIQA 3B4UA 1OYCA 3GXNA 5E0KA 2NXHA 4A29A 3U6WA 2AQWA 1M7OA 3QPYA 4ORIA 1HUVA 1TYGA 2CZEA 5K3VA 2YPIA 1O5KA 2TYSA 4WUIA 1FCUA 3L66A 1ZFJA 2QCCA 2WSYA 2X1TA 3I7RA 4X9SA 3SIZA 2QJIA 2EKCA 4MPQA 4IQLA 3IVUA 4NZJA 3SW6A 2WJZA 3Q58A 4JS3A 2CZDA 4CQ9A 2JGQA 1OFRA 3C2VA 5IBXA 2X30A 3TSBA 3CHVA 4LVDA 1BTMA 1KM1A 1T96A 1LRTA 2YYTA 4GUGA 3KRZA 2WSQA 1KM2A 3IVTA 3B0VC 1ZJIA 2E6AA 5CSRA 3A9IA 3M5YA 1I2PA 1OJXA 5K4XA 3OBKA 4NT0A 3HB9A 4NNCA 1QDSA 2VFGA 3FYPA 1KM4A 1SQ7A 3HOJA 3FKKA 2QCEA 2VFDA 1B57A 1M5WA 3TW6A 4AHPA 4UFHA 4BWLC 4GXMA 1YTEA 3T4CA 3MHUA 2C16A 3BVJA 2Y61A 4O14A 4OE7A 1MSSA 2CLLA 4K37A 4UNKA 4H6KA 3DXIA 1F6KA 4DXVA 1TQXA 4W9TA 1TTJA 1Z41A 1R46A 4HSNA 2B7NA 3GZ3A 1H7WA 3BGGA 1VQTA 2G95A 4XTDA 4AVFA 1K02A 1KFCA 3HG4A 1PV8A 4RXGA 2CLHA 4QNWA 5F2MA 1ME9A 2ATMA 3GXPA 4UTIA 3TC7A 5DLCA 1V5XA 2CLKA 1H60A 4O13A 1KW1A 1JCNA 3N9RA 4NZFA 2YX0A 1YXYA 1CI1A 4RK8A 1TO3A 1K3UA 3G1YA 4LY8A 1KTBA 1FXPA 3VI2A 1WYIA 4MJMA 2GVGA 2Q3OA 1FWNA 3KVLA 1A5AA 3IVSA 5FEPA 4CCCA 1ZNNA 2G97A 5D2TA 1A5CA 3JRKA 1I2QA 5J5RA 5CGQA 3NQFA 1TREA 2QCFA 3TKFA 2X16A 4EWND 4JICA 1OABA 3Q37A 1EWDA 5FESA 5AN7A 5AHEA 1MEWA 4OHQA 5LHEA 4O8RA 2AAMA 2J9XA 1AL7A 1SZFA 2A21A 2G5WA 1PHQA 1JCYA 2V2CA 2ZZ2A 5DCEA 4Z1BA 4X3ZA 2VFHA 3IIZA 1TV8A 4K6AA 2ZCGA 3C8FA 2C13A 2ZRXA 3LHZA 4A3UA 4MUZA 3O1NA 1TTIA 1I2NA 1WQ5A 1XBVA 3NDOA 1AW5A 3GNDA 2QDGA 3ELFA 2WOQA 5G2WA 2VC6A 1TIMA 2RDTA 1EEPA 1XC4A 3PUOA 3HF3A 3LX9A 5AFDA 3S8HA 3IIXA 4UTTC 3HBLA 4AAJA 2QR6A 4PL2A 4MKNA 2RKXA 2I9EA 3KAOA 1FDZA 4GRSA 1JCJA 3TX9A 1RPXA 1TTQA 2QCNA 3NQ7A 5J5DA 3MI3A 1XBZA 4M5PA 3LHUA 2YGYA 4IGHA 5HR6A 3NQAA 1S5VA 4PH6A 4JY8A 3W1MA 4UCGA 3CWOX 2NUWA 3NNTA 2W6RA 1XUUA 5D33A 4NUWA 3TQKA 3O06A 1Z42A 4CNOA 1Q3NA 3WJXA 1YADA 4QSHA 2B4GA 1EP3A 1I8JA 2BLEA 4GBUA 4LS2A 3E96A 2J88A 3NQEA 1GYLA 2Y85A 4NJHA 3TSMA 1VC4A 2QAPA 4LUIA 2HSAA 2A7RA 4UTMA 3M0ZA 1KTNA 4H3DA 1X1OA 3W22A 1FWRA 3OVRA 4FIQA 4UIOA 2X2GA 3KOFA 4O12A 1QWGA 3NQCA 1HO1A 3MW7A 3O15A 3T7VA 1K8XA 2DORA 1D9EA 4YCOA 3I7QA 4FXSA 1TPWA 4FNUA 4KKXA 1QOPA 3YPIA 2GJNA 3LV6A 4HN4A 1YXCA 5K9CA 1OF8A 1X8FA 2NV2A 3L2IA 3M41A 5F4SA 4WXZA 2GQ8A 2YYUA 2YZRA 1NFBA 4LVGA 1W56A 2DP3A 3UZJA 3TR2A 3RLUA 1CX9A 1W1ZA 2WV8A 1J5TA 1W54A 1ZY9A 3IGXA 3ZR4A 2V8ZA 4WOZA 1BWLA 2E77A 2QDHA 3MWAA 4E2DA 4IXHA 2J6XA 2A6LA 4OGZA 3VFLA 2Y88A 5A5WA 2QCLA 2YSWA 1J4EA 4JYDA 4DF0A 3WJSA 7TIMA 1HTIA 3UPBA 3G1VA 5BRBA 3QSTA 4CCEA 2YFOA 3R5EA 5KZEA 3IIOA 2C3ZA 4AHQA 2BZNA 1C9DA 3W1TA 3W71A 2C14A 3HPZA 4NNAA 3RLVA 1SR9A 5CZ0A 2R14A 1D3HA 3Q2DA 4LVBA 3PBVA 2FTPA 5D30A 5HJLA 3WK1A 1P0KA 1R2SA 2ABBA 4JYFA 3OA3A 4FX8A 4UFKA 3W76A 2Y7FA 3CM4A 4HT3A 3FS2A 3GDKA 1TPB1 2ZRUA 4ZQMA 2XFWA 2ZFAA 4IMGA 1QO2A 4WOQA 1G67A 4LT9A 4WY0A 3QF0A 3W7GA 2XN0A 3DFOA 3GNNA 4O1AA 3STCA 4HPJA 4BI7A 3UY7A 4GUIA 1OFQA 3CB8A 3MI2A 3V1PA 4K36A 2E5BA 3EX3A 1QPRA 3P67A 1O95A 2WKJA 2YR1A 2ISSA 2NXGA 3EKLA 3TC6A 4ORMA 2A7PA 3C2EA 4GE8A 3QMTA 1P4CA 3UWWA 5LSMA 3LXBA 1UB3A 3IIPA 5D04C 2J9ZA 3TSDA 3VE9A 1LOSA 4IMCA 4AEOA 1IF2A 3CEPA 1TMHA 4TIMA 3CWNA 4Y90A 3GDMA 1M7PA 5HINA 4FO4A 3G8EA 3PY2A 1RQHA 1PCWA 2NWRA 2QJGA 1R47A 1RQBA 3KHJA 3PC0A 5CG7A 2R91A 1YYAA 3GX9A 3LGEA 5BNKA 3M47A 3G3MA 4WY0F 1UJPA 4Y96A 1FX6A 3EX6A 5CPOA 2ZRYA 1VYRA 3GXTA 4PC8A 2RHGA 3BG3A 2VEPA 4BI5A 1LORA 1W5QA 3G18A 4LNYA 4CNPA 4LC8A 3FFSA 3S5ZA 2PCQA 3O07A 5LHFA 4MFEA 3TA6A 4LV9A 1CW2A 3GAYA 2E68A 4WJEA 1JQXA 4OV4A 4JN6A 2E1DA 3EEGA 2Q8LA 3LXCA 2TSYA 1K7XA 3TW7A 2VEMA 2RDWA 3LB0A 4RV8A 1L2UA 3QQ0A 4CCDA 4ZQRA 4TMCA 3NGJA 4FNSA 1B4KA 4GUJA 3OIXA 4XZ9A 5G2HA 5FF7A 3L68A 1VS1A 4NQ1A 2Z1BA 3W7EA 4UFIA 4IMFA 3FJLA 3B06A 3LLFA 3PUEA 4R7JA 1GQNA 3ZS4A 2R94A 3QW4B 3TQVA 5IBXC 2YXGA 4AWSA 2GVLA 3N73A 1PL9A 4XUGA 4JTGA 2Z6JA 1AG1O 5HUOA 3E49A 4O11A 4M6PA 1F2JA 1KTCA 2QF7A 4P61A 1VCGA 3E9AA 1OK4A 4M7SA 3ZFHA 4WXYA 5BMXA 5HQEA 2YFNA 1LCOA 3CLMA 4UR7A 3GK0A 3P62A 5KTLA 3PG9A 1HL2A 4JIPA 3DAQA 2GQ9A 3G1XA 3S5OA 2QAFA 1O5XA 3EWXA 3HQ1A 3O16A 4JR5A 4IPJA 4AMAA 4M6VA 1MXSA 2QEZA 1KFEA 3N2MA 3F1QA 1PS9A 1HO4A 4OT7A 3WJYA 2D73A 3ABSA 2H8XA 2DZPA 3L65A 1ZALA 1EWEA 5G4WA 4MZ1A 1GVOA 2JKEA 3O6DA 6ALDA 1KFLA 1T0OA 3TJXA 4JYEA 3GLCA 3INPA 4QIUA 5AHFA 4ZVJA 3M1ZA 3NQ8A 1SU5A 4YMZA 5EBUA 1GJPA 4LS0A 3PS7A 3DFTA 1ZENA 1ZAHA 4EIVA 1WAUA 5AOUA 3QH2A 2HTMA 1F7BA 5D37A 1TB3A 5BW6A 1GVQA 4O19A 5TBOA 5C2XA 1TPUA 1LDCA 1OX6A 1WOBA 2O7QA 5CPLA 4MZ8A 5HULA 3HPXA 4GNJA 4M19A 3PF3A 3EXRA 3R89A 5LNVA 4CLMA 5T26A 4AWUA 1JCMP 4UTLA 1LP6A 4N9BA 4GJ1A 5EL1A 2F7FA 4PTNA 1OFDA 5LNRA 2NX1A 4MY8A 3LCIA 3ZWTA 2ZRWA 4O10A 3QPZA 4QITA 2YCEA 1SZEA 1E51A 3ABQA 5FF0A 4A22A 5CSSA 3KRUA 4LW7A 5FEZA 3CTLA 4U4MA 3SGZA 4MVAA 4O1CA 4OV9A 1KM6A 3W1RA 1R30A 1K7FA 2P10A 3LRLA 4JTFA 5F2LA 3W1UA 2GPTA 2W0UA 1OF6A 4DF2A 1TTPA 3IGSA 1KV5A 4NJJA 1LTDA 5I3GA 1TPDA 4O28A 2QCGA 4JDBA 1VZWA 3S1WA 1TPFA 3EXTA 3UYCA 4XQ6A 1JQVA 3BPWA 3ANYA 3NG3A 1R2RA 3BV4A 4JTTA 1X6UA 4NX0A 3C3NA 5LGZA 4XKYB 3P80A 3IV3A 2CU0A 4PA8A 4LS1A 1GWJA 4N9DA 4CQAA 1K7EA 4P2VA 1Z44A 2EF9A 3BK0A 4ZQNA 3MP5A 2VEKA 5AYXA 2Y70A 2YW4A 5KITA 1XXXA 1H62A 2AGKA 3G1AA 1JULA 2OCZA 3WJZA 4YCPA 1QR7A 4Z0JA 3UWVA 4FHAA 4HNVA 3DHFA 3WK2A 2Y7EA 1OX4B 2V5BA 4Z1DA 1ONRA 1WDWA 3W2UA 2BX7A 2BTMA 3M7WA 3LTPA 3BG5A 2WQPA 5G5IA 3A5VA 1MEHA 5H91A 5MHBA 5G1YA 3HGSA 5D2WA 2ZA3A 4YWIA 5D2VA 4AH7A 2ABAA 4K39A 1WXJA 4O15A 4ICNA 1TJRA 1RVGA 1F5ZA 4PCFA 1L6YA 4LC6A 4UFMA 3LCHA 2NLIA 1LOQA 3WFAA 5AHMA 3L0NA 4QJ1A 3TDFA 3CQ0A 3LRKA 4A21A 4YXGA 4AF0B 2CZ5A 1ZAIA 3O6CA 1VHCA 5AYYA 4FNTA 1ML1A 4K8HA 4DBEA 1H50A 4MY9A 3EX1A 5A8GA 3DFNA 3ZWSA 2FB2A 3QC3A 2B7QA 2R8WA 5AC6A 3HPSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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