1R86A

Crystal structure of the extracellular xylanase from geobacillus stearothermophilus t-6 (xt6, monoclinic form): the e159a/e265a mutant at 1.8a resolution
Total Genus 147
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
147
sequence length
371
structure length
371
Chain Sequence
KPHISALNAPQLDQRYKNEFTIGAAVEPYQLQNEKDVQMLKRHFNSIVAENVMKPISIQPEEGKFNFEQADRIVKFAKANGMDIRFHTLVWHSQVPQWFFLDKEGKPMVNETDPVKREQNKQLLLKRLETHIKTIVERYKDDIKYWDVVNAVVGDDGKLRNSPWYQIAGIDYIKVAFQAARKYGGDNIKLYMNDYNTEVEPKRTALYNLVKQLKEEGVPIDGIGHQSHIQIGWPSEAEIEKTINMFAALGLDNQITALDVSMYGWPPRAYPTYDAIPKQKFLDQAARYDRLFKLYEKLSDKISNVTFWGIADNHTWLDSRADVYYDANGNVVVDPNAPYAKVEKGKGKDAPFVFGPDYKVKPAYWAIIDHK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of the extracellular xylanase from Geobacillus stearothermophilus T-6 (XT6, monoclinic form): The E159A/E265A mutant at 1.8A resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Geobacillus stearothermophilus
molecule keywords Endo-1,4-beta-xylanase
total genus 147
structure length 371
sequence length 371
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2003-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1r86A00
3S2CA 1V0MA 3FN9A 1CWYA 3WH7A 1OCQA 1EH9A 3JUGA 4PMDA 3ZT5A 1JDDA 1M03A 2HISA 4RL3A 3EDJA 3A6OA 1GOIA 2C8NA 1ISVA 1W32A 1JF6A 4IPNB 1QBAA 3U57A 1VB9A 4ACYA 4DUVA 2XJ7A 1K9TA 1EOMA 2OWCA 2ZX7A 3O9NA 3FW6A 3WDQA 1E1FA 1UH3A 1GQLA 1BLIA 3ZO9A 5FD0A 1YQ2A 5IHRA 1G1YA 1PX4A 3SCWA 3IAPA 1UHVA 3VTRA 1E3XA 3MUY1 1NOWA 5BYWA 1QBBA 4AD5A 2FDMA 4CN4A 3PTQA 4AD3A 1W2PA 2X0HA 1W2VA 4R27A 1OM0A 1I75A 3KWXA 4JCMA 3AYSA 5HPCA 1MFUA 4CN6A 3SCOA 2FHFA 1JYVA 1J12A 1BHGA 3WD4A 2GDVA 5C70A 2ZXQA 2WMHA 1C8YA 2VCBA 1VJSA 5I6SA 5HBFA 3WBAA 2CITA 3NUKA 1XH2A 3K8KA 5FL0A 2VX4A 1EQCA 1EA9C 3VIHA 3VDHA 4CCDA 4H41A 3VGHA 3RIKA 2CERA 1R8LA 3AXIA 5EB8A 3AHVA 1F4HA 2DT3A 3GTNA 2W66A 2WHJA 1MQPA 4YHEA 5LA1A 1X1NA 2W4XA 5A1AA 2CHOA 3QHNA 3SCTA 4AIUA 2PWFA 1OGSA 1WCGA 1JZ3A 4OOZA 1ZL1A 2BVYA 3L2LA 1M53A 3FAXA 5CSUA 4EAMA 4U3CA 2D0FA 3M6DA 2OLHA 3WIJA 2W61A 7CGTA 2Y8VA 4F66A 2WCSA 1J10A 3CO4A 2W62A 3N17A 4D6JA 3SIMA 6TAAA 2XSBA 2Y4SA 3FY1A 1US2A 3LPOA 4PUDA 5CPTA 1MVYA 2GUYA 1AQHA 1BGAA 2VRJA 2WC3A 5E0CA 2WVTA 4AEFA 1QI3A 4RE3A 4KGLA 2V3FA 1K9DA 1HJUA 5IDIA 2JEQA 1LWHA 1V3LA 2J78A 4HA4A 3E1F1 3PZOA 1JNEA 1UD8A 2WC7A 1NWSA 2JF6A 1E9LA 2GJRA 1BVNP 4Z2HA 4KWUA 2D1ZA 1IZJA 1UKSA 1KWGA 3PTKA 4QAWA 3WENA 4QLKA 1J11A 4S3KA 2JFEX 3WDIA 5D9PA 1NWRA 3VKKA 3W29A 2BHZA 3AS0A 1O7AA 2CBJA 1BGGA 5A6BA 4CCEA 3KL5A 2E4TA 4WIWA 1B3WA 1Q6DA 4AZ5A 2PBOA 3MV01 1ZU8A 4R5EA 5LA2A 2W67A 3AIQA 3ZR6A 2WWCA 3A47A 4D6EA 1QNSA 2EPLX 5DT7A 3ZT7A 2YA0A 4MAZA 4L4PA 4AISA 5LA0A 5JBFA 3LPPA 4P7OA 5DT5A 1UKQA 4ZE5A 1AVAA 1PIGA 4AZIA 2WMFA 1QHZA 3AFBA 3WEZA 1KXVA 3RPMA 1E55A 5EFDA 5DO8A 2ZUSA 3OZPA 4TUFA 4OJYA 3WNNA 1UWUA 1C7TA 1KFWA 2VQTA 1XD0A 4HOZA 2O9RA 1UR1A 1CXHA 1Z32X 1TFVA 1G5AA 3ZSTA 3RDKA 1E6RA 5HDRA 2UY5A 4TX8A 1HVQA 1VEMA 1B31A 2DT0A 1CXLA 3CUIA 5E9AA 1NM9A 3B9AA 4BQ3A 4D6GA 2D24A 4UFKA 1H1NA 4KH2A 1E0WA 2UWFA 3OGVA 4GQRA 1HNYA 2J7HA 2YDSA 2YOCA 4CD8A 1WZMA 4IM4A 5AC4A 4JIEA 4WLCA 4CD5A 4JCLA 1FH7A 1EDQA 3WUGA 1YHTA 2NW0A 5BRPA 1WZAA 4W5ZA 4UOJA 3VMOA 1QPKA 3UERA 4KRUA 4K68A 4DM2A 1UD6A 2X1IA 1CGVA 2J7BA 3CHDA 1OIFA 4KRTA 1CDGA 4PMNA 2JF7A 3BAYA 3F5JA 4U2ZA 1CGWA 1HL8A 3WF1A 3WMCA 1TUXA 3VU2A 2NT0A 2VO5A 1V6UA 3T0BA 4JL1A 3BSGA 1I1XA 3U5YA 4P7NA 2VVNA 2GSJA 2W63A 3WH9A 1HVXA 3GM8A 1R85A 3GNRA 3UG5A 1L8NA 1C7SA 5BXSA 2D0GA 3LPGA 2WSPA 5ABHA 1E73M 2F2HA 3VGBA 4JAWA 3L4TA 4ZENA 1ECEA 1W9VA 1CENA 1EDTA 3SURA 4DUXA 3CZGA 1TE1A 1ZBWA 2YDRA 3CZJA 5A2CA 2DSWA 4QLLA 3N04A 2EBNA 2HVMA 1JFXA 1W9UA 3N18A 2QF8A 1GOOA 1KXQA 4D6HA 2QV4A 2WPGA 4ATLA 2WYSA 1W1PA 1I1WA 3PTMA 3MSGA 3WDJA 3AHTA 1BAGA 1NOFA 2YA2A 2PWGA 1JI1A 3EBVA 2D2OA 1JZ6A 5D9MA 1R7AA 3AIRA 2ZX9A 4LYRA 1DWHM 3F4VA 2ZUUA 1KWKA 5FKYA 2O9OA 2CCRA 5BWFA 4HPHA 3AZSA 2A3HA 2CBUA 2O9PA 1UZ1A 4MB1A 2FGLA 2EJ1A 2CIPA 3WL0A 1HP4A 1QNPA 1E70M 4B15A 4E8DA 1C3FA 3AIVA 4W5UA 3K1DA 1KBBA 3VGEA 4C7DA 3T0DA 3OGSA 3SUWA 1JFHA 2IXUA 1ISWA 2BNJA 3NIYA 3IAQA 2XSAA 3WUFA 3ARQA 1HIZA 1PJ9A 2XIIA 3WD2A 1C8QA 1KCKA 3SCRA 2Y5EA 3PBGA 4MDPA 4F79A 4PTVA 4BQ5A 2FGZA 1J0YA 3UEQA 1PAMA 6CGTA 4D72A 5A6BD 1E5JA 2J7EA 3IJ8A 2WBKA 3WBEA 4JHZA 4D6FA 1VJZA 4JFUA 1W3LA 1EQPA 4M8UA 2UY3A 4ATDA 2DSUA 3CH9A 5CXPA 3WNKA 2NT1A 3AYRA 3T0AA 3MUAA 3EYPA 3GXMA 8A3HA 1GQJA 3W28A 2QMKA 2WHKA 3ARZA 1KXTA 1P6WA 3CHFA 1VENA 3POHA 1V6WA 2QPSA 1H41A 2WMJA 3DECA 1E72M 3MUZ1 3CUGA 1V3IA 4CGTA 4C7FA 1W1VA 2VC9A 5HNNA 3MO4A 1H5VA 2NSXA 1E6QM 3ZR5A 1GONA 1OB0A 4MDOA 1WKYA 5CGMA 2CBIA 4QDMA 4WF7A 3FHQA 3L4YA 2J62A 1UD3A 4CD6A 1XCXA 2DT1A 2DGAA 1X6NA 3GH7A 4BZYA 4J7RA 3SCNA 4OBSA 3BLKA 1B0IA 1BFNA 2CBVA 3EMZA 4W8AA 3A3HA 1XSIA 4BCEA 1XC6A 2YIHA 1E0XA 2VCCA 2WM0A 3J7HA 3SCVA 4J3WA 4J3TA 4HP5A 3RO8A 4UQEA 3L4VA 3WY1A 3W53A 8CGTA 2YLAA 4UQ9A 5KZ6A 2OSYA 1RP8A 4HU8A 1X6LA 4TVUA 3TTSA 4JFVA 3VIOA 1JYWA 3OA5A 4TXEA 1WZKA 1UR8A 1R7OA 2BXYA 5AYBA 2GDUA 3AHYA 3GDBA 3O2LA 4AZ7A 1J0KA 5A8QA 1VEOA 1KGUA 3NDZA 2WB5A 5ECUA 3AHZA 2BHUA 3MUIA 2VL4A 3WUEA 3VOCA 5M3WA 2WK2A 2OWWA 2VZTA 4QCFA 4UR9A 3AMCA 2XTKA 3K46A 2XFRA 4HZ7A 1KQYA 3EDDA 3NDYA 4CUCA 1VFOA 1UA3A 1B9ZA 1KBKA 2XFFA 5M5DA 1UQZA 3BGAA 3SCUA 5EFFA 5JBDA 3DYOA 4AZ6A 5C71A 2E3ZA 3B8SA 2E8YA 4U5KA 1HT6A 4HA3A 3WQWA 3WN6A 5A8OA 1B2YA 1B30A 3MV11 3I3DA 3VMNA 2VTFA 3RILA 1UOKA 1BG4A 4Z2JA 3AS3A 2J79A 1JZ5A 1DWIM 1CXIA 4UFJA 3LMYA 1BF2A 2BVDA 2JE8A 2RGMA 4UFHA 2ZXBA 2PF0A 5KEZA 1JAKA 5FCZA 2ZX6A 1W9BM 4GI8A 2PB1A 3B9EA 3OG2A 4JFSA 1ISZA 4JHOA 6A3HA 3CMJA 1GORA 3AJ7A 3WELA 3IJ7A 3RMEA 3CBWA 4HZ8A 3VX1A 3RM4A 1DHKA 3VIJA 2DPEA 4Q22A 2BVTA 1JZ8A 4TTGA 1FFRA 3VIIA 1BTCA 3M46A 3TONA 1NP2A 3S6TA 2Z1SA 1R87A 1MW0A 2FH8A 2DIJA 2WC4A 5A8NA 1JDAA 4AD4A 5C8BB 2E9MA 1NWUA 3FHAA 2ZX8A 2E40A 3WUBA 5GNXA 3AMLA 1ZBVA 3ARXA 3L4ZA 3TA9A 1E6SM 3N13A 3VILA 1DTUA 4MJ2A 3WNPA 3CZKA 2CKRA 1U30A 3AROA 5CPSA 4MNJA 1QW8A 1WZLA 3WKZA 3CUHA 4CU6A 3BXWA 4JFTA 4HA1A 2X2YA 3ZSSA 3WNMA 4UQDA 4BQ2A 1HXJA 3N12A 1ITCA 4U3AA 3I3BA 3WFLA 1JZ2A 3NCOA 1FHDA 3ARUA 4OZOA 4JL2A 4W7WA 1UD2A 4IUGA 3TP4A 5A6SA 3EMCA 1NQ6A 2G3IA 1V3HA 1LLOA 3ECQA 5LYRA 1J0HA 2E9LA 2GFTA 1CPUA 2ZX5A 5E6ZA 5CGTA 2VZUA 4FLRA 4CU7A 1WDSA 2ZXDA 4S3JA 4WKHA 1DWGM 2FHCA 2ZOXA 2W5FA 2BHYA 3GXIA 4W93A 5A2AA 5I5RA 2ZWYA 1O6IA 1TG7A 3VDCA 1J0IA 3GNOA 4W89A 3UG3A 2VUYA 3AHXA 4AD0A 3OZOA 4W8LA 4AD1A 3VIKA 4PMQA 2D3NA 2WBGA 3FNDA 4PMUA 3QHMA 3ZT6A 5I3DA 2IXVA 2WNWA 2O92A 3W6LA 3WH8A 3PZMA 1FOBA 1HF6A 3CZEA 5IHSA 1JI2A 2IUZA 3PZNA 1MW2A 3U5UA 3ARWA 4GO8A 4EANA 4X0NA 5I24A 4ACZB 5HPOA 2VVSA 2J7GA 4AC1X 4PN2A 4AIEA 1WDRA 2ZXAA 2J4GA 3POCA 1EGZA 3AISA 1UWQA 2DEPA 4P8WA 3MANA 2WAGA 4WJXA 4HMDA 1NARA 3SEPA 2QHAA 1HJWA 3VDBA 1UKTA 1XV8A 3D5HA 1TVPA 1HJSA 4N0RA 3BMVA 5BCAA 1KB3A 3VD5A 2J7FA 2EPNA 1CEOA 5A6KA 4PMYA 3AIEA 2J47A 3PZVA 4ML4A 1BG9A 3CLWA 2OWXA 1OSEA 2X8RA 3BLPX 3W25A 1NOUA 1BYAA 4QFUA 2G8ZA 3UR7A 2A3BA 5ABEA 4RE2A 2CPUA 2DSZA 2QLYA 1IZKA 4UCFA 1UH2A 4M24A 5CQ1A 5D4YA 3DHPA 4D1IA 2WVUA 3CUJA 4UQCA 3ARSA 5E0FA 2VX6A 3QHOA 1E56A 4NSBA 4J3UA 2DIEA 4BS0A 3KZSA 3MMWA 1Q4NX 1G9HA 1LL6A 1B3VA 5AYIA 3UETA 3OIHA 4EE9A 4B3LA 2XGBA 5D9NA 2J7DA 3M07A 1E1EA 2ZUMA 1Y7VA 3APGA 4YHGA 5DMYA 4UOQA 2J74A 1GVYA 4KGJA 4GO9A 1V02A 1GJUA 4XB3A 4KMQA 1L0PA 3BAWA 3T2QA 4AWEA 1E4LA 1BYBA 4J3VA 1W9PA 4TX6A 1QVBA 1SMDA 4CVUA 4GINA 1JL8A 1WNOA 1ZBKA 1UYQA 4WKFA 1GHSA 4JFWA 3TTOA 3VIFA 4UZUA 1D7FA 3TTYA 4AMCA 2AMGA 2G3NA 5A2BA 1PX3A 4W7UA 1EDGA 5IXEA 1UD5A 4P8XA 2J8FA 3BH4A 1W9DM 4NF7A 2EQDA 1VFMA 4JKMA 1PPIA 1JD7A 3WNOA 2WKLA 4DWSD 2DT2A 1G0CA 5A95A 3PN8A 4CD7A 4XZBA 3MS8A 1E6NA 4GI9A 2G41A 1XGZA 1V6XA 3GH5A 1K9EA 3WF0A 4GI6A 1CGYA 5A69A 2JALA 4M82A 3WD3A 5BXPA 1MXDA 2VT0A 4GQQA 1JXKA 2WVVB 5FL1A 4GXPA 1HKJA 1QOXA 1J01A 1JYNA 5IFPA 3MKKA 2J77A 1MQRA 2WZHA 5CLTA 1V02E 3WNLA 1OGGA 2V3DA 2V5DA 1AQMA 5TD4A 2GK1B 1RPKA 1HN1A 4OIFA 1CTNA 3VGFA 1DWAM 1RH9A 3SUUA 4Z2IA 1QNOA 1V3KA 1FP9A 3BSHA 1ZJBA 3GH4A 1CGUA 1CBGA 3HN3A 3EDFA 1WDQA 2VR5A 4OOUA 2WLZA 2X0YA 1KCLA 1OGBA 2ZUVA 4UZSA 3A4WA 3AIWA 3QR3A 4EKJA 1MWOA 3AS2A 3K8LA 5DFAA 3WD1A 3PZQA 4D71A 1A3HA 4Z2GA 4AZCB 2WANA 3NSXA 4LYPA 1JNDA 2ZIDA 4PBGA 4AXNA 3CMGA 3GBDA 1E3ZA 1XD1A 2OYLA 2G3JA 3BAJA 2VCAA 1M7XA 2WZIA 5ABFB 2DSVA 2QPUA 2ESCA 2WLYA 1OINA 1V6VA 4CCCA 3NJ3A 3BAKA 1QNRA 1CLVA 5F7UA 2BY1A 1W91A 4PCSA 1HJXA 2XM2A 4D6IA 3VO0A 3W6MA 3MMDA 4W8BA 3UG4A 1GOQA 3SCPA 1CZ1A 1AQ0A 1MW3A 2CESA 1V3JA 4M81A 5A8PA 4CKQA 2VURA 3WFZA 4H04A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3S2C A;  1V0M A;  3FN9 A;  1CWY A;  3WH7 A;  1OCQ A;  1EH9 A;  3JUG A;  4PMD A;  3ZT5 A;  1JDD A;  1M03 A;  2HIS A;  4RL3 A;  3EDJ A;  3A6O A;  1GOI A;  2C8N A;  1ISV A;  1W32 A;  1JF6 A;  4IPN B;  1QBA A;  3U57 A;  1VB9 A;  4ACY A;  4DUV A;  2XJ7 A;  1K9T A;  1EOM A;  2OWC A;  2ZX7 A;  3O9N A;  3FW6 A;  3WDQ A;  1E1F A;  1UH3 A;  1GQL A;  1BLI A;  3ZO9 A;  5FD0 A;  1YQ2 A;  5IHR A;  1G1Y A;  1PX4 A;  3SCW A;  3IAP A;  1UHV A;  3VTR A;  1E3X A;  3MUY 1;  1NOW A;  5BYW A;  1QBB A;  4AD5 A;  2FDM A;  4CN4 A;  3PTQ A;  4AD3 A;  1W2P A;  2X0H A;  1W2V A;  4R27 A;  1OM0 A;  1I75 A;  3KWX A;  4JCM A;  3AYS A;  5HPC A;  1MFU A;  4CN6 A;  3SCO A;  2FHF A;  1JYV A;  1J12 A;  1BHG A;  3WD4 A;  2GDV A;  5C70 A;  2ZXQ A;  2WMH A;  1C8Y A;  2VCB A;  1VJS A;  5I6S A;  5HBF A;  3WBA A;  2CIT A;  3NUK A;  1XH2 A;  3K8K A;  5FL0 A;  2VX4 A;  1EQC A;  1EA9 C;  3VIH A;  3VDH A;  4CCD A;  4H41 A;  3VGH A;  3RIK A;  2CER A;  1R8L A;  3AXI A;  5EB8 A;  3AHV A;  1F4H A;  2DT3 A;  3GTN A;  2W66 A;  2WHJ A;  1MQP A;  4YHE A;  5LA1 A;  1X1N A;  2W4X A;  5A1A A;  2CHO A;  3QHN A;  3SCT A;  4AIU A;  2PWF A;  1OGS A;  1WCG A;  1JZ3 A;  4OOZ A;  1ZL1 A;  2BVY A;  3L2L A;  1M53 A;  3FAX A;  5CSU A;  4EAM A;  4U3C A;  2D0F A;  3M6D A;  2OLH A;  3WIJ A;  2W61 A;  7CGT A;  2Y8V A;  4F66 A;  2WCS A;  1J10 A;  3CO4 A;  2W62 A;  3N17 A;  4D6J A;  3SIM A;  6TAA A;  2XSB A;  2Y4S A;  3FY1 A;  1US2 A;  3LPO A;  4PUD A;  5CPT A;  1MVY A;  2GUY A;  1AQH A;  1BGA A;  2VRJ A;  2WC3 A;  5E0C A;  2WVT A;  4AEF A;  1QI3 A;  4RE3 A;  4KGL A;  2V3F A;  1K9D A;  1HJU A;  5IDI A;  2JEQ A;  1LWH A;  1V3L A;  2J78 A;  4HA4 A;  3E1F 1;  3PZO A;  1JNE A;  1UD8 A;  2WC7 A;  1NWS A;  2JF6 A;  1E9L A;  2GJR A;  1BVN P;  4Z2H A;  4KWU A;  2D1Z A;  1IZJ A;  1UKS A;  1KWG A;  3PTK A;  4QAW A;  3WEN A;  4QLK A;  1J11 A;  4S3K A;  2JFE X;  3WDI A;  5D9P A;  1NWR A;  3VKK A;  3W29 A;  2BHZ A;  3AS0 A;  1O7A A;  2CBJ A;  1BGG A;  5A6B A;  4CCE A;  3KL5 A;  2E4T A;  4WIW A;  1B3W A;  1Q6D A;  4AZ5 A;  2PBO A;  3MV0 1;  1ZU8 A;  4R5E A;  5LA2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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