1RD5A

Crystal structure of tryptophan synthase alpha chain homolog bx1: a member of the chemical plant defense system
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
SRPVSDTMAALMAKGKTAFIPYITAGDPDLATTAEALRLLDGCGADVIELGVPCSDPYIDGPIIQASVARALASGTTMDAVLEMLREVTPELSCPVVLLSYYKPIMFRSLAKMKEAGVHGLIVPDLPYVAAHSLWSEAKNNNLELVLLTTPAIPEDRMKEITKASEGFVYLVSVNGVTGPRANVNPRVESLIQEVKKVTNKPVAVGFGISKPEHVKQIAQWGADGVIIGSAMVRQLGEAASPKQGLRRLEEYARGMKNALG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title On the structural basis of the catalytic mechanism and the regulation of the alpha subunit of tryptophan synthase from Salmonella typhimurium and BX1 from maize, two evolutionarily related enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain, chloroplast
molecule tags Lyase
source organism Zea mays
total genus 94
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.8: Indole-3-glycerol-phosphate lyase.
pdb deposition date 2003-11-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1rd5A00
3DENA 4PA8A 3FKKA 3QSRA 4O52A 5EY5A 3E9AA 2ZYFA 1KFBA 3LRLA 3PM6A 5AC8A 3EKZA 5HR7A 3P81A 2ZA2A 5CGQA 1H61A 3ELFA 1VH7A 5DLCA 5EYWA 3CWNA 1K8YA 4UR7A 1FY6A 4Z1DA 4HNTA 3LCFA 1FDYA 4IMCA 4NZFA 5F4SA 1L6WA 3IEBA 2JKPA 3UZJA 3M47A 3UWQA 3KOFA 4FX8A 5F4WA 5FF7A 4JTEA 3EWWA 3IVSA 5CZJA 3IVUA 5CPLA 4FF7A 1X1OA 5FF2A 5FESA 3HJZA 3O6CA 1FWWA 2J27A 4JTUA 3STGA 2ISWA 3LV6A 2Q3OA 4M6VA 1OHLA 4S1FA 5FF3A 3TMQA 3W7GA 2JGYA 1XXXA 3TIMA 1TPC1 1EIXA 1I2PA 3LI0A 3DI1A 4POCA 2WSYA 3G1FA 3EWXA 1RV8A 1I4NA 5J5RA 4EIVA 3A5VA 3MBFA 3EWYA 4MFDA 1T0OA 5AHLA 2NLIA 3WK2A 5I3KA 4ADUA 4JTFA 3G0UA 4N9EA 5HR6A 1EX5A 2A4AA 1X6UA 5D37A 3SGZA 1F5ZA 2V2HA 1PE1A 3UY8A 4O0ZA 3GR8A 4LS1A 3U8GA 4D2JA 1OVDA 2J9YA 4H4IA 1LRQA 3W72A 4A2SA 2GOUA 1H60A 3TC7A 1H51A 3TE9A 3EX1A 4JY9A 4NUWA 5F2IA 4Y9AA 3C2FA 2J9XA 5D2TA 2EHHA 4HNUA 2EKCA 1QPNA 3T4CA 5F2GA 1LDCA 4IXXA 1FCQA 2PRMA 3N2XA 2YW4A 4O8RA 2E5DA 1JCXA 4R7JA 4MKNA 3PSVA 3IIVA 3RNDA 3G1VA 4IPJA 1YLVA 3W7OA 3W83A 2HSAA 4HNNA 4DO5A 1FUYA 2G5WA 1L6YA 3EX2A 4XTDA 2JGQA 4RZ6A 1VYRA 2Y7EA 4UTUA 1TPVA 1DV7A 3W75A 2A6NA 2DJLA 2CFFA 4RXGA 3TJLA 5EKYA 3O05A 5LKYA 3L68A 3L67A 3EX4A 2RKXA 1TTIA 2YFOA 3M1ZA 2VEIA 1GVFA 3G3MA 4WZHA 3UPWA 2ZRWA 1W1ZA 3ANYA 3EB2A 2ZTKA 1LRTA 4LT9A 4O14A 1MEIA 2ZZ2A 1ALDA 1KFKA 4TU1A 3S42A 1DOSA 2GQ8A 3VE7A 1A5BA 3R5EA 4AWUA 1SPQA 3P5YA 3B03A 3W7RA 3DHDA 2Y62A 5F1VA 2ZA1A 1ZCOA 5C5YA 4YXGA 1B4KA 4CLMA 4MJMA 5FF4A 1WYIA 1TPH1 2JKEA 2H8XA 1VZWA 2JKAA 3GB6A 3LHTA 4ONVA 2ZRZA 1OABA 1OK6A 2GUUA 4AHQA 1W37A 4O57A 1M6JA 1GVSA 5KINA 3PG9A 1RQHA 4L4LA 1DORA 4JYDA 3INPA 1TV7A 4IQLA 1H7OA 3TA6A 3ATZA 2DZXA 3SR7A 4LV4A 2R8WA 3W1RA 3E0IA 1I45A 1WDWA 3N2MA 4IX2A 5CKSA 1TPB1 4FNTA 4DQWA 4E2BA 4N2YA 1TMHA 1FCVA 3S0CA 3PBVA 3P8IA 5HULA 4O4VA 1F73A 4NQ1A 5CPOA 2FDSA 2H8ZA 1TB3A 1T99A 3HGRA 1OFPA 3M5VA 5LGZA 5DBUA 3CB8A 1A5SA 5C55A 5KZDA 3DFQA 3QC3A 3CLMA 4I9AA 3B0PA 3W2NA 4O18A 1LLWA 1OFBA 4K38A 1FBAA 5F2MA 2EGZA 3VKJA 2A6LA 5BRBA 2VFDA 2XN2A 1W54A 2C13A 2WNQA 2Q3RA 4K37A 3C52A 3EXTA 1LBFA 3R2GA 4OU1A 1EEPA 3TQ0A 3FJLA 2FB2A 2ZZ3A 3UZ5A 3BVJA 1NVMA 3HGJA 2QUTA 4M6QA 3UNDA 1JCLA 4FO4A 1VRDA 1OFOA 3HGOA 3QQ1A 4JIQA 4PFMA 1O5KA 1NF7A 3THQA 4MPQA 4AF0B 1HL2A 3LXCA 1TQJA 1AG1O 3W7DA 3NYZA 1P4CA 1SSGA 4UNLA 3W7PA 1J5TA 3G3DA 1XFBA 4UFJA 3JRKA 4LU0A 4O54A 2PC4A 1QCWA 5K7JA 4MZ1A 2ZRYA 3W1NA 1R30A 3TSBA 4JYFA 2CLIA 3BV4A 1GOXA 1XBXA 2E68A 4NX5A 4Q33A 1UCWA 4MYAA 2C15A 2QCNA 1OK4A 2V81A 3HO8A 5DXXA 5MHBA 1NEYA 1W0MA 2X1SA 4BF9A 4BR1A 3MHGA 4UTMA 1P0KA 3C2OA 1XI3A 3GKAA 3MW7A 2H3DA 2Y6ZA 2QCCA 3OHIA 5AHNA 3W74A 3BG9A 4CCCA 3GXTA 1ME7A 2AAMA 4ADSA 2Y7GA 3NQMA 3HGSA 1NSJA 3O16A 1H1ZA 4LC6A 3PWAA 3MI2A 4ZQNA 4I7UA 4ML9A 3W7EA 1TPUA 5HMSA 1ML1A 4UTTC 5D30A 1LOLA 1PIIA 4MLJA 5D32A 2QCGA 4MYXA 3LCXA 3FA5A 1HFBA 1M7OA 2NUXA 4KFPA 1SUXA 3GXPA 3Q37A 1F74A 1YPFA 1D3GA 1H7PA 4RXFA 3VFLA 2DU2A 3HQ1A 4HN4A 3TQVA 1TV5A 3NQ7A 3P67A 1Q6QA 4AXKA 2NXGA 1WBJA 3PVFA 3RLVA 1SO3A 5AHEA 4IWWA 5LNSA 5DXYA 4A29A 3L0NA 2EAWA 1W5PA 2FQIA 3W2MA 3MBDA 1ZNNA 1YTEA 5I3HA 4N4QA 4XQ6A 4ZQOA 2R14A 4BK9A 2CLMA 2QJGA 3HG2A 3QYQA 1YDOA 3W22A 4FNUA 3THAA 3VE9A 2GVGA 3BLEA 3S5OA 3E02A 3G1SA 2X30A 3C6CA 2CZEA 1V5XA 4AWTA 3GXNA 3QW4B 5D02A 1XBYA 4YL2A 4EWND 1UBSA 3LRMA 4LTSA 1HO1A 4DEFA 2RH9A 4MZ8A 3QMTA 1FDJA 3LHWA 3NQVA 5AHMA 2ABAA 2FPVA 4FXSA 1G7VA 1PVNA 4XBSA 3NPVA 3MP3A 2C16A 4UTKA 2Y7DA 4N02A 4FNSA 2DZTA 5IBXA 1WV2A 3B0VC 3S1VA 3BW2A 3I6RA 3HPXA 2C14A 1OF6A 3MYOA 4ZQMA 1KV5A 1FWSA 1UUOA 3LERA 2X1TA 3AO0A 3O6DA 4GXMA 2QUUA 3BARA 4IMGA 4DBDA 3TR2A 3DI0A 1QMLA 4O11A 1VYPX 1WA3A 4JN6A 3TSMA 3ZS4A 4JIPA 3G24A 3C2RA 1TPWA 5I3FA 1QWGA 3B04A 2IQTA 1ZENA 3HB9A 3TKFA 2FTPA 1MEWA 2DP3A 3TW7A 3OVPA 4JX4A 3M6YA 3W1XA 4LS0A 2Z2UA 4MLRA 2Z1BA 4WY0A 3L5AA 1I2QA 3IGXA 1QO5A 5AFDA 4Q32A 1LRNA 5H2ZA 4TX9A 3LXAA 4O15A 2DZUA 3BW3A 4JYEA 3NQAA 3W2JA 3TSDA 3MMTA 2NUYA 2NX3A 5D05A 2A1YA 4O10A 5DY3A 2Y61A 4J9JA 4DBEA 1QNVA 4DPQA 4P61A 1I2RA 4M5PA 2ZQ0A 2VFHA 3UXAA 3IVTA 4LWWA 4PC8A 4OBTA 4HSNA 3TW6A 4BWLC 3M43A 4JTIA 3W1PA 1FCUA 2ZRXA 3M5ZA 3QF0A 1SZFA 1RPXA 5G4EA 3TNOA 2A7RA 1OYAA 1WOAA 1LTDA 2WOQA 3GLCA 3LRKA 4ZZ9A 4JTHA 2NWRA 4X22A 4Z08A 4IPIA 4LC8A 5J5DA 2QCDA 4UXDA 2V9DA 1AW2A 4IOTA 3M44A 1EP3A 3DGRA 3R12A 6TIMA 2B7OA 4NNCA 4UTWA 5K4ZA 1M5WA 3ZFHA 1ZY9A 3NPWA 2ATSA 2WV8A 1I8JA 2Z6JA 3STEA 1GQNA 1G4TA 3N73A 3UWWA 5A8GA 5G5IA 3M16A 3W6YA 4LNYA 5G2IA 2WQPA 1IGSA 4R53A 4Z0SA 4K7YA 3NR0A 5I3IA 1PHWA 2GQ9A 3KXQA 3NM3A 2ALDA 1XDMA 4DF0A 5KITA 3HBLA 4YWIA 3MP4A 2YW3A 2ZRVA 2WPBA 4PL1A 4TMCA 4RZ5A 4UUIA 3TCEA 2VFGA 4CCEA 1SZEA 2VFIA 1EB3A 2DJXA 3OA3A 1B4EA 4N6FA 1EA0A 1PCKA 1BWKA 2LLEA 3B0UX 4FIRA 2C18A 1AK5A 5KTLA 3KVKA 1TO3A 3W7LA 5FEXA 2J9ZA 3USBA 3O15A 3HPZA 1GYLA 1TRIA 1ME9A 1G7UA 2HMCA 4YCPA 1NF0A 4QNEA 3C61A 4IMFA 1W5OA 3BLFA 1FXPA 4MY9A 4NJGA 2CLEA 3W9ZA 1MSSA 3TAOA 1TPDA 1TIMA 3FIGA 2FFCA 1AMKA 4DXVA 3R8RA 4K36A 3NG3A 4KWVA 3NXFA 4WXZA 2VELA 2XFWA 1AL8A 4NXSA 1YPIA 1FX6A 1QDSA 1YTDA 4AHPA 1KA9F 4PL2A 3O06A 2YX0A 4CNOA 4LVGA 5D09A 5D38A 3HIJA 4GRSA 1K7XA 1B3OA 1G4EA 3DKJA 4Q4KA 3W7KA 4O19A 3ABSA 4RZ4A 3FS2A 3TC6A 3G8EA 1UJPA 2YR1A 4JTKA 3OVRA 4JX6A 1IXNA 1MZHA 3N3MA 3PBYA 1SZGA 2FLIA 3LHZA 3TFCA 2O7SA 3L66A 5CZ0A 3QFEA 3HG5A 1Q6RA 1TQXA 2PCQA 1VQTA 2CLKA 3NQEA 4GUFA 4BI6A 1A50A 4QQ3A 1GZGA 4GFSA 4HKPA 1AW1A 4FNRA 2I14A 3ATYA 4WJEA 4O1AA 3TX9A 1U5JA 3NAVA 1THFD 2RDWA 3NEVA 1FWTA 3M0ZA 4AH7A 4H6KA 5HJLA 1SFLA 5KZMA 4W9TA 1K7FA 1YDVA 5DCDA 3KVJA 1PS9A 3KHJA 3STFA 3NOEA 1S5VA 4DELA 2V82A 1KM5A 3BG5A 1QFEA 1TSIA 3QZEA 2I9EA 1RQEA 3FJ6A 3GDTA 5C2XA 1EP2A 3G1YA 3L5LA 4NNAA 3QH2A 3DBPA 1KM0A 2P10A 4JXCA 5G4WA 2W6RA 4UMCA 1GVQA 4GUJA 1JULA 2VXNA 3DXIA 4QISA 3WK3A 1KLYA 2TYSA 3PS7A 5K2ZA 1Q6OA 2QR6A 4HPXA 3VCRA 1JCNA 1EWEA 2G95A 1WQ5A 5ABTA 4AEOA 3I65A 3LXBA 2B7PA 4IMEA 4YMZA 1G4SA 4S2CA 1W3TA 2YDAA 4X3ZA 3TK7A 1G67A 4MUZA 2RHGA 1KTNA 3UYCA 3LHUA 1U83A 3P5ZA 3W86A 4UTLA 1FXQA 1TV8A 4GUHA 4FHAA 4HIBA 3MHUA 4GC4A 3L0GA 4KWWA 3F4WA 2GQAA 4WD0A 3WJYA 2RDUA 3MYPA 3V1PA 4WY0B 1GT8A 5KMYA 1LROA 1SW7A 5DCEA 3VNDA 2YSWA 2VEPA 4AHOA 2YCEA 4O0KA 1BWLA 1TTQA 4LUJA 4H3DA 4JICA 3NA8A 3W2KA 2F7FA 3LTYA 1JCJA 2Y85A 1J4EA 5AHIA 3OG3A 3B8DA 4RV8A 5HWNA 4ZQCA 3NQ6A 3QMRA 1N55A 2VEKA 2CLOA 1TJRA 3S8HA 4PCFA 4LRSA 5CSRA 1ZALA 1W5NA 2ZCGA 1ICQA 4K7VA 1PHQA 3STCA 4Y96A 5G1YA 2ZDRA 3QSTA 4GWEA 3L9CA 4LOCA 1XC4A 4WOQA 4LV9A 4A3UA 1IXOA 4UFKA 1ZHAA 4IMDA 1FWNA 2ZZ7A 5C54A 3G0SA 4KFOA 2BTMA 3U6WA 2YYTA 1KM6A 1O5XA 2P1FA 3UWUA 5BNKA 1S3HA 2QCDB 3PBUA 1SFJA 5GVJA 3JS3A 3PR2A 3P61A 3IRDA 2YXGA 4CNPA 1PL9A 3LLDA 1TRDA 2EPHA 2QCFA 1EWDA 2KZHA 4Y90A 5AHFA 4E2DA 2FB3A 1YADA 2Y63A 5KSWA 1O94A 3HMJG 3M5YA 4WOZA 2CLLA 2ZRUA 4XBKA 3NM1A 4BWLA 2B7NA 8TIMA 3TAKA 1F7BA 1X7FA 4WX2A 2R94A 3UD6A 2V2DA 1KM2A 4Y6GA 4NT0A 3NPUA 3TQKA 1LYXA 5LNUA 3DFSA 3NVTA 2GVLA 5AOUA 3W7HA 5EA9A 3ZWTA 2ZBTA 3W7IA 2ABBA 4LVAA 3NL5A 1W56A 2RDTA 3PG8A 4JDBA 1W31A 4AAJA 3M5XA 1LCOA 4HT3A 3CT7A 1R2RA 1RZMA 3NL3A 3LOTA 5K9XA 2YZRA 1QPOA 2WNZA 2GJNA 3G0XA 5BOOA 3IIZA 1KFJA 3I7SA 4EF9A 1K8XA 1TCDA 3W84A 3EXSA 3JR2A 1MEHA 3RFAA 5U4NA 2E6YA 1JCMP 3W71A 2HS8A 4PODA 2PRHA 3W7QA 1OYCA 4K8HA 1Q6LA 4UTIA 1L9WA 2A2IA 2VFFA 4R34A 4RLIA 3CQ0A 1W3NA 5AN7A 1LM1A 1M7PA 3GDMA 3O8AA 3QQ0A 2QKFA 3NL6A 1JJKA 3TFXA 1YTKA 3GVGA 2E09A 4B5NA 2QCHA 3KVLA 3FFSA 4FNPA 5AB3A 1QPRA 4LY8A 3OBKA 4L4MA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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