1RD5A

Crystal structure of tryptophan synthase alpha chain homolog bx1: a member of the chemical plant defense system
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
SRPVSDTMAALMAKGKTAFIPYITAGDPDLATTAEALRLLDGCGADVIELGVPCSDPYIDGPIIQASVARALASGTTMDAVLEMLREVTPELSCPVVLLSYYKPIMFRSLAKMKEAGVHGLIVPDLPYVAAHSLWSEAKNNNLELVLLTTPAIPEDRMKEITKASEGFVYLVSVNGVTGPRANVNPRVESLIQEVKKVTNKPVAVGFGISKPEHVKQIAQWGADGVIIGSAMVRQLGEAASPKQGLRRLEEYARGMKNALG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Zea mays
publication title On the structural basis of the catalytic mechanism and the regulation of the alpha subunit of tryptophan synthase from Salmonella typhimurium and BX1 from maize, two evolutionarily related enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain, chloroplast
total genus 94
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.8: Indole-3-glycerol-phosphate lyase.
pdb deposition date 2003-11-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1rd5A00
4WQ6A 2ISVA 4J9JA 1ICPA 2J88A 3E9AA 4UFJA 3QMTA 4EF9A 2Y70A 3LHVA 3L9CA 4M7TA 5HJLA 3H54A 3M0ZA 1JQXA 1SZFA 3KVLA 4DEFA 5DCBA 1FY6A 3HPXA 3GR8A 3P8IA 4P2VA 2HTMA 1HUVA 1K8XA 3PSVA 4LS1A 5AC7A 3PUOA 3RK8A 5LHEA 5CSRA 1BTMA 2GJNA 2VFIA 1OYBA 1ZAHA 2C14A 4IQLA 2YSWA 3TR2A 4ORMA 4FB7A 3P82A 2A21A 1YDOA 3V1PA 2WPBA 2Z2UA 1SZNA 3BG3A 3WJWA 1FX6A 2E5BA 3GR7A 5F1UA 3W73A 2QCDB 2CZ5A 5TBOA 4S2BA 3UWZA 3QF0A 3B0UX 1AMKA 1Z42A 2CWNA 3RMJA 1OK4A 1WOBA 1SO5A 2JBMA 3NPWA 4O10A 3BW4A 1WQ5A 3C6CA 2H8XA 1TSIA 1W3IA 2Y85A 1TPVA 5E93A 3NM3A 2W0UA 1OF6A 2V30A 2WO5A 2ZRYA 1QNVA 4QJ1A 3SI9A 2ZYFA 2QJIA 3WK1A 2NUYA 2B7NA 4WD0A 2GJLA 3W7HA 1KLZA 4H4IA 5E0KA 4O11A 5LGXA 5D2TA 1J2WA 1E51A 1WOAA 2TSYA 3W7LA 2DZSA 3CWOX 3KOFA 3LHUA 3DFPA 3HGOA 4O53A 3PBUA 1K02A 1M7OA 7TIMA 1LRNA 1GOXA 2R14A 3IIZA 4FXSA 3U8GA 1IXOA 1SW3A 3DKJA 4OGZA 1RZMA 2ZRXA 4LTSA 1Z41A 1ZJIA 2DP3A 4Z0JA 3NA8A 1OX5A 1RD5A 5F2IA 2R91A 4EOUA 1KTNA 4KFOA 2J9XA 4U4MA 3SY5A 4LVGA 4BWLC 3TROA 1VCVA 4A21A 2VC6A 1X7FA 3P80A 4IMEA 4LOCA 3LGEA 2WJZA 1TRIA 2EKCA 5CZTA 3C2OA 4FO4A 4XKYB 3P61A 3DHDA 2RDWA 3EXSA 4N9CA 5DBUA 1WDWA 1W37A 1YLVA 2C13A 1X8FA 3R8RA 3PY2A 3KRZA 2X1RA 2A7RA 2H6RA 1LBFA 1LBLA 3GZ3A 3EWZA 1DOSA 5C5YA 4OHQA 4QNWA 1LRTA 4AF0A 4LUJA 4DPQA 1XCFA 1W5OA 4O57A 2E5DA 5L9FA 4MY1A 1KFCA 4UXDA 1PVNA 3T55A 2QEZA 3QMSA 1GVQA 3NQVA 1H7NA 3KVMA 4JGDA 3DHFA 4RXGA 3BV4A 3BK0A 2AQWA 3W6YA 5F4XA 3INPA 2FPVA 5HR6A 5EA9A 3MYPA 1W8SA 1S5TA 3UQNA 3SW6A 1VYRA 3L5MA 3FEMA 3NQ7A 1UBSA 3BARA 3QFEA 2ZZ1A 2NUWA 1TIMA 4CQAA 3W7GA 2NXGA 3P74A 1D3GA 1OG0A 3LI0A 2QJGA 5KITA 3STFA 3CWNA 1VLIA 3NQCA 1S5WA 4IGHA 5D02A 5AYYA 3P5YA 5HINA 4QISA 1TPC1 3W7DA 5DY2A 2C19A 4NX0A 4UTIA 4MYAA 4OT7A 3L0NA 1CW2A 4AHQA 3DFSA 3N9SA 2NZLA 5AN7A 5D38A 2NXHA 1TPUA 1EIXA 2RH9A 3KAOA 3FYPA 1F05A 2A6NA 2GUUA 4LC6A 3DKLA 3MUXA 3UWWA 2F7FA 3N3MA 1DKWA 3D0CA 4K39A 5FEWA 4BWLA 4DF0A 1HFBA 4JIPA 5LNVA 3CEUA 3OBKA 2GQ8A 3TQ0A 3G18A 2VFDA 2X2GA 3A5FA 3TV8A 3IGXA 1SO3A 1F73A 3K30A 2TYSA 3BLIA 3UY7A 1XI3A 1SUXA 3N9RA 2Q8LA 3G1XA 2E6DA 2X1TA 3CQ0A 3FJ6A 4QIUA 1NF7A 2JK2A 4WJEA 4A29A 1Q6QA 4JN6A 3SGZA 2YPIA 4Z08A 2EF9A 3G3DA 3KRUA 2A1YA 4MYXA 4IXXA 3GLCA 3QPZA 1GG1A 5BRBA 4MFDA 1FWWA 3QQ1A 3VNDA 3GNDA 2PE4A 3EX1A 1TPH1 1FXQA 4O12A 3TFXA 2A85A 4DQWA 2ZA2A 1A5CA 1GQNA 3OHIA 1F76A 1I2RA 3IVUA 4LUIA 4FNRA 4AB4A 3F4NA 4O54A 3NQ2A 3NZRA 2E09A 1IXQA 4I7UA 3HG2A 4AAJA 2Z1BA 3MP4A 4XBSA 5G2IA 3WJXA 4DO5A 3L2IA 1FCVA 1LM1A 1IXPA 3OIXA 3PC0A 1MEIA 2CLFA 3FKKA 1TRDA 3GX9A 1TCDA 1OFEA 3HBLA 5C54A 1GJPA 2WOQA 2VFHA 3STCA 5K7JA 1MO0A 1C29A 1OYAA 1LROA 1N8FA 3M41A 4N02A 3S1XA 3PM6A 3W1NA 2P0OA 2V5LA 1TPFA 4ADUA 1H62A 5D2WA 1UCWA 1AW2A 1VHNA 4UFHA 5D03A 1XM3A 3S5YA 4ML9A 1OHLA 3KVJA 2EGZA 4O0ZA 1SZGA 3TAKA 1PHQA 4O4VA 5IM51 3E49A 3AO0A 3UYCA 3HGSA 1SO6A 5LZLA 4HPXA 1TB3A 3HOJA 3M5VA 1EA0A 3CPRA 3O63A 4CQ8A 5A8GA 2DJLA 4CCDA 2YZRA 3E0IA 2HS8A 1WA3A 3N2XA 4MZYA 4BI6A 2PRHA 1BWLA 2NWSA 5FF4A 3W1XA 4O1BA 3HB9A 3DBPA 5BNKA 4WUIA 3EX3A 1HL2A 3G1DA 4XWUA 2A0NA 2XFWA 3UXAA 4XBKA 2VEKA 4LS2A 1JQVA 1H60A 4FF7A 5FF7A 1WX0A 3NQMA 5CG7A 3GDKA 1CI1A 3NQ8A 4DXVA 3LCIA 3LBCA 4NNBA 2VEMA 1R46A 4BFAA 3LX9A 4XTDA 5K9XA 3NOEA 1ADOA 2QCDA 3CM4A 4GC4A 2CFFA 4MIMA 4N2YA 3ZFHA 1VS1A 2CW6A 3WK0A 4O50A 3W3OA 4LU0A 2BX7A 1V7YA 5AHLA 1R47A 2ZFAA 4ZQCA 3VCRA 3M5YA 3OVPA 3NPXA 1VGAA 4Y6GA 2B7PA 1EWDA 4R33A 2B7OA 5HWNA 4O14A 3T78A 4PA8A 2CZEA 4RXFA 1H5YA 1OFRA 4FIQA 3M5XA 4E0CA 1X1ZA 3L5AA 1L6WA 3BG5A 4RZ4A 4EIVA 3Q2DA 3EX4A 4MUZA 3IGUA 3EWUA 2OJPA 3LRMA 3DFTA 3LERA 3RF9A 3BO9A 1KA9F 5J5RA 1TTJA 4LRSA 2F84A 2Q3RA 4XZ9A 5DN1A 4NXKA 2ABAA 5L6UA 3LTSA 3ZWSA 3HGRA 4MLRA 4GUIA 1SFLA 3L65A 1GVRA 3S42A 1LORA 5MHBA 1RV8A 4HNVA 1MXSA 3NO5A 1PHWA 5EL1A 4FNTA 4KFNA 3HPSA 3A24A 1CX9A 3NQAA 3S5OA 3C61A 2X1SA 1DHPA 2H3DA 1GVFA 2A4AA 1WBHA 3T7VA 1WV2A 4Z1BA 3TMQA 4MKNA 4DBDA 4NNAA 4JY9A 3TH6A 1K7FA 4XKYA 1H7WA 1DORA 1KM6A 3W2JA 2QKFA 1UJPA 2OX1A 3GXPA 3OVQA 4O1CA 3LV5A 3T44A 1FCUA 2FLIA 1QR7A 4LVDA 3R5EA 6ALDA 5HWMA 3GDMA 2B4GA 4Z0SA 1LDCA 1ZHAA 3W74A 2YW3A 5G4EA 4LVAA 2GOUA 4QQ3A 3GKAA 3IIVA 3TA6A 1EP2A 2CLIA 4ZQRA 4UCGA 2ZRVA 2I1OA 3N34A 4RK8A 2ZZ2A 3LHTA 1ICSA 4L4MA 1N55A 1YTDA 3G1FA 3TSBA 1GYNA 3W83A 3G1HA 1OFPA 1SW0A 3TXVA 3LCFA 5HQEA 3WK3A 3IEBA 1G4SA 3KXQA 3FA5A 4WOQA 1FWTA 4HHPA 1KM5A 2FB2A 4UTKA 5LNWA 2BTMA 3L21A 5D33A 1B9BA 4HPJA 1TPB1 1MSSA 1NEYA 2C0AA 3MI3A 1WXJA 3Q58A 4Q4KA 4UNKA 1LCOA 3A21A 1B57A 1MZHA 2CLLA 1QDSA 1YPFA 1Z48A 1AG1O 2V2CA 3T4CA 2FTPA 1Q6RA 2NX3A 3IIOA 4UMCA 3FJLA 1I2NA 4X3ZA 3M9YA 3A23A 4CQ9A 1GG0A 2Q8ZA 3S1VA 3HG3A 3A5VA 4NX5A 5LNSA 5CSSA 4Y90A 1L6SA 4IUOA 3O1NA 4GUHA 3WJZA 3W7MA 1EX5A 5LSMA 3NQ6A 2J9YA 5F2LA 3FOKA 1Y0EA 1KFEA 3TJXA 1YYAA 3EKZA 4ZQNA 1JUBA 1FWSA 1H7OA 2FIQA 3QZEA 1JCYA 3CLMA 3G22A 5AHEA 4AHPA 5IBXC 2QR6A 1K7EA 3DI1A 3SFKA 2CLEA 2QCFA 1YDNA 2A6LA 3CU2A 1AL8A 3O8AA 1P0KA 1XBXA 1PS9A 2H3BA 4N6FA 2O7SA 2C3ZA 5DXYA 1H63A 5FI8A 3JR2A 3LLFA 2QCLA 2CLKA 1OX4B 4MLJA 3BGGA 3MJYA 3T40A 5F1VA 2VXNA 4K6AA 5DY3A 3G3MA 1GVOA 3N19B 5D37A 3NL5A 3DH7A 1A50A 1I2PA 1QOQA 1GEQA 4JTUA 3BLEA 3W1UA 2Z0IA 3M7WA 3LLDA 4RCXA 2IQTA 5CZSA 3TNOA 3FS2A 1DBTA 3M44A 1Z44A 2ABBA 2RHGA 5SWUA 1QWGA 1K03A 1G7UA 3W7OA 4AWUA 1JJKA 1NAL1 1KFBA 2E77A 1EEPA 1JUKA 4LV9A 4MJMA 3ZWTA 1G7VA 3W7NA 3R12A 3R2GA 3P62A 3W84A 3VE7A 3NM1A 3VFLA 2QUVA 1R30A 5F2GA 1ME9A 5G2HA 4LVBA 1H7XA 4O15A 2QUUA 5LNUA 1QO2A 4K36A 2ZZ6A 1P1XA 1TQJA 2Y88A 4BF9A 3HIJA 1O4UA 3L0KA 2B7QA 1BKSA 4UMBA 3GXTA 5EYWA 2FQIA 3W7JA 4UUIA 1VRDA 1F6KA 3EWWA 5CGQA 2YW4A 3L67A 5CZJA 4GNJA 4RLIA 4TR9A 2JGQA 4IPJA 4AVFA 4NU7A 1SO4A 3TFCA 2PC4A 4IX2A 5CPMA 1XXXA 1G4TA 4M6PA 3GK0A 3LHYA 4POCA 1RQHA 2WSYA 2JKAA 4GRSA 1HO4A 2R8WA 3BLFA 3UPWA 2DZXA 1SPQA 1H50A 1AW1A 1JCLA 3MI2A 4FX6M 3UY8A 3BVJA 2E6YA 4FNUA 4IMFA 3QQ0A 4AWSA 3TU9A 4MFEA 3F03K 5DBTA 1T8XA 4X9SA 2BWGA 3LXAA 3SR7A 3OG3A 1RR2A 3ABQA 3B0PA 3EKLA 3PG8A 3G8EA 3PR2A 1LLZA 2Y6ZA 3W70A 2R94A 4RZ6A 3GDLA 2E6FA 3HG5A 3FIGA 1OF8A 2QAFA 1GTHA 1H7RA 2AGKA 4EWND 1VQTA 3G1AA 4OU1A 4WOZA 2B0MA 3W86A 1A5AA 2PURA 1KV8A 4JYDA 1PV8A 4S2CA 1O95A 2NX1A 2E6AA 4ONVA 4RV8A 4NJIA 5CPOA 3W1MA 1R2TA 4PH6A 3G1SA 3W7PA 3UXDA 4JX4A 2ZTKA 2ZQ0A 3EXRA 3QMRA 2DORA 1IIGA 1EUAA 4O4WA 3M6YA 2ALDA 3O6YX 1FDJA 2ISSA 4UIOA 3TCEA 3RU6A 1EPXA 4NJHA 2ZZ3A 4RR4A 1YXDA 3C2EA 3LBMA 3QYQA 4O0KA 3V75A 4ZQMA 3EX6A 5HNRA 4HKPA 3MHGA 3EWBX 5LKYA 3IRDA 4JTTA 4I7WA 4IMGA 1LOLA 4O1AA 1LOQA 1FCQA 2ISWA 1HO1A 4HSNA 4FNQA 1QAPA 2H8ZA 3U6WA 1R2RA 3DI0A 2YXGA 4XUGA 4AMAA 2CLOA 1AW5A 3TDFA 2QCNA 2YGYA 4JDBA 4JYEA 4O17A 2G5WA 1K7XA 4HNTA 3FKRA 3P67A 4ZL1A 4K7VA 3C56A 3UZJA 1W1ZA 3NPUA 6TIMA 3QSTA 1DQWA 3LHZA 3USBA 3QPYA 1OVDA 5K9DA 3TC7A 1LZOA 4KFPA 3NR0A 1K3UA 4FX7A 3TK7A 3ABRA 1R2SA 2XN1A 4I7VA 4BI5A 3TMLA 2JKPA 3PG9A 4MOZA 1GVSA 3N14A 2NV2A 4TMCA 1JR1A 1FWNA 3EB2A 4DO6A 1JVNA 1P0NA 4N4PA 4O13A 1ZFJA 3LRLA 4DO4A 1H51A 1F6PA 1H1YA 2J27A 3G24A 1P5BA 5FEXA 5TQLA 3NQEA 1YTKA 3NNTA 2A7PA 5DXXA 1TTIA 1WBJA 1MEWA 3S8HA 1YXCA 3DAQA 4ALDA 2G97A 3O07A 4O19A 2CLHA 3W88A 4HSOA 3DFNA 4JTKA 3TJLA 1B3OA 3L5LA 3I7SA 3S0CA 3O06A 4E2DA 4A2RA 4LVFA 4PCFA 2BZNA 3B0VC 5CKSA 5G5IA 4JD4A 1KM2A 3NQGA 3YPIA 4FXRA 2C1HA 1RQEA 2YX0A 4OWGA 3QJAA 1FUYA 1RVGA 1XKYA 4IXHA 2WNQA 2FFCA 3SSJA 2VFGA 1TMHA 4MJZA 3WJSA 1A5BA 2GQ9A 2ATSA 1KM4A 4WX2A 1F2JA 4PFMA 4GFSA 3DFQA 3P81A 1TV7A 3RLUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2NQJ A;  2ISV A;  3GNR A;  3M0Y A;  1WE5 A;  1XGD A;  4DEF A;  3WBA A;  4V15 A;  1BSL A;  3HPX A;  1BYB A;  4P2V A;  1LUC B;  2HTM A;  2IKJ A;  4Z2J A;  1PBG A;  1B3W A;  1A0E A;  3RK8 A;  5CSR A;  5EGR A;  3VGE A;  4F48 A;  1QXL A;  5A8P A;  1RP9 A;  4KS0 A;  4IQL A;  2XG9 A;  1YRR A;  3AXX A;  1WP6 A;  4IFK A;  2CBU A;  2ZVR A;  3B0U X;  2CWN A;  1OK4 A;  1WOB A;  1JZ8 A;  3CV7 A;  4BEQ A;  3N2O A;  3AZS A;  2Y85 A;  3NM3 A;  1JF6 A;  1RY0 A;  1VFL A;  3NSM A;  2ZRY A;  3WMB A;  1ZL1 A;  1PUD A;  2ZYF A;  1JDC A;  4DXX A;  4W84 A;  3CUG A;  4JL1 A;  1BQG A;  2QJJ A;  1U5H A;  1W1Y A;  3GWQ A;  5FIP A;  3R0D A;  1J2W A;  1E51 A;  7A3H A;  3CWO X;  1WDP A;  2YOC A;  2I16 A;  3HGO A;  3L4Z A;  2FYM A;  3I3E A;  2XIB A;  1W3H A;  4HYR A;  1CLX A;  1GOX A;  4GOA A;  1NFP A;  3CAV A;  1UWI A;  2IKI A;  2VHL A;  3RUB L;  4JEJ A;  1ZJI A;  2DP3 A;  3RG6 A;  4QG8 A;  1OX5 A;  4NP7 A;  3PZU A;  2R91 A;  1GVE A;  2YXO A;  1KTN A;  4WKH A;  5F2I A;  3SY5 A;  3TRO A;  1X7F A;  2BY0 A;  1E3X A;  3I6E A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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