1SO3A

Crystal structure of h136a mutant of 3-keto-l-gulonate 6-phosphate decarboxylase with bound l-threonohydroxamate 4-phosphate
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
214
structure length
214
Chain Sequence
SLPMLQVALDNQTMDSAYETTRLIAEEVDIIEVGTILCVGEGVRAVRDLKALYPHKIVLADAKIADAGKILSRMCFEANADWVTVICCADINTAKGALDVAKEFNGDVQIELTGYWTWEQAQQWRDAGIGQVVYARSRDAQAAGVAWGEADITAIKRLSDMGFKVTVTGGLALEDLPLFKGIPIHVFIAGRSIRDAASPVEAARQFKRSIAELW
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
publication title Evolution of Enzymatic Activities in the Orotidine 5'-Monophosphate Decarboxylase Suprafamily: Crystallographic Evidence for a Proton Relay System in the Active Site of 3-Keto-l-gulonate 6-Phosphate Decarboxylase(,)
pubmed doi rcsb
molecule keywords 3-keto-L-gulonate 6-phosphate decarboxylase
total genus 85
structure length 214
sequence length 214
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.85: 3-dehydro-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2004-03-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1so3A00
2DZXA 4RZ6A 3PB0A 4BWLA 3ZS4A 4PFMA 1AG1O 1H7NA 3O6YX 3ZWSA 5LZLA 4K8HA 3UWUA 2QCNA 1TTQA 1DJNA 2J27A 3LERA 3MP5A 4U28A 4TO8A 3OG3A 4QQ3A 4EOUA 3BW3A 4RXGA 2RDTA 4GUGA 5K2ZA 1YPIA 1MSSA 4GXMA 2NV1A 3W1RA 1VHCA 1FQ0A 3ABOA 3QMSA 5A8GA 1QWGA 3UZ5A 5DCEA 5K7JA 4ADUA 3T40A 3G1VA 3NQMA 3NDOA 4CCDA 3S8HA 3KRUA 3DFPA 3L65A 3ELFA 1FWRA 4JTLA 2AGKA 4XQ6A 4QNEA 1LOQA 1SR9A 4FNRA 2Y62A 4HSNA 1W56A 2ZZ5A 3GAKA 3B0PA 5AHNA 3E12A 1DKWA 2DZPA 3A5VA 3NXFA 5G4EA 3LI0A 5HWJA 4QJ1A 5KMYA 3CM4A 3LX9A 4XKYB 1G69A 1JVNA 3SJ3A 1EWEA 4IMDA 4RR4A 2OMAA 3O1NA 1DBTA 1UASA 5T26A 1VYPX 1L6YA 1VRDA 2O7SA 1H7OA 3M5VA 2NWSA 2NUWA 3M44A 2C13A 3GR8A 4YCOA 3P82A 2WNQA 1GZGA 2YGYA 4LC6A 2YR1A 1PCKA 1XDMA 1MEWA 3W2JA 4AH7A 4N9EA 1VH7A 1KM6A 3LCIA 4ZQPA 1RZMA 1I2PA 4Z1AA 2CLLA 4KFNA 4AWTA 5LSMA 1K3UA 4HNNA 2QCDB 1MEIA 4JX5A 1BTMA 2NX9A 3B04A 5LNSA 5HR7A 2OZ0A 4AB4A 4IJBA 4LVBA 1Y0EA 3H54A 4DELA 5CPMA 5AHIA 4JTJA 4RCXA 5D2XA 3E0IA 1Z42A 1F2JA 1SQ7A 3L0GA 1GG1A 1C8VA 2GJLA 1THFD 3TMQA 1Z48A 2B7QA 1H1YA 5AHLA 3TJXA 4E2BA 3DKJA 3TW7A 2YX0A 4ZVJA 4N6FA 1WX0A 2ZTJA 3NQFA 4O4VA 3OIXA 5E0KA 4FX8A 3O06A 3IIOA 1X7FA 5I3HA 3CPRA 1G4SA 3FYPA 3DGRA 3DXIA 4O54A 1W54A 1KFCA 3TK7A 4MKNA 4DXVA 1RR2A 1SFLA 2A4AA 3W2MA 1IF2A 1G67A 4JX4A 5HMSA 4HN4A 3UWZA 1K7EA 3PG9A 4Q4KA 5LHEA 4JR5A 2AQWA 3M0ZA 3KFTA 5GVJA 1PHWA 1ZAIA 2ZRWA 5HJLA 4JTSA 4NJIA 3B4UA 2ZTKA 1IXPA 3P8IA 1LTDA 4LUJA 5FEWA 3LB0A 4NXKA 3P5YA 1KFEA 1I2OA 2CZEA 4HKPA 1K8YA 2C6QA 3EX2A 1QPRA 3SIZA 1JJKA 1WBHA 3HJZA 1QPOA 1YXYA 3E9AA 1JUEA 4FIQA 3VI2A 3W7QA 1SW0A 5DN1A 3MI6A 3FYOA 2V9DA 1MO0A 2F84A 1EP2A 1EP3A 3NQ8A 3PUEA 4XBKA 2NX3A 3TXVA 3QW3A 4N6EA 3GXPA 1QCWA 2FFCA 4GUIA 1YTKA 3MYPA 3GB6A 3GDLA 1F76A 4HNUA 5SWUA 3BG3A 4A22A 3EWZA 2ZZ4A 4MVAA 3W1LA 1F7BA 3QQ0A 1KA9F 4JY9A 3GIYA 3G0XA 2QDHA 1D9EA 1LLZA 4HNVA 1ICPA 1TV5A 1PE1A 2G97A 4XZ9A 2QAFA 2B7PA 4WZHA 3BV4A 4LVAA 1VCVA 1E51A 4O1DA 3PWAA 3B0UX 3IIPA 4X2RA 5D30A 4GFSA 1GVQA 3W7RA 3O07A 3LTSA 1W3TA 2GQAA 1SZGA 4N9BA 4N02A 3DFNA 1W5PA 3R8RA 1TPB1 1HO1A 3O16A 3CT7A 2ABAA 4BF9A 2CLHA 1VLWA 4JXCA 2PC4A 2C18A 3FJ6A 3MP3A 3TX9A 4MZYA 3L5MA 2G96A 5BOOA 1VCFA 3QC3A 4WXZA 1SU5A 3NL6A 1UBSA 3HF3A 2C16A 2B7OA 3W75A 1H1ZA 1I2QA 3MP4A 3W76A 1VS1A 1SO4A 2AAMA 3NO5A 5KTLA 3T4CA 3N19B 4UC5A 1L6WA 2HS6A 1OF8A 1EIXA 1OJXA 3G1AA 3S0CA 4XKYA 4O1CA 1ME7A 4ADTA 1A5BA 1KM5A 2DORA 3S5ZA 4GNJA 5F1VA 2E6AA 5FF2A 3W7MA 1NF0A 3PB2A 3P74A 3M47A 3QFEA 2NLIA 3NM1A 3W1PA 2YYUA 3DBPA 3FA5A 4RLIA 4C1KA 1DQXA 3TW6A 3BO9A 1KFJA 1G7UA 2YSWA 1LOLA 1DQWA 1TPH1 2TRSA 3LXAA 4O50A 3FOKA 3HIJA 5F2MA 4GBUA 3GZ3A 5LGXA 5F2GA 3STEA 4AMAA 1W37A 5FF7A 5F2IA 5AYXA 3TE9A 1W5NA 4ML9A 4WY0F 2NV2A 3MO7A 1H51A 2E6DA 1H5YA 2QCDA 3CB8A 5EKYA 3U6WA 5CSRA 3QMTA 2ABBA 5DY3A 5I3JA 3TR2A 3EB2A 3TROA 4TX9A 3BLEA 4JTFA 5K3VA 3HG2A 3DZ1A 3KRZA 2NX1A 3PVFA 4UNKA 2JGQA 4LC8A 5H91A 4JYEA 1RQBA 4NX0A 4OT7A 3QEZA 2V82A 2A7NA 4K7YA 3R12A 2HS8A 2PRLA 4OV4A 4AXKA 4AHPA 3EX1A 3KVKA 1TTIA 5D05A 3U8GA 3GLCA 2CLIA 1VZWA 2IQTA 4LT9A 4A21A 3W7GA 4K38A 3NL2A 1SZNA 4UTMA 5FI8A 1KLZA 3KVLA 4NZJA 3VFLA 3O15A 1ZAJA 5LGZA 2WO5A 1J4EA 4W9TA 3C4UA 3N3MA 1L6SA 4BI6A 1TMHA 5LNRA 3DKLA 3AO0A 2WSQA 1TTPA 3W7LA 1SO3A 1D3GA 3L0NA 5KZDA 2RHGA 3TJLA 1S3HA 2QJHA 2V2HA 4I7VA 2ZRZA 3VNDA 2WKJA 1FDZA 2I9EA 3EX3A 4JY8A 3UWYA 2ISWA 1MEHA 3PBWA 1OFQA 5D09A 1W0MA 2V5LA 4WJEA 4KWWA 5FEPA 4WXYA 4M6PA 4FXSA 3LV6A 4ZMGA 3P84A 4JTKA 5DCDA 1M7PA 3L5AA 4E0CA 3MHFA 1QO2A 1NFBA 2Z6IA 3LHTA 1SW3A 2J9XA 3P5ZA 4IOTA 1O60A 2FJKA 3O6DA 3BPWA 1PS9A 1ZY9A 2C0AA 1TRDA 3O05A 2Q8ZA 1XBXA 1H7PA 2R8WA 1GG0A 1H60A 3W7CA 4TMCA 1EUNA 1MXSA 5BMWA 1AL7A 3P8JA 3MBFA 3QPZA 1NAL1 5KITA 4Z0JA 5C55A 4POCA 1GJPA 3W1MA 4A3UA 1VCGA 2Y6ZA 1DHPA 3OVQA 5F1UA 4UTKA 4NNCA 4OU1A 3TA6A 1ICSA 4JTHA 2P0OA 5F4WA 3FJLA 1XUZA 4J9JA 4QSHA 1DV7A 4M7TA 1SSGA 5CGQA 5FEZA 1VR6A 2DJXA 3PUOA 4UTTA 4JIQA 4O11A 1DORA 4EIVA 2QF7A 1ZNNA 3SZ8A 4HT3A 3UPWA 1I8JA 3GAYA 4WY0B 5E1QA 3EKZA 3VCRA 1CI1A 3HGJA 4X3ZA 2FDSA 3W87A 1OFEA 4UTWA 4I9AA 3HGSA 1VPXA 2H3DA 3DHFA 4MY9A 2JGYA 3I65A 3WJSA 2GQ9A 3C2RA 5K9CA 2CWNA 2BSLA 4UTIA 1JCLA 3MMTA 1B9BA 3BGJA 4ALDA 1G4EA 2V5BA 3JR2A 5AN7A 2I14A 2Y61A 3KOFA 3NVTA 1GVFA 3LCGA 1A53A 4BI7A 4O19A 5ABTA 4K37A 4HPJA 5IBXA 4EWND 4O13A 5G2IA 2Y7EA 4PEKA 4M6QA 3SSJA 4LVGA 3W6YA 1G6CA 3YPIA 1ME8A 4JTTA 4D2JA 3DI1A 3LLFA 2X2GA 3LBMA 1MZHA 2ATSA 1KV8A 3MHUA 4FNUA 1KBJA 2GVLA 3BLFA 2DZVA 1OHLA 2ZZ1A 3MBDA 2Y89A 2QCGA 1TJPA 1GWJA 4TMBA 1OFDA 2FPYA 4JDYA 1QR7A 1GVSA 3RNDA 1U5JA 3TH6A 4P2VA 1EEPA 1FCBA 2YFNA 5AB3A 1EX5A 2A1YA 2BZNA 2VXNA 2YXGA 4UFHA 4U4MA 3DH7A 1XL9A 2FPTA 2GPTA 4PC8A 3NM3A 1GYLA 3HPSA 3NQGA 2ISVA 5KZEA 4YCPA 2Q3RA 3QQ1A 4FXRA 2ATMA 5D33A 1DL3A 3ABSA 1B3OA 1K02A 1RQHA 1W5QA 3S1UA 3V75A 3IVSA 3NA8A 1W5OA 3NL5A 4EF8A 4YXGA 2ISSA 4MUZA 1XUUA 3SGUA 2V2CA 3A9IA 3OA3A 3WFAA 3EWBX 2C1HA 1LORA 1YLVA 3Q2DA 1LZOA 2YZRA 3C2EA 4IMCA 4JTIA 4O0KA 4DO5A 4KFPA 1TV7A 4Z0SA 5DY2A 3QRHA 4M6VA 1M5WA 2DP3A 3Q37A 2VEIA 4GUJA 1LRTA 2VFFA 4JEQA 1WOAA 3FLUA 1JULA 4AF0B 3WJYA 3IGUA 4UFJA 1FXPA 3G3MA 1Q3NA 4GRSA 4UFKA 3TV8A 2ZZ6A 4LW7A 3W70A 2E68A 2A21A 1QO5A 4LTSA 3MYOA 4C1LA 3GVGA 1YADA 3NQ6A 2VFDA 2RDWA 3FKKA 2J6XA 4IMEA 4XTDA 2BX7A 4YWIA 3MI3A 5BRBA 3UY8A 5DCBA 1XM3A 2E6FA 4KFOA 1K7XA 2I1OA 4TIMA 1UCWA 3NZ1A 3ATYA 3SFKA 1TYGA 1OX5A 5AHFA 1OYAA 1YDVA 1VGAA 3C6CA 1VYRA 4N9DA 3ZFHA 3HPXA 3DHDA 1K8ZA 3SGZA 4AVFA 3W88A 1FUYA 4I7WA 4M7SA 1FXQA 4K8EA 3TSBA 4PTNA 3W1QA 3TFXA 3W1XA 3QSTA 4ORIA 1I2RA 4GE8A 3WK0A 1SW7A 3HOJA 5F4XA 4L4LA 1RQEA 4FO4A 3P80A 4ZQOA 4WY0A 2GJNA 4AAJA 2VEPA 3HGOA 3C0JA 2VENA 4CNPA 4LU0A 4S2BA 4O53A 3O6CA 2A7PA 3HB9A 4TR9A 3ABQA 5K4XA 3KRSA 3RLVA 1HG3A 1GTEA 3M1ZA 4N4PA 1CW2A 2X16A 2E77A 3T55A 3IVTA 1HL2A 1A5AA 3DU0A 1FWSA 5BNKA 5E93A 3KVMA 4QIUA 2W0UA 1V7YA 4WD0A 1W3NA 3LM7A 2ZFAA 5H2ZA 1ML1A 2TSYA 1XBZA 5AYYA 3S1XA 4IPJA 4PA8A 4CQAA 3TUUA 3TIMA 1LBFA 3IVUA 3BVJA 4CLMA 4R33A 5G1TA 4NUWA 5D37A 1FWWA 2TPSA 3LOTA 4PCFA 4HSOA 3M9YA 2QJIA 3GYEA 2C15A 3IGXA 1TTJA 3AJXA 3CEPA 3USBA 3O8AA 3LI1A 1SSDA 1L2UA 3G8RA 1XXXA 1OX6A 2Y63A 3NNTA 4IGHA 4O8RA 5C54A 1OYBA 2FTPA 5D2WA 2DZSA 3C3NA 5DLCA 2GQ8A 1ALDA 3UY7A 4L4MA 1YTEA 3L2IA 1PL9A 2H90A 1ZENA 1XFBA 1JRCA 2QUUA 4RKAA 1IXQA 2XN0A 3QSRA 4UUIA 3B0VC 1B4EA 3NQAA 4K39A 5FF4A 3QH2A 2RKXA 3HO8A 5A5WA 2ZRVA 3ATZA 3P81A 4IX0A 3M5YA 1XDLA 3R2GA 4MFDA 1K7FA 4DO4A 5EPDA 2DZTA 3G1FA 3I7SA 4ZZ9A 1ZAHA 5D2TA 4LS2A 2A0NA 4AWUA 2ZDRA 2Y88A 4JNMA 4NJHA 5HUPA 2VC6A 3A22A 4RX0A 2CFFA 3MUXA 3S1VA 2YCEA 2QKFA 1DJQA 1ZCOA 1XKYA 1FCQA 2QUTA 3LBCA 4IX2A 2FB2A 1WV2A 4E2DA 3QM3A 4O0ZA 1Z44A 4UXDA 2EPHA 3TQVA 1RPXA 1JCJA 3S5OA 3W7DA 3TXZA 2DZWA 2Z0IA 2R14A 3NL3A 4LUIA 3G0UA 1I4NA 1M6JA 4UIOA 3A5FA 4JX6A 2RDUA 1WQ5A 2CZFA 1GPWA 3I7RA 3W73A 4GUFA 3G0SA 3D0CA 4GUHA 3E49A 4UR8A 3NPUA 4QISA 1ICQA 1QAPA 4DBDA 3PBYA 2ZQ0A 5I3GA 2CLEA 3R89A 4ORMA 1VJIA 3STFA 2OX1A 4UMBA 4I7UA 3E02A 1ZFJA 4A2RA 2VFGA 4MFEA 4Q32A 5K9XA 4IXXA 1OK4A 4AWSA 3GNNA 1XCFA 2E09A 2QCCA 3NPWA 4Z08A 4JD4A 1KBIA 2VFHA 3I6RA 3T44A 5CPLA 3NEVA 4K36A 4CNOA 1TB3A 1PVNA 1B4KA 5FESA 2B7NA 2QCLA 3THAA 1S5WA 2TMDA 3OHIA 2VFEA 3PC0A 2FLIA 3B06A 3W2KA 2YFOA 2FQIA 3BGGA 3RK8A 1T99A 1AK5A 1R46A 4B5NA 3STCA 1IIGA 4NJKA 4RV8A 3DFSA 4FEZA 3P60A 3TSDA 1SPQA 4FX7A 2Q8LA 3MI2A 4Y8FA 1N8FA 5AOUA 3DFQA 1KFLA 2WQPA 5CZTA 5HNRA 2A2IA 4R34A 2NZLA 4M5PA 2QJGA 3LCFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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